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samedi 29 avril 2023

Danemark : Données sur des épidémies à Salmonella et 2022 a été une «année Listeria»

Le Statens Serum Institut du Danemark publie dans son bulletin 1/2 de 2023 des informations sur les épidémies de maladies infectieuses (EPI-News) parmi lesquelles figurent les maladies infectieuses d’origine alimentaire comprenant une épidémie à Listeria due à de la charcuterie et à Salmonella dans du chocolat.

L'année 2022 s'est avérée être une «année Listeria», car une augmentation a été enregistrée, passant de 43 à 61 cas de listériose invasive au cours des cinq dernières années à plus de 80 cas en 2022.

De plus, le printemps a provoqué deux épidémies d'origine alimentaire à Listeria monocytogenes. La source de l'infection de l'un des foyers de cas à Listeria a été identifiée comme de la viande assaisonnée roulée produite dans une usine danoise en Allemagne. Le produit a été retiré du marché. En automne, un deuxième foyer à Listeria a été résolu et un grand nombre de boulettes de poisson produits au Danemark ont été retirés du marché.

Une grande épidémie internationale à Salmonella Typhimurium monophasique s'est produite au premier semestre 2022. La source de l'infection était le chocolat d'une usine de production belge.
L'épidémie a déclenché un retrait majeur de l'UE peu avant Pâques, comprenant également le Danemark. Le Danemark a enregistré un total de quatre personnes faisant partie de cette épidémie. L'utilisation étendue de nouvelles méthodes de biologie moléculaire telles que le séquençage du génome entier pour l'identification d'agents pathogènes identiques chez l'homme et les aliments, associée à des études épidémiologiques classiques, a renforcé la surveillance et la résolution des épidémies d'origine alimentaire à l'échelle nationale et internationale. Il est important de prélever des échantillons pour analyse auprès de personnes suspectées de maladies d'origine alimentaire, même s'il n'y a pas d'indication de traitement pour le patient en question. La collecte d'échantillons peut aider à résoudre et à freiner les épidémies.

Par ailleurs, entre le 31 mars et le 28 septembre 2022, 24 cas de Salmonella Enteritidis ont été enregistrés au Statens Serum Institut . Le Statens Serum Institut, la Danish Veterinary and Food Administration et le Norwegian Food Institute DTU ont enquêté sur le foyer de la maladie, mais la source de l'infection est restée inconnue.

«Une épidémie à Salmonella rend 16 personnes malades et un décès au Danemark en 2023», source Food Safety News.
Les autorités danoises recherchent la source d'une épidémie à Salmonella qui a touché 16 personnes malades avec un décès enregistré.
En mars et avril 2023, 16 cas à Salmonella Muenchen ont été enregistrés.
Huit hommes et huit femmes sont malades. Les patients sont âgés de 10 à 95 ans avec une moyenne de 73 ans. Une personne est décédée et sept ont été hospitalisées.
Les personnes malades vivent dans tout le pays avec huit cas à Hovedstaden, quatre à Sjælland, trois à Midtjylland et un à Syddanmark.

Le Statens Serum Institut (SSI), la Danish Veterinary and Food Administration (Fødevarestyrelsen) et le DTU Food Institute enquêtent sur l'épidémie.

Le SSI continue de séquencer le génome entier des isolats des patients et de les interroger, eux ou leurs proches, pour tenter d'identifier une source possible de l'infection.
Le séquençage du génome entier de bactéries isolées chez des patients a révélé qu'elles étaient très étroitement liées, ce qui suggère qu'il existe une source commune d'infection.
Salmonella Muenchen est un type rare au Danemark avec généralement seulement environ deux à huit cas par an.

vendredi 18 mars 2022

A propos de deux épidémies au Danemark, l'une à STEC et l'autre à EIEC

A la même date, les autorités sanitaires danoises publient deux communiqués à propos de E. coli dans deux épidémies distinctes ...

1. «Eclosion à E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) O157:H7 au Danemark», source dernière modification le 18 mars 2022 du Statens Serum Institut.

De décembre 2021 à janvier 2022, 14 personnes ont été identifiées comme faisant partie d'une éclosion avec un type spécifique de bactérie E. coli producteurs de shigatoxines (STEC), dont 3 enfants qui ont développé une insuffisance rénale aiguë, également appelée syndrome hémolytique et urémique (SHU). L'épidémie s'est arrêtée et il n'a pas été possible de déterminer la source de l'infection.

L'épidémie a été étudiée par SSI en collaboration avec l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise et l'Institut alimentaire DTU pour déterminer si les patients avaient une source commune d'infection. Entre autres, des entretiens ont été menés avec des patients ou des parents de patients pour obtenir des informations sur les apports alimentaires pertinents, les contacts avec les animaux et autres expositions, ainsi que pour obtenir des données sur les achats.

Les entretiens avec les personnes concernées ont montré qu'elles n'avaient pas voyagé pendant la période précédant leur maladie, qu'elles ne se connaissaient pas et qu'elles n'avaient pas participé à des événements communs. Cela suggère que c'est un aliment courant qui a été vendu dans tout le pays qui est la source de l'infection. Cependant, il n'a pas été possible d'identifier de quel aliment il s'agissait.

Au sujet de la socuche bactérienne, la souche épidémique a le sérotype O157: H7 et possède le gène eae et code pour les sous-types stx1a et stx2a de la toxine shiga. stx2a est le type le plus courant associé au SHU. Dans le séquençage du génome entier, il a été constaté que les isolats de 10 patients sont étroitement liés et sont deséquence type 11.

2. «Eclosion à Escherichia coli entéro-invasif au Danemark», source dernière modification le 18 mars 2022 du Statens Serum Institut.

Du 23 novembre au 4 février 2022, 88 personnes infectées par Escherichia coli entéro-invasif (EIEC) ont été enregistrées au Statens Serum Institut. L'enquête montre que la source d'infection était des oignons nouveaux émincés dans des salades de chou prêtes à consommer.

Entre le 23 novembre et le 4 février 2022, 88 personnes infectées par EIEC, positif pour le gène ipaH, ont été enregistrées au Statens Serum Institut. Les données sont basées sur des examens de laboratoire et la soumission d'isolats par les services de microbiologie clinique danois. EIEC est une bactérie intestinale que nous associons généralement à la diarrhée des voyageurs, mais dans ce cas, les patients n'ont pas voyagé. Les malades vivent dans tout le pays (à l'exception du Jutland du Nord) et il y a 58 femmes et 30 hommes âgés de 0 à 91 ans. L'âge médian est de 52 ans. Tous les patients étaient tombés malades en novembre et en décembre. Trois décès liés à cette épidémie ont été enregistrés ainsi que 27 admissions à l’hôpital (31%).

Source de l'infection
En collaboration avec l'administration vétérinaire et alimentaire danoise et le DTU Food Institute, le Statens Serum Institut a découvert que la source de l'infection était des oignons nouveaux tranchés, qui sont inclus comme ingrédient commun dans diverses salades de chou prêtes à consommer vendues par exemple dans des magasins REMA1000, COOP et MENU en novembre 2021.

Souche épidémique
EIEC a été isolé chez 34 patients et les 54 patients restants étaient PCR positifs pour le gène ipaH (marqueur diagnostique pour toutes les espèces de Shigella et de EIEC). Le sérotypage de EIEC a identifié deux types de cette épidémie, O136:H7 et O96:H19. L'accumulation a ensuite été génétiquement confirmée par le séquençage du génome entier, où deux types d'épidémies ont été détectés.

CommenatireOn ne manquera pas de (re)lire cet article publié sur le blog, Comment E. coli est devenu célèbre ?
Merci à Joe Whiworth de m'avoir communiqué ces informations.

Aux lecteurs du blog
Je suis en conflit depuis plusieurs années avec la revue PROCESS Alimentaire pour une triste question d’argent qui permettrait de récupérer et de diffuser correctement les 10 052 articles initialement publiés gracieusement par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue, alors qu’elle a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles. Le départ du blog de la revue a été strictement motivé par un manque de réactivité dans la maintenance du blog, la visibilité de celui-ci devenant quasi nulle. J’accuse la direction de la revue de fuir ses responsabilités et le but de ce message est de leur dire toute ma colère. Elle ne veut pas céder, moi non plus, et je lui offre ainsi une publicité gratuite.