Les distributeurs britanniques informent de la présence de Campylobacter chez le poulet pour 2023

C’est une chose inconnue chez nous mais pas au Royaume-Uni où «Les distributeurs britanniques informent de la présence de Campylobacter chez le poulet pour 2023», source article de Joe Whitworth paru le 31 octobre 2023 dans Food Safety News.

Les supermarchés du Royaume-Uni ont rapporté des résultats nuancés de la présence et du dénombrement de Campylobacter chez le poulet pour les deux premiers trimestres de 2023.

Le niveau cible maximum de la Food Standards Agency (FSA) va jusqu'à 7% des oiseaux avec plus de 1 000 unités formant colonie par gramme (UFC/g) de Campylobacter.

Les données des distributeurs couvrent le premier semestre 2023 et font état de concentrations élevées de Campylobacter dans des poulets réfrigérés achetés en magasin et produits au Royaume-Uni.

Les résultats chez Morrisons, Asda et Sainsbury’s ont augmenté tandis que Marks and Spencer a enregistré des niveaux plus faibles. Le pourcentage de positifs variait selon les trimestres chez Waitrose et Lidl et restait le même pour Co-op.

Campylobacter est la cause la plus fréquente d’intoxication alimentaire bactérienne au Royaume-Uni, et la dose nécessaire pour rendre les gens malades peut être aussi faible que quelques centaines de cellules.

Tesco a cessé de publier des données car il a modifié la façon dont il surveille l'agent pathogène chez le poulet, de sorte que les résultats ne sont pas comparables à ceux d'autres distributeurs. Aldi n'a pas mis à jour sa page internet correspondante, ni fourni les chiffres lorsque la Food Safety News lui a demandé de le faire.

Résultats par distributeur

Morrisons avait 2,3% de 86 poulets au niveau le plus contaminé d'avril à juin et 2,4% sur 84 échantillons de janvier à mars 2023, contre 2% au quatrième trimestre 2022.

Lidl a enregistré près de 4% d'oiseaux dans la catégorie la plus élevée d'avril à juin et 2% de janvier à mars 2023. Ce chiffre était d'environ 3% fin 2022.

Marks and Spencer n'a eu aucun échantillon au seuil supérieur d'avril à juin. Le distributeur n’en avait également aucun au-dessus de 1 000 UFC/g en janvier et 1% chacun pour février et mars 2023 sur 376 prélèvements. Cela se compare à 1% dans la catégorie maximale en octobre, novembre et décembre pour le même nombre de poulets prélevés.

Asda a signalé que 3,6% des échantillons étaient supérieurs à 1 000 UFC/g au premier trimestre 2023 et 3,5% au deuxième trimestre. Cela se compare à aucun poulet à ce niveau au dernier trimestre de 2022.

Les résultats de Sainsbury’s pour Campylobacter au premier trimestre 2023 ont montré que 3% des poulets présentaient des niveaux supérieurs à 1 000 UFC/g, contre 1% au deuxième trimestre 2023 et 1% au quatrième trimestre 2022.

Co-op a poursuivi sa série de résultats montrant qu'aucun poulet testé n'était contaminé à des niveaux supérieurs à 1 000 UFC/g. La dernière fois qu’un échantillon avait des niveaux aussi élevés, c’était au troisième trimestre 2021.

Waitrose and Partners a enregistré 2% de tests positifs pour Campylobacter à des niveaux supérieurs à 1 000 UFC/g d’avril à juin, contre 4% de janvier à mars 2023 et 2% au dernier trimestre 2022.

«La clé de nos bons résultats continue de résider dans le travail incroyablement acharné de nos agriculteurs et de nos fournisseurs, combiné à notre collecte et analyse rigoureuses des données, en enquêtant sur le poulet à la fois à l'usine et dans les rayons des supermarchés», a déclaré un porte-parole de Waitrose and Partners.

Une étude révèle la présence de Campylobacter chez des poulets de chair commerciaux âgés de moins de 8 jours

«Le séquençage en parallèle révèle la présence de Campylobacter chez des poulets de chair commerciaux âgés de moins de 8 jours», source Applied and Environmental Microbiology.

Résumé

Campylobacter issu de la viande de volaille contaminée est une source majeure de gastro-entérite humaine dans le monde. À ce jour, les tentatives de contrôler cette infection zoonotique avec des mesures de biosécurité à la ferme ont été incohérentes dans leurs résultats.

Une pierre angulaire de ces efforts a été la détection de l'infection du poulet par culture microbiologique, où Campylobacter n'est généralement pas détectable avant que les oiseaux n'aient au moins 21 jours.

À l'aide d'une analyse de profilage bactérien 16S basée sur une séquence en parallèle et d'un séquençage ciblé du gène porA, Campylobacter a été identifié à de très faibles niveaux dans tous les troupeaux commerciaux âgés de moins de 8 jours qui ont été testés au Royaume-Uni, Suisse et France. Ces jeunes poussins présentaient une bien plus grande diversité de types de porA que les oiseaux plus âgés testés positifs pour Campylobacter par culture ou qPCR.

Cela suggère que, comme les bactéries se multiplient suffisamment pour être détectées par des méthodes de culture, un ou deux variants, comme indiqué par le type porA, dominent l'infection.

Les résultats selon lesquels : (i) la plupart des jeunes poussins sont porteurs de Campylobacter et (ii) tous les troupeaux ne deviennent pas Campylobacter positifs par culture, suggèrent que les efforts pour contrôler l'infection, et donc éviter la contamination de la viande de volaille, devraient se concentrer sur la manière de limiter Campylobacter à faible niveaux par la prévention de la prolifération de souches isolées.

Importance

Nos résultats démontrent la présence d'ADN de Campylobacter parmi les échantillons de matières fécales d'une gamme de poussins de viande élevés commercialement qui sont âgés de moins de 8 jours, cohérents dans trois pays européens. La méthode de détection sensible récemment développée indique que l'infection se produit dans les élevages commerciaux beaucoup plus tôt et plus largement qu'on ne le pensait auparavant, ce qui ouvre de nouvelles opportunités pour contrôler la contamination par Campylobacter au début de la chaîne alimentaire et réduire les niveaux inacceptablement élevés de la maladie humaine.

A propos du séquençage massivement parallèle:

Le séquençage massivement parallèle est une approche analytique de séquençage de l’acide nucléique à haut débit qui utilise un traitement massivement parallèle pour étudier des génomes entiers, des transcriptomes et des séquences ciblées d’acides nucléiques de différentes origines, en un laps de temps relativement court. Source ISO.

Avis aux lecteurs

Voici une liste des rappels du 28 septembre 2021: 13 produits

- oxyde d’éthylène: 6

- corps étrangers: 4, quatre avis de rappel: deux avis de rappel pour tartes, tartelettes et quiches (fragments de métaux), un avis de rappel pour des escargots au raisins (morceaux de plastique souple blanc) et un avis de rappel pour des pains aux raisins beurre (morceaux de plastique souple blanc) de marque Bridor, source Auchan. Ce dernier rappel est-il un oubli de RappelConso ?

- Listeria monocytogenes: 2, salade de lentilles vertes au tofu, saumon fumé

- allergène: 1, pignon de pin (allergène pistache), source Carrefour. Oubli de RappelConso ?

COVID-19: Durée de la présence d'ARN viral dans différentes sécrétions chez des patient

Deux études, entre autres, tentent de démêler la persistance d'ARN viral du SRAS-CoV-2, responsable du COVID-19, chez des patients, pas simple du tout ...

Persistance d’ARN viral dans des prélèvements de selles de patients se remettant de COVID-19

La PCR a des limites et l'isolement des patients pendant un mois ou plus peut ne pas être possible ;

L'isolement a longtemps été considéré comme le moyen de protection le plus efficace contre la propagation des maladies infectieuses et, pendant la pandémie actuelle de COVID-19, des milliers de patients potentiellement infectés ont été isolés dans le monde. Différentes opinions existent sur la durée de l'isolement, notamment parce que les données sur la persistance et l'infectiosité du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) dans divers fluides corporels sont rares.

Dans l'étude liée, Zheng et ses collègues décrivent la dynamique de la charge virale chez 96 patients atteints du SRAS-CoV-2.

Les charges virales dans les prélèvements respiratoires, les selles, le sérum et l'urine ont été testées en utilisant une technique par PCR pendant quatre semaines d'hospitalisation. À la fin de ces quatre semaines, plus de la moitié des patients étaient toujours testés positifs pour le SRAS-CoV-2 dans des prélèvements respiratoires et un tiers des patients dans des prélèvements de selles en utilisant la PCR, des résultats avec des implications inquiétantes pour le contrôle de la maladie.

En revanche, tous les prélèvements d'une petite série de cas européens, y compris ceux des prélèvements nasopharyngés et des selles, sont devenus négatifs au SARS-CoV-2 en deux semaines pour tous les patients survivants. Il n'est pas clair si ces différences reflètent un état clinique différent ou des différences dans les caractéristiques des tests de PCR.

La PCR a été utilisée pour la première fois il y a plus de 30 ans dans un article décrivant une nouvelle amplification enzymatique d'acide nucléique. Depuis lors, des améliorations techniques ont fait de la PCR l'outil de choix pour l'amplification enzymatique spécifique d'acide nucléique in vitro. Une limitation importante des tests PCR, cependant, est l'incapacité de faire la différence entre la réplication virale réelle et la détection de matériel viral non viable, et donc non infectieux. Cela a été un défi clé dans les épidémies précédentes lors de l'évaluation de l'infectiosité des patients en convalescence et de la détermination de la pertinence clinique de la détection d'ARN viral dans les selles est particulièrement difficile.

Dans la maladie liée au virus Ebola, de l'ARN viral a été retrouvé dans des prélèvements de selles après l'élimination de la virémie sanguine chez les patients en convalescence, mais les tentatives de récupération du virus à partir de cultures cellulaires ont jusqu'à présent échoué.

De même, chez les patients atteints du coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS), l'ARN était généralement détecté dans les fèces, mais les essais d'isolement viral ont donné des résultats négatifs.

Au cours de la pandémie de SRAS-CoV-1 de 2002-2003, des articles des résultats positifs de PCR dans les selles ont également été signalés. Ces données, combinées à des observations de transmission indirecte à travers des surfaces contaminées et des fomites, ont conduit à suggérer une transmission fécale-orale du SRAS-CoV-1.

Alors, que pouvons-nous conclure de l'étude ? Vaut-il mieux prévenir que guérir et les patients doivent-ils être isolés tant qu'ils présentent des signes de perte d'ARN viral?

En termes de confinement de la maladie, cela pourrait être préconisé. Cependant, l'impact sur les systèmes de santé, les laboratoires de virologie et, surtout, les patients maintenus en isolement pendant au moins un mois, serait énorme.

Cependant, une hygiène méticuleuse des mains et des toilettes pourrait être justifiée et devrait réduire considérablement la pertinence clinique de l'excrétion virale des selles.

Il reste nécessaire d'accepter certaines incertitudes en ces temps difficiles et de s'appuyer sur l'amélioration clinique de COVID-19 pour éclairer les stratégies pour mettre fin à l'isolement. Cette incertitude se reflète dans les propositions d'institutions telles que les Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis, le National Health Service et le European Center for Disease Prevention and Control, qui préconisent tous des combinaisons de tests et d'autres mesures de santé publique pour réduire le risque de transmission.

Davantage de données épidémiologiques, de tests et de modélisation mathématique seront nécessaires pour comprendre pleinement la pertinence clinique de l'excrétion virale de divers fluides corporels chez les patients se remettant de COVID-19. Pendant ce temps, les décideurs politiques, les professionnels de la santé et les patients devraient continuer à coopérer afin de tirer le meilleur parti des connaissances scientifiques et cliniques disponibles pour limiter la propagation du virus, sans mettre trop de pression sur les systèmes de santé déjà poussés à leurs limites.

Référence. Persistence of viral RNA in stool samples from patients recovering from COVID-19. BMJ 2020; 369 doi: https://doi.org/10.1136/bmj.m1724 (Published 07 May 2020)

Une étude chinoise montre que l'ARN du COVID-19 est présent jusqu'à 49 jours

Une nouvelle étude publiée dans Emerging Infectious Diseases montre que le matériel génétique du SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, a été détecté dans des fluides corporels des patients COVID-19 jusqu'à 49 jours.

L'étude a été menée chez 49 patients de Guangdong, en Chine, et a évalué la présence d'ARN viral dans des prélèvements de gorge, des prélèvements nasopharyngés, des prélèvements d'expectorations et des prélèvements de matières fécales. Quarante-trois des patients avaient des cas bénins de COVID-19, tandis que 6 avaient des cas graves. Les chercheurs ont obtenu des prélèvements tous les 3 jours pendant 4 semaines.

Les auteurs ont constaté une excrétion persistante d'ARN viral dans des prélèvements d'écouvillons nasopharyngés et d'excréments.

« Le temps estimé jusqu'à la perte de la détection de l'ARN viral variait de 45,6 jours pour les prélèvements nasopharyngés à 46,3 jours pour les prélèvements de fèces dans les cas bénins, et de 48,9 jours pour les prélèvements nasopharyngés à 49,4 jours pour les prélèvements de fèces dans les cas graves, ce qui était plus long que ceux du SARS-CoV et du MERS-CoV », ont écrit les auteurs, se référant aux coronavirus responsables respectivement du SRAS et du MERS.

Les résultats sont cohérents avec les articles de cas publiés, ont conclu les auteurs. Ils ont dit que leurs résultats devraient éclairer les tests de diagnostic du COVID-19 et les mesures de prévention.