mardi 30 juillet 2019

Rapport annuel sur l'épidémiologie des maladies infectieuses en Allemagne - 2018


« Rapport annuel sur l'épidémiologie des maladies infectieuses en Allemagne - 2018 », source Institut Robert Koch du 29 juillet 2019.

Le rapport complet en allemand est ici.

Résumé

Le rapport annuel sur l'épidémiologie des maladies infectieuses fournit un résumé des déclarations de maladies infectieuses rapportées à l'Institut Robert Koch.

Comme l'année précédente, les maladies gastro-intestinales, la gastro-entérite à norovirus, l'entérite à Campylobacter et la gastro-entérite à rotavirus, ainsi que les maladies à prévention vaccinale (grippe et varicelle) étaient les cinq maladies à déclaration obligatoire les plus fréquemment signalées.

Le nombre de cas de grippe notifiés correspond à une saison grippale sévère par rapport à l'année précédente, mais également à toutes les saisons grippales précédentes depuis l'entrée en vigueur de la nouvelle loi allemande sur la prévention et le contrôle des maladies infectieuses.

La majorité des cas étaient encore des enfants. Par rapport à l'année précédente, toutefois, le groupe d'âge des 40 à 59 ans était plus touché, de même que les plus âgés (plus de 80 ans).

Une augmentation des cas signalés d'encéphalite à tiques et d'hépatite E a été observée en 2018.

Pour les autres maladies à déclaration obligatoire, une baisse significative du nombre de cas signalés a été observée au cours des dernières années, probablement en raison des mesures de contrôle efficaces des infections.

La baisse significative de rotavirus, en particulier chez les enfants, peut être attribuée à la recommandation du Comité permanent sur la vaccination concernant le vaccin antirotavirus dans la petite enfance.

La mise en œuvre améliorée des mesures d'hygiène dans les hôpitaux a également probablement contribué à la réduction significative des infections invasives à SARM signalées vu au cours des dernières années.

Avec la modification de la loi allemande sur la prévention et le contrôle des maladies infectieuses de mai 2016, de nouvelles exigences en matière de rapport ont été introduites et intégrées dans la réglementation en vigueur en matière de notification. En conséquence des nouvelles exigences, les données sur les infections à SARM, les infections à Clostridium difficile à évolution clinique grave, le virus Chikungunya et le virus Zika ont déjà été publiées dans le rapport annuel 2016 sur l'épidémiologie des maladies infectieuses.

En 2018, les données sur les agents pathogènes résistants au carbapénème étaient publiées dans le rapport actuel pour la deuxième fois. Le nombre de cas notifiés ainsi que le fait que les notifications provenaient de tous les États allemands indiquent une bonne acceptation des nouvelles exigences.

La surveillance moléculaire joue un rôle de plus en plus important dans la détection des épidémies. L’une des plus grandes épidémies de 2018, qui concernait 191 cas dans plusieurs États fédéraux, était due à un complexe de type 1734 de Salmonella enteritidis. Le vecteur probable de l’infection était des œufs de poulailler. Au cours de cette épidémie, les résultats du typage moléculaire des isolats des agents pathogènes ont été utilisés pour découvrir l'association avec 24 épidémies plus petites.

Grâce à la comparaison d'échantillons environnementaux avec des échantillons de cas de légionellose déclarés, les techniques moléculaires permettent également d'identifier la source des éclosions. Cependant, pour la majorité des maladies à déclaration obligatoire, les résultats du typage moléculaire sont incomplets ou non signalés. L'amendement de 2017 de la loi sur la protection contre les infections souligne que les résultats du typage moléculaire doivent être inclus dans les déclarations de maladie.

En général, une diminution des données transmises sur le typage des agents pathogènes est observée depuis des années, ce qui rend difficile la détection des épidémies d’entérite à EHEC, de SHU ou de listériose, par exemple.

Les investigations sur les épidémies ont permis d’identifier des voies de transmission qui n’avaient pas joué auparavant un rôle important dans les épidémies. 59 personnes atteintes d'hépatite C ont été affectées à une seule grande épidémie. La transmission s'est probablement faite par injection pendant le séjour à l'hôpital.

En 2018, une épidémie de tularémie parmi les membres d'une société de chasse était également à noter. La source d'infection était des lièvres fraîchement chassés.

En règle générale, la fréquence des cas d’hantavirus est très variable en raison de l’association entre la densité de population des rongeurs et la mastification des hêtres au cours des années précédentes.

Après une mauvaise mastication des fruits du hêtre en 2017, l'incidence de la maladie à hantavirus dans le sud et l'ouest de l'Allemagne, principalement causée par le Puumala virus, était extrêmement faible en 2018. Le nombre de cas de fièvre Q signalés montre également qu'il existe des cas exceptionnels, et comme dans l'année 2018, des années non substantielles pour les maladies sporadiques et les épidémies en Allemagne. Depuis 2001, les chiffres ont considérablement fluctué, sans tendance perceptible.

La plupart des maladies évitables par la vaccination, telles que la tuberculose, l'hépatite A, la varicelle et la coqueluche, sont survenues chez des individus non vaccinés, bien qu'une vaccination efficace soit disponible.

La surveillance de la répartition des sérogroupes (par exemple, des infections invasives à méningocoques), le statut vaccinal des cas ainsi que les quotas de vaccination de la population sont nécessaires pour évaluer l'impact des vaccinations recommandées, déterminer la nécessité de vaccinations de rappel, ainsi que comme la mise en œuvre de la vaccination contre des sérogroupes supplémentaires.

L’apparition d’autres maladies, telles que le virus Chikungunya, le virus de la dengue et le virus Zika dépend fortement de la situation épidémiologique dans les pays d’endémie et des habitudes de déplacement de la population. En 2018, une diminution du nombre de cas de ces trois maladies a été observée. En particulier, beaucoup moins de cas de maladie à virus Zika ont été signalés que les années précédentes. Cela peut probablement s'expliquer par le déclin de la circulation du virus Zika en Amérique, mais aussi par une diminution de l'attention.

La tendance à la hausse du nombre de cas déclarés d'hépatite E, constatée ces dernières années, s'est poursuivie en 2018. Cette augmentation peut probablement être attribuée à une sensibilisation accrue des médecins et à une augmentation du nombre d'échantillons soumis à analyse.

Pour d’autres maladies, par exemple l’infection à E. coli producteurs de shigatoxines et la leptospirose, il n’est pas clair non plus si l’augmentation du nombre de cas est due à une augmentation du nombre d’échantillons soumis aux tests.

Outre les tendances à long terme et les épidémies, il convient de prendre en compte d'autres facteurs lors de l'interprétation du nombre de cas signalés. Par exemple, modifier les définitions de cas, en particulier la définition de référence, et les exigences de notification ont également une incidence sur le nombre de cas, par exemple. pour l'hépatite B.

NB : Rappelons qu’un tel rapport n’existe pas en France. Parmi les moyens à votre disposition pour rechercher une telle information, il vous faut aller sur le site de l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA). C'est en regroupant ces données et celles des pays européens que l'EFSA établit chaque année la compilation intitulée « The European Union summary report on trends and sources of zoonoses, zoonotic agents and food-borne outbreaks ».

L'Allemagne rapporte des cas d'infection à EHEC liés à l'Egypte


Photo issue de l'Université de Gand (Belgique).
« L'Allemagne rapporte des cas d'infection à E. coli liés à l'Egypte », source article de Joe Whitworth publié le 30 juillet 2019 dans Food Safety News.

L'institut de santé publique en Allemagne a annoncé que plus de 30 personnes avaient contracté une maladie liée à E. coli cette année après être allées en Égypte.

L'Institut Robert Koch (RKI) a noté une augmentation du nombre de cas d'infection à E. coli entérohémorragique (EHEC) liés au séjour en Égypte ou après. Plus tôt ce mois-ci, Public Health England a également signalé une augmentation du nombre d'adultes et d'enfants malades après leur retour d'Hurghada en Égypte.

En Allemagne, il y a eu 31 cas à EHEC et cinq personnes atteintes du syndrome hémolytique et urémique (SHU), un type d'insuffisance rénale associé à une infection à E. coli.

C'est beaucoup plus que pendant la même période des années précédentes. En 2018, il y avait 21 cas à EHEC et un cas de SHU. En 2017, neuf cas à EHEC et un cas de SHU ont été enregistrés. La hausse ne peut pas être expliquée que par l'augmentation du nombre de voyages en Égypte, selon RKI.

Cela fait suite à un avertissement de PHE après que 18 personnes aient contracté une infection à E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) et qu'une personne ait développé un SHU après son retour d'Égypte cette année. Quatre personnes ont eu besoin d'être hospitalisées.

Une porte-parole de PHE a déjà déclaré à Food Safety News qu'il ne s'agissait pas d'une épidémie, car différentes souches de STEC avaient été détectées chez des visiteurs en Egypte, dont STEC O157 et STEC O26.

L'agence a informé le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) de ces cas.

Réduire le risque d'infection
E. coli est transmis aux humains principalement par la consommation d'aliments contaminés, tels que la viande hachée crue ou insuffisamment cuite, le lait cru, les légumes crus et les graines germées.

La période d'incubation des infections à E. coli peut aller de trois à huit jours. La plupart des patients guérissent dans les 10 jours. Les symptômes comprennent la diarrhée, les nausées, les vomissements, les douleurs abdominales, les crampes d'estomac et parfois de la fièvre.

La cause des cas allemands est inconnue et des personnes malades ont séjourné dans différents hôtels dans des endroits distincts, selon RKI, qui a informé les autorités égyptiennes de cette augmentation.

Le Dr Nick Phin, directeur adjoint du Service national des infections à PHE, a déclaré que les voyageurs pouvaient prendre certaines précautions.

« Cela implique de s'assurer que la viande est bien cuite, de ne pas boire de l'eau du robinet ou de la glace faite à partir de l'eau du robinet et d'essayer d'éviter d'avaler de l'eau en nageant. Toute personne souffrant de diarrhée et de vomissements doit s’assurer de bien s’hydrater et consulter un médecin si les symptômes ne s’améliorent pas dans les 48 heures. Ils devraient également éviter de préparer ou de servir de la nourriture lorsqu'ils présentent des symptômes et se laver soigneusement les mains après avoir utilisé les toilettes pour empêcher la transmission du virus à d'autres personnes », a-t-il déclaré. »

Tout le monde doit avoir en mémoire l’épidémie de 2011, voir  Final presentation and evaluation of epidemiological findings in the EHEC O104:H4 Outbreak, Germany 2011.

Des bactéries telles que E. coli détectées en quelques minutes par une nouvelle technologie, selon l'Université de Warwick


Un communiqué de l’Université de Warwick du 26 juin 2019 nous informe que « Bacteria such as E. coli detected in minutes by new technology ». Traduction par mes soins -aa.

Des scientifiques de l'Université de Warwick ont montré que les signaux bioélectriques provenant de bactéries peuvent être utilisés pour déterminer rapidement si elles sont vivantes ou mortes.

Les résultats offrent une nouvelle technologie qui détecte les bactéries vivantes en quelques minutes au lieu d'attendre les résultats des analyses de laboratoire qui peuvent prendre des jours.

Lorsque ses bactéries vivantes reçoivent un champ électrique, les bactéries vivantes absorbent les molécules de colorant, ce qui permet de les rendre lumineuses et permet de les dénombrer facilement.

Cette technique rapide permet de détecter les bactéries résistantes aux antibiotiques.

Une découverte effectuée par des chercheurs de la Faculté des sciences de la vie de l’Université de Warwick offre une nouvelle technologie permettant de détecter des bactéries en quelques minutes en « électrifiant » (zapping) les bactéries avec de l’électricité.

Le test de contamination bactérienne dans des échantillons cliniques ou les produits commerciaux prend généralement plusieurs jours. Pendant ce temps, ils peuvent causer des dommages importants; de nombreuses infections peuvent devenir très rapidement une menace pour la vie si elles ne sont pas identifiées et traitées avec des antibiotiques appropriés.

Par exemple, 8% des personnes atteintes d'une septicémie grave d'infection sanguine décèdent pour chaque heure de retard d'un traitement approprié. Les problèmes plus courants tels que les infections des voies urinaires sont difficiles à diagnostiquer et certaines personnes ne peuvent obtenir une réponse claire à propos de leurs symptômes en raison de la difficulté à détecter les infections avec un taux faible. Des études ont révélé que 20 à 30% des infections des voies urinaires ne sont pas détectées par les bandelettes réactives utilisées pour détecter la présence de bactéries dans l'urine.

Des scientifiques de l’Université de Warwick ont ​​découvert que des cellules de bactéries saines et des cellules inhibées par des antibiotiques ou des rayons UV provoquaient des réactions électriques complètement différentes.

Ils ont fait cette découverte en combinant des expériences biologiques, l'ingénierie et la modélisation mathématique. Publiées dans Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA (PNAS), ces découvertes pourraient conduire à la mise au point de dispositifs médicaux capables de détecter rapidement les cellules bactériennes vivantes, d'évaluer les effets des antibiotiques sur les colonies de bactéries en croissance ou d'identifier différents types de bactéries. de bactéries et révéler des bactéries résistantes aux antibiotiques.

Les chercheurs ont un plan ambitieux pour mettre la technologie sur le marché afin de maximiser le bien social et ont fondé une start-up, Cytecom, pour commercialiser l’idée. La société a reçu une subvention d'Innovate UK, l'agence nationale de financement de l'innovation. Ce soutien gouvernemental accélère le processus et les appareils seront mis à la disposition des chercheurs et des entreprises dans un avenir très proche.

Le Dr Munehiro Asally, professeur adjoint à l'Université de Warwick, a déclaré:
« C'est un moment tellement excitant de travailler sur la bioélectricité des cellules bactériennes. Ce travail démontre que l'électricité bactérienne peut mener à une technologie importante pour la société, tout en permettant de mieux comprendre notre compréhension de base des cellules. L'outil que nous avons développé peut offrir plus d'opportunités en permettant des expériences qu'il était impossible de réaliser auparavant. »

Le docteur James Stratford, Cytecom, entreprise dérivée de la School of Life Sciences et de Warwick, commente:
« Le système que nous avons créé peut produire des résultats similaires au nombre de plaques utilisé dans les tests médicaux et industriels, mais environ 20 fois plus rapide. Cela pourrait sauver la vie de nombreuses personnes et profiter à l'économie en détectant la contamination des processus de fabrication. »

Le Dr Yoshikatsu Hayashi, de l'Université de Reading, commente:
« En utilisant le modèle mathématique largement utilisé en neuroscience, nous avons révélé un mécanisme commun de cellules excitables, cellules de neurones et bactéries, et le modèle neuronal étendu pourrait expliquer deux réactions électriques distinctes de cellules bactériennes saines et malsaines. Étonnamment, un seul paramètre représentant le degré de non-équilibre à travers la membrane était suffisant pour expliquer les réponses distinctes des cellules. C’est une étape importante dans la compréhension de l’origine de la signalisation électrique. »
Comparaison avec les techniques existantes. Cliquez sur l'image pour l'agrandir.