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mardi 28 mai 2019

Danemark et Suède : Épidémie à Yersinia liée à des épinards frais, plus de 50 personnes malades


« Épidémie en cours de Yersinia liée à des épinards frais, plus de 50 personnes malades », source article de Joe Whitworth paru le 28 mai 2019 dans Food Safety News.

Un foyer de cas à Yersinia au Danemark et en Suède comptant plus de 50 cas a été associé à des épinards frais.

Le Statens Serum Institut, un institut de recherche en santé publique au Danemark, a signalé que 20 personnes ont été infectées dans le pays. Une personne a eu besoin d'être hospitalisée. L'Agence suédoise de la santé publique (Folkhälsomyndigheten) a enregistré 37 cas confirmés.

En mars, 20 cas à Yersinia enterocolitica ont été découverts au Danemark. Il y avait 11 femmes et neuf hommes âgés de 2 à 74 ans, la plupart des cas âgés de 20 à 30 ans. Les patients étaient répartis dans tout le Danemark à Hovedstaden, Sjaelland, Syddanmark, Midtjylland et Nordjylland. Le lien avec les épinards a été basé sur une étude cas-témoins et sur une enquête de traçabilité, qui est toujours en cours pour déterminer le pays d'origine des épinards.

Après des entretiens avec des patients, le Statens Serum Institut a mené une étude dans laquelle il était demandé aux personnes en bonne santé du même sexe et du même âge vivant dans la même municipalité que les personnes malades si elles avaient mangé certains aliments que beaucoup de patients ontaminés par Yersinia avaient consommés. L'étude a montré que les patients avaient consommé des épinards frais dans une bien plus grande mesure que les témoins.

L'enquête a révélé que des épinards avaient été achetés chez Netto et dans une chaîne de supermarchés en Suède. Des responsables danois ont déclaré que le produit en cause n'était plus disponible sur le marché, car le pays n'avait pas vu de cas depuis mars et compte tenu de la durée de l'éclosion, il est probable que seul un lot a été contaminé.

La cause de l'épidémie a été Yersinia enterocolitica, sérotype O3, biotype 4. le séquençage du génome complet a motré que tous les patients étaient infectés par la même souche bactérienne.

« Bien que l’épidémie soit terminée, nous pouvons utiliser ces connaissances pour éviter qu’elle ne se reproduise. C’est également une bonne raison de rappeler aux consommateurs que les légumes verts à feuilles doivent toujours être bien lavés avant de les manger », a déclaré Luise Müller, épidémiologiste au Statens Serum Institut.

Le Danemark connaît environ 400 cas à Yersinia enterocolitica par an, dont 366 ont été signalés en 2018.

En Suède, l'augmentation des infections à Yersinia a débuté en mars et les 37 cas, principalement de jeunes adultes, provenaient de tout le pays.

L’infection à Yersinia est relativement rare en Suède, 200 à 300 cas étant notifiés chaque année.

Les épidémies précédentes étaient dues à la consommation de viande crue ou insuffisamment cuite et à des légumes contaminés prêts à être consommés. Après une période d'incubation de trois à sept jours, les symptômes incluent fièvre, diarrhée et douleurs abdominales dans la partie inférieure droite de l'abdomen.

vendredi 3 mai 2019

Survie plus longue de Salmonella enterica dans des sols enrichis avec des granulés d’engrais de volaille traités thermiquement qu’avec des bactéries dans des sols non amendés


Un article récente paru dans AEM a attiré notre attention sur la survie plus longue de Salmonella enterica dans les sols enrichis avec des granulés d’engrais de volaille traités thermiquement qu'avec des bactéries présentes dans les sols non amendés. Salmonella a été facilement transféré et persistant dans des épinards.
Résumé.

Des engrais biologiques du sol d'origine animale non traités sont couramment utilisés comme engrais biologiques, mais peuvent héberger des agents pathogènes d'origine alimentaire tels que Salmonella enterica, ce qui pourrait entraîner un transfert des sols vers les fruits et légumes destinés à la consommation humaine. Les granulés d’engrais issus de volaille et traités thermiquement (HTPP pour Heat-treated poultry pellets) peuvent fournir aux producteurs de fruits et légumes un engrais à libération lente avec un risque minimal de contamination par des agents pathogènes. On sait peu de choses sur l'impact des sols amendés par des HTTP sur la survie de Salmonella enterica. Les contributions du facteur sigma (RpoS)* et la formation de cellules viables mais non cultivables à la survie de Salmonella dans les sols sont également mal comprises.

Nous avons quantifié la survie de souches de Salmonella enterica subsp. enterica sérovar Newport de type sauvage (WT) et déficient en rpoS (mutant ΔrpoS) dans un sol amendé et non amendé avec des HTPP avec ou sans culture d’épinards pendant 91 jours en utilisant des méthodes de culture et par PCR quantitative avec du monoazide de propidium (PMA-qPCR). Le transfert simulé par « splash » de S. Newport du sol aux épinards a été évalué entre 35 et 63 jours après l’inoculation. S. Newport WT et le mutant ΔrpoS ont atteint la limite de détection, 1,0 log UFC/g (poids sec), dans un sol non-amendé au bout de 35 jours, alors que 2 à 4 log UFC/g (poids sec) étaient observés à la fois pour WT et ΔrpoS. souches mutantes après 91 jours d’inoculation dans un sol amendés avec des HTPP. Les taux de S. Newport dans des sols déterminés par PMA-qPCR et par les méthodes de dénombrement sur boîtes étaient similaires (P > 0,05). Les sols amendés avec des HTPP ont ont eu des taux plus élevés de transfert de S. Newport et une survie dans des feuilles d'épinards pendant des périodes plus longues que les sols non amendés (P < 0,05). Salmonella Newport introduits dans des sols amendés a vec des HTPP a survécu plus longtemps et était plus susceptible de se transférer et de persister dans les plants d'épinard que S. Newport introduit dans des sols non amendés.

Importance. Des granulés d’engrais de volaille traités thermiquement (HTPP) sont souvent utilisés par les producteurs de fruits et de légumes comme engrais à libération lente. Toutefois, la contamination des sols dans les exploitations peut être due à l’eau d’irrigation contaminée ou à des résidus d’animaux sauvages. Nous montrons ici que la présence des HTPP dans le sol a entraîné une augmentation de la survie de S. Newport dans le sol et une probabilité accrue de son transfert et de sa survie sur des plants d’épinards. Il n'y avait pas de différences significatives dans les durées de survie des isolats sauvages et des isolats mutants ΔrpoS de S. Newport. Les populations statistiquement similaires récupérées par dénombrement sur boîtes et estimées par PMA-qPCR pour les deux souches dans les sols amendés et non amendés dans cette étude indiquent que toutes les populations viables de S. Newport dans les sols étaient cultivables.

* Le facteur sigma (RpoS) contrôle la transcription des gènes impliqués dans la survie des bactéries en phase stationnaire et qui joue un rôle important dans la réponse au stress.