Eaux usées valorisées: prévention des agents pathogènes bactériens sur les fruits et légumes frais, selon un avis du BfR

« Eaux usées valorisées: prévention des agents pathogènes bactériens sur les fruits et légumes frais », Avis du BfR n°021/2020 du 21 avril 2020.

Du fait du changement climatique affectant l'Allemagne et l'Europe, une augmentation de l'utilisation des eaux usées récupérées pour l'irrigation des plantes est à prévoir, y compris pour les cultures prêtes à consommer. Des exigences appropriées pour cette eau d'irrigation sont donc en cours d'élaboration au niveau de l'UE.

Dans ce contexte, l'Institut fédéral allemand pour l'évaluation des risques (BfR) a travaillé avec l'Institut Julius Kühn (JKI) et l'Institut Max Rubner (MRI) pour analyser les résultats de recherches récentes sur la présence de certains agents pathogènes bactériens dans les eaux usées récupérées ainsi que dans les fruits et les légumes. Les propriétés saines des fruits et légumes signifient que la plupart des gens - et même des individus particulièrement sensibles aux infections d'origine alimentaire - les mangent crus ou seulement après une préparation alimentaire minimale.

Les agents pathogènes bactériens les plus importants qui se trouvent dans les eaux usées et qui pourraient être consommés par l'homme en consommant des fruits ou des légumes sont Salmonella, Escherichia coli producteurs de shigatoxines (STEC) et Listeria monocytogenes. Les STEC sont des souches de E. coli pathogènes, qui peuvent produire une shigatoxine qui affecte l'intestin humain. Lorsque ces bactéries causent des maladies chez l'homme, elles sont également connues sous le nom de E. coli entérohémorragiques (EHEC). Listeria monocytogenes peut entraîner une maladie grave chez la femme enceinte et les personnes dont le système immunitaire est affaibli.

Malgré un taux de détection relativement faible dans les aliments d'origine végétale, des éclosions importantes de maladies d'origine alimentaire se produisent régulièrement en raison de la contamination des fruits et légumes par des agents pathogènes humains. Étant donné que les chaînes d'approvisionnement alimentaire sont souvent très longues et que les aliments frais à base de végétaux se gâtent relativement rapidement, les fruits et légumes sont souvent consommés bien avant que des foyers potentiels ne soient identifiés et que des denrées alimentaires suspectes soient examinées.

Le risque que la population générale contracte une salmonellose ou une infection à STEC à la suite de la consommation de fruits ou légumes prêts à consommer a jusqu'à présent été considéré comme faible en Allemagne. Pour les femmes enceintes et les personnes dont le système immunitaire est affaibli en Allemagne, le risque de souffrir de listériose après avoir consommé des fruits et légumes prêts à consommer continue également d'être considéré comme faible, malgré la gravité de la maladie. Cependant, si les plantes cultivées pour produire des fruits ou des légumes sont irriguées avec des eaux usées récupérées et ensuite consommées crues (en tout ou en partie), ces risques pourraient augmenter.

Pour se protéger contre les infections d'origine alimentaire, il est recommandé aux consommateurs de laver soigneusement les fruits et légumes frais à l'eau potable avant de les consommer, afin de réduire la concentration de microbes présents sur la peau des fruits et des légumes. Le simple fait de laver les fruits et légumes ne peut cependant pas enlever tous les agents pathogènes qui peuvent être présents. Il est donc conseillé aux consommateurs de peler ou de blanchir les légumes qui poussent près du sol pour réduire encore plus le risque d'infection.

Il est conseillé aux femmes enceintes et aux individus dont le système immunitaire est faible (en raison de l'âge avancé, de conditions préexistantes ou de prendre certains types de médicaments) de bien chauffer les germes avant la consommation. Il est également conseillé à ces deux groupes de personnes de ne pas consommer de salades prêtes à consommer  préemballées. Au lieu de cela, les salades doivent être préparées juste avant de manger à partir d'ingrédients frais soigneusement lavés à l'eau potable.

Des profils de risque sont proposés dans cet avis.

Surveillance à l'échelle de la population de la résistance aux antibiotiques chez Escherichia coli par une analyse des prélèvements d’eaux usées municipales et des hôpitaux

« Une étude révèle des taux de résistance aux antibiotiques similaires dans les eaux usées et les prélèvements cliniques », source CIDRAP News.

Une étude publiée dans Eurosurveillance suggère que l'analyse des prélèvements d'eaux usées pourrait être utilisée pour la surveillance de la résistance aux antibiotiques au niveau de la population, complétant les systèmes de surveillance actuels et fournissant des données cliniquement pertinentes pour les pays où la surveillance clinique fait défaut.

Dans le cadre de cette étude, une équipe de chercheurs suédois a collecté les eaux usées hospitalières et municipales respectivement à huit et six reprises, en 2016, puis ils ont analysé 1 252 isolats de Escherichia coli prélevés dans les échantillons afin de déterminer leur résistance à huit antibiotiques différents.

Les taux de résistance annuels moyens mesurés dans les eaux usées des hôpitaux étaient plus élevés que dans les eaux usées municipales pour sept des huit antibiotiques, et une prévalence plus élevée des producteurs de bêta-lactamase à spectre étendu (BLSE) a également été observée dans les eaux usées des hôpitaux.

En outre, les bactéries E. coli présentant une résistance à au moins un des antibiotiques étaient deux fois plus présentes dans les eaux usées de l'hôpital (36,6% contre 17,9%), et 10 des 11 isolats les plus résistants ont été retrouvés dans les eaux usées de l'hôpital.

La comparaison des taux de résistance dans les isolats hospitaliers et municipaux a montré une forte corrélation avec les taux de résistance des isolats cliniques correspondants provenant de patients hospitalisés et d'échantillons d'urine de soins primaires, la corrélation plus forte observée entre le taux de résistance des eaux usées hospitalières et des isolats cliniques hospitaliers ( respectivement, r² = 0,95 et 0,89 pour les échantillons d'urine et de sang,) et une corrélation légèrement plus faible entre les taux de résistance dans les eaux usées municipales et les isolats de soins primaires (r² = 0,82).

Les taux de résistance des isolats d'eaux usées hospitalières étaient globalement proches de ceux observés chez les isolats de patients hospitalisés, tandis que les taux de résistance dans les eaux usées municipales étaient environ la moitié de ceux mesurés dans les isolats de soins primaires.

« En conclusion, cette étude indique que les données de résistance obtenues à partir de prélèvements d’eaux usées reflètent bien la situation de résistance dans les populations étudiées.

« Cependant, pour pouvoir utiliser la surveillance des eaux usées afin de prédire la situation clinique d'autres populations, y compris celles pour lesquelles de telles données sont manquantes, une nouvelle calibration est nécessaire », écrivent les auteurs de l'étude. « Cette calibration pourrait être étendu de E. coli à d'autres agents pathogènes importants pouvant être présents dans les matières fécales (telles que Klebsiella pneumoniae et Salmonella enterica) et éventuellement à l'étude des populations humaines jusqu'à l'élevage d'animaux. »