A propos du rôle des mesures de biosécurité dans la maîtrise Campylobacter dans les élevage de poulets

Je vous souhaite un très bon et très joyeux Noël, de belles fêtes de fin d’année

«Le rôle de la biosécurité dans la maîtrise de Campylobacter: une étude qualitative des attitudes et des perceptions des personnels des élevages de poulets de chair au Royaume-Uni», source article paru dans Fontiers in veterinary Science. L’article est disponible en intégralité.

Résumé

Campylobacter est la principale cause de diarrhée bactérienne humaine dans le monde, les produits de viande de volaille contribuant à une grande proportion des cas. En raison de la présence omniprésente de Campylobacter dans l'environnement des élevages avicoles, la biosécurité est le principal domaine d'intervention pour prévenir la colonisation des troupeaux commerciaux de poulets. Cependant, la recherche a démontré à maintes reprises que l'adoption par les éleveurs des recommandations de biosécurité est souvent faible. Cette étude a exploré les attitudes des éleveurs envers la biosécurité et identifié les obstacles à la mise en œuvre efficace des protocoles de biosécurité. Des entretiens semi-structurés ont été menés avec 1 à 3 membres du personnel dans chacune des 16 élevages de poulets de chair, 6 détenus par des éleveurs et 10 sous contrat avec 3 intégrateurs de volaille britanniques différents. Au total, 28 personnes interrogées ont participé, y compris des propriétaires d’élevages, des gestionnaires et des membres du personnel, avec une gamme d'expérience dans l'industrie. L'analyse thématique des entretiens a révélé des niveaux élevés de reconnaissance parmi les éleveurs de poulets de chair de l'importance de Campylobacter et de la responsabilité de l'ensemble de la chaîne de la ferme à la table au sein de l'industrie avicole afin de réduire la contamination par Campylobacter de la viande de poulet au profit de la santé publique. La sensibilisation et la mise en œuvre de la biosécurité déclarées par les participants se sont considérablement améliorées à la suite de l'accent mis par l'ensemble de l'industrie sur la maîtrise de Campylobacter. Cependant, l'approche de l'industrie pour lutter contre Campylobacter et le lourd fardeau de responsabilité qui a été imposé aux interventions au niveau de l’élevage suscitent des frustrations. Les participants étaient également sceptiques quant à l'efficacité des mesures de biosécurité actuelles dans la réduction de Campylobacter. Néanmoins, la reconnaissance par les personnes interrogées des avantages d'une meilleure biosécurité sur la santé et le bien-être des poulets de chair et d'autres objectifs importants, tels que la réduction de l'utilisation d'antimicrobiens, laisse un héritage dont l'industrie britannique des poulets de chair peut être fière. Il est possible de poursuivre l'éducation des éleveurs sur les preuves à l'appui des interventions de biosécurité, en particulier dans la maîtrise de Campylobacter, et sur la nécessité d'établir des canaux de communication plus efficaces. En outre, pour donner à tous les acteurs au sein de l'industrie et des objectifs d'investissement dans l'industrie, les contributions à tous les niveaux devraient être autorisées dans la conception des futures interventions de biosécurité. Le respect de la biosécurité peut être amélioré grâce à des efforts de collaboration, tels que des pratiques participatives et de co-conception, pour faciliter la co-création et l'échange de connaissances.

Conclusion

Dans cette étude, nous avons montré qu'il existe un niveau élevé de reconnaissance parmi les éleveurs de poulets de chair de l'importance de Campylobacter et d'autres menaces de maladies. Tous les participants ont compris leur responsabilité dans la réduction de la colonisation par Campylobacter des troupeaux de poulets de chair commerciaux. La sensibilisation et la mise en œuvre des mesures de biosécurité déclarées par les participants se sont considérablement améliorées à la suite de l'accent mis par l'ensemble de l'industrie sur la maîtrise de Campylobacter chez les poulets de chair. L'approche de l'industrie pour lutter contre Campylobacter suscite des frustrations et la lourde responsabilité qui pèse sur les interventions au niveau de l’élevage, en particulier pour une maladie difficile à contrôler et qui n'est pas largement considérée comme affectant la santé et le bien-être des poulets. La conformité peut être améliorée en établissant des canaux de communication efficaces avec les éleveurs afin de partager les recherches scientifiques actuelles sur Campylobacter. En outre, davantage peut être fait pour éduquer les éleveurs en ce qui concerne la base de preuves soutenant les interventions actuelles en matière de biosécurité. Il est impératif que tous les acteurs de l'industrie soient invités à contribuer à tout processus décisionnel et soient impliqués dans la co-conception des interventions de biosécurité. Les éleveurs sont responsables de la mise en œuvre des interventions de biosécurité et des opportunités de développer et d'améliorer les mesures de biosécurité et la conformité globale peut être obtenue en utilisant des approches de co-conception avec la contribution des agriculteurs. Il est crucial d'exploiter l'expérience précieuse des éleveurs et de leur donner le pouvoir et l'investissement dans les objectifs de réduction de Campylobacter demandée par l'industrie. Cependant, l'accent mis dans les entretiens sur le fait que l'objectif de réduction de Campylobacter a eu un effet d'entraînement positif notable sur la mise en œuvre de la biosécurité au sein de l'industrie du poulet de chair est très positif. La reconnaissance universelle des avantages de cela en ce qui concerne la santé et le bien-être des poulets de chair et d'autres objectifs importants, tels que la réduction de l'utilisation d'antimicrobiens, laisse un héritage dont l'industrie britannique des poulets de chair peut être fière.

Aux lecteurs du blog

Grâce à la revue PROCESS Alimentaire, vous n'avez plus accès aux 10 052 articles initialement publiés par mes soins de 2009 à 2017 sur le lien suivant, http://amgar.blog.processalimentaire.com/. Triste histoire de sous ...

Une étude révèle la présence de Campylobacter chez des poulets de chair commerciaux âgés de moins de 8 jours

«Le séquençage en parallèle révèle la présence de Campylobacter chez des poulets de chair commerciaux âgés de moins de 8 jours», source Applied and Environmental Microbiology.

Résumé

Campylobacter issu de la viande de volaille contaminée est une source majeure de gastro-entérite humaine dans le monde. À ce jour, les tentatives de contrôler cette infection zoonotique avec des mesures de biosécurité à la ferme ont été incohérentes dans leurs résultats.

Une pierre angulaire de ces efforts a été la détection de l'infection du poulet par culture microbiologique, où Campylobacter n'est généralement pas détectable avant que les oiseaux n'aient au moins 21 jours.

À l'aide d'une analyse de profilage bactérien 16S basée sur une séquence en parallèle et d'un séquençage ciblé du gène porA, Campylobacter a été identifié à de très faibles niveaux dans tous les troupeaux commerciaux âgés de moins de 8 jours qui ont été testés au Royaume-Uni, Suisse et France. Ces jeunes poussins présentaient une bien plus grande diversité de types de porA que les oiseaux plus âgés testés positifs pour Campylobacter par culture ou qPCR.

Cela suggère que, comme les bactéries se multiplient suffisamment pour être détectées par des méthodes de culture, un ou deux variants, comme indiqué par le type porA, dominent l'infection.

Les résultats selon lesquels : (i) la plupart des jeunes poussins sont porteurs de Campylobacter et (ii) tous les troupeaux ne deviennent pas Campylobacter positifs par culture, suggèrent que les efforts pour contrôler l'infection, et donc éviter la contamination de la viande de volaille, devraient se concentrer sur la manière de limiter Campylobacter à faible niveaux par la prévention de la prolifération de souches isolées.

Importance

Nos résultats démontrent la présence d'ADN de Campylobacter parmi les échantillons de matières fécales d'une gamme de poussins de viande élevés commercialement qui sont âgés de moins de 8 jours, cohérents dans trois pays européens. La méthode de détection sensible récemment développée indique que l'infection se produit dans les élevages commerciaux beaucoup plus tôt et plus largement qu'on ne le pensait auparavant, ce qui ouvre de nouvelles opportunités pour contrôler la contamination par Campylobacter au début de la chaîne alimentaire et réduire les niveaux inacceptablement élevés de la maladie humaine.

A propos du séquençage massivement parallèle:

Le séquençage massivement parallèle est une approche analytique de séquençage de l’acide nucléique à haut débit qui utilise un traitement massivement parallèle pour étudier des génomes entiers, des transcriptomes et des séquences ciblées d’acides nucléiques de différentes origines, en un laps de temps relativement court. Source ISO.

Avis aux lecteurs

Voici une liste des rappels du 28 septembre 2021: 13 produits

- oxyde d’éthylène: 6

- corps étrangers: 4, quatre avis de rappel: deux avis de rappel pour tartes, tartelettes et quiches (fragments de métaux), un avis de rappel pour des escargots au raisins (morceaux de plastique souple blanc) et un avis de rappel pour des pains aux raisins beurre (morceaux de plastique souple blanc) de marque Bridor, source Auchan. Ce dernier rappel est-il un oubli de RappelConso ?

- Listeria monocytogenes: 2, salade de lentilles vertes au tofu, saumon fumé

- allergène: 1, pignon de pin (allergène pistache), source Carrefour. Oubli de RappelConso ?

Augmentation des cas d’infection à Campylobacter en Suède. Le poulet serait une source probable

«Augmentation des cas d’infection à Campylobacter en Suède. Le poulet serait la source probable», source Food Safety News.

Une augmentation du nombre de personnes malades à Campylobacter a été signalée ces dernières semaines en Suède. Depuis fin juillet jusqu'à la semaine dernière d’août, le nombre de personnes infectées par Campylobacter se situe entre 160 et 200 par semaine.

Le pic des cas humains a été précédé d'une augmentation de Campylobacter dans les troupeaux de poulets de chair, selon les données du National Veterinary Institute (SVA).

L'augmentation a été observée dans tout le pays et dans tous les groupes d'âge.

À partir de juillet, d’avantage de résultats positifs pour Campylobacter chez des poulets suédois élevés pour la production de viande ont également été enregistrés. L'infection chez l'homme et la présence dans les troupeaux de poulets de chair sont plus fréquentes en été.

Une comparaison avec les années précédentes est compliquée par l'impact de la pandémie de coronavirus mais le nombre médian de 2008 à 2019 varie entre 150 et 170 cas par semaine pour la même période, ce qui fait que les chiffres des dernières semaines n'ont que légèrement augmenté.

Cependant, l'été dernier, le nombre de cas a culminé à environ 150 pendant deux semaines lors d'une épidémie. De plus, l'effet pandémique n'est probablement pas aussi prononcé maintenant qu'il ne l'était l'année dernière.

Lien de nouveau avec la viande de poulet

Des études antérieures ont montré que les infections sont souvent liées à la viande de poulet crue, ce qui rend probable qu'une présence accrue de Campylobacter chez les poulets soit la cause de l'augmentation des cas humains, selon Folkhälsomyndigheten (l'Agence de santé publique de Suède).

Au cours des prochaines semaines, Folkhälsomyndigheten collectera des prélèvements chez des patients pour analyse et typage dans le cadre du programme de surveillance microbiologique afin d'identifier la présence de sources communes d'infection.

«Au cours des années précédentes, des comparaisons ont été faites entre Campylobacter provenant de poulet réfrigérés achetés en magasin pendant l'été avec Campylobacter provenant de cas de maladie humaine pendant la période correspondante. Ils ont montré qu'environ un tiers des cas peuvent être liés à la viande de poulet réfrigérée. Il y a beaucoup à suggérer que l'augmentation des cas chez l'homme et l'incidence dans les troupeaux de poulets de chair ont également maintenant un lien direct», a déclaré Rikard Dryselius, de Folkhälsomyndigheten.

Au total, 3 434 cas à Campylobacter ont été signalés en 2020, le nombre le plus faible depuis 1998.

Cependant, une épidémie majeure s'est produite jusqu'à la fin de l'automne et a contribué à une augmentation du nombre de personnes infectées en Suède au cours du second semestre de l'année. Il y a eu une augmentation des cas en août après qu'une proportion accrue de Campylobacter dans les troupeaux de poulets de chair a été notée. La source de l'infection était principalement liée à un grand producteur de poulets où des cages de transport mal nettoyées étaient citées comme une cause.

Approches pour prévenir et contrôler la colonisation par Campylobacter spp. des poulets de chair

«Approches pour prévenir et contrôler la colonisation par Campylobacter spp. des poulets de chair: une revue», source Environmental Science and Pollution Research (2020).

Résumé

Campylobacter, bactérie Gram négatif, est la cause la plus fréquente d'entérite bactérienne aiguë chez l'homme, tant dans les pays en développement que dans les pays développés. On pense que la volaille, en particulier les poulets de chair, est le principal hôte de l'infection humaine par Campylobacter.

La manipulation et la consommation de viande de poulet contaminée sont les modes habituels de transmission. La prévention et la réduction de la colonisation par Campylobacter dans les élevages avicoles couperont la route de la transmission de l'infection aux humains tout au long de la chaîne alimentaire.

Avec l'incidence de la résistance aux antibiotiques et l'inquiétude croissante concernant les superbactéries, la recherche d'alternatives naturelles et sûres augmentera considérablement dans les années à venir.

Dans cette revue, nous discuterons de la prévalence et des facteurs de risque de la colonisation par Campylobacter chez les poulets de chair et des sources d'infection.

Cette revue fournit également des approches approfondies et récentes pour prévenir et contrôler la colonisation par Campylobacter chez les poulets de chair, y compris des mesures de biosécurité, des additifs naturels pour l'alimentation et l'eau de boisson ayant des propriétés antimicrobiennes, des bactériocines, des bactériophages, des peptides antimicrobiens et des stratégies de vaccination pour prévenir et contrôler l'incidence des humains. campylobactériose.

Une étude néerlandaise évalue les agents pathogènes chez les poulets de chair

 

« Une étude néerlandaise évalue les agents pathogènes chez les poulets de chair », source article de Joe Whitworth paru le 22 septembre 2020 dans Food Safety News.

Deux agences aux Pays-Bas ont examiné la prévalence de certains agents pathogènes chez des poulets destinés à la production de viande.

L'étude a réaffirmé que Campylobacter, Salmonella et les bactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) dans les élevages de poulets de chair peuvent être transmis aux humains par la consommation de viande et par contact direct ou indirect.

En 2018 et 2019, l'Institut national pour la santé publique et l'environnement (RIVM) et l'Autorité néerlandaise de sécurité des produits alimentaires et de consommation (NVWA) ont enquêté sur la fréquence à laquelle ces agents pathogènes sont apparus chez les poulets de chair. L'étude a impliqué des poulets de chair dans 198 des plus de 600 fermes du pays ainsi que 132 éleveurs, membres de la famille et employés de 81 entreprises.

La viande peut être contaminée dans l'abattoir si elle entre en contact direct avec les fientes. Les consommateurs peuvent prévenir l'infection en consommant du poulet bien cuit. Il est également important d'éviter que d'autres aliments entrent en contact avec la volaille et la viande crues, ont conseillé RIVM et NVWA.

BLSE et Campylobacter principalement retrouvés

Des échantillons de fumier ont été prélevés dans toutes les élevages et analysés pour Campylobacter, E. coli producteurs de BLSE, Listeria monocytogenes et E. coli producteurs de shigatoxines (STEC). Des échantillons de poussière ont été examinés pour détecter Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM). Les résultats pour Salmonella proviennent de la surveillance régulière des troupeaux échantillonnés. Des échantillons fécaux de personnes ont été testés pour Campylobacter, E. coli producteurs de BLSE et Salmonella, tandis que des écouvillons nasaux ont été examinés pour le SARM.

Des bactéries productrices de BLSE ont été retrouvées dans des poulets de chair dans 36 pour cent des élevages. Pour les éleveurs et les membres de la famille, ces bactéries ont été retrouvées chez 7 pour cent des participants. Ceci est comparable au pourcentage de la population néerlandaise en général.

Campylobacter a été retrouvé dans près d'un tiers des élevages de poulets de chair. Ceci est comparable aux chiffres de la surveillance entre 1999 et 2002. Il a également été retrouvé chez deux participants humains.

Malgré des mesures d'hygiène telles que l'utilisation de surchaussures ou de vêtements de travail d'entreprise, la douche avant d'entrer dans les poulaillers et le nettoyage et la désinfection, la prévalence de Campylobacter chez les volailles vivantes semble difficile à réduire, selon le rapport.

L'approche modèle utilisée a montré neuf variables significativement associées à l'occurrence de Campylobacter, y compris la saison, l'âge des poulets de chair au moment de l'échantillonnage, le nombre de logements dans l’élevage et la densité de peuplement.

Résultats pour Salmonella, STEC et Listeria

La surveillance de Salmonella est effectuée dans tous les élevages de poulets de chair conformément à la législation européenne. Il a été rapporté la présence chez des poulets de chair dans 11 pour cent des élevages. Salmonella a également été retrouvé chez une personne.

La prévalence de Salmonella semble être supérieure à la moyenne européenne de 2018. Le sérotype émergent Salmonella Infantis a été retrouvé dans près de la moitié des cas, mais Typhimurium et Enteritidis n'ont pas été détectés. Le variant Java de Salmonella Paratyphi B était un autre sérotype courant.

Six facteurs de risque importants ont été relevés pour la présence de Salmonella, notamment le lavage des mains après être entré dans le poulailler, l'absence de contact avec d'autres volailles au cours des 12 dernières heures et les animaux de compagnie présents sur l’élevage. Cela montre la nécessité de suivre des mesures de biosécurité strictes pour contrôler Salmonella, selon le rapport.

Les STEC et Listeria ont été retrouvés dans très peu d'élevages de poulets de chair, ce qui signifie que les sites sont probablement moins importants dans la propagation de la Listeria et des STEC et présentent un risque limité. Ils ont été détectés sur 1 pour cent pour Listeria, ou moins pour les STEC, des élevages étudiés.

Des STEC ont été isolés de deux échantillons de fientes dans l'une des logements échantillonnés. L'isolat retrouvé dans les deux échantillons était le sérotype O24:H18, positif pour le gène de virulence stx2 mais négatif pour le gène eae.

Lors de la surveillance, Listeria monocytogenes a été retrouvé dans deux élevages. La prévalence de Listeria chez les poulets de chair aux Pays-Bas n'avait pas été étudiée auparavant.

Le SARM n'a été retrouvé dans aucune des 190 fermes de poulets de chair étudiées, mais des inquiétudes ont été soulevées quant au fait que la méthode n'était pas assez sensible. Il a été détecté dans l'écouvillon nasal de quatre personnes.

La Suède enquête sur une augmentation du nombre de cas à Campylobacter

« La Suède enquête sur une augmentation du nombre de cas à Campylobacter », source article de Joe Whitworth paru le 22 août 2020 dans Food Safety News.

Les responsables de la santé publique en Suède ont noté une augmentation du nombre de personnes souffrant d'infections à Campylobacter ce mois-ci.

L'augmentation coïncide avec une augmentation de Campylobacter dans les troupeaux de poulets de chair depuis la fin juillet, selon Folkhalsomyndigheten (Agence de santé publique de Suède).

Cette agence, les unités régionales de contrôle des infections, l'Institut national vétérinaire (SVA), Livsmedelsverket (Agence nationale des aliments), le Conseil suédois de l'agriculture et l'Autorité suédoise de l'environnement de travail enquêtent sur les causes de l'augmentation et tentent de réduire le nombre de cas.

Au cours des quatre semaines précédant l'augmentation, le nombre de cas signalés d'infections domestiques ou pour lesquels des informations sur le pays d'infection manquaient était de 88 cas à la semaine 28 début de juillet, 77 pour la semaine 29, 88 pour la semaine 30 et 94 pour la semaine 31. À la semaine 32, début août, les infections sont passées à 149 et à 161 pour la semaine 33.

Enquêter sur l'augmentation soudaine des cas d’infection

La hausse a touché différentes régions du pays mais un comté, Sörmland, a eu 12 cas en juillet et il y en a déjà eu 19 en août.

Rikard Dryselius, microbiologiste à Folkhalsomyndigheten, a dit que l'augmentation générale est observée dans la plupart des comtés de Suède, en particulier dans ceux dont la population est suffisamment nombreuse.

« Nous ne savons pas encore s'il s'agit d'une épidémie ou non. Les informations dont nous disposons sont une augmentation soudaine du nombre de cas humains qui, selon l'Institut national vétérinaire suédois, fait suite à une augmentation soudaine parmi les grands troupeaux de poulets de chair. La saisie est en cours et des comparaisons seront effectuées », a-t-il déclaré à Food Safety News.

Le SVA publie chaque semaine des informations sur la proportion de troupeaux positifs à Campylobacter. Cela montre une augmentation pour les semaines 29, 30 et 31.

L'infection à Campylobacter est plus fréquente en été, mais l'augmentation survient après une période où l'incidence a été exceptionnellement faible. La prévalence de Campylobacter dans les troupeaux de poulets de chair a été très faible pendant la première moitié de l'année.

« La pandémie de COVID-19 est une explication plausible des faibles chiffres, car des tendances similaires ont également été observées pour d'autres maladies, que nous avons l'intention d'étudier plus en détail. Une explication supplémentaire pourrait également être le faible niveau de troupeaux de poulets de chair positifs à Campylobacter, comme vous pouvez le voir dans les statistiques de SVA », a dit Dryselius.

S'attaquer au problème de Campylobacter

Au cours des trois dernières années, Folkhalsomyndigheten et Livsmedelsverket ont comparé Campylobacter dans des poulets réfrigérés acheté dans les magasins pendant l'été avec Campylobacter isolés de cas humains pendant la période correspondante.

Ce travail a révélé qu'environ un tiers des cas pourraient être liés à la viande de poulet et la majorité au poulet suédois élevé de manière conventionnelle.

Selon Folkhalsomyndigheten, des preuves à ce jour suggèrent que l'augmentation des cas d’infection et la fréquence plus élevée dans les troupeaux de poulets de chair sont également liées à cette occasion.

Dans le cadre de l'enquête, Folkhalsomyndigheten et l'Institut national vétérinaire analyseront des échantillons de Campylobacter provenant de patients et de troupeaux de poulets de chair.

Au total, 8 132 cas de campylobactériose ont été rapports en 2018, contre 10 608 en 2017. La plupart sont considérés comme sporadiques, mais au cours des dernières années, plusieurs éclosions importantes liées au poulet produit dans le pays se sont produites. En 2016 et 2017, le pays a connu une importante épidémie causée par le poulet suédois avec environ 5 000 cas de plus signalés entre août 2016 et mai 2017 que la normale.

Les personnes infectées ont généralement une diarrhée souvent sanglante, de la fièvre et des crampes d'estomac. Des nausées et des vomissements peuvent survenir. Les symptômes commencent généralement deux à cinq jours après l'ingestion de Campylobacter et durent environ une semaine.

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous

Allemagne : Résultats 2019 du programme de lutte contre Salmonella, selon un avis du BfR

« Programme de lutte contre Salmonella, résultats 2019: Salmonella Enteritidis et Salmonella Typhimurium chez les poules pondeuses en rémission », source Avis du BfR n°034/2020 du 28 juillet 2020.

Dans le cadre du programme européen de lutte contre Salmonella, les États membres établissent un rapport annuel sur la proportion de troupeaux positifs à Salmonella dans les volailles reproductrices (Gallus gallus), les poules pondeuses, les poulets de chair et les dindes reproductrices et d'engraissement. Pour le rapport national, les Länder allemands ont transmis les résultats de leurs enquêtes aux autorités fédérales compétentes pour évaluation depuis 2007. Ces données sont utilisées pour établir le rapport annuel sur le programme de contrôle de l'Institut fédéral allemand pour l'évaluation des risques (BfR) .

L'évaluation des données pour 2019 montre une occurrence (prévalence) comparable de Salmonella pour toutes les espèces animales et tous les types de production (troupeaux de poules reproductrices, poules pondeuses, poulets de chair, dindes reproductrices et dindes) considérée dans le rapport, par rapport à l'année précédente. En ce qui concerne les types de Salmonella pertinents pour le contrôle (sérovars), les objectifs de contrôle ont été atteints pour tous les groupes de volailles considérés. Conformément aux exigences du droit communautaire, les sérotypes de Salmonella pertinents pour le contrôle doivent être détectables dans un maximum de 1% ou 2% (poules pondeuses) des troupeaux examinés.

Résumé

Les résultats transmis par les Länder fédéraux dans le cadre des programmes de contrôle conformément au règlement (CE) n°2160/2003 ont été résumés pour rapport au niveau fédéral. Pour 2019, ils documentent une prévalence comparable ou légèrement réduite de Salmonella pour toutes les espèces animales et types de production considérés par rapport à l'année précédente. En ce qui concerne les sérotypes pertinents pour le contrôle, la valeur cible communautaire a été atteinte pour tous les groupes de volailles inclus dans les programmes de contrôle. Pour les poules reproductrices, les poulets de chair ainsi que les dindes reproductrices et d'engraissement, une prévalence de moins de 1% a été atteinte pour les sérotypes pertinents pour le contrôle, pour les poules pondeuses, la prévalence de 0,8% était inférieure à la valeur cible de 2%.

S. Enteritidis et/ou S. Typhimurium ont été signalés pour toutes les espèces animales et tous les types de production en 2019. S. Infantis a de nouveau été détecté uniquement chez les poulets de chair, mais pas dans les troupeaux reproducteurs. Chez les poulets de chair, ce sérovar ne fait pas partie des sérotypes pertinents pour le contrôle.

Salmonella a été détecté dans 0,9% des troupeaux reproducteurs en 2019, 0,4% des troupeaux ont été testés positifs pour un sérovar pertinent pour le contrôle. Par conséquent, la situation ne s'est pas améliorée en 2019.

Il n'y a pas eu de baisse de la prévalence de Salmonella dans les troupeaux de poules pondeuses en 2019, mais au lieu de cela, il y a eu une réduction de la prévalence des sérotypes pertinents pour le contrôle. Cela a affecté à la fois S. Enteritidis et S. Typhimurium.

Aucun changement de la prévalence de Salmonella et de la détection des sérotypes de S. Enteritidis et S. Typhimurium pertinents pour le contrôle n'a été observé chez les poulets de chair en 2019. Comme les années précédentes, les poulets de chair ont dominé les sérotypes non pertinents pour le contrôle dans toutes les études.

En 2019, aucune Salmonella n'a été retrouvé dans les troupeaux de dindes reproductrices.

La prévalence observée de Salmonella (0,4%) dans les troupeaux de dindes d'engraissement a de nouveau légèrement diminué en 2019 après avoir augmenté à 0,7% l'année précédente. La détection de S. Typhimurium mais pas de S. Enteritidis a de nouveau été signalée. Cela coïncide avec les observations des années précédentes.

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous !

Une étude danoise montre que les infections à Campylobacter font souvent partie d’épidémies

« Une étude danoise montre que les infections à Campylobacter font souvent partie d’épidémies », source article de Joe Whitworth paru le 17 mars 2020 dansFood Safety News.

Selon une étude réalisée au Danemark, une grande partie des infections à Campylobacter ne sont pas sporadiques et peuvent être liées à des épidémies.

Les éclosions à Campylobacter sont rarement signalées, ce qui peut refléter les limites des tests de surveillance car le typage moléculaire n'est pas systématiquement effectué.

Des chercheurs ont séquencé le génome complet de 1 509 isolats de Campylobacter jejuni provenant de 774 patients et 735 sources alimentaires ou animales au Danemark de 2015 à 2017 pour déterminer la fréquence des cas groupés génétiques parmi les patients et pour trouver des liens avec des isolats provenant de viande de volaille, de poulets de chair, de bovins, de porcs et de chiens. Les 774 isolats de Campylobacter jejuni représentaient environ 10% des cas au cours de la période.

Les travaux, publiés dans Emerging Infectious Diseases, Whole-Genome Sequencing to Detect Numerous Campylobacter jejuni Outbreaks and Match Patient Isolates to Sources, Denmark, 2015–2017, ont trouvé de nombreux cas groupés puisque 366 des 774 isolats cliniques formaient 104 cas groupés ou clusters de plus de deux isolats.

Un total de 41 cas groupés de patients représentant 54% des patients correspondaient à une source potentielle, principalement des poulets ou des poulets de chair domestiques.

Trouver l’origine des petits clusters

Les isolats cliniques ont été fournis par quatre laboratoires de microbiologie clinique : l'hôpital universitaire d'Aalborg, l'hôpital Slagelse, l'hôpital universitaire Hvidovre et l'hôpital universitaire Odense. Ces laboratoires ont diagnostiqué environ 60% des cas à Campylobacter au Danemark.

Les isolats cliniques représentaient 673 cas d’infection acquises au pays, 60 cas d’infection associés aux voyages et 41 cas chez des personnes dont le statut de voyage était inconnu. Une grande partie des isolats cliniques correspondaient à ceux des poulets de chair domestiques et du poulet ou de la viande de poulet importée, confirmant que le poulet est une source majeure d'infections humaines.

Cas groupés importants et cas groupés petits et cas sporadiques. Cliquez sur l'image pour l'agrandir.

Des isolats de Campylobacter jejuni provenant d'aliments et d'animaux ont été collectés par la Danish Veterinary and Food Administration. Au total, 735 isolats représentaient des animaux du Danemark, dont 27 porcs, 214 bovins et 150 poulets de chair ou viande au détail, comme 172 poulets domestiques, 111 poulets importés, neuf dindons importés, quatre canards domestiques et 22 canards importés.

Au total, 82 cas groupés étaient petits avec deux à quatre isolats cliniques et 22 cas groupés étaient grands qui comprenaient de cinq à 17 isolats cliniques. Deux seulement n'étaient pas associés à une source. En revanche, parmi des petits nombres de cas groupés, moins d'un tiers correspondait à un isolat source.

Les chercheurs ont dit que cela indique que la viande de poulet et les poulets de chair domestiques ne sont pas des sources dominantes des petits nombres de cas groupés et suggèrent qu'ils peuvent provenir d'aliments importés, d'aliments à moindre charge de contamination, de petits lots d'aliments moins largement distribués ou de sources non alimentaires telles que le contact direct avec les animaux ou des expositions environnementales.

Séquençage du génome entier et épidémiologie

Les scientifiques disent que le séquençage du génome complet ou WGS est un outil précieux pour améliorer la surveillance et la détection des épidémies à Campylobacter, mais une limite est la détection des épidémies multi-souches.

Les chercheurs ont trouvé deux exemples pour lesquels des cas groupés génétiquement distincts pourraient être liées par des données épidémiologiques. Le premier était une éclosion dans laquelle 14 isolats ont été séquencés dans le cadre d'une investigation. Ces isolats se sont divisés en deux cas groupés distincts respectivement de huit et six isolats cliniques. L'épidémie multi-souches a impliqué 100 écoliers à qui on avait servi du lait non pasteurisé dans une exploitation laitière.

Dans le second exemple, un échantillon d'un patient était positif pour deux souches appartenant à des cas groupés distincts. Les deux cas groupés ont été observés pour la même période de 2016, et chacun des isolats appariés provenait de la viande de poulets domestiques et de poulets de chair en quelques semaines et contenait des isolats cliniques des quatre régions. Les deux isolats provenant de poulets de chair représentant chacun des cas groupés provenaient du même abattoir; les poulets provenaient de deux élevages géographiquement proches.

Au total, 75 cas groupés contenaient des isolats d'origine clinique et alimentaire ou animale. Les isolats cliniques correspondaient le plus souvent à des isolats provenant de viande de poulets domestiques, de poulets de chair ou des deux, correspondant à 25 pour cent de tous les isolats cliniques de l'étude.

La viande de poulet et les isolats de poulets de chair d'un même groupe étaient souvent liés au même abattoir et certains provenaient du même élevage. Cependant, il était également courant que les isolats de cas groupés proviennent de différentes élevages.

Les cas groupés provenaient souvent de la détection d'un isolat alimentaire ou animal, suivis de la présence de plusieurs isolats cliniques sur quelques mois. Dans certains cas, le type de cas groupé a disparu pendant des mois et est réapparu plus tard chez de nouveaux patients.

Le travail a conduit à une surveillance continue basée sur des prélèvements de ≈10% des patients et il a démarré au Danemark pour détecter de grandes épidémies et les relier à des sources alimentaires ou animales afin de réduire l'incidence des infections à Campylobacter.