Ventes d’antibiotiques chez les animaux destinés à l'alimentation humaine aux Etats-Unis en 2022 : À tous égards, c'est un échec complet»

«Un nouveau rapport de la FDA montre que davantage d'antibiotiques sont vendus pour les animaux destinés à l'alimentation humaine», source article de Chris Dall paru le 8 décembre 2023 dans CIDRAP News.

De nouvelles données publiées par la Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis montrent que les ventes d'antibiotiques médicalement importants destinés à être utilisés chez les animaux destinés à l'alimentation ont augmenté de 4% l'année dernière.

Le dernier rapport de synthèse du Center for Veterinary Medicine de la FDA montre que 6,2 millions de kg d'antibiotiques médicalement importants ont été vendus et distribués pour une utilisation chez le bétail (poulet, dinde, bovins, porcs, etc.) en 2022, contre 5,9 millions de kg en 2022. 2021. Les antibiotiques médicalement importants, qui sont suivis car ils sont également utilisés en médecine humaine, représentaient 56% de tous les antibiotiques vendus pour être utilisés chez les animaux destinés à l'alimentation.

La FDA note que, depuis 2015 (année record des ventes d’antibiotiques pour animaux), le volume d’antibiotiques vendus pour le bétail et la volaille aux États-Unis a chuté de 36%. Mais la totalité de la baisse des ventes s’est produite en 2016 et 2017, l’année où les nouvelles règles de la FDA mettant fin à l’utilisation d’antibiotiques médicalement importants pour stimuler la croissance sont entrées en vigueur.

Depuis 2017, les ventes d'antibiotiques ont augmenté régulièrement – une tendance qui milite en faveur d'une meilleure gestion des antibiotiques dans la production animale destinée à l'alimentation indique que la FDA n'en fait pas assez pour garantir une utilisation plus judicieuse des antibiotiques dans les élevages.

Source FDA

«Pour chaque année du plan de gestion quinquennal de la FDA de 2018, les ventes ont augmenté, et non diminué [par rapport à 2017]», a dit David Wallinga, responsable de la santé au Natural Resources Defense Council (NRDC), à CIDRAP News. «À tous égards, c'est un échec complet.»

Augmentation des ventes ajustées à la biomasse

Comme les années précédentes, les porcs représentaient le pourcentage le plus élevé des ventes d'antibiotiques médicalement importants (43%), suivis par les bovins (41%), la dinde (12%), le poulet (2%) et d'autres animaux destinés à l'alimentation (2%). Alors que moins d’antibiotiques médicalement importants ont été vendus chez le poulet en 2022, davantage ont été vendus pour les bovins (une augmentation de 4,4%), les porcs (5%) et la dinde (10%).

«Il est décevant que l'utilisation [d'antibiotiques] réapparaisse progressivement chez tous les animaux, à l'exception du poulet», a dit Gail Hansen, consultante en santé publique et vétérinaire. «Il ne semble pas y avoir d'intérêt à préserver l'efficacité des antibiotiques pour les animaux et les humains en travaillant sur des méthodes permettant de réduire le besoin d'antibiotiques.»

Près des deux tiers de tous les antibiotiques médicalement importants vendus pour la production animale étaient des tétracyclines (65%), les pénicillines représentant 10% des ventes, les macrolides 9%, les aminosides 6%, les sulfamides 5%, les lincosamides 3%, ainsi que les fluoroquinolones et les céphalosporines. chacun représentant moins de 1%. Presque toutes les classes de médicaments ont vu leurs ventes augmenter en 2022, avec en tête les lincosamides (une augmentation de 11%).

Le rapport 2022 de la FDA comprend également, pour la première fois, des données de ventes ajustées à la biomasse, qui ajustent les données brutes annuelles de ventes d'antibiotiques pour tenir compte de la masse totale (la population estimée multipliée par le poids moyen) de chaque espèce animale recevant potentiellement ces médicaments. L’ajustement de la biomasse animale permet de contextualiser les données sur les ventes d’antibiotiques en tenant compte de la taille et de la composition des populations animales, qui peuvent changer d’année en année. L’Union européenne (UE) et le Canada utilisent depuis plusieurs années des données de ventes ajustées sur la biomasse.

Selon le graphique des ventes ajustées à la biomasse du nouveau rapport, toutes les classes d'antibiotiques, à l'exception des fluoroquinolones, ont vu leurs ventes ajustées à la biomasse augmenter de 2021 à 2022, et la plupart d'entre elles ont connu des augmentations à deux chiffres.

«Cela montre vraiment que davantage d'antibiotiques sont utilisés», a dit Hansen.

La FDA dit que les données sur les ventes ne fournissent qu’une partie du tableau de l’utilisation d’antibiotiques médicalement importants dans les fermes.

«Le volume des ventes observé au fil du temps peut être un indicateur précieux des tendances du marché liées à ces produits», a indiqué l'agence dans un communiqué. «Cependant, lors de l'évaluation des progrès de la gestion actuelle des antimicrobiens en milieu vétérinaire, il est important de prendre en compte des sources d'informations supplémentaires, notamment les données sur l'utilisation réelle, les données démographiques sur les animaux, les données sur la santé animale et les données sur la résistance aux antimicrobiens.»

Mais Wallinga a dit que l'augmentation des ventes ajustées à la biomasse montre que l'intensité de l'utilisation d'antibiotiques médicalement importants dans la production animale destinée à l'alimentation est en augmentation et que les efforts de gestion échouent.

«Cela signifie que les antibiotiques sont utilisés de manière moins judicieuse et nuisent davantage à la santé publique», a dit Wallinga.

Des baisses plus importantes dans d’autres pays

L’inquiétude concernant la surutilisation d’antibiotiques médicalement importants chez les animaux destinés à l’alimentation est qu’elle contribue à un réservoir de bactéries résistantes qui pourraient réduire l’efficacité de ces antibiotiques, tant chez les animaux que chez les humains. Bien que l’utilisation d’antibiotiques pour traiter les animaux atteints d’infections bactériennes soit nécessaire à la santé et au bien-être des animaux, les antibiotiques sont également utilisés dans l’alimentation animale et dans l’eau pour prévenir les maladies, une pratique jugée inappropriée par les critiques.

Wallinga et Hansen ont tous deux noté que l’évolution de l’utilisation des antibiotiques dans les élevages américains contraste avec celle d’autres pays qui ont connu une forte baisse de l’utilisation d’antibiotiques médicalement importants chez le bétail et la volaille. Hansen dit que ces pays ont réussi en partie parce qu'ils se sont fixés des objectifs de réduction de l'utilisation d'antibiotiques vétérinaires, ce que la FDA a hésité à faire.

«Cela se fait ailleurs et cela se fait avec succès», a-t-elle dit. «Donc je ne sais pas pourquoi c'est impossible à faire ici.»

Un exemple est le Royaume-Uni, où les chiffres publiés par l’UK Veterinary Medicines Directorate en novembre ont montré que les ventes d'antibiotiques destinés à être utilisés chez les animaux destinés à l'alimentation ont chuté de 9% entre 2021 et 2022 et ont diminué de 59% depuis 2014. Wallinga et ses collègues du NRDC ont également publié un rapport plus tôt cette année montrant que l’intensité de l’utilisation d’antibiotiques dans les élevages européens a chuté de manière beaucoup plus spectaculaire que dans les élevages américains entre 2011 et 2020.

«Les États-Unis sont vraiment une exception ici, en termes d'augmentation de l'utilisation des antibiotiques», a dit Wallinga.

Une campagne de sensibilisation aux antibiotiques en Angleterre a atteint ses objectifs clés, selon une étude

«Une campagne de sensibilisation aux antibiotiques en Angleterre a atteint ses objectifs clés, selon une étude», source article de Chris Dall paru le 28 novembre 2023 dans CIDRAP News.

Une campagne médiatique en Angleterre a contribué à améliorer les connaissances sur la résistance aux antimicrobiens (RAM) et les attitudes concernant l'utilisation inappropriée des antibiotiques, selon une étude publiée la semaine dernière dans Eurosurveillance.

La campagne Keep Antibiotics Working a été la première campagne de marketing social et de communication multicanaux intégrée en Angleterre promouvant une prescription prudente des antibiotiques auprès du public et des médecins généralistes.

Le message visait à réduire les attentes des patients en matière de prescription d'antibiotiques et à aider les médecins généralistes à se sentir en confiance pour refuser les demandes de prescription d'antibiotiques lorsqu'elles sont inappropriées.

Pour évaluer l'impact de la campagne, les chercheurs ont analysé les réponses aux entretiens donnés avant et après chaque vague de publicité en 2017, 2018 et 2019.

Meilleure compréhension de l’utilisation appropriée des antibiotiques

Les entretiens ont montré que la reconnaissance suscitée par la campagne (lorsque l'on montre aux personnes interrogées le matériel de campagne et qu'on leur demande si elles le reconnaissent) était élevée, passant de 68% en 2018 à 74% en 2019, et était significativement plus élevée après 2019 chez les mères d'enfants âgés de 0 à 16 ans, un sous-groupe identifié comme l’une des cibles clés de la campagne. Le niveau de reconnaissance était plus élevé que celui constaté lors des précédentes campagnes nationales de sensibilisation aux antibiotiques.

Plus important encore, les connaissances et la compréhension des personnes interrogées sur l'utilisation appropriée des antibiotiques ont augmenté après la campagne. Le pourcentage de personnes interrogées qui ont répondu «vrai» à la question «Les antibiotiques cesseront d'agir pour vous s'ils sont pris pour les mauvaises raisons» est passé de 69,1% avant 2017 à 77,6% après 2019, tandis que ceux qui reconnaissaient que la prise d'antibiotiques lorsque vous n'en avez pas besoin vous expose, vous et votre famille, au risque d'infections résistantes aux antibiotiques est passé de 80,5% à 86,1%. En outre, la proportion de personnes se déclarant préoccupées par la RAM pour elles-mêmes ou pour leurs enfants a augmenté respectivement de 11,2% et de 6,0%, avant et après la campagne. 

La plupart des médecins généralistes ont convenu que la campagne les avait aidés à dire non aux patients qui demandaient des antibiotiques inappropriés et qu'elle réduirait la probabilité que les patients demandent des antibiotiques.

«Dans l'ensemble, l'évaluation de la campagne a montré que les principaux objectifs de la campagne ont été atteints par plusieurs changements significatifs dans les connaissances, les attitudes, les préoccupations concernant la RAM et les intentions de modifier les comportements, ce qui améliorerait l'utilisation appropriée des antibiotiques et réduirait la pression sur les médecins généralistes pour qu'ils prescrivent des antibiotiques inutiles.», ont écrit les auteurs de l’étude.

Une occasion ratée : L’utilisation des antibiotiques en médecine de ville est revenue aux niveaux d’avant la pandémie en Europe en 2022

Une baisse des usages d'antibiotiques dans les élevages français de moitié depuis 2011, de 80% depuis 1999. Un travail de fond payant a été mené.

Et pendant ce temps, les Humains continuent de les avaler sans discernement. Les prescriptions ne baissent pas en santé humaine. https://t.co/V5RudJnKwz

— Emmanuelle Ducros (@emma_ducros) November 21, 2023

«L’utilisation des antibiotiques en médecine de ville est revenue aux niveaux d’avant la pandémie en Europe en 2022», source article de Chris Dall paru le 21 novembre 2023 dans CIDRAP News.

Une analyse de la consommation communautaire d'antibiotiques en Europe montre un retour aux niveaux d'avant la pandémie de COVID-19, ont rapporté des chercheurs la semaine dernière dans Eurosurveillance.

À l'aide des données du Réseau européen de surveillance de la consommation d'antimicrobiens (ESAC-Net), une équipe dirigée par des chercheurs du Centre européen de prévention et de contrôle des maladies, a analysé la consommation d'antibactériens dans le secteur communautaire à usage systémique dans 29 pays de l'Union européenne/Espace économique européenne (UE/EEE) de 2019 à 2022.

Ils ont constaté une diminution de 18,5% de la consommation communautaire d’antibiotiques, mesurée en doses quotidiennes définies pour 1 000 habitants par jour, en 2020 par rapport à 2019. Comme dans les pays non européens, la réduction de l’utilisation communautaire d’antibiotiques a été attribuée à des facteurs non liés à la pandémie. interventions pharmaceutiques et accès perturbé aux services de santé. Les taux de consommation sont restés similaires en 2021 dans la plupart des pays de l’UE/EEE.

Cependant, en 2022, alors que les pays ont levé les interventions non pharmaceutiques, les données de l’ESAC-Net ont montré que la consommation communautaire moyenne a augmenté de 18,8% par rapport aux niveaux de 2021, puis est revenue aux niveaux d’avant la pandémie. Dans 13 pays, la consommation communautaire d’antibiotiques était plus élevée en 2022 qu’en 2019, avec une augmentation moyenne de 8,4%.

«Occasion ratée»

Les auteurs de l'étude disent que le rebond pourrait s'expliquer par une résurgence des infections virales et bactériennes à mesure que les restrictions pandémiques ont été levées, mais «pourrait également refléter une occasion ratée de renforcer et de renforcer l'utilisation prudente des antibiotiques.»

Ils ajoutent que pour atteindre l’objectif de l’UE d’une réduction de 20% de la consommation totale d’antibiotiques (secteurs communautaire et hospitalier combinés) d’ici 2030, la plupart des pays de l’UE devront intensifier leurs efforts pour réduire l’utilisation inutile d’antibiotiques.

«Les activités de gestion des antibiotiques renforçant une consommation communautaire prudente jouent [sic] un rôle essentiel à cet égard, car la consommation communautaire représente environ 90% de la consommation totale d'antibiotiques», ont-ils écrit.

Ressources sur la résistance aux antimicrobiens

Ressources sur la résistance aux antimicrobiens, source American Society for Microbiology.

L’adaptation est une conséquence naturelle de l’exposition aux antimicrobiens qui rend la résistance aux antimicrobiens (diminution de la sensibilité aux agents antimicrobiens) inévitable et irréversible. L’utilisation excessive d’agents antimicrobiens en médecine, dans la production d’animaux destinés à l’alimentation humaine et dans la protection des cultures a provoqué une résistance croissante à ces agents.

À mesure que l’efficacité des agents antimicrobiens existants diminue, les infections seront plus difficiles et plus coûteuses à traiter et les épidémies plus difficiles à contrôler. L’Organisation mondiale de la santé (OMS) prévoit la perspective terrifiante de 10 millions de décès liés à la résistance aux antimicrobiens par an dans le monde d’ici 2050.

Principales causes de la résistance aux antimicrobiens :

- Surprescription d’antimicrobiens.
- Traitement raccourci ou observance incomplète du traitement antimicrobien.
- Surutilisation des antimicrobiens dans l’élevage et la pisciculture.
- Faible contrôle des infections dans les établissements de soins de santé.
- Faible hygiène et nettoyage-désinfection
- Découverte limitée de nouveaux antimicrobiens.

Les gènes de la résistance aux antimicrobiens sont incroyablement dispersés et circulent parmi les humains, les animaux, les plantes et l'environnement, et la mise en œuvre d'une approche One Health est essentielle pour lutter contre la propagation de la résistance.

Pour aller plus loin, voir ici.

NB : résistance aux antimicrobiens = résistance aux antibiotiques

En France, on lira ce document de l’Anses, «Antibiorésistance en santé animale : bilan 2023».

Par les missions qu’elle exerce, l’Anses contribue à lutter contre l'antibiorésistance. À l’occasion de la semaine mondiale pour le bon usage des antibiotiques, l'Agence publie les données recueillies en 2022 pour :

- Le suivi des ventes de médicaments vétérinaires contenant des antimicrobiens,
- Le Réseau d’épidémiosurveillance de l’antibiorésistance des bactéries pathogènes animales (Résapath),
- Le dispositif européen de surveillance de l’antibiorésistance dans la chaîne alimentaire.

L’antibiorésistance ou comment les bactéries deviennent résistantes

«L’antibiorésistance ou comment les bactéries deviennent résistantes», source document pédagogique de l’Institut Pasteur du 16 novembre 2023.

La résistance aux antibiotiques - ou antibiorésistance - est un enjeu de santé publique majeur. Conserver l’efficacité des antibiotiques contre les bactéries passe notamment par comprendre comment ces résistances fonctionnent et comment les bactéries deviennent résistantes. Explications.

Les antibiotiques sont des médicaments qui servent à lutter contre les infections dues à des bactéries. Ils ont sauvé et sauvent encore des millions de vies chaque année, mais leur efficacité est menacée car les bactéries peuvent s’adapter et résister au traitement. On parle de résistance aux antibiotiques ou aux antibactériens. «L’antibiorésistance désigne à la fois une dynamique qui existe depuis l’utilisation des antibiotiques, mais aussi l’ensemble des mécanismes que les bactéries utilisent pour résister à ces traitements», résume Didier Mazel responsable de l’unité Plasticité du génome bactérien à l’Institut Pasteur.

Comment les résistances fonctionnent ?

Plusieurs mécanismes de résistance existent et peuvent conduire à une même insensibilité au traitement. La plupart du temps, la bactérie va soit altérer l’antibiotique lui-même, soit la molécule cible avec laquelle celui-ci réagit normalement, ce qui dans les deux cas le rend inefficace. D’autres formes de résistance moins efficaces sont connues, comme la pompe d’efflux, qui permet d’expulser l’antibiotique en dehors de la bactérie.

«La surveillance de l’antibiorésistance passe par la mesure de la fréquence des souches sensibles ou résistantes à un antibiotique, c’est-à-dire la proportion de bactéries devenues insensibles à ce médicament», poursuit Céline Loot, chercheuse dans l’unité de Didier Mazel.

Comment les bactéries deviennent résistantes ?

Quand elles sont confrontées à un antibiotique, les bactéries évoluent : les lignées résistantes se reproduisent mieux et finissent par devenir majoritaires.

Mais les nouvelles résistances se propagent bien plus vite par des mécanismes dits de «transferts horizontaux» : la résistance se transmet entre des organismes de lignées différentes, et non d’une bactérie à ses descendantes.

- La conjugaison, lorsque des bactéries se transmettent entre elles des petits morceaux de matériel génétique, appelés des plasmides, et qui peuvent porter des gènes qui fournissent des résistances. «Les plasmides peuvent se transmettre entre des genres bactériens très différents, ce qui en fait le mécanisme de transmission de résistances le plus important et celui que nous voudrions le plus contrôler», précise Céline Loot.

- La transformation naturelle, qui a lieu quand une bactérie intègre de l’ADN présent dans son environnement.

- La transduction, qui consiste en un transfert de matériel génétique entre une bactérie et un virus qui l’infecte. Ce mécanisme joue cependant un rôle mineur dans l’acquisition de résistance.

«Tout ce qui va stresser les bactéries va favoriser les transferts horizontaux, alerte Didier Mazel. C’est le cas des antibiotiques même à faible concentration, comme dans les eaux usées où l’on en trouve des traces. C’est d’autant plus le cas là où on concentre des bactéries, comme dans les biofilms, des communautés de cellules qui adhérent aux supports solides, et qui peuvent se former par exemple sur le matériel médical».

La lutte contre l’antibiorésistance, un enjeu de santé publique

- La prévention

Pour combattre l’antibiorésistance, «le plus efficace reste la prévention, souligne Céline Loot. Aujourd’hui, les foyers de la résistance sont en Asie du Sud-Est, où l’on voit une utilisation massive d’antibiotiques sans prescription médicale, qu’il faudrait limiter».

- Des alternatives aux antibiotiques actuels

«Nous sommes en quête de nouvelles molécules dont on aurait une utilisation prudente pour prévenir l’apparition de nouvelles résistances», développe la chercheuse. Les scientifiques développent aussi de nouveaux modes de traitements, «comme les bactériophages, ou rendre de nouveau la bactérie sensible à l’antibiotique. On souhaite aussi empêcher les transferts horizontaux pour limiter la dispersion des résistances. Au final, on devient très créatifs !», décrit Didier Mazel.

La recherche fondamentale reste nécessaire, puisque c’est sur ces connaissances que s’appuie le développement de nouvelles approches thérapeutiques.

ESKAPEE : sept pathogènes à surveiller

Parmi les bactéries incriminées dans l’antibiorésistance, un groupe de sept pathogènes identifiés sous le terme de bactéries ESKAPEE constitue notamment une menace sérieuse. Ce sont les bactéries résistantes qui représentent le plus un problème de santé publique selon l’OMS, et sur lesquelles la recherche se focalise. Ces bactéries sont à l’origine de nombreuses infections nosocomiales : des infections pulmonaires, urinaires ou post-opératoires, mais aussi parfois des septicémies chez les patients immunodéprimés.

- Enterococcus faecium,

- Staphylococcus aureus,
- Klebsiella pneumoniae,
- Acinetobacter baumannii,
- Pseudomonas aeruginosa,
- Enterobacter spp.,
- Escherichia coli.

France : Un journal rapporte la fable des animaux «gavés d'antibiotiques pour la rentabilité»

QUIZZ SPECIAL

Arriverez vous à deviner dans quel grand journal cette phrase a été publiée?

A: Le JDD
B: Le journal de Mickey
C: Picsou magazine
D: La gazette du sorcier pic.twitter.com/H13pImXkAf

— Dr Toudou (@DrToudou) November 15, 2023

Parce qu’en plus voyez vous, vous précisez bien « en France », « continuent d’etre gavé d’antibios », « rentabilité oblige ».

Ce qui est factuellement et grossierement faux.

A mais si si, je vous assure, c’est quelque part par là: https://t.co/kVazBCSSjY

— Dr Toudou (@DrToudou) November 15, 2023

Il existe un lien entre la vaccination contre la grippe saisonnière et une utilisation réduite des antibiotiques, selon une étude

En tant que vacciné contre la grippe, je suis très content de savoir qu’«Une étude relie la vaccination contre la grippe à une utilisation réduite des antibiotiques», source article de Chris Dall parue le 30 octobre 2023 dans CIDRAP News.

Une nouvelle étude réalisée au Japon suggère que la vaccination contre la grippe saisonnière est associée à une utilisation moins inutile d'antibiotiques chez les personnes de plus de 65 ans, ont rapporté des chercheurs la semaine dernière dans le Journal of Antimicrobial Chemotherapy.

À l'aide des données du Vaccine Effectiveness, Networking et la base de données de l’étude Universal Safety, qui comprend toutes les données sur les réclamations et les dossiers de vaccination des saisons grippales 2015-2016 à 2020-2021, des chercheurs du National Center for Global health and Medicine du Japon ont examiné l'association du statut de la vaccination avec la fréquence de prescription d'antibiotiques, la fréquence de consultation en établissement de santé, le risque d'admission à l'hôpital et le risque de décès dans la période de suivi pour la même saison (du 1er janvier au 31 mars).

Ils se sont concentrés sur les patients âgés de 65 ans et plus qui ont visité un établissement de santé souffrant d’une infection des voies respiratoires supérieures (IVRS), en comparant les patients vaccinés aux patients non vaccinés.

Taux d’hospitalisation réduit de 50%

Au total, 244  642 personnes ont participé à l’étude. Des analyses de régression de Poisson modifiées ont montré que la vaccination contre la grippe saisonnière était associée à un risque relatif (RR) plus faible pour la fréquence de prescription d'antibiotiques (RR : 0,98 ; intervalle de confiance [IC] à 95% : 0,96 à 1,0), et à un RR plus élevé pour la fréquence des visites dans les établissements de santé. visites (RR 1,12 ; IC à 95% 1,11 à 1,12), un taux d'admission plus faible (RR 0,51 ; IC à 95% 0,48 à 0,54) et un risque de décès plus faible (RR 0,39 ; IC à 95% 0,30 à 0,51).

L'analyse de 101  734 personnes avec des données de score de propension appariées dans chacun des groupes non vaccinés et vaccinés a montré que l'effet moyen du traitement de la vaccination était de −0,004 (IC à 95% de −0,006 à −0,002) pour la fréquence de prescription d'antibiotiques, de −0,005 (−0,007 à −0,004) pour la fréquence de consultation en établissement de santé, −0,001 (−0,002 à −0,001) pour le risque d'admission et 0,00 (0,00 à 0,00) pour le risque de décès.

«Nos résultats suggèrent que le vaccin contre la grippe saisonnière pourrait aider à réduire l’utilisation inappropriée d'antimicrobiens pour les IVRS, bien qu'il faille être prudent dans l'interprétation des résultats», ont écrit les auteurs de l'étude.

«Cet avantage indirect serait une autre raison de recommander la vaccination contre la grippe saisonnière à la population générale afin de renforcer les mesures de lutte contre la résistance aux antimicrobiens dans la société.»

La FDA publie un projet de lignes directrices sur les limites de durée d'utilisation des antibiotiques chez les animaux destinés à l'alimentation humaine

«La FDA publie un projet de lignes directrices sur les limites de durée d'utilisation des antibiotiques chez les animaux destinés à l'alimentation humaine», source article de Chris Dal paru le 26 septembre 2023 dans CIDRAP News.

La Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis a publié aujourd'hui un projet de lignes directrices afin définir la durée d'utilisation appropriée des antibiotiques utilisés dans l'alimentation des animaux destinés à lla production de denrées alimentaires.

Les lignes directrices visent à résoudre un problème dont des critiques disent que la FDA a négligé dans ses efforts visant à promouvoir une utilisation plus judicieuse des antibiotiques médicalement importants chez le bétail et la volaille. Environ un tiers des antibiotiques médicalement importants approuvés pour une utilisation chez les animaux destinés à l'alimentation n'ont pas de limite de durée, ce qui signifie que les éleveurs peuvent utiliser ces antibiotiques dans l'alimentation animale pendant des périodes prolongées pour prévenir les maladies - une pratique qui, selon les critiques, compense les mauvaises conditions de vie qui favorisent les maladies dans les troupeaux.

Les partisans d’une gestion plus rigoureuse des antibiotiques dans la production de viande aux États-Unis affirment que la surutilisation d’antibiotiques importants sur le plan médical dans les élevages américains favorise la résistance aux antibiotiques et menace l’efficacité des antibiotiques essentiels à la médecine humaine et vétérinaire. Certains groupes ont demandé à la FDA de limiter la durée d'utilisation des antibiotiques médicalement importants à 21 jours.

Dans un plan d'action quinquennal publié en 2018, le Center for Veterinary Medicine de la FDA a dit que l'établissement de limites de durée appropriées serait l'une de ses priorités.

Minimiser l’exposition aux antibiotiques

L'agence affirme que la portée du projet de lignes directrices est limitée aux médicaments dont l'utilisation dans l'alimentation animale est approuvée, car les antibiotiques qui ont été approuvés sous des formes non alimentaires ont déjà des durées d'utilisation correctement définies.

«L'objectif de la FDA en publiant ces lignes directrices est de fournir des recommandations spécifiques aux promoteurs de médicaments pour animaux sur la manière de réviser les conditions d'utilisation des produits (par exemple, le schéma posologique, les instructions d'utilisation) des produits concernés, si nécessaire, afin de mieux cibler quan et combien de temps un médicament peut être utilisé pour traiter, contrôler ou prévenir efficacement la ou les maladies pour lesquelles le produit est indiqué», indique le projet de lignes directrices.

Bien que le respect des directives soit volontaire, la FDA affirme que les révisions sont «destinées à assurer l'utilisation continue et efficace de ces produits tout en minimisant l'étendue de l'exposition aux médicaments antimicrobiens, soutenant ainsi les efforts visant à réduire le développement de la résistance aux antimicrobiens».

La période de commentaires publics sur le projet de lignes directrices est ouverte jusqu'au 26 décembre.

Des probiotiques meilleurs que des antibiotiques pour combattre Helicobacter pylori, c'est une idée à suivre ...

Helicobacter pylori est à l'origine de 78% des cas de cancer gastrique. Pour contrôler la bactérie, des chercheurs ont conçu des probiotiques qui sécrètent des peptides antimicrobiens guidés sélectifs ; les probiotiques ont surpassé le traitement antibiotique chez la souris. Lire l’étude parue dans Microbiology Spectrum, «Control of Helicobacter pylori with engineered probiotics secreting selective guided antimicrobial peptides».

Helicobacter pylori is the cause of 78% of gastric cancer cases. To control the bacterium, researchers engineered probiotics that secrete selective guided antimicrobial peptides; the probiotics outperformed antibiotic treatment in mice. @JournalSpectrum: https://t.co/tMY4i59J2G pic.twitter.com/usAv9fqvlX

— ASM (@ASMicrobiology) September 26, 2023

Une enquête britannique montre de faibles taux de résistance aux antimicrobiens chez E. coli dans la viande bovine et porcine

«Une enquête britannique montre de faibles taux de résistance aux antimicrobiens chez E. coli dans la viande bovine et porcine», source article paru le 9 août 2023 dans Food Safety News.

Le rapport a été réalisé par l'Animal and Plant Health Agency (APHA) sous contrat avec la Food Standards Agency (FSA).

Selon une enquête, il existe de faibles niveaux de résistance aux antimicrobiens (RAM) chez E. coli sur la viande bovine et porcine en vente au Royaume-Uni.

En 2021, 105 prélèvements de bœuf et de porc frais en vente au détail au Royaume-Uni ont été réalisés entre octobre et décembre et une recherche de E. coli a été réalisée. Lors des enquêtes précédentes, 300 prélèvements ont été analysés pendant une année. Les nombres réduits étaient dus au démarrage retardé après la sortie de l'UE et à la capacité des laboratoires.

Les isolats de E. coli sont des indicateurs utiles de la RAM. Ils sont omniprésents chez les animaux et permettent aux scientifiques de surveiller la présence de la RAM circulant généralement chez les animaux producteurs de denrées alimentaires.

Des taux de résistance trouvés

Moins de 1% des prélèvements de bœuf et 4% des prélèvements de porc possédaient des E. coli producteurs de bêta-lactamase à spectre étendu (BLSE) ou E. coli exprimant AmpC. Aucun prélèvement de viande, avant enrichissement, ne présentait de dénombrement de E. coli AmpC/BLSE supérieur aux niveaux de détection dans l'UE, ce qui indique un faible nombre de ces bactéries. Cependant, après enrichissement, un prélèvement de bœuf et quatre prélèvements de porc ont révélé E. coli résistant aux antimicrobiens. Les résultats étaient similaires à ceux des enquêtes de 2015, 2017 et 2019.

Les enzymes BLSE et AmpC confèrent une résistance aux céphalosporines. Aucun prélèvement de bœuf et de porc n'était positif pour E. coli résistant aux antimicrobiens de dernier recours, carbapénèmes ou colistine.

La plupart des prélèvements de bœuf provenaient du Royaume-Uni, mais certains provenaient d'Irlande, du Brésil, de Pologne, d'Écosse et d'Espagne. La plupart des prélèvements de porc étaient nationaux, mais d'autres provenaient d'Allemagne, du Danemark, de Belgique, d'Irlande et des Pays-Bas. Des prélèvements ont été réalisés auprès de distributeurs en Angleterre, en Écosse, au Pays de Galles et en Irlande du Nord.

Deux prélèvements de porc étaient positifs pour E. coli producteur d'AmpC et deux étaient positifs pour E. coli producteur de BLSE. L'isolat de boeuf avait un E. coli avec un phénotype exprimant AmpC + BLSE.

Étude sur la résistance aux antimicrobiens dans les aliments pour animaux de compagnie

Une autre enquête recueille des données sur la résistance aux antimicrobiens des bactéries retrouvées dans des aliments crus pour chiens et chats en vente au Royaume-Uni.

Dans les cinq isolats de E. coli, une résistance a été observée à certains antibiotiques. L'isolat de bœuf était résistant à quatre antibiotiques de la famille des céphalosporines contre lesquels il a été testé (céfépime, céfotaxime, céfoxitine et ceftazidime), tandis que les isolats de porc étaient résistants à au moins deux de ces antibiotiques. Les cinq isolats de E. coli présentaient une résistance à l'ampicilline, mais pas à l'amikacine, à la témocilline ou à la tigécycline.

Les aliments crus pour animaux de compagnie ne subissent pas de traitement thermique, ce qui signifie que le produit de vente au détail final peut être contaminé par des micro-organismes, notamment des agents pathogènes et des bactéries résistantes aux antimicrobiens.

Les résultats permettront à la FSA d'identifier tout risque pour le public par contamination croisée lors du stockage et de la manipulation de ces produits.

L'enquête va consister à collecter 280 aliments pour chiens et 100 aliments pour chats en vente au Royaume-Uni de mars 2023 à février 2024. Avant d’analyser la résistance aux antimicrobiens, des prélèvements seront analysés pour la détection et le dénombrement de E. coli, Salmonella, Campylobacter, E. coli producteurs de shigatoxines et Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline associé au bétail. Le dépistage de la RAM comprendra la recherche de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE), l'AmpC, les carbapénèmes et les fluoroquinolones, ainsi que l'analyse de la résistance à la colistine et du gène MCR de résistance à la colistine.

140 autres aliments pour chiens et 50 aliments pour chats auront l'emballage écouvillonné avant de l'ouvrir et analyser les contaminants dessus. Ces données indiqueront si l'emballage des aliments crus pour chiens et chats est approprié pour empêcher l'infiltration de liquide de viande microbiologiquement contaminée pendant la décongélation et le potentiel de contamination croisée d'autres aliments et surfaces à l'intérieur de la maison.

L'American Society for Microbiology met en évidence le rôle des microbiologistes dans la lutte contre la résistance aux antimicrobiens

«L'American Society for Microbiology met en évidence le rôle des microbiologistes dans la lutte contre la résistance aux antimicrobiens», source article de Chris Dall paru le 20 juillet 2023 dans CIDRAP News.

Un document d'orientation de l'American Society for Microbiology (ASM) appelle les décideurs à donner la priorité à la science et au rôle des microbiologistes dans la lutte contre la résistance aux antimicrobiens (RAM).

L'article, publié hier, identifie les domaines dans lesquels les politiques doivent être renforcées et présente des recommandations de solutions scientifiques pour lutter contre la résistance aux antimicrobiens dans le cadre d'une seule santé (One Health). Ce faisant, l'ASM met l'accent sur le rôle des microbiologistes dans la conduite de la recherche, le développement de nouveaux médicaments et diagnostics et la promotion d'une utilisation responsable des antibiotiques.

«L’ASM a fait de la lutte contre la crise de la RAM une priorité absolue», écrit le groupe. «Nos membres du monde entier sont à l'avant-garde des efforts de lutte contre la résistance aux antimicrobiens, en étudiant comment les microbes interagissent et persistent dans les organismes vivants et l'environnement, comment ils développent une résistance et comment nous pouvons prévenir, détecter et traiter les infections résistantes aux antimicrobiens.»

Arguant que les politiques actuelles aux niveaux national et international sont insuffisantes, le groupe recommande que les décideurs politiques soutiennent et renforcent la main-d'œuvre en microbiologie dans les environnements de santé publique, de laboratoire, vétérinaire et de recherche, soutenir la recherche innovante sur la résistance aux antimicrobiens afin de mieux comprendre la science des microbes et la façon dont la résistance émerge et se propage, moderniser la collecte de données pour s'assurer que les tests et le suivi chez les humains et les animaux suivent le rythme de l'évolution des micro-organismes, et défendre les solutions qui répondent au défi du marché des antibiotiques et encouragent le développement de nouveaux antibiotiques, antifongiques et thérapies alternatives.

D'autres recommandations incluent l'amélioration des modèles de détection des agents pathogènes résistants et des épidémies dans les hôpitaux et les élevages ; favoriser la gestion responsable des antimicrobiens chez les humains, les animaux et les cultures ; accroître la capacité des laboratoires dans les pays à revenu faible et intermédiaire  et la promotion des efforts pour développer une évaluation mondiale de la résistance aux antimicrobiens.

«Alors que la résistance aux antimicrobiens augmente aux États-Unis et dans le monde, l'ASM et ses membres sont prêts à travailler avec le Congrès, les agences fédérales et les organes directeurs mondiaux pour développer une approche One Health pour faire progresser la science et la pratique afin de protéger la santé humaine et animale, l'économie et la société en général», conclut le document.

NB : L’image représente les trois composante de One Heath, source American Society for Microbiology.

Commentaire

Sans polémique aucune, je pense que si l’Anses embauchait plus de microbiologistes que de sociologues, l’Anses se porterait beaucoup mieux …

Une étude américaine montre une augmentation des infections à Campylobacter résistantes aux antibiotiques

«Une étude américaine montre une augmentation des infections à Campylobacter résistantes aux antibiotiques», source article de Chris Dall paru le 17 juillet 2023 dans CIDRAP News.

Une analyse des infections à Campylobacter aux États-Unis a révélé que leur incidence est restée stable ou a diminué de 2012 à 2018, mais que la résistance aux antibiotiques a augmenté, ont rapporté des chercheurs dans Open Forum Infectious Diseases.

À l'aide de données sur les infections à Campylobacter jejuni et à Campylobacter coli confirmées en laboratoire par le Foodborne Diseases Active Surveillance Network, des chercheurs des Centers for Disease Control and Prevention et des départements de la santé des États de Californie et du Tennessee ont estimé les tendances de l'incidence des infections de 2005 à 2018, en ajustant pour les changements de sexe, d'âge et de surveillance attribuables aux tests de diagnostic indépendants de la culture. Ils ont utilisé un sous-ensemble d'isolats de Campylobacter collectés par le National Antimicrobial Resistance System pour comparer les changements de résistance à l'érythromycine et à la ciprofloxacine au fil du temps.

Depuis 2012, l'incidence ajustée de Campylobacter a enregistré une variation annuelle prévue de -0,1 % (intervalle de crédibilité à 95 % [ICr], -1,1 % à 0,9 %). L'incidence était plus faible chez les hommes que chez les femmes et plus élevée chez les enfants de moins de 5 ans par rapport aux autres groupes d'âge. Parmi 2 499 dossiers liés en 2017-2018, l'âge médian des patients était de 40,2 ans, 54,8 % des patients étaient des hommes, 17,2% étaient hospitalisés et 0,2 % sont décédés.

Résistance liée aux voyages internationaux

Le pourcentage d'infections résistantes est passé de 24,5% en 2005-2016 à 29,7% en 2017-2018 pour la ciprofloxacine et de 2,6% à 3,3% pour l'érythromycine, soit des augmentations respectivement de 21% et 27%. Les personnes ayant récemment voyagé à l'étranger étaient plus susceptibles que les non-voyageurs d'avoir des isolats résistants à l'érythromycine (odds ratio ajusté [aOR], 1,7 ; intervalle de confiance à 95% [IC]. 1,3 à 2,1) et à la ciprofloxacine (aOR variait de 1,7 à 10,6 par race/ethnie).

Campylobacter est la cause la plus fréquente de maladie diarrhéique bactérienne aux États-Unis et est associée à la consommation de volaille insuffisamment cuite, au contact avec des animaux et aux voyages internationaux.

Bien que la maladie se résolve généralement sans antibiotiques, les auteurs de l'étude notent que la résistance croissante est préoccupante car le traitement antibiotique peut raccourcir les symptômes et sauver la vie en cas d'infections graves.

«L'évaluation de l'utilisation des antimicrobiens et des pratiques de prévention des infections pourrait aider à identifier des moyens de réduire les infections résistantes à Campylobacter», ont-ils écrit. «Avant de commencer un traitement empirique, les cliniciens doivent tenir compte des facteurs de risque du patient (y compris les antécédents de voyage) et envisager de commander des tests de diagnostic de confirmation avec des tests de sensibilité aux antibiotiques pour guider le traitement si indiqué.»

NB : La photo est du CDC.

Vision mondiale des déterminants des résistances aux antibiotiques

«Vision mondiale des déterminants des résistances aux antibiotiques», source communiqué de l’Institut Pasteur du 11 juillet 2023.

Résumé

Pour comprendre les principaux déterminants de la dynamique mondiale de la résistance aux antibiotiques, des scientifiques de l’Institut Pasteur, de l’Inserm et des universités de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines et de Paris-Saclay ont développé un modèle statistique grâce à une analyse spatio-temporelle de grande ampleur. En utilisant la base de données de suivi de l’antibiorésistance ATLAS, ce modèle a mis en évidence des différences importantes de tendances et de facteurs associés en fonction des espèces de bactéries et des résistances à certains antibiotiques. Par exemple, la bonne qualité du système de santé d’un pays est associée à de faibles niveaux d’antibiorésistance chez toutes les bactéries à Gram négatif* étudiées ; des températures élevées sont à l’inverse associées à des forts niveaux d’antibiorésistance chez les Entérobactéries. De façon inattendue, la consommation d’antibiotique nationale n’est pas corrélée à la résistance chez la majorité des bactéries testées. Ces résultats suggèrent que les mesures de contrôle de l’antibiorésistance doivent s’adapter au contexte local et aux combinaisons bactéries-antibiotiques ciblées. Les résultats de cette étude ont été publiés dans la revue The Lancet Planetary Health le 10 juillet 2023.

La résistance aux antibiotiques ou l’antibiorésistance constitue aujourd’hui l’une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale. Ce phénomène est naturel mais le mauvais usage des antibiotiques y contribue en sélectionnant les résistances et complexifie la lutte contre les infections bactériennes. Une surveillance mondiale de l’antibiorésistance est en place, notamment sous l’égide de l’OMS, et de nombreuses bases de données ont été créées pour répertorier chaque apparition d’antibiorésistance dans le monde, et pouvoir à terme bien comprendre ce phénomène pour mieux lutter contre. Il n’existe pas une résistance aux antibiotiques mais plusieurs, très dépendantes des espèces bactériennes. Une étude récente a estimé qu’en 2019, 1,27 millions de décès dans le monde résultaient de la résistance aux antibiotiques et 4,95 millions y étaient associés.

Pour définir les principaux facteurs associés à la dynamique de l’antibiorésistance au niveau mondial, une équipe de recherche pluridisciplinaire à l’Institut Pasteur a développé un modèle statistique et analysé les données d’antibiorésistance de la base ATLAS, données collectées  depuis 2004 dans plus de 60 pays sur les cinq continents. Les scientifiques ont analysé les données en testant un grand nombre de déterminants afin de faire émerger les principaux facteurs de l’antibiorésistance et de comprendre leur association avec les dynamiques observées au niveau mondial. «Des équipes de recherche étudient comment l’antibiorésistance émerge au sein d’une bactérie dans une boite de Petri ou encore chez un individu… mais il manque aujourd’hui cette vue d’ensemble au niveau populationnel et mondial afin de pouvoir étudier les liens, en fonction des espèces de bactéries pathogènes, entre la résistance et certains facteurs comme la qualité d’un système de santé national. Pour comprendre la dynamique de l’antibiorésistance, il est nécessaire d’étudier toutes les échelles. C’est ce que cette étude propose», explique Eve Rahbe, chercheuse doctorante au sein de l’unité Epidémiologie et modélisation de la résistance aux antimicrobiens à l’Institut Pasteur et première auteure de l’étude.

L’étude a consisté dans un premier temps à sélectionner des facteurs pertinents pouvant influer sur les dynamiques d’antibiorésistance. «Si certains facteurs biologiques sont connus, il était important pour nous d’évaluer également des hypothèses associées à des facteurs socio-économiques et climatiques», continue la chercheuse. Au total, 11 facteurs ont été retenus, notamment la qualité du système de soins (indice GHS), la consommation d’antibiotiques et la richesse du pays (indice PIB), ainsi que des données sur les voyages et des variables climatiques. Puis, des modèles statistiques ont été élaborés pour étudier les associations potentielles entre les données ATLAS et les facteurs retenus.

L’analyse des données au niveau mondial sur la période 2006-2019 a d’abord mis en évidence une augmentation de la résistance aux carbapénèmes chez plusieurs espèces, alors que les tendances restent stables mondialement pour les autres résistances. De plus, cette étude a démontré que les dynamiques et les facteurs associés à l’antibiorésistance sont dépendants des combinaisons bactéries-antibiotiques. Cependant, de façon surprenante, la consommation nationale d’antibiotiques n’est pas associée significativement à la résistance chez la majorité des bactéries testées (sauf pour la consommation de quinolones pour les Escherichia coli et Pseudomonas aeruginosa résistantes aux quinolones ou encore la consommation de carbapénèmes chez Acinetobacter baumannii résistantes aux carbapénèmes).

A contrario la bonne qualité du système de santé d’un pays est associée à de faibles niveaux d’antibiorésistance chez toutes les bactéries à Gram négatif* testées. Les températures élevées sont, elles, associées à des forts niveaux d’antibiorésistance mais chez les Entérobactéries uniquement (Escherichia coli et Klebsiella pneumoniae).

« Cette étude met en évidence la diversité des déterminants conduisant à l’antibiorésistance de différentes bactéries pathogènes au niveau mondial, et la nécessité d’adapter les approches de contrôle de la résistance au contexte local (pays, contexte de transmission) et à la combinaison bactérie-antibiotique en question», conclut Philippe Glaser, responsable de l'unité Écologie et évolution de la résistance aux antibiotiques à l'Institut Pasteur et co-principal auteur de l’étude.

«Notre modèle statistique pourra être appliqué à d’autres bases de données, comme celle de l’OMS notamment. Une meilleure connaissance des déterminants de résistance, différents entre les pays, et probablement entre des régions d’un même pays, est essentielle et permettra d’adapter les actions de santé publique», conclut Lulla Opatowski, Professeur à l’université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines et chercheuse au sein de l’unité d’Epidémiologie et modélisation de la résistance aux antimicrobiens, co-principale auteure de l’étude.

*Les bactéries à Gram négatif sont des bactéries à deux membranes qui posent plus de problème de résistance aux antibiotiques, du fait de la perméabilité réduite de la membrane externe.

NB : L'image est du CDC.

Mise à jour du 25 juillet 2023

On lira l'artcile paru dans Le Figaro du 25 juillet 2023, «Les causes des résistances aux antibiotiques dans le monde mieux connues», par Vincent Bordenave.

La consommation globale d’antibiotiques n’est pas la cause première de résistance chez la majorité des bactéries testées. 

Potentiel thérapeutique des lysines de phages de Bacillus cereus dans les infections oculaires

Les lysines de phages sont une alternative très tendance aux antibiotiques généraux. Dans mSphere, «Therapeutic potential of Bacillus phage lysin PlyB in ocular infections», des chercheurs démontrent que la lysine de phages, PlyB, est une option thérapeutique prometteuse pour les infections oculaires à Bacillus cereus.

Résumé

Les enzymes lytiques des bactériophages (c'est-à-dire les lysines de phages) sont une alternative tendance aux antibiotiques généraux pour lutter contre la résistance croissante aux antimicrobiens. Bacillus cereus, bactérie Gram positif, provoque l'une des formes les plus graves d'infection intraoculaire, entraînant souvent une perte de vision complète. Il s'agit d'un micro-organisme intrinsèquement résistant aux β-lactamases qui est hautement inflammogène dans l'œil, et les antibiotiques ne sont souvent pas bénéfiques comme seule option thérapeutique pour ces infections cécitantes.

L'utilisation de lysines de phages comme traitement de l'infection oculaire à B. cereus n'a jamais été testée, ni rapportée. Dans cette étude, le phage lysine PlyB a été testé in vitro, démontrant la destruction rapide de B. cereus végétatif mais pas de ses spores.

PlyB était également hautement spécifique au groupe et tuait efficacement les bactéries dans diverses conditions de croissance bactérienne, y compris le corps vitreux du lapin (Vit) ex vivo. De plus, PlyB n'a démontré aucune activité cytotoxique ou hémolytique envers les cellules rétiniennes humaines ou les érythrocytes et n'a pas déclenché d'activation innée. Dans des expériences thérapeutiques in vivo, PlyB était efficace pour tuer B. cereus lorsqu'il était administré par voie intravitréenne dans un modèle expérimental d'endophtalmie et par voie topique dans un modèle expérimental de kératite. Dans les deux modèles d'infection oculaire, la propriété bactéricide efficace de PlyB a empêché les dommages pathologiques aux tissus oculaires. Ainsi, PlyB s'est avéré sûr et efficace pour tuer B. cereus dans l'œil, améliorant considérablement un résultat autrement dévastateur. Dans l'ensemble, cette étude démontre que PlyB est une option thérapeutique prometteuse pour les infections oculaires à B. cereus.

Importance

Les infections oculaires causées par Bacillus cereus résistant aux antibiotiques sont dévastatrices et peuvent entraîner la cécité avec peu d'options de traitement disponibles. Les lysines de bactériophages sont une alternative aux antibiotiques conventionnels avec le potentiel de contrôler les bactéries résistantes aux antibiotiques. Cette étude démontre qu'une lysine appelée PlyB peut tuer efficacement B. cereus dans deux modèles d'infections oculaires à B. cereus, traitant et prévenant ainsi les effets aveuglants de ces infections.

NB : L’image proposée est une illustration issue du site CRIOAc (Centre de Référence des Infections Ostéo‑Articulaires complexes) de Lyon sur les lysines de bacétriophages.