Etats-Unis : Les premiers résultats d'une étude nationale indiquent que la transplantation de microbiote fécal est sûre, efficace pour traiter les infections à C. difficile

 

« Les premiers résultats d'une étude nationale indiquent que la transplantation de microbiote fécal est sûre, efficace pour C. difficile », source CIDRAP News.

Les premiers résultats du registre national de la TMF (transplantation de microbiote fécal) indiquent que la TMF est très efficace pour traiter l'infection à Clostridioides difficile (ICD), avec un bon profil de sécurité sanitaire, ont rapporté des chercheurs américains dans Gastroenterology.

Le registre national de la TMF est un registre multicentrique continu, prospectif, d'observation des patients nord-américains qui reçoivent dla TMF pour toute indication, conçu pour évaluer les méthodes d'administration de la TMF, ainsi que l'innocuité et l'efficacité de la procédure. Les données sont collectées par les sites participants au départ et à 1 mois, 6 mois, 1 an et 2 ans après la procédure. Le critère de jugement principal analysé dans cette étude était la guérison de l'ICD à 1 mois. Les résultats en matière de sécurité sanitaire comprenaient les symptômes des patients, les infections, les hospitalisations, les décès et les changements des conditions médicales actuelles ou le développement de nouvelles conditions.

Sur les 259 premiers participants inscrits dans 20 sites, 222 ont terminé le suivi à 1 mois et 123 ont eu un suivi à 6 mois. Toutes les procédures ont été effectuées pour une ICD, et 249 (96%) ont utilisé des selles provenant d'un donneur inconnu, principalement une banque de selles. La principale méthode d'administration était la coloscopie (221 patients, 85%). Sur les 222 patients avec un suivi d'un mois, 200 (90%) ont eu un traitement pour une ICD, 197 (98%) n'ayant besoin que d'un seul traitement pour guérir. Parmi 112 avec une cure initiale qui ont été suivis jusqu'à 6 mois, 4 (4%) ont eu une récidive d'une ICD.

Les symptômes sévères rapportés dans le mois suivant la TMF comprenaient la diarrhée (2 patients, 5%), des douleurs abdominales (4 patients, 2%). Des hospitalisations ont été rapportées chez 27 patients (12%), mais seulement 3 hospitalisations (1%) étaient possiblement liées à la TMF. À 6 mois, de nouveaux diagnostics de syndrome du côlon irritable ont été posés chez 2 patients (1%) et de maladie inflammatoire de l'intestin chez 2 patients (1%).

« Les taux de guérison de l'ICD étaient excellents à environ 90% et en ligne avec ceux rapportés dans les [essais contrôlés randomisés de la TMF et dans un registre national de la TMF pédiatrique », ont écrit les auteurs de l'étude. « Ainsi, les patients peuvent s'attendre à obtenir des taux de succès élevés avec la TMF pour l'ICD réfractaire dans la pratique clinique standard. »

Les auteurs disent que l'évaluation des nouvelles conditions lors du suivi à long terme est prévue à mesure que le registre se développe et sera importante pour déterminer le profil complet de la sécurité sanitaire de la TMF.

NB : La photo est extraite du site de Luxia Scienfific.

Une nouvelle découverte de la biologie de C. difficile pourrait conduire à des traitements pour les infections dangereuses

Annonce : S’agissant de l’information à propos des rappels de produits alimentaires, pour le moment, il ne faut pas faire confiance à nos autorités sanitaires (Ministère de l’agriculture et DGCCRF). Ces deux entités ont fait et font toujours preuve d’une incroyable légèreté et d’un manque d’informations fiables vis-à-vis des consommateurs avec comme corollaire une absence de transparence en matière de sécurité des aliments.

« Une nouvelle découverte de la biologie de C. difficile pourrait conduire à des traitements pour les infections dangereuses », source communiqué du Mount Sinai Hospital.

Cette photo représente des colonies de Clostridium difficile après une croissance de 48 heures sur une milieu gélosé au sang; Grossissement x4,8. C. difficile, un bâtonnet anaérobie gram positif, est la cause la plus fréquemment identifiée de diarrhée associée aux antibiotiques. Il représente environ 15-25% de tous les épisodes de ce type. Crédit CDC.

Un processus appelé sporulation, qui aide la bactérie dangereuse Clostridium difficile (C. difficile) à survivre et à se propager dans des conditions inhospitalières, est régulé par l'épigénétique, des facteurs qui affectent l'expression des gènes au-delà du code génétique de l'ADN, ont rapporté des chercheurs de l’Icahn School of Medicine au Mount Sinai. C'est la première découverte que l'épigénétique régule la sporulation chez toutes les bactéries. Leur recherche, publiée le 25 novembre dans Nature Microbiology, ouvre une nouvelle voie pour mettre au point des traitements pour cette infection dévastatrice.

C. difficile infecte près d'un demi-million de personnes chaque année, provoquant une diarrhée sévère et faisant près de 10% de victimes chez les personnes de plus de 65 ans qui contractent cette maladie. Les spores de la bactérie, qui se propagent dans les selles, sont extrêmement résistantes et peuvent survivre à l’extérieur du corps pendant des semaines ou des mois, infectant ainsi les personnes en contact avec des surfaces contaminées.

Comme l’infection est si courante et dévastatrice, le génome de C. difficile a été bien étudié, mais Gang Fang, professeur de génétique et de génomique à l’Icahn Institute for Data Science and Genomic Technology du Mount Sinai et auteur principal de l'étude, dit que ses collègues et lui ont adopté une approche différente dans leurs recherches. « Nous voulions étudier au-delà du code génétique de la bactérie et examiner quelles modifications chimiques étaient apportées au génome », a déclaré le Dr Fang.

Bien que ces modifications chimiques épigénétiques, appelées méthylation, ne modifient pas la séquence d'un gène, elles peuvent modifier l'activité d'un gène particulier pour le rendre plus ou moins actif, ce qui a de profondes répercussions sur la fonction de l'organisme.

L'équipe du Dr Fang a été pionnière dans l'utilisation du séquençage de l'ADN de troisième génération pour cartographier les facteurs épigénétiques dans les bactéries et a commencé à étudier l'épigénétique de C. difficile en 2015. Premièrement, l'équipe a isolé C. difficile à partir d'échantillons fécaux de 36 patients dans l'unité de soins intensifs à l’hôpital Mount Sinai qui en avait été infecté. Ils ont analysé les échantillons et ont trouvé un motif épigénétique particulier hautement conservé dans tous les échantillons. Ensuite, ils ont vérifié environ 300 génomes de C. difficile provenant de GenBank, une banque de données de séquences génétiques gérée par le National Institutes of Health, et ont constaté que tous partageaient le même gène responsable du schéma épigénétique trouvé chez les patients en USI.

Soupçonnant que ce type de comportement épigénétique jouait un rôle crucial dans le fonctionnement de la bactérie, l'équipe du Dr Fang a collaboré à deux autres études sur la sporulation de C. difficile et sur des souris infectées par C. difficile, avec le laboratoire d’Aimee Shen, professeur de biologie moléculaire et de microbiologie à la faculté de médecine de l'Université Tufts et co-auteur principal de l'étude, et avec le laboratoire de Rita Tamayo, professeur de microbiologie et d'immunologie à l'Université de Caroline du Nord, Chapel Hill .

Dans une étude portant sur des souris, les chercheurs ont découvert que, lorsqu'ils inhibaient le gène responsable du profil épigénétique, le nombre de bactéries présentes était de 100 fois inférieures après 6 jours par rapport aux bactéries non modifiées.

Le Dr Fang affirme que les résultats de ces études soulignent l’importance de l’épigénétique dans l’étude du développement de bactéries et de médicaments pour le traitement de l’infection.

En plus d’offrir de nouvelles connaissances épigénétiques sur l’étude de C. difficile et les cibles possibles pour le développement de médicaments, le Dr Fang espère que cette recherche encouragera de nouvelles études sur les caractéristiques épigénétiques des bactéries. « Ce n'est que le début de notre compréhension de la régulation épigénétique chez les bactéries; il reste encore tant de questions à résoudre », a déclaré le Dr Fang. « Nous espérons que cette découverte passionnante encouragera de nouvelles collaborations interdisciplinaires afin d'étudier l'épigénétique des bactéries et la manière dont nous pouvons utiliser ces nouvelles connaissances pour développer des traitements anti-infectieux sauvant la vie. »

Des probiotiques associés à un risque accru d’infection à Clostridioides difficile dans une étude menée à l'hôpital de New York

« Des probiotiques associés à un risque accru d’infection à C. difficile dans une étude menée à l'hôpital de New York », source CIDRAP News.

Les patients qui ont reçu des probiotiques en même temps que des antibiotiques étaient plus susceptibles d'avoir un incident d'infection à Clostridioides difficile (IDC) que ceux qui n'ont pas reçu de probiotiques, ont annoncé des chercheurs dans l'American Journal of Infection Control.

L’étude rétrospective a analysé une cohorte de patients de l’hôpital NYU Winthrop ayant reçu au moins une dose d’antibiotiques associés à un risque élevé d’ICD, y compris des patients prenant ou ayant commencé à utiliser des probiotiques lors de l’administration des antibiotiques.

Bien qu'il soit courant dans les hôpitaux d'administrer des probiotiques en même temps que des antibiotiques sur la base de la théorie selon laquelle ils pourraient prévenir l'ICD, il existe des preuves contradictoires que les probiotiques aient ce bénéfice. Pour déterminer si les probiotiques sont efficaces dans la prophylaxie contre l'ICD, les chercheurs ont regroupé les patients en fonction de l'utilisation de probiotiques et ont examiné le lien entre l'utilisation de probiotiques et un incident d'ICD.

Sur les 3 266 patients analysés, 167 (5,1%) ont reçu des probiotiques dans les 24 heures suivant le début du traitement par antibiotiques et 216 autres (6,6%) ont reçu des probiotiques au cours de la période de suivi de 12 semaines. Un total de 150 patients (4,6%) ont présenté une ICD dans les 12 semaines suivant le début de l’administration du traitement par antibiotiques.

Parmi les patients qui ont commencé à utiliser des probiotiques au début du traitement par des antibiotiques ou avant, 9,6% ont eu un incident d’ICD dans les 12 semaines, contre 4,2% pour les non-probiotiques au début de leur traitement par des antibiotiques (risque relatif, 2,3; intervalle de confiance à 95% [ CI], 1,4 à 3,7; P = 0,001).

Dans les variables du temps dans le modèle de Cox en tenant compte de l'initiation des probiotiques et des facteurs de confusion potentiels, une association positive entre les probiotiques et l'ICD demeurait significative (ratio de risque de 2,7; IC 95%: 1,74 à 4,08; P < 0,001).

L'utilisation d'inhibiteurs de la pompe à protons et d'antagonistes des récepteurs H2 de l'histamine étaient également associée à un risque accru d'ICD, de même que l'administration simultanée de plusieurs antibiotiques. Le sexe et l'âge n'ont pas eu d'impact significatif sur l'incidence de l'ICD.

« Bien que notre découverte d'augmentation de l'ICD chez les patients prenant des probiotiques soit inattendue, les patients sont vulnérables à l'ICD lorsque leur flore intestinale est perturbée », écrivent les auteurs de l'étude. « Peut-être que de nouvelles perturbations avec diverses espèces bactériennes considérées comme protectrices sont tout aussi perturbantes et potentiellement dangereuses. »

Sur la base des résultats, les auteurs ne recommandent pas l’administration de probiotiques pour prévenir l’ICD.

Complément du 22 novembre 2019. On lira L’efficacité des "probiotiques" remise en question.