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mardi 2 juillet 2019

La mondialisation augmente les risques de problèmes multinationaux en matière de sécurité sanitaire des aliments, selon la FAO


La mondialisation ne serait-elle pas heureuse avec ce monde merveilleux dont on nous rabat régulièrement les oreilles ?

« La mondialisation augmente les risques de problèmes multinationaux en matière de sécurité sanitaire des aliments, selon la FAO », source Food Safety News.

Selon l’agence des Nations Unies, la mondialisation croissante de l'approvisionnement alimentaire signifie que les populations du monde entier sont davantage exposées à différents risques.

Dans une brochure sur l'avenir de la sécurité sanitaire des aliments, l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO) a déclaré que les pays qui dépendent fortement des importations de produits alimentaires sont particulièrement préoccupés par le fait que des maladies évitables d'origine alimentaire continuent de toucher des millions de personnes chaque année.

Les aliments sont produits et transformés en volumes plus importants et distribués sur de plus grandes distances qu'auparavant. L'expansion du commerce agricole a augmenté les risques que des aliments non sûrs produits dans un pays puissent affecter les consommateurs d'un autre. Un défi croissant est que les autorités chargées des contrôles officiels ne contrôlent pas directement le processus de production des partenaires commerciaux.

Il peut être difficile pour les petits producteurs des pays en voie de développement et des économies émergentes de se conformer aux exigences de la réglementation alimentaire nationale sur les marchés d'exportation. De nombreux pays en voie de développement importent une part importante des réserves alimentaires de leur population. Certains, comme les îles du Pacifique, dépendent presque entièrement des importations pour assurer la sécurité des aliments.

Les volumes élevés de produits alimentaires importés, ainsi que la diversification de l'origine et la complexité croissante des technologies utilisées dans les approches de suivi traditionnelles, signifient que les inspections intermittentes aux frontières ne sont plus suffisantes, selon la FAO.

Passer de réactif à proactif
Les résidus chimiques et la contamination microbiologique continuent à poser des risques pour la santé publique et à perturber les échanges commerciaux, entraînant des coûts économiques et sociaux considérables. Les épidémies de maladies d'origine alimentaire et les rappels peuvent avoir de vastes conséquences et avoir un impact sur la confiance des consommateurs.

La FAO reconnaît que les coûts liés aux aliments non sûrs vont au-delà de la souffrance humaine. Elle entrave le développement socio-économique, surcharge les systèmes de santé et compromet la croissance économique et le commerce. Les menaces pesant sur la sécurité sanitaire des aliments pèsent sur les économies en raison des perturbations ou des restrictions du commerce agroalimentaire mondial et régional, de la perte de produits alimentaires et des revenus correspondants, ainsi que du gaspillage de ressources naturelles.

Les défis mondiaux transforment la manière dont les aliments sont produits, commercialisés, consommés et réfléchis. Il y a une population croissante et une demande alimentaire accrue, les impacts négatifs de la dégradation de l'environnement, du changement climatique, de la rareté de l'eau, de la perte de biodiversité, des conflits et des inégalités socio-économiques. Le monde est confronté à une convergence sans précédent de pressions provenant de fronts socioéconomiques, environnementaux et politiques.

Le passage  matière de sécurité des aliments de « la réaction et la réponse » à la « prévision et la prévention » nécessite des approches structurées pour la collecte et l'analyse de renseignements permettant une identification précoce des problèmes émergents.

La FAO a indiqué qu'elle travaillait avec les membres et les experts internationaux pour fournir des orientations aux pays en développement et aux pays émergents afin que les meilleures preuves disponibles soient utilisées pour éclairer les décisions en matière de sécurité sanitaire des aliments. Ces orientations sont adaptées aux besoins des pays, en particulier ceux qui peuvent être pauvres en données ou disposer de systèmes de contrôle moins développés.

Le Mali a amélioré sa prise de décision en matière de sécurité sanitaire des aliments en adoptant un cadre d'analyse des risques. Les responsables ont demandé l'avis de la FAO et un programme de renforcement des capacités de deux ans a été lancé en 2014. Une formation a été dispensée sur l'utilisation des données nationales pour hiérarchiser les risques et optimiser leur gestion.

Les gestionnaires des risques en matière de sécurité sanitaire des aliments doivent souvent prendre des décisions en tenant compte de l’équilibre entre les priorités en matière de sécurité sanitaire des aliments et des ressources et en choisissant les interventions les plus appropriées pour minimiser les risques. Ils doivent influencer les décisions de haut niveau sur la base des meilleures données et preuves disponibles pour donner la priorité à la sécurité alimentaire dans leur pays.

La FAO et l'Organisation mondiale de la santé fournissent des avis scientifiques aux autorités nationales pour appuyer la mise au point de systèmes modernes de contrôle des aliments, tels que le séquençage du génome entier aux fins de la surveillance épidémiologique des agents pathogènes d'origine alimentaire. Les systèmes de surveillance permettent aux autorités de mieux comprendre les principaux risques en matière de sécurité des aliments et de recentrer les efforts de prévention.

Un projet arménien débute
Dans le même temps, un projet de deux ans visant à renforcer la sécurité des aliments et la santé animale a été lancé en Arménie.

La conformité avec les réglementations et les normes internationales, la capacité d’évaluation des risques et les approches fondées sur les risques dans les systèmes de contrôle des aliments posent des problèmes dans le pays.

« La sécurité sanitaire des aliments signifie avoir des producteurs diligents fournissant des aliments sains, des consommateurs suffisamment informés de leurs droits et un système d'inspection permettant aux entreprises du secteur alimentaire de ne pas nuire aux consommateurs », a déclaré Georgi Avetisyan, responsable du corps de l'inspection de la sécurité sanitaire des aliments.

L'organisme d'inspection de la sécurité sanitaire des aliments est la principale institution chargée du contrôle et de la gestion officielle de la sécurité des aliments et de la santé des animaux et des végétaux.

Le projet de la FAO aidera à identifier et à améliorer les bases factuelles et les sources de données sur la sécurité sanitaire des aliments et les risques pour la santé des animaux et la préservation des végétaux et à mettre en œuvre des évaluations des risques afin de déterminer les priorités en matière de sécurité sanitaire des aliments. Cela contribuera à la mise en place de contrôles et à la gestion des risques afin d'éviter des aliments et des mouvements d'animaux non sûrs. Les capacités des opérateurs économiques en matière de systèmes de management de la sécurité des denrées alimentaires et les services d'inspection en matière de catégorisation des risques vont être améliorées.

Mary Kenny, responsable de la sécurité des aliments et de la protection des consommateurs à la FAO, a déclaré que le projet aidera l'Arménie à utiliser les ressources disponibles pour cibler les problèmes les plus préoccupants.

« Le projet aidera l’organe d’inspection de la sécurité des aliments à concrétiser sa vision: un cadre institutionnel solide et efficace, des décisions adaptées fondées sur des preuves et des processus de travail performants. »

« L’approche One Health sera appliquée pour évaluer et gérer les risques pouvant exister à l’interface entre humains-animaux et plantes », a-t-elle déclaré.

lundi 1 juillet 2019

L'utilisation du séquençage du génome complet des pathogènes est ‘extrêmement limitée’ dans les pays en voie de développement


Getty Image
« L’utilisation du séquençage du génome complet des pathogènes est ‘extrêmement limitée’ dans les pays en voie de développement », source Food Safety News.

Selon une étude, l'utilisation du séquençage du génome complet est extrêmement limitée dans la plupart des pays en voie de développement.

Des chercheurs ont constaté que, bien que certains pays n’aient pas la capacité de collecter et d’analyser les données générées par le séquençage du génome complet, la principale lacune technique dans la plupart des pays en voie de développement réside dans l’interprétation des données faisant appel à la bioinformatique. L'étude a été publiée dans le journal Foodborne Pathogens and Disease et est disponible gratuitement et en intégralité.

Un examen de la portée et une session d’un groupe de discussion ont permis de comprendre l'utilisation de séquençage du génome complet pour la surveillance des maladies d'origine alimentaire et la surveillance des aliments à l'échelle mondiale et d'identifier les limites pour les pays en voie de développement dans l'adoption du séquençage du génome complet pour leurs systèmes de contrôle des aliments. Des experts du Ghana, d’Iran, des Philippines, du Soudan, de la Tanzanie et de la Thaïlande faisaient partie du groupe de discussion.

La sous-déclaration des maladies d'origine alimentaire et les cas de contamination microbienne est fréquente dans les pays développés et en voie de développement; toutefois, le nombre extrêmement faible de foyers déclarés par les pays en voie de développement ne reflète probablement pas la situation réelle dans ces pays.

Différences entre pays développés et en voie de développement
Les résultats ont montré que certains pays développés utilisent régulièrement le séquençage du génome complet dans les systèmes de surveillance des aliments, ce qui permet de mieux comprendre les causes des épidémies. Dans les pays en voie de développement, la connaissance du séquençage du génome complet existe dans les secteurs universitaires et de la recherche; toutefois, au niveau gouvernemental, on comprend peu l’utilité de ce principe pour les activités de réglementation de la sécurité sanitaire des aliments.

Les lacunes dans les connaissances et les capacités des pays développés et en voie de développement concernant l'utilisation du séquençage du génome complet introduiront probablement une inégalité dans le commerce international des produits alimentaires. Les organisations internationales et les pays qui connaissent déjà bien le séquençage du génome complet ont un rôle important à jouer pour aider les pays en voie de développement à tirer pleinement parti de la technologie et de ses applications dans la gestion de la sécurité des denrées alimentaires, ont déclaré des chercheurs.

L'examen de la portée a révélé que plus de 10 pays utilisaient le séquençage du génome complet à des fins réglementaires, contre quatre qui l'utilisaient pour la gestion de la sécurité des denrées alimentaires en 2016. Toutefois, il a également été constaté que ces autres pays étaient des pays développés. Il n'y avait aucune donnée indiquant qu'un pays en voie de développement ait commencé à utiliser le séquençage du génome complet dans le système gouvernemental, ce qui a été confirmé par le groupe de discussion.

Tous les participants au groupe de discussion se sont déclarés prêts à utiliser la technologie pour contribuer à leurs systèmes nationaux de contrôle des aliments, mais le manque d'engagement des niveaux hiérarchiques supérieurs a constitué un obstacle à leur utilisation.

Selon les membres du groupe de discussion, des laboratoires nationaux bien équipés sont disponibles pour l'analyse des isolats, mais le séquençage du génome complet doit être effectué systématiquement si ce système est utilisé comme base pour les systèmes de surveillance des aliments, selon l'étude.

Le séquençage du génome complet est-il rentable?
Certains instituts de recherche, tels que l’Institut Pasteur en France, ont mené des études sur le séquençage du génome complet dans des pays en voie de développement pour promouvoir la technologie. Avant d'introduire le séquençage du génome complet, il est essentiel que les pays disposent d'un mécanisme systématique pour collecter les isolats et les métadonnées à partir d'échantillons cliniques, d'aliments et de l’environnement.

« En supposant qu'il soit déjà coûteux pour les pays en voie de développement de mettre pleinement en œuvre les méthodologies traditionnelles pour détecter les épidémies d'origine alimentaire, il est nécessaire de se demander si l'intégration du séquençage du génome complet serait rentable pour améliorer les situations de détection/déclaration d'épidémie », selon l'étude.

L'universalité du séquençage du génome complet a un avantage en efficacité et le coût par échantillon a diminué. Bien que cela puisse contribuer à des économies de coûts pour l'identification des agents pathogènes d'origine alimentaire, le coût global peut rester élevé, car le séquençage du génome complet nécessite des infrastructures appropriées et un équipement en état de fonctionnement et du personnel.

En juillet 2018, entre 11 000 et 18 000 articles scientifiques traitaient de l'utilisation des technologies génomiques pour l'identification, l'investigation et/ou la prévention des épidémies de maladies d'origine alimentaire.

Des études de cas réalisées aux États-Unis, au Danemark et en Angleterre ont montré comment le séquençage du génome complet peut être intégré au système réglementaire de sécurité sanitaire des aliments pour les investigations sur les épidémies avec des avantages, telles que la spécificité, permettant une meilleure définition des cas pour améliorer la gestion des épidémies, la sensibilité, permettant de lier des maladies apparemment sporadiques survenant sous le radar de la surveillance des épidémies et la précision, déterminant la cause fondamentale des éclosions complexes.

L’introduction du séquençage du génome complet au Kenya a attiré l’attention des décideurs sur l’importance de la sécurité sanitaire des aliments et a servi de base à la mise en place d’un système national de contrôle des aliments. Le Kenya Medical Research Institute a introduit le séquençage du génome complet pour séquencer des souches d'agents pathogènes sélectionnés à partir d'échantillons cliniques et le gouvernement a été en mesure de cartographier les points chauds de la maladie afin de réviser les systèmes existants et d'identifier les aliments à haut risque.

Les bases de données et les plates-formes pour le partage de données du séquençage du génome complet comprennent la base de données Genome Trakr de la FDA, European Nucleotide Archive et la DNA Data Bank of Japan. Certaines initiatives, telles que le Global Microbial Identifier, tentent de renforcer le partage mondial des données.