jeudi 29 novembre 2018

Il était une fois la Pologne, les œufs et … Salmonella : une épidémie qui continue …


Le feuilleton européen des œufs et des salmonelles se poursuit en Europe depuis quelque temps … quelques articles précédents en témoignent :
« Pas de plan pour des sanctions contre la Pologne alors que l'épidémie de salmonelles liée aux œufs se développe », source article de Joe Whitworth du 28 novembre 2018 paru dans Food Safety News.

La Commission européenne a déclaré qu'aucune mesure contre la Pologne n'était envisagée « pour le moment », une épidémie de salmonellose liée aux œufs continuant de se développer. Près de 1 500 personnes ont été infectées par Salmonella Enteritidis, liée à des œufs polonais lors de l'épidémie qui dure depuis plus de six ans et qui touche 18 pays.
Dans une mise à jour publiée plus tôt ce mois-ci, le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) a averti qu’en raison des retards de notification, de nouvelles infections étaient attendues au cours des derniers mois, soit 1 412 personnes malades dans l’UE à cause de Salmonella présent dans des œufs de Pologne.

Une porte-parole de la Commission européenne a déclaré à Food Safety News que l'UE et ses agences scientifiques vont aider à résoudre l'épidémie dans les États membres en publiant régulièrement des rapports d'évaluation des risques et en offrant des services d'analyse aux pays signalant des cas présumés liés aux troupeaux de poules pondeuses polonaises.

Suite à la détection de l'épidémie en 2016, la Commission européenne a coordonné avec les États membres le retrait et le rappel des articles incriminés impliquant plus de 100 millions d'œufs.

Dans le marché unique de l’UE, les biens sont l’une des choses qui peuvent circuler le plus librement dans une région au sein d’un même pays. La Pologne est devenue membre de l’UE en 2004.

La porte-parole a déclaré que l'interdiction de la vente d'œufs ne mettrait pas nécessairement fin à l'épidémie.

« Ce qui est important, c’est d’identifier la source initiale de l’infection et de l’arrêter afin de résoudre le problème. Par exemple, il est possible que la bactérie ait pénétré plus haut dans la chaîne alimentaire, par exemple dans les écloseries. Les autorités polonaises continuent à enquêter. Dans le même temps et conformément aux règles de l'UE, les troupeaux polonais identifiés comme positifs pour Salmonella enteritidis ou Typhimurium ne peuvent pas mettre d’œufs de consommation sur le marché. »

Selon l'Institut national de la santé publique et l’Institut national d'hygiène en Pologne, le nombre de cas de salmonellose dans le pays est en augmentation. En 2016, une augmentation de 1 373 cas a été enregistrée, la tendance semblant se poursuivre en 2017, avec 410 cas supplémentaires jusqu'à mi-juin par rapport à 2016.

Le formaldéhyde a été interdit comme additif alimentaire en Europe au début de cette année. Il était utilisé pour tuer Salmonella.

La porte-parole de la Commission européenne a déclaré que l'utilisation de formaldéhyde en tant qu'additif pour l'alimentation animale n'était pas autorisée, en raison de préoccupations sanitaires des utilisateurs de la substance. Il a été classé cancérogène par inhalation et mutagène sur cellules germinales.

« Afin de réduire la contamination microbiologique, dont Salmonella, dans les aliments pour animaux, d'autres additifs pour aliments pour animaux peuvent être utilisés comme produits alternatifs, en combinaison avec la mise en œuvre d'exigences d'hygiène pertinentes et de bonnes pratiques tout au long de la chaîne alimentaire. La législation de l'UE en matière d'hygiène des aliments pour animaux vise en effet à contrôler, prévenir et traiter les aliments contaminés par la bactérie Salmonella », a-t-elle déclaré.

Un audit de la Direction générale de la santé et de la sécurité alimentaire (DG SANTE) en Pologne du 6 février 2018 au 15 février 2018 a donné des résultats mitigés.

Extraits du rapport d’audit :

En 2016, le niveau de détection de salmonelles dans les populations de dindes d’engraissement et de poulets de chair était environ 100 fois plus faible dans les échantillons de produits prélevés par l’exploitant du secteur alimentaire que dans les échantillonnages officiels et, pour le premier semestre de 2017, pour les poulets d’élevage, sur 10 cheptels présentant des résultats positifs, 9 n’ont été détectés que lors d’échantillonnages officiels, ce qui est beaucoup moins fréquent que lors d’échantillonnages pratiqués par les exploitants du secteur alimentaire. Le taux beaucoup plus faible de détection d’échantillonnages pratiqués par les exploitants du secteur alimentaire rend cet élément quasiment inefficace pour détecter les salmonelles, ce qui peut expliquer que des foyers se déclarent encore même lorsque les mesures des programmes nationaux de lutte contre les salmonelles sont correctement en place.

Les contrôles officiels respectent (et parfois dépassent) les fréquences préétablies d’inspections
sur place, ainsi que les corrections décelées et effectivement imposées pour les non-conformités aux exigences de la part des exploitants du secteur alimentaire. La vérification de l’exécution des contrôles officiels se fait et a permis de détecter et de faire corriger des lacunes par le biais des contrôles officiels.
En Pologne, les programmes nationaux de lutte contre les salmonelles sont généralement conformes aux exigences de l’UE et bien appliqués et des mesures restrictives correctes ont été imposées et/ou prises par les agriculteurs si nécessaire et sont pour la plupart bien documentées.

Des progrès ont été constatés à la suite de cet audit. « Un autre audit a été effectué en 2018 », a déclaré la porte-parole de la CE.

« La priorité pour la Commission est que les autorités polonaises appliquent correctement les recommandations des deux audits précédents et prennent des mesures correctives pour remédier aux non-conformités identifiées. Sur la base des documents régulièrement transmis par les autorités polonaises, la Commission examinera s'il est nécessaire d'envoyer un nouvel audit en Pologne dans un proche avenir. »

Dans un autre article, « La Pologne a un problème d'œufs » de Doug Powell du barfblog, on apprend que « Selon le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC), 1 412 cas ont été retrouvés associés à ce foyer: 532 cas confirmés et 166 cas probables depuis le 1er février 2017 et 343 cas confirmés historiques et 367 cas probables historiques entre 2012 et le 31 janvier 2017. En outre, aucune date n'a été signalée pour quatre autres cas confirmés de l'épidémie, ils sont donc inclassables en tant que cas actuels ou historiques (voir tableau ci-dessous).

Tableau 1. Répartition des cas selon la classification des cas et le pays, UE/EEE, de février 2012 à novembre 2018 (n = 1 420; 4 cas n’ont pas de données sur la date du début de l’infection ou du prélèvement ou de la réception au laboratoire de référence), au 12 novembre 2018.
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La plupart des cas épidémiques ont été signalés pendant les mois d'été. En raison des retards dans les rapports, de nouveaux cas devraient être signalés au cours des derniers mois.

Au total, 112 cas confirmés ou historiquement confirmés ont été signalés avec des antécédents de voyage dans un pays de l'UE pendant la période d'incubation et ont donc probablement été infectés dans ce pays. Les pays où des infections ont probablement eu lieu sont la Pologne (25 cas identifiés de 2016 à 2018), la Bulgarie (22 cas de 2015 à 2018), Chypre (14 cas en 2016 et 2018), le Portugal (11 cas de 2015 à 2017) et la Hongrie (10 cas de 2016 à 2018). Des cas supplémentaires liés aux voyages ont également été signalés (< 10 cas par pays) avec des antécédents de voyage en Autriche, en Belgique, en Grèce, en Italie, aux Pays-Bas, en Roumanie, en Slovénie et en Espagne.

Les investigations européennes sur les épidémies de 2016 et 2017 ont révélé que les œufs originaires de Pologne étaient le vecteur de l'infection dans cette épidémie (Evaluations rapides de l'ECDC/EFSA publiées en mars et décembre 2017). Les cas confirmés par une éclosion appartiennent à quatre clusters différents par séquençage du génome entier.

Une des conséquences de cette épidémie est selon le rapport de l’ECDC/EFSA sur les zoonoses que « Les cas à salmonelles ne diminuent plus dans l'UE ».
  • La tendance à la baisse des cas de salmonellose dans l'UE s'est stabilisée.
  • Les cas à Salmonella Enteritidis contractés dans l'Union européenne ont augmenté de 3% chez l'homme depuis 2014.
  • Chez les poules pondeuses, la prévalence est passée de 0,7% à 1,21% au cours de la même période.

Nouveau blog, troisième essai ...

Bonjour,

Après avoir tenu très régulièrement un blog hébergé par la revue PROCESS Alimentaire avec 10 052 articles publiés du 8 juillet 2009 au 13 décembre 2017 que l'on peut toujours consulter ici, j'ai été, par la suite, amicalement accueilli par le blog de seppi, "Agriculture, alimentation, santé publique... soyons rationnels", où j'ai publié 127 articles du 13 février 2018 au 26 novembre 2018 que l'on peut consulter ici, voici que j'ai enfin décidé voler de mes propres ailes, après ces deux expériences très fructueuses ... il était temps !

Ce blog qui sera ma troisième expérience dans ce domaine ne changera pas l'idée générale des précédents blogs qui est d’échanger et de faire partager des informations scientifiques et techniques recueillies ici et là en matière d’hygiène et de sécurité des aliments, mais aussi pourquoi pas des informations utiles au quotidien.

Bienvenue sur ce blog et merci de me suivre ...

Albert Amgar

Norovirus inside : recherche sur le nettoyage et épidémiologie


« Des chercheurs de l’Université de Clemson ciblent des méthodes de nettoyage des vomissures dans le cadre d’une nouvelle étude sur norovirus », source Doug Powell du barfblog.

On lira plus le résumé d’une étude qui donne une idée de la contagiosité de ce virus.

Deux chercheurs de l’Universite de Clemson, qui collaborent avec le gouvernement fédéral pour lutter contre les épidémies des microbes intestinaux chez les personnes âgées, sont convaincus que des progrès dans ce domaine pourraient sauver des vies.

Angela Fraser et Xiuping Jiang, professeurs au département food, nutrition and packaging sciences de Clemson vont conduire une étude, « Building the Evidence for Vomit Clean Up in Long-Term Care Facilities. » (Construire des preuves du nettoyage de vomissures dans les établissements de soins de long séjour) Ils vont travailler avec des chercheurs du Center for Disease Control (CDC), de l’Université Emory et de l’Université de Chicago.

« Je pense simplement que ceux d'entre nous qui sommes en bonne santé doivent veiller sur ceux qui sont vulnérables », a déclaré Fraser. « Et c'est une population vulnérable. »
Crédit image du Clemson College of Agriculture, Forestry and Life Sciences.
L’un des principaux objectifs de leur nouveau projet, qui a récemment reçu un financement de plus d’un million de dollars de l’Agence fédérale pour la recherche et la qualité de la santé, est de mettre au point des procédures faciles à mettre en œuvre, rentables et efficaces pour le nettoyage des vomissures sur des surfaces molles. L'espoir est que cela permettra de lutter directement contre le pourcentage élevé d'épidémies à norovirus dans les établissements de soins de long séjour et dans des environnements similaires.

Dans des études antérieures sur le nettoyage correct des vomissures, Fraser et Jiang ont appris qu'il y avait des lacunes dans la recherche, en particulier concernant le désinfectant approprié à utiliser par les services appropriés afin de prévenir la propagation de la maladie.

L'eau de javel, le désinfectant le plus couramment utilisé, est principalement utilisé sur des surfaces dures et pouvait rarement être utilisé sur des surfaces molles comme les tapis et les divans. Les établissements de soins de long séjour constituaient l’un des domaines dans lesquels ils pourraient tirer le meilleur parti de ces informations.

« Les établissements de soins de long séjour veulent créer un environnement très accueillant, ils ont donc beaucoup de tapis ou de moquette en comparaison des hôpitaux et d'autres environnements », a déclaré Jiang.

Bien sûr, ils ont aussi tendance à avoir un nombre élevé d’adultes plus âgés.

« C’est le milieu de vie de ces personnes », a déclaré Fraser. « Voulez-vous vraiment que ces personnes vivent là où il y a juste des parpaings ou des murs lisses? »


Elle a ajouté que les patients âgés étant davantage susceptibles de souffrir de maladies chroniques, car leur système immunitaire est également généralement affaibli. Cela signifie que lorsque ces personnes âgées sont infectées par des maladies telles que norovirus, l'expression de la maladie peut être plus grave que celle d'une personne plus jeune. En raison de tous ces facteurs, certains considèrent que l’étude est encore plus impérative.

Clostridium difficile est une autre bactérie importante dans les établissements de soins de long séjour. Il figure parmi les plus grands problèmes de santé publique de tous les temps. Selon le CDC, près d’un demi-million d’Américains souffrent d’infections à Clostridium difficile par an. Plus de 100 000 de ces infections touchent des résidents de maisons de retraite médicalisées aux États-Unis. Cette infection coûte aux établissements de santé de courte durée jusqu'à 4,8 milliards de dollars par an.
Une étude des CDC a révélé qu'un patient sur cinq présentant une infection à Clostridium difficile associée aux soins de santé avait présenté une nouvelle infection et qu'un patient sur 11 âgé de 65 ans et plus présentant cette infection était décédé dans les 30 jours suivant le diagnostic.

« Notre objectif est de déterminer comment nous pouvons contrôler ces pathogènes », a déclaré Jiang. « Étant donné que de plus en plus de personnes vivent dans des établissements de soins de long séjour et que ces infections se rencontrent le plus souvent dans les établissements de soins de long séjour, nous devons déterminer quels désinfectants sont les plus efficaces pour aider à éliminer ces bactéries, de sorte que les patients ne seront pas malades. Il est important que nous apprenions comment contrôler la propagation de maladies telles que les infections à norovirus et à Clostridium difficile. »

Comme annoncé en début d’article, voici, « Plusieurs modes de transmission lors d'une éclosion à norovirus lors de Thanksgiving 2017 », source Doug Powell du barfblog.

Selon le Center for Disease Control américain, le 28 novembre 2017, le directeur du restaurant A au Tennessee a reçu 18 plaintes de clients atteints de troubles gastro-intestinaux qui avaient dîné là le jour de Thanksgiving, le 23 novembre 2017. Les responsables du Tennessee Department of Health ont confirmé l'épidémie, évalué l’exposition et recommandé des mesures pour prévenir la propagation de la maladie.

Le 23 novembre, un client a vomi dans une salle à manger privée et un employé a immédiatement utilisé un spray désinfectant étiqueté comme efficace contre le norovirus* pour nettoyer les vomissures. Après un lavage des mains, l'employé a servi des assiettes de type familial et coupé une tarte aux noix de pécan. Pour le Thanksgiving Day du 23 novembre, le restaurant A a servi à 676 clients un menu restreint de 11h à 20h. Le responsable a fourni des informations pour contacter les clients, les horaires et les emplacements des places assises à 114 clients ayant une réservation. Tous les clients avec des coordonnées ont été appelés par téléphone. Un questionnaire a été utilisé pour évaluer la maladie et l'exposition des personnes vivant dans leur foyer domestique qui ont mangé au restaurant A le 23 novembre. Des échantillons de selles ont été demandés aux clients malades. Parmi les 676 clients, 137 (20%) ont été inclus dans une étude cas-témoin.

Image en 3D de norovirus, Université de Clemson 
Un cas probable a été défini comme ayant une diarrhée (trois selles molles ou plus en 24 heures) ou des vomissements dans les 72 heures suivant le repas au restaurant A le 23 novembre ; les cas probables avec l'ARN du norovirus détecté dans un échantillon de selles par RT-PCR ont été considérés comme confirmés. Le 30 novembre, des prélèvements de l’environnement pour la recherche de norovirus ont été recueillis au restaurant. Des prélèvements de patients et de l’environnement ont été testés par RT-PCR en temps réel et séquencés au laboratoire de la santé publique de l'Etat du Tennessee.

Trente-six (26%) patients (deux confirmés et 34 probables) et 101 (74%) témoins ont été inclus dans l'étude cas-témoin. La maladie est apparue du 23 au 25 novembre, avec 17 cas sur 49 (49%) survenus le 24 novembre. La période d'incubation moyenne était de 31 heures (intervalle = 2,5 à 54,5 heures) et la durée moyenne de la maladie était de 3 jours (intervalle = 0-6 jours). Un seul patient a eu besoin de soins médicaux. Des cas de diarrhée ont été signalés par 33 cas (94%), de fatigue 29 (83%), de nausées et de crampes abdominales par 28 (80%), de vomissements par 24 (69%) et de fièvre par six (17%).

Parmi les éléments du menu, seule la tarte aux noix de pécan était associée de manière significative à la maladie (odd ratio [OR] = 2,6; intervalle de confiance à 95% [IC] = 1,1-5,8) ; cependant, il n'a été consommé que par 16 (47%) des 34 cas-patients. Des vomissements ont eu lieu vers midi ; les clients assis de 11h à 13h ont été significativement plus susceptibles de tomber malades que les clients assis pendant d'autres périodes (OR = 6,0; IC à 95% = 2,6-15,3). Aucune différence significative entre les lieux de restauration (c.-à-d. salle à manger privée par rapport aux sièges en général) n'a été identifiée (OR = 1,4; IC à 95% = 0,4 à 4,3). La régression logistique a été utilisée pour évaluer les effets de la consommation de tarte aux noix de pécan, du temps assis et de l’emplacement des sièges ; seul le temps assis de 11h à 13h est resté statistiquement significatif (OR = 6,0; IC à 95% = 2,2 à 16,5).

Des échantillons de selles provenant de deux cas-patients identifiés ont identifié le Norovirus GII.P16-GII.4, Sydney. Norovirus GII a été identifié dans un écouvillon environnemental prélevé sous une jambe d’une table adjacente au vomi.

Une épidémie ponctuelle à norovirus s'est produite après qu'un client infecté ait vomi dans un restaurant. La transmission à proximité du vomissement s'est probablement produite par aérosols ou fomites. Norovirus s’est répandu dans tout le restaurant par aérosols, de personne à personne, de fomites, ou par voie alimentaire. Le lavage inadéquat des mains de l’employé a probablement facilité la transmission d'origine alimentaire par le biais de portions de tarte aux pécans.

Dans les hôpitaux, le CDC et le département de la Santé du Tennessee ont recommandé des précautions de contact (gants et blouses, par exemple) lorsque le personnel est en contact avec des vomissures. De même, le Food Code 2017 de la Food and Drug Administration recommande aux restaurants d’avoir un plan écrit détaillant quand et comment les employés doivent utiliser un équipement de protection individuelle pour nettoyer les vomissures. Renforcer la nécessité de bien se laver les mains et de procéder à un nettoyage minutieux en profondeur avec un équipement de protection individuelle approprié dans les établissements de restauration commerciale peut prévenir ou atténuer de futures épidémies.

*Principes actifs : Alkyl Dimethyl Benzyl Ammonium Chloride (ADBAC) et chlorure d'alkyldiméthylbenzylammonium.




Quant aux données des gastro-entérites aiguës en France, le plus souvent à norovirus, selon le réseau Sentinelles, la semaine 45 de 2018 avait une « Activité modérée à forte en médecine générale » et la semaine 46, une « Activité modérée en médecine générale » :

En France métropolitaine, le taux d’incidence des cas de diarrhée aiguë vus en consultation de médecine générale a été estimé à 142 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [126 ; 158]), en dessous du seuil épidémique (162 cas pour 100 000 habitants).Au niveau régional, les taux d’incidence les plus élevés ont été observés en : Hauts-de-France (286 cas pour 100 000 habitants, IC 95% [204 ; 368]), Grand Est (162, IC 95% [107 ; 217]) et Auvergne-Rhône-Alpes (152, IC 95% [102 ; 202]).