Il était une fois, les pathogènes, les fromages et l’Anses

Du 6 au 14 décembre 2023, 28 fromages ont été rappelés pour cause de présence de STEC, mais comme l’on dit sans transition, voici que l’Anses nous informe le 15 décembre 2023, «Fabriquer des fromages pour étudier les risques sanitaires»

Pour étudier les risques de transmission d’organismes pathogènes via la consommation de fromages, plusieurs équipes de l’Anses vont en fabriquer en laboratoire. Une tâche rendue complexe par les précautions nécessaires pour éviter toute contamination extérieure par les microorganismes étudiés.

Deux projets portant sur les risques de transmission de microorganismes pathogènes de l’animal à l’être humain via la consommation de fromages ont été initiés ces derniers mois.

- virus de l’encéphalite à tiques : comprendre les différences entre fromage de chèvre et de vache

- Brucella melitensis : évaluer le risque de contamination du reblochon

Pour les autres pathogènes, prière de vous adresser à l’Anses ...

Complément du 17 décembre 2023

Selon ce RappelConso, il y a eu, à ce jour, 99 avis de rappel de fromages pour cause de présence de STEC et 653 avis de rappels (tous produits confondus) pour cause de présence de Listeria monocytogenes ...

Les Pays-Bas enregistrent une hausse des foyers de cas d'intoxication alimentaire en 2022

«Les Pays-Bas enregistrent une hausse des foyers de TIAC en 2022», source article de Joe Whitworth paru le 26 septembre 2023 dans Food Safety News.

Il y a eu une augmentation significative du nombre de foyers d’intoxication alimentaire et de personnes malades en 2022 aux Pays-Bas, selon des chiffres récents.

En 2022, 1 165 foyers de cas ont été signalés, et 4 470 personnes sont tombées malades. En 2021, il y a eu 838 foyers avec 3 517 cas. Les causes spécifiques de cette augmentation sont incertaines, mais pourraient être dues à des facteurs tels qu'une meilleure information ou une pénurie de personnel et un manque de connaissances et d'expérience dans l’industrie.

Les informations sur les foyers de cas d’intoxication alimentaire proviennent de l'Autorité néerlandaise de sécurité des produits alimentaires et de consommation (NVWA) et des services municipaux de santé publique (GGD). NVWA inspecte l'endroit où les aliments sont préparés ou vendus, ou d'où ils viennent. Le Wageningen Food Safety Research (WFSR) examine si les aliments contiennent des agents pathogènes. Les GGD se concentrent sur les personnes infectées pour tenter de découvrir ce qui les a rendues malades.

Un article antérieur révélait que la plupart des infections d’origine alimentaire avaient augmenté aux Pays-Bas en 2022 par rapport à l’année précédente.

Agents connus dans les foyers d’intoxication alimentaire

Un agent pathogène a été identifié chez des patients et/ou dans des prélèvements alimentaires ou environnementaux dans 23 des 1 165 rapports, mais l'agent était inconnu dans 1 142 foyers d’intoxication alimentaire.

Salmonella était à l'origine de six éclosions signalées, cinq étaient dus à Campylobacter et quatre étaient liés à norovirus. E. coli producteur de shigatoxines (STEC) a provoqué trois épidémies, tandis que Listeria et Shigella sonnei ont été chacun responsables d'un incident. Lors d'une épidémie, Staphylococcus aureus et STEC ont été suspectés, avec 30 personnes malades.

Au total, 101 personnes ont été touchées par les épidémies à Salmonella, 53 par des épidémies à norovirus, 49 par des épidémies à STEC et 47 par des épidémies à Shigella. Des épidémies à Campylobacter ont fait 22 malades, et celle de Listeria a eu sept cas.

La majorité des épidémies concernaient deux à quatre patients. Viennent ensuite les épidémies impliquant cinq à neuf patients. Il y a eu 17 grandes épidémies, impliquant 25 patients ou plus.

Cinq des 23 foyers dans lesquels un agent pathogène a été détecté concernaient des prélèvements environnementaux. Lors d’une épidémie, Listeria a été détectée dans des prélèvements de surveillance qui, grâce au séquençage du génome entier, ont été liés à un groupe de patients. Au cours d'autres épidémies, STEC O157 a été détecté dans des poulets et des maquereaux ont été testés positifs pour Staphylococcus aureus.

Norovirus a été détecté dans des huîtres lors d'une épidémie au cours de laquelle norovirus et sapovirus ont été retrouvés chez des patients. Cette épidémie comprenait trois groupes de personnes tombées malades après avoir mangé des huîtres dans des restaurants.

Dans une douzaine d’épidémies, un agent pathogène n’a été détecté que chez des patients. Lors d'une épidémie à STEC O157, un lien vital a été observé avec des produits de bœuf qui auraient pu être consommés crus ou pas entièrement cuits, tels que du filet américain, des saucisses de bœuf, de la viande hachée et des hamburgers. Les enquêtes sur une autre épidémie, avec 26 cas, ont identifié un gâteau fourni par une boulangerie locale comme source probable.

Incidents pluriannuels liés à Listeria

La plus grande épidémie en 2022 concernait 96 cas provenant de 103 personnes ayant assisté à des funérailles. La cause n’a pas été trouvée, mais étant donné la période d’incubation signalée d’environ une journée, l’agent pathogène était probablement norovirus.

Lors de l’épidémie à Listeria, avec sept cas, des personnes sont tombées malades entre août 2022 et janvier 2023. Cependant, quatre cas ont été enregistrés entre août et septembre 2019 avec la même souche. Cela a été attribué à un producteur d'un type de saucisse à base de foie.

L’entreprise faisait l’objet d’une surveillance accrue et deux cas de maladie ont été observés en 2020 et 2021. Les enquêtes ont révélé que les contrôles plus stricts avaient été supprimés plus tôt en 2023 et les tests ont à nouveau révélé la souche épidémique dans des prélèvements environnementaux. Des mesures de maîtrise ont de nouveau été prises sur le site.

Une situation similaire s’est produite chez un producteur de poisson. Quatre cas se sont produits entre août 2021 et janvier 2022, liés à la surveillance d'isolats de différents types de poisson fumé. Une enquête plus approfondie a permis d'identifier une entreprise de transformation du poisson et des mesures de maîtrise ont été prises. Plus tard dans l’année, quatre autres personnes sont tombées malades. Des souches de Listeria faisant partie du groupe d'épidémies ont été trouvées dans des prélèvements de produits et d'environnement à l'usine, des mesures renforcées ont donc été mises en œuvre.

Entre 2017 et 2020, une souche de Listeria attribuée à un producteur de saumon a été observée chez un à trois patients par an ainsi que dans des prélèvements de produits et environnementaux. En décembre 2021 et début 2022, cinq personnes ont été malades, la souche épidémique a été découverte chez le producteur, ce qui a incité à prendre des mesures, notamment un nettoyage en profondeur, du site. Au premier semestre 2022, il y a eu deux autres patients et en novembre 2022, un autre cas a été signalé.

La FAO et l'OMS publient un rapport complet sur les dangers liés aux fruits et aux légumes frais

«La FAO et l'OMS publient un rapport complet sur les dangers liés aux fruits et aux légumes frais», source article de Joe Whitworth paru le 14 septembre 2023 dans Food Safety News.

La FAO et l'OMS ont publié le rapport complet d'une analyse visant à réduire le risque de dangers microbiologiques dans les fruits et légumes frais.

Le document de l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO) et de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) couvre les légumes verts à feuilles et les herbes, les baies et les fruits tropicaux, les melons et les fruits de vergers, ainsi que les légumes à graines et les légumes-racines

Les réunions conjointes d'experts FAO/OMS sur l'évaluation des risques microbiens (JEMRA) ont publié un résumé des conclusions l'année dernière, mais le rapport final est désormais disponible dans le cadre de la série d'évaluation des risques microbiologiques (MRA pour Microbiological Risk Assessment).

En 2019, la Commission du Codex Alimentarius a approuvé l'élaboration de lignes directrices pour le contrôle de E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) dans les légumes verts à feuilles et les graines germées.

Pour soutenir cela, le JEMRA a organisé une série de sessions sur la prévention et le contrôle des risques microbiologiques dans les fruits et légumes frais. Une réunion en septembre 2021 a porté sur les fruits et légumes prêts à consommer et peu transformés, y compris les légumes verts à feuilles. Un événement ultérieur a porté sur les graines germées depuis la production de graines destinées à la germination jusqu'au point de vente.

Évaluer les moyens de réduire les risques

Des scientifiques ont évalué les interventions spécifiques aux produits utilisées lors de la production de fruits et légumes, depuis la production primaire jusqu'à la récolte, en passant par le transport, le point de vente et l'utilisation par le consommateur. Ces produits sont principalement consommés crus et ont une durée de conservation limitée.

Les experts ont constaté que les mesures préventives telles que les bonnes pratiques agricoles (BPA) et les bonnes pratiques d'hygiène (BPH) pendant la production primaire restent les moyens les plus efficaces pour réduire le risque d'agents pathogènes dans les fruits et légumes.

Les activités après récolte nécessitent des BPH, de bonnes pratiques de fabrication (BPF) et un système foné sur l'analyse desdangers et des points critiques pour leur maîtrise (HACCP) pour prévenir la contamination microbienne, réduire la contamination croisée ou éviter la croissance d'agents pathogènes.

Des systèmes de production très diversifiés sont utilisés pour cultiver une gamme de légumes verts à feuilles dans des régions géographiques aux environnements, à la biodiversité et au climat variables. En outre, les récoltes de ces systèmes sont livrées aux consommateurs via différents canaux de marché.

Les eaux d’irrigation de qualité microbiologique médiocre ou variable ont été qualifiées de «facteur de risque majeur» lors de la production de fruits et légumes. La qualité de l’eau de traitement était également d’une importance cruciale.

Plusieurs méthodes, telles que les UV, le plasma, la lumière pulsée et les ultrasons, ont été étudiées pour la désinfection des eaux de traitement. Cependant, il existe peu de preuves de son utilisation dans l’industrie.

«Le manque d'adoption des interventions par l'industrie indique la nécessité de recherches futures pour aborder plus attentivement le caractère pratique des nouvelles technologies et examiner leurs performances dans des conditions qui simulent étroitement la production sur le terrain, le conditionnement à l’exploitation agricole et la transformation commerciale, ou par expérimentation. dans les installations de transformation commerciale», ont dit les experts.

Légumes, fruits et baies

L'irradiation est le traitement après récolte le plus efficace contre les agents pathogènes des légumes, mais son coût et la réaction négative des consommateurs continuent d'entraver les applications commerciales. L'eau électrolysée associée à d'autres traitements peut réduire les bactéries pathogènes et les bactériophages présentent également un potentiel, mais tous deux présentent des inconvénients, ont dit les scientifiques.

Les baies peuvent être produites en plein champ et en agriculture avec un environnement contrôlé, qui comprend l'agriculture en intérieur et l'agriculture verticale, tandis que les fruits tropicaux poussent principalement sur des arbres ou des buissons. Les étapes telles que le lavage ne sont pas courantes sur les baies en raison du risque de dommages et de croissance de moisissures.

Les traitements assistés par l'eau, comme les UV et la lumière pulsée, présentaient un potentiel dans certaines situations pour les baies et les fruits tropicaux. Les méthodes à base de gaz telles que les lingettes à libération contrôlée ont également eu des effets variables.

Habituellement, les fruits à pépins, tels que les pommes et les poires, sont soumis à une atmosphère contrôlée et à un stockage au froid pour conserver les fruits plus longtemps.

La principale stratégie de sécurité sanitaire des melons et des fruits des vergers implique une manipulation hygiénique et un contrôle de l'hygiène, y compris la surveillance de l'environnement pendant le tri et le conditionnement. Il est également essentiel d’avoir un environnement et un équipement de conditionnement exempts de contamination.

«Bien que de nombreux travaux aient été réalisés sur ces produits, ils ont principalement été associés à un nombre limité d'agents pathogènes bactériens d'origine alimentaire, ce qui laisse des lacunes dans les connaissances liées aux protozoaires ou aux cibles virales», ont dit les scientifiques.

Des chercheurs évaluent le lien entre le statut social et le risque d’infection

«Des chercheurs évaluent le lien entre le statut social et le risque d’infection», source article paru le 27 août 2023 dans Food Safety News.

La relation entre le niveau de vie et l'incidence d'une infection au Royaume-Uni varie selon l'agent pathogène, selon les scientifiques.

Une étude a analysé l'association entre la privation socio-économique et l'incidence des maladies infectieuses intestinales (MII) par des pathogènes gastro-intestinaux signalés à l'Agence britannique de la santé (UKHSA).

La maladie infectieuse intestinale (MII) est une infection du tractus gastro-intestinal qui provoque une gastro-entérite. Bien que la plupart des cas soient bénins, certaines personnes doivent s'absenter du travail ou de l'école en raison de symptômes et d'agents pathogènes particuliers. Les mesures de santé publique exigent l'exclusion du travail de certains groupes, tels que les manipulateurs d'aliments.

Les données couvrent la période 2015 à 2018 pour les infections à Salmonella, Campylobacter, Shigella, Giardia et norovirus confirmées en laboratoire. Les résultats ont été publiés dans la revue Epidemiology and Infection.

Variation des pathogènes

Campylobacter et Giardia ont diminué avec l'augmentation de la privation. Cependant, l'incidence de norovirus, des espèces Salmonella non typhique, de Salmonella Typhi/Paratyphi et de Shigella augmentait avec une privation plus élevée.

Au cours d’une période d'étude de 4 ans, 314 381 patients ont été signalés, dont 167 299 étaient des hommes et 59 827 étaient des enfants.

Près de 250 000 cas vivaient dans des zones urbaines et 4% ont déclaré avoir voyagé hors du Royaume-Uni dans les sept jours suivant l'apparition des symptômes.

Environ les deux tiers des patients étaient infectés par Campylobacter, 6% chacun pour Giardia et Cryptosporidium, 8% chacun par norovirus et Salmonella, et 3% chacun par Salmonella Typhi/Paratyphi et Shigella.

Il y avait une nette tendance à la diminution de la probabilité d'un rapport de laboratoire avec tous les agents pathogènes issus de MII avec une privation croissante, ont dit les chercheurs. Ils ont reconnu que l’utilisation des données de surveillance nationale aboutit à un ensemble de données qui surreprésente les agents pathogènes tels que Campylobacter et sous-représente le véritable fardeau de l’infection à norovirus dans la communauté.

Résultats par mode de transmission

Pour les agents pathogènes les plus fréquemment associés à la transmission d’origine alimentaire, notamment Campylobacter et Salmonella, l’incidence était plus faible dans les zones les plus défavorisées.

«Nos résultats pourraient être influencés par le fait que des personnes qui consomment des fast-foods, des voyageurs vers des pays à revenu faible ou intermédiaire, ainsi que celles qui vivent dans des zones rurales et ont des contacts réguliers avec du bétail présentent un risque accru d'infection à Campylobacter», ont dit les scientifiques.

Pour les pathogènes d’origine hydrique, comme Giardia, l’incidence était plus faible dans les régions les plus défavorisées, même après avoir pris en compte les différences rurales et urbaines.

Pour les agents pathogènes transmis par contact de personne à personne, tels que norovirus, les espèces de Shigella et Salmonella Typhi/Paratyphi, l'incidence était plus élevée dans les quartiers les plus défavorisés.

Les infections les plus fortement associées aux zones de privation croissante étaient celles transmises par contact de personne à personne. Cette forme de transmission peut être contenue en mettant en œuvre des politiques ciblant la surpopulation et le manque d'hygiène, ont dit les chercheurs. Ceux transmis par une contamination zoonotique de l’environnement étaient les moins susceptibles d’être associés aux zones les plus pauvres.

Derrière le rideau de douche : Investigation sur l'impact des caractéristiques de la pomme de douche sur les bactéries auxquelles nous sommes exposés

«Derrière le rideau de douche : Investigation sur l'impact des caractéristiques de la pomme de douche sur les bactéries auxquelles nous sommes exposés», source communiqué de l’Université de Pittsburgh.

La professeure adjointe en génie civil et environnemental Sarah Haig a reçu 420 000 dollars de la National Science Foundation (NSF) pour comprendre comment différentes caractéristiques de la pomme de douche ont un impact sur l'exposition aux agents pathogènes associés à l'eau potable

En allant sous la douche, nous nous attendons à ce que l'eau chaude nous nettoie et nous décompresse après une longue et dure journée, mais il peut y avoir quelque chose de dangereux qui se cache dans la pomme de douche.

Les douches peuvent nous exposer à de nombreux types de cellules bactériennes. La plupart sont inoffensives, mais certaines, appelées pathogènes associés à l'eau potable pour des personnes immunodéprimées (DWPIs pour drinking water-associated pathogens of the immunocompromised), peuvent présenter un risque sérieux pour notre santé, en particulier pour les personnes dont le système immunitaire est affaibli.

Sarah Haig va mener une étude de trois ans visant à tester les différentes caractéristiques de la pomme de douche afin de comparer les concentrations de DWPIs présents dans l'eau de la douche, et les aérosols qu'elle produit.

«Il existe de nombreux types de pommes de douche sur le marché, laissant aux consommateurs le choix du type de jet, du matériau, du débit et des additifs tels que les produits chimiques tueurs de bactéries qu'ils souhaitent», a expliqué Haig. «Mais on ne sait pas comment ces décisions affectent le risque d'exposition aux DWPIs.»

Les DWPIs ont un coût élevé non seulement pour notre santé, mais aussi pour l'économie des États-Unis, coûtant 2,93 milliards de dollars par an.

Ils sont aussi incroyablement difficiles à tuer. Malgré le large éventail de processus physiques et chimiques utilisés pour traiter l'eau potable, les DWPIs peuvent survivre et continuer à se développer et à prospérer dans les circuits de tuyauterie.

Bien qu'il existe de nombreux DWPIs préoccupants, Legionella pneumophila, Pseudomonas aeruginosa et des mycobactéries non tuberculeuses (MNT) provoquent la plupart des infections respiratoires. Cependant, comme les MNT cause 57% de tous les décès dus aux maladies d'origine hydrique aux États-Unis, ce sera l'objectif principal de Haig et de son équipe.

«L'objectif pour ceux d'entre nous qui travaillent dans le domaine de la santé publique et de la prévention est d'avoir des moyens de limiter l'exposition à ces bactéries, physiquement ou chimiquement, afin de contrôler l'exposition et ainsi contrôler le risque de maladie», a déclaré Janet Stout, une collaboratrice d'Haig et vice-président exécutif et fondatrice du Special Pathogens Laboratory. «Les recherches du professeur Haig sur les tests de ces matériaux s'alignent sur ces objectifs.»

L'exposition aux DWPIs peut provenir de diverses sources, mais l'inhalation d'aérosols associés à l'eau est le plus souvent liée à une infection. Cependant, l'aérosolisation des DWPIs et sa relation avec les caractéristiques de la pomme de douche sont mal comprises.

Pour combler ce manque de connaissances, Haig et son équipe testeront des pommes de douche avec différentes caractéristiques et compareront la concentration de DWPIs présents dans l'eau de douche et les aérosols produits par l'eau de douche.

Le Dr Janet Lee, chef de la division de médecine pulmonaire et de soins intensifs, professeur émérite en médecine, professeur de pathologie et d'immunologie à l'Université de Washington à St. Louis et co-chercheuse principale de ce projet, a déclaré que ce projet apportera des informations précieuses pour la société afin de minimiser son risque d'exposition au DWPIs.

«Cette connaissance permettra aux individus de sélectionner des pommes de douche qui donnent la priorité à leur santé tout en améliorant notre compréhension globale de l'impact de nos choix dans l'environnement bâti sur notre bien-être», a déclaré Lee.

Haig dirige le laboratoire Investigating Home Water and Aerosols’ Links to Opportunistic Pathogen Exposure (INHALE) de l’Université de Pittsburgh.

NB : Les cinéphiles auront reconnu une photo de la scène de la douche dans le film Psychose d'Alfred Hitchcock.

L'Écosse réfléchit aux seuils d'action des pathogènes

«L'Écosse réfléchit aux seuils d'action des pathogènes», source article de Joe Whitworth paru le 13 juillet 2023 dans Food Safety News.

La Food Standards Scotland (FSS) envisage d'introduire des seuils d'action pour certains agents pathogènes sur la base d'une approche britannique ou écossaise.

L'utilisation de cibles basées sur les infections signalées d'agents pathogènes clés pourrait aider à surveiller les tendances et servir de déclencheur pour agir. Cependant, les chiffres devraient être interprétés avec prudence en raison de la sous-déclaration, de l'incapacité de séparer les sources alimentaires et non alimentaires, des changements démographiques et des impacts des fluctuations d'une année à l'autre des facteurs environnementaux, tels que les conditions météorologiques.

Lorsque des cas signalés dépassent le seuil, différentes étapes seraient envisagées, notamment une enquête pour identifier les raisons de l'augmentation ; prélèvements supplémentaires d’aliments associés à l'agent pathogène et communication des risques aux consommateurs à l'aide de messages personnalisés.

La FSS utilise actuellement les données de Public Health Scotland sur des rapports de laboratoire confirmés pour cinq agents pathogènes afin de surveiller l'évolution des maladies d'origine alimentaire.

Considérations sur le seuil d'action

En avril 2017, la FSS a publié une stratégie de réduction des maladies d'origine alimentaire en Écosse. L'accent a été mis sur les agents pathogènes microbiologiques qui ont la charge de morbidité la plus élevée en termes d'incidence, de gravité des symptômes et de mortalité - Campylobacter, Salmonella, E. coli producteurs de shigatoxines (STEC), Listeria monocytogenes et norovirus. Jusqu'à présent, les travaux se sont concentrés sur Campylobacter, Listeria et STEC car les cas à Salmonella sont souvent contractés à l'étranger et de nombreuses infections à norovirus sont dues à la propagation de personne à personne.

Les variations d'une année sur l'autre et le faible nombre de rapports pour certains agents pathogènes en Écosse ont rendu difficile la création de seuils appropriés. Cependant, la Food Standards Agency (FSA) a précédemment développé un système de déclenchement pour les agents pathogènes d'origine alimentaire et l'examine actuellement.

L'adoption de niveaux spécifiques écossais peut être problématique pour les agents pathogènes avec un nombre de cas inférieur, tels que Listeria, où les rapports de laboratoire confirmés sont généralement inférieurs à 20 chaque année, mais les seuils à l'échelle du Royaume-Uni devraient être pris en compte dans un contexte écossais.

Quatre autres domaines ont été identifiés dans une mise à jour de la stratégie : examiner et renforcer l'adoption des interventions pour soutenir la réduction de Campylobacter ; soutenir les entreprises et les consommateurs pour minimiser les risques liés à Listeria monocytogenes ; comprendre l'épidémiologie des infections d'origine alimentaire en Écosse, et, un meilleur ciblage des conseils aux consommateurs visant à éduquer le public sur les risques particuliers auxquels sont exposés les groupes vulnérables et sur la manière de les éviter.

Travail sur des pathogènes spécifiques

Campylobacter reste la principale cause de maladies bactériennes d'origine alimentaire. Une étude d'attribution des sources financée par la FSS a montré que les souches liées au poulet étaient les plus fréquemment identifiées dans les maladies humaines en Écosse.

La FSS et la FSA élaborent un plan pour comprendre comment le poulet contribue aux taux d'infection et où les interventions doivent être renforcées. Les résultats d'une enquête sur les agents pathogènes et la résistance aux antimicrobiens du poulet au détail seront publiés plus tard cette année. Un autre exercice de cartographie aidera à comprendre les interventions utilisées dans la chaîne alimentaire par les agriculteurs, les transformateurs et les distributeurs pour réduire la contamination. La communication avec les traiteurs et les consommateurs sur les risques de Campylobacter dans les foies et la viande de canard et sur la façon de les préparer en toute sécurité sera également une priorité à l'avenir.

Les données des travaux britanniques suggèrent une réduction des niveaux élevés de contamination du poulet ces dernières années, mais très peu de changement dans le nombre de personnes malades ou d'attribution aux souches de Campylobacter liées au poulet.

Au cours de l'année écoulée, des éclosions et des décès associés à du poisson fumé et au fromage non pasteurisé ont mis en évidence les défis techniques auxquels sont confrontés les petits et moyens producteurs pour maîtriser Listeria. La FSS examine la communication des risques aux consommateurs et l'approvisionnement du secteur public et la fourniture d'aliments dans les EHPAD.

Étant donné que Listeria peut persister dans l'environnement de production et se développer à basse température, il est nécessaire de disposer d'orientations sur la validation de la durée de conservation pour garantir l'application de dates de durabilité appropriées, et sur les systèmes de prélèvements requis pour vérifier l'efficacité des méthodes de nettoyage pour enlever Listeria des surfaces et des équipements.

L'Écosse a le taux de STEC signalé le taux plus élevé du Royaume-Uni. En 2022, il y a eu deux éclosions en crêche, non causées par des aliments, avec 45 cas de maladie à cause de E. coli O157 et 12 cas dans une éclosion de non-O157. 26 autres patients ont été liés à un grand cluster à l'échelle du Royaume-Uni pour lequel aucun véhicule n'a été identifié.

La FSS commandera également un examen indépendant de la définition actuelle du groupe personnes vulnérables, afin de déterminer si elle peut être affinée sur la base de preuves à jour sur l'éventail des facteurs sous-jacents de santé et de mode de vie qui peuvent rendre les personnes de ces groupes plus vulnérables à la maladie. . Les résultats seront utilisés pour soutenir les évaluations des risques et la recherche sociale afin d'identifier les méthodes de communication les plus susceptibles d'atteindre les personnes susceptibles de courir un risque accru.

L'agence continuera de surveiller les tendances des maladies d'origine alimentaire avec Public health Scotland et utiliser tout changement dans les rapports qui pourrait avoir un impact sur les chiffres afin de hiérarchiser les travaux.

Explorer la diversité des virus intestinaux des humains et des grands singes

«Explorer la diversité des virus intestinaux des humains et des grands singes», source CNRS.

Les transmissions de pathogènes entre humains et animaux menacent à la fois la santé humaine et la santé animale. Cette étude, menée par une collaboration incluant notamment l’Institut Pasteur, le CNRS et l’hôpital Saint Louis et publiée dans Nature Communication, intègre des analyses métagénomiques, historiques, anthropologiques et écologiques et compare un site en milieu naturel au Cameroun et un zoo européen. Les auteur.es montrent que les virus intestinaux se ressemblent plus entre les humains et les grands singes au Cameroun qu’au zoo.

Les transmissions de pathogènes entre humains et animaux menacent à la fois la santé humaine et la santé animale, et les processus qui favorisent la propagation des zoonoses sont complexes. Les précédentes études de terrain offrent un aperçu partiel de ces processus, mais ne prennent pas en compte l’écologie des animaux ni les perceptions et pratiques humaines qui facilitent le contact entre humains et animaux. Menée au Cameroun et dans un zoo européen, cette étude intègre des analyses métagénomiques, historiques, anthropologiques et écologiques des grands singes (gorilles et chimpanzés), ainsi qu'une évaluation en temps réel des types et de la fréquence des contacts entre les humains et les grands singes.

L'équipe constate que les humains et les grands singes partagent davantage leur virome intestinal au Cameroun qu’au zoo. De plus, la plus forte convergence est constatée entre gorilles et humains au Cameroun. Les adénovirus et les entérovirus sont les virus les plus fréquemment partagés entre les humains et les grands singes. C’est par l’approche profondément interdisciplinaire que les auteurs peuvent proposer des explications sur les résultats métagénomiques obtenus. Les contacts physiques et environnementaux sont plus intenses au Cameroun avec les gorilles qu’avec les chimpanzés. Les analyses menées indiquent que les gorilles sont plus nombreux que les chimpanzés, et sont aussi beaucoup plus chassés et consommés, notamment en raison d’un statut différent de celui des chimpanzés dans les représentations locales. Alors que les chimpanzés sont considérés comme très ressemblant aux humains et intelligents, les gorilles sont plutôt vus comme des animaux dangereux et très impliqués dans les pillages des cultures. Ce dernier point a été confirmé par nos questionnaires indiquant que les gorilles sont beaucoup plus impliqués dans les pillages que les chimpanzés.

Ainsi, c’est à la fois par plus de contacts physiques et de contacts environnementaux (dû notamment au pillage des champs), que peut être expliquée la plus grande convergence du virome intestinal des humains avec les gorilles au Cameroun. Concernant le zoo, les soigneurs et les grands singes avaient des contacts quotidiens et une grande proximité spatiale dans un site relativement petit. Le lavage des mains par les soigneurs pourrait contribuer à limiter le partage de virus intestinaux, et les mécanismes proposés au Cameroun pourraient expliquer cette plus grande convergence au Cameroun qu’au zoo.

Les agents pathogènes transmis par les tiques et les encéphalites à tiques en France

L’Anses avait indiqué le 15 juin 2023, «Mieux connaître et combattre les agents pathogènes transmis par les tiques».

Il existe près de 1 000 espèces de tiques dans le monde, seules quelques-unes sont vectrices d’agents pathogènes. Celles-ci représentent néanmoins les vecteurs qui transmettent la plus grande variété d’agents pathogènes (bactéries, virus et parasites) au monde. Elles sont responsables de maladies infectieuses pour les humains et les animaux et sont le principal vecteur d’agents pathogènes pour les animaux en Europe.

Quelles maladies sont liées aux tiques ?

Les maladies liées aux tiques peuvent être d’origine :

- bactérienne : maladie de Lyme, rickettsiose, tularémie, bartonellose, etc. ;

- virale : encéphalites à tiques, fièvres hémorragiques telle que la fièvre hémorragique de Crimée-Congo, louping-ill du mouton, etc. ;

- parasitaire : piroplasmose canine, babesiose bovine, anaplasmose, etc.

En France, la principale maladie humaine liée aux tiques est la maladie de Lyme qui est transmise par Ixodes ricinus. L’Anses étudie à la fois les tiques et les agents pathogènes qu’elles transmettent, afin de les identifier, de les caractériser et de lutter contre leurs effets nocifs.

Voici que Santé publique France rapporte le 7 juillet 2023 à propos de l’«Encéphalite à tiques en France : premier bilan des cas recensés par la déclaration obligatoire entre 2021 et 2023».

Santé publique France publie le bilan des deux premières années de surveillance par la déclaration obligatoire des cas d’encéphalite à tiques (TBE) sur la période mai 2021 à mai 2023.

Chiffres clés des encéphalites à tiques en France hexagonale sur la période 2021-2023

- 71 cas ont été notifiés entre mai 2021 et mai 2023, (30 en 2021, 36 en 2022 et 5 en 2023).

- 86% des cas était des cas d’infection «autochtone» (61 cas) et 14% (10 cas) avaient été infectés dans un pays «à risque», à l’occasion d’un voyage ou parce qu’il s’agissait de leur lieu habituel de résidence.

Sur les 71 cas notifiés :

- 4 cas étaient des enfants de moins de 16 ans et 15 étaient âgés de plus de 65 ans ;

- 94% des cas ont été hospitalisés ;

- aucun décès survenu au moment de la déclaration.

- 15% des cas exerçaient des professions les exposant particulièrement à des piqures de tiques : éleveur ou famille d’un éleveur ou ouvrier d’élevage de chevaux ou ruminants (n=7), agent de l’Office National des Forêts (ONF) (n=1), horticulteur (n=1), forestier (n=1), étudiant en lycée agricole (n=1).

- La Haute-Savoie est le département ayant rapporté le plus de cas au cours de ces deux années, alors que la reconnaissance du virus y est beaucoup plus récente qu’en Alsace.

- La région Auvergne-Rhône Alpes est dorénavant une zone importante de circulation du virus, avec des massifs particulièrement à risque, tels que le Forez. La zone de circulation du virus atteinte au sud l’Ardèche, département qui devrait faire l’objet d’une vigilance particulière.

Comment se protéger des piqûres de tiques ? 

Petites par leur taille, les tiques sont difficiles à repérer. Lorsque l’on se promène en forêt, dans des prés ou lorsque l’on jardine, quelques conseils à suivre permettent de se protéger des piqûres :

- se couvrir, en portant des vêtements longs qui recouvrent les bras et les jambes, un chapeau et rentrer le bas du pantalon dans les chaussettes ;

- rester sur les chemins et éviter les broussailles, les fougères et hautes herbes ;

- utiliser des répulsifs cutanés.

En rentrant chez soi après une balade en forêt ou après avoir jardiné, il est conseillé de :

- s’examiner et vérifier soigneusement l’ensemble de son corps ;

- en cas de piqûre, retirer le plus rapidement possible la ou les tiques avec un tire-tique ou à défaut une pince fine.

La vaccination contre l’encéphalite à tiques

La vaccination contre l’encéphalite à tiques est recommandée chez les voyageurs adultes et enfants exposés en pays très endémique.

En savoir plus : Le vaccin contre l'encéphalite à tiques | Vaccination Info Service

Zoonoses : Finlande et Suède au rapport

J’ai pris la liberté de regrouper ces deux pays qui ont publié leur rapport respectif sur les zoonoses.

1. Voici donc le rapport sur les zoonoses en Finlande, source Food Safety News du 3 juillet 2023.

Les résultats de la surveillance des principales zoonoses de 2011 à 2021 ont été compilés pour comprendre la situation et l'évolution des tendances en Finlande.

Campylobacter est le plus courant et Salmonella est la deuxième cause d'infections humaines. Au cours des dernières années, les cas de cryptosporidiose et de E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) ont été signalés plus qu'auparavant.

Parmi les animaux de production, les cas à Salmonella chez les bovins et les porcs ont augmenté, tandis qu'ils ont diminué chez les poulets de chair. Salmonella est encore très rare dans le bœuf et le porc domestiques. Chez les poulets à l’abattage, la prévalence de Campylobacter a diminué. STEC O157 est devenu plus fréquent chez les bovins.

Pour les aliments, le lait cru a servi de véhicule à plusieurs zoonoses provoquant des infections, notamment à Campylobacter, Yersinia et E. coli. L'importance des légumes comme source de maladie a également été soulignée.

Entre 2011 et 2021, 33 éclosions ont été causées par Campylobacter, dans lesquelles 451 personnes sont tombées malades et 11 avec STEC et 399 patients.

De 2011 à 2020, une moyenne de deux éclosions à Salmonella avec 35 cas ont été enregistrées. Cependant, sept épidémies ont été notées en 2021, dont une qui a rendu malades plus de 700 personnes.

De 2011 à 2021, Yersinia a provoqué sept épidémies, au cours desquelles 133 personnes sont tombées malades. Dix éclosions de listériose ont touché 143 personnes.

L'analyse a révélé que la situation en Finlande était affectée par les changements liés à l'environnement et au climat, le nombre de personnes dont l'immunité était affaiblie et les chiens importés de zones endémiques.

Faude à la viande bovine

Dans un autre contexte, les douanes finlandaises découvrent une importation illégale de viande. Les autorités finlandaises ont découvert que de grandes quantités de viande non réfrigérée étaient introduites dans le pays sans aucun document.

Les douanes finlandaises (Tulli) ont dit que l'affaire concernait l'évasion fiscale et la sécurité des aliments. Le problème a été découvert lors du contrôle douanier dans le port ouest d'Helsinki au printemps 2022.

2. «La Suède connaît une nouvelle augmentation des maladies pour 2022», source article de Joe Whitworth paru  le 5 juillet 2023 dans Food Safety News.

La plupart des infections d'origine alimentaire ont augmenté en Suède en 2022 par rapport à l'année précédente, selon les derniers chiffres.

Un rapport de l'Institut vétérinaire national (SVA), Folkhälsomyndigheten (l'Agence de santé publique de Suède), Livsmedelsverket (l'Agence suédoise de l'alimentation) et Jordbruksverket (Conseil suédois de l'agriculture) a montré une augmentation des infections à Campylobacter, Salmonella, Listeria et E. coli. Cela était dû en partie à l'augmentation des voyages et à l'augmentation du nombre de personnes infectées à l'étranger.

Au total, 5 165 cas de campylobactériose ont été signalés en 2022 et 57% d'entre eux étaient domestiques. Cela représente plus de 4 000 cas en 2021. Pour les infections domestiques en 2022, l'âge médian était de 51 ans avec une fourchette de 0 à 101 ans. Plus d'hommes, 54%, que de femmes ont été malades.

Une corrélation entre les cas humains et les lots de poulets de chair positifs à Campylobacter souligne la nécessité de mesures préventives supplémentaires, selon le rapport.

Données sur Salmonella

Au total, 1 137 cas de salmonellose ont été déclarés, contre 944 en 2021. Près de 450 personnes ont été considérées comme infectées à l'étranger. Parmi les cas domestiques, l'âge médian était de 44 ans et l'incidence était la plus élevée chez les enfants de moins de 5 ans. Parmi les isolats sérotypés provenant de patients domestiques, les plus courants étaient Salmonella Typhimurium, Enteritidis, Agona et Salmonella Typhimurium monophasique. 59 autres types différents ont été identifiés en 2022.

Six éclosions impliquant 10 personnes ou plus se sont produites. En décembre, Salmonella Enteritidis a été détectée chez des poules pondeuses dans la plus grande usine de production d'œufs de Suède. Bien qu'il s'agisse de la cause la plus fréquente de salmonellose en Europe, en Suède, le sérovar n'a été détecté chez des poules pondeuses commerciales qu'à trois reprises depuis 2003. L'épidémie a provoqué 81 cas d’infection humaine, principalement en 2023.

La source dans le troupeau de ponte n'a pas encore été identifiée. Cependant, les isolats sont génétiquement similaires à ceux d'autres foyers de l'UE causés par des œufs contaminés par Salmonella Enteritidis. La Belgique a connu une importante épidémie avec une souche presque identique au début de 2022 liée à des œufs d'un producteur national. La souche épidémique est également similaire à un événement danois plus petit lié aux œufs à l'été 2022.

Quinze personnes ont été infectées par Salmonella Liverpool dans des écrevisses précuites congelées en provenance de Chine. Cinq cas ont également été enregistrés en 2021. Cependant, le producteur n'a été agréé pour l'exportation qu'en février 2022 et l'importateur avait reçu des écrevisses d'une autre entreprise au cours des années précédentes, il n'a donc pas été possible d'identifier un lien avec des personnes malades antérieures.

Deux producteurs suédois ont été liés à une épidémie à Salmonella Typhimurium causée par de la roquette. Au total, 109 personnes sont tombées malades et des patients ont également été enregistrés en Finlande. Une éclosion à Salmonella Agona a touché 35 personnes. Des cas ont également été enregistrés en Norvège et aux Pays-Bas. La source suspectée était des concombres espagnols.

E. coli et Listeria

En 2022, 857 cas à E. coli ont été signalés, dont 583 ont été contractés au pays. Comme les années précédentes, l'incidence était la plus élevée chez les enfants de moins de 5 ans. Au total, 79 sérotypes différents ont été ididentifié. Les types les plus courants étaient O157:H7, O26:H11 et O103:H2. Au total, 653 patients ont été signalés en 2021.

Le syndrome hémolytique et urémique (SHU) associé aux STEC a été signalé chez 19 patients, dont 17 ont été contractés au pays. Onze patients atteints de SHU étaient des enfants de moins de 10 ans. Aucun sérotype n'a causé plus de deux cas de SHU.

Trois enquêtes ont été menées après que des cas humains aient été détectés avec un lien suspecté avec des animaux de ferme. Les soupçons sont tombés sur la consommation de lait non pasteurisé ou le contact direct avec le bétail. Toutes les fermes étaient négatives pour STEC. Aucune source n'a pu être trouvée dans trois épidémies causées par O121:H19, O63:H6 et une combinaison de O103:H2 et O157:H7.

Au total, 125 cas de listériose ont été signalés contre 107 en 2021. L'âge médian était de 79 ans et, comme les années précédentes, la plupart avaient plus de 80 ans. Soixante-sept cas étaient des femmes et 57 des hommes. Au total, 45 personnes sont décédées dans le mois suivant le diagnostic.

Cinq patients atteints d'une souche rare de Listeria monocytogenes en Suède ont été inclus dans un groupe plus large avec des cas de 2019 à 2022. Tous ont été notifiés à l'automne mais la source de l'infection n'a pas été identifiée.

La matière première de saumon qui a été contaminée lors de la transformation en Norvège a été à l'origine d'un foyer avec quatre patients. Seize cas enregistrés de 2020 à 2022 étaient liés à des produits d'une usine de transformation de viande.

Listeria monocytogenes a été détecté dans un emballage ouvert d'un fromage à croûte lavée prélevé au domicile d'une personne malade. Quatre autres patients de 2018 à 2022 ont été identifiés. Cependant, une analyse au niveau de l'UE a révélé que la source était le saumon et non le fromage. Les cinq patients en Suède étaient liés à 11 cas dans cinq autres pays de 2017 à 2022.

Cryptosporidium, Yersinia et Brucella

En 2022, 716 cas de cryptosporidiose ont été signalés. L'âge médian était de 38 ans et 55 % étaient des femmes. Au total, 550 personnes ont été infectées en Suède. Le total est en hausse par rapport à 524 cas en 2021.

Entre fin septembre et mi-octobre, 107 cas à Cryptosporidium parvum ont été détectés dans 15 régions différentes. L'âge médian était de 40 ans et plus de femmes que d'hommes étaient infectées. Les enquêtes épidémiologiques ont indiqué que la laitue frisée contaminée dans des mélanges de feuilles vertes prêtes à consommer était la cause probable.

Au total, 238 cas à Yersinia ont été signalés, contre 313 en 2021. Comme les années précédentes, l'incidence était la plus élevée chez les enfants de moins de 5 ans. Yersinia ne fait pas partie du programme national de surveillance microbienne en Suède, mais aucune épidémie n'a été détectée.

En 2022, 10 cas de brucellose ont été signalés. Ils étaient âgés de 25 à 71 ans, dont cinq hommes et cinq femmes. Trois personnes ont été infectées en Suède par un fromage de chèvre en provenance d'Irak. Six ont contracté leur infection en Irak et pour une personne, le pays d'infection était inconnu. Pour sept cas, les produits laitiers non pasteurisés étaient la source probable d'infection.

Des chercheurs produisent le premier vaccin à ARNm contre les bactéries

Des chercheurs ont trouvé un moyen d'utiliser des vaccins à ARNm pour cibler les agents pathogènes bactériens, en développant spécifiquement un vaccin à ARNm efficace à 100% pour protéger les souris contre l'infection par la bactérie mortelle qui cause la peste. Source tweet de l’ASM.

Les vaccins à ARN messager n'ont été déployés que dans le cadre de maladies virales, à savoir la COVID-19. Cependant, des chercheurs ont trouvé un moyen d'utiliser la technologie pour cibler les pathogènes bactériens, en développant spécifiquement un vaccin à ARNm efficace à 100% pour protéger les souris contre l'infection par la bactérie mortelle qui cause la peste.

Référence de l’étude

- Kon E., et al. A single-dose F1-based mRNA-LNP vaccine provides protectiong against lethal plague bacterium. Science Advances. March 8, 2023.

Autres références

- Aizenman, N. Frozen cells reveal a clue for a vaccine to block the deadly TB bug. NPR. March 6, 2023.

- Ghert-Zand R. Des Israéliens produisent le premier vaccin à ARNm au monde contre les bactéries. The Times of Israel. 14 mars 2023.

États-Unis : Incidence préliminaire et tendances des infections causées par des pathogènes transmis couramment par les aliments en 2022

«Incidence préliminaire et tendances des infections causées par des pathogènes transmis couramment par les aliments. Réseau de surveillance active des maladies d'origine alimentaire sur 10 sites américains en 2022», source MMWR du 30 juin 2023.

Résumé

Que sait-on déjà sur ce sujet ?

Campylobacter et Salmonella sont les principales causes d'infections entériques bactériennes transmises couramment par les aliments. L'in
cidence signalée des infections entériques était plus faible pendant la pandémie de la COVID-19 (2020-2021) par rapport aux années précédentes.

Qu'apporte cet article ?

En 2022, FoodNet a identifié des incidences plus élevées d'infections à Escherichia coli producteurs de shigatoxines, à Yersinia, à Vibrio et à Cyclospora par rapport à 2016-2018. Les incidences de Campylobacter, Salmonella, Shigella et Listeria n'ont pas changé.

Quelles sont les implications pour la pratique de la santé publique?

Aucun progrès dans la réduction de l'incidence des infections entériques n'a été observé en 2022, car les influences de la pandémie de COVID-19 se sont atténuées. La collaboration entre les producteurs d'aliments, les transformateurs, les magasins de détail, les restaurants et les agences de réglementation est nécessaire pour réduire la contamination par des pathogènes lors de l'abattage des volailles et pour prévenir la contamination des légumes verts à feuilles.

Discussion

De nombreux facteurs liés à la pandémie de la COVID-19 influençant la transmission, la détection et la déclaration des maladies entériques ont pris fin d'ici 2022. L'incidence des infections causées par des pathogènes transmis couramment par les aliments en 2022 est généralement revenue aux niveaux observés pendant la période pré-pandémique 2016-2018. Des efforts concertés sont nécessaires maintenant pour mettre en œuvre des stratégies visant à atteindre les cibles nationales de prévention et à réduire la prévalence des infections entériques.

Cet article souligne l'absence de progrès dans la réduction de l'incidence des infections entériques. L'incidence des infections à Salmonella en 2022 était supérieure à l'objectif Healthy People 2030. En 2022 également, l'incidence des infections domestiques les plus courantes, celles causées par Campylobacter (17,4 pour 100 000 habitants), était supérieure à l'objectif Healthy People 2030. de 10.9. La viande de volaille est la source la plus couramment identifiée d'infections à Campylobacter dans de nombreux pays depuis de nombreuses années et on estime également qu'elle est la source la plus courante d'infections à Salmonella aux États-Unis.

Des efforts supplémentaires pour réduire la contamination lors de l'abattage et de la transformation de la volaille sont nécessaires pour réduire l'incidence de Campylobacter, de Salmonella et d'autres pathogènes d'origine alimentaire. En 2021, le FSIS de l’USDA a publié de nouvelles directives pour les établissements d'abattage et de transformation de la volaille afin de maîtriser Campylobacter dans la volaille crue. l'eau, les aliments et la litière des volailles. En 2022, le FSIS a proposé un nouveau cadre réglementaire pour maîtriser Salmonella dans les produits de volaille, guidé par les recommandations du National Advisory Committee on Microbiological Criteria for Foods. En 2023, le FSIS a publié une proposition d'avis de détermination visant à déclarer Salmonella comme un contaminant dans les produits de poulet panés et farcis non prêts à consommer, et la Loi sur la modernisation de la sécurité des aliments pourraient également réduire Salmonella, STEC, Listeria et d'autres pathogènes qui causent des maladies d'origine alimentaire.

En 2022, 73% des infections détectées par la surveillance FoodNet avaient un résultat d’un test sans cuture (CIDT pour culture-independent diagnostic test), allant de 24% à 100% par pathogène. Ces tests rapides et très sensibles permettent des diagnostics cliniques rapides à partir d'un large éventail d'étiologies potentielles, améliorant la détection d'infections qui, autrement, seraient restées non détectées. Cependant, l'adoption de la CIDT et l'utilisation courante des méthodes de culture ont varié selon le temps, le pathogène et les forces du marché. Ces facteurs ainsi que la sensibilité et la spécificité différentes des CIDT compliquent l'interprétation des données de surveillance. De plus, le fait d'avoir une proportion plus faible de cas avec un isolat obtenu par culture réflexe limite la réponse de santé publique en réduisant le nombre d'isolats ayant des génomes séquencés, ce qui peut entraver l'identification des épidémies d'infections génétiquement liées et la détermination des gènes codant pour la résistance aux antibiotiques.

Les résultats de cette analyse sont soumis à au moins trois limites. Premièrement, le nombre d'infections signalées pourrait être sous-estimé parce que certaines personnes malades pourraient ne pas demander de soins, et les tests recommandés pour les personnes malades pourraient ne pas toujours être effectués ; à l'inverse, des résultats faussement positifs peuvent entraîner un certain surcomptage.

Deuxièmement, les personnes répondant aux critères FoodNet d'hospitalisation ou de décès sont incluses dans cet article, bien que les raisons sous-jacentes de l'hospitalisation ou du décès puissent être inconnues.

Enfin, les décès associés à des infections entériques survenant > 1 semaine après le prélèvement d'échantillons chez les patients non hospitalisés, et survenant après le congé chez des personnes hospitalisées (p. ex., en soins palliatifs), pourraient avoir été omis.

Les incidences des infections causées par certains pathogènes signalées en 2022 étaient plus élevées que pendant la période prépandémique 2016-2018, et des progrès substantiels vers les objectifs Healthy People 2030 n'étaient pas évidents. Des mesures de prévention visant à réduire la contamination des aliments, y compris le cadre réglementaire pour Salmonella proposé par le FSIS pour réduire les maladies liées à la volaille, sont nécessaires pour réduire la prévalence des maladies et atteindre les objectifs Healthy People 2030. Une meilleure compréhension des raisons de la diminution de l'incidence des infections d'origine alimentaire pendant la pandémie de la COVID-19 (2020-2021) qui n'a pas été maintenue en 2022 pourrait aider à orienter la création de stratégies de réduction supplémentaires.