Voici
un article paru dans la revue Applied
and Environmental Microbiology et qui pour titre,
« Variabilité des souches de Listeria monocytogenes
avec un stress au NaCl élucidée par un protocole d'assemblage et
d'analyse de données de croissance microbienne à haut débit ».
Résumé
Listeria
monocytogenes
provoque une
grave
maladie d'origine alimentaire, la listériose et survit dans les
environnements associés aux
ateliers alimentaires
en raison de sa tolérance élevée au stress. Un protocole
d'assemblage et d'analyse des données pour des
expériences de croissance microbienne a été compilé pour élucider
la variabilité des souches de la tolérance au stress de L.
monocytogenes.
Le
protocole comprend la mesure de la capacité de croissance sous
contrainte (étape 1), la sélection d'une méthode appropriée pour
le calcul des paramètres de croissance (étape 2), la comparaison
des profils
de
croissance entre les souches (étape 3) et l'interprétation
biologique des différences découvertes (étape 4).
Dans
l'étape 1, des souches de L.
monocytogenes
(n = 388) de divers sérotypes et origines cultivées sur des milieux
avec 9,0% de NaCl ont été mesurées en utilisant un lecteur de
microbiologie Bioscreen C. La variabilité technique des mesures de
croissance a été évaluée et éliminée.
À
l'étape 2, les paramètres de croissance déterminés par les
modèles Gompertz, Gompertz modifié, logistique et Richards et les
splines sans
modèle ont été comparés, illustrant les différences dans
l'aptitude de ces méthodes à décrire les données expérimentales.
À
l'étape 3, un regroupement hiérarchique a été utilisé pour
décrire la tolérance au NaCl de L.
monocytogenes
mesurée par la variation spécifique de
la souche à
la capacité de croissance ; les souches tolérantes avaient des taux
de croissance et des densités optiques maximales plus élevés et
des phases de latence
plus courtes que les souches sensibles. La zone du paramètre spline
sous la courbe a classé les souche en croissance « pauvre »,
« moyenne » et « bonne ».
À
l'étape 4, les souches testées de la lignée I de L.
monocytogenes
(sérovars 4b et 1/2b) se sont révélées significativement plus
tolérantes envers 9,0% de NaCl que les souches de la lignée II
(sérovars 1/2a, 1/2c et 3a). Notre protocole fournit des outils
systématiques pour obtenir des données comparables pour étudier la
variation spécifique de
la souche lors
d’une
croissance bactérienne sous stress.
Importance
Le
pathogène Listeria
monocytogenes
provoque une
listériose d'origine alimentaire, qui peut être mortelle chez les
personnes immunodéprimées. L.
monocytogenes
tolère plusieurs facteurs de stress environnementaux et peut
persister dans les environnements de transformation alimentaire
et croître dans les denrées alimentaires malgré les mesures de
contrôle traditionnelles telles qu'une teneur élevée en sel.
Néanmoins,
les souches de L.
monocytogenes
diffèrent par leur capacité à résister aux facteurs de stress.
L'élucidation de la variabilité des souches intraspécifiques de la
tolérance au stress de L.
monocytogenes
est cruciale pour l'identification des souches particulièrement
tolérantes.
Pour
améliorer l'identification fiable de la variabilité des phénotypes
de tolérance au stress bactérien, nous avons compilé un protocole
à grande échelle pour l'ensemble des données et l'analyse des
expériences de croissance microbienne, fournissant une approche
systématique et une liste de contrôle pour les expériences sur la
capacité de croissance spécifique de
la souche. Notre étude a illustré la diversité et la variation
spécifique des
souches
de L.
monocytogenes à
la
tolérance au stress avec une portée sans précédent et a permis
de découvrir
des phénotypes dépendant du sérotype et de la lignée
biologiquement pertinente
de la tolérance au NaCl.