La transplantation de microbiote fécal favorise la réduction des bactéries résistantes, selon un essai clinique

«La transplantation de microbiote fécal favorise la réduction des bactéries résistantes, selon un essai clinique», source article de Chris Dal paru le 3 novembre 2023 dans CIDRAP News.

Les données d'un petit essai clinique randomisé indiquent que la transplantation de microbiote fécal peut réduire la colonisation par des micro-organismes multirésistants aux antibiotiques (MMAs) chez les receveurs de greffe de rein, ont rapporté des chercheurs cette semaine dans Science Translational Medicine.

Dans l'essai de phase 1, une équipe dirigée par des chercheurs de la faculté de médecine de l'Université Emory a recruté et randomisé 11 receveurs de transplantation rénale (RTR) pour recevoir une transplantation de microbiote fécal (ou TMF est une procédure au cours de laquelle les selles d'un donneur sain sont transplantées à un patient) ou une période d'observation. suivi d'une TMF retardée si les cultures de selles étaient positives pour MMAs à J36. Les patients transplantés rénaux présentent un risque élevé de colonisation et d'infection par des MMAs, car ils reçoivent des antibiotiques prophylactiques après la transplantation, qui peuvent sélectionner des MMAs. Ils constituent donc une priorité pour la décolonisation, car de nombreux antibiotiques utilisés pour traiter les infections par des MMAs sont néphrotoxiques.

Les 11 patients ont finalement reçu au moins une dose de TMF, dont 9 ont reçu deux traitements. Bien qu'aucun participant du groupe d'observation n'ait présenté une décolonisation des MMAs de façon spontanée, 4 des 6 participants randomisés dans le groupe TMF étaient MMAs négatifs après une dose, et 8 des 9 participants ayant reçu toutes les TMF spécifiées dans le protocole étaient MMAs négatifs lors de leur dernière visite. De plus, après 180 jours, les participants traités par TMF avaient un délai plus long avant de récidiver une infection par des MMAs par rapport à un groupe témoin de receveurs de transplantation rénale qui n'avaient pas reçu de TMF.

Compétition de souches bactériennes

L'analyse des isolats de Escherichia coli provenant d'un sous-ensemble du groupe de traitement par TMF a révélé que, plutôt que de simplement éradiquer les souches MMAs, la TMF semblait favoriser la compétition avec les souches de E. coli sensibles aux antibiotiques qui étaient présentes chez les patients avant la TMF, avec les souches sensibles de remplacement des souches MMAs.

«Nous concluons que les thérapies microbiologiques comme la TMF pourraient permettre d'exploiter la compétition entre les souches bactériennes pour éradiquer la colonisation par des MMAs», ont écrit les auteurs. «Cet essai a également fourni la preuve que la réduction de la colonisation par des MMAs dans les TMF pourrait réduire la récidive des infections par des MMAs, ce qui présente un large potentiel pour améliorer les soins aux patients et la réponse de santé publique et pour réduire les coûts des soins de santé dans les groupes de patients au-delà des receveurs de greffe d'organe solide».

Une étude suggère que la transplantation de microbiote fécale est plus efficace que les antibiotiques pour lutter contre l’infection récurrente à Clostridioides difficile

«Une étude suggère que la transplantation fécale est plus efficace que les antibiotiques pour lutter contre l’infection récurrente à Clostridioides difficile», source article de Chris Dall paru le 25 avril 2023 dans CIDRAP News.

Une nouvelle Cochrane Review a révélé que la transplantation de selles est significativement plus efficace pour résoudre les infections récurrentes à Clostridioides difficile (rCDI) que les antibiotiques.

Dans leur analyse de six essais cliniques randomisés (ECRs) impliquant 320 patients, les examinateurs ont découvert que l'utilisation de la transplantation de microbiote fécal (TMF), qui consiste à transplanter des bactéries à partir des selles d'un donneur sain chez un patient présentant un microbiome intestinal perturbé, conduit probablement à une forte augmentation de la résolution des symptômes de rCDI chez les patients immunocompétents par rapport au traitement antibiotique. La revue a également révélé que la TMF peut entraîner moins d'événements indésirables et une réduction de la mortalité toutes causes confondues.

Briser le cycle des infections récurrente à  C. difficile

C . difficile est une bactérie qui provoque une diarrhée sévère et une inflammation du côlon. Il cause plus de 450 000 infections associées aux établissements de santé et à la communauté et jusqu'à 30 000 décès aux États-Unis chaque année. De plus, les personnes atteintes de rCDI courent un risque accru d'être à nouveau infectées, souvent plusieurs fois.

Bien que la TMF soit toujours considérée comme un traitement expérimental par la Food and Drug Administration des États-Unis, plusieurs études observationnelles ont montré que la procédure pourrait guérir plus de 90% des patients atteints de rCDI, et elle est désormais recommandée par l'Infectious Diseases Society of America et l'American College of Gastroenterology comme option de traitement après une deuxième récidive ou plus. Au moins 10 000 procédures de TMF pour les rCDI sont effectuées chaque année, en utilisant des selles filtrées provenant de donneurs sains.

L'une des raisons pour lesquelles la TMF est de plus en plus considérée comme une option privilégiée pour la rCDI est que les antibiotiques, qui sont un facteur de risque majeur pour les premiers épisodes de la CDI , peuvent éliminer à la fois les bonnes et les mauvaises bactéries du microbiome intestinal, créant un déséquilibre qui permet C. difficile de s'épanouir et d'attaquer le côlon. En conséquence, des traitements antibiotiques répétés pour le rCDI peuvent entraîner davantage de récidives.

Dans un communiqué de presse de Cochrane, l'examinateur principal Aamer Imdad, professeur agrégé au SUNY Upstate Medical Center spécialisé en gastro-entérologie pédiatrique, explique que les traitements antibiotiques répétés pour la rCDI créent un cycle difficile à rompre.

«Après qu'une personne atteinte d'une infection à C. difficile ait été traitée avec des antibiotiques, il y a environ 25% de chances qu'elle ait un autre épisode d'infection à C. difficile dans les 8 prochaines semaines», a dit Imdad. «Le risque de récidive augmente à environ 40% avec le deuxième épisode et à près de 60% avec le troisième épisode.»

Le but de la TMF, ajoute Imdad, est d'introduire des bactéries donneuses saines pour inverser la dysbiose (déséquilibre dans la composition microbienne de l'intestin) causée par les antibiotiques et réduire le risque de récidive.

Augmentation significative de la résolution des rCDI

Pour déterminer l'efficacité de la TMF pour les rCDI, Imdad et ses collègues ont analysé les données de six ECRs menés dans cinq pays, deux au Danemark et un au Canada, Danemark, Italie et aux États-Unis. Cinq des études excluaient les personnes immunodéprimées, tandis qu'une n'incluait qu'une poignée de patients immunodéprimés.

Tous les ECRs ont été menés sur des adultes, avec un âge moyen allant de 52 à 73 ans, et tous impliquaient des participants ayant au moins une récidive de CDI après une cure d'antibiotiques (une étude n'a recruté que des patients avec deux récidives ou plus, et une autre uniquement des patients à trois ou plus).

Les six études avaient une serie qui avait reçu une TMF d'un donneur sain pour le traitement de la rCDI, délivrée par différentes méthodes (coloscopie, sonde nasoduodénale et lavement). La série de comparaison dans cinq des études a reçu un antibiotique, la vancomycine, avec une étude ayant un groupe supplémentaire qui a reçu de la fidaxomicine. Sur les 320 patients, 133 étaient dans le groupe TMF et 187 dans le groupe témoin. Les six études ont évalué l'innocuité et l'efficacité de la TMF.

Les critères de jugement principaux étaient la proportion de patients avec une résolution de la rCDI et des événements indésirables graves. Les critères de jugement secondaires comprenaient la mortalité toutes causes confondues.

Les résultats regroupés des six ECRs ont montré que l'utilisation de la TMF a conduit probablement à une augmentation de 92 % de la résolution de la rCDI par rapport au groupe de comparaison (risque relatif [RR], 1,92 ; intervalle de confiance [IC] à 95%, 1,36 à 2,71). La certitude globale des preuves à l'appui de cette conclusion a été jugée modérée.

Les examinateurs ont également constaté une légère réduction des événements indésirables (RR, 0,73 ; IC à 95%, 0,38 à 1,41) et de la mortalité toutes causes confondues (RR, 0,57 ; IC à 95%, 0,22 à 1,45) chez les patients ayant reçu une TMF. Mais dans les deux cas, le nombre d'événements qui se sont produits était si petit que la preuve n'a pas été considérée comme concluante.

Les examinateurs affirment qu'en raison du faible nombre de patients immunodéprimés dans les ECRs, il est impossible de tirer des conclusions sur les risques ou les avantages de la TMF pour la rCDI dans la population immunodéprimée. En outre, ils notent que la revue ne fournit pas de preuves concernant la sécurité sur le long terme de la TMF.

La transplantation de microbiote fécal supérieure aux antibiotiques pour C. difficile dans un essai clinique en double aveugle, contrôlé versus placebo

Lors du lancement du Grand Défi «Ferments du futur» par le ministre de l’Agriculture, j’avais retenu pour promesse, «Maintenir ou rétablir un microbiote favorable à la santé de l’hôte, développer de nouveaux probiotiques.»

Après un récent article sur une Première thérapie de transplantation fécale pour traiter les infections à Clostridioides difficile approuvée par la FDA, voici «Essai clinique : la transplantation de microbiote fécal supérieure aux antibiotiques pour C. difficile», source CIDRAP News.

Un essai clinique randomisé mené au Danemark a révélé que, chez des patients présentant une première ou une deuxième infection à Clostridioides difficile, la transplantation de microbiote fécal (FMT pour fecal microbiota transplantation) était supérieure au traitement antibiotique standard pour obtenir une résolution durable des symptômes, ont rapporté les chercheurs la semaine dernière dans The Lancet Gastroenterology & Hepatology.

Mené dans un hôpital universitaire d'Aarhus, au Danemark, l'essai en double aveugle et contrôlé par placebo a recruté des patients adultes atteints d'une première ou d'une deuxième infection à C. difficile et les a assignés au hasard pour recevoir soit une FMT, soit un placebo après avoir reçu 10 jours de vancomycine, l'antibiotique standard de traitement. Les traitements ont été administrés au jour 1 et entre les jours 3 et 7, et les patients ont été suivis pendant 8 semaines ou jusqu'à la récidive. Le résultat principal était la résolution de la diarrhée associée au C. difficile après 8 semaines.

Un total de 42 patients ont été assignés à FMT (21) ou à un placebo (21) du 21 juin 2021 au 1er avril 2022. L'analyse intermédiaire du 7 avril a montré que 19 des 21 patients du groupe FMT avaient une résolution de de la diarrhée associée au C. difficile à 8 semaines, contre 7 sur 21 dans le groupe placebo, pour une réduction du risque absolu de 57%. En raison du taux de résolution significativement plus faible dans le groupe placebo, l'essai a été arrêté pour des raisons éthiques.

«Dans de rares cas, il peut arriver que vous découvriez que le traitement que vous êtes en train d’étudier est si efficace qu'il est éthiquement indéfendable de continuer», a déclaré le premier auteur Simon Mark Dahl Baunwall, dans un communiqué de presse de l'Université d'Aarhus. «Notre étude en est un exemple, dans la mesure où le nouveau traitement FMT est tellement meilleur que le traitement standard avec des antibiotiques qu'il serait contraire à l'éthique de continuer, car les patients du groupe témoin risqueraient de ne pas recevoir le traitement FMT.»

Dans l'ensemble, 204 événements indésirables ont été signalés, dont un ou plusieurs signalés chez 20 des 21 patients du groupe FMT et les 21 du groupe placebo. Les événements indésirables les plus fréquents étaient la diarrhée et les douleurs abdominales.

Etats-Unis : Les premiers résultats d'une étude nationale indiquent que la transplantation de microbiote fécal est sûre, efficace pour traiter les infections à C. difficile

 

« Les premiers résultats d'une étude nationale indiquent que la transplantation de microbiote fécal est sûre, efficace pour C. difficile », source CIDRAP News.

Les premiers résultats du registre national de la TMF (transplantation de microbiote fécal) indiquent que la TMF est très efficace pour traiter l'infection à Clostridioides difficile (ICD), avec un bon profil de sécurité sanitaire, ont rapporté des chercheurs américains dans Gastroenterology.

Le registre national de la TMF est un registre multicentrique continu, prospectif, d'observation des patients nord-américains qui reçoivent dla TMF pour toute indication, conçu pour évaluer les méthodes d'administration de la TMF, ainsi que l'innocuité et l'efficacité de la procédure. Les données sont collectées par les sites participants au départ et à 1 mois, 6 mois, 1 an et 2 ans après la procédure. Le critère de jugement principal analysé dans cette étude était la guérison de l'ICD à 1 mois. Les résultats en matière de sécurité sanitaire comprenaient les symptômes des patients, les infections, les hospitalisations, les décès et les changements des conditions médicales actuelles ou le développement de nouvelles conditions.

Sur les 259 premiers participants inscrits dans 20 sites, 222 ont terminé le suivi à 1 mois et 123 ont eu un suivi à 6 mois. Toutes les procédures ont été effectuées pour une ICD, et 249 (96%) ont utilisé des selles provenant d'un donneur inconnu, principalement une banque de selles. La principale méthode d'administration était la coloscopie (221 patients, 85%). Sur les 222 patients avec un suivi d'un mois, 200 (90%) ont eu un traitement pour une ICD, 197 (98%) n'ayant besoin que d'un seul traitement pour guérir. Parmi 112 avec une cure initiale qui ont été suivis jusqu'à 6 mois, 4 (4%) ont eu une récidive d'une ICD.

Les symptômes sévères rapportés dans le mois suivant la TMF comprenaient la diarrhée (2 patients, 5%), des douleurs abdominales (4 patients, 2%). Des hospitalisations ont été rapportées chez 27 patients (12%), mais seulement 3 hospitalisations (1%) étaient possiblement liées à la TMF. À 6 mois, de nouveaux diagnostics de syndrome du côlon irritable ont été posés chez 2 patients (1%) et de maladie inflammatoire de l'intestin chez 2 patients (1%).

« Les taux de guérison de l'ICD étaient excellents à environ 90% et en ligne avec ceux rapportés dans les [essais contrôlés randomisés de la TMF et dans un registre national de la TMF pédiatrique », ont écrit les auteurs de l'étude. « Ainsi, les patients peuvent s'attendre à obtenir des taux de succès élevés avec la TMF pour l'ICD réfractaire dans la pratique clinique standard. »

Les auteurs disent que l'évaluation des nouvelles conditions lors du suivi à long terme est prévue à mesure que le registre se développe et sera importante pour déterminer le profil complet de la sécurité sanitaire de la TMF.

NB : La photo est extraite du site de Luxia Scienfific.

La FDA publie une alerte après deux décès à l'issue d'une transplantation de microbiote fécal

« La FDA publie une alerte après deux décès à l'issue d'une transplantation de microbiote fécal », source CIDRAP News.

Le 13 juin 2019, la Food and Drug Administration (FDA) a émis une alerte de sécurité sanitaire après le décès d'un patient et le décès d'un autre patient souffrant d'une infection invasive, toutes deux causées par Escherichia coli producteurs de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) du même donneur.

Les selles du donneur utilisées chez les deux patients n'avaient pas encore été testées pour détecter la présence de micro-organismes Gram-négatifs producteurs de BLSE avant leur utilisation, et des tests ultérieurs ont montré que les selles étaient positives pour E. coli producteurs de BLSE. La FDA, qui n’a pas approuvé la transplantation de microbiote fécal (TMF) pour une utilisation clinique, a déclaré que les deux patients étaient immunodéprimés.

La FDA demande aussi qu'on arrête plusieurs essais cliniques en cours utilisant le TMF, a rapporté le New York Times, jusqu'à ce que les enquêteurs puissent démontrer qu'ils effectuent un dépistage des germes dangereux dans les selles.

« La FDA informe les membres des communautés médicale et scientifique et les autres personnes intéressées du risque potentiel de transmission de micro-organismes multirésistants aux antibiotiques (MMRA) par le TMF et des effets indésirables graves qui peuvent en résulter », a déclaré la FDA dans son alerte à la sécurité sanitaire.

Le TMF expérimental recommandé

La TMF est une procédure utilisée pour traiter l’infection à Clostridioides difficile (ICD) chez les patients qui n’ont pas répondu aux traitements classiques.

L'année dernière, l'Infectious Diseases Society of America (IDSA) et la Society for Healthcare Epidemiology of America (SHEA) ont recommandé une TMF avec des selles saines si les antibiotiques de première intention échouaient dans le traitement de l'ICD récurrente.

Au cours des dernières années, plusieurs petits essais cliniques ont montré que le TMF était un succès pour certains patients, même pour sauver des vies.

Mais dès juillet 2013, la FDA avait averti que le TMF était une procédure expérimentale comportant des risques potentiels, notamment l'exposition à des organismes multirésistants. L'agence avait averti que les médecins doivent informer les patients que le TMF comporte des risques inconnus avant leur utilisation.

L'ICD est la principale cause de diarrhée chez les patients hospitalisés et l'une des infections associées aux soins de santé les plus courantes. La maladie frappe près de 500 000 Américains et est associée à 15 000 à 30 000 décès par an.

Recommandations pour la sélection des donneurs

À la lumière des événements indésirables, la FDA a déclaré hier qu'elle recommandait que les questions de sélection des donneurs traitent spécifiquement « des facteurs de risque de colonisation par des MMRA et de l'exclusion des personnes présentant un risque plus élevé de colonisation par des MMRA ».

L'agence a également déclaré que les analyses de MMRA sur les selles du donneur étaient nécessaires et que les selles ne devaient pas être utilisées pour le TMF si l'analyse était positive. « Les scientifiques de la FDA ont déterminé les essais spécifiques des MMRA et la fréquence à mettre en œuvre », a déclaré l'agence.

NB : On lira aussi ce texte de l'ANSM, La transplantation de microbiote fécal et son encadrement dans les essais cliniques, marrs 2014.