« La faune
urbaine peut aggraver la résistance aux antibiotiques », source CIDRAP
News.
Selon une étude publiée dans The
Lancet Planetary Health le 19 juin 2019, la faune vivant en milieu
urbain pourrait être un vecteur potentiel d'organismes résistants aux
antimicrobiens (RAM).
Des chercheurs de l’International Livestock Research Institute (ILRI)
à Nairobi, au Kenya et à l’Université de Liverpool ont constaté que la faune
urbaine en milieu urbain à Nairobi avait un lourd fardeau de bactéries cliniquement
résistantes aux antimicrobiens.
Analyse des matières
fécales de 75 espèces
L’étude a été menée au cours d'une enquête épidémiologique
sur la ville, auprès de 99 ménages sélectionnés au hasard et stratifiés en
fonction du revenu.
Au total, les chercheurs ont analysé des échantillons de
selles de 75 espèces d'animaux sauvages (849 animaux), de 13 espèces d'animaux
d'élevage (656 animaux) et de 333 prélèvements humains en 2015 et 2016.
L'équipe a cultivé Escherichia coli à
partir des spécimens et analysé un seul isolat de chaque échantillon. pour la
sensibilité à 13 antibiotiques.
En général, les animaux sauvages présentaient une faible
prévalence d'isolats de E. coli
sensibles à tous les antibiotiques testés (45 [9%] sur 485 échantillons) et une
prévalence élevée de la résistance à
plusieurs antibiotiques cliniquement pertinents (252 [52%] sur 485
échantillons), ont écrit les auteurs.
Les oiseaux, les rongeurs et les chauves-souris étaient les
animaux les plus couramment présents, et certains animaux sauvages ont montré
une résistance aux céphalosporines de troisième génération et aux
fluoroquinolones synthétiques, considérées par l’Organisation mondiale de la
Santé comme des médicaments essentiels.
« 252 (52%) des
485 échantillons prélevés sur des animaux sauvages échantillonnés à Nairobi hébergeaient
E. coli multirésistants; huit (2%) sur 485 isolats d'animaux sauvages (tous
provenant d'oiseaux) hébergeaient E. coli résistant à des agents appartenant à
au moins sept parmi les classes d’antimicrobiens testés, et E. coli qui a été isolé
d'un seul échantillon aviaire était résistant à tous les antimicrobiens testés »,
ont écrit les auteurs.
Bien que la faune dans l'étude ait montré des taux plus
élevés de RAM que le bétail et les humains, les auteurs ont indiqué que la
diversité phénotypique observée dans la faune était plus faible que chez
l'homme, le bétail ou l'environnement extérieur.
Les villes en
développement, lieux de reproduction de la RAM
Bien que l'étude n'ait montré aucune menace directe pour la
santé humaine, les résultats suggèrent des voies futures de la RAM.
Les animaux de l'étude, en particulier les rongeurs et les
oiseaux, qui étaient davantage en contact avec les déchets humains et d'animaux
d'élevage étaient plus susceptibles de résister à plusieurs antibiotiques, ce
qui suggère que les pratiques de gestion des déchets d'une ville constituent un
site d'intervention important pour lutter contre la résistance aux
antimicrobiens.
« Nous avons
tendance à penser à la RAM en termes principalement médicaux, à la mise au
point de nouveaux médicaments et à une meilleure utilisation des anciens »,
a déclaré le principal auteur Eric Fevre, dans un communiqué
de presse de l'Université de Liverpool. « Mais nous devons adopter une approche écologique pour faire face à
cette menace. Les villes urbaines peuvent y remédier en améliorant leur
planification urbaine, leur élimination des déchets et leurs pratiques
d'élevage. Cela peut contribuer à perturber les échanges de RAM entre la faune,
le bétail et les humains. »
Selon
Fevre, Nairobi est représentatif de plusieurs villes africaines en
développement, qui abritent des populations humaines en plein essor et un
mélange complexe d’élevage informel et d’espèces sauvages.
