Cas groupés à Listeria monocytogenes lié à des produits de la pêche dans cinq pays européens

«Cas groupés à Listeria monocytogenes lié à des produits de la pêche dans cinq pays européens, source EFSA et ECDC du 13 décembre 2023

Des produits de la pêche prêts à consommer, principalement du saumon fumé, sont probablement à l'origine d'un foyer épidémique à Listeria monocytogenes qui frappe actuellement plusieurs pays, affirment les experts de l'EFSA et de l’ECDC dans une évaluation préliminaire rapide de ce foyer.

Entre 2022 et 2023, ce foyer de cas a touché l'Autriche, la Belgique, l'Italie, l'Allemagne et les Pays-Bas, avec des rapports faisant état de 17 cas et de deux décès. Les infections sont survenues principalement chez des personnes âgées. Des cas humains antérieurs liés au foyer épidémique ont été détectés depuis 2011.

Des techniques avancées de typage moléculaire ont permis d'identifier le variant de Listeria monocytogenes détectée dans la majorité des cas recensés entre 2022 et 2023. L’analyse des données suggère un lien avec deux établissements en Lituanie au cours de la même période. Il s'est avéré que ces établissements avaient introduit des produits de la pêche contaminés sur les marchés de détail en Allemagne et en Italie. La production a été arrêtée dans l'une des usines lituaniennes, ce qui a probablement permis de réduire le risque d'infection. Les données relatives à la distribution des produits contaminés en Autriche, en Belgique et aux Pays-Bas ne sont pas disponibles à l'heure actuelle.

Les experts de l'EFSA et de l'ECDC estiment que des investigations supplémentaires sont nécessaires pour identifier l'origine de la contamination. Cela permettra aux autorités nationales de mettre en œuvre des mesures de maîtrise et de réduction ciblées. Les experts recommandent également de respecter les bonnes pratiques de fabrication, d'hygiène et de contrôle de la température tout au long de la chaîne de production, de distribution et de stockage des denrées alimentaires, y compris à la maison. Il est conseillé aux consommateurs de maintenir la température du réfrigérateur à un niveau suffisamment bas pour empêcher la prolifération potentielle de bactéries telles que Listeria, qui pourraient être présentes dans les aliments prêts à consommer.

Selon un article de Joe Whitworth de Food Safety News,

Sur 94 cas confirmés, la Suède a signalé le premier cas en 2011. L'Allemagne en compte le plus avec 45, suivie de la Belgique avec 17 et de l'Italie avec 15. Le Royaume-Uni a enregistré un cas.

Des données sur l'âge et le sexe étaient disponibles pour 76 cas provenant de six pays. La tranche d'âge des patients était de 13 à 93 ans, avec une médiane de 78 ans. Le groupe le plus touché était celui des 75 à 84 ans. Sur 54 cas pour lesquels des informations ont été recueillies, 52 ont été hospitalisés et 17 sont décédés à cause ou à cause d'une infection à Listeria.

Un cluster actif

Sur la base de la similarité génomique, les cas peuvent être divisés en trois sous-groupes. Le sous-groupe 1 compte 64 cas dans cinq pays entre 2016 et 2023, dont 17 en 2022 et 2023. Dix personnes sont décédées, dont cinq en 2020, deux en 2019 et une en 2021, 2022 et 2023. Sous-groupes 2 et 3 sont historiques, avec 30 cas entre 2011 et 2021.

En 2020, l'EFSA et l'ECDC avaient préparé un résumé de notification conjoint, qui n'a pas été rendu public, d'un cluster à Listeria lié à des poissons signalé par l'Allemagne. Alors que des cas continuent d’être enregistrés dans différents pays, les agences publient une évaluation de l’épidémie.

Les enquêtes alimentaires nationales, la traçabilité et les données génomiques ont identifié 34 isolats de Listeria monocytogenes provenant de 12 produits de la pêche et un isolat provenant de l'environnement de transformation au sein du premier sous-groupe.

Persistance de la souche sur plusieurs années

L'analyse du séquençage a révélé la souche épidémique dans deux usines de transformation en Lituanie et leurs produits de poisson prêt à consommer scellés entre 2016 et 2023. Entre 2022 et 2023, les produits contaminés provenant de ces usines ont été vendus au détail en Allemagne et en Italie.

À la mi-septembre 2023, à la suite des conclusions d’une enquête italienne, l’agence lituanienne de sécurité des aliments a dit que le transformateur impliqué, qui s’approvisionnait en poissons en Norvège, avait arrêté sa production. Le saumon fumé à froid a été testé négatif pour Listeria. Un échantillon de l'environnement de transformation provenant d'une surface non en contact avec les aliments s'est révélé positif pour Listeria monocytogenes. Un échantillonnage d'emballages scellés de saumon fumé réfrigéré et collecté au domicile d'un patient en Italie s'est révélé positif pour Listeria monocytogenes à 3 000 000 et 820 000 UFC/g.

Un échantillon de saumon fumé réfrigéré collecté dans un commerce de détail en Allemagne en mai 2023 s'est également révélé positif à la Listeria. Une autre usine en Lituanie l'a fabriqué.

Vendredi 15 décembre 2023, le blog fera paraître le Top 10 de l’année 2023 de la sécurité des aliments en France. Il s’gait d’une mise en perspective de quelques faits saillants, mais aussi avec des absents …

Les cas à Listeria ont atteint un niveau record en Europe en 2022

Le blog vous a proposé un article à propos du rapport 2022 sur les zoonoses au sein de l’UE par l’EFSA-ECDC, Les foyers de toxi-infection alimentaire signalés dans l'UE ont augmenté de 44%, la campylobactériose et la salmonellose restent inférieures aux niveaux d'avant la pandémie.

Il est toujours bon d’avoir un autre éclairage sur ce rapport, et de plus, par certains égards, il est bien plus complet que mon article initial.

Ainsi Joe Whitworth de Food Safety News a publié un article paru le 13 décembre 2023, «Les cas à Listeria ont atteint un niveau record en Europe en 2022».

Les infections à Listeria ont atteint des niveaux records en Europe tandis que les cas à Salmonella et à E. coli ont également augmenté en 2022, selon les derniers chiffres.

Les données proviennent du rapport 2022 One Health Zoonoses de l’Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) et du Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC).

La plupart des décès étaient associés à la listériose avec 286, dont 81 liés à la salmonellose.

Les cas déclarés de campylobactériose, la maladie zoonotique la plus fréquente, sont restés stables en 2022 par rapport à l'année précédente, avec 137 107 cas. Il y a eu plus de 10 500 hospitalisations et 34 décès. La viande de poulet était la source d'infection la plus courante.

Les taux de notification par pays les plus élevés ont été enregistrés au Luxembourg, en République tchèque, en Slovaquie et au Danemark. Les taux les plus faibles ont été enregistrés en Pologne, en Bulgarie, en Roumanie et en Grèce. L'Allemagne a enregistré le plus grand nombre de cas, avec près de 43 500.

Vingt-quatre États membres et l'Irlande du Nord ont soumis des données sur le critère d'hygiène des procédés pour Campylobacter défini dans la réglementation de l'UE. Seize pays et l'Irlande du Nord ont signalé 7 905 résultats de tests issus des contrôles officiels, avec 19,4% qui sont supérieurs à 1 000 UFC/g. Vingt pays ont signalé 58 372 résultats de surveillance des entreprises, dont 17,5% dépassaient 1 000 UFC/g. Une douzaine de pays ont partagé les résultats de leurs prélèvements, montrant que le nombre dépassant la limite était nettement plus élevé dans les échantillons officiels, avec 22,1%, que dans les autocontrôles qui étaient à 9%.

Statistiques sur Salmonella

La salmonellose était la deuxième maladie la plus courante, avec 65 208 cas, contre 60 169 en 2021. Les principaux sérotypes acquis dans l'UE étaient Salmonella Enteritidis, Typhimurium, Salmonella Typhimurium monophasique, Infantis, Newport et Derby.

Les taux de notification les plus élevés ont été enregistrés en République tchèque et en Slovaquie, tandis que la Bulgarie, la Grèce, l'Italie, la Lettonie, le Portugal et la Roumanie ont enregistré les taux les plus faibles. La France compte le plus grand nombre de cas, avec 11 162.

Sur les 4 135 cas associés à des voyages pour lesquels des informations sur le pays probable d'infection ont été enregistrés, la Turquie, l'Égypte, le Maroc et la Thaïlande étaient les destinations en dehors de l'UE les plus fréquemment signalées. Les principaux pays d'infection pour les cas associés aux voyages en Europe étaient l'Espagne et l'Italie.

«Le nombre de cas humains signalés pour les deux maladies d’origine alimentaire les plus courantes reste inférieur à celui d’avant la pandémie. Cependant, étant donné l'impact de ces infections sur la santé humaine, une vigilance accrue et des efforts supplémentaires pour réduire le nombre de cas sont nécessaires», a déclaré Ole Heuer, chef de la section des maladies à tendance épidémique à l'ECDC.

La yersiniose arrive en troisième position avec près de 8 000 cas. Il s’agit du plus grand nombre d’infections au cours des 10 dernières années.

Données sur E. coli et Listeria

Viennent ensuite E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) avec plus de 7 100 cas et Listeria monocytogenes avec 2 738.

Les STEC ont provoqué 1 130 hospitalisations et 28 décès dus à des infections, contre 6 406 en 2021.

Les taux de notification les plus élevés étaient en Irlande, à Malte, en Suède et au Danemark, tandis que les plus faibles étaient au Portugal, en Slovaquie et en Pologne. La Bulgarie, Chypre et la Lituanie n'ont enregistré aucun cas d’infection en 2022. L'Allemagne a enregistré le plus grand nombre de cas, avec 1 873.

Sur la base des informations provenant de 3 374 cas, les principaux sérogroupes étaient O157, O26, O103 et O146.

L'Espagne, la Grèce, l'Italie et la Croatie étaient les pays d'Europe les plus susceptibles d'être infectés. Pour les pays non membres de l'UE, la Turquie était le principal pays d'infection, suivie par l'Égypte et le Maroc.

Au total, 562 cas de syndrome hémolytique et urémique (SHU) ont été signalés, touchant principalement des enfants âgés de moins de 4 ans, et 20 d'entre eux sont décédés. Les principaux sérogroupes étaient O26, O157, O80 et O145.

Les infections à Listeria ont provoqué 1 330 hospitalisations et les cas (2 738 cas) ont augmenté par rapport aux 2 365 cas de 2021. Il s’agit du nombre le plus élevé signalé depuis le début de la surveillance au niveau de l’UE en 2007.

Le Danemark, la Finlande, la Suède, l'Espagne, la Slovénie et la Belgique affichaient les taux de notification les plus élevés. La Bulgarie, la Croatie, Chypre, la Grèce, Malte et la Roumanie ont enregistré les taux les plus bas. L'Allemagne compte le plus grand nombre de patients, avec 548.

La République tchèque a enregistré 48 cas en 2022 contre 24 en 2021, et la Slovaquie est passée de 13 à 25. En Italie, les cas ont augmenté de 115 ; en Espagne, ils ont augmenté de 82. Douze infections associées aux voyages ont été signalées en dehors de l'UE, notamment au Royaume-Uni, aux États-Unis et en Afrique du Sud.

Les décès ont augmenté de 100 contre 186 en 2021. La France a enregistré le plus grand nombre de cas mortels avec 73, suivie par l’Espagne avec 67 cas, Allemagne, 33 cas et la Pologne, 22 cas.

Les cas de Brucella sont passés de 162 à 198, mais les infections à Trichinella ont chuté de 77 à 41.

Vendredi 15 décembre 2023, le blog fera paraître le Top 10 de l’année 2023 de la sécurité des aliments en France. Il s’gait d’une mise en perspective de quelques faits saillants, mais aussi avec des absents …

Les foyers de toxi-infection alimentaire signalés dans l'UE ont augmenté de 44%, la campylobactériose et la salmonellose restent inférieures aux niveaux d'avant la pandémie, selon le rapport 2022 de l’EFSA-ECDC sur les zoonoses

«La campylobactériose et la salmonellose restent inférieures aux niveaux d'avant la pandémie - Les infections au virus du Nil occidental en hausse», source EFSA du 12 décembre 2023.

La campylobactériose et la salmonellose ont été les maladies zoonotiques les plus fréquemment signalées chez l'homme dans l'UE en 2022. Toutefois, le nombre de cas est resté inférieur à celui des années prépandémiques 2018-2019.

Pour le virus du Nil occidental, une augmentation du nombre d'infections a été observée. Ces informations, ainsi que d'autres informations sur les zoonoses, ont été publiées aujourd'hui par l'EFSA et l'ECDC dans le dernier rapport annuel de l’UE sur les zoonoses.

Le nombre de cas signalés de campylobactériose, la maladie zoonotique la plus fréquemment signalée, est resté stable en 2022 par rapport à l'année précédente, avec 137 107 cas. La viande de poulet est la source la plus fréquente des infections.

La salmonellose est la deuxième zoonose la plus signalée, avec 65 208 cas en 2022, contre 60 169 en 2021. Cependant, dix-neuf États membres et le Royaume-Uni (Irlande du Nord) ont atteint tous les objectifs fixés pour la réduction de la salmonellose dans les populations de volailles. Il s'agit du résultat le plus élevé depuis 2018, l'année où 14 États membres avaient atteint tous les objectifs – une étape importante dans les efforts collectifs pour lutter contre les maladies zoonotiques et protéger la santé publique.

«Le nombre de cas humains signalés pour les deux maladies d'origine alimentaire les plus courantes reste inférieur à ce qu'il était avant la pandémie», a déclaré Ole Heuer, chef de la section ‘Maladies à potentiel épidémique’ à l'ECDC. «Toutefois, compte tenu de l'impact de ces infections sur la santé humaine, il convient de rester vigilant et de redoubler d'efforts pour continuer à réduire le nombre de cas.»

Augmentation des infections par le virus West Nile

L'année 2022 est la deuxième année présentant le nombre de cas le plus élevé d'infections par le virus du Nil occidental jamais enregistré dans l'UE (1 133 cas) ; 2018 étant l'année où le nombre de cas était le plus élevé jusqu'à présent (1 612 cas). Ces chiffres sans précédent pourraient être dus à des conditions climatiques plus favorables à l'activité des moustiques.

«Le changement climatique accroît la recrudescence des maladies à transmission vectorielle. C’est pourquoi aujourd’hui, une approche «Une seule santé» (One Health) intégrant l’évaluation des risques à la fois pour l’homme et pour l’animal est la voie à suivre», a déclaré Frank Verdonk, chef de l’unité ‘Risques biologiques et santé et bien-être des animaux’ de l’EFSA.

En 2022, 431 oiseaux et 166 chevaux ont été testés positifs au virus du Nil occidental dans l'Union européenne, soit environ le double des chiffres de l'année précédente. Le virus a également étendu sa zone géographique, atteignant des régions jusque-là épargnées (sud-ouest de la France, nord de l'Allemagne et sud de l'Italie).

Le rapport publié ne se contente pas d'examiner les cas de maladie signalés de manière sporadique mais il se penche également sur les foyers de toxi-infection alimentaire, c'est-à-dire les cas où un minimum de deux personnes contractent la même maladie après avoir consommé le même aliment contaminé.

Le nombre de foyers de toxi-infection alimentaire signalés dans l'UE a augmenté de 44%, passant de 4 005 en 2021 à 5 763 en 2022, atteignant des niveaux similaires à ceux des années prépandémiques et provoquant le plus grand nombre de décès liés à des foyers de toxi-infection au cours de la dernière décennie (64). Les décès ont été principalement attribués à Listeria monocytogenes et ont été associés à une grande variété d'aliments, allant de la viande et des produits laitiers au poisson et aux légumes. L'utilisation plus fréquente du séquençage du génome entier est susceptible d'avoir amélioré la sensibilité de la surveillance, augmentant ainsi la capacité à détecter les foyers dans les États membres de l’UE.

Il y a aussi une Infographie qui rapporte dans quelle mesure vos aliments sont-ils sûrs ?

Sources et nombre d'épidémies d'origine alimentaire dans l'Union européenne en 2022.

Commentaire

On découvre les données 2022 sur la listeriose en France avec 451 cas (6,5 cas par million d’habitants), soit une augmentation significative, selon le rapport de l’EFSA-ECDC, alors que Santé publique France est restée à 2019 (6,2 cas par millions d’habitants), étonnant, non ?

Pour les STEC, en France, une tendance à la hausse significative (p < 0,05) a été observée sur la période 2018–2022 en France.

Pour les données relatives aux toxi-infections alimentaires collectives en France, Santé publique France rapporte en 2021, 1 309 toxi-infections alimentaires collectives (TIAC) ont été déclarées en France, affectant 11 056 personnes. Selon le rapport 2022 de l’EFSA-ECDC, la France a signalé en 2022, 1 861 foyers de TIAC, affectant 16 102 personnes.

Mise à jour du 18 décembre 2023

On lira l'article de Joe Whitworth paru le 18 décembre 2023 dans Food Safety News, «Data shows outbreaks rose across Europe in 2022» (Les données montrent une hause des foyers de cas d'intoxication alimentaire en Europe en 2022.

Les arômes de fumée peuvent contenir des substances dangereuses pour la santé

Comme je n’ai pas bien compris l’avis de l’EFSA sur les arômes de fumées, qui est devenu désormais, Arômes de fumée : Questions et réponses avec Wim Mennes, président du groupe de travail de l'EFSA sur les substances aromatisantes, je vous livre une version selon le BfR.

«Les arômes de fumée peuvent contenir des substances dangereuses pour la santé. Réévaluation par l'Autorité européenne d'évaluation de la sécurité des aliments (EFSA) avec une nouvelle notation», source BfR.

L'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) a effectué une nouvelle évaluation de la sécurité sanitaire de huit produits primaires pour la production d'arômes de fumée. Cette évaluation était nécessaire car les fabricants ont demandé une prolongation de dix ans de l'autorisation, qui expire le 1er janvier 2024, dans l'UE. Ce faisant, l'EFSA a pris en compte les dernières découvertes scientifiques et les critères d'évaluation actuels. De leur côté, les fabricants sont tenus de fournir des données d'essais à jour sur ces produits primaires. L'EFSA est désormais parvenue à une nouvelle évaluation de la sécurité sanitaire.

Des substances génotoxiques (capacité d'une substance chimique à endommager le matériel génétique des cellules) ont été détectées dans six de ces produits primaires ; les deux autres produits primaires sont soupçonnés d'avoir des effets génotoxiques, qui doivent encore être clarifiés expérimentalement. L’Institut fédéral allemand pour l’évaluation des risques (BfR) partage les préoccupations de l’EFSA concernant le potentiel génotoxique de ces produits primaires. L'EFSA a conclu que les huit produits primaires évalués ne peuvent plus être considérés comme inoffensifs pour la santé.

La séparation entre l'évaluation des risques et la gestion des risques est inscrite dans le droit européen depuis 2002. Il appartient désormais à la gestion des risques (représentants de la Commission européenne et des États membres de l'UE) de décider, en tenant compte des avis scientifiques actuels de l'EFSA, si et , le cas échéant, dans quelles conditions les autorisations pour les huit produits principaux destinés à la production d'arômes de fumée peuvent être prolongées.

L'EFSA évalue les dangers liés à l'utilisation de l'eau dans le secteur des fruits et légumes

«L'EFSA évalue les dangers liés à l'utilisation de l'eau dans le secteur des fruits et légumes», source article de Food Safety News paru le 8 novembre 2023.

Des experts de l'EFSA ont examiné la qualité de l'eau utilisée lors des opérations dans le secteur des produits frais et surgelés.

L'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) a demandé au groupe scientifique sur les dangers biologiques (BIOHAZ) un avis scientifique sur les dangers microbiologiques associés à l'utilisation de l'eau dans la manipulation et la transformation après récolte des fruits, légumes et herbes frais et surgelés.

L'utilisation de l'eau pendant la récolte et la transformation constitue un facteur de risque important de contamination de ces produits. Les risques microbiens pertinents comprennent Listeria monocytogenes, Salmonella, E. coli et des virus tels que le norovirus.

De grands volumes d’eau sont utilisés pour le lavage, le rinçage, le transfert hydraulique, la réfrigération, le nettoyage général et la désinfection. Par exemple, de grandes quantités d’eau sont nécessaires pour produire des salades en sachet. La plupart des transformateurs après récolte préfèrent utiliser la même eau pendant de nombreuses heures de fonctionnement afin d'économiser de l'eau et de l'énergie, car l'accès à l'eau potable peut être limité ou coûteux.

Selon les pratiques actuelles, l'eau potable est utilisée pour remplir les équipements et les réservoirs pendant la première heure du matin et n'est pas remplacée avant plusieurs heures, voire plusieurs jours dans certains cas, période pendant laquelle de grands volumes de fruits, légumes et herbes peuvent être traitées, selon le rapport paru le 3 novembre 2023.

Traitement de l'eau

La contamination de l'eau de traitement dépend de plusieurs facteurs, notamment le type de produit traité, la durée de l'opération et le transfert de micro-organismes du produit à l'eau et vice versa.

Pour éviter la contamination croisée du produit due à l'utilisation d'eau contaminée, des traitements de désinfection de l'eau sont nécessaires pour éliminer ou réduire les micro-organismes à un niveau acceptable, mais ils ne doivent pas nuire à la qualité et à la sécurité sanitaire du produit.

L'efficacité des traitements de désinfection dépend des conditions spécifiques de l'opération de transformation, notamment de la qualité initiale de l'eau et du type de traitement.

Les désinfectants à base de chlore et l'acide peroxyacétique sont des traitements courants de désinfection de l'eau. La validation, la surveillance opérationnelle et la vérification pour démontrer les performances sont nécessaires. Les pratiques d'hygiène comprennent l'entretien des infrastructures, la formation du personnel et le refroidissement de l'eau de traitement après récolte.

Gestion de l'eau

Les efforts des experts comprenaient une revue de la littérature, des données de surveillance des épidémies et une enquête auprès de l'industrie.

La maîtrise de l’eau basé uniquement sur un programme de conditions préalables de base (PRP) n’est pas réalisable et une approche HACCP est nécessaire pour la gestion de l’eau. Les bonnes pratiques de fabrication (BPF) et les bonnes pratiques d'hygiène (BPH) liées à un plan de gestion de l'eau et à la mise en œuvre d'un système de gestion de l'eau sont essentielles.

D'après les réponses à l'enquête de l'industrie, trois bonnes pratiques ne sont pas encore bien mises en œuvre : le remplacement des infrastructures pour éviter la formation de biofilm, la recherche de la formation de biofilm dans le système de gestion de l'eau et le refroidissement par l’eau. Les réponses ont montré que la surveillance de la qualité de l’eau de traitement était absente ou faible.

Lors de certaines éclosions de listériose, les enquêtes ont révélé que la contamination s'était produite à l'usine de transformation ; cependant, des bactéries peuvent également pénétrer dans l’usine à partir de la production primaire. Malgré les enquêtes menées sur l'épidémie, la voie de contamination a rarement été confirmée.

Les pratiques agricoles émergentes telles que la culture hydroponique, l'agriculture verticale et l'agriculture urbaine peuvent introduire des agents pathogènes dans la chaîne alimentaire, même si l'ampleur de ce phénomène devrait être inférieure à celle de l'agriculture conventionnelle, selon le rapport.

Le groupe BIOHAZ a recommandé que davantage d'informations soient incluses dans les rapports d'enquête sur les épidémies et que des lignes directrices claires soient disponibles pour les entreprises afin de clarifier les exigences sur la manière dont les traitements de désinfection de l'eau peuvent être utilisés pour maintenir la qualité microbiologique de l'eau utilisée dans la manipulation et le traitement après récolte. de fruits, légumes et herbes.

Commentaire

Quand on lit le rapport, les experts semblent sous le charme de l’ariculture urbaine, hydroponique et autres fermes verticales. Auant de billvesées qui ne recouvrent le marché actuellement. Sinon, trien de bien neuf et je suggère aux experts de passer une semaine dans des usines de transformation de fruis et de légumes ...

Foyer épidémique à Salmonella Enteritidis dans plusieurs pays lié à de la viande de poulet et des produits à base de viande de poulet (kebab)

«Foyer épidémique dans plusieurs pays à Salmonella Enteritidis dans de la viande de poulet et des produits à base de viande de poulet», source EFSA du 26 octobre 2023.

Entre janvier et octobre 2023, 14 pays de l'UE et de l’EEE, le Royaume-Uni et les États-Unis ont signalé 335 cas liés à ce foyer épidémique.

D'après l’évaluation rapide du foyer épidémique menée par l'EFSA et l'ECDC, de la viande de poulet et des produits à base de viande de poulet (kebab) constituent la source probable de ce foyer épidémique qui touche plusieurs pays et qui est causé par trois types de Salmonella Enteritidis.

Des bactéries semblables à celles qui ont causé le foyer épidémique ont été détectées dans des échantillons de viande de poulet et de kebab de poulet. Alors que les données de traçabilité des aliments pointent vers des producteurs situés en Pologne (7 producteurs) et en Autriche (1 producteur), aucune preuve microbiologique d'une contamination dans leurs installations n'a été identifiée.

Les scientifiques s'attendent à ce que de nouveaux cas surviennent dans ce foyer qui touche plusieurs pays car la source n'a pas encore été identifiée. Les experts de l'EFSA et de l'ECDC recommandent de poursuivre les investigations afin d'identifier les endroits de la chaîne de production de viande de poulet où la contamination a pu se produire.

Source Three clusters of Salmonella Enteritidis ST11 infections linked to chicken meat and chicken meat products.

L’article de Joe Whitworth du 27 octobre 2023 dans Food Safety News rapporte,

De janvier à octobre 2023, 335 cas de Salmonella Enteritidis de type séquence (ST) 11 confirmés en laboratoire, appartenant à trois groupes, ont été signalés dans 14 pays de l'UE, au Royaume-Uni et aux États-Unis, touchant tous les groupes d'âge. Neuf cas dans trois pays ont été hospitalisés et une personne est décédée en Autriche.

Le dernier nombre de patients représente une augmentation par rapport aux 130 cas dans 11 pays révélés en août lorsqu'une analyse de l'ECDC s'est concentrée sur deux sous-groupes de Salmonella Enteritidis de type 11.

Le blog signalait dès le 2 avril 2023 que La viande de kebab contenant de la viande de poulet est-elle dans le collimateur de l'ECDC ?

Détails de l'épidémie

Le premier cluster compte 66 patients répartis dans neuf pays de l’UE et au Royaume-Uni. Les patients sont âgés de moins de 1 à 84 ans, les hommes étant plus touchés que les femmes. Le Royaume-Uni compte le plus de cas dans ce groupe, avec 21, suivi de la France avec 19. Une personne en Autriche est décédée, trois en Pologne et cinq en Allemagne ont été hospitalisées. Le dernier cas s’est produit au Royaume-Uni en octobre 2023.

Le cluster 2 compte 192 cas dans 12 pays de l’UE et au Royaume-Uni. Une femme était malade aux États-Unis et avait voyagé en Espagne en juin 2023, où l’infection s’est probablement produite. La tranche d’âge des patients dans l’UE allait de moins de 1 à 98 ans. Une personne en Italie a été hospitalisée. Le Royaume-Uni compte le plus grand nombre d'infections, avec 83, suivi de la France avec 60.

Le cluster 3 compte 77 patients dans huit pays de l’UE et au Royaume-Uni. Quatre cas en Pologne se sont produits avant 2023 et ont été détectés lors d'un projet de recherche. Dans ce groupe, l'âge variait de 2 à 83 ans et plus d'hommes étaient malades que de femmes. La France compte le plus de cas avec 33 tandis que le Royaume-Uni en compte 27.

Les pays concernés comprennent l'Autriche, la Belgique, le Danemark, la Finlande, l'Allemagne, l'Irlande, l'Italie, le Luxembourg, les Pays-Bas, la Norvège, la Pologne, la Slovénie et la Suède.

La plupart des cas interrogés ont signalé une consommation de viande de poulet, y compris des brochettes. Trois brochettes contaminées par Salmonella se partageaient plusieurs entreprises alimentaires polonaises.

L'analyse des cas groupés (clusters) des séquences a révélé la présence d'isolats humains en 2022 et 2023 pour le groupe 1, de 2012 à 2023 pour le groupe 2 et de 2014 à 2023 pour le groupe 3 dans plusieurs pays européens, indiquant une circulation prolongée et endémique des souches.

Les contrôles officiels ont également révélé la présence d'autres types de Salmonella, notamment Infantis, Kottbus, Virchow et Rauform.

Bien que la contamination ait pu se produire au niveau du restaurant dans un cas, pour d’autres produits, elle s’est probablement produite avant qu’ils ne quittent leurs sites de production ou de transformation ou au niveau de l’élevage de poulets de chair.

«Des enquêtes supplémentaires sont nécessaires pour identifier la cause profonde de la contamination et la source des infections, ce qui est crucial pour la mise en œuvre rapide de mesures de contrôle et de mesures correctives efficaces et ciblées. Comme les sources n’ont pas été identifiées, de nouveaux cas surviendront probablement dans cette épidémie prolongée dans plusieurs pays , ont déclaré l’ECDC et l’EFSA.

Décryptage du dossier glyphosate pour Le Figaro par Gil Rivière-Wekstein : "Il n'y a pas de risque pour la santé et pour l'environnement"

Les 27 États membres ne sont pas parvenus à se mettre d’accord sur le renouvellement d’homologation du glyphosate. Selon @AEGRW, cette situation ne doit pas occulter le consensus scientifique des agences sanitaires qui s'accordent sur la non-dangerosité de l'herbicide. pic.twitter.com/hdjSb4976f

— Le Figaro (@Le_Figaro) October 16, 2023

L'EFSA explique la différence entre danger et risque

L'EFSA a lancé la nouvelle campagne «Hazard vs Risk» (Danger versus Risque).

Vous avez hâte de commencer la saison de la cueillette des champignons ? 

Lorsque vous êtes dans les bois, faites attention au danger des champignons vénéneux : les manger peut être un risque !

Reconnaissez le danger, réduisez le risque :

Des experts de l'UE ont discuté de huit risques émergents

«Des experts de l'UE ont discuté de huit risques émergents», source article de Food Safety News paru le 27 septembre 2023.

E. albertii producteurs de shiagtoxines et la surdose de vitamine D chez les enfants font partie des sujets sur lesquels les autorités européennes se concentrent, selon un rapport récent.

Dix-huit problèmes émergents potentiels ont été discutés en 2021 et huit ont été jugés comme des risques émergents, selon l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA).

Les réseaux de l’EFSA contribuant au sujet comprennent l’Emerging Risks Exchange Network (EREN), le Stakeholder Discussion Group on Emerging Risks, les unités scientifiques de l’EFSA, les groupes scientifiques et le comité scientifique.

Dans quatre des questions abordées en 2021, un changement dans les tendances de consommation a été identifié comme un facteur déterminant. Six ont été classés comme risques microbiologiques et quatre comme risques chimiques.

Exemples de risques émergents

Un risque émergent était la présence de vitamine D dans les complléments de santé. Les autorités sanitaires françaises avaient été alertées de plusieurs cas d'hypercalcémie sévère et d'hospitalisation, chez des nourrissons auparavant en bonne santé et ayant pris de la vitamine D sous forme de compléments alimentaires.

En 2019 et 2020, les centres antipoison ont été appelés pour au moins 23 surdoses après consommation d'un complément contenant de la vitamine D pour enfants. En 2020, deux cas graves d’intoxication à la vitamine D ont été signalés à l’Anses suite à la prise par des nourrissons de compléments achetés sur internet. En 2021, un autre cas d’hypercalcémie extrême a été signalé par un hôpital pédiatrique. Il a été conseillé aux pays de vérifier auprès des pédiatres au niveau national s'il existe une tendance à une surdose de vitamine D chez les bébés.

Un autre sujet était E. albertii producteurs de shigatoxines. Le réservoir naturel de E. albertii n'est pas clair, mais ces informations sont nécessaires pour déterminer la dynamique de transmission et prévenir les infections. Il a été demandé aux pays de collecter des données sur l'incidence, la prévalence chez l'homme et les voies d'exposition au risque afin de mieux caractériser le danger.

Les risques potentiels pour la santé liés à l’huile de coco ont également été signalés. Les experts ont déclaré que des recherches supplémentaires étaient nécessaires pour renforcer les preuves de la toxicité potentielle et que les pays ont été invités à vérifier les données nationales pour voir si une tendance à la hausse de la consommation alimentaire d'huile de coco pouvait être confirmée.

Les brévétoxines présentes dans les coquillages français ont été évoquées. Il s’agit de biotoxines marines responsables d’intoxications neurotoxiques par les coquillages après consommation de coquillages contaminés. Ils ne sont pas réglementés en Europe. Les scientifiques ont déclaré qu'il était recommandé de surveiller les brevetoxines dans les eaux européennes.

Autres problèmes surveillés

L’EREN comprend les 27 États membres de l'UE, la Norvège et la Suisse, ainsi que les observateurs de l'Organisation mondiale de la santé (OMS), de l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO), de Food Standards Australia New Zealand (FSANZ), de la Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis et l'Agence canadienne d'inspection des aliments (ACIA).

En 2021, les membres d’EREN ont discuté de 35 signaux et problèmes émergents potentiels identifiés par leurs propres activités d’analyse prospective.

Les domaines qui n'ont pas été jugés comme des risques émergents comprenaient la sous-estimation des infections humaines à Arcobacter, les dangers des non-experts fermentant des aliments à la maison, l'intoxication potentielle par des morilles asiatiques et les compléments alimentaires contenant de la coumarine.

D'autres problèmes concernaient la consommation croissante de viande de crocodile, l'augmentation des intoxications par le champignon Chlorophyllum molybdites en Italie, les cannabinoïdes synthétiques dans les aliments et le Bocavirus humain dans les coquillages.

En Nouvelle-Zélande, le système d'identification des risques émergents (ERIS) a enregistré 57 problèmes inscrits dans le registre des risques émergents. Les exemples incluent les microplastiques et les nanoplastiques dans les aliments, Salmonella dans les poissons et les nouvelles limites pour le chlorate dans le lait.

Le partage de données et la confiance mis en avant lors de l'événement EFSA WGS

«Le partage de données et la confiance mis en avant lors de l'événement EFSA WGS», source article de Joe Whitworth paru le 8 septembre 2023 dans Food Safety News.

La plupart des aspects techniques liés au séquençage ont été résolus, mais le partage des données et la confiance restent des problèmes clés, selon des experts européens.

L’Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) et le groupe de travail des Laboratoires de référence inter-européens (EURL) de la Commission européenne sur le prochain séquençage du génome (NGS) ont organisé cette semaine la deuxième conférence Science Meets Policy. Plus de 100 personnes de 20 pays y ont participé en personne, tandis que le nombre de personnes en ligne a culminé à 257.

Stefano Morabito de l'Institut national italien de la santé (ISS), George Haringhuizen de l'Institut national néerlandais pour la santé publique et l'environnement (RIVM), João André Carriço de bioMérieux, Katja Alt, du ministère fédéral allemand de l'Alimentation et de l'Agriculture, et Coen van der Weijden, de l'Autorité néerlandaise de sécurité des produits alimentaires et de consommation (NVWA) ont participé à une table ronde.

Les experts ont souligné la nécessité de faire preuve de flexibilité, d'autant plus qu'il existe 27 pays en Europe à différents stades d'utilisation du séquençage du génome entier et que les épidémies peuvent impliquer des pays extérieurs à l'UE. Ils ont discuté des types de données nécessaires, de la qualité et de la comparabilité des données, des problèmes de ressources, de la manière d'instaurer la confiance et du rôle des différentes parties, notamment les services réglementaires et l'industrie.

Le système One Health WGS de l’EFSA et de l’ECDC fonctionne depuis juillet 2022 et, même si les choses se passent bien, tous les États membres n’y contribuent pas de la même manière.

Dilemme du partage de données

Bernhard Url, directeur exécutif de l’EFSA, a dit que le partage de données génomiques se trouvait désormais à un tournant.

«Nous pensons que d’un point de vue technologique et méthodologique, nous sommes prêts à utiliser les données WGS plus largement et avec plus d’impact. De nombreux problèmes ont été résolus et l'infrastructure technique a été construite. Il ne fait aucun doute, du moins au sein de la communauté, que le partage de données ajoute de la valeur, car il permet une détection plus rapide des épidémies et une meilleure traçabilité. Cela augmente la probabilité de relier des cas sporadiques aux clusters et de détecter les épidémies, et il y a un impact économique mesurable», a-t-il dit.

«Cependant, même si l’on sait que le partage de données est utile, certains obstacles empêchent encore une utilisation plus large», a dit Url.

«Il existe des lacunes technologiques dans la mesure où tous les États membres ou organisations n'utilisent pas régulièrement le WGS. On s’inquiète également du fait que des personnes et des pays disent que nous ne disposons pas d’une base juridique solide pour partager des données. On craint que les personnes perdent le contrôle des données, qu’ils produisent les données, les partagent mais ne sachent pas ce qui se passe ensuite. On craint que si cette technologie était utilisée à grande échelle, beaucoup plus de clusters seraient détectés, ce qui est une bonne chose du point de vue de la santé publique, mais cela augmenterait également la charge de travail des autorités nationales pour suivre et traiter ces clusters.»

Url a dit qu’il serait «imprudent» d’attendre que les législateurs définissent les règles du jeu.

«La communauté WGS doit faire sa part pour créer les conditions du succès. Nous pensons que nous pouvons faire beaucoup pour faire progresser le partage de données dans le cadre législatif actuel. Nous devons encore travailler à créer une compréhension mutuelle sur les avantages et les limites de cette technologie. Nous devons nous mettre d’accord sur des lignes directrices, des processus et des procédures communs, sinon nous ne saurions pas comment comparer les différents résultats», a-t-il dit.

«Nous voulons agir aussi ouvertement que possible mais aussi confidentiellement que nécessaire, il y a une ligne fine que nous devons trouver. L'EFSA a investi des ressources dans la création d'une infrastructure technologique permettant le partage de données WGS, principalement pour lutter contre les menaces d'origine alimentaire. Nous continuerons à faire notre part pour faire progresser le partage des données génomiques.»

Eric Stevens

Point de vue des États-Unis

Eric Stevens, de la Food and Drug Administration des États-Unis, a dit que le réseau GenomeTrakr est le résultat de 12 années de travail. Fin 2021, il y avait 600 000 génomes dans la base de données publique, aujourd’hui c’est plus de 1 000 000 séquences.

«Après plus d'une décennie d'expérience, ce n'est pas le séquençage qui constitue le défi lors de la transition vers ces données, mais la manière dont vous allez les analyser, former le personnel, acquérir les compétences et permettre à l'ensemble du système de les utiliser efficacement.»

«Les métadonnées aident à dresser un tableau complet. Sans elles, vous disposez d’une séquence d’ADN qui ne peut vous renseigner que sur certaines choses. Les données contextuelles donnent vie à ces données, elles vous indiquent d'où viennent ces bactéries, comment elles vivaient et lorsque nous commençons à réfléchir aux interventions que nous pouvons faire, nous avons besoin de ces informations pour comprendre la situation dans son ensemble.

«Pour nous, la meilleure utilisation est de rendre les données ouvertes accessibles à tous, car quelqu'un peut s'intéresser à Salmonella, quelqu'un d'autre à E. coli et parfois ces données se chevauchent avec des interventions que vous pouvez effectuer pour des contrôles préventifs et réduire la contamination.»

Stevens a dit qu'une fois les données entrées dans la base de données, diverses choses peuvent être examinées.

«Quand on commence à penser à la chaîne alimentaire mondiale, on peut se demander où avons-nous besoin de plus de données.et commencer à réaliser des projets pour résoudre ces problèmes afin de mieux comprendre comment les aliments sont contaminés en premier lieu. Vous ne sauriez rien de tout cela si vous n’aviez pas les données qui peuvent vous aider à montrer la voie», a-t-il dit.

«GenomeTrakr est responsable de près de 100 000 isolats alimentaires et environnementaux afin de dresser un tableau plus complet du lien entre les isolats cliniques et leurs sources, afin que nous puissions non seulement répondre aux épidémies d'origine alimentaire, mais aussi essayer de les prévenir. Lorsque vous commencez à examiner d’où proviennent vos sources d’isolats alimentaires et environnementaux liés aux maladies humaines, vous pouvez commencer à attribuer les sources et à un ciblage plus préventif. Si nous pouvons parvenir à un point où nous pouvons télécharger des données en temps réel, nous pouvons commencer à établir ces connexions le plus tôt possible pour retirer un produit contaminé du marché.»

Cela peut également aider à passer de la réponse aux épidémies à la prévention de la contamination.

«Dans un établissement par exemple, vous n'allez pas faire de WGS pour identifier un agent pathogène, vous pouvez faire une méthode de culture rapide pour voir sa présence ou son absence. Mais si vous avez un établissement qui se demande s'il y a un agent pathogène résident, vous aimeriez à 100% cette information du WGS. Vous pourriez étendre cela aux exploitations agricoles et aux sources d’eau potentielles», a dit Stevens.

«Lorsque vous commencez à réaliser des projets dans différentes parties du monde, vous commencez à comprendre que tout le monde a des problèmes qui ne le sont peut-être pas pour vous. Nous avons fait beaucoup de travail en Amérique latine et le gros problème pour se lancer dans le séquençage est la disponibilité des réactifs. Nous entendons dire que cela coûte cinq à sept fois plus cher que ce que nous payons. Lorsque nous parlons de l’utilisation de cette technologie dans le monde, nous devons commencer à nous concentrer sur les questions qui auront le plus d’impact.»

Des cas groupés (clusters) à Salmonella Enteritidis liés à la consommation de viande de poulet détectés dans 11 pays de l'UE et de l’EEE

Je signalais le 2 avril 2023, La viande de kebab contenant de la viande de poulet est-elle dans le collimateur de l'ECDC ?

Voici la suite ...

«Des cas groupés (clusters) à Salmonella Enteritidis liés à la consommation de viande de poulet détectés dans 11 pays de l'UE et de l’EEE», source ECDC du 30 août 2023.

Deux sous-clusters à Salmonella Enteritidis ST11 endémiques ont été détectés avec au moins 134 cas humains identifiés dans 11 pays de l'UE et de l’EEE. La plupart des cas ont été signalés entre janvier et août 2023. Les informations disponibles provenant d'entretiens avec des patients en Autriche et au Danemark suggèrent que la viande de poulet est un véhicule possible d'infection. En Allemagne, les entretiens avec les patients ont commencé.

En juillet 2023, le Danemark a signalé un cluster microbiologique d'infections à Salmonella Enteritidis ST11 avec des dates de prélèvements commençant en mai. Au 25 août 2023, 97 cas avec des isolats récents (2023) ou historiques, étroitement liés génétiquement, ont été signalés en Autriche (6), en Belgique (6), au Danemark (22), en Finlande (5), en France (19), Allemagne (1), Irlande (12), Pays-Bas (12), Norvège (9), Slovénie (3) et Suède (2). Au Danemark, la majorité des 19 cas interrogés ont signalé avoir consommé du kebab ou de la pizza pouvant contenir du poulet comme ingrédient, avant de développer des symptômes. En Autriche, deux des cinq cas interrogés ont déclaré avoir mangé des brochettes de poulet dans les sept jours précédant l'apparition des symptômes et deux cas ont déclaré avoir mangé d'autres plats de poulet (burrito au poulet et escalope de poulet).

Début août 2023, l'Autriche a signalé un cluster d'infections à Salmonella Enteritidis ST11, qui a entraîné un décès. L'apparition de la maladie du premier cas de ce groupe aurait eu lieu à la mi-mars et la date d'apparition la plus tardive à la mi-juillet 2023. Au 25 août 2023, 8 cas ont été enregistrés en Autriche et cinq des huit cas interrogés ont signalé une consommation de la viande de poulet kebab peu de temps avant l'apparition des symptômes. Des cas supplémentaires avec des isolats étroitement liés génétiquement ont été signalés en France (10), en Allemagne (10), en Norvège (3), en Slovénie (2) et en Suède (4), portant le nombre total de cas dans ce groupe à 37.

Dans le cluster danois, les âges variaient de 10 à 98 ans, tandis que les âges variaient de 5 à 75 ans dans le cluster autrichien. Dans les deux groupes, les femmes et les hommes étaient touchés, mais les hommes étaient prédominants en Autriche (86%) et en Allemagne (71%).

La majorité des isolats testés présentent des modifications génétiques qui entraînent une résistance à la ciprofloxacine. De nombreux cas d'infection à Salmonella ne nécessitent pas de traitement antibiotique, mais lorsqu'un traitement est nécessaire, la ciprofloxacine est souvent utilisée. La ciprofloxacine n’étant pas adaptée au traitement de l’infection dans ces cas-là, d’autres antibiotiques doivent être utilisés.

Les deux groupes ne représentent qu'une proportion de toutes les infections à S. Enteritidis ST11 et ces souches continuent de présenter un risque d'infection dans l'ensemble de la population de l'UE et de l’EEE jusqu'à ce que les sources de la chaîne alimentaire soient correctement étudiées et maîtrisées.

Une cuisson minutieuse de la viande et de la volaille et la prévention de la contamination croisée de la viande crue aux aliments prêts à consommer sont essentielles pour prévenir l'infection par Salmonella et d'autres organismes d'origine alimentaire. Ceci est particulièrement important pour les personnes vulnérables, notamment les très jeunes, les personnes âgées et celles dont le système immunitaire est affaibli.

Les pays sont encouragés à signaler les cas associés via les événements EpiPulse 2023-FWD-00045 et 2023-FWD-00048 et à renforcer leur collaboration pour les enquêtes sur les épidémies d'origine alimentaire entre les autorités de santé publique, de sécurité des aliments et vétérinaires.

Commentaire

Le Danemark signale que la viande de poulet kebab provient de Pologne. Idem pour les brochettes en Autriche.

On se rappellera aussi cette Épidémie en Europe à Salmonella Virchow liée à des restaurants servant de la viande de type kebab. La France rapporte le plus de cas.

Eclosion dans plusieurs pays d'infections à Salmonella Senftenberg ST14 possiblement liée à des tomates cerises

«Eclosion dans plusieurs pays d'infections à Salmonella Senftenberg ST14 possiblement liée à des tomates cerises», source EFSA du 27 juillet 2023.

Résumé

Depuis août 2022 et au 12 juillet 2023, 92 cas à Salmonella Senftenberg ont été signalés en Autriche (5), Belgique (4), Tchéquie (4), Estonie (1), Finlande (12), France (16), Allemagne (26), l'Irlande (1), Pays-Bas (5), Norvège (1), Suède (11), Royaume-Uni (4) et États-Unis (2). Au total, 69,6% des cas signalés étaient des femmes. Un patient est décédé de l'infection. Le premier cas a été signalé en France avec une date d'isolement au 22 août 2022 et le cas le plus récent a été signalé le 24 juin 2023 en Suède. La plupart des cas ont été signalés entre octobre 2022 et mars 2023, avec une baisse du nombre de pays exposés après décembre. En Autriche, Allemagne et France, les tomates cerises ont été identifiées comme l'exposition alimentaire la plus signalée par les cas interrogés. La souche du foyer a été détectée en France à partir d'un plat de salade composée, contenant des tomates cerises et des légumes vertes à feuilles, préparé le 17 août 2022 mais non servi. Les tomates de la salade en France et les tomates en Autriche ont été suspectées d'être le vecteur d'infections par les autorités nationales et ont été tracées jusqu'à des grossistes en Allemagne, Pays-Bas et Espagne, ainsi qu'à des producteurs Pays-Bas, Espagne et Maroc. En l'absence de preuves microbiologiques provenant des tomates, la source des infections n'a pas pu être établie. La similitude génétique des souches épidémiques humaines suggère une ou plusieurs sources communes probables provoquant une épidémie d'origine alimentaire prolongée et transfrontalière avec des cas signalés par intermittence dans 11 pays de l'UE et de l’EEE, au Royaume-Uni et aux États-Unis pendant environ 10 mois. La contamination pourrait provenir de fermes cultivant des tomates. Depuis décembre 2022, alors que le nombre de cas a diminué, le risque de nouvelles infections est tombé à un niveau faible.