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mercredi 18 mars 2020

De la variabilité des souches de Listeria monocytogenes avec un stress au NaCl


Voici un article paru dans la revue Applied and Environmental Microbiology et qui pour titre, « Variabilité des souches de Listeria monocytogenes avec un stress au NaCl élucidée par un protocole d'assemblage et d'analyse de données de croissance microbienne à haut débit ».

Résumé
Listeria monocytogenes provoque une grave maladie d'origine alimentaire, la listériose et survit dans les environnements associés aux ateliers alimentaires en raison de sa tolérance élevée au stress. Un protocole d'assemblage et d'analyse des données pour des expériences de croissance microbienne a été compilé pour élucider la variabilité des souches de la tolérance au stress de L. monocytogenes.

Le protocole comprend la mesure de la capacité de croissance sous contrainte (étape 1), la sélection d'une méthode appropriée pour le calcul des paramètres de croissance (étape 2), la comparaison des profils de croissance entre les souches (étape 3) et l'interprétation biologique des différences découvertes (étape 4).

Dans l'étape 1, des souches de L. monocytogenes (n = 388) de divers sérotypes et origines cultivées sur des milieux avec 9,0% de NaCl ont été mesurées en utilisant un lecteur de microbiologie Bioscreen C. La variabilité technique des mesures de croissance a été évaluée et éliminée.

À l'étape 2, les paramètres de croissance déterminés par les modèles Gompertz, Gompertz modifié, logistique et Richards et les splines sans modèle ont été comparés, illustrant les différences dans l'aptitude de ces méthodes à décrire les données expérimentales.

À l'étape 3, un regroupement hiérarchique a été utilisé pour décrire la tolérance au NaCl de L. monocytogenes mesurée par la variation spécifique de la souche à la capacité de croissance ; les souches tolérantes avaient des taux de croissance et des densités optiques maximales plus élevés et des phases de latence plus courtes que les souches sensibles. La zone du paramètre spline sous la courbe a classé les souche en croissance « pauvre », « moyenne » et « bonne ».

À l'étape 4, les souches testées de la lignée I de L. monocytogenes (sérovars 4b et 1/2b) se sont révélées significativement plus tolérantes envers 9,0% de NaCl que les souches de la lignée II (sérovars 1/2a, 1/2c et 3a). Notre protocole fournit des outils systématiques pour obtenir des données comparables pour étudier la variation spécifique de la souche lors d’une croissance bactérienne sous stress.

Importance
Le pathogène Listeria monocytogenes provoque une listériose d'origine alimentaire, qui peut être mortelle chez les personnes immunodéprimées. L. monocytogenes tolère plusieurs facteurs de stress environnementaux et peut persister dans les environnements de transformation alimentaire et croître dans les denrées alimentaires malgré les mesures de contrôle traditionnelles telles qu'une teneur élevée en sel.

Néanmoins, les souches de L. monocytogenes diffèrent par leur capacité à résister aux facteurs de stress. L'élucidation de la variabilité des souches intraspécifiques de la tolérance au stress de L. monocytogenes est cruciale pour l'identification des souches particulièrement tolérantes.

Pour améliorer l'identification fiable de la variabilité des phénotypes de tolérance au stress bactérien, nous avons compilé un protocole à grande échelle pour l'ensemble des données et l'analyse des expériences de croissance microbienne, fournissant une approche systématique et une liste de contrôle pour les expériences sur la capacité de croissance spécifique de la souche. Notre étude a illustré la diversité et la variation spécifique des souches de L. monocytogenes à la tolérance au stress avec une portée sans précédent et a permis de découvrir des phénotypes dépendant du sérotype et de la lignée biologiquement pertinente de la tolérance au NaCl.