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dimanche 11 juillet 2021

Colorado: Une fillette décède de la peste

Yersinia pestis
Le 18 mai 2021, les autorité de santé du Colorado informaient les habitants d’une «Activité de peste présente dans le Colorado; les personnes peuvent prendre des précautions pour éviter l'exposition».

Un écureuil a été testé positif à la peste dans le comté d'El Paso la semaine dernière, et le Colorado Department of Public Health and Environment (CDPHE) rappelle aux résidents qu'il n'est pas rare que la peste soit présente à cette période de l'année. Des précautions simples peuvent maintenir le risque de transmission à l'homme très faible.

«La peste est présente dans le Colorado depuis au moins les années 1940, et des cas de rongeurs sauvages dans l'État sont signalés la plupart du temps», a dit la Dr Jennifer House, vétérinaire de la santé publique de l'État. «Bien que nous observions la plupart des activités de peste pendant l'été, la maladie peut être retrouvée chez les rongeurs toute l'année et se propage parfois à d'autres espèces sauvages ainsi qu'aux chats et chiens domestiques.»

Voici que l’on apprend que «La peste a été confirmée dans le décès d'un enfant de Durango», source CPR du 9 juillet 2021.

Les autorités sanitaires de l'État ont confirmé que la peste était responsable de la mort d'une enfant de la région de Durango.

La fillette de 10 ans était membre d'un club 4-H local, le Weaselskin 4-H Club, a confirmé l'un des dirigeants du club, Mike Latham. Le club et la famille de la jeune fille ont refusé de commenter davantage.

Un communiqué publié vendredi soir par le CDPHE a dit que l'investigation sur l'affaire visant à déterminer comment et quand la jeune fille avait contracté la peste se poursuivait.

«La santé publique mène une investigation épidémiologique et veut que les Coloradans sachent que même si cette maladie est très rare, elle survient parfois, et qu'elle consulte un médecin si vous présentez des symptômes», a dit le Dr Jennifer House du CDPHE.

Il s'agit du premier décès de peste humaine dans l'État en six ans. Bien qu'extrêmement rares, lorsque des infections et des décès surviennent, ils surviennent de manière disproportionnée dans le comté de La Plata, qui abrite Durango. Les résidents du comté de La Plata représentaient près de la moitié des cas de peste du Colorado entre 2005 et 2020, selon le CDPHE.

La peste est causée par une bactérie, Yersinia pestis, et est généralement transmise à l'homme par un animal infecté ou une piqûre de puce de rongeur, selon le CDC.

Le Durango Herald a rapporté que la jeune fille est décédée lundi. Le CDPHE a confirmé vendredi après-midi avoir été informé du décès par le Mercy Regional Medical Center de Durango.

mercredi 30 juin 2021

Méningites néonatales : l’immaturité du microbiote et des barrières épithéliales mise en cause

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«Méningites néonatales : l’immaturité du microbiote et des barrières épithéliales mise en cause», source communiqué de l’Institut Pasteur du 29 juin 2021.

Les méningites sont associées à une mortalité importante et entraînent fréquemment de lourdes séquelles. Les nouveau-nés sont particulièrement sensibles à ce type d’infection et en développent 30 fois plus fréquemment que la population générale. Le streptocoque du groupe B est la bactérie la plus souvent en cause dans les méningites du nouveau-né alors qu’elle ne provoque qu’exceptionnellement une maladie chez l’adulte. Des chercheurs de l’Institut Pasteur, en collaboration avec l’Inserm, Université de Paris et l’hôpital Necker-Enfants malades ont cherché à expliquer la susceptibilité néonatale au développement des méningites à streptocoque B. Ils montrent, chez le modèle murin, que l’immaturité du microbiote intestinal ainsi que celles des barrières épithéliales telles que l’intestin et le plexus choroïdes jouent un rôle dans la susceptibilité des nouveau-nés à la méningite bactérienne due au streptocoque du groupe B. Ces résultats ont été publiés dans la revue Cell Reports.

Les nouveau-nés sont plus susceptibles de développer une méningite bactérienne que les enfants et les adultes. Le streptocoque du groupe B est le pathogène responsable d’une grande partie des méningites néonatales. Dans la plupart des cas, l’infection est précédée par la colonisation de l’intestin par la bactérie. La flore commensale bactérienne intestinale (microbiote) joue un rôle physiologique clé, car elle participe notamment à la digestion, protège des pathogènes intestinaux et contribue à la différentiation des tissus et au développement de l’immunité. Chez le nouveau-né, cette flore est absente, et elle va progressivement s’implanter dans les premières semaines de vie.

Dans une nouvelle étude, des chercheurs de l’Institut Pasteur, en collaboration avec l’Inserm, Université de Paris et l’Assistance Publique - Hôpitaux de Paris démontrent, dans un modèle murin, que l’immaturité du microbiote intestinal du nouveau-né est en partie responsable de la susceptibilité néonatale à la méningite bactérienne due au streptocoque du groupe B. En l’absence de microbiote mature, la bactérie peut en effet coloniser abondamment l’intestin du nouveau-né. De plus, la fonction barrière des vaisseaux sanguins de l’intestin que la bactérie doit traverser pour disséminer jusqu’au cerveau par le sang est moindre et le système immunitaire ne parvient pas à contrôler l’infection.

De manière surprenante, les chercheurs ont également mis en évidence qu’indépendamment du microbiote, les barrières épithéliales que constituent l’intestin et les plexus choroïdes (l’interface entre le sang et le liquide cérébro-spinal qui baigne le cerveau) ne sont pas complètement matures chez le nouveau-né, ce qui favorise l’accès des bactéries au cerveau. En effet, l’activité d’une voie de signalisation appelée Wnt impliquée dans la croissance et la différentiation des tissus est plus importante chez le nouveau-né, ce qui se traduit par une fonction barrière moindre de l’intestin et des plexus choroïdes à cet âge.

«Nous montrons dans cette étude comment deux facteurs liés au jeune âge, l’immaturité du microbiote et la croissance des tissus épithéliaux intestinaux et choroïdiens, sont impliqués dans la susceptibilité des nouveau-nés à la méningite bactérienne due au streptocoque du groupe B, à toutes les étapes de l’infection depuis la colonisation de l’intestin jusqu’à sa dissémination dans le cerveau» explique Marc Lecuit (PU-PH, Université de Paris, hôpital Necker - Enfant malades), responsable de l’unité Biologie de l’infection à l’Institut Pasteur et dernier auteur de cette étude.

Les résultats de ces travaux illustrent l’importance du microbiote et son rôle dans la protection contre les infections.

vendredi 21 mai 2021

Le contact sexuel comme facteur de risque d'infection à Campylobacter

Campylobacter

Des chercheurs de l'Université d'Oklahoma (UO) identifient un nouveau mode de transmission des bacteries, source EurekAlert!

L'infection à Campylobacter, l'une des maladies d'origine alimentaire les plus courantes dans le monde occidental, peut également se propager par contact sexuel, selon une nouvelle découverte réalisée par un membre du corps professoral du Hudson College of Public Health de l'UO en collaboration avec des collègues danois.

La recherche de l'équipe a été publiée dans Emerging Infectious Diseases, une revue publiée par le Centers for Disease Control and Prevention (CDC), et est la première étude connue à prouver ce mode de transmission de Campylobacter. À une époque où le COVID-19 a dominé l'actualité des maladies infectieuses, la recherche rappelle que de nombreux autres agents pathogènes affectent des vies dans le monde chaque jour. L'étude a été dirigée par l'épidémiologiste des maladies infectieuses Katrin Kuhn, professeur au Département de biostatistique et d'épidémiologie de l'Hudson College of Public Health de l'UO.

«Cette étude est importante pour les messages de santé publique et pour les médecins qui parlent à leurs patients des risques associés aux contacts sexuels», a déclaré Kuhn. «Bien que l'infection à Campylobacter ne soit généralement pas une maladie grave, elle provoque la diarrhée, qui peut entraîner le manque de travail, la perte de productivité ou peut-être la perte d'emploi. Elle pose un risque supplémentaire pour les personnes souffrant de problèmes de santé sous-jacents.»

Les infections à Campylobacter surviennent généralement lorsque les gens mangent du poulet qui n'a pas été complètement cuit ou lorsque du jus de volaille non cuit se retrouve dans d'autres aliments. Les infections peuvent également être causées par la consommation de lait non pasteurisé ou d'eau qui a été contaminée par les excréments d'animaux infectés. Cependant, ceux-ci ne représentaient pas tous les cas d'infection, a déclaré Kuhn, et elle se demandait s'il y avait une autre voie de transmission qui n'était pas prouvée. Une épidémie d'infections à Campylobacter dans le nord de l'Europe chez des hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes l'a incitée à étudier cette population de personnes au Danemark, où elle travaillait lorsque l'étude a commencé.

Les résultats de l'étude ont montré que le taux d'infection à Campylobacter était 14 fois plus élevé chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes que chez les sujets témoins. Bien que l'étude se soit concentrée sur les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes, les résultats sont pertinents pour les personnes de toute orientation sexuelle qui se livrent à un comportement sexuel pouvant impliquer un contact fécal-oral, a déclaré Kuhn.

Deux autres bactéries, Salmonella et Shigella, ont été utilisées comme comparaisons dans l'étude. Salmonella se propage principalement par les aliments infectés, tandis que Shigella peut être transmise par contact alimentaire ou sexuel. Salmonella a une dose infectieuse élevée, ce qui signifie que les gens doivent ingérer une quantité importante de bactéries avant de tomber malades. Cependant, Shigella et Campylobacter ont de faibles doses infectieuses, ce qui facilite la transmission.

«C'est une raison supplémentaire pour laquelle nous pensons que Campylobacter peut être transmis par contact sexuel comme Shigella - parce que les gens peuvent être infectés lorsque seules de petites quantités de bactéries sont présentes».

mardi 18 mai 2021

Pourquoi les scientifiques ne devraient pas nommer les maladies en fonction de leur emplacement

Exemples de maladies avec des noms basés sur les lieux. Source: CDC, OMS. 
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Aujourd’hui, presque plus personne ne parle du virus chinois à propos de l’agent responsable du Covid-19, le SARS-CoV-2, peut-être des politiques, et c’est une des raisons pour laquelle cet article a été écrit et il pose la question, «Pourquoi les scientifiques ne devraient pas nommer les maladies en fonction de leur emplacement», source ASM News.

Extraits. Alors que le monde aurait dû s'unir pour lutter contre une pandémie, les stéréotypes ont séparé les gens. Alors que le COVID-19 a commencé à faire le tour du globe, le terme «Chinavirus» a fait de même, perpétuant des attitudes désobligeantes contre le pays, ses coutumes et ses habitants. Bien que l'association de la maladie à son origine présumée à Wuhan ait pu être nécessaire pour la surveillance initiale, le terme dérisoire est rapidement devenu le carburant de théories du complot et des préjugés racistes accrus. Un hashtag est apparu sur les réseaux sociaux parmi ceux d'origine asiatique: «IAmNotAVirus». Suite à des informations faisant état de crimes haineux tragiques, la Maison Blanche a publié un mémorandum en janvier 2021 condamnant le racisme fondé sur le COVID-19, déclarant que la rhétorique «défie les meilleures pratiques et directives des responsables de la santé publique» et «attise des craintes infondées et perpétue la stigmatisation». Ce sont précisément pour cela que les noms officiels SARS-CoV-2 et COVID-19 ont été conçus pour éviter.

Les noms de maladies incorporent souvent la géographie, les références au lieu de découverte ou d'origine suspectée, les zones à haut risque ou les principaux sites d'épidémie. Bien que l'identification d'une maladie par emplacement puisse sembler inoffensive, peut-être même utile, ces types de noms peuvent ternir les cultures et les communautés, en particulier si ces liens ne sont pas exacts. Cela est vrai dans de nombreux cas: le virus de Marburg n'est pas originaire d'Allemagne, le virus du Nil occidental (ou virus West Nil) n'est pas limité à l'Afrique et bien que la fièvre de la vallée du Rift (coccidioïdomycose) se réfère à une épidémie des années 1930 dans la vallée de San Joaquin, Californie, le premier cas a été signalé en Argentine. en 1892. Afin de minimiser cette désinformation et son impact socio-économique sur les communautés, l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a publié de nouvelles meilleures pratiques en 2015 préconisant une terminologie plus générique et descriptive. Cependant, à l'ère des médias sociaux, les noms «viraux» créés en dehors de la communauté scientifique ont tendance à rester.

jeudi 13 mai 2021

La Réunion: Attention à la leptospirose après de fortes pluies !

«Attention à la leptospirose après de fortes pluies !», source ARS La Réunion du 10 mai 2021.

La leptospirose est une maladie grave : si elle n’est pas traitée à temps, elle peut mener à une hospitalisation voire un décès. Depuis le début de l’année, 74 cas de leptospirose ont été déclarés à La Réunion, dont 35 cas au mois d’avril (contre une cinquantaine de cas recensés chaque année).
Les épisodes de fortes pluies peuvent favoriser l’apparition de la leptospirose. Cette maladie se contracte au contact d’un milieu humide contaminé par les urines des rats principalement (eaux stagnantes, boue…). Les activités de nettoyage des cours et des jardins ou de baignades en eau douce après de fortes pluies sont donc particulièrement à risque.
En cette période de pluies, l’ARS La Réunion et Santé Publique France recommandent à la population la nécessité de renforcer la vigilance et les moyens de protection par la mise en œuvre de gestes simples pour ne pas contracter la leptospirose.

Situation épidémiologique

Chaque année, plus d’une centaine de cas de leptospirose sont recensés à la Réunion, nécessitant pour la majorité d’entre eux une hospitalisation.
Depuis le début de l’année, une augmentation significative du nombre de signalements est observée avec 74 cas de leptospirose déclarés en 2021, dont 35 cas au mois d’avril.
La saison des pluies est la période la plus à risque car elle présente des conditions de température et de pluviométrie favorables à la survie dans l’environnement des bactéries responsables de cette maladie. Les épisodes de fortes pluies favorisent le lessivage des sols et la contamination des milieux et sont donc des périodes particulièrement à risque.

Qu’est-ce que la leptospirose et quels sont les symptômes ?

La leptospirose est une maladie grave, provoquée par une bactérie souvent présente chez les rats ou autres rongeurs. La maladie se contracte lors d’un contact avec un environnement humide contaminé par les urines de ces animaux infectés (boues, flaques d’eau, eaux stagnantes en bord de ravines) 
La bactérie entre dans l’organisme par la peau en cas de coupures ou de plaies (même petites). Après 4 à 14 jours d’incubation, la leptospirose se manifeste par les symptômes suivants (qui peuvent être facilement confondus avec une dengue ou une infection Covid-19) :
  • fièvre élevée d’apparition brutale (souvent > 38,5°C)
  • douleurs musculaires et articulaires,
  • douleurs au ventre, nausées, vomissements
  • maux de tête
La maladie peut s’aggraver après quelques jours. Si elle n’est pas traitée à temps par des antibiotiques, elle peut être mortelle.

Quelles sont les activités à risques ?

La grande majorité des cas recensés sur l’île est liée à la pratique d’activité :
  • de jardinage et élevage « la kour »,
  • de loisirs en eau douce (pêche, baignade en rivière ou bassin, sport d’eaux vives)
  • et majoritairement chez des personnes présentant des plaies non protégées ou sans protections suffisantes (bottes, gants, lunettes, combinaison…)

Comment éviter la leptospirose ?

Des mesures simples permettent de limiter efficacement les risques de contamination :
  • Appliquer des mesures de protection individuelle :
    • utiliser des équipements adaptés (port de gants, bottes, combinaison…)
    • protéger et désinfecter ses plaies
    • reporter des activités de loisirs en eau douce en cas d’eau trouble
    • ne pas marcher pieds nus ou en savates dans les eaux stagnantes ou boueuses
  • Lutter contre les rats :
    • entretenir régulièrement sa cour (absence d’encombrants, déchets propices à la prolifération des rats…)
    • éliminer toutes les sources d’alimentation (y compris les restes d’alimentation des animaux)
    • Respecter les interdictions de baignade dans les lieux à risque signalés.
Ces mesures de prévention doivent être appliquées tout particulièrement après des périodes de fortes pluies car le risque de contact avec des milieux humides contaminés est alors plus important.
NB : Je me suis permis d'ajouter une photo pour signaler leur présence notable à Paris ...
Selon Le Figaro.fr du 1er octobre 2020, La «maladie du rat» inquiète les autorités en vue des JO de Paris 2024.

Une étude est en cours à la mairie de Paris, qui veut éviter une future contamination à la leptospirose des athlètes et des Franciliens en cas de baignade dans la Seine.

Selon Santé publique de France,

En 2019, 676 cas ont été diagnostiqués en France métropolitaine par le CNR et son réseau de laboratoires et l’incidence estimée était de 1,05 cas pour 100 000 habitants.
Depuis 2014, des incidences supérieures à 0,9 cas pour 100 000 habitants sont observées en métropole, nettement supérieures aux incidences estimées avant 2014 qui variaient entre 0,3 cas par 100 000 habitants en 2006 et 0,6 cas par 100 000 habitants en 2013. 
 

Mise à jour au 26 mai 2021. 190 cas enregistrés depuis le début de l'année au 18 mai 2021, source DASS.

jeudi 29 avril 2021

Combattre Shigella en bloquant sa toxine

«De nouvelles molécules abordables pour lutter contre les maladies diarrhéiques chez les jeunes enfants», source Univesrité d'Utrecht.

Des scientifiques d'Utrecht et une branche mondiale de la société pharmaceutique GSK, spécialisée dans la santé, ont découvert de nouvelles molécules abordables dans la lutte contre les maladies diarrhéiques chez les jeunes enfants.

La bactérie Shigella cause 165 millions de cas de maladies diarrhéiques, dont de nombreux décès, dont 70% chez des enfants de moins de 5 ans. Plus de 95% de ces décès surviennent dans les pays en développement. L'issue de la maladie est plus grave si elle produit une shigatoxine, qui peut provoquer une maladie rénale mortelle. Dans un article publié Journal of Medicinal Chemistry (l'article est disponible en intégralité) des chercheurs présentent une nouvelle molécule capable de bloquer cette toxine, dont la prévalence augmente parmi les quatre espèces de bactéries Shigella.

Des tentatives antérieures par d'autres ont produit des molécules puissantes capturant la toxine, mais ces molécules étaient trop complexes pour un développement et une application ultérieure dans les pays à faible revenu. De plus, la toxine est une cible difficile, car elle passe du tractus intestinal à la circulation après quelques jours. Alors que la présente étude se concentrait sur une forte capture en circulation, des chercheurs d'Utrecht ont également découvert un polysaccharide et un additif alimentaire facilement disponibles qui peuvent capturer la toxine dans l'intestin. Une telle approche à deux volets peut être nécessaire pour lutter contre ce pathogène difficile.

Pays en voie de développement

«Nous sommes très heureux d'avoir trouvé une molécule non seulement efficace, mais aussi relativement facile et peu coûteuse à fabriquer», a dit Roland Pieters, auteur correspondant de la publication. «Cela signifie qu'il convient parfaitement à une utilisation dans les pays en voie de développement.»

Afin de capturer la toxine, les chercheurs ont exploré les glycodendrimères: des molécules arborescentes avec des feuilles de glucides appropriées. De plus, ils ont étudié un type de glycopolymère qui s'assemble en une sphère semblable à des particules d'une taille similaire à celle de la toxine. Ces dernières particules se sont révélées les plus efficaces et des études ont indiqué qu'elles n'étaient pas toxiques.

Rayon d'espoir

Lluís Ballell, responsable de l'incubateur GSK Global Health, a dit: «Les effets d'une diarrhée sévère sont dramatiques, en particulier chez les enfants des pays en voie de développement. Cette innovation offre une lueur d'espoir vers une solution simple et abordable qui s'attaque aux effets les plus pernicieux de la sécrétion de toxines dans les maladies diarrhéiques. Nous sommes très heureux que GSK et la Fondation Tres Cantos Open Lab aient pu jouer un rôle déterminant dans ce projet.

Ce travail est d'autant plus pertinent qu'une souche de souche de E. coli (STEC) produit des toxines similaires pour lesquelles aucun traitement ou vaccin adéquat n'est actuellement disponible.

dimanche 14 février 2021

Encapsulation et administration de phages à usage thérapeutiques

Voici un article très intéressant sur «Encapsulation et administration de phages à usage thérapeutiques», publié en intégralité dans Applied and environmental Microbiology, une revue de l'ASM.

Résumé

L'administration de composés thérapeutiques sur le site d'action est cruciale. Alors que de nombreuses substances chimiques telles quedles antibiotiques comme les bêta-lactamines peuvent atteindre des niveaux thérapeutiques dans la plupart des régions du corps humain après administration, les substances de poids moléculaire plus élevé telles que les protéines thérapeutiques peuvent ne pas être en mesure d'atteindre le site d'action (par exemple, une infection) et sont donc inefficaces.

Dans le cas des phages thérapeutiques, c'est-à-dire des virus qui infectent les microbes, pour traiter les infections bactériennes, ce problème est exacerbé; non seulement les phages sont incapables de pénétrer dans les tissus, mais les particules de phages peuvent être éliminées par le système immunitaire et les protéines de phages sont rapidement dégradées par les enzymes ou inactivées par le faible pH de l'estomac.

Pourtant, l'utilisation de phages thérapeutiques est une stratégie très prometteuse, en particulier pour les infections causées par des bactéries qui présentent une multirésistance. Les cliniciens sont de plus en plus confrontés à des situations dans lesquelles aucune option de traitement ne reste disponible pour de telles infections où les antibiotiques sont inefficaces. Alors que le nombre de pathogènes résistants aux médicaments continue d'augmenter en raison de la surutilisation et du mauvais usage des antibiotiques, aucun nouveau composé n'est disponible, car de nombreuses sociétés pharmaceutiques cessent de rechercher des antimicrobiens chimiques.

Ces dernières années, la phagothérapie a fait l'objet d'une innovation massive pour le traitement des infections causées par des pathogènes résistants aux antibiotiques conventionnels. Alors que la plupart des applications thérapeutiques des phages sont bien décrites dans la littérature, d'autres aspects de la thérapie par phages sont moins bien documentés. Dans cette revue, nous nous concentrons sur les questions qui sont essentielles pour que la thérapie phagique devienne une thérapie standard fiable et décrivons des méthodes pour une administration efficace et ciblée de phages, y compris leur encapsulation.

Dans la conclusion de l'artilce, les auteurs rapportent,

À l'échelle mondiale, les infections bactériennes résistantes aux antibiotiques sont responsables de plus de 750 000 décès par an et on estime que la mortalité atteindra environ 10 millions par an d'ici 2050. L'avenir semble sombre sans autres options de traitement, car les antibiotiques deviennent de plus en plus inefficaces; l'étude du potentiel thérapeutique des bactériophages et l'utilisation de la phagothérapie comme stratégie clinique standard pour traiter les infections pourraient être notre moyen de sortir de cette crise. Les phages ont un potentiel prometteur pour être utilisés comme interventions thérapeutiques dans le traitement des infections bactériennes résistantes aux antibiotiques. Cependant, il existe encore des limitates qui doivent être abordées afin de permettre à la phagothérapie de devenir une stratégie standard dans la pratique clinique. L'un d'eux est la production de préparations de phages robustes et fiables, un problème critique. Les produits pharmaceutiques à bas de phages doivent remplir de nombreux critères, tels que la question de la stabilité sur de longues périodes de temps et l'aptitude à l'administration (par exemple, la nébulisation) tout en permettant également une libération ciblée, pour n'en nommer qu'un. En raison de leur nature comparativement instable en tant qu'entités biologiques, en particulier par rapport aux médicaments compoés de petites molécules, de nouvelles formulations pharmaceutiques pourraient devoir être développées pour les phages à usage thérapeutique. Ces dernières années, des progrès ont été réalisés dans le domaine, et une pléthore d'options sont facilement disponibles pour l'encapsulation et la délivrance de phages. Alors que les bactériophages pourraient ne pas être en mesure de remplacer les composés antibiotiques chimiques, l'avenir verra probablement une coexistence des deux stratégies, avec la phagothérapie comme arme supplémentaire contre le monde bactérien, éventuellement utilisée en combinaison avec des antibiotiques plus souvent que seule. Pour atteindre ce statut, cependant, des méthodes de préparation robustes pour la délivrance ciblée de phages à usage thérapeutique doivent être établies.

lundi 18 janvier 2021

Un composé à partir d’herbe médicinale tue des amibes mangeuses de cerveau dans des études en laboratoire

«Un composé à partir d’herbe médicinale tue les amibes mangeuses de cerveau dans des études en laboratoire», selon ACS News Service.

La méningo-encéphalite amibienne primitive (MEAP), une maladie mortelle causée par «l'amibe mangeuse de cerveau», Naegleria fowleri, est de plus en plus courante dans certaines régions du monde, et elle n'a pas de traitement efficace. Désormais, des chercheurs rapportant dans ACS Chemical Neuroscience (Exploration de la valeur anti-infectieuse de l'inuloxine A isolée de Inula viscosa contre l'amibe mangeuse de cerveau (Naegleria fowleri) par l'activation de la mort cellulaire programmée) ont découvert qu'un composé isolé des feuilles d'une plante médicinale traditionnelle, Inula viscosa (l’inule visqueuse) ou «false yellowhead», tue des amibes en les poussant à commettre un suicide cellulaire dans des études de laboratoire, ce qui pourrait conduire à de nouvelles traitements.

La MEAP, caractérisée par des maux de tête, de la fièvre, des vomissements, des hallucinations et des convulsions, est presque toujours mortelle dans les quelques semaines suivant l'apparition des symptômes. Bien que la maladie, généralement contractée en nageant dans de l'eau douce contaminée, soit rare, des cas en augmentation ont été signalés récemment aux États-Unis, aux Philippines, au sud du Brésil et dans certains pays d'Asie. L'amphotéricine B est le traitement le plus couramment administré aux personnes infectées. Il peut tuer N. fowleri en laboratoire, mais il n’est pas très efficace lorsqu'il est administré aux patients, probablement parce qu’il ne peut pas traverser la barrière hémato-encéphalique.

Ikrame Zeouk, José Piñero, Jacob Lorenzo-Morales et leurs collègues voulaient explorer si des composés isolés de I. viscosa, une plante à forte odeur utilisée depuis longtemps pour la médecine traditionnelle dans la région méditerranéenne, pouvaient traiter efficacement la MEAP. Les chercheurs ont d'abord fabriqué un extrait à l'éthanol des feuilles de l'herbe, constatant qu'il pouvait tuer les amibes N. fowleri. Ensuite, ils ont isolé et testé des composés spécifiques de l'extrait. Le composé le plus puissant, l'inuloxine A, a tué les amibes en laboratoire en perturbant les membranes et en provoquant des changements mitochondriaux, la condensation de la chromatine et des dommages oxydatifs, forçant finalement les parasites à subir une mort cellulaire programmée, ou apoptose. Bien que l'inuloxine A soit beaucoup moins puissante que l'amphotéricine B en laboratoire, la structure du composé d'origine végétale suggère qu'il pourrait être mieux à même de traverser la barrière hémato-encéphalique. D'autres études sont nécessaires pour confirmer cette hypothèse, disent les chercheurs.

jeudi 14 janvier 2021

Des scientifiques du NIH étudient le comportement de la nage de Salmonella comme indices d'une infection

Des scientifiques des National Institutes of Health ont identifié une protéine de Salmonella Typhimurium qui permet aux bactéries de nager directement lorsqu'elles sont prêtes à infecter les cellules.

«Des scientifiques du NIH étudient le comportement de la nage de Salmonellcomme indices d'une infection», source NIH.

Les bactéries Salmonella enterica sérovar Typhimurium (S. Typhimurium) provoquent fréquemment une gastro-entérite humaine, une inflammation de la muqueuse de l’intestin. Les bactéries vivent à l'intérieur de l'intestin et peuvent infecter les cellules épithéliales qui tapissent sa surface. De nombreuses études ont montré que Salmonella utilise une méthode «run-and-tumble» de courtes périodes de nage (courses) ponctuées de chutes lorsqu'elles changent de direction au hasard, mais comment se déplacent-elles dans l'intestin n'est pas bien compris.

Des scientifiques du National Institutes of Health NIH) et leurs collègues pensent avoir identifié une protéine de S. Typhimurium, McpC pour Methyl-accepting chemotaxis protein C, qui permet aux bactéries de nager directement lorsqu'elles sont prêtes à infecter les cellules. Cette nouvelle étude, publiée dans Nature Communications, décrit le mouvement de S. Typhimurium et montre que McpC est nécessaire pour que les bactéries envahissent les cellules épithéliales de surface dans l'intestin.

Les auteurs de l'étude suggèrent que McpC est une cible potentielle pour le développement de nouveaux traitements antibactériens pour entraver la capacité de S. Typhimurium d’infecter les cellules épithéliales intestinales et à coloniser l'intestin.

Des scientifiques de l'Institut national des allergies et des maladies infectieuses des Rocky Mountain Laboratories à Hamilton, dans le Montana, ont dirigé l'étude. Les collaborateurs comprenaient des groupes des campus de l'Université du Texas A&M à College Station et Kingsville.

S. Typhimurium utilise des flagelles - de longues projections en forme de fouet - pour se déplacer dans les fluides. Lorsque les flagelles tournent dans le sens antihoraire, ils forment un faisceau rotatif derrière les bactéries et les propulsent vers l'avant. Cependant, les flagelles commutent fréquemment la rotation du sens anti-horaire au sens horaire, perturbant le faisceau et provoquant la chute et le changement de direction des bactéries.

À l'aide de microscopes et de caméras spéciaux pour observer S. Typhimurium en direct, les scientifiques ont découvert que les bactéries cultivées dans des conditions qui activent leur comportement invasif nageaient dans des courses droites plus longues parce que les flagelles ne commutaient pas la rotation du sens antihoraire au sens horaire. Les bactéries dépourvues de McpC démontraient toujours la méthode de nage «run-and-tumble» dans ces conditions et présentaient un défaut d'invasion dans un modèle d'intestin de veau, indiquant que la nage directe est importante pour une invasion efficace des cellules épithéliales intestinales.

Les chercheurs émettent l'hypothèse que la nage douce contrôlée pourrait être une stratégie d'infection bactérienne répandue. Un comportement de nage régulier similaire peut être observé chez des bactéries entériques non apparentées, telles que Vibrio, qui peuvent provoquer une infection lorsque des produits de la mer mal cuits sont consommés. Ces résultats peuvent informer le développement de nouveaux antibiotiques.

Ce communiqué de presse décrit un résultat de recherche fondamentale. La recherche fondamentale améliore notre compréhension du comportement humain et de la biologie, ce qui est fondamental pour faire progresser de nouvelles et meilleures façons de prévenir, diagnostiquer et traiter les maladies.

La science est un processus imprévisible et progressif, chaque avancée de la recherche s'appuie sur des découvertes passées, souvent de manière inattendue. La plupart des progrès cliniques ne seraient pas possibles sans la connaissance de la recherche fondamentale fondamentale. Pour en savoir plus sur la recherche fondamentale au NIH, voir ici.

mardi 22 décembre 2020

Évolution d'un tueur: comment Salmonella en Afrique a fait le saut de l'intestin à la circulation sanguine

«Évolution d'un tueur: comment Salmonella en Afrique a fait le saut de l'intestin à la circulation sanguine», source Université de Liverpool.

Des scientifiques de l'Université de Liverpool ont exploité la puissance combinée de la génomique et de l'épidémiologie pour comprendre comment un type de bactérie, Salmonella, a évolué pour tuer des centaines de milliers de personnes immunodéprimées en Afrique.

Les infections sanguines causées par un type de Salmonella Typhimurium résistant aux antibiotiques appelé ST313 sont un problème de santé publique majeur en Afrique, où la maladie est endémique et cause environ 50 000 décès chaque année. Ce qui manquait était une compréhension du moment des événements évolutifs majeurs qui ont équipé Salmonella d'Afrique afin de provoquer des infections sanguines chez l'homme.

Dans un nouvel article publié dans Nature Microbiology, une équipe de chercheurs du Royaume-Uni, de France et du Malawi a échantillonné deux collections complètes d'isolats de Salmonella provenant de patients africains atteints d'infections sanguines, couvrant de 1966 à 2018, pour reconstituer le parcours évolutif de la Salmonella sur 50 ans d'infections humaines en Afrique, dont la découverte d'une nouvelle lignée de ST313 sensible aux antibiotiques.

L'étude a été dirigée par le Professeur Jay Hinton de l'Université de Liverpool, qui fait des recherches sur Salmonella depuis plus de 30 ans et dirige le 10,000 Salmonella Genomes Project, un effort mondial pour comprendre l'épidémiologie, la transmission et la virulence de la salmonellose invasive non typhique.

Le professeur Hinton a dit: «Grâce à un effort d'équipe remarquable, nous avons éliminé une partie du mystère sur l'évolution de la salmonelle africaine. Nous espérons qu'en apprenant comment ces agents pathogènes sont devenus capables d'infecter la circulation sanguine humaine, nous serons mieux préparés pour lutter contre les futures épidémies bactériennes.»

Dans l'étude, les scientifiques ont séquencé les génomes de 680 isolats de Salmonella, à partir d'archives conservées par le programme de recherche clinique Malawi Liverpool Wellcome Trust (MLW) et l'Institut Pasteur, et les ont utilisés pour découvrir la chronologie des événements génétiques cruciaux responsables de l'infection des humains immunodéprimés par S. Typhimurium ST313. Les mutations qui ont influencé la fonction des gènes au cours de l'évolution de ST313 ont été identifiées pour la première fois.

L'équipe a également découvert une nouvelle lignée sensible aux antibiotiques de ST313 qui a émergé au Malawi en 2016 et est étroitement liée aux variants de Salmonella qui provoquent des infections de l'estomac au Royaume-Uni et au Brésil. Les chercheurs pensent que les changements dans l'utilisation des antibiotiques au Malawi entre 2002 et 2015 auraient pu créer une fenêtre d'opportunité pour l'émergence de cette nouvelle lignée ST313 sensible aux antibiotiques.

Le Dr Caisey Pulford, qui a mené une grande partie de la recherche dans le cadre de son doctorat, a dit: «En combinant la puissance de l'analyse génomique avec l'épidémiologie, les observations cliniques et les connaissances fonctionnelles, nous avons montré l'intérêt d'utiliser une approche intégrée pour relier la recherche scientifique avec la santé publique.»

L'étude a été réalisée par des chercheurs de l'Université de Liverpool, de l'Université du Malawi, de l'Université Queens de Belfast, de l'Institut Pasteur, de l'Institut Earlham et du programme de recherche clinique Malawi-Liverpool-Wellcome Trust (MLW).

dimanche 20 décembre 2020

Les maladies d'origine hydrique causent 6 600 décès par an aux États-Unis, selon le CDC

Dessin satirique de 1828 relatif à l'eau de la Tamise intitulé Soupe de monstres communément appelée l'eau de la Tamise (Monster Soup commonly called Thames Water). Source Wikipédia.

« Le CDC rapporte que les maladies d'origine hydrique causent 6 600 décès par an aux États-Unis », source CIDRAP News.

Les infections causées par 17 agents pathogènes d'origine hydrique causent environ 7,15 millions de cas de maladie et 6 630 décès (0,9% de mortalité par cas) à travers les États-Unis chaque année, rapportent les chercheurs du CDC dans Emerging Infectious Diseases. Les maladies les plus courantes étaient l'otite externe (65,3% des cas), les infections à norovirus (18,6%), la giardiase (5,8%) et la cryptosporidiose (4,5%).

Les chercheurs ont exclu les maladies causées par des agents pathogènes adjacents à l'eau comme le paludisme, les toxines des algues et les expositions chimiques. D'autres maladies d'origine hydrique pour lesquelles les données sont insuffisantes, telles que les sapovirus et les rotavirus, n'ont pas non plus été incluses.

En utilisant des données de 2000 à 2015 et la population américaine de 2014, une modélisation statistique et un jugement d'expert structuré, les chercheurs ont constaté que l'otite externe était à l'origine de 94,3% des visites aux urgences pour les maladies transmises par l'eau. L'infection à mycobactéries non tuberculeuses (MNT), l'otite externe et la pneumonie à Pseudomonas ont provoqué respectivement 43,6%, 19,7% et 13,1% des hospitalisations pour maladies d'origine hydrique.

La septicémie à Pseudomonas avait le coût le plus élevé pour les séjours à l'hôpital (38 200 dollars), suivie de la maladie des légionnaires (37 300 dollars). Les coûts les plus cumulatifs ont été dus à l'infection à MNT (1,53 milliards de dollars), l'otite externe (564 millions de dollars) et la pneumonie à Pseudomonas (453 millions de dollars).

Les chercheurs ont également classé les maladies d'origine hydrique de l'étude en maladies principalement respiratoires et entériques, constatant que 5 530 (83,4%) des décès étaient dus à des maladies respiratoires, contre 131 (2,0%) à des maladies entériques. Par rapport à une étude de 2011 parue dans Emerging Infectieous Diseases les maladies d'origine hydrique pesaient moins lourdement sur le système entérique que les maladies d'origine alimentaire, peut-être parce que le traitement de l'eau est fait pour prévenir les maladies entériques.

Dans l'ensemble, les maladies d'origine hydrique causaient plus de maladies que les maladies d'origine alimentaire si les agents non spécifiés étaient exclus.

«Cette analyse met en évidence le rôle croissant des agents pathogènes environnementaux (par exemple, mycobactéries, Pseudomonas, Legionella) qui peuvent se développer dans les réseaux de distribution d'eau potable, la tuyauterie dans les hôpitaux, les maisons et les autres bâtiments, les installations de loisirs aquatiques et les systèmes d'eau industriels (par exemple, les tours de refroidissement)», écrivent les chercheurs du CDC.