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vendredi 18 mars 2022

A propos de deux épidémies au Danemark, l'une à STEC et l'autre à EIEC

A la même date, les autorités sanitaires danoises publient deux communiqués à propos de E. coli dans deux épidémies distinctes ...

1. «Eclosion à E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) O157:H7 au Danemark», source dernière modification le 18 mars 2022 du Statens Serum Institut.

De décembre 2021 à janvier 2022, 14 personnes ont été identifiées comme faisant partie d'une éclosion avec un type spécifique de bactérie E. coli producteurs de shigatoxines (STEC), dont 3 enfants qui ont développé une insuffisance rénale aiguë, également appelée syndrome hémolytique et urémique (SHU). L'épidémie s'est arrêtée et il n'a pas été possible de déterminer la source de l'infection.

L'épidémie a été étudiée par SSI en collaboration avec l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise et l'Institut alimentaire DTU pour déterminer si les patients avaient une source commune d'infection. Entre autres, des entretiens ont été menés avec des patients ou des parents de patients pour obtenir des informations sur les apports alimentaires pertinents, les contacts avec les animaux et autres expositions, ainsi que pour obtenir des données sur les achats.

Les entretiens avec les personnes concernées ont montré qu'elles n'avaient pas voyagé pendant la période précédant leur maladie, qu'elles ne se connaissaient pas et qu'elles n'avaient pas participé à des événements communs. Cela suggère que c'est un aliment courant qui a été vendu dans tout le pays qui est la source de l'infection. Cependant, il n'a pas été possible d'identifier de quel aliment il s'agissait.

Au sujet de la socuche bactérienne, la souche épidémique a le sérotype O157: H7 et possède le gène eae et code pour les sous-types stx1a et stx2a de la toxine shiga. stx2a est le type le plus courant associé au SHU. Dans le séquençage du génome entier, il a été constaté que les isolats de 10 patients sont étroitement liés et sont deséquence type 11.

2. «Eclosion à Escherichia coli entéro-invasif au Danemark», source dernière modification le 18 mars 2022 du Statens Serum Institut.

Du 23 novembre au 4 février 2022, 88 personnes infectées par Escherichia coli entéro-invasif (EIEC) ont été enregistrées au Statens Serum Institut. L'enquête montre que la source d'infection était des oignons nouveaux émincés dans des salades de chou prêtes à consommer.

Entre le 23 novembre et le 4 février 2022, 88 personnes infectées par EIEC, positif pour le gène ipaH, ont été enregistrées au Statens Serum Institut. Les données sont basées sur des examens de laboratoire et la soumission d'isolats par les services de microbiologie clinique danois. EIEC est une bactérie intestinale que nous associons généralement à la diarrhée des voyageurs, mais dans ce cas, les patients n'ont pas voyagé. Les malades vivent dans tout le pays (à l'exception du Jutland du Nord) et il y a 58 femmes et 30 hommes âgés de 0 à 91 ans. L'âge médian est de 52 ans. Tous les patients étaient tombés malades en novembre et en décembre. Trois décès liés à cette épidémie ont été enregistrés ainsi que 27 admissions à l’hôpital (31%).

Source de l'infection
En collaboration avec l'administration vétérinaire et alimentaire danoise et le DTU Food Institute, le Statens Serum Institut a découvert que la source de l'infection était des oignons nouveaux tranchés, qui sont inclus comme ingrédient commun dans diverses salades de chou prêtes à consommer vendues par exemple dans des magasins REMA1000, COOP et MENU en novembre 2021.

Souche épidémique
EIEC a été isolé chez 34 patients et les 54 patients restants étaient PCR positifs pour le gène ipaH (marqueur diagnostique pour toutes les espèces de Shigella et de EIEC). Le sérotypage de EIEC a identifié deux types de cette épidémie, O136:H7 et O96:H19. L'accumulation a ensuite été génétiquement confirmée par le séquençage du génome entier, où deux types d'épidémies ont été détectés.

CommenatireOn ne manquera pas de (re)lire cet article publié sur le blog, Comment E. coli est devenu célèbre ?
Merci à Joe Whiworth de m'avoir communiqué ces informations.

Aux lecteurs du blog
Je suis en conflit depuis plusieurs années avec la revue PROCESS Alimentaire pour une triste question d’argent qui permettrait de récupérer et de diffuser correctement les 10 052 articles initialement publiés gracieusement par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue, alors qu’elle a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles. Le départ du blog de la revue a été strictement motivé par un manque de réactivité dans la maintenance du blog, la visibilité de celui-ci devenant quasi nulle. J’accuse la direction de la revue de fuir ses responsabilités et le but de ce message est de leur dire toute ma colère. Elle ne veut pas céder, moi non plus, et je lui offre ainsi une publicité gratuite.

mercredi 2 mars 2022

Danemark: Trois personnes décédées dans une épidémie à E. coli. des dizaines d'autres personnes sont infectées

«Danemark: Trois personnes décédées dans une épidémie à E. coli. des dizaines d'autres personnes sont infectées», source article de Joe Whitworth paru le 2 mars 2022 dans Food Safety News.

Les autorités danoises ont révélé que trois personnes sont mortes dans une épidémie d'E. coli l'année dernière. Les oignons de printemps importés ont été étudiés comme source.

Une mise à jour du Statens Serum Institut (SSI) du 10 janvier 2022 a révélé que du 23 novembre au 31 décembre 2021, 85 personnes ont été infectées par EIEC.
E. coli entéro-invasif (EIEC pour Enteroinvasive E. coli) est généralement associé à la diarrhée de voyage, mais les patients n'étaient pas allés à l'étranger.

Il a déjà été rapporté que 68 personnes étaient malades dans l'épidémie liée à des oignons de printemps (ou oignons nouveaux) d'Égypte via un fournisseur néerlandais qui étaient utilisés dans des salades prêtes à consommer.

Lien vers les oignons nouveaux
Les malades vivaient dans tout le pays, à l'exception de Nordjylland. Ils comprenaient 56 femmes et 29 hommes âgés de moins de 1 an à 91 ans. L'âge médian était de 52 ans. Trois décès étaient liés à l'épidémie et 25 personnes ont été hospitalisées.

Sjælland avait le plus de patients avec 29, Hovedstaden en avait 23, Midtjylland en avait 21 et 12 venaient du Syddanmark.

Le Statens Serum Institut, la Danish Veterinary and Food Administration (Fødevarestyrelsen) et le DTU Food Institute ont découvert que la source d'infection était des oignons nouveaux dans des salades vendues dans trois chaînes de vente au détail différentes en novembre 2021.

Des entretiens avec des patients ont révélé que plusieurs d'entre eux avaient mangé des salades et les données d'achat ont montré qu'ils avaient été achetés du 15 au 30 novembre 2021.

E. coli entéro-invasif a été isolé chez 36 patients et les 47 autres étaient positifs par PCR pour un gène spécifique à l'espèce Shigella et EIEC.

Une analyse plus poussée a identifié deux types de E. coli dans l'épidémie: O136:H7 et O96:H19 avec confirmation par séquençage du génome entier.

Mise à jour sur une épidémie à E. coli O157
Pendant ce temps, une épidémie à E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) O157 dans le pays semble être terminée, selon les responsables de la santé publique.

L'épidémie avait commencé en décembre 2021 et comprenait 14 patients avec une source commune probable d'infection, a déclaré le Statens Serum Institut.

Dix personnes ont été hospitalisées et un patient âgé est décédé. Trois enfants ont également développé un syndrome hémolytique et urémique (SHU), une complication potentiellement mortelle de l'infection à E. coli.

Quatre hommes et 10 femmes âgés de 2 à 90 ans avec un âge médian de 45 ans ont été touchés.

Le Statens Serum Institut, l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise et les responsables de l'Institut alimentaire DTU n'ont pas été en mesure de trouver une source d'infection.

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jeudi 23 décembre 2021

Le Danemark à la recherche de la source d'une nouvelle épidémie à E. coli

Je vous souhaite un très bon et très joyeux Noël, de belles fêtes de fin d’année

«Le Danemark à la recherche de la source d'une nouvelle épidémie à E. coli», source article de Joe Whitworth paru le 23 décembre 2021 dans Food Safety News.

Le Danemark enquête sur une augmentation du nombre de cas enregistrés d'un type de E. coli signalés le mois dernier.

E. coli entéroinvasif (EIEC) est généralement associé à de la diarrhée des voyages, mais les patients de l'épidémie actuelle n'ont pas été à l'étranger, ce qui suggère qu'un aliment commun peut avoir rendu les gens malades, selon le Statens Serum Institut(SSI).

Entre le 23 novembre et le 16 décembre, 63 personnes infectées par EIEC ou ipaH-positif (invasion plasmid antigen H codant pour l'invasivité -aa) ont été enregistrées au Statens Serum Institut et 18 d'entre elles ont été hospitalisées.

EIEC a été isolé chez 22 patients et les 41 autres sont positifs par PCR pour le gène de l'antigène plasmidique d'invasion H (ipaH), qui est spécifique de l'espèce Shigella et de EIEC.

Les patients vivent dans tout le pays et 43 femmes et 20 hommes sont malades. Ils sont âgés de 1 à 91 ans avec un âge médian de 53 ans.

Hovedstaden a le plus grand nombre de cas avec 23, Sjælland en a 19, Midtjylland en a 14 et sept vivent à Syddanmark.

Le Statens Serum Institut, l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise (Fødevarestyrelsen) et le DTU Food Institute tentent de trouver la source de l'infection.

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