Le coronavirus du porc montre un potentiel de propagation aux humains

« Le coronavirus du porc montre un potentiel de propagation aux humains », source communiqué de The University of North Carolina at Chapell Hill du 14 octobre 2020.

Des tests en laboratoire à l'UNC-Chapel Hill Gillings School of Global Public Health démontrent que le coronavirus porcin se réplique dans les voies respiratoires humaines et les cellules intestinales.

Une nouvelle étude de l'Université de Caroline du Nord à Chapel Hill suggère qu'une souche de coronavirus qui a récemment alarmé l'industrie porcine a le potentiel de se propager également aux humains.

La souche de coronavirus, connue sous le nom de coronavirus du syndrome de diarrhée aiguë porcine, est issue de chauves-souris et a infecté des troupeaux de porcs dans toute la Chine depuis sa découverte en 2016. Les épidémies d'une telle maladie ont le potentiel de faire des ravages économiques dans de nombreux pays du monde qui en dépendent de l’industrie porcine.

La menace potentielle du virus pour les humains a été démontrée dans des tests de laboratoire montrant que le SADS-CoV se répliquait efficacement dans les voies respiratoires et les cellules intestinales humaines. Les résultats ont été publiés le 12 octobre dans PNAS.

Bien qu'il fasse partie de la même famille de virus que le bétacoronavirus SARS-CoV-2, qui provoque la maladie respiratoire COVID-19 chez l'homme, le SADS-CoV est un alphacoronavirus qui provoque des maladies gastro-intestinales chez le porc. Le virus provoque une diarrhée et des vomissements sévères et a été particulièrement mortel pour les jeunes porcelets.

Le SADS-COV est également distinct de deux alphacoronavirus courants du rhume chez l'homme, HCoV-229E et HCoV-NL63.

« Alors que de nombreux chercheurs se concentrent sur le potentiel émergent des bétacoronavirus comme le SRAS et le MERS, les alphacoronavirus peuvent en fait s'avérer des préoccupations tout aussi importantes - sinon plus grandes - pour la santé humaine, étant donné leur potentiel à passer rapidement d'une espèce à l'autre », a déclaré Ralph Baric, professeur de épidémiologie à l'UNC-Chapel Hill Gillings School of Global Public Health.

Bien que le SADS-CoV n'ait pas été connu pour affecter les humains à ce jour, la pandémie de COVID-19 sert de rappel puissant que de nombreuses souches de coronavirus trouvées chez les animaux ont le potentiel d'infecter également les humains - un effet connu sous le nom de débordement.

Le laboratoire de Baric a travaillé avec Caitlin Edwards, spécialiste de la recherche et étudiante en maîtrise en santé publique à l'UNC-Chapel Hill, sur l'étude qui suggère que les humains pourraient être sensibles aux retombées du SADS-CoV.

Edwards, le premier auteur de l'étude, a testé plusieurs types de cellules en les infectant avec une forme synthétique de SADS-CoV pour comprendre à quel point le risque de contamination croisée pourrait être élevé.

Les preuves de l'étude indiquent qu'un large éventail de cellules de mammifères, y compris les cellules pulmonaires et intestinales humaines primaires, sont sensibles à l'infection. Selon Edwards, le SADS-CoV montre un taux de croissance plus élevé dans les cellules intestinales trouvées dans l'intestin humain, contrairement au SRAS-CoV-2, qui infecte principalement les cellules pulmonaires.

L'immunité de protection croisée des troupeaux empêche souvent les humains de contracter de nombreux coronavirus retrouvés chez les animaux. Cependant, les résultats des tests effectués par Edwards et son équipe suggèrent que les humains n'ont pas encore développé une telle immunité contre le SADS-CoV.

« Le SADS-CoV est dérivé du coronavirus de chauve-souris appelés HKU2, qui est un groupe hétérogène de virus avec une distribution mondiale », a déclaré Edwards. « Il est impossible de prédire si ce virus, ou une souche de chauve-souris HKU2 étroitement apparentée, pourrait émerger et infecter les populations humaines. Cependant, la large gamme d'hôtes de SADS-CoV, associée à une capacité de réplication dans les cellules pulmonaires et entériques humaines primaires, démontre un risque potentiel d'événements d'émergence futurs dans les populations humaines et animales. »

En réponse à ces résultats, Edwards et ses collègues ont testé le remdesivir antiviral à large spectre comme méthode potentielle de traitement de l'infection.

En collaboration avec Gilead Sciences, le remdesivir a été développé par le laboratoire de Baric pour lutter contre tous les coronavirus connus, y compris le SADS-CoV. Il est actuellement utilisé pour traiter les infections au COVID-19 chez l'homme. Les résultats préliminaires de cette étude montrent qu'il a une activité robuste contre le SADS-CoV, bien qu'Edwards prévient que des essais supplémentaires sont nécessaires sur d'autres types de cellules et chez les animaux pour confirmer ces résultats.

« Des données prometteuses avec le remdesivir offrent une option de traitement potentielle en cas d'événement de contagion humaine », a-t-elle déclaré. « Nous recommandons que les employés du secteur porcin et la population porcine soient continuellement surveillés pour détecter les signes d'infections de SADS-CoV afin de prévenir les épidémies et les pertes économiques massives.

Le SADS-CoV pourrait également constituer une menace pour l'économie américaine, qui occupait le troisième rang de la production mondiale de porc en 2019. En 2012, l'industrie porcine américaine a été dévastée par différents coronavirus porcins qui ont émergé de Chine.

« Sans surprise, nous recherchons actuellement des partenaires pour étudier le potentiel des vaccins candidats vis-à-vis du SADS-CoV pour protéger les porcs » a déclaré Baric. « Alors que la surveillance et la séparation précoce des porcelets infectés des truies offrent l'occasion de réduire les épidémies plus importantes et le potentiel de débordement chez l'homme, le vaccin peut être essentiel pour limiter la propagation mondiale et les événements d'émergence humaine à l'avenir.

Commentaire. Pour information, selon cette étude, le remdesivir montre un petit effet ou pas d'effet du tout contre le SRAS-CoV-2.

Les rotavirus des troupeaux de volailles peuvent échanger des gènes avec les rotavirus de mammifères, mais le risque d'infection pour l'homme est faible

« Les rotavirus des troupeaux de volailles peuvent échanger des gènes avec les rotavirus de mammifères, mais le risque d'infection pour l'homme est faible », source BfR, Résumé du rapport de recherche sur le projet du BfR, « Characterisation of the zoonotic potential of rotaviruses in poultry » du 17 août 2020.

Les rotavirus aviaires sont répandus dans les troupeaux de volailles destinées à l'alimentation. Cependant, ils ne sont que lointainement liés aux rotavirus qui se produisent chez les mammifères et les humains et qui peuvent conduire à des cas de maladie en. Dans le projet de recherche du BfR «Caractérisation du potentiel zoonotique des rotavirus chez les volailles», financé par la Fondation allemande pour la recherche (DFG), le professeur Reimar Johne et son groupe de recherche ont montré que les rotavirus des oiseaux peuvent échanger du matériel génétique contenant des rotavirus de mammifères, ce qui peut conduire au développement de nouveaux types de rotavirus. Les scientifiques considèrent, cependant, que le risque de développer de tels types de virus, connus comme des «virus réassortis», dans la nature comme étant faible. En effet, les nouveaux virus capables de se répliquer n'apparaissent que dans quelques cas dans des conditions de laboratoire. De plus, il était difficile pour eux de se reproduire efficacement. Le risque d'infection pour l'homme est donc estimé à relativement faible. Néanmoins, des études sur la diversité des rotavirus chez l'homme devraient à l'avenir également inclure des rotavirus éloignés tels que ceux des oiseaux afin de pouvoir déterminer l’apparition de nouveaux types à un stade précoce.

Contrairement aux rotavirus des mammifères, les rotavirus des oiseaux n'ont été que peu étudiés jusqu'à maintenant. L'objectif du BfR était d'analyser la diversité génétique des rotavirus, en particulier chez les oiseaux, et de déterminer leur potentiel de transmission et d'adaptation aux mammifères et aux humains. Une question importante était de savoir si les rotavirus des oiseaux échangeaient du matériel génétique avec ceux des mammifères, ce qui pourrait éventuellement entraîner de nouveaux types de rotavirus. Le projet a identifié une grande variété d'espèces de rotavirus connues et inconnues auparavant et des types chez les oiseaux et les mammifères. Le génome de ces virus était généralement entièrement séquencé à l'aide de méthodes nouvellement développées, ce qui permettait de caractériser précisément leurs propriétés et leur relation avec les rotavirus connus.

Dans l'ensemble, les analyses indiquent qu'il faut s'attendre à un large répertoire de souches de rotavirus divergentes dans le règne animal, qui pourrait éventuellement être transmis directement à l'homme ou, par échange de segments de génome, et cela pourrait conduire à la formation de nouveaux rotavirus. Pour les rotavirus des oiseaux, cependant, cela semble être très rare.

Les rotavirus sont parmi les agents pathogènes les plus courants à l'origine de maladies gastro-intestinales chez les humains et dans de nombreuses espèces animales. Il existe de nombreux types de rotavirus qui évoluent constamment à travers les mutations et l'échange de segments de génome. Les maladies humaines sont principalement causées par des rotavirus humains. Mais il est également connu que certains rotavirus peuvent être transmis de l'animal à l'homme et vice versa. Des vaccins contre les maladies à rotavirus chez homme existent depuis 2006 et sont généralement très efficaces. Cependant, si de nouveaux rotavirus contenant du matériel génétique d'animaux se développent, l'immunité acquise par la vaccination contre de telles infections pourrait devenir inefficace.

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous

Zoonose reverse, quand les humains contaminent les animaux

Les zoonoses, nous dit-on, sont des maladies et infections dont les agents se transmettent naturellement des animaux vertébrés à l'être humain, et vice-versa. Les pathogènes en cause peuvent être des bactéries, des virus ou des parasites. La transmission de ces maladies se fait soit directement, lors d'un contact entre un animal et un être humain, soit indirectement par voie alimentaire ou par l’intermédiaire d'un vecteur (insecte, arachnides…).

Voici un cas appelé zoonose reverse où c'est un animal qui a été contaminé par des êtres humains …

Il est beaucoup question de la présence de norovirus chez l'homme, mais voici qu'il est ici question de norovirus chez le chien … selon Emerging Infectious Diseases, vol. 26, no. 2 :

Résumé

En juillet 2018, norovirus recombinant GII.Pe-GII.4 Sydney a été détecté chez des chiens qui avaient la diarrhée dans un chenil et chez des enfants vivant dans les mêmes locaux en Thaïlande. Le séquençage du génome entier et l'analyse phylogénétique de 4 norovirus de Thaïlande ont montré que le norovirus canin était étroitement lié au norovirus humain GII.Pe-GII.4 Sydney, suggérant une transmission de l'homme au chien.

Conclusion

Nous rapportons une infection de chiens par des norovirus humain GII.4 Sydney. Des norovirus humains ont été rapportés chez des chiens en Finlande (GII.4 Denhaag et GII.4 non classés). Les chiens ont montré de légers signes cliniques de diarrhée aqueuse aiguë, similaires à ceux de l'infection aux norovirus humains, et de faibles niveaux de maladie et de décès. Des observations similaires ont également été signalées dans d'autres études. Dans cette étude, les enfants avaient été hospitalisés 2 semaines avant l'investigation. La maladie s'est développée chez les chiens et les chiots après qu'ils aient partagé les mêmes locaux et un contact direct possible avec les enfants. Cette observation suggère une transmission potentielle d'homme à chien de norovirus humains. Les analyses génétiques et phylogénétiques ont confirmé que les génomes entiers des norovirus canins et humains étaient étroitement liés au norovirus humain GII.Pe-GII.4 Sydney, suggérant qu'une souche commune circule en Thaïlande et dans le monde. Cependant, dans notre étude, il n'est pas clair comment et quand les virus ont été introduits chez les enfants et les chiens.

En résumé, nous avons démontré des signes d'infection par norovirus GII.Pe-GII.4 chez l'homme et le chien en Thaïlande. Les propriétaires de chiens et les vétérinaires devraient accorder plus d'attention à l'infection à norovirus en tant que maladie zoonotique et zoonotique inverse dans les foyes domestiques, les cliniques pour animaux et les refuges. Une surveillance accrue du norovirus est nécessaire pour déterminer son statut et sa distribution dans les populations humaines et canines.

NB : Merci à Doug Powell du barfblog de m'avoir signalé cet article.