«Des scientifiques japonais ont découvert des voies potentielles de
contamination des aliments par un agent pathogène d'origine
alimentaire nouvellement identifié», source Osaka
Metropolitan University.
Les personnes doivent consommer suffisamment d'aliments sûrs et
nutritifs pour rester en vie et en bonne santé. La consommation
d'aliments non sûrs, contaminés par des bactéries dangereuses, des
virus, des parasites ou des substances chimiques, est responsable de
plus de 200 maladies, allant de la diarrhée au cancer. Les maladies
diarrhéiques sont les maladies les plus courantes causées par des
aliments contaminés, affectant 550 millions de personnes et tuant
230 000 personnes chaque année dans le monde. Même dans les pays
développés, certains agents pathogènes bactériens d'origine
alimentaire menacent la vie des gens par l'ingestion de repas
quotidiens. Parmi les micro-organismes préoccupants, Staphylococcus
argenteus est une bactérie qui provoque une intoxication
alimentaire. Il a d'abord été découvert comme une lignée
génétiquement distincte dans les communautés aborigènes
d'Australie. Depuis lors, Staphylococcus argenteus a été isolé sur
d'autres continents, indiquant sa prévalence mondiale.
Dans une étude récente, une équipe de scientifiques basée à
l'Université de la préfecture d'Osaka au Japon, a cherché à
examiner la prévalence de Staphylococcus argenteus dans des aliments
tels que les légumes, le poisson, le poulet, le bœuf et le porc
dans les magasins de distribution. Ils ont utilisé des techniques
moléculaires pour identifier le matériel génétique bactérien par
réaction en chaîne par polymérase et séquençage du génome
entier. À l'exception du poulet, aucun des aliments qu'ils ont
échantillonnés ne présentait de preuve de contamination par
Staphylococcus argenteus. Étonnamment, du matériel génétique de
Staphylococcus argenteus a été retrouvé dans 13,9% des
échantillons de poulet analysés.
Les chercheurs ont en outre profilé le génotype de Staphylococcus
argenteus, les facteurs de virulence et le niveau de résistance aux
antibiotiques. En utilisant le typage de séquences à plusieurs
locus (MLST), la souche ST2854 était la plus prédominante,
représentant 33% de tous les isolats. Les autres souches
prédominantes étaient ST1223, ST5961 et ST2250 respectivement à
28,6%, 23,8% et 14,3%. Tous les isolats avaient des répertoires de
gènes d'entérotoxine staphylococcique. En particulier, le gène
selx, qui code pour la protéine selx. Étonnamment, l'une des 21
souches testées pour la résistance aux antibiotiques était
résistante à la pénicilline, à la tétracycline et à la
doxycycline, tandis qu'une autre n'était résistante qu'à la
pénicilline.
De plus, les chercheurs ont examiné des échantillons de poulet
provenant de deux abattoirs différents, l'un spécialisé dans la
transformation des poulets à griller et l'autre dans la
transformation des poules. Au total, 357 échantillons ont été
analysés, y compris des plumes de poulet, de l'eau de
refroidissement et des écouvillons d'installation. De manière
surprenante, 14 souches de Staphylococcus argenteus ont été isolées
chez un même abattoir. Ces isolats ont été retrouvés dans l'eau
du refroidisseur, des écouvillons de manche de couteau et des
planches à découper, ainsi que dans les carcasses de poulet.
Lors de l'analyse génétique des isolats de l'abattoir, 13 isolats
ont été attribués au génotype ST5961 et un isolat au génotype
ST5964. Un profilage des toxines et des tests de sensibilité aux
antibiotiques ont également été effectués. Le profilage des
toxines a révélé le gène selx, dans tous les isolats. De plus,
des gènes sey supplémentaires, sel26 et sel27, n'ont été
retrouvés que dans ST5964, ce qui implique que ces isolats provenant
d'un abattoir peuvent provoquer une intoxication alimentaire à
Staphylococcus. Étonnamment, les 14 isolats de l'abattoir étaient
sensibles aux antibiotiques.
Dans d'autres études de confirmation, les chercheurs ont utilisé la
phylogénétique pour analyser les séquences de l'ensemble des 35
isolats de Staphylococcus argenteus afin de clarifier la relation
entre le poulet au détail et les isolats dérivés d'abattoirs.
Curieusement, certains des isolats de poulet vendus au détail se
sont phylogénétiquement regroupés avec des isolats de l'abattoir.
De plus, trois isolats de poulet et un isolat d'eau de
refroidissement de l'abattoir étaient phylogénétiquement
regroupés. De plus, cinq isolats de poulets vendus au détail et 13
isolats d'abattoirs se sont regroupés et ont tous été classés
comme ST5961. Ces résultats indiquent que l'environnement de
l'abattoir est très probablement une source de contamination par
Staphylococcus argenteus, suggérant ainsi une propagation
bactérienne continue dans les aliments transformés.
Dans une interview, le professeur Masami Miyake, qui a supervisé
cette étude à l'Université d'Osaka, a déclaré:
«Fondamentalement, cette investigation a montré que la viande de
poulet était fortement contaminée par Staphylococcus argenteus, la
bactérie qui peut causer des maladies humaines. Notre approche de
phylogénétique moléculaire a en outre révélé que les usines de
transformation de viande peuvent également jouer un rôle dans la
transmission des germes de l'environnement aux aliments et vice
versa. L'illustration schématique de leur proposition de dynamique
de contamination des aliments par Staphylococcus argenteus est
illustrée dans l’image. Lorsque nous avons eu un entretien avec le
Dr Yuki Wakabayashi, qui était doctorant lorsqu'il a mené cette
étude à l'Université d'Osaka, il a ajouté: c’est la première
étude qui a démontré la présence de S. argenteus dans une
installation de transformation des aliments, et la possibilité de
contamination bactérienne lors de la transformation des aliments,
doit être prise en compte.»
L'article, Isolation and characterization of Staphylococcus
argenteus strains from retail foods and slaughterhouses in Japan,
a été publié le 16 février 2022 dans International
Journal of Food Microbiology.
Merci à Joe
Whitworth de m’avoir transmis l’information.
Aux lecteurs du blog
Je suis en conflit depuis
plusieurs années avec la revue PROCESS
Alimentaire
pour une triste
question d’argent qui permettrait de récupérer et de diffuser
correctement les 10 052 articles initialement publiés gracieusement
par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue, alors qu’elle
a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la
diffusion de ces articles. Le départ du blog de la revue a été
strictement motivé par un manque de réactivité dans la maintenance
du blog, la visibilité de celui-ci devenant quasi nulle. J’accuse
la direction de la revue de fuir ses responsabilités et le but de ce
message est de leur dire toute ma colère. Elle ne veut pas céder,
moi non plus, et je lui offre ainsi une publicité gratuite.