Des chercheurs ont développé une méthode pour prédire des
épidémies à Salmonella.
Des chercheurs de l’Université de Sydney ont mis au point un
modèle capable de prévoir des épidémies plusieurs mois à l’avance.
L'Australie a plus d'épidémies à Salmonella que n'importe
quel autre pays du monde, le nombre de cas ayant doublé au cours de la dernière
décennie.
Au cours du seul mois écoulé, de nombreux cas d'infection
par des agents pathogènes tels que Salmonella infectant des œufs ont été
signalés, ce qui a entraîné de nombreux rappels de produits et suscité des
appels d'experts pour des pratiques d'hygiène plus strictes.
Dans une étude publiée dans Nature
- Scientific Reports, des chercheurs de l’Université de Sydney ont mis
au point un modèle permettant de prévoir les épidémies plusieurs mois à
l’avance.
Bien que cette prévision puisse fournir des signes
avant-coureurs pour la surveillance de la maladie et permettre une affectation
plus rapide et plus précise des ressources de santé, l'équipe a découvert que
les futures épidémies à Salmonella pourraient
s'aggraver.
Sous la direction du professeur Mikhail Prokopenko, directeur
du Groupe de recherche sur les systèmes complexes, l'équipe a utilisé des
données des souches de 2008 à 2016 pour démontrer que les réseaux génétiques de
Salmonella ne sont reliés que par quelques degrés de séparation, ce qui indique
une gravité croissante des épidémies futures.
« Les données sur les flambées à Salmonella
dans la Nouvelle-Galles du Sud au cours des dix dernières années mettent en
évidence une « course aux armements » entre les agents pathogènes et
leurs hôtes humains », a expliqué le professeur Prokopenko.
« Dans un
scénario d'évolution darwinien classique, les agents pathogènes se sont
répandus dans le temps en créant initialement de nombreux variants qui ont muté,
avec des clones plus infectieux à venir devenant bientôt les plus dominants au
sein de leur propre population », a-t-il expliqué.
En constante évolution, on estime à 93,8 millions le nombre
d’infections à Salmonella dans le
monde, causant environ 155 000 décès dans le monde. Selon le CSIRO (Commonwealth Scientific and
Industrial Research Organisation),
l'agent pathogène serait responsable de plus de décès en Australie que toute
autre maladie d'origine alimentaire.
L’étude a démontré que les réseaux à Salmonella fonctionnent comme des « petits mondes », un
peu comme les réseaux sociaux humains, dans lesquels le monde entier est relié
par une courte chaîne de connexions ou de degrés. Les chercheurs pensent que ce
degré de séparation des agents pathogènes pourrait entraîner l’émergence d’une
souche agressive, augmentant les chances d’apparition d’une ‘supermicrobe’.
Bien que l'agent pathogène Salmonella soit observé depuis
longtemps, le Dr Oliver Cliff, chercheur chez Complex Systems, a expliqué que
son développement était mal compris et que la bactérie avait évolué en des
souches plus fortes.
« Nous avons constaté qu’il existait des corrélations
entre la gravité des épidémies à Salmonella
et la diversité génétique de l’agent pathogène. Aussi désagréable que cela
puisse paraître, les hôtes humains fournissent l'environnement idéal pour que
les microbes continuent d'évoluer.
« Les épidémies
d'origine alimentaire touchent généralement des produits frais, la restauration
de masse, ainsi que les hôpitaux et les établissements de soins pour personnes
âgées. Nous espérons que cette meilleure compréhension de Salmonella conduira à
une meilleure protection des sources d’aliments afin de réduire les cas de
maladie et de décès », a-t-il déclaré.
Selon le professeur Vitali Sintchenko, microbiologiste en
santé publique au Centre des maladies infectieuses et de microbiologie de
l’Université de Sydney, cet article est un exemple frappant de la manière dont
la complexité des agents pathogènes peut être cartographiée pour indiquer une
évolution du pathogène jusque-là inconnue.
« Notre article a
permis d'identifier comment le pathogène Salmonella évolue et se modifie et
peut nous aider à mieux comprendre ce qui l'a amené à s'adapter, à changer et à
se renforcer », a expliqué le professeur Sintchenko.
« Travaillant aux
côtés des chercheurs sur les pathogènes, des autorités de santé publique et de
l'industrie des aliments frais, cette cartographie de réseau aidera à prédire
les futures épidémies en comprenant le comportement de Salmonella. »
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