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samedi 11 septembre 2021

Des E. coli modifiés pourraient fabriquer des glucides, un carburant renouvelable, à partir du CO2

Photo d'illustration
«Des E. coli modifiés pourraient fabriquer des glucides, un carburant renouvelable, à partir du CO2», source ASM news.

Des chercheurs de l'Université de Newcastle, au Royaume-Uni, ont conçu des bactéries Escherichia coli pour capturer le dioxyde de carbone (CO2) en utilisant de l'hydrogène gazeux (H2) pour le convertir en acide formique. L’étude, publiée dans Applied and Environmental Microbiology, soulève la possibilité de convertir le CO2 atmosphérique en produits chimiques de base.

Normalement, une enzyme chez E. coli catalyse l'inverse de cette réaction : la production de H2 et de CO2 à partir d'acide formique. Dans la nature, ce dernier est surtout connu comme un type de composé du vinaigre utilisé par les fourmis pour éloigner les prédateurs (Formic vient du latin «formica», qui signifie fourmi.)

Pour inverser la réaction normale chez E. coli, les chercheurs ont fait en sorte que les bactéries remplacent le molybdène, un métal qui est normalement un élément essentiel de l'enzyme, par du tungstène, en faisant croître les bactéries en excès de ce dernier. «C'est assez facile à faire car E. coli ne peut pas facilement faire la différence entre les deux», a dit le chercheur principal Frank Sargent.

«L'échange de tungstène contre du molybdène a modifié les propriétés de notre enzyme de sorte qu'elle était verrouillée en mode de capture de CO2 plutôt que de pouvoir basculer entre la capture de CO2 et la production de CO2», a dit le Dr Sargent.

Les chercheurs ont utilisé un bioréacteur pressurisé spécial rempli de H2 et de CO2 pour rendre les gaz disponibles pour les microbes. «Cela a fonctionné - les bactéries pouvaient se développer sous la pression du gaz et générer de l'acide formique à partir du CO2», a dit le Dr Sargent.

Le Dr Sargent a développé l'idée en lisant sur l'émergence de la vie sur Terre, à la fois dans la littérature primaire et les livres de vulgarisation scientifique, a-t-il dit. Il y a trois milliards et demi d'années, il n'y avait pas d'oxygène dans l'atmosphère, mais il y avait des niveaux élevés de CO2 et de H2, et la vie cellulaire avait commencé à évoluer à 10 000 mètres sous la surface de l'océan.

À l'époque, ces composés auraient dû être convertis en glucides dont dépend toute vie. Cela aurait pu être accompli par une enzyme «comme celle que nous avons trouvée chez E. coli, hydrogénant le dioxyde de carbone en un acide organique», a dit le Dr Sargent. «Nous voulions essayer cela en laboratoire.»

«Partout dans le monde, des sociétés comprennent l'importance de lutter contre le changement climatique, de développer des sources d'énergie durables et de réduire les déchets», a dit le Dr Sargent. «La réduction des émissions de CO2 nécessitera un ensemble de solutions différentes. La biologie et la microbiologie offrent des options intéressantes.»

«L'objectif ultime serait de capturer le CO2 gaspillé à l'aide d'hydrogène gazeux renouvelable à partir de biohydrogène - comme dans cette étude - ou d'électrolyse alimentée par de l'électricité renouvelable, et de le convertir en acide formique», a dit le Dr Sargent. «La clé est qu'un microbe utilise le formiate comme seule source de carbone. Ensuite, nous pouvons fabriquer du carburant, du plastique ou des produits chimiques. C'est la vision d'une bioéconomie véritablement cyclique où le CO2 est constamment produit, capturé et renvoyé sur le marché.»


Avis aux lecteurs
Voici une liste des rappels du 10 septembre 2021, 18 produits alimentaires.
- oxyde d’éthylène: 13
- Listeria monocytogenes: 4, fromage de tête, salade traiteur, grattons et trois produits au rappel en un seul avis: pain de côte, poitrine roulée et jambons cuits.
- Salmonella: 1, bulots cuits

Total de la semaine du 6 au 10 septembre 2021: 46 produits alimentaires.
- oxyde d’éthylène: 29
Listeria monocytogenes8
- allergènes: 4
Salmonella2
- corps étrangers: 1
Bacillus cereus: 1
Escherichia coli O157: 1

vendredi 30 octobre 2020

La façon dont les grains entiers sont transformés a des effets différents sur l'accès du microbiome intestinal aux glucides des grains entiers

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La façon dont les grains entiers sont transformés (ex: ébullition, extrusion, pain au levain, pain sans levain, pain à la levure) a des effets différents sur l'accès du microbiome intestinal aux glucides des grains entiers.

Voici une étude parue dans Applied and Environmental Microbiology, article en accès libre, qui montre que la transformation a des effets différentiels sur les glucides accessibles au microbiote intestinal dans des grains entiers pendant la fermentation in vitro.

Résumé
Les grains entiers sont généralement pauvres en glucides non digestibles disponibles pour la fermentation par le microbiote intestinal ou les glucides accessibles au microbiote (ou GAM en Français, MAC pour microbiota accessible carbohydrates).

Cependant, il existe un potentiel d'augmentation des GAM dans les grains entiers grâce à la transformation des aliments.

Cinq méthodes de transformation: l'ébullition, l'extrusion, le pain au levain, le pain sans levain et le pain au levain ont été appliquées à de la farine de blé entier, puis soumises à une digestion in vitro suivie d'une fermentation à l'aide de microbiomes fécaux de 10 sujets.

Les microbiomes se sont séparés en 2 groupes: ceux qui ont montré une utilisation des glucides (UG) élevée et ceux qui ont présenté une faible UG. Le premier présentait non seulement une UG améliorée, mais aussi une production accrue de butyrate (GAM 31,1 ± 1,1% contre 19,3 ± 1,2%, P 0,001; butyrate, 5,26 ± 0,26 mM contre 3,17 ± 0,27 mM, P 0,001).
Seuls les microbiomes des groupes à haute teneur en UG ont montré des différences significatives entre les méthodes de transformation: l'extrusion et le pain au levain ont conduit à des résultats dichotomiques pour la production de GAM et d'acides gras à chaîne courte, où l'extrusion entraînait une production élevée de GAM mais une faible production de butyrate tandis que le pain au levain entraînait de faibles GAM mais une production élevée de butyrate. L'extrusion a conduit à une diminution notable de la diversité de certains membres des familles des Ruminococcaceae et des Lachnospiraceae avec des augmentations de Acinetobacter, de Enterococcus et de Staphylococcaceae.

Cette étude a démontré que seuls les microbiomes qui présentaient une UG élevée répondaient aux effets de la transformation en montrant des différences significatives entre les méthodes de transformation.

Dans ces microbiomes, l'extrusion a pu augmenter l'accessibilité des polysaccharides de la paroi cellulaire mais n'a pas augmenté la production de butyrate. En revanche, le pain au levain a conduit à une production élevée de butyrate en soutenant d'importants producteurs de butyrate dans les familles des Lachnospiraceae et des Ruminococcaceae.

Importance
Les glucides alimentaires non digestibles, ou fibres alimentaires, sont reconnus depuis longtemps pour leurs effets bénéfiques sur la santé. Cependant, des études récentes ont révélé que la fermentation d'hydrates de carbone non digestibles par les bactéries intestinales est essentielle pour la médiation de nombreuses propriétés bénéfiques pour la santé des fibres alimentaires.

Les grains entiers sont d'excellents candidats pour fournir au microbiome une source abondante de glucides non digestibles, bien que malheureusement la majorité de ces glucides dans les grains entiers ne soient pas disponibles pour les bactéries intestinales pour la fermentation.

La transformation est connue pour modifier les caractéristiques structurelles des glucides non digestibles dans les grains entiers, mais la relation entre ces effets et la fermentation microbienne intestinale est inconnue.

Cette recherche visait à combler cette lacune de recherche importante en identifiant les interactions entre la transformation des grains entiers et les bactéries intestinales, dans le but ultime d'augmenter la disponibilité de glucides non digestibles pour la fermentation afin d'améliorer la santé de l'hôte.

Mots clés
Lachnospiraceae, Ruminococcaceae, butyrate, fibres alimentaires, blé.