Les éditeurs d'Applied and Environmental Microbiology font part d'une nouvelle famille de protéines antibiofilm produite par des bactéries marines ; c'est un travail réalisé par une équipe française.
Il est urgent d'utiliser des molécules antibiofilm respectueuses de l'environnement en médecine et dans divers autres domaines. Jouault et coll. ont décrit l'altérocine, une protéine antibiofilm, qui est active contre un large éventail de bactéries, y compris des agents pathogènes humains.
Les gènes de l'altérocine et de ses homologues ont été trouvés dans des bactéries marines, principalement du genre Pseudoalteromonas. Cette famille de protéines joue vraisemblablement une fonction importante dans la biologie des bactéries productrices et présente donc un intérêt écologique, en plus d'avoir un potentiel biotechnologique.
Source article paru dans Applied and Environmental Microbiology, « Alterocin, an Antibiofilm Protein Secreted by Pseudoalteromonas sp. Strain 3J6 ».
Résumé
Nous avons cherché à identifier et à étudier la protéine antibiofilm sécrétée par la bactérie marine Pseudoalteromonas sp. souche 3J6. Ce dernier est actif contre les bactéries marines et terrestres, notamment les souches cliniques de Pseudomonas aeruginosa formant différents types de biofilms. Plusieurs séquences d'acides aminés ont été obtenues à partir de la protéine antibiofilm partiellement purifiée, appelée altérocine.
Le génome Pseudoalteromonas sp. 3J6 a été séquencé et un gène alt candidat a été identifié en comparant les protéines codées par le génome aux séquences d'altérocine purifiée. Exprimer le gène alt dans une autre souche non active de Pseudoalteromonas sp. 3J3, a démontré qu'elle est responsable de l'activité antibiofilm. L'altérocine est une protéine de 139 résidus qui comprend une séquence signal prédite de 20 résidus, qui serait clivée lors de l'exportation par le système de sécrétion général. Aucune homologie de séquence n'a été trouvée entre l'altérocine et les protéines de fonctions connues. Le gène alt n'est pas organisé en opéron et les gènes adjacents ne semblent pas liés à la production d'altérocine, à l'immunité ou à la régulation, ce qui suggère que ces fonctions ne sont pas remplies par des protéines dévouées. Au cours de la croissance en milieu liquide, le niveau d'ARNm alt a culminé pendant la phase stationnaire. Un seul promoteur a été identifié expérimentalement, et plusieurs répétitions inversées pourraient être des sites de liaison pour les régulateurs. Les gènes alt ont été retrouvés dans environ 30% des génomes de Pseudoalteromonas et dans quelques cas seulement d'autres bactéries marines des genres Hahella et Paraglaciecola. La génomique comparative a conduit à l'hypothèse que des pertes de gènes alt se produisaient dans le genre Pseudoalteromonas. Dans l'ensemble, l'altérocine est un nouveau type de protéine antibiofilm d'intérêt écologique et biotechnologique.
Importance
Les biofilms sont des communautés microbiennes qui se développent sur des surfaces solides ou des interfaces et sont préjudiciables dans un certain nombre de domaines, y compris par exemple l'industrie alimentaire, l'aquaculture et la médecine. Dans ces derniers, les antibiotiques sont insuffisants pour éliminer les infections liées à des biofilms, conduisant à des infections chroniques comme dans le cas d'une infection par Pseudomonas aeruginosa des poumons des patients atteints de mucoviscidose. Il est donc urgent d'utiliser des molécules d'antibiofilm en association avec des antibiotiques conventionnels, ainsi que dans d'autres domaines d'application, notamment s'il s'agit de molécules respectueuses de l'environnement.
Ici, nous décrivons l'altérocine, une nouvelle protéine antibiofilm sécrétée par une bactérie marine appartenant au genre Pseudoalteromonas et son gène. Des homologues d'altérocine ont été trouvés dans environ 30% des souches de Pseudoalteromonas, indiquant que cette nouvelle famille de protéines antibiofilm joue probablement une fonction importante, quoique non essentielle, dans la biologie de ces bactéries. Cette étude ouvre la possibilité d'une variété d'applications.
