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mardi 19 décembre 2023

Les micro-organismes multitâches pourraient améliorer l’économie des biocarburants et l’impact climatique

Dans une nouvelle étude en microbiologie parue dans Applied and Environmental Microbiology, une revue de l’ASM, des chercheurs ont conçu des microbes pour produire deux produits précieux à partir de fibres végétales, améliorant ainsi l'économie des biocarburants et l'impact climatique. Lire l'article de GLBioénergie sur les microbes multitâches. Découvrez comment GL Bioenergy les a formés pour faire à la fois deux choses précieuses.

Des microbes multitâches pourraient améliorer l'économie des biocarburants et l'impact climatique. Les scientifiques de l'University of Wisconsin–Madison conçoivent des bactéries pour fabriquer deux produits précieux à partir de fibres végétales.

lundi 20 novembre 2023

Solutions microbiennes pour réduire les émissions de méthane

«Un nouveau rapport présente des solutions microbiennes pour réduire les émissions de méthane», source ASM News.

L'Académie américaine de microbiologie, groupe de réflexion scientifique et honorifique d’experts de l'American Society for Microbiology (ASM), a publié un nouveau rapport intitulé Le rôle des microbes dans la médiation des émissions de méthane ou The Role of Microbes in Mediating Methane Emissions. Le rapport met en évidence des recommandations visant à approfondir la compréhension de la communauté scientifique des processus microbiens de production et de consommation de méthane afin d’atténuer les émissions de méthane et de lutter contre le changement climatique.

Les microbes peuvent influencer le changement climatique grâce à des cycles biogéochimiques qui consomment ou produisent des gaz à effet de serre. L’augmentation des niveaux de méthane est l’un des principaux moteurs de la hausse des températures mondiales. Le pouvoir réchauffant du méthane est environ 80 fois plus puissant que celui du dioxyde de carbone sur une période de 20 ans. La réduction des émissions de méthane est un moyen efficace de ralentir la hausse des températures mondiales à court terme. Les microbes sont d’importants consommateurs et producteurs de méthane. Comprendre les diverses capacités métaboliques des microbes peut donc aider les scientifiques à mieux développer des solutions microbiennes permettant de résoudre le problème des émissions de méthane.

«En comprenant le rôle des microbes dans la médiation des émissions de méthane, nous ouvrons un large éventail de solutions prometteuses pour relever le défi climatique», a dit Vanessa Sperandio, présidente des gouverneurs de l'Académie. «Plus que jamais, la communauté scientifique doit travailler ensemble pour proposer de toute urgence ces solutions.»

Le rapport est le résultat des discussions et délibérations des experts participants au colloque des 31 mai et 1er juin 2023, organisé par l'ASM et l'American Geophysical Union, avec le soutien supplémentaire de la Soil Science Society of America. L’expertise des participants couvrait une variété de disciplines et de secteurs. Ils ont identifié des lacunes dans les connaissances qui doivent être explorées davantage et ont mis en évidence des stratégies potentielles pour lutter contre les émissions de méthane. Les recommandations du rapport visent à contribuer au développement de solutions qui exploitent les microbes pour réduire les émissions de méthane provenant de 4 sources principales : la fermentation entérique chez les ruminants (comme les vaches ou les moutons), les déchets animaux, les rizières et les décharges.

On lira :


Complément

jeudi 9 novembre 2023

L'EFSA évalue les dangers liés à l'utilisation de l'eau dans le secteur des fruits et légumes

«L'EFSA évalue les dangers liés à l'utilisation de l'eau dans le secteur des fruits et légumes», source article de Food Safety News paru le 8 novembre 2023.

Des experts de l'EFSA ont examiné la qualité de l'eau utilisée lors des opérations dans le secteur des produits frais et surgelés.

L'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) a demandé au groupe scientifique sur les dangers biologiques (BIOHAZ) un avis scientifique sur les dangers microbiologiques associés à l'utilisation de l'eau dans la manipulation et la transformation après récolte des fruits, légumes et herbes frais et surgelés.

L'utilisation de l'eau pendant la récolte et la transformation constitue un facteur de risque important de contamination de ces produits. Les risques microbiens pertinents comprennent Listeria monocytogenes, Salmonella, E. coli et des virus tels que le norovirus.

De grands volumes d’eau sont utilisés pour le lavage, le rinçage, le transfert hydraulique, la réfrigération, le nettoyage général et la désinfection. Par exemple, de grandes quantités d’eau sont nécessaires pour produire des salades en sachet. La plupart des transformateurs après récolte préfèrent utiliser la même eau pendant de nombreuses heures de fonctionnement afin d'économiser de l'eau et de l'énergie, car l'accès à l'eau potable peut être limité ou coûteux.

Selon les pratiques actuelles, l'eau potable est utilisée pour remplir les équipements et les réservoirs pendant la première heure du matin et n'est pas remplacée avant plusieurs heures, voire plusieurs jours dans certains cas, période pendant laquelle de grands volumes de fruits, légumes et herbes peuvent être traitées, selon le rapport paru le 3 novembre 2023.

Traitement de l'eau

La contamination de l'eau de traitement dépend de plusieurs facteurs, notamment le type de produit traité, la durée de l'opération et le transfert de micro-organismes du produit à l'eau et vice versa.

Pour éviter la contamination croisée du produit due à l'utilisation d'eau contaminée, des traitements de désinfection de l'eau sont nécessaires pour éliminer ou réduire les micro-organismes à un niveau acceptable, mais ils ne doivent pas nuire à la qualité et à la sécurité sanitaire du produit.

L'efficacité des traitements de désinfection dépend des conditions spécifiques de l'opération de transformation, notamment de la qualité initiale de l'eau et du type de traitement.

Les désinfectants à base de chlore et l'acide peroxyacétique sont des traitements courants de désinfection de l'eau. La validation, la surveillance opérationnelle et la vérification pour démontrer les performances sont nécessaires. Les pratiques d'hygiène comprennent l'entretien des infrastructures, la formation du personnel et le refroidissement de l'eau de traitement après récolte.

Gestion de l'eau

Les efforts des experts comprenaient une revue de la littérature, des données de surveillance des épidémies et une enquête auprès de l'industrie.

La maîtrise de l’eau basé uniquement sur un programme de conditions préalables de base (PRP) n’est pas réalisable et une approche HACCP est nécessaire pour la gestion de l’eau. Les bonnes pratiques de fabrication (BPF) et les bonnes pratiques d'hygiène (BPH) liées à un plan de gestion de l'eau et à la mise en œuvre d'un système de gestion de l'eau sont essentielles.

D'après les réponses à l'enquête de l'industrie, trois bonnes pratiques ne sont pas encore bien mises en œuvre : le remplacement des infrastructures pour éviter la formation de biofilm, la recherche de la formation de biofilm dans le système de gestion de l'eau et le refroidissement par l’eau. Les réponses ont montré que la surveillance de la qualité de l’eau de traitement était absente ou faible.

Lors de certaines éclosions de listériose, les enquêtes ont révélé que la contamination s'était produite à l'usine de transformation ; cependant, des bactéries peuvent également pénétrer dans l’usine à partir de la production primaire. Malgré les enquêtes menées sur l'épidémie, la voie de contamination a rarement été confirmée.

Les pratiques agricoles émergentes telles que la culture hydroponique, l'agriculture verticale et l'agriculture urbaine peuvent introduire des agents pathogènes dans la chaîne alimentaire, même si l'ampleur de ce phénomène devrait être inférieure à celle de l'agriculture conventionnelle, selon le rapport.

Le groupe BIOHAZ a recommandé que davantage d'informations soient incluses dans les rapports d'enquête sur les épidémies et que des lignes directrices claires soient disponibles pour les entreprises afin de clarifier les exigences sur la manière dont les traitements de désinfection de l'eau peuvent être utilisés pour maintenir la qualité microbiologique de l'eau utilisée dans la manipulation et le traitement après récolte. de fruits, légumes et herbes.

Commentaire

Quand on lit le rapport, les experts semblent sous le charme de l’ariculture urbaine, hydroponique et autres fermes verticales. Auant de billvesées qui ne recouvrent le marché actuellement. Sinon, trien de bien neuf et je suggère aux experts de passer une semaine dans des usines de transformation de fruis et de légumes ...

dimanche 17 septembre 2023

Le 17 septembre 2023 est la Journée internationale des micro-organismes !

Le 17 septembre est la Journée internationale des micro-organismes, car en ce jour de 1683, Antonie van Leeuwenhoek écrivait à la Royal Society que ses dents hébergeaient «de nombreux très petits animalcules». La compréhension de ces «animacules» et de leur importance dans tous les aspects de nos vies a depuis lors parcouru un long chemin ...

lundi 21 août 2023

Derrière le rideau de douche : Investigation sur l'impact des caractéristiques de la pomme de douche sur les bactéries auxquelles nous sommes exposés

«Derrière le rideau de douche : Investigation sur l'impact des caractéristiques de la pomme de douche sur les bactéries auxquelles nous sommes exposés», source communiqué de l’Université de Pittsburgh.

La professeure adjointe en génie civil et environnemental Sarah Haig a reçu 420 000 dollars de la National Science Foundation (NSF) pour comprendre comment différentes caractéristiques de la pomme de douche ont un impact sur l'exposition aux agents pathogènes associés à l'eau potable

En allant sous la douche, nous nous attendons à ce que l'eau chaude nous nettoie et nous décompresse après une longue et dure journée, mais il peut y avoir quelque chose de dangereux qui se cache dans la pomme de douche.

Les douches peuvent nous exposer à de nombreux types de cellules bactériennes. La plupart sont inoffensives, mais certaines, appelées pathogènes associés à l'eau potable pour des personnes immunodéprimées (DWPIs pour drinking water-associated pathogens of the immunocompromised), peuvent présenter un risque sérieux pour notre santé, en particulier pour les personnes dont le système immunitaire est affaibli.

Sarah Haig va mener une étude de trois ans visant à tester les différentes caractéristiques de la pomme de douche afin de comparer les concentrations de DWPIs présents dans l'eau de la douche, et les aérosols qu'elle produit.

«Il existe de nombreux types de pommes de douche sur le marché, laissant aux consommateurs le choix du type de jet, du matériau, du débit et des additifs tels que les produits chimiques tueurs de bactéries qu'ils souhaitent», a expliqué Haig. «Mais on ne sait pas comment ces décisions affectent le risque d'exposition aux DWPIs.»

Les DWPIs ont un coût élevé non seulement pour notre santé, mais aussi pour l'économie des États-Unis, coûtant 2,93 milliards de dollars par an.

Ils sont aussi incroyablement difficiles à tuer. Malgré le large éventail de processus physiques et chimiques utilisés pour traiter l'eau potable, les DWPIs peuvent survivre et continuer à se développer et à prospérer dans les circuits de tuyauterie.

Bien qu'il existe de nombreux DWPIs préoccupants, Legionella pneumophila, Pseudomonas aeruginosa et des mycobactéries non tuberculeuses (MNT) provoquent la plupart des infections respiratoires. Cependant, comme les MNT cause 57% de tous les décès dus aux maladies d'origine hydrique aux États-Unis, ce sera l'objectif principal de Haig et de son équipe.

«L'objectif pour ceux d'entre nous qui travaillent dans le domaine de la santé publique et de la prévention est d'avoir des moyens de limiter l'exposition à ces bactéries, physiquement ou chimiquement, afin de contrôler l'exposition et ainsi contrôler le risque de maladie», a déclaré Janet Stout, une collaboratrice d'Haig et vice-président exécutif et fondatrice du Special Pathogens Laboratory. «Les recherches du professeur Haig sur les tests de ces matériaux s'alignent sur ces objectifs.»

L'exposition aux DWPIs peut provenir de diverses sources, mais l'inhalation d'aérosols associés à l'eau est le plus souvent liée à une infection. Cependant, l'aérosolisation des DWPIs et sa relation avec les caractéristiques de la pomme de douche sont mal comprises.

Pour combler ce manque de connaissances, Haig et son équipe testeront des pommes de douche avec différentes caractéristiques et compareront la concentration de DWPIs présents dans l'eau de douche et les aérosols produits par l'eau de douche.

Le Dr Janet Lee, chef de la division de médecine pulmonaire et de soins intensifs, professeur émérite en médecine, professeur de pathologie et d'immunologie à l'Université de Washington à St. Louis et co-chercheuse principale de ce projet, a déclaré que ce projet apportera des informations précieuses pour la société afin de minimiser son risque d'exposition au DWPIs.

«Cette connaissance permettra aux individus de sélectionner des pommes de douche qui donnent la priorité à leur santé tout en améliorant notre compréhension globale de l'impact de nos choix dans l'environnement bâti sur notre bien-être», a déclaré Lee.

Haig dirige le laboratoire Investigating Home Water and Aerosols’ Links to Opportunistic Pathogen Exposure (INHALE) de l’Université de Pittsburgh.

NB : Les cinéphiles auront reconnu une photo de la scène de la douche dans le film Psychose d'Alfred Hitchcock.

lundi 3 juillet 2023

Qu'est-ce qui se mijote dans le microbiome de la cuisine ?

«La cartographie du microbiote de cuisines dans cinq pays européens révèle un ensemble de bactéries principales dans les pays, les surfaces de cuisine et les ustensiles de nettoyage», source article disponible en intégralité dans Applied and Environmental Microbiology
«Mapping the Kitchen Microbiota in Five European Countries Reveals a Set of Core Bacteria across Countries, Kitchen Surfaces, and Cleaning Utensils».

Qu'est-ce qui se mijote dans le microbiome de la cuisine ?

Moen et al. ont identifié un petit sous-ensemble de taxons bactériens partagés entre les ustensiles de nettoyage (éponges et torchons) et les surfaces des cuisines résidentielles à travers l'Europe. L'évolution du microbiote est plus corrélée au type d'ustensile de nettoyage qu'aux pratiques spécifiques et aux différences alimentaires de chaque pays.

Résumé

La cuisine résidentielle est souvent fortement colonisée par des microbes provenant de différentes sources, y compris les aliments et le contact humain. Bien que quelques études aient rapporté la composition bactérienne dans les ustensiles de nettoyage et les prélèvements de surface, la connaissance de la diversité bactérienne est limitée dans les différents types de prélèvements des ménages et des pays. Dans le cadre d'une vaste étude européenne, nous avons identifié le microbiote de 302 prélèvements d'ustensiles de nettoyage (éponges et torchons), de surfaces de cuisine (éviers, planches à découper, plans de travail, poignées de robinet et un prélèvement regroupant les autres poignées) dans 74 ménages à travers 5 pays (France, Hongrie, Norvège, Portugal et Roumanie).

Au total, 31 phylums bactériens ont été identifiés, Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidota et Actinobacteria étant les plus abondants. Malgré de grandes variations dans les ménages en ce qui concerne les règles en cuisine, les pratiques de cuisine, les systèmes de nettoyage et le régime alimentaire et des différences considérables dans la diversité bactérienne entre les échantillons, huit genres et/ou familles bactériennes couramment associés à des sources environnementales ont été identifiés dans la plupart des prélèvements et définis comme un microbiote central : Acinetobacter, Pseudomonas, Enhydrobacter, Enterobacteriaceae, Psychrobacter, Chryseobacterium, Bacillus et Staphylococcus. Ces genres et/ou les familles figuraient également parmi les bactéries présentant l'abondance relative la plus élevée dans tous les échantillons, en plus de Yersiniaceae, Kocuria, Pantoea et Streptococcus. Les taxons associés aux pathogènes potentiels et aux indicateurs fécaux étaient peu abondants mais largement répartis dans les ménages. La composition microbienne des prélèvements de surface a indiqué que la composition microbienne des surfaces de la cuisine est plus caractéristique pour le pays particulier que le type d'objet, tandis que le microbiote des ustensiles de nettoyage était similaire dans tous les pays mais différait selon les types (éponge ou torchon).

Importance

La connaissance des caractéristiques, des différences et des similitudes de la composition bactérienne dans les cuisines résidentielles est limitée. Ici, nous rapportons le microbiote des ustensiles de nettoyage (éponges et torchons) et cinq prélèvements de surface différents dans 74 ménages de cinq pays européens. En plus d'accroître les connaissances sur le microbiote des cuisines dans de nombreuses zones géographiques, cette étude a identifié un microbiote central dans les cuisines résidentielles européennes malgré de grandes variations dans les pratiques de cuisine et la conception et les règles de cuisine entre les pays et les ménages.

Les auteurs notent,

Cette étude montre qu'il existe un petit nombre de taxons bactériens qui composent un microbiote de cuisine malgré des variations considérables dans les normes de cuisine, les pratiques de cuisine, les systèmes de nettoyage, les ménages et les différences alimentaires. En plus de trouver un microbiote de base à travers les pays et les types de prélèvements, nous montrons également que le microbiote des prélèvements de surface de cuisine, en moyenne, était plus similaire dans un pays que dans un type de prélèvements de surface à travers les pays. Pour les ustensiles de nettoyage, nous avons observé que le microbiote était plus étroitement lié au type d'ustensile de nettoyage, éponge ou torchon, qu'au pays d'origine.

En conclusion, cette étude a contribué à approfondir notre compréhension de la communauté microbienne de la cuisine. Des études de suivi sont nécessaires pour corréler ces résultats avec les comportements en matière de sécurité des aliments et l'impact potentiel sur la santé humaine.

Mise à jour du 11 juillet 2023

L'ASM publie une information sur l'article intitulée, Bacteria in Kitchen May NotBe as Harmful as You Think.

mercredi 8 mars 2023

Contribution des omiques à la bioconservation : Vers une ingénierie du microbiome alimentaire

Légende de l’image. Des avancées majeures dans le domaine de la biopréservation grâce aux approches omiques. L'objectif de la bioconservation est d'induire l'arrêt de la croissance ou la décomposition des agents pathogènes et des parasites. Les approches omiques ont montré qu'en réponse à la bioconservation, les micro-organismes cibles modulent l'expression de gènes impliqués dans le métabolisme cellulaire, la tolérance au stress et la virulence. De plus, les omiques ont révélé que la bioconservation peut diminuer la diversité du microbiote alimentaire. A l'inverse, selon sa structure, le microbiote alimentaire peut soit améliorer, soit diminuer l'efficacité des agents de bioconservation. Le microbiote alimentaire peut également avoir des propriétés protectrices intrinsèques et ainsi inhiber les micro-organismes indésirables.  

«Contribution des omiques à la bioconservation : Vers une ingénierie du microbiome alimentaire», Source information diffusée par Actalia le 6 mars 2023.

La bioconservation est une approche durable pour améliorer la sécurité alimentaire et maintenir ou prolonger la durée de conservation des aliments en utilisant des micro-organismes bénéfiques ou leurs métabolites. Au cours des 20 dernières années, une gamme de méthodes comprenant la génomique, la transcriptomique, la protéomique, la métabolomique et les dérivés méta-omiques ont mis en évidence le potentiel de la bioconservation pour améliorer la sécurité microbienne de divers aliments.

Cet article de revue montre comment ces approches ont contribué à la sélection des agents de bioconservation, à une meilleure compréhension des mécanismes d’action et de leur efficacité et impact au sein de l’écosystème alimentaire. Il présente également le potentiel de combiner les omiques avec des approches complémentaires pour mieux prendre en compte la complexité des microbiomes alimentaires à plusieurs échelles, de la cellule à la communauté, et leur hétérogénéité spatiale, physico-chimique et microbiologique. Les dernières avancées en bioconservation par les omiques ont souligné l’importance de considérer l’alimentation comme un microbiome complexe et dynamique qui nécessite des stratégies d’ingénierie intégrées pour augmenter le taux de production d’innovation afin de répondre aux enjeux sécuritaires, environnementaux et économiques du secteur agroalimentaire.

Dans la conclusion, les auteurs indiquent,

Les outils omiques sont devenus incontournables dans le domaine de la bioconservation, tant pour sélectionner des agents innovants que pour étudier leur efficacité, leur mécanisme d'action et leur impact sur l'écosystème alimentaire. Ces approches ont révélé la diversité et la complexité des mécanismes moléculaires responsables de l'activité protectrice des agents de bioconservation. Ils ont apporté des connaissances fondamentales sur les enjeux de la biopréservation en termes de description des communautés (taxonomie), d'interactions biotiques et d'impact sur la qualité organoleptique du produit. Ils ont également montré que le microbiote alimentaire joue un rôle majeur dans la bioconservation en agissant positivement ou négativement. Il est maintenant clair que le microbiote alimentaire doit, à l'avenir, être pleinement intégré dans le processus d'ingénierie des systèmes de bioconservation pour amener le domaine dans la dimension de l'ingénierie du microbiome alimentaire, afin qu'il puisse également jouer son rôle protecteur contre les agents pathogènes et les micro-organismes d'altération. comme servir son but technologique. De plus, au-delà du fonctionnement du microbiome alimentaire, ce procédé d'ingénierie doit mieux intégrer ses interconnexions avec les autres microbiomes (sol, eau, végétal, animal et consommateur) pour ne pas perturber leur fonctionnement voire contribuer à leur équilibre. A cet égard, des efforts doivent être poursuivis pour exploiter davantage les approches multi-omiques et les combiner avec d'autres approches complémentaires prenant en compte l'hétérogénéité des microorganismes au niveau de matrice alimentaire.

Référence
Contribution of omics to biopreservation: Toward food microbiome engineering. Front. Microbiol., 02 August 2022 Volume 13, 2022. Article disponible en intégralité.

jeudi 24 novembre 2022

Désinfecter la maison : mythes, règles et meilleures pratiques

«Désinfecter la maison : mythes, règles et meilleures pratiques», source ASM News du 29 juin 2022.
 

Au début de la pandémie de la COVID-19, les magasins ont connu des pénuries dévastatrices de fournitures essentielles, comme du désinfectant pour les mains, des lingettes désinfectantes et des produits de nettoyage. Au fur et à mesure de l'apparition des premiers cas, de nombreuses questions se sont posées quant à la survie du virus SARS-CoV-2 sur les surfaces. Ainsi, de nombreuses personnes ont acheté des dizaines de produits de nettoyage dans l'espoir d'éradiquer le virus des produits d'épicerie, des emballages et des surfaces fréquemment touchées dans la maison. Finalement, les consommateurs ont vidé les étagères qui regorgeaient auparavant de sprays désinfectants et de lingettes antibactériennes. Photo ci-contre Source.

«Des personnes laissaient des colis sur leurs porches pendant des jours; ils essuyaient leurs emballages, désinfectaient tous les produits qu'ils achetaient à l'épicerie», a dit le Dr Jeffrey Van Komen, scientifique principal chez Procter and Gamble. Dans de nombreux cas, il est considéré comme la meilleure pratique de désinfecter les surfaces fréquemment touchées, comme les poignées de porte et les téléphones portables, pour réduire la propagation des maladies au sein d'une communauté. Pourtant, les scientifiques craignent, en particulier avec la récente propagation mondiale du virus de la variole du singe et les discussions sur les futures pandémies, que la surutilisation des produits de nettoyage ne contribue à d'importantes pénuries de la chaîne d'approvisionnement, à l'exposition aux toxines et à la résistance aux antimicrobiens.

Un appel à des pratiques d'hygiène fondées sur des données probantes
Pourquoi le public est-il déterminé à rester au 20ème siècle avec des pratiques dépassées pour une bonne hygiène ? C'est ce que le Dr Elizabeth Scott, codirectrice et fondatrice du Simmons Center for Hygiene and Health in Home and Community, aimerait savoir.

Les conseils modernes sur l'hygiène et le contrôle des infections ont été enregistrés pour la première fois au milieu du XIXe siècle en Europe et aux États-Unis. Décrit comme «l'ère des réformateurs sanitaires», le mouvement de réforme sanitaire et l'industrie du nettoyage et de la désinfection se sont développés à la fin du XIXe et au début du XXe siècle. Selon Scott, «Le milieu du 20ème siècle était une ère de grand optimisme, c'était l'ère des antibiotiques. On avait le sentiment que nous n'avions plus besoin de nous préoccuper des infections, nous pouvions toutes les traiter.»

Au XXe siècle, de nombreuses personnes pratiquaient le «nettoyage en profondeur» (par exemple, la désinfection de toutes les surfaces de la maison, y compris les sols et les murs, et le lavage d’articles, comme les coussins du canapé, qui peuvent être retirés des meubles) à la maison pour éviter les infections. Cette évaluation des risques non fondée sur des preuves a indiqué que le public supposait que les surfaces hébergeaient toujours des germes et des agents pathogènes qui devaient être éliminés. Cependant, Scott a expliqué qu'il ne s'agissait pas d'une approche fondée sur des preuves. «Les pratiques quotidiennes, hebdomadaires ou mensuelles que nous menons à domicile et dans les milieux communautaires nous font nous sentir meilleur, mais elles ne réduisent pas réellement les risques», a-t-elle expliqué.

À l'inverse, l'hygiène ciblée, une technique qui utilise une évaluation des risques fondée sur des preuves, tient compte du danger (par exemple, la probabilité que des agents pathogènes soient présents aux moments clés du contact) et de l'exposition (par exemple, la probabilité de propagation d'agents pathogènes susceptibles de provoquer des infections) et utilise les informations recueillies à partir de ces analyses pour indiquer quand et comment les pratiques d'hygiène doivent être menées. Lorsqu'elle est appliquée à la maison et à l'hôpital, l'hygiène ciblée «prévient la propagation des microbes dangereux de manière ciblée. Elle résout les problèmes de durabilité, évite l'utilisation excessive de produits chimiques et de microbicides, maintient l'exposition aux microbes bénéfiques et reconnaît que [le nettoyage et l'hygiène] sont une responsabilité partagée.

Selon Scott, l'exposition aux agents pathogènes survient très probablement par contact avec quelqu'un qui tousse ou éternue, les salles de bain, les aliments crus, les aliments pour animaux et les animaux domestiques, les surfaces fréquemment touchées (par exemple, les poignées de robinet), la manipulation de vêtements et de linge souillés, le fait de manger avec des mains nues, la manipulation des ordures ménagères et les soins pour un membre de la famille infecté. Les sols et les murs sont considérés comme des surfaces à faible risque d'exposition, tandis que les surfaces fréquemment touchées (par exemple, les télécommandes de télévision, les poignées de porte) dépendent de la surface et de l'agent pour l'exposition. Par exemple, Scott a expliqué : «Il y a un plus grand risque de transmission de norovirus et de virus du rhume par contact avec des surfaces parce que [ces virus] sont très robustes dans l'environnement et ont une faible dose infectieuse.» À l'inverse, des données suggèrent qu'un individu est plus susceptible de contracter la COVID-19 par voie aérienne que par contact de surface. Pour d'autres agents pathogènes, comme le virus du monkeypox, le contact avec la surface présente un risque de transmission plus élevé. En plus des grosses gouttelettes respiratoires, la variole du singe peut être transmise par une peau abimée ou de petites plaies qui ne sont pas toujours visibles. Par conséquent, la désinfection des surfaces fréquemment touchées est essentielle pour réduire la propagation du virus.
Les surfaces fréquemment touchées, comme les poignées de porte et les appareils électroniques, peuvent contribuer à l'exposition aux virus. Source Image adaptée du NCBI.

En avril 2021, un rapport conjoint de l'International Association for Soaps, Detergents and Maintenance Products et de l'International Scientific Forum on Home Hygiene a enquêté dans 23 pays d'Europe pour déterminer le niveau de compréhension entre les pratiques d'hygiène et de nettoyage. L'étude comptait plus de 4 000 participants, dont 87% ont reconnu que le nettoyage et l'hygiène à la maison sont importants. Cependant, plus de 30% des participants ne comprenaient pas la différence entre le nettoyage et l'hygiène. Le nettoyage est spécifique à l'enlèvement des salisures ou des déchets, tandis que l'hygiène englobe la prévention des maladies via plusieurs pratiques, dont le nettoyage. Certains participants ont conclu qu'une surface qui semblait propre était en fait hygiénique, et ce n'est pas le cas. Scott a expliqué que ces données fournissent une référence pour le niveau de compréhension que les individus ont du nettoyage et de l'hygiène en termes de pratiques à domicile et quelle éducation doit être dispensée pour améliorer la santé de la communauté. «Si nous ne savons pas ce que les personnes pensent, nous ne pouvons pas leur donner des informations sur lesquelles ils peuvent agir», a-t-elle déclaré. Pour les agents pathogènes émergents autres que la COVID-19, l'éducation sur les différentes pratiques de désinfection des virus transmissibles par contact avec la peau fera partie intégrante de la réduction de leur propagation.

Conseils pour appliquer des pratiques d'hygiène fondées sur des données probantes
Le Centers for Disease Control and Prevention (CDC) fournit des conseils sur la désinfection des surfaces, y compris les surfaces dures, les articles ménagers et les meubles rembourrés et conseille de limiter l'utilisation de produits qui font également office d'antimicrobiens, car une utilisation excessive de ces produits peut contribuer à la résistance aux antimicrobiens. Vérifier que les antimicrobiens utilisés à la maison sont des produits vrais et non des produits contrefaits est un bon point de départ. Portez une attention particulière aux types de surfaces sur lesquelles le désinfectant peut être utilisé, à la durée pendant laquelle le désinfectant doit rester humide sur la surface et si les instructions du produit recommandent d'enlever les salissures ou les déchets de la surface avant d'utiliser le désinfectant.

Planification des infections émergentes
Alors que le paysage des maladies continue d'évoluer, l'Emerging Viral Pathogen Guidance and Status for Antimicrobial Pesticides de l'EPA permet aux entreprises de pré-enregistrer volontairement leurs produits en vue de la préparation d'un agent pathogène émergent. Les entreprises peuvent présenter des données d'efficacité, et l'EPA peut accorder à l'entreprise la possibilité de faire des allégations en dehors de l’étiquetage du produit.

Il existe actuellement 3 politiques actives sur les agents pathogènes viraux émergents :
1. La liste N catalogue les désinfectants pour la COVID-19, y compris ses variants, et répertorie les produits contenant des ingrédients actifs tels que l'ammonium quaternaire, le peroxyde d'hydrogène et l'acide hypochloreux.
2. La liste O se concentre sur les agents pathogènes pertinents pour les soins vétérinaires, y compris le virus de la maladie hémorragique du lapin, et répertorie les produits contenant des ingrédients actifs tels que l'hypochlorite de sodium, le thymol et le dichloroisocyanurate de sodium.
3. La liste Q comprend des désinfectants pour les agents pathogènes viraux émergents, comme le monkeypox, avec des ingrédients actifs tels que le dioxyde de chlore, l'alcool isopropylique et le chlorure de sodium. Les lingettes, produits prêts à l'emploi et diluables figurent sur ces listes.

Le monkeypox est classé comme un virus de «niveau 1» (virus enveloppé) par l'EPA, et comme il peut se propager par transmission des germes, les produits classés dans la liste Q sont recommandés pour traiter les surfaces de la maison qui peuvent avoir été contaminées par le virus. Le CDC recommande de laver tous les tissus ou draps, comme les serviettes ou les taies d'oreiller, avant de nettoyer une zone ou une pièce particulière qui a été exposée au virus. De plus, lorsque vous partagez des espaces avec une personne infectée par le monkeypox, le CDC recommande de désinfecter tous les articles ménagers et les surfaces fréquemment touchées.

Avec la propagation mondiale du monkeypox, Van Komen a expliqué que les inquiétudes concernant la propagation du virus sont associées à la crainte que les produits de nettoyage soient aussi difficiles à trouver qu'ils l'étaient au début de la pandémie de la COVID-19, et qu'en réponse, la contrefaçon les produits seront commercialisés sur internet. Les produits sous-enregistrés et la dernière prolifération de pesticides non enregistrés sur le marché du commerce électronique, en particulier pendant cette période sans précédent, posent un risque sanitaire important et immédiat pour les consommateurs, les enfants et les animaux domestiques.» Van Komen a souligné l'importance pour les consommateurs et les décideurs politiques de prendre note des pénuries de la chaîne d'approvisionnement et des problèmes de contrôle des poisons qui se sont intensifiés au début de 2020 afin d'être conscients de l'impact des futures pandémies sur la disponibilité des produits de nettoyage et de façonner les meilleures pratiques de santé publique.

L’étude de cet article a été présentée à ASM Microbe, la réunion annuelle de l'American Society for Microbiology, qui s'est tenue du 9 au 13 juin 2022 à Washington, D.C.

mardi 22 novembre 2022

Les habitants microbiens de nos appareils et outils quotidiens de nettoyage

Des machines à laver aux brosses à dents, les ustensiles et les appareils que les consommateurs utilisent pour nettoyer leurs affaires ou eux-mêmes sont pleins de microbes. Beaucoup de ces organismes sont inoffensifs, mais certains peuvent présenter un risque d'infection. Que peut-on faire pour les combattre ?

«Les habitants microbiens de nos appareils et outils de nettoyage», source Madeline Barron sur ASM News du 21 novembre 2022.

Quel est le point commun entre les éponges, les machines à laver, les lave-vaisselle, les douches et les brosses à dents ? Des personnes les utilisent pour nettoyer, soit leurs biens, soit eux-mêmes. Cependant, de nombreux espaces, outils et appareils ménagers que les personnes associent au «propre» sont loin de là, d'un point de vue microbien. En fait, ils hébergent divers micro-organismes bien adaptés pour survivre à des conditions difficiles, comme les détergents et les températures élevées. Certains de ces organismes peuvent avoir un potentiel pathogène, bien que le risque d'infection ne soit pas toujours clair. Pourtant, il y a des choses que l'on peut faire pour limiter la croissance microbienne dans et sur les appareils et objets associés à l'entretien ménager et à l'hygiène personnelle.

Éponges de cuisine
Les éponges de cuisine sont connues pour avoir une charge microbienne élevée. Avec leurs surfaces humides et poreuses, les éponges offrent des conditions favorables à la croissance de hordes de bactéries (jusqu'à environ 50 milliards de cellules bactériennes par cm3). Les espèces gammaprotéobactériennes (par exemple Escherichia coli) sont des membres courants du microbiote des éponges. Les agents pathogènes d'origine alimentaire, comme Klebsiella pneumonieae,qui peuvent tout infecter, des poumons aux voies urinaires, habitent également les éponges, ainsi que divers virus et archées.

Ce qui peut être fait ?
Éviter d'essuyer les dégâts dangereux (par exemple, la viande crue) est une bonne idée. L'utilisation d'outils de nettoyage alternatifs, comme les brosses à vaisselle, qui sèchent plus rapidement et hébergent moins de bactéries, est également une option pour gérer les microbes de l'éponge, tout comme la désinfection de l'éponge elle-même. Une étude réalisée en 2008 par le ministère de l'agriculture des États-Unis (USDA) a montré que le passage d'éponges dans un four à micro-ondes trempées dans une bouillie de bœuf haché (environ 31 millions d'UFC bactériennes/éponge) pendant 1 minute réduisait la charge bactérienne à 2-3 unités formant colonies (UFC) par éponge. Cependant, l'efficacité du passage des éponges au four à micro-ondes peut dépendre de la puissance du four et du degré de saleté de l'éponge (c'est-à-dire de la charge microbienne). L'USDA a également constaté que faire passer des éponges dans le lave-vaisselle est une stratégie tout aussi efficace, en particulier pour tuer les moisissures et les levures.

Appareils de nettoyage : lave-vaisselle et machines à laver
Au lieu (ou en plus) des éponges, de nombreuses personnes utilisent des lave-vaisselle pour nettoyer leur vaisselle. Cependant, les lave-vaisselle sont loin d'être exempts de microbes. Les communautés microbiennes des lave-vaisselle sont ensemencées par l'eau du robinet, qui contient des bactéries prélevées dans le système de plomberie, ainsi que par les microbes et les aliments présents sur la vaisselle sale chargée dans la machine. La fréquence d'utilisation du lave-vaisselle et son âge façonnent également la composition de la communauté microbienne. Par exemple, des chercheurs ont découvert que la composition des biofilms bactériens sur les joints en caoutchouc des nouveaux lave-vaisselle (vieux de 0 à 4 ans) était unique (par exemple, il y avait une plus grande abondance de protéobactéries) par rapport aux lave-vaisselle plus anciens (8 ans), ce qui suggère qu'il y a eu des changements dans la structure communautaire au fil du temps. Cette dynamique est influencée, en partie, par les interactions avec les champignons, y compris des genres contenant des agents pathogènes comme Candida et Cryptococcus, qui vivent sur les joints en caoutchouc des lave-vaisselle, les distributeurs d'eau et les siphons.

Les machines à laver sont un autre appareil de nettoyage domestique riche en microbes, avec une charge bactérienne moyenne estimée à 21 000 UFC/cm-2 sur divers sites d'échantillonnage (par exemple, le tiroir à détergent et le joint en caoutchouc de la porte). D'où viennent ces microbes ? Les vêtements piègent les organismes de la peau humaine, des sécrétions et excrétions corporelles et de l'environnement, qui peuvent se transférer entre les vêtements pendant le lavage, et vers et depuis la machine à laver elle-même.

Comme dans les lave-vaisselle, l'eau du robinet contribue également à la communauté. L'abondance et les types de microbes vivant dans les machines à laver dépendent de la fréquence d'utilisation de la machine, du cycle de lavage (c'est-à-dire chaud ou froid) et du type d'appareil. Par exemple, les machines à laver à chargement frontal et écoénergétiques que l'on trouve dans de nombreuses maisons peuvent contenir de l'eau résiduelle dans le tambour, ce qui crée un environnement humide qui peut favoriser la croissance bactérienne. Parfois, il suffit d'un reniflement pour détecter les microbes de la machine à laver - les bactéries peuvent dégrader le détergent et les matières organiques sur les vêtements pour générer une odeur désagréable.

Ce qui peut être fait ?
Pour les lave-vaisselle et les lave-linge, l'augmentation de la température du cycle de lavage peut aider à contrôler la contamination microbienne. On peut également exécuter un cycle de «nettoyage» (sans vêtements, ni vaisselle) pour laver l'appareil. Le nettoyage manuel des pièces de la machine (par exemple, les joints et les parois en caoutchouc) périodiquement peut également prévenir l'accumulation de biofilm.

Douches
Qu'en est-il des endroits où les personnes vont se nettoyer ? Les pommeaux de douche peuvent littéralement inonder les personnes de microbes. Par exemple, les espèces mycobactériennes non tuberculeuses (MNT) se distinguent par leurs associations avec les aérosols de douche. Omniprésentes dans l'environnement, les MNT (par exemple Mycobacterium abscessus et M. avium complex [MAC]) sont couramment détectées dans l'eau de douche et des pommeaux de douche, où ils forment des biofilms. Bien que généralement inoffensives, ces espèces peuvent provoquer des maladies pulmonaires chez les personnes immunodéprimées.

Les rideaux de douche sont également recouverts de microbes. En effet, les «moisissures roses» qui se développent couramment le long des murs et des rideaux de douche est causée par deux espèces bactériennes pigmentées roses, Serratia marcescens et Aureobasidium pullalans, qui se nourrissent de résidus de savon et d'autres composés organiques qui éclaboussent autour de la douche. Oh, et ces canards en caoutchouc qui rendent l'heure du bain si amusante ? À l'intérieur, ils peuvent contenir jusqu'à 9,5 millions d'UFC bactériennes/cm2.

Ce qui peut être fait ?
La désinfection ou le remplacement régulier des pommeaux de douche, des rideaux, des jouets de bain et des tuyaux peut entraver la croissance bactérienne. Cela peut être plus important dans les maisons avec des personnes à haut risque.

Brosses à dents
Outre la douche, le brossage des dents est un élément clé des régimes d'hygiène personnelle. Les brosses à dents sont l'un des objets les plus densément colonisés de la maison. Les microbes sur les brosses à dents comprennent des taxons buccaux humains (par exemple, des espèces de Streptococcus, qui sont des membres abondants du microbiote oral), ainsi que ceux associés au microbiote cutané et à l'environnement domestique (par exemple, l'air). Des agents pathogènes comme Acinetobacter baumanii, Staphyloccocus aureus et Candida albicans ont également été détectés.

Le microbiote de la brosse à dents dépend de l'âge de la brosse à dents, du dentifrice et de la période d'utilisation, entre autres facteurs.

Ce qui peut être fait ?
Il existe des moyens de désinfecter les brosses à dents : le passage d'une brosse à dents au four à micro-ondes pendant 1 minute peut réduire la croissance bactérienne, tout comme le trempage dans du peroxyde d'hydrogène à 3% ou un rince-bouche comme la Listerine®. Le Centers for Disease Control and Prevention (CDC), cependant, a dit qu'il n'est pas nécessaire de tremper les brosses dans des solutions désinfectantes, car cela «pourrait propager des germes dans de bonnes conditions». Le mieux est de mettre les brosses à dents en position verticale pour leur permettre de sécher (un récipient fermé favorise davantage la croissance microbienne que de laisser la brosse exposée à l'air). De plus, il est recommandé de remplacer les brosses à dents tous les 3-4 mois, ou plus souvent si les poils semblent usagés.

Comment les microbes survivent-ils dans des environnements domestiques difficiles ?
Dans de nombreux espaces et outils évoqués ci-dessus, les microbes sont exposés à des produits chimiques et détergents agressifs, à des températures et à des forces mécaniques, ou à une combinaison de tous ces facteurs de stress. Comment survivent-ils ?

Les types et la gravité des facteurs de stress auxquels les microbes sont confrontés dépendent en grande partie de l'emplacement. Par exemple, les microbes présents dans le tiroir à lessive des machines à laver doivent tolérer des composés tels que l'eau de javel, les tensioactifs ou les parfums, tandis que ceux présents dans le joint de la porte doivent pouvoir survivre à des périodes fluctuantes de conditions sèches et humides et à des valeurs de pH variables. Le comportement humain compte aussi. Étant donné 90% de l'énergie utilisée par les machines à laver va au chauffage de l'eau, de plus en plus de personnes optent pour des cycles d'eau froide pour augmenter l'efficacité. Aux États-Unis, la température moyenne de lavage à l'eau froide est de 14,4°C, une forte baisse par rapport aux 40-60°C recommandés pour tuer la plupart des bactéries.

En général, la formation du biofilm est une condition essentielle à la survie microbienne dans des environnements domestiques hostiles. La matrice ue biofilm collante aide les cellules bactériennes à adhérer aux surfaces, tout en les protégeant des agressions environnementales. Par exemple, les conditions des pommeaux de douche sélectionnent probablement des espèces formant un biofilm qui peuvent résister à une pression d'eau élevée. Certains matériaux, comme le caoutchouc, un composant courant des appareils, offrent une surface favorable à la croissance du biofilm. De plus, certains microbes peuvent métaboliser les plastiques, les tensioactifs et les détergents trouvés dans ces endroits et les utiliser comme source de nutriments.

Souvent, les microbes qui se développent dans toute la maison sont aptes à faire face à de nombreux facteurs de stress simultanément. Par exemple, les espèces fongiques polyextremotolérantes (par exemple, les espèces de levures noires comme Exophiala dermititidis, une cause rare d'infections fongiques) peuvent résister à tout, des températures extrêmes aux radiations. Bien qu'ils soient présents en faible abondance dans l'environnement, ils sont généralement isolés des lave-vaisselle, ce qui souligne à quel point des conditions relativement inhospitalières sélectionnent des microbes abondants. À cette fin, il existe un lien présumé entre la polyextremotolérance et la pathogénicité opportuniste, ce qui suggère que certains des mêmes traits qui facilitent la survie microbienne permettent également la colonisation et l'infection de l'hôte. De même, les gènes bactériens de résistance aux antibiotiques, qui ont été détectés dans les siphons de douche, les joints de lave-vaisselle, les têtes de brosse à dents et d'autres endroits, sont liés aux réponses au stress. Ainsi, des conditions hostiles dans et sur les objets ménagers peuvent favoriser la croissance de bactéries résistantes aux antibiotiques.

Quels sont les risques ?
Dans cet esprit, des personnes peuvent-ils tomber malades à cause des outils qu'ils utilisent pour nettoyer ? Les preuves directes d'infections causées par le nettoyage des appareils, des espaces et des objets, en particulier dans les environnements domestiques, sont rares. Une étude a montré qu'une machine à laver de style domestique était responsable de la transmission de Klebsiella oxytoca, une bactérie qui peut causer diverses infections (par exemple, pneumonie, une bactérie qui peut causer diverses infections (pneumonie, infections de plaies et plus), chez les nouveau-nés dans une unité de soins intensifs. Lorsque la machine a été retirée, la transmission s'est arrêtée, mettant ainsi en évidence les machines à laver comme une voie de transmission potentielle pour les agents pathogènes.

De même, une épidémie d'infections causées par Saprochaete cllavata (une levure qui peut rendre malades des personnes immunodéprimées) dans un centre anticancéreux à Marseille, France, a été attribuée à un lave-vaisselle avec un chauffage défectueux, suggérant qu'il servait de «vecteur de contamination». Les éponges peuvent également propager des microbes - la contamination des éponges de cuisine par des coliformes fécaux (par exemple, E. coli) ou Staphylococcus aureus était prédictive d'autres surfaces de cuisine ayant la même contamination.

Dans le domaine de l'hygiène personnelle, une analyse de plus de 650 foyers domestiques aux États-Unis et en Europe a démontré que les régions géographiques présentant des niveaux élevés de mycobactéries pathogènes dans les pommeaux de douche résidentielles chevauchaient généralement les régions où les maladies pulmonaires à MNT étaient les plus répandues, suggérant une association possible entre les aérosols des pommeaux de douche et la manifestation de la maladie. Dans le même ordre d'idées, des chercheurs ont montré que les brosses à dents d'enfants atteints de mucoviscidose traités avec des antibiotiques pour des infections pulmonaires contenaient des agents pathogènes viables (c'est-à-dire Pseudomonas aeruginosa et S. aureus). Ils ont conclu que les brosses à dents pouvaient propager des bactéries susceptibles de déclencher de nouvelles infections dans les voies respiratoires inférieures.

Néanmoins, il convient de reconnaître que les exemples ci-dessus sont largement associatifs. La présence de microbes n'est pas intrinsèquement dangereuse, ils sont, après tout, partout. Même si des agents pathogènes opportunistes viables sont détectés, cela ne suffit pas pour déterminer leur potentiel pathogène. En fin de compte, davantage de recherches sont nécessaires pour découvrir des liens directs entre les microbes dans et sur les lieux et les outils de nettoyage à domicile et la santé humaine.

NB : Photo de l’éponge, source Pille R. Priske/Unsplash.