A propos de deux épidémies au Danemark, l'une à STEC et l'autre à EIEC

A la même date, les autorités sanitaires danoises publient deux communiqués à propos de E. coli dans deux épidémies distinctes ...

1. «Eclosion à E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) O157:H7 au Danemark», source dernière modification le 18 mars 2022 du Statens Serum Institut.

De décembre 2021 à janvier 2022, 14 personnes ont été identifiées comme faisant partie d'une éclosion avec un type spécifique de bactérie E. coli producteurs de shigatoxines (STEC), dont 3 enfants qui ont développé une insuffisance rénale aiguë, également appelée syndrome hémolytique et urémique (SHU). L'épidémie s'est arrêtée et il n'a pas été possible de déterminer la source de l'infection.

L'épidémie a été étudiée par SSI en collaboration avec l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise et l'Institut alimentaire DTU pour déterminer si les patients avaient une source commune d'infection. Entre autres, des entretiens ont été menés avec des patients ou des parents de patients pour obtenir des informations sur les apports alimentaires pertinents, les contacts avec les animaux et autres expositions, ainsi que pour obtenir des données sur les achats.

Les entretiens avec les personnes concernées ont montré qu'elles n'avaient pas voyagé pendant la période précédant leur maladie, qu'elles ne se connaissaient pas et qu'elles n'avaient pas participé à des événements communs. Cela suggère que c'est un aliment courant qui a été vendu dans tout le pays qui est la source de l'infection. Cependant, il n'a pas été possible d'identifier de quel aliment il s'agissait.

Au sujet de la socuche bactérienne, la souche épidémique a le sérotype O157: H7 et possède le gène eae et code pour les sous-types stx1a et stx2a de la toxine shiga. stx2a est le type le plus courant associé au SHU. Dans le séquençage du génome entier, il a été constaté que les isolats de 10 patients sont étroitement liés et sont deséquence type 11.

2. «Eclosion à Escherichia coli entéro-invasif au Danemark», source dernière modification le 18 mars 2022 du Statens Serum Institut.

Du 23 novembre au 4 février 2022, 88 personnes infectées par Escherichia coli entéro-invasif (EIEC) ont été enregistrées au Statens Serum Institut. L'enquête montre que la source d'infection était des oignons nouveaux émincés dans des salades de chou prêtes à consommer.

Entre le 23 novembre et le 4 février 2022, 88 personnes infectées par EIEC, positif pour le gène ipaH, ont été enregistrées au Statens Serum Institut. Les données sont basées sur des examens de laboratoire et la soumission d'isolats par les services de microbiologie clinique danois. EIEC est une bactérie intestinale que nous associons généralement à la diarrhée des voyageurs, mais dans ce cas, les patients n'ont pas voyagé. Les malades vivent dans tout le pays (à l'exception du Jutland du Nord) et il y a 58 femmes et 30 hommes âgés de 0 à 91 ans. L'âge médian est de 52 ans. Tous les patients étaient tombés malades en novembre et en décembre. Trois décès liés à cette épidémie ont été enregistrés ainsi que 27 admissions à l’hôpital (31%).

Source de l'infection

En collaboration avec l'administration vétérinaire et alimentaire danoise et le DTU Food Institute, le Statens Serum Institut a découvert que la source de l'infection était des oignons nouveaux tranchés, qui sont inclus comme ingrédient commun dans diverses salades de chou prêtes à consommer vendues par exemple dans des magasins REMA1000, COOP et MENU en novembre 2021.

Souche épidémique

EIEC a été isolé chez 34 patients et les 54 patients restants étaient PCR positifs pour le gène ipaH (marqueur diagnostique pour toutes les espèces de Shigella et de EIEC). Le sérotypage de EIEC a identifié deux types de cette épidémie, O136:H7 et O96:H19. L'accumulation a ensuite été génétiquement confirmée par le séquençage du génome entier, où deux types d'épidémies ont été détectés.

Commenatire. On ne manquera pas de (re)lire cet article publié sur le blog, Comment E. coli est devenu célèbre ?

Merci à Joe Whiworth de m'avoir communiqué ces informations.

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