Comment les microbiomes urbains contribuent à l'écologie de la vie en ville

«Comment les microbiomes urbains contribuent à l'écologie de la vie en ville», source article de Madeleine Baron dans ASM News.

Chaque ville a un microbiome. En fait, les paysages urbains hébergent des communautés microbiennes résidentes et transitoires qui peuplent tout, du sol et de l'air aux eaux usées et à l'intérieur et à l'extérieur des bâtiments. La composition de ces communautés varie d'une ville à l'autre. Il est important de noter que les microbes citadins jouent de nombreux rôles, largement inexplorés, dans la structure et la fonction des espaces urbains et la santé de ceux qui les habitent. Une meilleure compréhension des microbiomes urbains pourrait faciliter la conception de villes avec des microbes et leur importance pour le bien-être de la ville et des citoyens.

Comme le microbiome humain se compose de consortiums microbiens habitant des régions du corps (c'est-à-dire l'intestin, la peau, les poumons, etc.), les microbiomes urbains sont un ensemble de communautés microbiennes qui occupent divers réservoirs dans les paysages urbains, des profondeurs des égouts aux sommets des bâtiments. En tant que tel, il existe plusieurs réservoirs avec des rôles connus et émergents dans la santé et le fonctionnement des villes et de leurs habitants.

Sol

Le sol est l'une des substances les plus microbiennes et les plus diversifiées de la planète, et les écologistes microbiens découvrent les merveilles du microbiome du sol depuis des décennies. Les sols urbains (en particulier ceux des espaces verts, comme les parcs) contiennent une biodiversité considérable. En fait, Central Park à New York conserve un degré de diversité microbienne comparable à celui des paysages naturels du monde entier, y compris les sols tropicaux et désertiques. Comme dans les milieux naturels, les microbes du sol remplissent des fonctions biochimiques importantes pour l'écosystème urbain, notamment en facilitant le cycle des nutriments et le stockage du carbone.

Au-delà de ces fonctions, les microbes du sol urbain peuvent affecter la santé des habitants de la ville. Il est bien établi que les interactions avec les microbes environnementaux, y compris ceux du sol, sont nécessaires au bon développement et au bon fonctionnement du système immunitaire. Les sols urbains peuvent également héberger des pathogènes issus de la contamination par les eaux usées et d'autres déchets, ainsi que de nouveaux produits naturels dérivés de microbes ayant un potentiel thérapeutique. Des gènes microbiens censés coder un certain nombre de produits naturels thérapeutiquement pertinents, y compris l'agent anticancéreux épothilone et l'antibiotique érythromycine, ont été identifiés dans les sols des parcs de la ville de New York.

Air

L'air contient des populations microbiennes transitoires dont les compositions varient en fonction de l'utilisation des terres (par exemple, quelle partie du paysage est recouverte de végétation par rapport au béton). Les microbes qui occupent les surfaces des plantes peuvent être balayés dans l'atmosphère et aider à façonner la composition d’«aérobiome». En tant que telles, les communautés bactériennes planant au-dessus des parcs urbains sont distinctes et plus diversifiées sur le plan de la composition que celles au-dessus des parkings. De plus, le type de végétation dans les zones urbaines influence la diversité des aérobiomes urbains, avec une plus grande diversité microbienne observée dans les régions riches en arbres par rapport aux zones herbeuses.

Du point de vue de la santé, des études ont établi un lien entre les aérobiomes urbains et de moins bons résultats pour la santé par rapport aux zones rurales, notamment une prévalence accrue d'affections telles que l'asthme et les allergies. Cela peut être dû à l'abondance et à la diversité microbiennes accrues dans l'air rural par rapport aux zones urbaines, bien que seules quelques études aient évalué expérimentalement le lien entre les aérobiomes ruraux et urbains et la santé humaine. Ces études suggèrent que, par rapport aux espaces urbains, les aérobiomes ruraux orientent la réponse immunitaire vers une réponse T-régulatrice et de type Th1 (cellules T helper de type 1) plutôt qu'une réponse Th2 associée à l'allergie et l'asthme. Néanmoins, il existe un plus grand besoin d'explorations mécanistes sur les facteurs qui façonnent les communautés microbiennes aéroportées et leurs effets sur les citadins.

Eaux usées

Sous les villes animées se trouvent des réseaux de canalisations d'égouts; à travers ces tuyaux s'écoulent les déchets humains, les produits chimiques et les eaux de ruissellement. Les systèmes d'égouts contiennent des consortiums microbiens qui maintiennent des taxons de communautés sources (par exemple, des microbes dérivés d'excréments humains), mais diffèrent également de ces sources, suggérant une adaptation des microbes à l'environnement nutritionnellement et chimiquement distinct du système d'égouts. 

De plus, les biofilms bactériens le long de l'intérieur des tuyaux sont uniques du point de vue de la composition des populations transitoires dans les déchets qui s'écoulent, mettant l'accent sur la diversité de l'habitat au sein du système d'égout lui-même. Notamment, les eaux usées peuvent être utilisées pour surveiller la prévalence et la propagation des microbes pathogènes, y compris le SRAS-CoV-2, ainsi que des organismes résistants aux antibiotiques. Les microbes sont également bénéfiques pour la purification des déchets ; les usines de traitement des eaux usées s'enrichissent en micro-organismes qui digèrent les boues (c'est-à-dire les eaux usées filtrées pour éliminer le sable) pour les étapes ultérieures de purification de l'eau.

Bâtiments

Les villes ne sont pas appelées «jungles de béton» pour rien, les surfaces artificielles sont les fondements de la vie urbaine. L'intérieur des bâtiments héberge des assemblages de microbes largement dérivés de l'homme, comme ceux de la peau, ainsi que ceux introduits par l'air, le sol et l'eau. Les interactions avec ces microbes peuvent conduisent principalement à l'acquisition de microbes pathogènes et bénéfiques.

L'extérieur des bâtiments, qui communique avec l'air et d'autres réservoirs, héberge des communautés microbiennes qui influencent l'intégrité structurelle de la ville. Par exemple, les bactéries oxydant les sulfures déposées sur les surfaces des bâtiments peuvent produire des acides qui dégradent les métaux, tandis que certains champignons peuvent se transformer en pierre et produire des métabolites qui causent des dommages physiques et biochimiques. D'autre part, les microbes peuvent également protéger contre une telle dégradation et destruction. Par exemple, certains microbes non corrosifs produisent des antimicrobiens qui inhibent la croissance des espèces corrosives. Une meilleure compréhension des attributs structurels et fonctionnels des communautés habitant l'environnement ‘bâti’ peut favoriser l'application de méthodes microbiologiques pour préserver l'architecture de la ville, y compris les éléments précieux comme les monuments.

Bien que chacun des réservoirs ci-dessus soit caractérisé par son propre profil microbien, le microbiome urbain dans son ensemble est un ensemble de ceux associés à son sol, son atmosphère, son eau et ses surfaces. Les communautés microbiennes au sein des réservoirs se croisent pour façonner l'écosystème microbien à l'échelle de la ville. De plus, il existe des réservoirs au-delà de ceux discutés ici, tels que les animaux et les humains, qui contribuent aux assemblages microbiens des paysages urbains.

La composition des microbiomes urbains est spécifique à la ville

Il existe des variations considérables dans la composition des microbiomes urbains à travers le monde. Des facteurs tels que l'abondance d'espaces verts et l'exposition du sol, l'architecture urbaine et la composition des eaux usées varient d'une ville à l'autre. D'autres facteurs comme la géographie et le climat influencent également le type de microbes qui survivent dans les paysages urbains. Par conséquent, aucune ville n'a le même microbiome. Lorsque les scientifiques ont effectué des analyses du microbiome sur des échantillons prélevés sur diverses surfaces dans des immeubles de bureaux à Toronto, au Canada, Flagstaff, Arizona et San Diego, Californie, ils ont découvert que chacun présentait une structure de communauté bactérienne spécifique à la ville.

Plus récemment (et à plus grande échelle), le séquençage métagénomique d'échantillons prélevés dans des stations de transport en commun dans 60 villes du monde, de Denver à Tokyo, a révélé que chaque ville avait une empreinte microbienne unique. Il est important de noter que ces empreintes n'étaient pas des reflets directs des microbiomes humains ou du sol, illustrant que le microbiome urbain dans son ensemble est plus que la somme de ses parties. De plus, les chercheurs ont identifié 750 bactéries et plus de 10 900 virus dont les séquences ne correspondaient à aucune base de données de référence, soulignant qu'une grande partie de la vie microbienne habitant les espaces urbains, et leurs implications fonctionnelles en termes de structure de la ville et de santé des résidents, restent à explorer. Cette variation microbienne offre une excellente occasion de comprendre comment l'emplacement, la conception et les opérations de la ville influencent son microbiome, ce qui pourrait donner un aperçu de la façon dont les villes peuvent façonner leur microbiome pour un avantage fonctionnel maximal.

Vers une compréhension fonctionnelle des microbiomes urbains

Les progrès technologiques ont rendu de plus en plus évidents la complexité, le dynamisme et l'importance potentielle des microbiomes urbains, et de nombreuses questions restent sans réponse. Par exemple, l'importance relative des réservoirs microbiens spécifiques (par exemple, le sol, l'air, etc.) dans le paysage urbain varie-t-elle en fonction de la ville et du temps ? Comment les populations microbiennes au sein de ces réservoirs interagissent-elles et s'influencent-elles les unes les autres ? Une meilleure compréhension de ces interactions fournirait une vision plus nuancée des réseaux microbiens complexes qui définissent les microbiomes urbains dans leur ensemble.

De plus, une grande partie de ce que l'on sait sur les microbiomes urbains provient d'analyses d'acides nucléiques microbiens (principalement bactériens) dispersés dans les espaces urbains. Bien que cette approche donne un aperçu de la composition et des fonctions potentielles des communautés microbiennes, elle fait peu pour révéler les fonctions biologiques et écologiques réelles des microbes urbains et ce qu'elles signifient pour la santé humaine. Détecter les fragments d'ADN de pathogènes, par exemple, ne signifie pas nécessairement qu'ils sont largement répandus, ou même vivants. En effet, une analyse métagénomique du métro de New York a détecté Yersinia pestis et Bacillus anthracis (bactéries respectivement responsables de la peste et de la fièvre charbonneuse), bien que l'absence de cas signalés de peste ou de fièvre charbonneuse dans la ville suggère que ces pathogènes ne posent pas de problème de risque net pour la santé humaine. En fin de compte, obtenir des informations phénotypiques sur les communautés microbiennes urbaines, couplées à des enquêtes approfondies sur si et comment elles interagissent avec les humains et les infrastructures, permettrait de faire la lumière sur le rôle et l'utilisation potentielle de ces microbes dans la modulation de la santé de nos villes.

Il existe même un classement des villes en France où la présence des restaurants rapides est la plus élevée

Selon le SNARR, syndicat national de l’alimentation et de la restauration rapide,

La restauration rapide se distingue des autres formes de restauration (restaurants traditionnels, cafétérias, cafés-restaurants...) par trois spécificités :

• paiement au comptoir avant consommation, ce qui la différencie de la restauration traditionnelle,
• utilisation de vaisselle et de conditionnements jetables, ce qui la différencie des cafétérias,
• liberté de consommer sur place, d’emporter ou de se faire livrer.

Mais on apprend que restauration rapide peut aussi signifier Junk food ou malbouffe en Français … il y a donc du travail pour remonter la pente ...

Flashs s'associe au site Acontrecorps.com, jeune média santé et bien-être, afin de réaliser un nouvel état des lieux de la Malbouffe au sein des 32 plus grandes villes françaises.

Ainsi, chaque année depuis 2016, nous avons minutieusement répertorié toutes les plus grandes chaînes de restaurations rapides au sein des plus grandes villes de France. Objectif étant d'alerter sur le gain de terrain des géants de la malbouffe et d'inciter les métropoles à répondre et de trouver des solutions concernant ce mode d'alimentation, principal vecteur d'obésité chez les jeunes.

Cette dernière phrase en dit long sur l’incapacité à limiter ce type de restauration ...

Il s’agit donc du Classement malbouffe 2021 : l’impact de la pandémie sur les comportements alimentaires en France.

L'étude

Pour cette nouvelle année, l'étude a été une nouvelle fois réalisée sur les 16 chaînes de restauration rapide les plus présentes au sein des 32 plus grandes villes françaises.

Nous retrouvons ainsi, cette année encore, les chaînes les plus populaires; McDonald's, Burger King et Quick (toujours séparés cette année malgré la fusion progressive), KFC, Paul, La Brioche Dorée, Domino's Pizza, Subway, La Mie Câline, Starbucks, La Croissanterie, Pizza Hut, Pomme de Pain, O'Tacos, Bagelstein et Speed Burger. 

Cette année encore, c'est Bordeaux qui domine ce classement de la Malbouffe, avec un ratio de densité de fast-foods pour 1000 habitants, égal à 0,1959 contre 0,1724 pour Tours, qui se hisse cette année à la seconde marche du podium. 

6ème du classement l'an dernier, Tours a vu son nombre de fast-foods augmenter: 0,1611 en 2020 contre 0,1724 pour 1000 habitants en 2021. Une différence de ratio qui s'explique notamment par l'ouverture de trois nouveaux O'Tacos et la fermeture d'un restaurant Quick.

Metz, 3ème l'an dernier, conserve cette année sa place sur la dernière marche du podium. Devant Limoge 2ème l'an dernier, qui descend à la 4ème place, Lille et Brest, respectivement 7ème et 5ème l'an dernier.

Si je peux me permettre, ce classement est biaisé car, à mon sens, il manque un acteur important de la restauration rapide ou de la malbouffe, comme on voudra, ce sont les points de vente kebabs !

Ainsi, selon ce site,

Le kebab, l’un des sandwichs les plus consommés en France, serait en réalité le pire plat de restauration rapide, a affirmé un nutritionniste. Outre un énorme apport calorique, c’est la viande elle-même qui présenterait des risques pour la santé, au point que McDonald’s et autres fast-foods constituent des alternatives plus saines.

Nouveauté aussi, à mon sens, qui n’a pas été étudié, dans ce classement la malbouffe végétarienne ...

Cela étant, regardez le classement de votre ville préférée en consultant l’étude ...

COVID-19: Le rôle clé du masque mis en évidence dans une récente méta-analyse

Selon un article parue dans la revue The Lancet, la distance physique, le port du masque et la protection oculaire sont des éléments clés pour la prévention du COVID-19.

Le choix de divers mécanismes de protection respiratoire, y compris les masques et les masques respiratoires, a été un problème épineux, dans la pandémie H1N1 de 2009 à l'épidémie d'Ebola en Afrique de l'Ouest en 2014, jusqu'à la pandémie actuelle du COVID-19.

Les directives COVID-19 publiées par l'OMS, les Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis et d'autres agences ont été cohérentes quant à la nécessité d'une distance physique de 1 à 2 m, mais contradictoires sur la question de la protection respiratoire avec un masque facial ou un masque respiratoire.

Cet écart reflète des preuves incertaines et aucun consensus sur le mode de transmission du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2). Pour la protection des yeux, les données sont encore moins certaines. D'où conséquent, un examen systématique et une méta-analyse par Derek Chu et ses collègues publiée dans The Lancet est une étape importante dans notre compréhension de l'utilisation des équipements de protection individuelle (EPI) et de la distance physique pour le COVID-19.

Aucun essai contrôlé randomisé n'était disponible pour l'analyse, mais Chu et ses collègues ont systématiquement examiné 172 études observationnelles et synthétisé rigoureusement les preuves disponibles de 44 études comparatives sur le SRAS, le syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS), COVID-19 et les bêtacoronavirus qui causent ces maladies.

Les résultats ont montré une réduction du risque de 82% avec une distance physique de 1 m dans les établissements de santé et les milieux communautaires. Chaque 1 m supplémentaire de séparation a plus que doublé la protection relative, avec des données disponibles jusqu'à 3 m. Ces preuves sont importantes pour étayer les directives communautaires sur la distance physique et montrent que la réduction des risques est réalisable par la distance physique. De plus, cette découverte peut éclairer la levée des restrictions sociétales et des moyens de rassemblement plus sûrs dans la communauté.

La règle de la distance de 1 à 2 m dans la plupart des directives hospitalières est basée sur des résultats obsolètes des années 40, avec des études de 2020 montrant que de grosses gouttelettes peuvent voyager jusqu'à 8 m.

La séparation des gouttelettes et de la transmission aéroportée est probablement quelque peu artificielle, les deux voies faisant probablement partie d'un continuum pour les infections respiratoires transmissibles.

La protection contre les infections présumées par gouttelettes par l'utilisation de respirateurs, mais pas de masques, prend en charge un continuum plutôt que des états discrets de gouttelettes ou de transmission aéroportée. Des études expérimentales et hospitalières ont montré des signes de transmission par aérosol du SRAS-CoV-2.

Une étude a trouvé un virus viable dans l'air 16 h après aérosolisation et a montré une plus grande propension aéroportée au SARS-CoV-2 par rapport au SARS-CoV et au MERS-CoV.

Chu et ses collègues ont rapporté que les masques et les masques respiratoires réduisaient le risque d'infection de 85%, avec une plus grande efficacité dans les milieux de santé que dans la communauté. Ils attribuent cette différence à l'utilisation prédominante de masques N95 (FFP2) dans les établissements de santé que dans la communauté; dans une sous-analyse, les masques respiratoires étaient efficaces à 96% par rapport aux autres masques, qui étaient efficaces à 67%. L'autre constatation importante pour le personnel de santé par Chu et ses collègues est que la protection oculaire a entraîné une réduction de 78% de l'infection; une infection par voie oculaire peut survenir par transmission par un aérosol ou auto-inoculation.

Pour les personnels de santé dans les locaux COVID-19, un masque respiratoire devrait être la norme minimale de soins. Cette étude réalisée par Chu et ses collègues devrait inciter à revoir toutes les lignes directrices recommandant un masque médical pour les agents de santé s'occupant de patients COVID-19. Bien que les masques médicaux protègent, la santé et la sécurité au travail des agents de santé devraient être la priorité absolue et le principe de précaution devrait être appliqué. Les infections évitables chez les personnels de santé peuvent entraîner non seulement des décès, mais aussi la mise en quarantaine de nombreux personnels de santé et des éclosions nosocomiales. Dans les établissements du National Health Service au Royaume-Uni, jusqu'à un personnel de santé sur cinq a été infecté par le COVID-19, ce qui est un risque inacceptable pour les personnels de première ligne. Pour répondre aux pénuries mondiales d'EPI, les pays devraient assumer la responsabilité de l'augmentation de la production plutôt que de s'attendre à ce que les personnels de santé travaillent dans des EPI sous-optimaux.

Chu et ses collègues signalent également que les masques respiratoires et les masques multicouches sont plus protecteurs que les masques monocouches. Cette découverte est vitale pour informer sur la prolifération des modèles de masques en tissu faits maison, dont beaucoup sont à une seule couche. Un masque en tissu bien conçu doit avoir un tissu résistant à l'eau, plusieurs couches et un bon ajustement facial.

Cette étude prend en charge l'utilisation universelle des masques, car les masques étaient tout aussi efficaces dans les établissements de santé que dans les milieux communautaires lorsqu'ils étaient ajustés pour le type d'utilisation du masque.

Une preuve croissante pour la transmission présymptomatique et asymptomatique de SARS-CoV-2 prend également en charge l'utilisation universelle du masque et la distanciation. Dans les régions à forte incidence de COVID-19, l'utilisation d'un masque universel combinée à une distance physique pourrait réduire le taux d'infection (aplatir la courbe), même avec des masques légèrement efficaces.

L'utilisation d'un masque universel pourrait permettre de lever en toute sécurité les restrictions dans les communautés cherchant à reprendre leurs activités normales et pourrait protéger les personnes dans des lieux publics surpeuplés et au sein des ménages. Les masques portés dans les ménages de Pékin, en Chine, ont empêché la transmission secondaire du SRAS-CoV-2 s'ils étaient portés avant l'apparition des symptômes du cas index.

Enfin, Chu et ses collègues réitèrent qu'aucune intervention n'est totalement protectrice et que des combinaisons de distanciation physique, d'utilisation de masques faciaux et d'autres interventions sont nécessaires pour atténuer la pandémie de COVID-19 jusqu'à ce que nous ayons un vaccin efficace. Jusqu'à ce que des données d'essais contrôlés randomisés soient disponibles, cette étude fournit les meilleures preuves spécifiques pour la prévention du COVID-19.

Porter un masque en ville pendant la pandémie de COVID-19: altruisme et solidarité. Oui au port du masque en tissu!

Je refuse aujourd’hui de recommander le port du masque pour tous et jamais le gouvernement ne l’a fait. Si nous le recommandons, ce serait incompréhensible. Les soignants en souhaitent davantage, c’est normal et c’est bien l’objectif de notre agenda de production de répondre à cette attente. »

Source Le Point du 16 avril, ‘conversation à bâtons rompus’ avec le président de la République.

« Porter un masque en ville pendant la pandémie de COVID-19: altruisme et solidarité », source article publié en ligne dans The Lancet le 6 avril 2020.

À mesure que la pandémie de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) progresse, un débat porte sur l'utilisation de masques par les personnes en ville. Nous avons précédemment souligné une certaine incohérence dans les directives initiales de l'OMS sur janvier à ce sujet.

L'OMS n'avait pas encore recommandé l'utilisation massive de masques pour les individus en bonne santé en ville (port massif du masque) comme moyen de prévenir l'infection par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) dans ses directives provisoires du 6 avril 2020.

La Public Health England (PHE) a formulé une recommandation similaire. En revanche, les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis conseillent désormais le port de masques en tissu en public et de nombreux pays, comme le Canada, la Corée du Sud et la République tchèque, exigent ou conseillent à leurs citoyens de porter des masques dans les lieux publics.

Un examen et une analyse des preuves ont soutenu le port massif du masque dans cette pandémie. Il est suggéré que l'OMS et la PHE sont en train de réexaminer la question.

Les personnes portent souvent des masques pour se protéger, mais nous suggérons qu'une raison de santé publique plus forte est le contrôle à la source pour protéger les autres contre les gouttelettes respiratoires. Cette approche est importante en raison des transmissions asymptomatiques possibles du SRAS-CoV-2.

Des autorités telles que l'OMS et la PHE n'ont jusqu'à présent pas recommandé le port massif de masque car elles suggèrent qu'il n'y a aucune preuve que cette approche prévienne l'infection par des virus respiratoires, y compris le SRAS-CoV-2.

Des recherches antérieures sur l'utilisation de masques dans des établissements autres que ceux de santé avaient principalement porté sur la protection des porteurs et étaient liées à la grippe ou à une maladie de type grippal.

Ces études n'ont pas été conçues pour évaluer le port massif de masque dans des villes entières. La recherche n'a pas non plus été effectuée pendant une pandémie lorsque la conformité du port massif de masque est suffisamment élevée pour que son efficacité soit évaluée. Mais l'absence de preuves de l'efficacité des essais cliniques sur le port massif de masque ne doit pas être assimilée à des preuves d'inefficacité. Il y a des raisons mécaniques à se couvrir la bouche afin de réduire la transmission de gouttelettes respiratoires et, en effet, le cas de la toux est basée sur ces considérations et non sur des preuves issues d'essais cliniques.

Les données sur les mesures de santé publique non pharmaceutiques, y compris l'utilisation de masques pour atténuer le risque et l'impact de la grippe pandémique, ont été examinées lors d'un atelier organisé par l'OMS en 2019; l'atelier a conclu que bien qu'il n'y ait aucune preuve d'essais d'efficacité dans la réduction de la transmission, « il existe une plausibilité mécanique pour l'efficacité potentielle de cette mesure », et il a recommandé qu'en cas de pandémie grippale sévère, l'utilisation de masques en public soit envisagée.

Rejeter une intervention à faible coût comme le port massif du masque comme inefficace car il n'y a aucune preuve d'efficacité dans les essais cliniques est à notre avis potentiellement dangereux.

Une autre préoccupation est la pénurie de masques en ville. Les masques médicaux doivent être réservés aux personnels de santé. Pourtant, pour contrôler la source de l'infection plutôt que pour se protéger, nous pensons que les masques en tissu, comme recommandé par les CDC, sont susceptibles d'être adéquats, surtout si tout le monde porte un masque. Les masques en tissu peuvent être facilement fabriqués ou fabriqués à la maison et réutilisés après le lavage. Les autorités s'inquiètent également des techniques correctes de port, de retrait et d'élimination des masques faciaux, mais ces techniques pourraient être apprises grâce à l'éducation du public.

Enfin, certains craignent que le port du masque puisse engendrer un faux sentiment de sécurité par rapport à d'autres méthodes de contrôle des infections telles que la distanciation sociale et le lavage des mains. Nous ne connaissons aucune preuve empirique que le port de masques signifierait que d'autres approches de la lutte contre les infections seraient ignorées. Il est toutefois important de souligner l'importance de ce point pour le public même s'il choisit de porter des masques.

Le port massif du masque repose sur des principes de santé publique de base qui n'ont peut-être pas été suffisamment appréciés par les autorités ou le public. Premièrement, la maîtrise des méfaits à la source (port du masque) est au moins aussi importante que la réduction (lavage des mains). Les avantages du port massif du masque pour la population peuvent également être conceptualisés comme un soi-disant paradoxe de la prévention, c'est-à-dire des interventions qui apportent des avantages modérés aux individus mais qui ont de grands avantages pour la population.

Le port de la ceinture de sécurité en est un exemple. De plus, l'utilisation de masques en ville n'apportera une réduction significative du nombre de reproduction efficace que si la plupart des personnes portent un masque, ce qui s'apparente à l'immunité collective après la vaccination.

Enfin, le port du masque peut être comparé à une conduite sûre: les autres usagers de la route et les piétons bénéficient d'une conduite sûre et si tous conduisent prudemment, le risque d'accidents de la route est réduit.

La distanciation sociale et le lavage des mains sont d'une importance primordiale dans le cadre du confinement actuel. Nous suggérons que le port du masque compléterait ces mesures en contrôlant le préjudice à la source. Le port massif du masque serait particulièrement important pour la protection des travailleurs essentiels qui ne peuvent pas rester à la maison. Lorsque les gens retournent au travail, le port massif du masque pourrait aider à réduire une augmentation probable de la transmission. La Corée et Hong Kong ont réussi à limiter leurs épidémies de COVID-19 sans confinement.

Il est difficile de répartir la contribution de diverses mesures, y compris des tests, un suivi des contacts rigoureux et un isolement strict, mais l'utilisation de masques en public est universellement pratiquée dans ces deux endroits. Nous encourageons la prise en compte du port massif du masque au cours des phases à venir de la pandémie de COVID-19, qui devraient se produire en l'absence d'un vaccin efficace au COVID-19.

Enfin, cette pratique pourrait également être utile pour contrôler les futures épidémies de grippe.

Le port massif du masque pour le contrôle des sources est à notre avis un complément utile et peu coûteux à la distanciation sociale et à l'hygiène des mains pendant la pandémie de COVID-19. Cette mesure déplace l'attention de l'autoprotection vers l'altruisme, implique activement tous les citoyens et est un symbole de solidarité sociale dans la réponse mondiale à la pandémie.

En complément, on lira, Face MasksAgainst COVID-19: An Evidence Review.

... nous recommandons l'adoption du port d'un masque en tissu public, comme une forme efficace de contrôle des sources, en conjonction avec les stratégies existantes d'hygiène, de distanciation physique et de recherche des contacts. Nous recommandons que les autorités sanitaires et les gouvernements encouragent fortement l'utilisation de masques en public, y compris l'utilisation d'une réglementation appropriée.

Merci Monsieur le président de bien vouloir rendre obligatoire lors de courts déplacements de rendre obligatoire le port du masque en tissu, puisque les autres masques sont réservés aux soignants ... 

Complément du 18 avril 2019. Dans une interview au Figaro du 18 avril, la directrice générale de Santé publique de France persiste dans son aveuglement sur le port du masque en ville, elle reste alignée sur la doxa du gouvernement et du président de la République ...

A la question sur le port du masque pour le grand public, quelles sont vos recommandations ?

Nos recommandations concernent les personnels de santé, et les personnes avec des symptômes. Nous estimons que nous ne disposons pas assez d'informations assez robustes pour se prononcer pour le reste de la population, et nous étudions le sujet avec le Haut Conseil de la santé publique.

La décision est renvoyée à comité Théodule alors qu'il faut encourager le port d'un masque en ville et compris celui fait maison !!! 

Complément du 19 avril 2020. On lira le communiqué de l’Académie nationale de médecine du 18 avril 2020 : Âgisme et tensions intergénérationnelles en période de Covid-19.

Mise à jour du 30 avril 2020. La DGCCRF publie un communiqué le 29 avril 2020, Mise en vente de masques de protection dans les enseignes de la grande distribution.

Les enseignes de la grande distribution alimentaire confirment que des masques grand public (en tissu et réutilisables) et des masques à usage unique seront progressivement mis en vente, dans des magasins et drive, à partir du lundi 4 mai, avec des approvisionnements qui monteront en puissance après le 11 mai.

Avant l'heure, on ne doit pas porter un masque, mais après le 11 mai, il faudra en porter un !

Lu dans l'éditorial du Figaro du 30 avril 2020 de Vincent Trémolet de Villers,

Après les amendes pour défaut de dérogation de sortie, le secrétaire d’État aux Transports a ajouté aux souches de son carnet de contraventions une nouvelle sanction: à partir du 11 mai, les usagers des transports pourront être sanctionnés s’ils ne portent pas de masque. Le citoyen, bonne pomme, à qui l’on a expliqué que le masque ne servait à rien, puis qu’on en manquait cruellement, puis qu’il pouvait se le fabriquer lui-même, ne devrait pas être, comme les pouvoirs publics, en retard à l’allumage. Il portera son masque. Il n’en reste pas moins que la passion de l’amende comme l

Covid-19 : De la désinfection des villes, mythe ou réalité ?

On l’avait vu à la télévision,

En plus d'un confinement strict de plusieurs villes, puis de l'ensemble de la province du Hubei, il avait ainsi été décidé d'une désinfection massive des rues de certaines des métropoles, dans l'espoir de limiter la propagation du coronavirus. En Corée du Sud, c'est l'armée qui avait été dépêchée afin de participer à cette tache. 

Plusieurs villes du sud de la France ont commencé des opérations de désinfection à grande échelle. Dans l'espoir de faire reculer le coronavirus, les équipes municipales, fortement protégées, ont pour mission d'assainir les rues.

En France, cette semaine, c'est la ville de Cannes qui a mis en branle plusieurs équipes d'agents communaux, protégés par d'imposantes combinaisons, pour assainir les artères de la commune des Alpes-Maritimes.

Armés de petits diffuseurs et épaulés de camions à jet, ils ont pour mission de nettoyer le mobilier urbain à l'aide d'une solution mélangeant eau et eau de Javel (à hauteur de 3%). Selon le maire de la ville, David Lisnard, qui a appliqué le principe de précaution, des désinfections pourraient durer plusieurs semaines.

Je ne vois pas ce que vient faire ici le principe de précaution. Je pense que cette mesure est là pour dire qu’on fait quelque chose, mais quoi précisément, je ne sais pas ...

Le plus souvent l’opération de nettoyage et de désinfection, qui est sensée lutter contre le Covid19 dans les rues, est menée le plus souvent à la demande de la population pour tenter de rassurer les riverains.

Selon France bleu Drôme, 

… l'efficacité de cette méthode pour lutter contre la propagation du virus n'est pas prouvée à ce stade. La technique a déjà été utilisée en Chine et en Corée du Sud, « mais on manque de recul pour savoir si cela fonctionne. Il en va de même pour la recherche médicamenteuse : nous avons besoin de faire des tests. Mais c'est un coup d'essai qui vaut le coup d'être fait », résume-t-il.

Le gouvernement ne s'est pas prononcé sur l'utilité de la pulvérisation de virucide en extérieur. En revanche, en ce qui concerne le nettoyage du domicile, l'Etat a recommandé l'utilisation de l'eau de Javel pour purifier les surfaces des cuisines ou salles de bains. A Romans, l'opération de désinfection des espaces publics sera renouvelée dès la semaine prochaine. 

La plupart des scientifiques consultés restent septiques face à cette mesure, en revanche, nettoyer et désinfecter les surfaces chez soi dans les appartements et les maisons a une réelle utilité face au COVID-19, comme le rappelle l’Anses dans « Comment nettoyer des surfaces potentiellement contaminées ? »

Afin de nettoyer des surfaces potentiellement contaminées, il faut utiliser des produits ménagers permettant d’effacer toute trace du virus. Vous pouvez utiliser par exemple l’alcool à 70°C qui est très efficace, pour désinfecter les poignées de porte, les claviers d’ordinateur ou de tablette. Si vous utilisez de l’eau de javel, utiliser ce produit avec précaution car il est fortement oxydant et caustique pour la peau, les muqueuses et les matériaux.

Le téléphone, en contact direct avec les mains et le visage, peut donc être un vecteur important de transmission du virus. Vous pouvez utiliser des lingettes désinfectantes ou de l’essuie-tout imbibé d’alcool ménager pour désinfecter l’écran du smartphone.

Selon Informations Coronavirus, le site du gouvernement, à la question, faut-il désinfecter les surfaces ?

Oui. Les produits de nettoyage et désinfectants couramment utilisés (eau de Javel, éthanol 70%...) sont efficaces contre le COVID-19. En plus du nettoyage régulier, les surfaces qui sont fréquemment touchées avec les mains doivent être nettoyées et désinfectées deux fois par jour, notamment lorsqu’elles sont visiblement souillées. Il s’agit par exemple des poignées de porte, des boutons d’ascenseur, des interrupteurs d’éclairage, des poignées de toilettes, des comptoirs, des mains courantes, des surfaces d’écran tactile et des claviers.

A suivre ...

Mise à jour du 9 avril 2020. Avis du Haut Conseil de la santé publique mis en ligne le 7 avril 2020, Coronavirus SARS-CoV-2 : nettoyage spécifique ou désinfection de l’espace public.

Dans le cadre de la lutte contre la pandémie à Covid-19, des pays ou des villes procèdent à un nettoyage avec utilisation de produit désinfectant dans l’espace public.

Pour répondre à la question sur l’opportunité de telles mesures, le HCSP a étudié les expériences internationales et la littérature scientifique et réalisé une analyse relative au risque de contamination de la population par les espaces publics (voirie et mobilier urbain) ainsi qu’au risque lié à l’utilisation de produits détergents et désinfectants sur l’écosystème et l’environnement urbain.

Le HCSP rappelle la nécessité de l’application des mesures barrières, notamment la distanciation physique et l’hygiène des mains en cas de contacts avec les surfaces du mobilier urbain, pour la prévention de la transmission croisée du SARS-CoV-2 dans les espaces publics.

Tout en notant son impact psychologique sur la population, il recommande de ne pas mettre en œuvre une politique de nettoyage spécifique ou de désinfection de la voirie, du fait de l’absence d’argument scientifique de l’efficacité d’une telle mesure sur la prévention de la transmission du SARS-CoV-2.

Il préconise aussi de continuer d’assurer le nettoyage habituel des voiries et d’assurer le nettoyage et la désinfection à une fréquence plus régulière du mobilier urbain, avec les équipements de protection habituels des professionnels. Enfin, il recommande de ne surtout pas employer d’appareils pouvant souffler des poussières des sols de type souffleurs de feuilles.

Les bactéries forment des biofilms comme les nouveaux arrivants forment des villes

L'urbanisation fournit une analogie efficace sur la façon dont les biofilms se développent à partir de bactéries individuelles (Image Amauri J. Paula). Cliquez sur l'image pour l'agrandir.

« Les bactéries forment des biofilms comme les nouveaux arrivants forment des villes », source article de Katherine Unger Baillie, Universityof Pennsylvania.

Les microbiologistes ont depuis longtemps adopté le langage des colonies humaines pour décrire comment les bactéries vivent et se développent : elles « envahissent » et « colonisent ». Les relations vivant à proximité sont des « colonies ».

En associant la technologie d'imagerie super-résolution à un algorithme de calcul, une nouvelle étude parue dans Nature Communications confirme que cette métaphore est plus appropriée que les scientifiques ne l'ont peut-être réalisé. Les résultats montrent que, comme les bactéries individuelles se multiplient et se développent en un biofilm dense et collant, comme la communauté qui forme la plaque dentaire, leurs schémas de croissance et leur dynamique reflètent ceux observés dans la croissance des villes.

« Nous adoptons cette vision ‘au niveau satellite’, à la suite de centaines de bactéries distribuées sur une surface depuis leur colonisation initiale jusqu'à la formation d'un biofilm », explique Hyun (Michel) Koo, professeur à la Penn's School of Dental Medicine et auteur principal de l’étude. « Et ce que nous voyons, c'est que, remarquablement, les caractéristiques spatiales et structurelles de leur croissance sont analogues à ce que nous voyons dans l'urbanisation. »

Cette nouvelle perspective sur la croissance des biofilms pourrait contribuer à éclairer les efforts visant soit à promouvoir la croissance de microbes bénéfiques, soit à briser et à tuer les biofilms indésirables grâce à la thérapeutique.

L'idée de la recherche est née des conversations entre Koo; Geelsu Hwang, professeur adjoint de Penn Dental Medicine qui applique l'ingénierie aux problèmes de santé bucco-dentaire; et Amauri Paula, un physicien qui a travaillé comme professeur invité au laboratoire de Koo.

« Habituellement, lorsque des scientifiques étudient les biofilms, ils analysent une seule cellule dans un champ de vision étroit à mesure qu'elle se multiplie, cela devient un cluster puis le biofilm commence à se constituer », explique Koo. « Mais nous nous sommes demandé si nous suivions plusieurs cellules individuelles simultanément et si nous pouvions identifier certains modèles à grande échelle. »

Hwang a développé de puissants outils d'imagerie time-lapse, utilisant la microscopie confocale à balayage laser capable d'analyser la topographie de surface et de suivre les bactéries qui peuplent une surface jusqu'à la cellule individuelle en trois dimensions dans le temps. Pendant ce temps, Paula a travaillé à construire un algorithme qui pourrait analyser le comportement de cette croissance au fil du temps.

Pour leur étude, ils ont utilisé le microorganisme Streptococcus mutans, un pathogène oral responsable de provoquer des caries lorsqu'il forme un biofilm plus communément appelé plaque dentaire et libère des acides qui dégradent l'émail des dents.

Ils ont distribué les bactéries sur un matériau semblable à l'émail des dents et ont suivi des centaines de microorganismes individuels pendant plusieurs heures alors qu'ils se divisaient et grandissaient.

Dans l'ensemble, les schémas de croissance rappellent la formation de zones urbaines, a constaté l'équipe. Certains « colons » individuels se sont développés, s'étendant dans des « villages » avec de petites bactéries. Puis, au fur et à mesure que les limites des villages augmentaient et, dans certains cas, se réunissaient, ils se sont joints pour former de plus grands villages et finalement des « villes ». Certaines de ces villes ont ensuite fusionné pour former de plus grandes « mégapoles ».

Surprenant les chercheurs, leurs résultats ont montré que seul un sous-ensemble de bactéries se développait. « Nous pensions que la majorité des bactéries individuelles finiraient par croître », explique Koo. « Mais le nombre réel était inférieur à 40%, le reste mourant ou étant englouti par la croissance d'autres microcolonies. »

Ils ne s'attendaient pas non plus à un manque d'inhibition lors de cet engloutissement. Ils pensaient que, à mesure que différentes microcolonies se rencontraient, elles pourraient rivaliser, provoquant peut-être la répulsion des deux bords.

« Au lieu de cela, elles fusionnent et commencent à se développer comme une seule unité », explique Koo.

À la fois sur les bactéries individuelles et à l'échelle du biofilm, les chercheurs ont confirmé que la sécrétion semblable à une colle connue sous le nom de substances polymères extracellulaires (SPE) permettait aux bactéries de s'assembler étroitement et fermement au sein dun biofilm. Lorsqu'ils ont introduit une enzyme qui a digéré les SPE, les communautés se sont dissoutes et sont retournées à une collection de bactéries individuelles.

« Sans les SPE, ils perdent la capacité de se regrouper et de former ces ‘villes’ de manière dense », explique Koo.

Enfin, les chercheurs ont expérimenté pour voir comment l'ajout d'un « ami » ou « ennemi » microbien influencerait la croissance des bactéries d'origine. « L'ennemi » était Streptococcus oralis, une bactérie qui peut inhiber la croissance de S. mutans. Cet ajout a considérablement réduit la capacité de S. mutans à former de plus grandes « villes », comme des voisins perturbateurs qui peuvent affecter la croissance collective de la communauté.

L’« ami », la levure Candida albicans, que Koo et d'autres ont trouvé pour interagir avec S. mutans dans les biofilms et contribuer à la carie dentaire, n'a pas affecté le taux de croissance du biofilm mais a aidé à combler les microcolonies adjacentes, permettant le développement de plus grandes microcolonies « villes ».

Koo met en garde contre l'idée de pousser trop loin la métaphore de l'urbanisation de la croissance des biofilms, mais souligne les leçons utiles qui peuvent résulter de l'étude holistique du système et en examinant les événements sous des vues à la fois « rapprochées » et « à vol d'oiseau ».

« C'est une analogie utile, mais il faut en prendre et en laisser », dit Koo. « Nous ne disons pas que ces bactéries sont anthropomorphes. Mais cette perspective de la croissance des biofilms nous donne une image multidimensionnelle et multidimensionnelle de leur croissance que nous n'avons jamais vue auparavant. »