La transplantation de microbiote fécal favorise la réduction des bactéries résistantes, selon un essai clinique

«La transplantation de microbiote fécal favorise la réduction des bactéries résistantes, selon un essai clinique», source article de Chris Dal paru le 3 novembre 2023 dans CIDRAP News.

Les données d'un petit essai clinique randomisé indiquent que la transplantation de microbiote fécal peut réduire la colonisation par des micro-organismes multirésistants aux antibiotiques (MMAs) chez les receveurs de greffe de rein, ont rapporté des chercheurs cette semaine dans Science Translational Medicine.

Dans l'essai de phase 1, une équipe dirigée par des chercheurs de la faculté de médecine de l'Université Emory a recruté et randomisé 11 receveurs de transplantation rénale (RTR) pour recevoir une transplantation de microbiote fécal (ou TMF est une procédure au cours de laquelle les selles d'un donneur sain sont transplantées à un patient) ou une période d'observation. suivi d'une TMF retardée si les cultures de selles étaient positives pour MMAs à J36. Les patients transplantés rénaux présentent un risque élevé de colonisation et d'infection par des MMAs, car ils reçoivent des antibiotiques prophylactiques après la transplantation, qui peuvent sélectionner des MMAs. Ils constituent donc une priorité pour la décolonisation, car de nombreux antibiotiques utilisés pour traiter les infections par des MMAs sont néphrotoxiques.

Les 11 patients ont finalement reçu au moins une dose de TMF, dont 9 ont reçu deux traitements. Bien qu'aucun participant du groupe d'observation n'ait présenté une décolonisation des MMAs de façon spontanée, 4 des 6 participants randomisés dans le groupe TMF étaient MMAs négatifs après une dose, et 8 des 9 participants ayant reçu toutes les TMF spécifiées dans le protocole étaient MMAs négatifs lors de leur dernière visite. De plus, après 180 jours, les participants traités par TMF avaient un délai plus long avant de récidiver une infection par des MMAs par rapport à un groupe témoin de receveurs de transplantation rénale qui n'avaient pas reçu de TMF.

Compétition de souches bactériennes

L'analyse des isolats de Escherichia coli provenant d'un sous-ensemble du groupe de traitement par TMF a révélé que, plutôt que de simplement éradiquer les souches MMAs, la TMF semblait favoriser la compétition avec les souches de E. coli sensibles aux antibiotiques qui étaient présentes chez les patients avant la TMF, avec les souches sensibles de remplacement des souches MMAs.

«Nous concluons que les thérapies microbiologiques comme la TMF pourraient permettre d'exploiter la compétition entre les souches bactériennes pour éradiquer la colonisation par des MMAs», ont écrit les auteurs. «Cet essai a également fourni la preuve que la réduction de la colonisation par des MMAs dans les TMF pourrait réduire la récidive des infections par des MMAs, ce qui présente un large potentiel pour améliorer les soins aux patients et la réponse de santé publique et pour réduire les coûts des soins de santé dans les groupes de patients au-delà des receveurs de greffe d'organe solide».

Le CDC met en garde contre l'augmentation de la shigellose ultrarésistante aux antibiotiques

«Le CDC met en garde contre l'augmentation de la shigellose ultrarésistante aux antibiotiques», source article de Chris Dall paru le 28 février 2023 dans CIDRAP News.

Le Centers for Disease Control and Prevention (CDC) a émis un avis sur une augmentation des infections à Shigella ultrarésistantes aux antibiotiques (URA) aux États-Unis.

Dans un avis de santé publié à la fin de la semaine dernière par le Health Alert Network (HAN) du CDC, l'agence a déclaré que 5% des infections à Shigella (shigellose) signalées en 2022 étaient causées par des souches URA, contre 0% en 2015 (voir graphique ci-dessus). Ces souches sont résistantes aux antibiotiques empiriques et alternatifs couramment recommandés.

La shigellose est une affection gastro-intestinale causée par l'une des quatre espèces de bactéries Shigella, Shigella sonnei, S. flexneri, S. boydii ou S. dysenteriae. Les symptômes vont de la diarrhée légère à la dysenterie sévère. La plupart des cas sont spontanément résolutifs, mais les antibiotiques sont fréquemment utilisés pour traiter les symptômes plus graves et réduire l'excrétion, ce qui peut aider à limiter la transmission.

Le CDC affirme qu'en plus de limiter les options de traitement pour les patients, les souches de Shigella URA sont préoccupantes car elles peuvent propager des gènes de résistance aux antimicrobiens à d'autres bactéries entériques.

«Compte tenu de ces problèmes de santé publique potentiellement graves, le CDC demande aux professionnels de la santé d'être vigilants quant à la suspicion et au signalement des cas d'infection Shigella URA à leur service de santé local ou national et d'éduquer les patients et les communautés à risque accru sur la prévention et la transmission», a déclaré l'agence.

Changement démographique vers des adultes à risque

L'alerte HAN fait suite à une série de rapports sur les épidémies de Shigella URA en Europe, au Royaume-Uni et aux États-Unis. Bon nombre de ces épidémies se sont produites au sein de réseaux d'hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH), la transmission se produisant par l'activité sexuelle.

En janvier, des chercheurs de la faculté de médecine de l'Université de Washington et du département de santé publique de Seattle et du comté de King ont décrit une épidémie en cours impliquant plusieurs souches URA à Seattle qui a commencé en 2017 et s'est propagée à la fois aux HSH et aux sans-abri.

Les responsables du CDC affirment que l'alerte a été déclenchée par plusieurs rapports de Shigella URA des départements de santé de l'État à travers le pays, ainsi que par des questions de cliniciens des maladies infectieuses sur la façon de traiter ces infections.

«Ce qui nous a vraiment poussés à agir, c'est de recevoir ces demandes répétées de la part de nos partenaires de santé et de cliniciens de l'État disant «nous ne savons pas quoi faire de ce que nous voyons», a déclaré l'épidémiologiste médicale du CDC Louise François Watkins à CIDRAP News. «J'ai juste eu l'impression que c'était peut-être le moment de le mettre cela en avant.»

La shigellose est généralement associée à une exposition à des aliments ou à de l'eau contaminés par des matières fécales humaines et est très contagieuse, se propageant facilement dans des environnements surpeuplés et mal équipés. Elle provoque environ 450 000 cas d’infection aux États-Unis chaque année.

«Les bactéries Shigella se transmettent si facilement, et elles ont une dose infectieuse si faible, que les épidémies sont courantes, et vous le voyez généralement chez les personnes en contact étroit ou dans des conditions de surpeuplement», a déclaré le médecin du CDC Naeemah Logan.

Le CDC note qu'historiquement, Shigella sensible aux médicaments a principalement touché les jeunes enfants (âgés de 1 à 4 ans) aux États-Unis, avec une propagation couramment observée dans les garderies d’enfants qui ne sont pas propres.

Mais cela semble changer. Peut-être à cause de la pandémie de la COVID-19, les cas de shigellose chez les enfants américains ont diminué au cours des dernières années. Dans le même temps, l'agence affirme avoir constaté une augmentation des infections à Shigella résistantes aux antibiotiques, en particulier les HSH, mais aussi chez les sans-abri, les voyageurs internationaux et les personnes vivant avec le VIH.

«Il semble que nous ayons assisté à un changement démographique vers davantage de cas chez les hommes adultes», a dit Louise François Watkins. Et bien que le CDC ne recueille pas systématiquement les antécédents sexuels lorsqu'il reçoit des rapports de cas, Louise François Watkins a noté que dans des enquêtes spécifiques sur les épidémies, des patients masculins ont signalé de nouveaux partenaires sexuels.

Plus de 230 cas URA

Ces tendances se reflètent dans les données de l'avis de santé HAN. De 2015 au 22 janvier de cette année, le CDC dit avoir reçu des rapports sur 239 isolats de Shigella URA, principalement S. sonnei (66%) et S. flexneri (34%).

L'âge médian des cas-patients était de 42 ans et sur les 232 patients pour lesquels des informations étaient disponibles, 82% étaient des hommes. Sur les 41 patients qui ont répondu aux questions sur l'activité sexuelle, 88% ont déclaré avoir eu des contacts sexuels entre hommes.

Mais ce ne sont là que les cas qui ont été identifiés grâce à la surveillance. Toutes les personnes atteintes de shigellose ne vont pas chez le médecin, et celles qui le font n’ont pas toujours de cultures de selles, qui doivent ensuite être transmises aux services de santé de l'État pour une analyse plus approfondie, y compris le séquençage du génome entier.

«C'est définitivement la pointe de l'iceberg», a déclaré Louise François Watkins. «Il faut que beaucoup de choses se passent pour qu'un cas entre dans notre système de surveillance.»