Selon Wikipédia,
En épidémiologie, le nombre de reproduction de base ou R0 d'une
infection peut être considéré comme le nombre attendu de cas
directement générés par un cas dans une population où tous les
individus sont sensibles à l'infection.
« Le
R0 est le nombre moyen de personnes qu’une personne contagieuse
peut infecter. Ce taux s’applique, et se calcule à partir d’une
population qui est entièrement susceptible d’être infectée,
c’est-à-dire qui n’a pas encore été vaccinée ni immunisée
contre un agent infectieux. »
« A
propos du COVID-19, qu’est-ce que le nombre R ? »,
source BMJ.
Cela
a conduit les décisions politiques depuis que COVID-19 a émergé
fin 2019, mais quel est le nombre R, et est-ce important, se demande
Elisabeth Mahase.
Qu’est-ce
que le nombre R ?
Le
nombre R pourrait faire référence soit au nombre de reproduction de
base, connu sous le nom de R zéro (R0), soit au nombre de
reproduction effectif (Re).
R0
décrit combien de personnes chaque personne infectée infectera en
moyenne, en supposant qu'il n'y a pas d'immunité préexistante dans
la communauté.
Il
est souvent estimée à l'aide de trois facteurs: la durée de la
contagiosité après l'infection d'une personne, la probabilité
d'infection à chaque contact entre une personne sensible et une
personne ou un vecteur infectieux, et la fréquence des contacts.
Il
s'agit du nombre de personnes qui peuvent être infectées par un
individu à un moment donné, et il change à mesure que la
population est de plus en plus immunisée, soit par le biais de
personnes acquérant l'immunité après avoir été infectées, soit
par la vaccination, et également lorsque des personnes décèdent.
Re
peut également être affecté par le comportement des personnes,
comme la distance sociale. R0 et Re sont souvent confondus ou
simplement appelés le R.1
Quels
sont les R0 et Re pour SARS-CoV-2?
Le
SARS-CoV-2, le coronavirus qui a provoqué la pandémie de COVID-19,
a un R0 estimé à environ 2,63, a déclaré la COVID-19
Evidence Service de l’Université d’Oxford.
Cependant,
les estimations varient entre 0,4 et 4,6. Ce n'est pas inhabituel,
car les estimations R0 varient souvent, avec différents modèles et
données utilisés pour le calculer. La rougeole, par exemple, a eu
des valeurs R0 comprises entre 3,7 et 203,03.
Le
Re variera également d'un pays à l'autre et d'une région à
l'autre. Le Premier ministre britannique, Boris Johnson, a déclaré
le 10 mai que le Re en Angleterre était actuellement «entre 0,5 et
0,9, mais potentiellement juste en dessous de 1».
En
Écosse, le premier ministre Nicola Sturgeon a déclaré qu'il se
situait entre 0,7 et 1.
En
Allemagne, le Robert Koch Institute a rapporté le 9 mai que le Re
était passé à 1,1 juste
seulement après que le pays eut commencé
à assouplir les mesures de confinement.
Le
même effet a également été observé au Danemark lors de la
réouverture des écoles primaires en avril: le Re est passé de 0,6
à 0,9.
Le
Re est-il important?
De
nombreux politiciens ont souligné le Re comme une mesure importante
pour déterminer dans quelle mesure leur pays réagit à la pandémie
et ce qui peut se passer ensuite.
La
chancelière allemande Angela Merkel est apparue à la télévision
pour expliquer le raisonnement derrière la stratégie de son
gouvernement, se référant au nombre
de reproduction.
Pendant
ce temps, Boris Johnson a déclaré à
la population le 10 mai que
l'assouplissement du confinement
en Angleterre dépendrait de la possibilité de limiter le nombre de
reproduction.
Il
est souvent présenté en termes simples: si le Re est supérieur à
1, l'épidémie devrait se poursuivre, mais si il
peut être réduit à moins de 1, l'épidémie prendra fin. En effet,
si chaque personne infectée infecte à son tour moins d'une
personne, l'épidémie diminuera; un Re de 0,5 signifierait que 10
personnes infectées en infecteraient cinq autres, qui en
infecteraient alors 2,5 autres.
En
revanche, un Re supérieur à 1 signifierait que l'épidémie
augmenterait de façon exponentielle.
Cependant,
les experts ont averti que sans données actualisées et complètes,
le numéro de reproduction est un «outil de surveillance diffus.
Azra
Ghani, professeur d'épidémiologie des maladies infectieuses à
l'Imperial College de Londres, a dit:
« À l'heure actuelle, nous estimons à la fois R et le taux
d'infection à partir de données sur les hospitalisations. Ceux-ci
ne représentent qu'une petite fraction de toutes les infections et
représentent une estimation de la transmission qui s'est produite 1
à 2 semaines plus tôt - et sont donc un outil de surveillance
diffus. »
«Les
modèles ou les estimations basées sur des modèles (tels que R)
peuvent être utiles pour interpréter les tendances des données,
mais ne doivent jamais être considérés comme un substitut de
bonnes données. Ce n'est qu'avec une surveillance approfondie et des
tests rapides des cas suspects dans la communauté au sens large,
dans les hôpitaux, les maisons de soins et d’autres
endroits à haut risque, que nous pouvons être vraiment convaincus
que l'épidémie est en déclin et qu'il est sûr de relâcher les
mesures. »
Référence
COVID-19: What is the R number?
