Annonce : S’agissant de l’information à propos des rappels de
produits alimentaires, pour le moment, il ne faut pas faire confiance à
nos autorités sanitaires (Ministère de l’agriculture et DGCCRF). Ces deux
entités ont fait et font toujours preuve d’une incroyable légèreté et d’un
manque d’informations fiables vis-à-vis des consommateurs avec comme corollaire
une absence de transparence en matière de sécurité des aliments.
« Des
chercheurs aident à identifier des
gènes d’intérêt
dans les infections bactériennes »,
source
Food
Safety News.
Des
chercheurs ont mis au point une base de données facilitant
l'identification de protéines cibles pouvant aider à lutter contre
les maladies infectieuses.
Des
scientifiques du département de biochimie et de biologie moléculaire
de l'Universitat Autònoma de Barcelona (UAB) et du Centre of Genomic
Regulation (CGR) ont déclaré que cela accélérerait également le
développement de nouveaux agents antimicrobiens.
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L’équipe
de scientifiques de l’UAB et du CRG qui a créé la base de données
BacFITBase.
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La
base de données BacFITBase
contient 90 000 entrées contenant des informations sur des gènes de
bactéries pathogènes et leur contribution aux conditions
infectieuses in vivo chez cinq espèces hôtes différentes.
Des études in vivo examinent les effets sur des organismes ou
des cellules entiers et vivants. Selon l'étude publiée dans la
revue Nucleic
Acids Research, de nombreux mécanismes sous-jacents à la
pathogenèse bactérienne sont encore mal compris.
Cela
comprend des informations sur 15 bactéries, dont deux variants de
Salmonella
enterica,
trois types de
E.
coli,
Vibrio
cholerae,
Campylobacter
jejuni,
Klebsiella
pneumoniae,
Acinetobacter
baumannii
et Vibrio
parahaemolyticus,
avec des informations sur 10 tissus différents.
Les
chercheurs espèrent continuer à enrichir la base de données au
cours des prochaines années en tant que référentiel de protéines
bactériennes qui pourraient constituer des cibles importantes dans
la lutte contre les maladies infectieuses.
Gènes
nécessaires lors de l'infection de l'hôte
Les
maladies infectieuses sont causées par des micro-organismes
pathogènes qui pénètrent, colonisent et se développent dans
l'organisme hôte et provoquent une infection. Les protéines codées
par les gènes bactériens sont responsables des processus
biochimiques aidant le
pathogène.
D'autres
études ont montré que pour identifier ces gènes, des informations
in vivo sont nécessaires sur ce qui se passe avec la bactérie
chez un hôte infecté. Les études in vitro, qui sont celles
recréées en laboratoire avec des cultures cellulaires et
bactériennes, ne correspondent pas toujours aux données des études
in vivo. En effet, les gènes bactériens pathogènes
essentiels à la production d’infections dépendent de
l’environnement de l’organisme colonisé. Les maladies
infectieuses ne peuvent être correctement comprises que dans le
contexte des interactions hôte-pathogène, car les bactéries
pathogènes ne se développent pas seules mais dans un environnement
de l’hôte complexe.
Sur
la base des résultats d'expériences in
vivo,
les chercheurs ont caractérisé des
gènes bactériens d’intérêt
pour l'invasion et l'infection des cellules hôtes. Toutes les
expériences étaient basées sur une technique connue sous le nom de
mutagenèse par
transposons,
dans laquelle des
fragments d’ADN appelés transposons sont transférés aux gènes
pathogènes de l’organisme, afin de les inactiver. Cela signifie
que leur rôle dans l'infection peut être observé directement et
que les chercheurs peuvent déterminer lesquels sont nécessaires
pour qu'un organisme hôte spécifique soit infecté.
Cela
comprend Salmonella
Typhimurium ST4/74 d'un bovin,
un porc et un poulet de trois types de tissus différents et
Salmonella
Typhimurium SL1344 d'une souris. E.
coli
O157:H7 provenant des matières fécales d'un bovin,
E.
coli
M12 et E.
coli
CFT073 de souris et Campylobacter
jejuni
81-176 de souris.
La
BacFITBase
propose une recherche textuelle pour trouver des gènes bactériens
pathogènes spécifiques, une fonction de recherche BLAST permettant
de trouver des gènes bactériens similaires à une séquence
protéique ou d'acide nucléique présentant un intérêt, une
capacité d'interrogation à identifier des gènes à
fort impact
lors d'une infection et une section didactique.
Les espèces pathogènes et/ou hôtes peuvent être spécifiées dans
les menus déroulants sur
la page recherche.
