L'OMS identifie des pathogènes fongiques potentiellement mortels

«L'OMS identifie des pathogènes fongiques potentiellement mortels», source article de Chris Dal dans CIDRAP News du 25 octobre 2022.

L'Organisation mondiale de la santé (OMS) a publié le 25 octobre sa toute première liste de «pathogènes prioritaires» fongiques, identifiant 19 champignons qui sont apparus comme des menaces importantes pour la santé publique en raison de leur capacité à provoquer des infections invasives graves et de leur résistance croissante aux antifongiques.

Bien que les données sur la prévalence des infections fongiques invasives et les schémas de résistance aux antifongiques soient rares et que l'on en sache peu sur certains de ces pathogènes, les responsables de l'OMS affirment que de nouvelles preuves suggèrent que l'incidence et l'étendue géographique des maladies fongiques augmentent en raison du changement climatique et de l'augmentation des voyages mondiaux. La pandémie de la COVID-19 a également mis en lumière le problème, l'incidence signalée d'infections fongiques invasives augmentant chez les patients hospitalisés atteints de COVID.

En outre, la population la plus exposée aux infections invasives causées par ces pathogènes, notamment les patients cancéreux, les personnes vivant avec le VIH/sida, les receveurs d'organes et d'autres patients immunodéprimés, est en augmentation.

Les responsables de l'OMS craignent que le nombre limité de médicaments antifongiques, le manque de diagnostics rapides et sensibles et les ressources financières limitées consacrées aux infections fongiques n'entravent la capacité de détecter et de répondre au problème croissant. Ils espèrent que la liste des pathogènes fongiques prioritaires pourrait avoir un impact similaire à celui du document sur lequel elle a été modélisée - la liste 2017 de l'OMS des pathogènes bactériens prioritaires.

En fait, il s’agit de la liste de bactéries contre lesquelles il est urgent d’avoir de nouveaux antibiotiques.-aa.

Nous voulons que ce rapport catalyse la recherche et le développement sur de nouveaux antifongiques et de nouveaux diagnostics sur les maladies fongiques», a dit Haileyesus Getahun, directeur de la coordination mondiale de la résistance aux antimicrobiens (RAM) à l'OMS, lors d'un point de presse.

Il a ajouté que l'identification de ces 19 pathogènes fongiques parmi des milliers de champignons aidera à orienter les efforts de recherche et à orienter les investissements publics et privés indispensables dans les traitements et les diagnostics.

Actuellement, les infections fongiques reçoivent moins de 1,5% de tous les financements de recherche sur les maladies infectieuses.

Focus sur les infections fongiques invasives

Comme le rapport de 2017 sur les pathogènes bactériens prioritaires, le document est divisé en trois catégories en fonction de l'impact sur la santé publique et/ou du risque émergent de résistance aux antifongiques : priorité critique, élevée et moyenne, avec une note indiquant que certains des pathogènes pourraient être plus préoccupants. dans les régions où elles sont endémiques. Pour chaque catégorie, la résistance aux antifongiques était le critère le plus important, suivi de l'incidence annuelle, de la morbidité et de la mortalité.

Parmi les champignons du groupe prioritaire critique se trouve Candida auris, la levure multirésistante qui a été découverte pour la première fois au Japon en 2009 et qui s'est depuis propagée dans le monde entier. Les infections invasives causées par C. auris, qui se propage facilement dans les établissements de santé et, dans certains cas, résiste à toutes les classes de médicaments antifongiques, sont mortelles chez 53% des patients.

Une autre espèce de Candida qui a reçu une priorité critique est Candida albicans, qui est commune dans la bouche, la gorge, l'intestin, le vagin et la peau, mais peut provoquer une maladie grave lorsqu'elle envahit d'autres tissus.

Figurent également dans le groupe prioritaire critique Crytptococcus neoformans, une levure pathogène qui vit dans l'environnement et peut provoquer de graves infections après avoir été inhalée, et Aspergillus fumigatus, une moisissure environnementale qui peut provoquer de graves infections pulmonaires et constitue une menace particulière pour la fibrose kystique, la grippe , et les patients atteints de la COVID-19.

Parmi les champignons répertoriés comme hautement prioritaires figurent trois autres espèces de Candida (Candida glabrata, Candida tropicalis et Candida parapsilosis), Histoplasma spp. et Mucorales (un grand groupe de champignons composé de différents genres). Le groupe de priorité moyenne comprend Scedosporium spp., Candida krusei et Coccidioides spp., qui causent la fièvre de la vallée.

La plus grande préoccupation avec ces pathogènes est lorsqu'ils pénètrent dans la circulation sanguine, en particulier chez les patients gravement malades et immunodéprimés. Carmem Pessoa-Silva, chef d'équipe de l’AMR à l'OMS, a souligné la présence d'espèces de Candida dans les trois groupes, notant la capacité du champignon à provoquer des infections mortelles du sang.

«La mortalité attribuable aux infections du sang à Candida est très élevée», a-t-elle dit. «Les chiffres varient selon les études, mais c'est presque toujours au-dessus de 30%.»

En raison de la mortalité estimée élevée et du besoin de plus de données, Pessoa-Silva a dit que l'OMS avait commencé à surveiller l'incidence des infections à Candida dans le sang dans 23 pays. Elle a également dit que le système mondial de surveillance de la résistance et de l'utilisation des antimicrobiens (GLASS pour Global Antimicrobial Resistance and Use Surveillance System) de l'OMS collectera bientôt des données sur la résistance des isolats d'infections sanguines à Candida, qui sont devenues de plus en plus résistantes aux quatre classes de médicaments antifongiques (azolés, échinocandines, polyènes et pyrimidines) actuellement utilisé en pratique clinique.

«Pour la plupart des pathogènes critiques et hautement prioritaires, les options de traitement sont limitées et très toxiques», a-t-elle dit.

Pessoa-Silva a dit qu'en plus d'une surveillance accrue et du développement antifongique, une plus grande capacité de laboratoire et de meilleurs outils de diagnostic sont aussi désespérément nécessaire. Elle a noté que parce que les infections fongiques invasives ont souvent des symptômes similaires aux infections bactériennes, les patients sont souvent mal diagnostiqués et sont traités avec des antibiotiques au lieu d'antifongiques.

Un problème One Health

Les responsables de l'OMS ont également souligné le fait que l'émergence de pathogènes fongiques résistants en tant que menace mondiale pour la santé publique est un problème d’une seule santé, motivé en partie par l'utilisation inappropriée d'antifongiques dans l'agriculture. Par exemple, le rapport note que l'utilisation généralisée des azolés comme fongicides pour protéger les plantes contre les infections fongiques a contribué à l'augmentation des taux d'infections d’A fumigatus résistantes aux azolés chez l'homme. Les azolés sont le traitement de première intention de l'aspergillose invasive.

Gethun a dit que les organisations quadripartites (l'OMS, la FAO, l'Organisation mondiale de la santé animale et le Programme des Nations Unies pour l'environnement) ont commencé à prendre des mesures pour identifier les antifongiques essentiels à la santé humaine et élaborer des stratégies pour garantir qu'ils ne sont pas utilisés de manière inappropriée dans l'agriculture.

Les responsables de l'OMS ont dit que bien qu'il existe d'importantes lacunes dans les connaissances sur le fardeau mondial des pathogènes fongiques invasifs, il est important de «sonner l'alarme» maintenant et de commencer à stimuler les investissements de recherche ciblés et les interventions de santé publique. Hatim Sati, responsable technique de la division RAM de l'OMS, a dit que si une chose a été apprise de la pandémie de COVID-19, c'est que si vous pouvez faire quelque chose dès le début pour informer la réponse de santé publique, cela devrait être fait.

«Nous n'avons pas besoin d'attendre que les choses soient catastrophiques pour agir», a-t-il dit.