Survie plus longue de Salmonella enterica dans des sols enrichis avec des granulés d’engrais de volaille traités thermiquement qu’avec des bactéries dans des sols non amendés

Un article récente paru dans AEM a attiré notre attention sur la survie plus longue de Salmonella enterica dans les sols enrichis avec des granulés d’engrais de volaille traités thermiquement qu'avec des bactéries présentes dans les sols non amendés. Salmonella a été facilement transféré et persistant dans des épinards.

Résumé.

Des engrais biologiques du sol d'origine animale non traités sont couramment utilisés comme engrais biologiques, mais peuvent héberger des agents pathogènes d'origine alimentaire tels que Salmonella enterica, ce qui pourrait entraîner un transfert des sols vers les fruits et légumes destinés à la consommation humaine. Les granulés d’engrais issus de volaille et traités thermiquement (HTPP pour Heat-treated poultry pellets) peuvent fournir aux producteurs de fruits et légumes un engrais à libération lente avec un risque minimal de contamination par des agents pathogènes. On sait peu de choses sur l'impact des sols amendés par des HTTP sur la survie de Salmonella enterica. Les contributions du facteur sigma (RpoS)* et la formation de cellules viables mais non cultivables à la survie de Salmonella dans les sols sont également mal comprises.

Nous avons quantifié la survie de souches de Salmonella enterica subsp. enterica sérovar Newport de type sauvage (WT) et déficient en rpoS (mutant ΔrpoS) dans un sol amendé et non amendé avec des HTPP avec ou sans culture d’épinards pendant 91 jours en utilisant des méthodes de culture et par PCR quantitative avec du monoazide de propidium (PMA-qPCR). Le transfert simulé par « splash » de S. Newport du sol aux épinards a été évalué entre 35 et 63 jours après l’inoculation. S. Newport WT et le mutant ΔrpoS ont atteint la limite de détection, 1,0 log UFC/g (poids sec), dans un sol non-amendé au bout de 35 jours, alors que 2 à 4 log UFC/g (poids sec) étaient observés à la fois pour WT et ΔrpoS. souches mutantes après 91 jours d’inoculation dans un sol amendés avec des HTPP. Les taux de S. Newport dans des sols déterminés par PMA-qPCR et par les méthodes de dénombrement sur boîtes étaient similaires (P > 0,05). Les sols amendés avec des HTPP ont ont eu des taux plus élevés de transfert de S. Newport et une survie dans des feuilles d'épinards pendant des périodes plus longues que les sols non amendés (P < 0,05). Salmonella Newport introduits dans des sols amendés a vec des HTPP a survécu plus longtemps et était plus susceptible de se transférer et de persister dans les plants d'épinard que S. Newport introduit dans des sols non amendés.

Importance. Des granulés d’engrais de volaille traités thermiquement (HTPP) sont souvent utilisés par les producteurs de fruits et de légumes comme engrais à libération lente. Toutefois, la contamination des sols dans les exploitations peut être due à l’eau d’irrigation contaminée ou à des résidus d’animaux sauvages. Nous montrons ici que la présence des HTPP dans le sol a entraîné une augmentation de la survie de S. Newport dans le sol et une probabilité accrue de son transfert et de sa survie sur des plants d’épinards. Il n'y avait pas de différences significatives dans les durées de survie des isolats sauvages et des isolats mutants ΔrpoS de S. Newport. Les populations statistiquement similaires récupérées par dénombrement sur boîtes et estimées par PMA-qPCR pour les deux souches dans les sols amendés et non amendés dans cette étude indiquent que toutes les populations viables de S. Newport dans les sols étaient cultivables.

* Le facteur sigma (RpoS) contrôle la transcription des gènes impliqués dans la survie des bactéries en phase stationnaire et qui joue un rôle important dans la réponse au stress.