Un outil de détection des micro-organismes plus rapide et moins cher dévoilé

« Un outil de détection des maladies plus rapide et moins cher dévoilé », source article de Jim Romahan paru le 28 février 2019 sur son blog Agri007.

Des chercheurs de la Kansas State University ont dévoilé un outil de détection des maladies plus rapide et moins coûteux.

Axiom Microbiome Array, ou AMA, est la plate-forme de détection de micro-organismes la plus complète jamais construite et le premier microarray à haut débit, a déclaré l'équipe universitaire.

« L'array réseau présente deux avantages: il est plus rapide et moins cher », a déclaré Raymond "Bob" Rowland, professeur de diagnostic médical et de pathobiologie à la faculté de médecine vétérinaire du Kansas State University.

« Je vis dans le monde de la médecine vétérinaire et le coût est critique. »

« Si nous devons faire une analyse avec le LLMDA (Lawrence Livermore Microbial Detection Array), cela nous coûterait environ 250 dollars pour les réactifs; alors qu'avec l'AMA, nous pouvons faire les mêmes tests pour 40 dollars. »

Lorsque des biologistes et des informaticiens ont dévoilé pour la première fois le LLMDA polyvalent en 2010, il pouvait analyser des échantillons de près de 3 000 bactéries et virus, le tout en 24 heures. Mais il ne pouvait analyser que quatre échantillons par jour.

Avec l'AMA à 96 puits, le nouveau système de détection peut analyser 96 échantillons en trois jours. De plus, chacun des 96 puits contient environ 1,4 million de sondes, de sorte que les échantillons sont analysés par environ 132 millions de sondes.

« L'une des conclusions les plus importantes de notre étude est qu'il s'agit du premier microarray à haut débit mis au point », a déclaré Crystal Jaing, biologiste au Lawrence Livermore National Laboratory, qui dirige les efforts dU LLMDA/AMA.

« Cela augmente le débit de 10 à 20 fois et diminue le coût de cinq fois. »

Le LLMDA a été concédée sous licence en 2016 à Thermo Fisher Scientific, basée à Waltham, dans le Massachusetts, et a été mise en vente plus tard au cours de la même année sous le nom d'Applied Biosystems AMA.

Référence. Thissen JB, Be NA, McLoughlin K, Gardner S, Rack PG, Shapero MH, et al. (2019) Axiom Microbiome Array, the next generation microarray for high-throughput pathogen and microbiome analysis. PLoS ONE 14(2): e0212045. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0212045