Des scientifiques isolent le virus vivant du COVID-19 des matières fécales et détectent de l'ARN sur des surfaces

« Des scientifiques isolent le virus vivant du COVID-19 des matières fécales et détectent de l'ARN sur des surfaces », source article de Mary Van Beusekom paru le 19 mai dans CIDRAP News.

Des chercheurs chinois ont isolé le virus vivant du COVID-19 dans des selles de patients décédés de la maladie, selon un article publié hier dans Emerging Infectious Diseases.

Dans la même revue, un groupe distinct de chercheurs chinois a rapporté la détection d'ARN du SARS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, sur les surfaces des chambres d'hôtel utilisées pour mettre en quarantaine les personnes soupçonnées d'être atteintes de la maladie.

Des fèces aérosolisées, vecteur possible de la maladie

Dans la première étude, des chercheurs décrivent le cas d'un patient COVID-19 de 78 ans qui avait récemment voyagé à Wuhan, Chine, et qui a été hospitalisé à Guangzhou, Chine, le 17 janvier. L'homme avait une toux, des fièvres sporadiques, et les résultats anormaux de la tomodensitométrie du thorax.

Le 22 janvier, le patient a été placé sur ventilateur après que son conditionnement ait empiré. Le test par RT-PCR a détecté l'ARN du SARS-CoV-2 dans quatre échantillons de matières fécales prélevés du 27 janvier au 7 février. Des antigènes du virus ont également été trouvés sur des cellules de la surface gastro-intestinale prélevées à partir d'un échantillon de biopsie. Le patient est décédé le 20 février.

Les échantillons fécaux contenaient des charges d'ADN viral plus élevées que les échantillons respiratoires prélevés 17 à 28 jours après l'apparition des symptômes. Les chercheurs n'ont pas pu isoler le virus vivant d'échantillons fécaux collectés à des moments ultérieurs, bien que la RT-PCR ait continué à détecter de l'ARN viral, « indiquant uniquement des fragments d'ARN, pas de virus infectieux, dans les fèces de ce patient », ont-ils écrit.

Lorsque les chercheurs ont coloré négativement les résidus d'une culture et les ont visualisés à l'aide d’un microscope électronique à transmission, ils ont vu des particules virales sphériques avec des protéines de pointe caractéristiques du SRAS-CoV-2.

Ils ont également collecté des échantillons fécaux de 27 autres patients, dont 11 ont été testés positifs pour l'ARN viral au moins une fois. Ils ont pu isoler le SARS-CoV-2 vivant de deux d'entre eux, « indiquant que le virus infectieux dans les matières fécales est une manifestation courante du COVID-19 », ont-ils dit.

Les auteurs ont dit que leurs résultats montrent la nécessité pour le personnel hospitalier de nettoyer soigneusement les surfaces après le rétablissement ou le décès d'un patient atteint d'une maladie grave pour éviter la propagation potentielle du virus à partir des matières fécales.

Ils ont noté une étude de 2004 suggérant que des conduites d'égout défectueuses avaient conduit à l'aérosolisation de matières fécales contaminées par le SRAS-CoV-1, le virus qui cause le syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS), dans un immeuble résidentiel à Hong Kong lors de l'épidémie de 2003 de cette maladie. Sur 329 résidents malades, 42 sont décédés.

« L'isolement du SARS-CoV-2 infectieux dans des matières fécales indique la possibilité d'une transmission fécale-orale ou fécale-respiratoire par les matières fécales en aérosols », ont-ils écrit.

Les taies d'oreiller et les draps les plus fortement contaminés

Dans la deuxième étude, des chercheurs ont trouvé de l'ARN du SARS-CoV-2 sur 8 des 22 surfaces (36%) et de la literie prélevées dans deux chambres d'hôtel après que deux anciens invités présymptomatiques eurent confirmés la présence de COVID-19.

Les clients étaient des étudiants chinois qui sont retournés en Chine après avoir étudié à l'étranger les 19 et 20 mars. Bien qu'ils soient asymptomatiques, ils devaient être mis en quarantaine à l'hôtel pendant 14 jours mais testés positifs pour COVID-19 par test RT-PCR deux jours après la mise en quarantaine. Après l'hospitalisation des deux patients, des échantillons du nez et de la gorge, des expectorations et de matières fécales ont tous montré des charges élevées d'ARN du SARS-CoV-2. Ils ont tous deux développé de la fièvre et de la toux, et l'un d'eux avait des anomalies de la tomodensitométrie du thorax.

Environ 3 heures après que les patients aient été testés positifs, les chercheurs ont prélevé les poignées des portes, les interrupteurs d'éclairage, les poignées des robinets, les thermomètres, les télécommandes TV, les taies d'oreiller, les housses de couette, les draps, les serviettes, les poignées de porte de salle de bain et des toilettes des deux chambres d'hôtel et d'une chambre. qui était resté inoccupé. Parce que l'hôtel avait été fermé du 24 janvier au 18 mars, seuls les deux étudiants y étaient restés.

Six (55%) des 11 échantillons de la chambre d'hôtel d'un patient ont été testés positifs pour l'ARN du SRAS-CoV-2, y compris la feuille, la housse de couette, la taie d'oreiller et la serviette; la taie d'oreiller et le drap avec lesquels le patient a eu un contact prolongé ont une charge virale élevée. La taie d'oreiller dans la chambre d'hôtel de l'autre patient a également été testée positive.

« Les patients présymptomatiques avec une forte perte virale peuvent facilement contaminer l'environnement en peu de temps », ont écrit les auteurs, reconnaissant qu'ils n'avaient pas isolé de virus vivant des échantillons.

Ils ont recommandé que les draps usagés ne soient pas secoués lorsqu'ils sont retirés des lits et qu'ils devraient être soigneusement nettoyés et séchés avant d'être réutilisés.

NB : On souhaite bon courage à ceux qui vont mettre en place des labels dans les chambres des hébergements ayant accueillis des personnes asymptomatiques ...