L’idéal serait peut-être de garder cette eau en surface dans des réservoirs ou des bassines?.. https://t.co/pV2SHOe38Q
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4 minutes d’explications de ce que sont les #bassines par @pascalperri pic.twitter.com/Vxr146J3yg
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Quand il pleut, les plantes ne sont pas seulement arrosées d'eau, mais aussi de microbes. Ces microbes transmis par la pluie ont la possibilité de faire partie de la communauté microbienne aérienne d'une plante, connue sous le nom de phyllosphère. Les microbes de la phyllosphère peuvent protéger les plantes contre les maladies et autres facteurs de stress et comprendre d'où ils viennent peut nous aider à améliorer la santé des plantes.
Alors que la recherche sur le microbiome végétal s'est historiquement concentrée sur le sol et les graines en tant que sources de microbes associés aux plantes, de nouvelles découvertes par des scientifiques de l'Université Virginia Tech suggèrent que la pluie peut également être un réservoir important.
Une étude récemment publiée dans Phytobiomes Journal dirigée par Marco Mechan-Llontop et Boris Vinatzer, «Experimental Evidence Pointing to Rain as a Reservoir of Tomato Phyllosphere Microbiota» a examiné la pluie en tant que réservoir de bactéries de la phyllosphère.
Après avoir trouvé de plus grandes densités de microbes sur les feuilles des plants de tomates exposés à la pluie par rapport à celles cultivées en laboratoire, ils ont entrepris de tester expérimentalement si les microbes transmis par la pluie pouvaient coloniser avec succès la phyllosphère des plants de tomates. «Bien qu'il s'agisse d'une question simple, il est en fait très difficile de répondre car les plantes à l'extérieur sont exposées à de nombreuses bactéries provenant du sol, de la pluie et de l'air», a noté Vinatzer.
De plus, alors que la pluie peut contenir des microbes importants, leurs quantités peuvent être faibles – un millilitre de pluie peut ne contenir que quelques cellules microbiennes. Pour contrôler les autres sources externes de microbes et inoculer les plantes avec des doses mesurables de microbes transmis par la pluie, Vinatzer et ses collègues ont réalisé une expérience en laboratoire avec la pluie qu'ils ont collectée. Ils ont filtré l'eau de pluie pour obtenir de l'eau stérilisée et des membranes contenant le microbiote bactérien. Ces membranes ont été incubées pour obtenir un inoculum hautement concentré de bactéries provenant de la pluie. Ils ont pulvérisé les plantes avec cet inoculum ou avec de l'eau de pluie stérilisée et de l'eau distillée (comme témoins négatifs) et ont incubé les plantes pendant une semaine avant de caractériser leurs communautés bactériennes via des analyses d'ADN.
Leur analyse a montré que l'inoculation des plantes avec les communautés microbiennes de l'eau de pluie augmentait l'abondance de plus de 100 taxons bactériens, indiquant que les microbes sous la pluie peuvent coloniser et se développer avec succès à la surface des plantes. Cela suggère que la pluie est un réservoir potentiellement important pour les bactéries de la phyllosphère. Les auteurs espèrent que cette recherche ouvrira la voie à davantage de recherches sur les origines des micro-organismes et des microbes associés aux plantes qui sont efficacement distribués par la pluie. «Plus nous en savons sur ces bactéries, mieux nous pouvons les utiliser à notre avantage pour améliorer la santé des plantes», explique Vinatzer. Par exemple, des bactéries qui suppriment les agents pathogènes des plantes pourraient être pulvérisées sur les feuilles pour réduire ou prévenir les maladies. Les auteurs prévoient de poursuivre leurs recherches en examinant l'importance de la pluie dans l'assemblage de la phyllosphère et espèrent identifier les bactéries bénéfiques de la pluie.
