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vendredi 20 octobre 2023

Hong Kong et COVID-19 : Le refus du vaccin semble lié à une méfiance envers les autorités sanitaires, selon une étude

«Le refus du vaccin semble lié à une méfiance envers les autorités sanitaires», source article de Stéphanie Soucheray paru le 19 octobre 2023 dans CIDRAP News.

Le refus des vaccins contre la COVID-19 est une caractéristique de la pandémie depuis que les vaccins ont été mis à disposition pour la première fois à la fin de l’hiver 2020 et au début de 2021.

Dans une nouvelle étude publiée dans JAMA Network Open, les auteurs examinent 28 000 entretiens sur la vaccination et l'hésitation à la vaccination menés à Hong Kong et à Singapour de février 2020 à janvier 2022 pour déterminer les causes du refus de se faire vacciner.

Jusqu’à la vague Omicron fin 2021 et début 2022, Hong Kong avait l’un des taux de prévalence du COVID-19 les plus bas au monde. Mais avec Omicron, le nombre de morts à Hong Kong a grimpé à 39,3 cas par million de personnes et par jour, soit le nombre de décès le plus élevé au monde.

Même si le nombre cumulé de décès dus au COVID-19 par habitant à Hong Kong reste inférieur à celui du Royaume-Uni et des États-Unis, il dépasse de loin celui des économies à revenu élevé de la région Asie-Pacifique.

«Bien que le nombre cumulé de décès dus au COVID-19 par habitant à Hong Kong reste inférieur à celui du Royaume-Uni et des États-Unis, il a largement dépassé celui des économies à revenu élevé de la région Asie-Pacifique», ont déclaré les auteurs. Cela était probablement lié à la faible couverture vaccinale : 82,4% des adultes de Hong Kong âgés de 80 ans et plus n'étaient pas vaccinés ou n'avaient reçu qu'une seule dose pendant la phase du variant Omicron BA.2 de la pandémie, contre seulement 9,0% des adultes de Singapour

Les auteurs de la présente étude ont utilisé 20 vagues de questionnaires et de données pour comprendre le refus du vaccin et ont comparé les résultats à ceux observés à Singapour, qui avait l'un des taux de vaccination les plus élevés d'Asie.
Les participants provenaient de la FAMILY Cohort, une étude de cohorte prospective basée sur la population de Hong Kong. Le groupe a été interrogé sur la vaccination au cours de la décennie précédant et pendant la pandémie. Au total, 28 007 entretiens ont été inclus.

65% étaient prêts à se faire vacciner contre la COVID au cours de la première année de la pandémie

En 2020, environ les deux tiers (65,3% ; intervalle de confiance [IC] à 95%, 61,7 % à 68,6 %) des adultes de Hong Kong ont déclaré qu'ils seraient prêts à se faire vacciner lorsqu'un vaccin serait disponible, ont découvert les auteurs. Mais la volonté de se faire vacciner est tombée à 55,0% lorsque les vaccins ont été achetés auprès de pays étrangers.

La volonté a encore chuté, à 43,6%, lorsque des effets secondaires indésirables ont été signalés au cours des premières semaines de vaccination à Hong Kong.

«Il a fallu plus d’un an pour que la confiance dans les vaccins se rétablisse. Une faible confiance dans le vaccin était associée au refus du vaccin», ont déclaré les auteurs.

Quatre facteurs, dont la méfiance à l'égard des autorités sanitaires, la faible confiance dans les vaccins, les idées fausses sur les vaccins et les opinions politiques, représentaient 82,2% (IC à 95%, 62,3% à 100,0%) du refus de vaccination chez les adultes âgés de 18 à 59 ans et 69,3% (IC à 95%, 47,2% à 91,4%) de refus de vaccination chez les adultes âgés de 60 ans et plus.

Les obligations, sous la forme à la fois d’obligation sur le lieu de travail et de pass vaccinal à Hong Kong, une fois que la vague d'Omicron a commencé à provoquer une mortalité importante, ont été liés à de fortes augmentations de la vaccination.

L’obligation de vaccination sur le lieu de travail étaient associés à une augmentation de 62,2% (IC à 95%, 9,9% à 139,2%) des rendez-vous quotidiens pour la vaccination contre la COVID-19, et le pass vaccinal de Hong Kong était associé à une augmentation de 124,8% (IC à 95%, 65,9% à 204,6%) a augmenté les rendez-vous quotidiens pour la vaccination contre la COVID-19.

jeudi 31 août 2023

Les virus gastro-intestinaux ont pratiquement disparu pendant la COVID, mais ont réapparu deux ans plus tard

«Les virus gastro-intestinaux ont pratiquement disparu pendant la COVID, mais ont réapparu deux ans plus tard» source ASM News, du 9 août 2023.

Suite aux premières ordonnances de confinement émises aux États-Unis pour freiner la propagation de la COVID-19, les virus gastro-intestinaux, tels que les norovirus, les rotavirus et les adénovirus, ont pratiquement disparu des communautés californiennes et sont restés à des niveaux très faibles pendant près de 2 ans. L’étude publiée dans Journal of Clinical Microbiology, une revue de l'American Society for Microbiology.

Il est intéressant de noter que ces virus sont revenus aux niveaux d’avant la pandémie fin 2022, a déclaré Niaz Banaei, professeur de pathologie et de médecine (maladies infectieuses) à l’Université de Stanford et directeur médical du laboratoire de microbiologie clinique de Stanford Health Care. «L'adénovirus de type 40 et 41, les souches d'adénovirus les plus fréquemment associées à la gastro-entérite, a en fait atteint des niveaux 2 fois plus élevés que les niveaux pré-pandémiques.»

Banaei soupçonne que la flambée des infections virales a été rendue possible par la diminution de l’immunité collective de la communauté due au manque d’exposition pendant la pandémie. «Quelque chose de similaire a été décrit pour la flambée des infections par le virus respiratoire syncytial en 2022», a-t-il dit.

Pour identifier les changements dans la prévalence des agents pathogènes gastro-intestinaux, les chercheurs ont comparé les taux de détection des agents pathogènes gastro-intestinaux acquis dans la communauté avant, pendant et après le confinement lié à la COVID en Californie. À cette fin, ils ont utilisé un panel de tests par PCR appelé panel BioFire FilmArray GI, qui teste 22 des agents pathogènes les plus courants causant la diarrhée, et ont analysé environ 18 000 tests effectués entre janvier 2018 et décembre. 2022.

Selon Banaei, la motivation de la recherche était le changement du taux de positifs pour certains agents pathogènes pendant la pandémie de COVID-19. «Il est immédiatement devenu clair que le confinement pandémique et le confinement à la maison avaient créé une expérience naturelle pour étudier la dynamique de transmission des agents pathogènes responsables de la gastro-entérite.»

La recherche offre une fenêtre unique sur la biologie des agents pathogènes gastro-intestinaux, soulevant de nouvelles questions de recherche, a dit Banaei. «Pourquoi certains ont-ils disparu alors que d’autres sont restés inchangés pendant le confinement ? Pourquoi certains atteignent-ils maintenant des niveaux que nous n’avons jamais vus auparavant ?» Une meilleure compréhension de ces phénomènes pourrait permettre de trouver des moyens d'interrompre la propagation des agents pathogènes, en particulier dans les pays à revenu faible ou intermédiaire où la gastro-entérite reste une cause majeure de maladie et de décès, notamment chez les enfants. «Cela pourrait également nous aider à nous préparer à de futures pandémies imprévues.»

mercredi 16 août 2023

De la contamination du réseau d'eau potable du Grand Poitiers par Cryptosporidium. Toutes les mesures de restriction sont levées !

L’ARS de la Nouvelle Aquitaine a publié un communiqué, «Prévention du risque de contamination de l’eau potable de Grand Poitiers du 11 août 2023».

L’eau potable distribuée dans certaines communes de la Communauté urbaine de Grand Poitiers provient de l’usine de potabilisation de Poitiers/Bellejouanne. Les résultats d’une analyse de contrôle périodique reçus le 9 août dernier pour un prélèvement effectué le 27 juillet mettent en évidence la présence d’un parasite (Cryptosporidium) en sortie de traitement (2 oocystes dans 100 litres d’eau).

Cette recherche est effectuée chaque mois par la Communauté urbaine de Grand Poitiers depuis 2009 dans une logique d’auto-surveillance de la qualité de l’eau. C’est la première fois que ces parasites sont identifiés dans l’eau potable produite par la Communauté urbaine de Grand Poitiers.

Des mesures de précaution sont donc prises en attendant le résultat des nouvelles analyses qui seront disponibles le mercredi 16 août.

Quels sont les impacts sur la santé ?

A ce jour, aucun cas de cryptosporidiose n’a été signalé à l’ARS Nouvelle-Aquitaine sur le territoire concerné. Par ailleurs, aucun pic de gastro-entérite aigue n’a été signalé.

Ce sont généralement des symptômes bénins. Le symptôme principal est une diarrhée, avec parfois vomissements, douleurs abdominales, fatigue et légère fièvre. L’infection peut aussi être asymptomatique. La durée d’incubation est en moyenne d’une semaine.

Pour une personne en bonne santé, l’évolution vers la guérison se fait spontanément même si les symptômes peuvent se prolonger.

Cependant l’infection peut être plus sévère chez une personne disposant d’un système immunitaire affaibli, ce qui nécessite une prise en charge médicale.

On lira un décryptage avec le docteur Benjamin Daviller, directeur départemental de l’Agence régionale de santé, à propos de la contamination de l’eau potable de dix communes de Grand Poitiers par le parasite Cryptosporidium.

A la question, «Vous êtes en attente des prochains résultats…»

«Oui, nous espérons fortement que ce n’était qu’un faux positif. Le prélèvement du 27 juillet 2023 était un prélèvement de routine qu’on fait régulièrement, d’où le délai entre le jeudi 27 juillet et le résultat le mercredi 9 août. Là, nous attendons les résultats des prélèvements effectués les jeudi 10 et vendredi 11 août 2023. Nous avons fait trois prélèvements : dans les eaux brutes de Fleury et du Clain et un prélèvement dans l’eau traitée.»

13 jours de délai pour attendre un résultat, hum, hum … d’autant que le communiqué de l’ARS indique attendre les résultats des nouvelles analyses faites les 10 et 11 août et qui seront disponibles le mercredi 16 août.

Au final, c'est le 15 août que les résultats sont tombés, c'est tant mieux et tout va bien …

NB : L'image est du CDC. 

lundi 26 juillet 2021

Des dizaines de cas de gasto-entérite dans une ville du Gard. Norovirus inside ?

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Sur le site de la ville de Marguerittes, proche de Nîmes dans le Gard, on peut y lire ce communiqué ci-contre.

Sur le site Objectif Gard,

Depuis ce week-end, des dizaines de cas de gastro-entérite sont signalés dans la commune de Marguerittes, alors que la fête votive bat son plein.

Le week-end a été douloureux pour certains Marguerittois qui ont été victimes de diarrhées et de vomissements alors que se déroulait la fête votive (elle se termine ce mardi, Ndlr). Plusieurs dizaines d’habitants de la commune présentent les mêmes symptômes, ce qui a incité, dès dimanche, la municipalité à faire analyser l’eau du robinet «À priori ce serait une gastro-entérite très fulgurante. Nous avons fait analyser l’eau du robinet et la nourriture, tout va bien à ce niveau. Les résultats sont positifs», explique Rémi Nicolas, le maire de Marguerittes.

«La plus grande partie des cas s’est déclenchée pendant la fête votive, mais les premiers cas ont été signalés la semaine dernière. La fête a certainement été propice au développement du virus», complète le maire. Dans une majorité des cas, les symptômes ont disparu au bout de 24h. «J’avoue que je ne pensais pas autant parler de gastro pour ma première fête votive», sourit Rémi Nicolas qui se veut rassurant au sujet de la santé de ses administrés. 

Pour Midi Libre qui cite lapage facebook de la ville,

Analyse de l’eau : pas d’inquiétude

Les premières analyses de l’eau distribuée à Marguerittes, analyses similaires à celles réalisées tout au long de l’année, ont donné des résultats rassurants : à tous les points de prélèvements réalisés par Eau de Nîmes Métropole (forage, château d’eau, arènes/champ de foire, rue de Baroncelli, rue du Vaccarès…) les valeurs constatées sont conformes aux valeurs habituelles et correspondent à une eau parfaitement potable.
D’autres analyses sont en cours, dont nous vous communiquerons bien sûr les résultats.

Contactée par Midi Libre, la mairie indique que des analyses bactériologies plus poussées ont été demandées. Les résultats devraient être connus dans un ou deux jours. 

Mise à jour du 27 juillet 2021On lira une interview du directeur de l’ARS pour le Gard, qui répond suite à des malaises, vomissements et diarrhées inexpliqués survenus chez des habitants de Marguerittes.

Mise à jour du 3 août 2021. Selon France Bleu,

C'était un épisode de gastro-entérite aigüe ! Fin du mystère à Marguerittes (Gard) où plusieurs dizaines de personnes ont été prises de vomissements et de diarrhées pendant plusieurs jours.
Pour la Mairie (page Facebook),
La Gastro-entérite confirmée par l'ARS
L'Agence Régionale de Santé d'Occitanie vient de le confirmer, c'est bien un épisode de Gastro-Entérite Aigüe (GEA) qui a sévi sur la commune.
Toutes les analyses effectuées pour rechercher des germes ou bactéries se sont avérées négatives.
Quelques cas continuent d'être signalés sur la commune, Il est recommandé de se laver régulièrement les mains et d'éviter les contacts physiques.
Les symptômes particuliers de cette GEA sont des vomissements et diarrhées importants, fatigue et douleurs mais fièvre modéré (38/38,5°) et une amélioration de la santé dans les 72h maximum.
Sans doute faudrait-il signaler qu'il s'agit d'un virus, norovirus, probablement ?
Le lavage des mains se fait avec de l'eau et du savon, pas de gel hydro-alcoolique !

Avis aux lecteurs du blog

L’ancien site Internet du blog qui était hébergé par la revue PROCESS Alimentaire est de nouveau opérationnel avec ce lien https://amgar.blog.processalimentaire.com/

lundi 5 juillet 2021

Exposition aux métaux de la population française. Quid du cuivre dans l'agriculture biologique ?

«Exposition aux métaux de la population française : résultats de l’étude ESTEBAN», source Santé publique de France du 1er juillet 2021.

Arsenic, cadmium, chrome, cuivre, nickel, mercure… Santé publique France publie les nouvelles données françaises d’exposition aux métaux de la population française issues de l’étude ESTEBAN. Cette étude a permis de décrire l’exposition à 27 métaux et de mesurer leur présence dans l’organisme des adultes, et pour la première fois à l’échelle nationale chez les enfants. Cette nouvelle photographie des imprégnations souligne que l’ensemble de la population est concerné. Il est donc nécessaire de maintenir les études de biosurveillance pour suivre l’évolution des expositions aux métaux et poursuivre les mesures visant à les réduire, en agissant en particulier sur les sources d’exposition, compte tenu de leurs effets néfastes sur la santé (cancérogénicité, effets osseux, rénaux, cardiovasculaires, neurotoxiques…).

(…) Les résultats publiés aujourd’hui concernant l’exposition aux métaux, comme le cadmium, le cuivre, le nickel ou encore le mercure, constituent le deuxième volet de cette grande étude de Biosurveillance menée par Santé publique France. Ces données s’ajoutent aux résultats publiés en septembre 2019 concernant les substances issues des produits d’usage courant et à ceux publiés en mars 2020 concernant le plomb. 

Des métaux détectés chez l’ensemble de la population française
Naturellement présents dans l’environnement, les métaux peuvent être à l’origine de l’apparition maladies chroniques, de déficience immunitaire ou encore de cancers. La mesure de l’imprégnation de la population à ces substances, couplées au recueil d’informations de leurs comportements ou leurs habitudes alimentaires permettent d’identifier des sources d’expositions sur lesquelles agir afin de prévenir l’apparition de telles pathologies.

Des sources d’expositions différentes selon les métaux

Les déterminants de l’exposition mesurés, principalement alimentaires, étaient similaires à ceux observés dans la littérature :
  • la consommation de poissons et de produits de la mer influençait les concentrations en arsenic, chrome, cadmium et mercure ;
  • la consommation de céréales, celles en cadmium et lorsqu’elles provenaient de l’agriculture biologique, celles en cuivre ;
  • la consommation de légumes issus de l’agriculture biologique, celle en cuivre.
D’autres déterminants connus ont également été observés :
  • la consommation de tabac augmentait les concentrations en cadmium et cuivre ;
  • les implants médicaux, celles en chrome ;
  • les plombages, celles en mercure urinaire.

Quelques conseils pour réduire l’exposition à certains métaux

En étudiant à la fois les niveaux et les modes d’imprégnation, les résultats de l’étude Esteban permettent de rappeler la nécessité d’ancrer davantage la lutte contre le tabagisme y compris le tabagisme passif afin de réduire l’exposition au cadmium

En effet, chez les adultes, le tabac entrainait une augmentation de plus de 50% d’imprégnation chez les fumeurs.

Par ailleurs, l’alimentation étant une des principales sources d’exposition, il apparait important de rappeler les recommandations du PNNS et de diversifier les sources d’aliments, notamment concernant les poissons. Le poisson et les produits de la mer ont beaucoup de qualités nutritionnelles mais leur consommation influence les concentrations en arsenic, cadmium, chrome et mercure. il est recommandé de consommer 2 fois par semaine du poisson dont un poisson gras en variant les espèces et les lieux de pêche.

NB; Pour la réduction du cuivre, je suggère soit de limiter son utilisation dans l'agriculture biologique ou soit de réduuire sa consommation de produits issus de l'agriclture biologique ...

Mise à jour du 6 juillet 2021. Selon La France AgricoleL’utilisation de cuivre dans les productions légumières en agriculture biologique pourrait expliquer le lien entre consommation de légume bio et augmentation de la concentration de cuivre chez les enfants.

Mise à jour du 7 juillet 2021

Mise à jour du 8 juillet 2021.

Mise à jour du 22 juillet 2021

Mise à jour du 31 juillet 2021.  

samedi 3 juillet 2021

Consommation d'aliments à risque élevé dans la population canadienne, selon une étude Foodbook

«Consommation d'aliments à risque élevé dans la population canadienne, étude Foodbook 2014-2015», source Journal of Food Protection (2021).

Résumé

De nombreux aliments peuvent causer des maladies d'origine alimentaire, mais certains présentent un risque plus élevé. Les données ont été recueillies dans le cadre de l'étude Foodbook, une enquête téléphonique auprès de la population menée entre 2014 et 2015 qui a évalué l'exposition alimentaire de 10 942 Canadiens au moyen d'une période de rappel de sept jours. Dix-neuf aliments inclus dans l'enquête ont été identifiés comme présentant un risque élevé de pathogènes d'origine alimentaire courants au Canada.

Les résultats ont été analysés par tranche d'âge, sexe, région de résidence, revenu et éducation. Les proportions de consommation d'aliments à risque variaient de 0,4 % (huîtres crues) à 49,3 % (charcuterie). Environ 94 % de la population a dit avoir consommé un ou plusieurs aliments à haut risque au cours de la semaine précédente. Certains comportements alimentaires à haut risque étaient associés à des caractéristiques démographiques. Les adultes à haut risque, comme ceux de 65 ans ou plus, déclarent toujours consommer des aliments à haut risque préoccupants, notamment de la charcuterie (41,8 %), des fromages à pâte molle (13,7 %) et du poisson fumé (6,3 %).

La consommation de certains aliments différait d'un sexe à l'autre, les hommes consommant beaucoup plus de charcuteries, de hot-dogs et d'œufs crus/pas assez cuits, et les femmes consommant beaucoup plus de salades mélangées pré-emballées. Le nombre total d'aliments à haut risque consommés était similaire, les deux sexes consommant le plus souvent 3 à 5 aliments à haut risque.

On a constaté que la consommation d'aliments à haut risque augmentait avec l'augmentation du revenu du ménage, 14,2% du niveau de revenu le plus élevé ayant consommé 6+ aliments à haut risque au cours de la semaine dernière, contre 7,1% du niveau de revenu le plus bas. Si un répondant avait entendu parler d'un risque de maladie d'origine alimentaire associé à un aliment, cela n'avait aucune incidence sur sa consommation. Des efforts supplémentaires en matière de sécurité des aliments des consommateurs mis en place parallèlement aux messages actuels peuvent améliorer les comportements de consommation alimentaire à haut risque. L'amélioration des messages actuels en utilisant des communications à multiples facettes (par exemple, les réseaux sociaux et les brochures d'information) et la mise en évidence de l'incidence et de la gravité importantes des maladies d'origine alimentaire au Canada sont des stratégies importantes pour améliorer le changement de comportement.

L’intégralité de cette enquête se trouve sur ce lien, ici.

Dans les conclusions du rapport, il est indiqué,

Le principal objectif de l’étude Foodbook était d’éclairer les capacités de lutte rapide et efficace contre les éclosions de maladies d’origine alimentaire au Canada, et d’optimiser la rectification des lacunes importantes en matière de données identifiées par l’Agence et les partenaires à l’échelle fédérale, provinciale et territoriale (FPT). 

Le Rapport Foodbook offre un accès rapide aux données sur les expositions dans la population générale, et celles-ci permettront d’orienter les enquêtes sur les éclosions lorsque la source de l’éclosion n’est pas immédiatement évidente. On disposera ainsi du niveau probant requis pour faciliter le retrait rapide du marché de la(des) source(s) alimentaire(s) contaminée(s). La fréquence de l’exposition aux aliments à risque élevé éclairera les évaluations des risques microbiens et la classification des risques liés aux pathogènes d’origine alimentaire. Les données concernant l’exposition à l’eau et aux animaux serviront à appuyer les évaluations des risques microbiens, les analyses d’attribution des sources et les politiques de salubrité de l’eau à l’échelle nationale. 

Enfin, le Rapport Foodbook inclut des données qui orienteront les efforts pluridisciplinaires pancanadiens visant à élucider les liens entre les profils de consommation, l’obésité et le statut socio-économique, en plus de renforcer la collaboration et le leadership en matière de promotion de la santé et de prévention des maladies. L’étude Foodbook vient combler de vastes lacunes en matière de données sur l’exposition des Canadiens aux aliments, à l’eau et aux animaux aux fins d’enquête et de lutte contre les éclosions de maladies d’origine alimentaire. Ces données sont destinées aux intervenants FPT qui unissent leurs efforts pour enquêter sur les maladies entériques au Canada, les combattre, les prévenir et les comprendre

vendredi 4 juin 2021

La faible confiance dans le gouvernement, des croyances complotistes et le fait de regarder YouTube prédisent une hésitation à la vaccination, selon une étude britannique

«La faible confiance dans le gouvernement, des croyances complotistes et le fait de regarder YouTube prédisent une hésitation à la vaccination», source Université d’Oxford.

Les personnes qui se tournent vers les réseaux sociaux pour obtenir des informations, en particulier YouTube, sont moins disposées à se faire vacciner contre le COVID-19, selon une nouvelle publication des universités d'Oxford et de Southampton, dont les chercheurs exhortent le gouvernement et les entreprises de réseaux sociaux à prendre des mesures urgentes à propos des résultats.

Melinda Mills, professeur à Oxford et le professeur Will Jennings de Southampton et leur équipe de recherche ont découvert que les sources des réseaux sociaux non réglementées posent un problème particulier en contribuant à l'hésitation à la vaccination. L'article avertit que les utilisateurs des réseaux sociaux peuvent être la proie d'un effet de ‘chambre d'écho’, où des recommandations personnalisées, basées sur ‘l'historique de surveillance’ d'un individu, soulignent les préoccupations d'un individu et fournissent rarement des opinions alternatives ou expertes.

Le professeur Mills a déclaré: «La désinformation prolifère sur certaines plateformes de réseaux sociaux parce que les utilisateurs reçoivent des suggestions de contenu alignées sur leurs peurs et regardent l'histoire, les poussant dans des terriers de lapin plus profonds. Les informations sont souvent présentées par des non-experts, avec une vérification limitée des faits, ce qui rend difficile d'évaluer l'exactitude ou d'équilibrer les informations.»

Le document a recommandé: «Ceux qui obtiennent des informations issues des réseaux sociaux relativement non réglementées telles que YouTube, qui ont des recommandations adaptées à l'historique de surveillance, sont moins susceptibles de vouloir se faire vacciner.» Les chercheurs appellent à l'action des gouvernements, des responsables de la santé et des sociétés des réseaux sociaux, et plus d'informations pour combler les ‘vides de connaissances’.

L'étude montre également que la confiance est la clé.

Le professeur Jennings a noté: «La désinformation prospère lorsqu'il y a un manque de confiance dans le gouvernement, la politique et les élites avec une leçon plus large que les autorités doivent communiquer de manière véridique, claire et cohérente

En collectant des données à partir d'un enquête auprès de 1 476 adultes au Royaume-Uni et de cinq groupes de discussion lors du premier déploiement du vaccin dans le pays en décembre 2020, ils ont découvert qu'un faible risque personnel perçu de COVID-19 était lié à l'hésitation à la vaccination. La complaisance est également née d'un malentendu selon lequel ‘l'immunité collective’ avait été atteinte et que seuls les plus vulnérables devaient être vaccinés. Le scepticisme autour du COVID-19 et des vaccins était lié à la croyance que les décès inégaux dans certains groupes de population étaient une forme de contrôle de la population, que l'immunité collective avait été atteinte et que le virus était d'origine humaine ou pas aussi mortel que rapporté.

Le professeur Mills a ajouté: «Il y avait souvent un manque de connaissances dans la compréhension des risques. Bien que certains aient des croyances complotistes, beaucoup essayaient simplement de donner un sens à des informations fragmentées, dynamiques et déroutantes, accédant souvent aux réseaux sociaux pour plus de clarté

La publication indique que plus de 80 % des Européens et plus de 70 % des Américains utilisent Internet comme source d'informations sur la santé, et constate que la croissance de l'utilisation d'Internet et la dépendance aux sources des réseaux sociaux telles que YouTube, Facebook, Twitter et TikTok ont changé la donne du paysage de la collecte d'informations. La plate-forme de partage de vidéos YouTube, qui contient un pourcentage élevé d’allégations négatives, était particulièrement liée à l'hésitation.

L’article indique: «Les utilisateurs de YouTube étaient nettement moins disposés à se faire vacciner, avec une probabilité de 45% de volonté de se faire vacciner. Une étude du contenu du vaccin sur YouTube a révélé que 65,5% des vidéos décourageaient l'utilisation de vaccins en mettant l'accent sur l'autisme, les risques non divulgués, les effets indésirables, la présence de mercure dans les vaccins.»

L'action est essentielle, selon l'équipe, qui a soutenu : «Les gouvernements devraient établir une présence sur Internet engageante pour combler les lacunes en matière de connaissances… Les sites ne sont pas réglementés et ne fonctionnent pas comme des ‘éditeurs’ [devraient être] contraints de présenter des informations équilibrées, car des informations erronées ou des théories du complot deviennent rapidement ‘virales’».

Complément. On lira l'article de Laure Mandeville paru dans Le Figaro du 3 juin 2021Quand «les mensonges» de Trump deviennent la vérité de Biden.

L’an dernier, Trump avait émis l’hypothèse d’un accident de laboratoire à Wuhan, qui serait à l’origine de la pandémie actuelle, provoquant une levée de boucliers. Un an après, son successeur en appelle à une enquête détaillé sur le thème.

C’est un véritable tête-à-queue que les médias et les réseaux sociaux américains sont en train d’opérer, sans trop s’en vanter, sur la question de l’origine du virus qui a bouleversé nos vies et suspendu la marche du monde. Tout à coup, ce que l’on nommait mensonges, fake news et racisme antichinois quand Donald Trump évoquait l’an dernier le fait que le Covid pourrait avoir été fabriqué dans le fameux laboratoire de Wuhan, devient de l’ordre du possible quand Biden appelle à une enquête détaillée sur ce thème. 

Mise à jour du 5 juin 2021. L'Anses nous parle dans Zootopique, une série d'anticipation, à propos de l'arrivée éventuelle d'une Covid 31, est-ce que cela est possible ? 

On apprend par ailleurs dans un éditorial du Figaro du 5 juin 2021 par Philippe GélieOrigine du Covid-19: «Mensonge d’État».

La seule chose dont la Chine ne s’est jamais cachée depuis l’apparition du coronavirus, c’est son refus absolu de la transparence et de la vérité. «Vous ne devez révéler à personne cette nouvelle pneumonie!», fut le premier ordre donné à la directrice des urgences de l’hôpital de Wuhan. 
Lire la suite ci-desous ... 

On lira aussi avec intérêt ce document de LCI du 9 avril 2020, Pourquoi autant de Français pensent que "le Covid-19 a été conçu en laboratoire"?
COMPLOTISME - Alors que le Covid-19 est arrivé avec son lot de thèses complotistes, un sondage Ifop a montré que la plus populaire d'entre elles était approuvée par un Français sur quatre. Qui est à l'origine de ces affirmations? Qui les diffuse? Et quels impacts ont-elles sur le public?

Il semble que ce qui était du complotisme hier ne le soit plus aujourd'hui .... 

jeudi 1 avril 2021

Comment la vie industrialisée remodèle le microbiome

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«Comment la vie industrialisée remodèle le microbiome», source MIT News.

Une étude internationale révèle que les bactéries intestinales des personnes dans les sociétés industrialisées échangent des gènes à des taux beaucoup plus élevés.

Des milliers d'espèces bactériennes différentes vivent dans l'intestin humain. La plupart sont bénéfiques, tandis que d'autres peuvent être nuisibles. Une nouvelle étude d'une équipe dirigée par le MIT a révélé que ces populations bactériennes peuvent se refaire au cours de la vie de leur hôte, en réalisant des allers-retours de gènes.

Les chercheurs ont également montré que ce type de transfert de gènes se produit plus fréquemment dans les microbiomes des personnes vivant dans les sociétés industrialisées, peut-être en réponse à leur alimentation et à leur mode de vie spécifiques.

«Une conséquence inattendue des humains vivant dans les villes est peut-être que nous avons créé des conditions très propices à l’échange de gènes entre les bactéries qui peuplent notre intestin», a dit Eric Alm, directeur du Center for Microbiome Informatics and Therapeutics du MIT. professeur de génie biologique et de génie civil et environnemental au MIT, membre du Broad Institute du MIT et de Harvard, et auteur principal de la nouvelle étude.

L'étude est le premier article majeur du Global Microbiome Conservancy (GMbC), un consortium qui collecte des échantillons de microbiome provenant de populations humaines sous-représentées dans le monde entier dans le but de préserver les espèces bactériennes qui risquent d'être perdues à mesure que l'humanité devient plus exposée à régimes et modes de vie industrialisés dans le monde.

«La plupart des espèces que nous trouvons dans les populations rurales et isolées sont des espèces que vous ne verriez pas dans le monde industrialisé», explique Mathieu Groussin, associé de recherche au MIT et l'un des principaux auteurs de l'article. «La composition du microbiome change complètement et, parallèlement, le nombre d'espèces différentes diminue. Cette moindre diversité du microbiome industrialisé pourrait être le reflet d'une mauvaise santé intestinale.»

Mathilde Poyet, associée de recherche au MIT, est également l'auteur principal de l'étude, qui apparaît dans Cell. D'autres auteurs de l'article comprennent des chercheurs d'institutions au Danemark, France, Afrique du Sud, Cameroun, Canada, Finlande, Nouvelle-Zélande, Tanzanie, Espagne, Suède, Ghana et Nigéria.

Diversité microbienne

Le GMbC a été lancé en 2016, avec pour mission de préserver la diversité du microbiome humain avant qu'elle ne soit perdue. Jusqu'à présent, le projet a recueilli des échantillons de 34 populations humaines dans le monde. Le consortium GMbC comprend des scientifiques de chaque pays où les échantillons sont collectés.

«Cet effort est dirigé par le MIT, mais il s'agit vraiment d'une collaboration mondiale», a déclaré Poyet. «Avec notre consortium international, nous consacrons du temps et des efforts à collecter et à préserver les souches bactériennes individuelles afin de pouvoir les conserver indéfiniment dans les générations futures, mais toutes ces bactéries et leurs dérivés appartiennent toujours aux participants qui les fournissent.»

Des travaux antérieurs ont montré que la composition du microbiome chez les personnes vivant dans les sociétés industrialisées est très différente de celle des populations rurales vivant dans un isolement relatif. Les populations non industrialisées ont généralement une plus grande biodiversité bactérienne, y compris de nombreuses espèces qui ne sont pas observées dans les populations industrialisées. On suppose que les différences de régime alimentaire, d'utilisation d'antibiotiques et d'exposition aux bactéries du sol contribuent à ces différences.

Dans l'étude parue dans Cell, les chercheurs ont exploré le phénomène du transfert horizontal de gènes, qui se produit lorsque des bactéries vivant dans le même environnement se transmettent des gènes entre elles. En 2011, le laboratoire d'Alm a découvert que l'intestin humain est un point chaud pour ce type d'échange de gènes. Cependant, avec la technique que les chercheurs utilisaient à l'époque, ils n'ont pu déterminer que ces transferts de gènes s'étaient probablement produits au cours des 5 000 dernières années.

Dans leur nouvelle étude, les chercheurs ont pu estimer beaucoup plus précisément quand ces transferts ont eu lieu. Pour ce faire, ils ont comparé les différences génétiques entre différentes espèces de bactéries intestinales. Lorsqu'ils ont comparé des paires d'espèces bactériennes provenant de la même personne, ils ont trouvé un taux de similitude génétique beaucoup plus élevé que celui observé dans les mêmes paires prélevées sur deux personnes différentes, confirmant que le transfert horizontal de gènes peut se produire au cours de la vie d'une personne individuelle.

«L'une des choses vraiment passionnantes à propos de cet article est que nous avons enfin pu répondre à la question de savoir si le taux de transfert horizontal a été élevé dans le microbiome humain au cours des derniers millénaires, ou est-il vrai qu'au cours de la vie de chaque personne, le les bogues dans leur intestin échangent constamment des gènes entre eux», a dit Alm.

Échange de gènes

Selon les espèces, les chercheurs ont découvert que les bactéries pouvaient obtenir entre 10 et 100 nouveaux gènes chaque année. Les chercheurs ont également constaté que le taux d'échange de gènes était significativement plus élevé chez les personnes vivant dans les sociétés industrialisées, et ils ont également constaté des différences dans les types de gènes les plus couramment échangés.

À titre d'exemple, ils ont trouvé parmi les populations pastorales qui traitent leur bétail avec des antibiotiques, des gènes de résistance aux antibiotiques sont parmi ceux échangés aux taux les plus élevés. Ils ont également constaté que les personnes issues de sociétés non industrialisées, en particulier les chasseurs-cueilleurs, avaient des taux élevés d'échange de gènes pour les gènes impliqués dans la dégradation des fibres. Cela a du sens parce que ces populations consomment généralement beaucoup plus de fibres alimentaires que les populations industrialisées, disent les chercheurs.

Parmi les microbes retrouvés dans les populations industrialisées, les chercheurs ont trouvé des taux d'échange particulièrement élevés de gènes dont le rôle est de faciliter le transfert de gènes.

Ces microbes ont également des taux d'échange plus élevés pour les gènes impliqués dans la virulence. Les chercheurs étudient actuellement comment ces gènes peuvent influencer les maladies inflammatoires telles que le syndrome du côlon irritable, qui est beaucoup plus souvent observé dans les sociétés industrialisées que dans les sociétés non industrialisées.

La recherche a été financée par le Center for Microbiome Informatics and Therapeutics du MIT, la Rasmussen Family Foundation et le prix BroadNext10 du Broad Institute.

jeudi 21 janvier 2021

Vaccinations en France, faut-il croire le ministre de la santé le matin ou le soir ?

Décidément la vaccination suscite bien des controverses, jugez plutôt, comme pour les posologies médicamenteuses, faut-il prendre la pilule du Dr Véran le matin ou bien le soir ?

Dans tous les cas, ne pas prendre en même temps les deux pilules, tant ses propos sont contradictoires, à vous de voir ...

Selon Public Sénat, le ministre de la Santé était auditionné par la commission des lois du Sénat jeudi 21 janvier 2021 sur la prolongation de l'Etat d'urgence sanitaire (vidéo sur YouTube):

Auditionné ce jeudi matin (21 janvier 2021-aa) par la commission des lois du Sénat, le ministre de la Santé a dévoilé que la France pourrait ne pas «avoir vacciné tous les publics fragiles d’ici à l’été». «Nous ciblons 15 millions de personnes vaccinées d’ici avant l’été. Cela représente une grosse partie de la population à risque de formes graves. Quoique, si on ajoute toutes les personnes qui sont en maladies chroniques, plus les personnes âgées de 60 ans et plus, on est plus proche des 25 à 30 millions de personnes», a-t-il commencé par expliquer.

«Ce qui veut dire que même avec la meilleure organisation et tous les approvisionnements qui arriveraient en temps et en heure, nous ne pourrions avoir vacciné tous les publics fragiles d’ici à l’été», a-t-il poursuivi. Raison pour laquelle, «nous demandons la poursuite de mesures sanitaires jusqu’à l’automne», a-t-il justifié. Il insiste : «C’est mathématiquement défendable.»

Mais voici qu'à 20h38 de la même journée, selon BMMTV,

Le ministre de la Santé a déclaré, ce jeudi soir sur TF1, que l'objectif est «d'avoir vacciné 70 millions de personnes fin août» en France «si la totalité des vaccins commandés sont validés par les autorités sanitaires européennes et mondiales».

Le ministre, qui était l'invité du 20 heures de TF1, a dit s'attendre à ce que «probablement 1,3 à 1,4 million de personnes soient vaccinées fin janvier, soit plus que le million annoncé».

«Ensuite, le nombre de personnes vaccinées monterait à 4 millions fin février, 9 millions au mois de mars, 20 millions à la fin d'avril, 30 millions à la fin mai, 43 millions à la fin du mois de juin, 57 millions à la fin du moins de juillet et 70 millions, c'est-à-dire la totalité de la population française, d'ici à la fin août», a-t-il énuméré.

A suivre ...

Complément du 22 janvier avec cette projection du journal Le Parisien,

Complément du 23 janvier 2021. Merci à Mme Emmanuelle Ducros ...

Le séquençage des eaux usées est utile pour le contrôle du SRAS-CoV-2

En France, nous avons le réseau Obépine, dont vous trouverez les objectifs ici, et qui nous dit à propos de ses réalisations,

Le réseau en cours de construction repose sur l’identification des quelques 150 STEU (Station de Traitement des Eaux Usées) dans lesquelles une analyse bi-hebdomadaire sera réalisée. Si, dans l’une d’entre elle, on mesure une augmentation de la concentration en trace de génome SARS-Cov-2, la première réaction, après la vérification qui s’impose, sera d’augmenter la fréquence des analyses. Ensuite, le réseau étant construit de façon hiérarchique, nous irons observer une dizaine de stations complémentaires, que nous pensons statistiquement semblables, pour y évaluer la dynamique de la concentration en génome.

C'est un bon début, mais comme nous allons le voir, il faut aussi vérifier quel type de variant se trouve dans les eaux usées car le «Séquençage des eaux usées est utile pour le contrôle du SRAS-CoV-2», source ASM News.

Le séquençage du génome viral des eaux usées peut détecter de nouveaux variants du SRAS-CoV-2 avant qu'ils ne soient détectées par séquençage clinique local, selon une nouvelle étude publiée dans mBio, une revue en accès libre de l'American Society for Microbiology. La capacité de suivre les mutations du SRAS-CoV-2 dans les eaux usées pourrait être particulièrement utile pour suivre de nouveaux variants, comme la souche B.1.17 qui est désormais répandue au Royaume-Uni et qui a déjà été introduite aux États-Unis. (en France aussi hélas -aa).

«Le virus du SRAS CoV-2 est excrété par les individus infectés par le COVID-19 et les déchets fécaux se retrouvent dans les systèmes de traitement des eaux usées. En prélevant les eaux usées, nous pouvons obtenir des informations sur les infections pour toute une population. Certains systèmes d'assainissement desservent plusieurs milliers de personnes. Certains servent des centaines de milliers de personnes», a déclaré la chercheuse principale de l'étude, Kara Nelson, professeur de génie civil et environnemental, au College of Engineering de l'Université de Californie-Berkeley. «Le prélèvement des eaux usées est un moyen très efficace d'obtenir des informations. C'est aussi une source d'information moins biaisée, car nous pouvons obtenir des informations de toutes les personnes du bassin d'égouts, qu'elles soient ou non testées dans une clinique. Nous savons qu'il y a des personnes qui ont des infections asymptomatiques qui pourraient ne jamais être testées.»

Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont développé et utilisé une nouvelle méthode d'échantillonnage des eaux usées. Lorsque les chercheurs séquencent l'ARN concentré et extrait des échantillons d'eaux usées, de nombreuses souches différentes peuvent être présentes car de nombreuses personnes contribuent à l'échantillon. Cependant, il est difficile de distinguer le signal génétique du SRAS-CoV-2 des milliards de bactéries et de virus que les humains excrètent chaque jour. Les chercheurs doivent identifier le SRAS CoV-2 au milieu d'une soupe entière d'autres matériels génomiques.

«La manière dont nous devons traiter les informations de séquence est complexe. Une contribution de cet article est la capacité de préparer des échantillons pour le séquençage à partir des eaux usées. Au lieu de séquencer directement tout ce qui est présent, nous avons utilisé une approche d'enrichissement où vous essayez d'abord d'enrichir l'ARN qui vous intéresse», a dit le Dr Nelson. «Nous avons ensuite développé une nouvelle approche d'analyse bioinformatique suffisamment sensible pour détecter une seule différence nucléotidique. Vous ne pouvez pas être plus sensible que cela.»

Les chercheurs ont séquencé l'ARN directement à partir des eaux usées collectées par les districts municipaux de la baie de San Francisco pour générer des génomes complets et presque complets du SRAS-CoV-2. Les chercheurs ont découvert que les principaux génotypes de consensus SRAS-CoV-2 détectés dans les eaux usées étaient identiques aux génomes cliniques de la région. Alors que les variants d'eaux usées observés étaient plus similaires aux génotypes locaux dérivés de patients californiens qu'ils ne l'étaient à ceux d'autres régions, ils ont également détecté des variants de nucléotides uniques qui n'avaient été signalés qu'ailleurs aux États-Unis ou dans le monde. Ainsi, les chercheurs ont découvert que le séquençage des eaux usées peut fournir des preuves d'introductions récentes de lignées virales avant qu'elles ne soient détectées par séquençage clinique local. En comprenant quelles souches de SRAS-CoV-2 sont présentes dans les populations au fil du temps, les chercheurs peuvent avoir un aperçu de la façon dont la transmission se produit et si de nouveaux variants, comme le B.1.1.7, dominent la transmission.

«Parmi tous ceux qui sont testés, seule une fraction de ces échantillons est séquencée. Lorsque vous échantillonnez les eaux usées, vous obtenez des données plus complètes et moins biaisées sur votre population», a dit le Dr Nelson. «Il semble que nous pourrions être en mesure d'obtenir un signal plus tôt dans les eaux usées si un nouveau variant apparaît par rapport au fait de ne compter que sur le séquençage des échantillons cliniques. Le simple fait de savoir que le SRAS-CoV-2 est présent dans une population est la première étape pour fournir des informations pour aider à contrôler la propagation du virus, mais savoir quels variants sont présents fournit des informations supplémentaires mais très utiles.