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samedi 14 janvier 2023

France : Retour sur une épidémie nationale à Salmonella liée à des saucisses sèches

Eurosurveillance nous propos un article qui revient sur une épidémie
nationale de plusieurs sérotypes à Salmonella Bovismorbificans ST142 et de Salmonella Typhimurium ST34 monophasique associée à des saucisses sèches de porc en France, septembre 2020 à janvier 2021.

Message clé de santé publique
Que vouliez-vous aborder dans cette étude ?
Salmonella enterica subsp. enterica est la principale cause d'infections diarrhéiques d'origine alimentaire en Europe. Les protocoles de diagnostic actuels ciblent les infections à agent unique, mais pas les infections à sérotypes multiples. Nous avons voulu décrire une récente épidémie de Salmonella à sérotypes multiples chez l'homme en France en 2020, qui a donné lieu à une enquête internationale.
Qu'avons-nous appris de cette étude ?
L'épidémie a touché 44 personnes en association avec la consommation de produits secs de charcuterie (saucisse sèche droite et saucisse sèche courbe) de porc contaminées par deux sérotypes différents de Salmonella. Les investigations identifiant plusieurs sérotypes de Salmonella dans les aliments étaient compliquées et nécessitaient la collaboration de sept institutions différentes. L'identification des deux sérotypes n'a été possible que dans un seul échantillon alimentaire.
Quelles sont les implications de vos découvertes pour la santé publique ?
Cette étude met en évidence la nécessité d'améliorer les procédures pour mieux détecter les contaminations mixtes des produits alimentaires par différents sérotypes de Salmonella, qui, selon nous, peuvent passer inaperçues avec les procédures de laboratoire standard actuelles.

Pour mémoire,
- le communiqué du ministère de l’agriculture du 26 novembre 2020, «Retrait et rappel de saucisses sèches et de rosettes tranchées contaminées par des salmonelles» parlait de 26 cas de salmonellose dont 17 enfants.
- Le rappel de rosette a eu lieu le 18 novembre 2020 en Belgique.
- Le blog avait publié le 26 novembre 2020 un article, France: Epidémie de salmonellose liée à des produits de charcuterie, 26 cas dont 17 enfants.

Dans la discussion de l’article, les auteurs notents (extraits) :
Nous décrivons une épidémie nationale de salmonellose impliquant 44 cas dans deux groupes microbiologiques par deux sérotypes : 33 cas avec S. Bovismorbificans ST142 et 11 cas avec le variant monophasique de S. Typhimurium ST34. Les deux clusters étaient associés à la consommation de saucisses sèches de porc produites par le même fabricant entre septembre et novembre 2020. Les enquêtes épidémiologiques ont pointé la consommation de saucisses de marque A commercialisées par la chaîne de supermarchés 1. De plus, l'enquête sur les cartes de fidélité des supermarchés a renforcé cette association, en enregistrant l'achat du produit suspect quelques jours avant la date d'apparition des symptômes dans la plupart des registres.

Des mesures de contrôle ont été mises en œuvre à la suite des enquêtes épidémiologiques du cluster S. Bovismorbificans avec trois rappels/retraits en novembre 2020. Le cluster S.4,12:i:- a été identifié fin décembre, mais l'apparition des symptômes de la plupart des cas s'est produite avant le 30 novembre (sauf un cas en décembre). Suite aux rappels et retraits des produits suspects, la détection des cas humains a rapidement décliné. Les agences de santé internationales ont été informées du premier groupe d'épidémies (S. Bovismorbificans) par le biais des notifications au RASFF et à EpiPulse en raison de l'exportation du produit dans d'autres pays européens. Aucun cas appartenant au premier groupe n'a été signalé hors de France et aucun génome appartenant au deuxième groupe n'a été identifié sur EnteroBase pour aucun autre pays.

S. Bovismorbificans n'a été isolé qu'à partir d'un échantillon alimentaire fourni par un patient. Bien qu'une contamination post-achat par le patient soit possible, les données épidémiologiques et l'absence de nouveaux cas suite aux rappels et retraits ont fortement soutenu l'hypothèse d'une contamination du produit avant la vente.

Dans cette éclosion, bien qu'il n'ait pas été possible d'isoler les deux sérotypes de Salmonella à partir d'un seul échantillon alimentaire ou humain, une qPCR a identifié les deux sérotypes dans le même échantillon alimentaire. Ceci a suggéré que les produits alimentaires pouvaient avoir été contaminés à des taux différents par les deux sérotypes, simultanément, échappant aux procédures standards des laboratoires de microbiologie pour l'identification des contaminations multi-souches. À cette fin, la détection d'un signal Salmonella positif par qPCR dans un échantillon de pré-enrichissement peut être une approche puissante pour une détection et une enquête rapides. Néanmoins, la méthode devrait être standardisée et une confirmation devrait toujours être effectuée par isolement, identification et caractérisation génomique des souches.

Conclusion
Nous présentons ici deux épidémies simultanées à Salmonella enterica liées à la consommation de saucisses sèches de porc produites pendant une courte période par le même fabricant : la première causée par S. Bovismorbificans et la seconde par le variant monophasique de S. Typhimurium, 4,12 :je:-. Cependant, les méthodes moléculaires ont révélé une double contamination d'un même échantillon alimentaire analysé. Les éclosions multi-souches peuvent ne pas être détectées par les approches de détection bactériologique actuelles. Nous pensons que les protocoles de laboratoire standard, tant au niveau clinique qu'au niveau du contrôle alimentaire, devraient inclure des procédures pour améliorer la détection des contaminations de sérotypes mixtes de Salmonella. De plus, notre rapport met en évidence l'utilité des tests qPCR spécifiques au sérotype pour enquêter sur les épidémies d'origine alimentaire.

Référence
Pardos de la Gandara Maria, Fournet Nelly, Bonifait Laetitia, Lefèvre Sophie, Chemaly Marianne, Grastilleur Charlotte, Cadel-Six Sabrina, Fach Patrick, Pignault Agnès, Brisabois Anne, Jourdan-Da Silva Nathalie, Weill François-Xavier. Countrywide multi-serotype outbreak of Salmonella Bovismorbificans ST142 and monophasic Salmonella Typhimurium ST34 associated with dried pork sausages in France, September 2020 to January 2021. Euro Surveill. 2023;28(2):pii=2200123. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2023.28.2.2200123