Des bactéries fournissent un traitement prometteur contre E. coli O157

« Des bactéries fournissent un traitement prometteur contre E. coli O157 », source communiqué de l’Université de Glasgow du 4 décembre 2018.

E. coli, microbe notoire associé à une grave intoxication alimentaire et généralement attrapé dans de la viande insuffisamment cuite, est une préoccupation commune pour tous ceux qui cuisinent pendant les périodes de fête.

Bien que la cuisson minutieuse de la viande et le lavage des légumes et des mains après la préparation des aliments puissent prévenir l’infection à E. coli, le traitement des microbes gastriques sévères peut être difficile, car les antibiotiques aggravent la maladie en libérant une toxine puissante dans l’intestin de la personne infectée.

Des scientifiques de l’Université de Glasgow ont découvert un produit fabriqué à partir de bactéries vivant dans le sol, capable de traiter avec succès E. coli O157 - [l’un des] types les plus graves de microbe - sans entraîner d’effets secondaires graves.

La nouvelle étude, publiée dans Infection and Immunity (en accès libre), a révélé qu'aurodox, un composé découvert pour la première fois en 1973, mais jugé peu actif comme véritable antibiotique, était capable de bloquer avec succès les infections à E. coli O157.

L’Ecosse est l’un de pays où l’incidence de E. coli O157 est la plus élevée au monde et près de la moitié des cas à O157 en Écosse concernent des enfants de moins de 16 ans.

Images en microscopie d'un essai d'infection cellulaire par EHEC.

Le composé aurodox  a été capable de réduire la capacité de E. coli O157 à se lier à des cellules humaines et, contrairement aux antibiotiques traditionnels, ne provoquait pas la libération de toxines puissantes. Les chercheurs estiment que ce composé pourrait être utilisé comme traitement futur prometteur des infections à E. coli O157.

Le professeur Andrew Roe, professeur de microbiologie moléculaire et auteur principal de l'article, a déclaré : « E. coli O157 est une bactérie potentiellement mortelle dont le traitement aux antibiotiques n’est actuellement pas recommandé. Nous avons été ravis de constater qu'aurodox était capable de prévenir une liaison entre E. coli et des cellules humaines et d'agir efficacement en tant que puissant composé bloquant la maladie. »

« Nos résultats sont encourageants et suggèrent que ce composé pourrait être utilisé comme traitement anti-virulence prometteur pour le traitement de ces infections. »

E. coli O157 provoque de la diarrhée, des crampes d'estomac et parfois de la fièvre. Les symptômes peuvent durer jusqu'à 14 jours, mais la bactérie peut rester présente plus longtemps. Certaines personnes infectées ne présentent aucun symptôme, tandis que d'autres développent des complications très graves, parfois mortelles. Les jeunes enfants courent un risque plus élevé d'infection à E. coli et, à l'instar des adultes plus âgés, ils présentent un risque plus élevé de complications graves.

L’article ‘Characterisation of the mode of action of Aurodox, a Type III Secretion System inhibitor from Streptomyces goldiniensis’ a été publié dans Infection and Immunity. L’étude a été financée par le Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) et a été réalisé en collaboration avec l’Université de Strathclyde.

D’après un article paru dans Food Safety News à ce sujet,

Les chercheurs ont caractérisé l'effet de l'aurodox sur le système de sécrétion de type III (T3SS) chez E. coli entérohémorragique (EHEC) O157:H7, E. coli entéropathogène (EPEC) O127:H6 et Citrobacter rodentium démontrant que les effets sont indépendants de la croissance.

Les T3SS jouent un rôle central dans la pathogenèse de nombreuses espèces bactériennes. L'équipe a découvert qu'aurodox entraînait une inhibition du T3SS dépendante de la concentration chez les EPEC, EHEC et C. rodentium et qu'aux concentrations utilisées (5 µg/ml au maximum), il n'y avait aucun effet sur le taux de croissance bactérienne ou la viabilité chez l'espèce testée.

Les chercheurs ont suggéré un modèle dans lequel aurodox agit en amont de Ler et non directement sur le T3SS lui-même. Le T3SS de EHEC et EPEC est codé par un îlot de virulence nommé Locus of enterocyte effacement (LEE). Cet îlot de pathogénicité est réglementé par le régulateur principal, Ler, (LEE encoded regulator).

La conception de capteurs à base de graphène pourrait améliorer la sécurité des aliments

« La conception de capteurs à base de graphène pourrait améliorer la sécurité des aliments », source article de Julie Larson Bricher du 3 janvier paru dans Meatingplace.

Un nouveau modèle de capteur pourrait un jour faciliter la détection d'agents pathogènes d'origine alimentaire tels que Salmonella et Listeria dans les aliments avant que les produits ne se retrouvent dans les rayons des supermarchés, affirment des chercheurs.

Dans la revue Optical Materials Express, publiée par l’Optical Society of America, des chercheurs ont annoncé un nouveau concept de capteur capable de détecter simultanément plusieurs substances, notamment des bactéries dangereuses et d'autres agents pathogènes. En plus de la sécurité des aliments, la nouvelle conception pourrait améliorer la détection de gaz et de produits chimiques pour un large éventail d'autres applications.

Crédit National Physical Laboratory

« Notre conception est basée sur des feuilles de graphène, qui sont des cristaux de carbone bidimensionnels d'un atome d'épaisseur », a déclaré Bing-Gang Xiao, membre de l'équipe de recherche, de l'Université de Chine Jiliang dans un communiqué de presse publié par l’Optical Society. « Le capteur est non seulement très sensible, mais peut également être réglé facilement pour détecter différentes substances. »

Selon les chercheurs, les excellentes propriétés optiques et électroniques du graphène le rendent attractif pour les capteurs utilisant des ondes électromagnétiques connues sous le nom de plasmons, qui se propagent à la surface d'un matériau conducteur en réponse à l'exposition à la lumière. Une substance peut être détectée en mesurant l'évolution de l'indice de réfraction du capteur lorsqu'une substance d'intérêt est proche de la surface du graphène.

Pour le nouveau capteur, les chercheurs ont utilisé des calculs théoriques et des simulations pour concevoir un ensemble de disques de graphène nanométriques contenant chacun un trou excentré. L'interaction entre les disques et leurs trous crée ce que l'on appelle l'effet d'hybridation de plasmons, ce qui augmente la sensibilité de l'appareil. Le trou et le disque créent également différents pics de longueur d'onde pouvant être utilisés pour détecter simultanément la présence de différentes substances.

Les chercheurs s’emploient actuellement à améliorer le processus qui serait utilisé pour créer un réseau de disques nanométriques. La précision à laquelle ces structures sont fabriquées aura un impact important sur les performances du capteur.

« Nous souhaitons également déterminer si l’effet d’hybridation plasmon du graphène pourrait être utilisé pour faciliter la conception de dispositifs de communication optiques à double bande en infrarouge moyen », a déclaré Xiao.

NB : L’article est disponible intégralement et gratuitement ici.

Campylobactériose : Rapport annuel épidémiologique 2016 en Europe

Après Listeria, voici que l’ECDC publie le 14 décembre Campylobactériose, Rapport annuel épidémiologique 2016 en Europe.

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La campylobactériose est une maladie gastro-intestinale très répandue dans l'UE/EEE. En 2016, 29 pays de l'UE/EEE ont signalé 248 752 cas confirmés de campylobactériose.

Faits marquants

• La campylobactériose est une maladie gastro-intestinale très répandue dans l'UE/EEE.

• En 2016, 29 pays de l'UE / EEE ont signalé 248 752 cas confirmés de campylobactériose.

• Le taux de notification global UE/EEE était de 66,0 cas pour 100 000 habitants en 2016.

• La campylobactériose humaine était plus fréquente chez les enfants de moins de cinq ans que chez les autres groupes d’âge.

• La campylobactériose montre une saisonnalité claire, avec un pic de cas en été et un plus petit pic en janvier.

En 2016, 29 pays de l'UE/EEE ont signalé 248 752 cas confirmés de campylobactériose. De 2012 à 2016, l'Allemagne, la République Tchèque et le Royaume-Uni ont signalé le plus grand nombre de cas par an. En 2016, la République Tchèque, l'Allemagne, l'Espagne et le Royaume-Uni représentaient 69,8% de tous les cas confirmés. Le taux de notification global UE/EEE de 66,0 cas pour 100 000 habitants (de 2,0 à 228,2) était similaire à celui des années précédentes, avec une augmentation de 5,3% par rapport à 2015. Le taux de notification en Allemagne a augmenté de 15% sur la période 2012-2016, tandis que le taux de notification au Royaume-Uni a diminué de 21% par rapport à 2012-2016. Les pays avec les taux de notification les plus élevés étaient la République Tchèque, la Slovaquie et la Suède. Les taux les plus bas ont été signalés en Bulgarie, à Chypre, en Lettonie, en Pologne, au Portugal et en Roumanie. Par rapport à 2015, les taux de notification ont augmenté dans 20 pays et une diminution a été rapportée dans sept pays. Les résultats ont été rapportés pour 75,9% des cas de campylobactériose confirmés. Soixante-deux décès attribués à la campylobactériose ont été signalés en 2016, ce qui était à un niveau similaire aux 60 décès signalés en 2015. Des décès signalés parmi les cas confirmés, 76,4% ont été observés dans le groupe d'âge de 65 ans et plus.

Les cas humains de campylobactériose déclarée ont suivi une saisonnalité claire correspondant aux années précédentes, la plupart des cas signalés de juin à août. Des pics de janvier ont également été observés au cours de la période

2012-2016. La tendance n'a montré aucune augmentation, ni diminution statistiquement significative de 2012 à 2016.

En 2016, les enfants de moins de cinq ans représentaient 13,4% des 248 382 cas confirmés dont l'âge était connu. Le taux de notification était de 144,4 cas sur 100 000 dans ce groupe d’âge (selon les pays, cela variait de 12,7 à 1 091,3). Des taux plus élevés chez les hommes que chez les femmes ont été observés dans cinq des six groupes d'âge. Le ratio global hommes/femmes était de 1,2 sur 1.

Depuis 2005, Campylobacter est l'agent pathogène bactérien gastro-intestinal le plus souvent rapporté chez l'homme en Europe, jusqu'en 2016 compris. Bien que la campylobactériose humaine ait nettement augmenté entre 2008 et 2016, au cours des cinq dernières années (2012-2016), la tendance UE/EEE est restée stable, sans augmentation ni diminution statistiquement significative. La répartition géographique est restée conforme aux années précédentes, la majorité des cas ayant été signalés par l'Allemagne, l'Espagne, le Royaume-Uni et la République Tchèque.

Malgré une surveillance complète et une couverture nationale dans 25 pays, les cas signalés ne représentent qu'une faible proportion des infections à Campylobacter survenues dans l'UE/EEE. En Belgique, de plus en plus de laboratoires ont commencé à rapporter la campylobactériose depuis 2015 et le nombre de cas notifiés a augmenté. En République Tchèque, le dépistage et la détection de la campylobactériose se sont améliorés depuis 2013 et le nombre de cas confirmés a également augmenté. En Espagne, la couverture du système de surveillance de la campylobactériose s'est améliorée et le nombre de cas confirmés signalés a considérablement augmenté depuis 2012. En Suède, une épidémie à Campylobacter en 2016 a impliqué plus de 3 000 cas domestiques infectés par Campylobacter après avoir consommé de la viande de volaille contaminée. Cela a permis de presque doubler le nombre de cas humains nationaux en Suède par rapport aux années précédentes.

Dans la majorité des pays de l'UE/EEE, les enfants de moins de cinq ans sont les plus touchés par la campylobactériose, avec un taux de notification global de 144,4 cas pour 100 000 habitants en 2016.

Campylobacter a une saisonnalité caractéristique, avec une forte augmentation du nombre de cas en été et au début de l'automne. Un pic hivernal plus petit mais distinct est apparu ces dernières années, y compris en 2016. Dans la plupart des pays, la viande de volaille est une source majeure de campylobactériose d'origine alimentaire. La colonisation des troupeaux de poulets de chair par Campylobacter montre une saisonnalité évidente, en particulier dans les pays d'Europe du Nord, avec un risque accru en été. En Suède, des pics hivernaux moins importants ont été associés à la fréquence accrue de Campylobacter chez les poulets domestiques. Le réservoir des volailles dans son ensemble, y compris la transmission environnementale, le contact direct avec les animaux, la consommation et la préparation de la viande de volaille, représenteraient jusqu'à 80% des cas. Les autres sources identifiées sont l’eau potable qui n’a pas été désinfectée, les oiseaux sauvages, les animaux domestiques et l’environnement. Plusieurs études ont utilisé des méthodes de typage basées sur le MVLA et le génome entier pour attribuer les sources d'infections humaines à Campylobacter. Par exemple, en France, le poulet était une source importante et les ruminants, l'environnement et les animaux domestiques étaient des sources supplémentaires.

La manipulation, la préparation et la consommation de viande de poulet de chair représenteraient 20 à 30% de tous les cas humains.

Une bonne hygiène en cuisine est nécessaire pour éviter la contamination croisée.

L'élimination de Campylobacter dans la production de volaille est difficile, car elle nécessite la combinaison de différentes stratégies dans la chaîne alimentaire pour réduire le risque d'infection chez l'homme.

La résistance antimicrobienne de Campylobacter chez l'homme aux antibiotiques utilisés pour le traitement d'infections humaines serait très élevée, en particulier en ce qui concerne la ciprofloxacine et les tétracyclines.

Rappelons qu’en France, selon l’étude de l’InVS paru en janvier 2018, Estimation de la morbidité et de la mortalité liées aux infections d’origine alimentaire en France métropolitaine, 2008-2013,

Les infections à Campylobacter spp. se classent au 2^e rang en nombre de cas (392 177 cas, 26% du nombre total), en première position en nombre d’hospitalisations (5 524 hospitalisations, 31% du nombre total) et en 3^e position en nombre de décès (41 cas décédés, 16% du nombre total).