Ecoutez le podcast, Probiotic Pulverizes Pathogen Persisters.
A probiotic strain of E. coli can target and destroy pathogens that survive a treatment of antibiotics!https://t.co/OWVWODhKd4
— ASM (@ASMicrobiology) December 17, 2023
«L'hygiène, avant la microbiologie, n'est hygiénique que dans ses intentions. C'est la science des apparences qui repose entre des mains d'aveugles : est sain ce qui est beau, bon, et ne sent pas mauvais.» Pierre Darmon, L'homme et les microbes, Fayard, 1999.
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La coculture de souches probiotiques augmente leur viabilité dans l'intestin humain. Ainsi, la méthode de culture améliore la tolérance au stress des souches probiotiques, ce qui pourrait être utile pour le développement de probiotiques.
#MicrobiologyMonday: Co-culturing probiotic strains increases their viability in the human gut. Thus, culturing method improves stress tolerance of probiotic strains, which could be useful for probiotic development. #AppEnvMicro: https://t.co/29qtl60GoK pic.twitter.com/0OKXwdL097
— ASM (@ASMicrobiology) December 4, 2023
C’est une équipe française qui a les honneurs d’ASM News …
De nombreuses souches de levures ont été utilisées et sélectionnées par l'industrie alimentaire pour leur capacité à fermenter, à produire des arômes ou à produire des molécules hétérologues. Selon une nouvelle étude, deux levures utilisées pour produire des produits alimentaires auraient des effets probiotiques potentiels sur l’inflammation intestinale. L'étude, publiée dans mSystems, une revue de l'American Society for Microbiology, démontre une méthode possible pour développer de nouveaux probiotiques.
«Il y a beaucoup à apprendre en étudiant le rôle des souches de levures dans le microbiote et la santé de l'hôte, et également sur le fait que les espèces simplement utilisées dans les procédés alimentaires peuvent être la source de nouveaux probiotiques», a dit l'auteur principal de l'étude Mathias L. Richard, directeur de recherche à INRAE à l'Institut Micalis de Jouy-en-Josas, France.
À ce jour, on sait très peu de choses sur la diversité des levures d’origine alimentaire et leurs effets potentiels sur le microbiote intestinal et la santé intestinale. Les levures sont des champignons microscopiques constitués de cellules solitaires qui se reproduisent par bourgeonnement. Certaines sont utilisées depuis des centaines d'années, comme Saccharomyces cerevisiae pour la production de vin et de pain, et bien d'autres pour la production de croûtes de fromage ou l'affinage, comme Debaryomyces hansenii.
Les chercheurs ont mené cette nouvelle étude car ils travaillent à approfondir les connaissances sur l’effet potentiel du microbiote fongique sur la santé humaine. Dans cette étude particulière, l’idée était de cibler spécifiquement les levures utilisées par les entreprises agroalimentaires pour fabriquer des produits alimentaires (fromages, charcuterie). «Comme notre intérêt se porte davantage sur le rôle des levures dans la santé intestinale et sur le développement de maladies inflammatoires de l'intestin (maladie de Crohn et colite ulcéreuse), nous avons surveillé l'effet de ces levures sur des modèles in vitro et in vivo adaptés», a dit Richard.
Les chercheurs ont d’abord sélectionné des levures intensivement utilisées dans la production alimentaire et représentant un large éventail d’espèces de levures différentes, puis les ont testées soit dans des tests d’interaction simples avec des cellules humaines en culture, soit dans un modèle animal spécifique imitant la colite ulcéreuse.
Ils ont découvert que dans la collection de souches utilisées pour la production alimentaire, certaines souches peuvent avoir un effet bénéfique sur l’intestin et l’hôte dans un contexte inflammatoire. Ils ont identifié deux souches de levures, Cyberlindnera jadinii et Kluyveromyces lactis, qui avaient des effets bénéfiques potentiels sur les paramètres inflammatoires dans un modèle murin de colite ulcéreuse. Plusieurs expériences supplémentaires ont été réalisées pour tenter de déchiffrer le mécanisme à l’origine de ces effets. Dans le cas de C. jadinii, la protection semblait provenir de la modification du microbiote bactérien après l’administration de C. jadinii aux souris, ce qui a modifié la sensibilité à l’inflammation intestinale par un mécanisme encore inconnu.
«Ces deux souches n'ont jamais été spécifiquement décrites avec un effet aussi bénéfique, donc même si elles nécessitent d'être étudiées plus en profondeur, et notamment pour voir comment elles sont efficaces chez l'homme, c'est une découverte prometteuse», a dit Richard.
Les souches de C. jadinii et de K. lactis ont le potentiel en tant que souches de levure probiotiques de lutter contre l'inflammation de l'intestin, mais des études plus approfondies sont nécessaires pour comprendre les mécanismes par lesquels ces souches agissent sur la santé intestinale.
«Deux probiotiques identifiés comme traitement prometteur contre l’hypertension», source ASM News du 19 octobre 2023.
Faits saillants
On estime que 40% de la population adulte mondiale souffre d’hypertension artérielle, ce qui expose les personnes à un risque de maladies cardiovasculaires et d’autres problèmes dangereux de santé. Des études récentes suggèrent que les probiotiques pourraient avoir un effet protecteur, mais les chercheurs comprennent mal pourquoi le modelage du microbiote intestinal peut réguler la pression artérielle.
Une étude publiée mSystems ajoute deux nouvelles souches à la liste des probiotiques antihypertenseurs potentiels. Lors d'expériences chez des souris hypertendues, un traitement avec les deux probiotiques, Bifidobacterium lactis et Lactobacillus rhamnosus, a ramené la pression artérielle à des niveaux normaux. Les chercheurs ont également suivi la manière dont ces probiotiques modifiaient le mélange microbien intestinal des animaux sur 16 semaines, identifiant des microbes spécifiques et des voies métaboliques pouvant aider à expliquer l’effet protecteur.
«Des preuves accumulées soutiennent un effet antihypertenseur des probiotiques et des aliments fermentés probiotiques dans des expériences in vitro et in vivo», a dit le biologiste informatique Jun Li de la City University de Hong Kong. Son équipe a travaillé avec celle du microbiologiste Zhihong Sun de l'Université agricole de Mongolie intérieure, sur cette étude. «Nous pensions donc que l'apport alimentaire d'aliments probiotiques compléterait bien le traitement traditionnel de l'hypertension.»
Des études antérieures ont établi un lien entre l'augmentation des taux d'hypertension dans le monde et l'augmentation de la consommation de sucre. Il est probable qu’il augmente la tension artérielle par le biais de nombreux mécanismes, augmentation de la résistance à l’insuline ou de la rétention de sel, par exemple, mais ces dernières années, les chercheurs ont également étudié l’effet du sucre sur le microbiome intestinal.
Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont testé les deux souches de probiotiques sur des souris ayant développé une hypertension artérielle après avoir consommé de l'eau mélangée à du fructose. Pendant 16 semaines, ils ont mesuré la tension artérielle des animaux toutes les 4 semaines. Ils ont constaté que les souris nourries au fructose et ayant reçu l’un ou l’autre probiotique présentaient une tension artérielle significativement plus basse que celles nourries avec un régime riche en fructose et non traitées avec des probiotiques.
De plus, les chercheurs n’ont trouvé aucune différence entre les mesures de tension artérielle des souris nourries au fructose et ayant reçu des probiotiques et celles d’un groupe témoin de souris qui ne buvaient que de l’eau. Selon Li, cela suggère que les interventions probiotiques maintiendraient la tension artérielle à des niveaux normaux.
Les chercheurs ont utilisé la métagénomique shotgun pour sonder les liens entre l’altération du microbiote intestinal et le changement de la pression artérielle. Ils ont découvert qu'un régime riche en fructose chez les souris entraînait une augmentation des bactéries Bacteroidetes et une diminution des bactéries Firmicutes ; cependant, le traitement par des probiotiques a ramené ces populations à celles retrouvées dans le groupe témoin. De plus, l'analyse a identifié de nouvelles signatures microbiennes associées à la pression artérielle : des niveaux accrus de bactéries Lawsonia et Pyrolobus et des niveaux réduits de Alistipes et Alloprevotella ont été associés à une pression artérielle plus basse.
Les chercheurs prévoient actuellement un vaste essai clinique pour voir si l’effet protecteur des probiotiques s’étend aux personnes souffrant d’hypertension. «Les probiotiques présentent une voie prometteuse en médecine préventive», a dit Sun, «offrant un potentiel pour réguler l'hypertension et remodeler notre approche de la santé cardiovasculaire.»
Helicobacter pylori est à l'origine de 78% des cas de cancer gastrique. Pour contrôler la bactérie, des chercheurs ont conçu des probiotiques qui sécrètent des peptides antimicrobiens guidés sélectifs ; les probiotiques ont surpassé le traitement antibiotique chez la souris. Lire l’étude parue dans Microbiology Spectrum, «Control of Helicobacter pylori with engineered probiotics secreting selective guided antimicrobial peptides».
Helicobacter pylori is the cause of 78% of gastric cancer cases. To control the bacterium, researchers engineered probiotics that secrete selective guided antimicrobial peptides; the probiotics outperformed antibiotic treatment in mice. @JournalSpectrum: https://t.co/tMY4i59J2G pic.twitter.com/usAv9fqvlX
— ASM (@ASMicrobiology) September 26, 2023
Des chercheurs dirigés par Hiroshi Ohno du Centre Riken pour les sciences médicales intégratives (IMS) au Japon ont découvert un type de bactérie intestinale qui pourrait contribuer à améliorer la résistance à l'insuline et ainsi protéger contre le développement de l'obésité et du diabète de type 2. L'étude, publiée le 30 août dans la revue scientifique Nature, impliquait une analyse génétique et métabolique des microbiomes fécaux humains, puis corroborait des expériences sur des souris obèses.
L'insuline est une hormone libérée par le pancréas en réponse à la glycémie. Normalement, cela aide à faire pénétrer le sucre dans les muscles et le foie afin qu’ils puissent utiliser l’énergie. Lorsqu’une personne développe une résistance à l’insuline, cela signifie que l’insuline ne peut plus faire son travail et que, par conséquent, davantage de sucre reste dans son sang et son pancréas continue de produire davantage d’insuline. La résistance à l’insuline peut conduire à l’obésité, au prédiabète et au diabète de type 2 à part entière.
Nos intestins contiennent des milliards de bactéries, dont beaucoup décomposent les glucides que nous consommons alors qu’ils ne seraient pas digérés autrement. Bien que beaucoup aient proposé que ce phénomène soit lié à l’obésité et au prédiabète, les faits restent flous en raison du grand nombre de bactéries différentes et du manque de données métaboliques.
Ohno et son équipe de Riken IMS ont comblé ce manque avec leur étude approfondie et, ce faisant, ont découvert un type de bactéries qui pourrait aider à réduire la résistance à l'insuline.
Premièrement, ils ont examiné autant de métabolites qu’ils pouvaient en détecter dans les selles fournies par plus de 300 adultes lors de leurs examens de santé réguliers. Ils ont comparé ce métabolome aux niveaux de résistance à l’insuline obtenus chez les mêmes personnes. «Nous avons constaté qu'une résistance plus élevée à l'insuline était associée à un excès de glucides dans les matières fécales», explique Ohno, «en particulier des monosaccharides comme le glucose, le fructose, le galactose et le mannose».
Ensuite, ils ont caractérisé le microbiote intestinal des participants à l’étude et leur relation avec la résistance à l’insuline et les glucides fécaux. Les intestins des personnes présentant une résistance à l’insuline plus élevée contenaient plus de bactéries de l’ordre taxonomique des Lachnospiraceae que des autres ordres. De plus, les microbiomes comprenant les Lachnospiraceae étaient associés à un excès de glucides fécaux. Ainsi, un microbiote intestinal dominé par les Lachnospiraceae était lié à la fois à la résistance à l’insuline et aux selles contenant un excès de monosaccharides. Dans le même temps, la résistance à l’insuline et les niveaux de monosaccharides étaient plus faibles chez les participants dont les intestins contenaient plus de bactéries de type Bacteroidales que d’autres types.
L’équipe a ensuite cherché à observer l’effet direct des bactéries sur le métabolisme en culture puis chez la souris. En culture, les bactéries Bacteroidales consommaient les mêmes types de monosaccharides que ceux trouvés dans les selles des personnes présentant une résistance élevée à l'insuline, l'espèce Alistipes indistinctus en consommant la plus grande variété. Chez les souris obèses, l’équipe a examiné comment le traitement avec différentes bactéries affectait la glycémie. Ils ont découvert que A. indistinctus abaissait la glycémie et réduisait la résistance à l'insuline ainsi que la quantité de glucides disponibles pour les souris.
Ces résultats étaient compatibles avec les résultats obtenus auprès de patients humains et ont des implications pour le diagnostic et le traitement. Comme l'explique Ohno : «En raison de son association avec la résistance à l'insuline, la présence de bactéries intestinales Lachnospiraceae pourrait être un bon biomarqueur du pré-diabète. De même, un traitement avec des probiotiques contenant A. indistinctus pourrait améliorer l'intolérance au glucose chez les personnes atteintes de pré-diabète.
Bien que la plupart des probiotiques en vente libre ne contiennent pas actuellement les bactéries identifiées dans cette étude, Ohno appelle à la prudence s'ils deviennent disponibles. «Ces résultats doivent être vérifiés dans des essais cliniques sur l'homme avant que nous puissions recommander un probiotique comme traitement contre la résistance à l'insuline.»
Légende de l’image. L'étude a montré que des personnes dont les bactéries intestinales sont dominées par les Lachnospiraceae tendent à avoir des niveaux plus élevés de résistance à l'insuline et une teneur en monosaccharides fécaux plus élevée. Ceux qui ont plus de Bacteroidales ont tendance à avoir une résistance à l'insuline plus faible et une teneur en monosaccharides fécaux plus faible. Crédit Riken.
«Un mélange de probiotiques bloque les bactéries qui causent le syndrome du choc toxique», source ASM News du 20 juillet 2023.
Faits saillants
Le micro-organisme pathogène répandu Staphylococcus aureus peut coloniser la peau et les muqueuses dans tout le corps, en particulier le vagin et le tractus gastro-intestinal. Une souche virulente de la bactérie produit des protéines qui déclenchent le syndrome de choc toxique (SCT), une maladie caractérisée par l'apparition rapide de fièvre, une éruption cutanée révélatrice et, sans traitement, une défaillance multiviscérale. Dans le vagin, le SCT est associé à une réaction potentiellement mortelle du système immunitaire.
Les probiotiques peuvent aider à prévenir la maladie avant que la cascade de cytokines ne commence. Une étude publiée dans la revue Microbiology Spectrum de l'American Society for Microbiology rapporte que des souches de deux bactéries, Lactobacillus acidophilus et Lacticaseibacillus rhamnosus, ont inhibé avec succès la production des superantigènes responsables du SCT, lors d'expériences en laboratoire. L. acidophilus, en outre, a inhibé la croissance des souches de S. aureus qui produisent les protéines problématiques.
Une combinaison des deux pourrait à la fois empêcher la croissance et inhiber la réponse immunitaire. «C'est en quelque sorte un double coup dur contre S. aureus», a dit le microbiologiste Patrick Schlievert de l'Université de l'Iowa, Carver College of Medicine, Iowa City. «Si une toxine est fabriquée, les probiotiques préviennent l'inflammation.»
Il a noté que l'ajout de ces probiotiques aux tampons ou à d'autres produits menstruels pourrait réduire le risque, et l'incidence mondiale, du SCT associé aux menstruations. Une telle mesure préventive a le potentiel de bénéficier à des millions de personnes vulnérables, selon Schlievert. «Nous savons que 20% des personnes de plus de 12 ans ne peuvent pas fabriquer d'anticorps et ne fabriqueront jamais d'anticorps contre le syndrome de choc toxique», a-t-il dit.
Schlievert étudie le SCT et sa prévention depuis des décennies. Au début des années 1980, il a été le premier chercheur à identifier la toxine qui déclenche une réaction excessive du système immunitaire et à montrer comment les tampons à haute capacité d'absorption facilitaient la production de cette toxine en présence de S. aureus.
Le nouveau travail, a-t-il dit, a été motivé par des observations faites lors d'une étude antérieure. Il y a quelques années, lses collègues et lui ont recruté 205 femmes pour tester si un nouveau mélange moléculaire, ajouté aux tampons, inhiberait les bactéries pathogènes. Cette molécule s'est avérée efficace contre E. coli et d'autres agents pathogènes, mais les chercheurs ont remarqué une conséquence inattendue.
«Certaines des femmes du groupe traitement ont eu cette énorme croissance de Lactobacilli, a dit Schlievert.
D'autres études ont révélé que 9 de ces femmes étaient colonisées uniquement par L. crispatus et aucune autre bactérie. Dans une étude en microbiologie, a déclaré Schlievert, la colonisation par une seule bactérie est souvent considérée comme malsaine. Dans ce cas, cependant, il offrait une action efficace contre S. aureus pathogène.
Les bactéries Lactobacillus se sont déjà révélées sûres, a dit Schlievert, et les nouveaux travaux suggèrent que le traitement avec L. crispatus seul, ou L. acidophilus et L. rhamnosus en combinaison, pourrait réduire considérablement le risque de SCT chez les populations vulnérables. Les souches de S. aureus peuvent également provoquer une entérocolite, une réponse immunitaire potentiellement mortelle dans l'intestin. Les probiotiques peuvent également aider à réduire la production de protéines dangereuses pour cette maladie, a dit Schlievert.
Dans les travaux en cours et futurs, Schlievert et son équipe étudient comment utiliser les probiotiques pour prévenir les infections cutanées à staphylocoques. La peau des personnes atteintes de dermatite atopique ou de diabète de type 2 est souvent colonisée par les souches de S. aureus qui produisent des superantigènes, souvent résistants au traitement par des antibiotiques standards. Chez les patients atteints de diabète de type 2, ces superantigènes pourraient entraîner des ulcères du pied qui, s'ils ne sont pas traités avec succès, pourraient entraîner une amputation.
Schlievert considère les probiotiques comme un moyen prometteur de prévenir ces complications. «Si nous pouvons améliorer leur vie en utilisant cette approche, ce serait merveilleux.»
Complément
Une vingtaine de cas de syndrome du choc toxique (SCT) menstruel sont enregistrés chaque année en France. Le SCT menstruel est lié aux conditions d’utilisation des protections intimes internes.
Résumé
Importance
Dans une étude menée par un groupe de recherche du Baylor College of Medicine, l'administration orale d'une souche bactérienne probiotique disponible dans le commerce s'est avérée efficace pour améliorer la sécheresse oculaire chez un modèle animal. Les résultats ont été présentés à ASM Microbe 2023, la réunion annuelle de l'American Society for Microbiology.
La sécheresse oculaire, une affection courante dans laquelle les larmes produites par l'œil ne peuvent pas maintenir l'œil correctement lubrifié, touche environ 1 personne sur 20 aux États-Unis. Il peut provoquer des picotements et des brûlures aux yeux, une inflammation, une vision floue et une sensibilité à la lumière. Les cas extrêmes peuvent entraîner des dommages à la surface de l'œil s'ils ne sont pas traités. Les traitements les plus courants impliquent l'application de gouttes ophtalmiques, de gels ou de pommades. Ce nouveau traitement non conventionnel implique des bactéries du tractus intestinal.
L'auteure, Laura Schaefer du Baylor College of Medicine à Houston, au Texas, a dit : «Les bactéries ‘amicales’ qui vivent dans le tractus gastro-intestinal humain ont été liées à la santé et à la protection contre les maladies dans de nombreuses parties du corps, y compris l'intestin, le cerveau et les poumons. Il n'est donc pas surprenant que le microbiome intestinal ait également des effets sur nos yeux.»
Des travaux antérieurs de ce groupe de recherche ont montré que des souris ayant reçu des bactéries intestinales de patients humains atteints du syndrome de Sjögren souffrant de sécheresse oculaire sévère développaient une maladie oculaire pire dans des conditions sèches que des souris ayant reçu des bactéries intestinales de patients humains en bonne santé. Cela suggère que les bactéries intestinales de personnes en bonne santé aident à protéger la surface de l'œil dans des conditions sèches. Une voie de traitement possible pour la sécheresse oculaire impliquerait des bactéries probiotiques qui ont des effets protecteurs similaires. Le groupe a étudié cela en utilisant une souche bactérienne probiotique administrée par voie orale, Limosilactobacillus reuteri DSM17938, dans un modèle de souris à œil sec. DSM17938 est une souche bactérienne probiotique d'origine humaine disponible dans le commerce qui a déjà démontré des effets protecteurs sur l'intestin et le système immunitaire chez l'homme et la souris, mais elle n'a pas été testée dans le contexte de la santé oculaire.
Les souris ont d'abord été traitées avec des antibiotiques, qui tuent de nombreuses bactéries «amies» vivant dans l'intestin. Ils ont ensuite été exposés à des conditions très sèches et ont reçu des doses quotidiennes de bactéries probiotiques ou d'une solution saline comme témoin. Après 5 jours, les yeux ont été examinés pour la maladie. Les souris qui ont été nourries avec les bactéries probiotiques avaient des surfaces cornéennes plus saines et plus intactes. De plus, ces souris avaient plus de cellules caliciformes dans leur tissu oculaire, qui sont des cellules spécialisées qui produisent de la mucine, un composant essentiel des larmes. Prises ensemble, ces données suggèrent que le bon probiotique oral pourrait aider à traiter et à gérer les symptômes de la sécheresse oculaire.
Les auteurs de cette étude sont Laura Schaefer, Robert Britton, Steven Pflugfelder et Cintia de Paiva. La recherche a été effectuée dans le laboratoire du Dr Cintia de Paiva du département d'ophtalmologie du Baylor College of Medicine et financée par des fonds du National Institutes of Health et de la Research to Prevent Blindness Foundation.
Une nouvelle étude menée par une équipe de la Pennsylvania State University suggère que les microbes de l'intestin humain pourraient être exploités pour bloquer l'absorption des métaux toxiques comme le mercure et aider le corps à absorber les éléments nutritifs utiles, comme le fer. Le groupe a présenté ses résultats au cours de ASM Microbe 2023, la réunion annuelle de l'American Society for Microbiology (ASM).
Le méthylmercure, une neurotoxine, est particulièrement inquiétant, selon Daniela Betancurt-Anzola, étudiante diplômée à Penn State qui a dirigé la nouvelle étude. Il a une variété d'effets toxiques et nuit au développement neurologique pendant la grossesse et l'enfance, en particulier dans les communautés fortement tributaires d'une alimentation à base de poisson. La plupart des expositions au méthylmercure se font par le biais de poissons ou de crustacés, mais elles peuvent également se manifester ailleurs. «Il s'accumule dans les êtres vivants, dans les plantes et les poissons», a-t-elle dit. «Nous mangeons ces choses, et elles s'accumulent en nous.»
Betancurt-Anzola et ses collègues ont d'abord analysé des milliers de génomes de bactéries intestinales, en se concentrant sur les déterminants génétiques associés à la capacité d'interagir avec les métaux. De nombreux gènes sont connus pour être liés à la résistance aux métaux, a-t-elle dit, mais le groupe s'est concentré sur ceux qui permettent aux bactéries de convertir le mercure dangereux en des formes moins toxiques et d'absorber le métal lourd.
Pour comprendre comment ces gènes fonctionnent et impactent l'hôte, l'équipe a utilisé le séquençage métagénomique pour étudier comment les microbes humains et de souris réagissaient à l'exposition au mercure. Enfin, les chercheurs ont utilisé ces connaissances pour développer un probiotique spécialement conçu pour détoxifier un type de mercure dangereux souvent présent dans l'alimentation humaine. Ils ont inséré des gènes de la bactérie Bacillus megaterium, connue pour être très résistante au méthylmercure, dans des souches de Lacticaseibacillus, un genre de bactéries lactiques.
«C'est un probiotique parfait pour cela parce que nous avons déjà montré qu'il fonctionne chez l'homme, et maintenant nous le concevons pour le rendre encore meilleur», a dit Betancurt-Anzola. «Il est à l'intérieur de l'intestin, il attrape le méthylmercure, puis il s’en va.»
Pour l'instant, le groupe se concentre sur la compréhension de la façon dont les microbes intestinaux interagissent avec le mercure, mais ils prévoient également d'étudier d'autres métaux. Leur objectif ultime est de développer des interventions qui pourraient aider à réduire les niveaux de métaux dangereux, comme le mercure, et à stimuler l'absorption de ceux dont le corps humain a besoin. «Nous sommes intéressés à étudier comment l'ensemble de la communauté microbienne réagit aux différents métaux», a dit Betancurt-Anzola.
Une consommation excessive d'alcool entraîne des gueules de bois douloureuses et des maux de tête, de la fatigue et des nausées. La consommation d'alcool a également été liée à une série de problèmes de santé dans le corps humain, notamment les maladies cardiaques, la cirrhose et l'immunodéficience. Une façon d'éviter ces conséquences serait de boire moins, mais des chercheurs en Chine ont introduit un autre moyen de réduire la gueule de bois et d'autres effets indésirables : un probiotique génétiquement modifié
Meng Dong de l'Institut de zoologie de l'Académie chinoise des sciences, qui a travaillé sur l'étude, a noté que les applications cliniques peuvent s'étendre au-delà des conditions liées à l'alcool. «Nous pensons que les probiotiques génétiquement modifiés fourniront de nouvelles idées pour le traitement des maladies du foie», a-t-elle déclaré.
Le corps humain utilise principalement des formes d'une enzyme appelée alcool déshydrogénase, ou ADH, pour métaboliser l'alcool. Mais certaines variantes sont plus efficaces que d'autres. Certaines études ont montré qu'une forme appelée ADH1B, trouvée principalement dans des populations d'Asie de l'Est et de Polynésie, est 100 fois plus active que les autres variantes. Des études antérieures chez la souris ont montré que les vecteurs viraux génétiquement modifiés pour exprimer ADH1B peuvent accélérer la dégradation de l'alcool, mais cette approche ne s'est pas avérée sûre chez l'homme.
Motivés par ces découvertes, Dong et ses collègues ont cherché une méthode de livraison plus sûre, en se concentrant sur le probiotique Lactococcus lactis, une bactérie souvent utilisée dans la fermentation. Ils ont utilisé le clonage moléculaire pour introduire le gène de l'ADH1B humain dans un plasmide bactérien, qui a ensuite été introduit dans une souche de L. lactis. Des tests en laboratoire ont confirmé que le probiotique sécrétait l'enzyme. Les chercheurs ont encapsulé le probiotique pour s'assurer qu'il survivrait contre l'acide gastrique, puis l'ont testé sur 3 groupes de 5 souris, chacune exposée à différents taux d'alcool.
Les souris non traitées ont montré des signes d'ivresse 20 minutes après l'exposition à l'alcool. Lorsque les souris étaient placées sur le dos, par exemple, elles étaient incapables de se remettre sur pied. Mais dans le groupe ayant reçu un probiotique exprimant l'ADH1B humain, la moitié des souris étaient encore capables de se retourner 1 heure après l'exposition à l'alcool. Un quart n'a jamais perdu sa capacité à se retourner.
D'autres tests ont montré que 2 heures après l'exposition, les taux d'alcoolémie dans le groupe témoin continuaient d'augmenter, tandis que les groupes des souris traitées avec le probiotique avaient commencé à baisser. De plus, les chercheurs ont découvert que les souris traitées présentaient des niveaux inférieurs de lipides et de triglycérides dans leur foie, ce qui suggère que le probiotique pourrait réduire les dommages causés par l'alcool à cet organe.
La prochaine étape, a déclaré Dong, consiste à déterminer si l'effet thérapeutique potentiel du probiotique modifié s'étend aux humains. «Nous sommes enthousiasmés par l'amélioration des probiotiques recombinants dans les lésions hépatiques et intestinales aiguës induites par l'alcool», a déclaré Dong.
Une analyse d'importantes souches de bactéries probiotiques isolées à partir d'aliments et de compléments alimentaires probiotiques a révélé la présence de plusieurs gènes de résistance aux antibiotiques (GRAs), ont rapporté des chercheurs hongrois dans Eurosurveillance, «A survey on antimicrobial resistance genes of frequently used probiotic bacteria, 1901 to 2022».
À l'aide du séquençage de nouvelle génération, des scientifiques de l'Université de médecine vétérinaire de Budapest ont examiné 579 isolats de 12 espèces bactériennes probiotiques couramment présentes dans les aliments fermentés et non fermentés et les compléments alimentaires probiotiques pour la présence de GRAs, de plasmides et d'éléments génétiques mobiles intégratifs (EGMis) qui peuvent permettre l'échange de GRAs entre les bactéries. Sur les 579 isolats, 169 (29%) représentant 10 des 12 espèces étaient GRA-positifs.
Les mécanismes de résistance dans lesquels les GRAs identifiés se sont précédemment révélés impliqués comprenaient l'efflux d'antibiotiques, l'inactivation d'antibiotiques et l'altération de la cible d'antibiotiques. Parmi les espèces probiotiques analysées, Bifidobacterium animalis et Lactococcus lactis avaient la proportion la plus élevée d'échantillons positifs pour les GRAs.
L'analyse a également révélé que 66% des isolats positifs aux GRAs contenaient au moins un gène pouvant être lié à un plasmide ou à un EGMi.
«Notre étude confirme que de nombreux GRAs sont présents dans les espèces bactériennes probiotiques constituant le bactériome des produits comestibles et que beaucoup d'entre eux sont mobiles», ont écrit les auteurs de l'étude. «Ainsi, l'application et la consommation de certaines souches bactériennes probiotiques pourraient avoir le potentiel de contribuer à l'apparition et à la propagation de la résistance aux antimicrobiens.»
Les auteurs notent que si les GRAs identifiés peuvent affecter l'activité de plusieurs classes d'antibiotiques utilisés en médecine humaine et animale, la présence de GRAs n'entraîne pas nécessairement une résistance phénotypique. Ils disent que d'autres études d'expression génique et des évaluations des valeurs minimales de concentration inhibitrice seraient nécessaires pour déterminer si les souches probiotiques porteuses de GRAs sont résistantes aux antibiotiques.
«Étant donné que nos résultats suggèrent que la prévalence de GRAs mobiles n'est peut-être pas négligeable, il pourrait être utile d'envisager l'élaboration de lignes directrices pour surveiller ces GRAs mobiles», ont-ils conclu.
Message clé de santé publique
NB : La photo est d’Elena Nachaeva/iStock.
Les résultats présentés ici indiquent d'importantes contributions génomiques et physiologiques à la robustesse et à la stabilité des bifidobactéries. Les résultats et les méthodologies appliquées peuvent faciliter la sélection de nouvelles souches commercialisables et guider l'optimisation des processus de production pour améliorer la robustesse et la stabilité des souches avec des avantages prometteurs pour la santé.
NB : Photo d'illustration.
Les abeilles vivent dans des sociétés denses et complexes, dont les services écosystémiques sont indispensables.
Les abeilles, en particulier l'abeille occidentale Apis mellifera, sont d'importants pollinisateurs dans les environnements agricoles. Les abeilles ouvrières remplissent toutes les fonctions de la colonie, à l'exception de la ponte, et leur santé est essentielle au bien-être de toute la ruche. Si ces ouvrières disparaissent, des événements destructeurs connus sous le nom d'effondrements de colonies peuvent en résulter. Lors d'un effondrement de colonie, les abeilles ouvrières meurent ou quittent la ruche, abandonnant leur reine et perdant ainsi toute la ruche.
Les forces motrices de l'effondrement des colonies sont à la fois complexes et peu claires, mais elles sont essentielles à comprendre si nous voulons protéger les abeilles et les services écosystémiques qu'elles fournissent. Ainsi, la santé des abeilles est un élément important de la recherche scientifique et des efforts de conservation dans le monde entier. Les chercheurs examinent des facteurs tels que les maladies, les pesticides, les changements dans les sources de nourriture et même le stress lorsqu'ils étudient comment ces types de perturbations affectent la survie, le comportement et le microbiote intestinal des abeilles. Certains de ces dangers ont des origines microbiennes, et certains ont des solutions microbiennes.
De plus, le microbiote intestinal peut jouer un rôle dans ce que l'on appelle l'axe intestin-cerveau, la communication bidirectionnelle entre le tractus gastro-intestinal et le système nerveux central. Les scientifiques ont montré que le microbiote intestinal affecte le comportement social des abeilles, car il semble être important pour la médiation des interactions sociales et l'analyse des informations sensorielles de leur environnement. Les abeilles utilisent ces signaux sociaux pour se transmettre des informations entre elles, les aidant à naviguer dans le monde qui les entoure, soulignant l'importance du microbiote intestinal pour une ruche fonctionnelle.
Chez les abeilles, comme chez les autres animaux, un microbiote intestinal sain est crucial pour un hôte sain. Cependant, tout comme le nôtre, le microbiote intestinal des abeilles est également vulnérable aux perturbations qui induisent un état perturbé appelé dysbiose. Les menaces viennent de plusieurs côtés : les antibiotiques, la perte d'habitat, l'alimentation, les pesticides et même les impacts à grande échelle du changement climatique. La dysbiose dans l'intestin peut rendre les abeilles plus vulnérables aux agents pathogènes et avoir un impact négatif sur leur santé.
Pour aller plus loin, des efforts sont également en cours pour produire des probiotiques «sur mesure» pour les abeilles, qui peuvent aider à les protéger contre les parasites et les agents pathogènes. Par exemple, l'acarien varroa, un agent pathogène destructeur des abeilles, parasite les abeilles et transmet un agent pathogène viral connu sous le nom de virus des ailes déformées (DWV pour deformed wing virus). Le varroa et le DWV sont des habitants indésirables des ruches, mais extrêmement communs, et peuvent provoquer des effondrements des colonies.
Cependant, les chercheurs commencent maintenant à comprendre comment la protection contre ces agents pathogènes peut provenir de l'intérieur. Dans une étude, des chercheurs ont génétiquement modifié Snodgrassella alvi, l'un des 5 microbes intestinaux de l'abeille domestique, pour stimuler le système immunitaire de l'abeille et augmenter la réponse d'ARN interférent. Dans cette réponse, le système immunitaire reconnaît l'ARN double brin exogène (ARNdb) à l'intérieur des cellules et dégrade tout ARNdb correspondant en le découpant. Cette réponse peut être exploitée pour cibler l'ARN spécifique de l'agent pathogène, bien que l'injection directe d'ARNdb ciblé ait eu un succès limité chez les abeilles. Cependant, S. alvi modifié pour le produire à l'intérieur de l'hôte a été très efficace pour protéger les abeilles contre le varroa et le DWV.
Sauver les abeilles, à la fois mellifères et sauvages, est un effort continu à travers le monde. Les comprendre de l'intérieur peut nous aider à les protéger de certaines des menaces auxquelles elles sont confrontées, bien que nous ne puissions pas perdre de vue des problèmes plus vastes, tels que la perte d'habitat et le changement climatique, pour lesquels les interventions microbiennes ne sont guère plus qu'un pansement.
Si vous souhaitez en savoir plus sur les facteurs qui menacent la survie des colonies d'abeilles, consultez cet article, qui explique les facteurs de stress microscopiques et macroscopiques, ainsi que ce qui peut être fait pour aider à résoudre le problème.
L’image représente des interactions directes entre les abeilles qui les aident à transmettre des informations et à maintenir le fonctionnement de la ruche.