Vers la fin du gaspillage alimentaire ? Une startup du MIT enveloppe les aliments de soie pour une meilleure durée de conservation

Photos gracieusement fournies par Cambridge Crops.

« Une startup du MIT enveloppe les aliments de soie pour une meilleure durée de conservation », source MIT News.

Cambridge Crops a développé un revêtement comestible et imperceptible qui pourrait remplacer les emballages en plastique afin de préserver les viandes et les produits.

Benedetto Marelli, professeur de génie civil et environnemental au MIT, était postdoctorant au laboratoire d'Omenetto de l'Université Tufts lorsqu'il est tombé sur une nouvelle utilisation de la soie. En se préparant à un concours de cuisine à l'échelle du laboratoire dont l'unique exigence était d'incorporer de la soie dans chaque plat, Marelli a accidentellement laissé une fraise trempée de soie sur son banc: «Je suis revenu presque une semaine plus tard, et les fraises enrobées étaient encore comestibles. Celles qui n'étaient pas enduites de soie étaient complètement pourries.» Marelli, dont les recherches antérieures portaient sur les applications biomédicales de la soie, a été stupéfait. «Cela m'a ouvert un nouveau monde», ajoute-t-il. Marelli a vu sa découverte par inadvertance comme une opportunité d'explorer la capacité de la soie à résoudre le problème des déchets alimentaires.

Marelli s'est associé à plusieurs scientifiques basés à Boston, dont Adam Behrens, alors post-doctorant dans le laboratoire du professeur Robert Langer de l'Institut afin de créer Cambridge Crops. La société vise à répéter et à étendre la découverte initiale, en utilisant de la soie comme ingrédient de base pour développer des produits qui prolongent la durée de conservation de toutes sortes d'aliments périssables. La technologie de l’entreprise a un impact considérable sur la prolongation de la durée de conservation des produits entiers et coupés, des viandes, du poisson et d’autres aliments. Avec le soutien pour le démarrage et d'un capital-risque subséquent, Cambridge Crops est équipé pour accroître l'accès mondial aux aliments frais, améliorer l'efficacité de la chaîne d'approvisionnement et même permettre de nouveaux produits.

Une solution simple pour un problème complexe

Un tiers de l'approvisionnement alimentaire mondial est gaspillé chaque année, mais plus de 10% de la population souffre de la faim.

Le gaspillage alimentaire a des implications sociales, économiques et sanitaires massives qui affectent aussi bien les pays développés que les pays en voie de développement. Bien que de nombreuses technologies soient apparues visant à prolonger la longévité des aliments frais, elles utilisent souvent des modifications génétiques, des matériaux d'emballage nocifs pour l'environnement ou sont coûteuses à mettre en œuvre. «Jusqu'à présent, la majorité des innovations dans les technologies agroalimentaires sont basées sur le génie génétique, le génie végétal, le génie mécanique, l'IA et l'informatique. Il y a beaucoup de place pour innover en utilisant des matériaux, comme les nanomatériaux et les biomatériaux», explique Marelli.

Le professeur considère la technologie de la soie comme une opportunité pour réduire bon nombre de problèmes auxquels est confrontée l'industrie alimentaire sans modifier les propriétés innées des aliments eux-mêmes.

Les atouts de la soie proviennent de la simplicité naturelle du matériau, affinée par des millénaires de biologie évolutive. Cambridge Crops utilise un procédé exclusif et efficace utilisant uniquement de l'eau et du sel pour isoler et réformer les protéines naturelles de la soie. Cela rend les enduits en soie de Cambridge Crops faciles à intégrer dans les lignes de transformation des aliments existantes sans avoir besoin de nouveaux équipements coûteux ou de modifications. Une fois déposé à la surface des aliments, le revêtement en soie forme une barrière insipide, inodore et autrement imperceptible qui ralentit les mécanismes naturels de dégradation des aliments. Selon l'aliment, le résultat peut montrer une augmentation de 200% de la durée de conservation. Non seulement cela permet de réduire le gaspillage alimentaire, mais cela réduit également la pression sur les chaînes du froid, permettant aux expéditeurs de réduire les gaz à effet de serre dans les transports.

Liens avec le MIT

Cambridge Crops a acquis une avance précoce dans l'industrie après avoir remporté la première place au Rabobank-MIT Food and Agribusiness Innovation Prize en 2017, un concours pour les start-ups en démarrage parrainé par Rabobank et le laboratoire Abdul Latif Jameel Water and Food Systems (J-WAFS) et soutenu par le club étudiant MIT Food and Agriculture.

Les commentaires techniques et les relations avec l'industrie que Cambridge Crops a tiré de sa participation au concours se sont révélés inestimables pour identifier les principaux problèmes et opportunités de marché dans l'industrie alimentaire qui pourraient être résolus grâce à sa technologie de base. «C'était génial pour nous», explique le directeur général Adam Behrens. «[Le prix] était important pour faire la validation technique en plus d'avoir des propositions précoces.»

Cambridge Crops a depuis levé deux rounds de financement, dirigés ou codirigés par The Engine, qui aident à incuber les startups travaillant sur des «technologies difficiles». Ceux-ci ont été combinés avec des récompenses d'AgFunder et de plusieurs subventions du Massachusetts Clean Energy Center. Les premiers succès ont même mérité une mention dans les «Notes Gates» de Bill Gates et par une entreprise qui s’attaque naturellement au gaspillage alimentaire.

Behrens soutient que les contributions des investisseurs dépassent strictement leur valeur monétaire. «Nos investisseurs ont fait partie intégrante de notre succès initial… en ajoutant de la valeur de toutes sortes de manières - du positionnement de la marque à la stratégie globale.»

Prochaines étapes

Behrens et Marelli considèrent la technologie de Cambridge Crops comme une véritable plate-forme, allant bien au-delà de cette fraise initiale. Non seulement la technologie peut prolonger la durée de conservation des produits entiers, mais elle voit également un effet dramatique sur les les produits découpés, viandes, poissons et aliments transformés. Cambridge Crops tire parti de son large éventail d'applications pour répondre aux besoins plus larges de l'industrie alimentaire grâce à des partenariats stratégiques.

Cambridge Crops est optimiste quant au potentiel de la soie pour réduire bon nombre des défis auxquels sont confrontés les réseaux alimentaires complexes. «Nous pensons que notre technologie est une technologie qui peut réellement permettre [l'élimination des emballages alimentaires en plastique]», ajoute Behrens.

Dans la salle de classe, Marelli essaie de susciter un sentiment d'excitation au sujet du rôle de la technologie dans l'avenir de l'alimentation et de l'agriculture, comme dans sa classe au Department of Civil and Environmental Engineering class, Materials in Agriculture, Food Security, and Food Safety. «Ils voient un angle sur l'agriculture et la science des aliments auquel ils n'ont jamais pensé», explique-t-il, «et ils voient à quel point il peut s'agir d'un secteur axé sur la technologie.» Alors que Cambridge Crops se prépare au lancement commercial de sa propre technologie brevetée, elle est prête à surmonter certains des obstacles les plus difficiles auxquels sont confrontés les réseaux alimentaires mondiaux pour réduire les déchets et rendre les aliments nutritifs plus accessibles à tous.

Intérêt des phages ARN F-spécifiques comme indicateurs du danger à norovirus dans les coquillages

Voici un article d'une équipe française paru dans Applied and Environmental Microbiology, une revue de l'ASM, dont le titre est 'Modèle des bactériophages à ARN F-spécifiques afin d'étudier le comportement des norovirus humains lors de la purification des huîtres: le mécanisme principal est probablement l'inactivation plutôt que la libération'.

Résumé

Les norovirus (NoV) sont responsables de nombreuses éclosions liées aux coquillages. Des processus de purification peuvent être appliqués aux huîtres avant leur commercialisation afin de réduire la pollution fécale potentielle. Cette étape est rapidement très efficace pour réduire Escherichia coli; néanmoins, l'élimination des génomes viraux a été décrite comme beaucoup plus lente. Il est donc important d'identifier (i) les conditions de purification qui optimisent l'élimination du virus et (ii) le mécanisme impliqué. À cette fin, les effets du stress des huîtres, des nutriments et de la présence d'un concurrent potentiel à l'adhésion des NoV pendant la purification ont été étudiés à l'aide d'huîtres naturellement contaminées.

Les concentrations de NoV (génomes) et de bactériophages à ARN F-spécifiques comme indicateur viral (FRNAPH pour F-specific RNA bacteriophage; génomes et particules infectieuses) ont été régulièrement surveillées. Aucune différence significative n'a été observée dans les conditions du test. La cinétique de diminution des deux génomes viraux était similaire, montrant à nouveau le potentiel des FRNAPH comme indicateur du comportement des NoV pendant la purification.

Les valeurs de T90 (temps nécessaire pour réduire 90% du titre initial) étaient de 47,8 jours pour le génome de NoV génogroupe I, 26,7 jours pour le génome de NoV génogroupe II et 43,9 jours pour le génome des FRNAPH-II.

Inversement, la surveillance des génomes viraux n'a pas pu être utilisée pour déterminer le comportement des virus infectieux car les valeurs de T90 étaient plus de deux fois inférieures pour les FRNAPH infectieux (20,6 jours) par rapport à leurs génomes (43,9 jours). Enfin, cette étude a mis en évidence que les virus sont principalement inactivés dans les huîtres plutôt que libérés dans l'eau lors des processus de purification.

Importance

Cette étude fournit de nouvelles données sur le comportement des virus dans les huîtres en cours de purification et sur leur mécanisme d'élimination. Premièrement, une forte corrélation a été observée entre les bactériophages à ARN F-spécifiques du sous-groupe II (FRNAPH-II) et les norovirus (NoV) chez les huîtres touchées par la contamination fécale lorsque les deux sont détectés à l'aide d'approches moléculaires.

Deuxièmement, lors de l'utilisation de la RT-PCR quantitative et de la culture afin de détecter les génomes respectivement des FRNAPH-II et des FRNAPH infectieux dans les huîtres, il semble que la détection du génome fournit des informations limitées sur la présence de particules infectieuses.

La comparaison des génomes et des particules infectieuses montre que le principal mécanisme d'élimination du virus chez les huîtres est l'inactivation. Enfin, cette étude montre qu'aucune des conditions testées ne modifie la suppression du virus.

Complément

Pour ceux que cela intéresse, une réunion est organisée le le 14 septembre 2020 sur «Comment estimer le caractère infectieux des norovirus dans les coquillages ?» et découvrir les avancées du projet FEAMP OXYVIR.

Le projet a pour objectif de mettre au point une méthode permettant d’estimer la présence de norovirus infectieux dans les coquillages.

Les partenaires du projet FEAMP OXYVIR ont travaillé sur une méthode innovante qui permettra de limiter les retraits injustifiés de lots du marché, d’optimiser les systèmes de purification pour améliorer la qualité sanitaire des coquillages et d’améliorer la surveillance des produits pour les consommateurs.

Je reste septique sur « les retraits injustifiés de lots du marché », il ne suffit pas de le dire mais il faut aussi les dénoncez, dans tous les cas, programme et inscription, ici.

La sécurité sanitaire des aliments, c’est l’affaire de tous, slogan de la deuxième édition de la Journée internationale de la sécurité sanitaire des aliments

« Journée internationale de la sécurité sanitaire des aliments 2020 », source OMS.

La sécurité sanitaire des aliments, c’est l’affaire de tous

La deuxième édition de la Journée internationale de la sécurité sanitaire des aliments (JISSA) sera célébrée le 7 juin 2020 afin d’attirer l’attention et d’inspirer l’action en matière de prévention, de détection et de gestion des risques d’origine alimentaire, contribuant ainsi à la sécurité sanitaire des aliments, à la santé humaine, à la prospérité économique, à l’agriculture, à l’accès aux marchés, au tourisme et développement durable.

À la suite du succès de la première célébration de 2019, la JISSA de cette année réitère une fois de plus son appel à renforcer l’engagement visant à accroître la sécurité sanitaire des aliments, comme annoncé par la Conférence d’Addis-Abeba et le Forum de Genève en 2019, avec pour thème commun «L’avenir de la sécurité sanitaire des aliments». L’OMS, en collaboration avec l’Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO), a le plaisir de soutenir les efforts déployés par les États Membres pour célébrer la Journée internationale de la sécurité sanitaire des aliments.

Ayant pour slogan «La sécurité sanitaire des aliments, c’est l’affaire de tous», cette campagne orientée vers l’action visera à sensibiliser à la sécurité sanitaire des aliments à l’échelle mondiale, tout en appelant les pays et les décideurs politiques, le secteur privé, la société civile, les organisations des Nations Unies et le public à agir.

La sécurité sanitaire des aliments est une responsabilité collective que partagent les gouvernements, les producteurs et les consommateurs. Chacun a un rôle à jouer, de bout en bout du circuit de la ferme à la table, afin de garantir que les aliments que nous consommons sont sains et ne nuisent pas à notre santé. Avec la Journée internationale de la sécurité sanitaire des aliments, l’OMS poursuit ses efforts visant à conférer une place importante à la sécurité sanitaire des aliments dans les politiques publiques, ainsi qu’à réduire la charge des maladies d’origine alimentaire à l’échelle mondiale.

Parmi toutes les très nombreuses infographies proposées, j'ai souhaité reprendre celle qui est constante dans ses conseils, la règle des cinq clés pour des aliments sûrs, sans oublier cette vidéo complémentaire en Français !

Lorsque vous achetez des aliments prêts à consommer sur les marchés, assurez-vous que les vendeurs mettent en pratique les cinq clés de l'OMS pour des aliments sûrs qui sont:

Saviez-vous qu’on estime que 600 millions de personnes dans le monde - près d’une personne sur 10 - tombent malades après avoir consommé des aliments contaminés, et que 420 000 en meurent chaque année ?

Les enfants de moins de 5 ans supportent 40% de la charge de morbidité imputable aux maladies d’origine alimentaire.

Mais quelle idée de faire cette deuxième édition de la Journée internationale de la sécurité sanitaire des aliments un dimanche, excuse toute trouvée pour nos ministères de la santé de l'agriculture et de l'alimentation, voire de l'Anses et de la DGCCRF, pour ne pas en parler, mais lundi, il sera trop tard !

Encéphalite à tiques : première description d'un foyer de contamination d'origine alimentaire en France

L'Anses nous a informé le 18 mai 2020 de CiTIQUE : la nouvelle version de l’application est désormais disponible.

Pour améliorer la prévention des risques liés aux piqûres de tiques, l’INRAE et ses partenaires ont créé en 2017 l’application participative « Signalement Tique » dans le cadre du projet CiTIQUE auquel l’Anses participe. A partir d’aujourd’hui, une nouvelle version, plus pratique pour les utilisateurs et plus utile pour les chercheurs, est accessible à tous.

L’application gratuite « Signalement Tique » a vocation à améliorer la connaissance des tiques et des maladies associées. Impliquant citoyens et chercheurs, cette application permet de collecter des données sur la répartition géographique, le contexte des piqûres de tiques (date, zone du corps piquée, nombre de tiques implantées, type d’environnement, motif de la présence sur le lieu de piqûre, photo de la piqûre et/ou de la tique…) et les agents pathogènes qu’elles transportent.

Depuis 2007, plus de 23 500 piqûres ont déjà été recensées à l’échelle française et plus de 20 000 tiques ont été déposées dans la première et unique tiquothèque participative française. Grâce à ces données, les chercheurs savent désormais que :

• les périodes les plus à risques sont le printemps et l’automne,
• 15 % des tiques analysées sont porteuses de la bactérie à l’origine de la maladie de Lyme,
• 1/3 des piqûres signalées ont lieu dans des jardins privés ou des parcs publics.

Mais c'est d'une autre information que j'aimerais partager avec vous, grâce à une internaute vétérinaire, il s'agit d'un article paru dans La Dépêche Vétérinaire le 4 juin 2020 par la Pr Jeanne Brugère-Picoux, « Encéphalite à tiques : première description d'un foyer de contamination d'origine alimentaire en France ».

Des fromages au lait cru de chèvre seraient à l'origine d'un foyer de cas d'encéphalite à tiques chez des habitants dans l'Ain, selon l'Agence régionale de santé Auvergne-Rhône-Alpes et la préfecture du département. C'est la première fois qu'un foyer d'encéphalite à tiques d'origine alimentaire est décrit en France. La transmission de cette maladie par des produits laitiers non pasteurisés semble augmenter ces dernières années en Europe.

L'annonce, le 28 mai, d'un foyer de cas d'encéphalite à tiques (EAT) confirmé (10 cas dont un décès qui ne semble pas être directement lié à cette virose) ou probable chez 26 habitants dans l'Ain, par l'Agence régionale de santé Auvergne-Rhône-Alpes et la préfecture de l'Ain, a surtout surpris par le caractère exceptionnel de l'origine de l'infection : des fromages au lait cru de chèvre d'une exploitation agricole du bassin d'Oyonnax (ces produits auraient été consommés par au moins 50% des personnes malades).

En effet, l'EAT est l'une des zoonoses virales les plus importantes transmises par la morsure d'une tique infectée. Elle est due à un flavivirus (Tick Borne Encephalitis virus ou TBEV).

Il existe trois sous-types principaux de TBEV (européen, sibérien et extrême-oriental), le sous-type européen étant transmis principalement par la tique Ixodes ricinus (Ixodes persulcatus transmettant les autres sous-types).

La transmission alimentaire par la consommation d'un lait ou d'un produit laitier non pasteurisé provenant d'un ruminant infecté, considérée comme rare, n'avait jamais été décrite en France jusqu'à cette suspicion récente.

Exceptionnellement, une contamination au laboratoire par piqûre ou par aérosols est également possible. 

Selon l'ARS Auvergne Rhône Alpes,

Trente-deux cas de méningite lymphocytaire, encéphalites et syndromes infectieux, ont été recensés depuis le 14 avril 2020 dans une zone limitée de l'Ain chez des personnes habitant sur le bassin de la commune d’Oyonnax, dans un rayon de 30 km environ. Le pic épidémique des cas est survenu dans la semaine du 20 au 26 avril 2020. Parmi ces 32 cas, le diagnostic d'infection par le virus TBE (Tick-Borne Encephalitis) a été confirmé par le Centre National de référence des Arbovirus le 27 mai 2020 pour 14 cas. Ce virus est l’agent responsable de l’encéphalite à tiques. Les 18 autres cas sont en cours d’investigation et des tests biologiques sont réalisés pour confirmer ou infirmer le diagnostic d’encéphalite à tiques.

L’âge médian des cas est de 48 ans et 17 (53%) sont des femmes. Vingt-huit cas ont été hospitalisés ou ont consulté aux urgences, dont 2 ont été admis en unités de soins intensifs. Un cas possible présentant des comorbidités est décédé. Parmi les cas investigués, les signes les plus fréquemment rapportés sont : fièvre (78%), céphalées (52%), myalgies (35%), vertiges (30%), asthénie (21%), diarrhées (13%), vomissements (13%), troubles de la vigilance (9%) et tremblements (9%).

Trente et un des 32 cas (97%) rapportent avoir consommé du fromage ou de la faisselle de chèvre à base de lait cru en provenance du même producteur de fromages situé dans la zone de résidence des cas. La cause alimentaire de ces infections a été confirmée le 2 juin 2020 par le Centre National de référence des Arbovirus. En effet, la présence de génome du virus TBE a été identifiée dans un fromage de chèvre du producteur concerné. Un retrait-rappel des produits laitiers de ce producteur a été effectué avant même la connaissance de ce résultat. Des investigations vétérinaires sont en cours. Cet épisode de cas groupés d’encéphalite à tiques est le premier identifié en France lié à la consommation alimentaire. En revanche, la documentation de cas d’encéphalites à tiques n’est pas nouvelle en Auvergne Rhône-Alpes. Quelques rares cas sont décrits chaque année dans la région d’Annecy depuis 2003 et plus récemment dans le massif du Livradois-Forez avec la détection de 3 cas en Loire et Haute-Loire durant les étés 2017 et 2018.

L'encéphalite à tiques en augmentation constante en Europe

De 1990 à 1994, on a pu observer une augmentation des cas d'EAT dans les pays de l'espace économique européen, peut-être du fait d'une surveillance accrue, puis, de 1995 à 2009, une certaine stabilité, avec 2 000 à 4 000 cas déclarés par an.

En 2012, la maladie accompagnée de troubles nerveux est devenue à déclaration obligatoire dans l'Union européenne.

Une enquête concernant l'EAT a été réalisée sur la période de 2012 à 2016 en Europe : 23 pays de l'Union européenne ont déclaré 12 500 cas d'EAT (l'Irlande et l'Espagne ne déclarant aucun cas), dont 93% ont été confirmés (11 623) et 7% considérés comme probables (783).

Les Pays-Bas ont déclaré des cas à partir de 2016. Deux pays (République tchèque et Lituanie) ont représenté 38,6% de tous les cas signalés, malgré un effectif ne représentant que 2,7% de la population sous surveillance.

Le taux annuel de notification a fluctué entre 0,41 cas pour 100 000 habitants en 2015 et 0,65 en 2013, sans modification significative. La Lituanie, la Lettonie et l'Estonie avaient les taux de notification les plus élevés avec respectivement 15,6, 9,5 et 8,7 cas pour 100 000 habitants.

Au niveau infranational, six régions avaient des taux de notification annuels moyens supérieurs à 15 cas pour 100 000 habitants, dont cinq dans les pays baltes.

Augmentation des cas en France en 2016

Plusieurs pays avaient signalé l'augmentation des cas d'EAT sur leur territoire, notamment la Suisse qui, de 100 cas annuels déclarés ces 5 dernières années, a notifié 251 cas à la fin du mois d'octobre 20196.

En France, depuis 1968 avec la description du premier cas humain, on a surtout observé une dizaine de cas par an en région alsacienne puis, à partir de 2003, un ou deux cas en Haute-Savoie et, en 2006, un premier cas dans le Sud-Ouest (soit 1 cas pour 100 000 habitants).

Une augmentation marquée des cas d'EAT en France a été observée en 2016 : 54 cas dont 46 avec des troubles nerveux (9 malades ont gardé des séquelles pendant les 15 jours à 8 mois suivants) et une enquête sérologique montrant 5,89% de séropositifs sur 1 643 échantillons sanguins.

La région alsacienne est ainsi passée de 0,5 cas à 1,33 cas pour 100 000 habitants.

Selon l'évaluation de l'ECDC sur l'encéphalite à tiques (EAT),

L'EAT est présent dans de grandes régions d'Europe avec des taux de notification les plus élevés dans les pays d'Europe du Nord, centrale et orientale. L'EAT suit une tendance saisonnière, la plupart des cas étant généralement signalés entre juin et septembre. Le vecteur Ixodes ricinus est largement distribué en France et est présent dans la région Auvergne-Rhône-Alpes. Bien que la transmission d'origine alimentaire soit rare, elle peut survenir par la consommation de lait non pasteurisé et de produits laitiers provenant d'animaux infectés. Des investigations complémentaires sont nécessaires pour définir l'étendue de la circulation du virus dans la région.

Les personnes qui vivent ou voyagent dans des régions où l'encéphalite à tiques est endémique doivent être conscientes du risque d'exposition aux tiques, se protéger contre les piqûres de tiques et envisager la vaccination avant l'exposition, qui offre la protection la plus efficace.

La vaccination est recommandée pour les personnes qui vivent dans des zones à risque TBE ou qui visitent fréquemment les forêts et les prairies. Il a conseillé d'éviter la consommation de lait et de produits laitiers non pasteurisés dans les zones à risque à EAT.

NB : L'article s'est largement inspiré de celui de la Pr Jeanne Brugère-Picoux et je conseille vivement la lecture intégrale de l'article qui est en accès libre.

Sur le sujet on lira de l'Anses, Tiques et maladie de Lyme. Mieux connaître et combattre les agents pathogènes transmis par les tiques.

Mise à jour du 2 juillet 2020. On lira le volet encéphalite à tique dans le Bulletin de l'IHU de Marseille du 30 juin 2020, où il est rapporté,

En pratique : L’encéphalite est endémique, de mai à octobre, dans les zones rurales de plusieurs pays d’Europe Centrale et du Nord. L’encéphalite à tiques est rare en France, une vingtaine de cas sont diagnostiqués chaque année essentiellement en Alsace et en Haute Savoie. La transmission du virus se fait par piqure de tique infestée.de façon exceptionnelle une contamination peut se faire par consommation de lait cru de chèvre ou de brebis. Cette transmission n’avait jamais été décrite en France.

Il existe deux vaccins : Ticovac  et Encepur.

Une infection bactérienne mortelle chez le porc déchiffrée

« Une infection bactérienne mortelle chez le porc déchiffrée », source Université de Berne.

Les porcelets nouveau-nés meurent souvent douloureusement d'une infection d'une bactérie intestinale. Une équipe de chercheurs de trois facultés de l'Université de Berne a maintenant découvert comment la bactérie provoque des saignements intestinaux mortels. Ils ont ainsi fait une percée dans la recherche vétérinaire. Des perspectives prometteuses de vaccinations et de médicaments à usage humain se sont également ouvertes.

La bactérie Clostridium perfringens fait partie du grand genre Clostridium qui peut provoquer diverses maladies mortelles chez les animaux et les humains. Les infections à Clostridium sont répandues. Ces bactéries sont dangereuses car elles produisent des poisons extrêmement puissants (toxines) qui causent des dommages ciblés aux cellules de l'hôte. Les maladies redoutées causées par Clostridium comprennent le botulisme, le tétanos, la gangrène gazeuse et les infections intestinales, par exemple.

Le groupe d'Horst Posthaus de l'Institut de pathologie animale de l'Université de Berne étudie une infection intestinale chez les porcs causée par Clostridium perfringens. Il y a 10 ans, ils étaient déjà en mesure de démontrer que la toxine produite par la bactérie, dite toxine bêta, tue les cellules vasculaires et provoque ainsi des saignements dans l'intestin du porcelet. Jusqu'à présent, cependant, on ne savait pas pourquoi la toxine attaquait spécifiquement ces cellules et pas d'autres.

Julia Bruggisser, biochimiste et doctorante à l'Institut de pathologie animale, a maintenant réussi à résoudre l'énigme de ce mécanisme dans une collaboration interdisciplinaire entre trois facultés. Les résultats de l'étude ont été publiés dans la revue spécialisée Cell Host & Microbe.

Une molécule clé

Il y a environ cinq ans, la technicienne de laboratoire Marianne Wyder de l'Institute of Animal Pathology a découvert une molécule appelée Platelet-Endothelial Cell Adhesion Molecule-1 (PECAM-1 ou même CD31 pour faire court). Elle est située à la surface de diverses cellules et joue un rôle central dans les saignements intestinaux chez les porcelets. Le rôle réel de la molécule CD31 est de réguler l'interaction entre les cellules inflammatoires et les vaisseaux sanguins. Elle survient principalement sur les cellules situées à l'intérieur des vaisseaux sanguins (les cellules dites endothéliales).

Au cours des expériences, il a été remarqué que CD31 et la toxine bêta sont distribués presque à l'identique sur ces cellules. « Notre projet résulte de cette première observation », explique Horst Posthaus. Julia Bruggisser de l'Institute of Animal Pathology a découvert que la toxine libérée par la bactérie dans l'intestin s'attache au CD31. Comme la toxine bêta compte parmi les toxines formant des pores ou porogènes, elle perce ainsi la membrane cellulaire et tue les cellules endothéliales. Cela entraîne des dommages aux vaisseaux et des saignements dans l'intestin.

Des chercheurs de l'Université de Berne unissent leurs forces

La collaboration entre plusieurs groupes de recherche de l'Université de Berne a été essentielle à la réussite du projet. « Pour mes recherches, je travaille dans trois laboratoires de l'université. Bien que ce soit difficile, j'apprends beaucoup et surtout, c'est amusant », explique Julia Bruggisser. En plus de la pathologie animale, elle travaille également avec des groupes dirigés par Britta Engelhardt (Theodor-Kocher Institute) et Christoph von Ballmoos (Département de chimie et biochimie). «Ils avaient les bonnes questions et les bonnes idées. Nous avons pu apporter notre savoir-faire concernant CD31 et les méthodes et réactifs que nous avions développés dans l'étude», explique Britta Engelhardt. «Cela s'est parfaitement assemblé», ajoute Christoph von Ballmoos.

Meilleure prophylaxie et médicaments

La découverte permet de développer de meilleurs vaccins afin de prévenir la maladie mortelle chez le porc. «Mais nous voulons également déterminer si la fixation de la toxine bêta au CD31 sur les cellules endothéliales permet également le développement de nouvelles formes de thérapie, pour les maladies vasculaires chez l'homme par exemple. Nous avons déjà entamé plus de collaborations au sein de l'Université de Berne à cette fin», explique Horst Posthaus.

Des spores microbiennes à codes barres peuvent retracer l'origine d'objets et des produits agricoles

« Des spores microbiennes à codes barres peuvent retracer l'origine d'objets et des produits agricoles », source communiqué de Harvard Medical School.

Chaque année, environ 48 millions d'Américains tombent malades à cause de maladies d'origine alimentaire, entraînant quelque 128 000 hospitalisations et 3 000 décès, selon les Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis.

Ce problème de santé publique est aggravé par des milliards de dommages économiques liés aux rappels de produits, ce qui met en évidence la nécessité de déterminer rapidement et avec précision les sources de maladies d'origine alimentaire.

Avec la complexité croissante des chaînes d'approvisionnement mondiales pour la myriade d'aliments disponibles pour les consommateurs, cependant, la tâche de tracer l'origine exacte des articles contaminés peut être difficile.

Dans une nouvelle solution qui peut aider à déterminer l'origine des produits agricoles et d'autres biens, des scientifiques de la Harvard Medical School (HMS) ont développé un système microbien à code-barres qui peut être utilisé pour étiqueter des objets de manière peu coûteuse, évolutive et fiable.

Présentée dans Science le 4 juin, l'équipe de recherche décrit comment des spores microbiennes synthétiques peuvent être introduites en toute sécurité sur des objets et des surfaces à un point d'origine, comme un champ ou une usine de fabrication, et être détectées et identifiées des mois plus tard.

Les spores sont dérivées de la levure de boulangerie et d'une souche bactérienne commune utilisée dans une grande variété d'applications, telles que des compléments alimentaires probiotiques, et conçues pour être incapables de croître dans la nature pour éviter les effets écologiques négatifs.

«Les spores sont à bien des égards une solution à l'ancienne et ont été pulvérisées en toute sécurité sur des produits agricoles comme inoculants du sol ou des pesticides biologiques pendant des décennies. Nous venons d'ajouter une petite séquence d'ADN que nous pouvons amplifier et détecter», a dit l'auteur correspondant de l'étude, Michael Springer, professeur de biologie des systèmes à l'Institut Blavatnik de la HMS.

«Nous avons également travaillé dur pour nous assurer que ce système est sûr, en utilisant des souches microbiennes courantes et en intégrant plusieurs niveaux de contrôle», a ajouté Springer. «Nous espérons que ceal pourra être utilisé pour aider à résoudre des problèmes qui ont d'énormes implications pour la santé publique et l'économie.»

Ces dernières années, les scientifiques ont beaucoup appris sur les interactions entre les microbes et leur environnement. Des études montrent que les communautés microbiennes dans les maisons, sur les téléphones portables, sur le corps humain et plus ont des compositions uniques, similaires aux empreintes digitales. Cependant, les tentatives d'utilisation d'empreintes digitales microbiennes pour identifier la provenance peuvent prendre du temps et ne sont pas facilement évolutives.

L'utilisation de séquences d'ADN synthétisées sur mesure comme codes barres s'est avérée en principe efficace pour l'étiquetage des aliments et d'autres articles. Pour être largement utiles, les codes barres d'ADN doivent être produits à bas prix en gros volumes, persister sur des objets dans des environnements très variables, et pouvoir être décodés de manière fiable et rapide - des obstacles qui n'ont jusqu'à présent pas été surmontés car l'ADN est fragile.

Emballage robuste

Dans leur étude, Springer et ses collègues ont cherché à déterminer si les codes barres d'ADN emballés dans des spores microbiennes, qui peuvent être pulvérisés sur les cultures et identifiés des mois plus tard, pourraient aider à résoudre ces problèmes.

De nombreux micro-organismes, notamment des bactéries, des levures et des algues, forment des spores en réponse à des conditions environnementales difficiles. De façon analogue aux graines, les spores permettent aux micro-organismes de rester dormants pendant des périodes extraordinairement longues et de survivre à des conditions extrêmes telles que des températures élevées, la sécheresse et le rayonnement UV.

L'équipe de recherche a créé des séquences d'ADN sur mesure qu'elles ont intégrées dans les génomes des spores de deux micro-organismes, Saccharomyces cerevisiae, également connue sous le nom de levure de boulanger, et Bacillus subtilis, une bactérie commune et répandue qui a de nombreuses utilisations commerciales, y compris comme probiotique alimentaire, inoculant du sol et fermentant certains aliments. Ces spores peuvent être cultivées à bon marché en laboratoire en grand nombre.

Les séquences d'ADN synthétique sont courtes et ne codent pour aucun produit protéique, et sont donc biologiquement inertes. Insérées dans le génome en tandem, les séquences sont conçues pour que des milliards de codes barres uniques puissent être créés.

L'équipe a également veillé à ce que les spores à code barres ADN ne puissent pas se multiplier, croître et se propager dans la nature. Ils l'ont fait en utilisant des souches microbiennes qui nécessitent une supplémentation nutritionnelle spécifique et en supprimant les gènes nécessaires à la germination et à la croissance des spores. Des expériences impliquant des centaines de millions à plus d'un billion de spores modifiées ont confirmé qu'elles étaient incapables de former des colonies.

Pour lire les codes-barres d'ADN, les chercheurs ont utilisé un outil CRISPR peu coûteux qui peut détecter la présence d'une cible génétique rapidement et avec une sensibilité élevée. La technologie, appelée SHERLOCK, a été développée au Broad Institute du MIT et Harvard, dans le cadre d'une collaboration dirigée par les membres de l'institut James Collins et Feng Zhang.

«Les spores peuvent survivre dans la nature pendant une très longue période et sont un excellent moyen pour nous d'incorporer des codes-barres d'ADN», a déclaré le co-premier auteur de l'étude, Jason Qian, un étudiant diplômé en biologie des systèmes au HMS. «L'identification des codes barres est simple, en utilisant une source de lumière bleue, un filtre en plastique orange et un appareil photo de téléphone portable. Nous n'envisageons aucun défi pour la déployabilité sur le terrain.»

Le monde réel

L'équipe a examiné l'efficacité de leur système de spores microbiennes à code s barres à travers une variété d'expériences.

Ils ont fait pousser des plantes en laboratoire et ont pulvérisé sur chaque plante différentes spores à code barres. Une semaine après l'inoculation, une feuille et un échantillon de sol de chaque pot ont été récoltés. Les spores ont été facilement détectées, et même lorsque les feuilles ont été mélangées, l'équipe a pu identifier de quel pot provenait chaque feuille.

Lorsqu'elles ont été pulvérisées sur l'herbe à l'extérieur et exposées aux intempéries pendant plusieurs mois, les spores sont restées détectables, avec une propagation minimale en dehors de la région inoculée. Sur des environnements tels que le sable, le sol, les tapis et le bois, les spores ont survécu pendant des mois sans perte au fil du temps, et elles ont été identifiées après des perturbations telles que l'aspiration, le balayage et la simulation du vent et de la pluie.

Les spores sont très susceptibles de persister à travers les conditions d'une chaîne d'approvisionnement réelle, selon les chercheurs. À titre de preuve de principe, ils ont testé des dizaines d'articles de produits achetés en magasin pour la présence de spores de Bacillus thuringiensis (Bt), une espèce bactérienne largement utilisée comme pesticide. Ils ont correctement identifié toutes les plantes Bt positives et Bt négatives.

Dans d'autres expériences, l'équipe a construit un bac à sable de 100 mètres carrés et a constaté que la propagation des spores était minime après des mois de vent simulé, de pluie et de perturbations physiques.

Ils ont également confirmé que les spores peuvent être transférées sur des objets de l'environnement. Des spores ont été facilement identifiées sur les chaussures des personnes qui ont traversé le bac à sable, même après avoir marché pendant plusieurs heures sur des surfaces qui n'ont jamais été exposées aux spores. Cependant, les spores n'ont pas pu être détectées sur ces surfaces, ce qui suggère que les objets retiennent les spores sans propagation significative.

Cette caractéristique, a noté l'équipe, pourrait permettre aux spores d'être utilisées pour déterminer si un objet a traversé une zone inoculée. Ils l'ont testé en divisant le bac à sable en grilles, chacune étiquetée avec jusqu'à quatre spores à codes barres différentes. Des individus et une voiture télécommandée ont ensuite navigué dans le bac à sable.

Ils ont découvert qu'ils pouvaient identifier les grilles spécifiques que les objets traversaient avec un minimum de faux positifs ou négatifs, suggérant une application possible comme outil complémentaire pour la médecine légale ou l'application de la loi.

L'équipe a également examiné les implications potentielles pour la vie privée, notant que les technologies existantes telles que les colorants UV, le suivi des téléphones portables et la reconnaissance faciale sont déjà largement utilisées mais restent controversées.

«En tant que scientifiques, notre charge est de résoudre les défis scientifiques, mais en même temps, nous voulons nous assurer que nous reconnaissons les implications sociétales plus larges», a dit Springer. «Nous pensons que les spores à code barres sont les mieux adaptées aux applications agricoles et industrielles et seraient inefficaces pour la surveillance humaine.» Quoi qu'il en soit, l'utilisation et l'adoption de cette technologie devraient se faire en tenant compte des problèmes d'éthique et de confidentialité, ont déclaré les auteurs de l'étude.

Les chercheurs étudient actuellement les moyens d'améliorer le système, y compris la mise au point de mécanismes potentiellement destructeurs dans les spores, la recherche de moyens de limiter la propagation et l'examen de la possibilité d'utiliser les spores pour fournir des informations temporelles sur l'historique de localisation.

«Les épidémies d'agents pathogènes d'origine alimentaire tels que Listeria, Salmonella et E. coli se produisent naturellement et fréquemment», a dit Springer. «Des outils de biologie synthétique simples et sûrs et une connaissance de la biologie de base nous permettent de créer des choses qui ont beaucoup de potentiel pour résoudre des problèmes de sécurité réels.»

Complément. On lira l'article paru dans AAAS.org sur BarcodedMicrobes Could Track Sources of Food Contamination, dont j'ai extrait l'image en titre.

Irlande: Lavez-vous les mains mais jamais le poulet cru !

Ne jamais laver de poulet cru

« L'agence irlandaise de sécuirté des aliments réitère son message de ne pas laver un poulet cru », source Food Safety News, adapté par mes soins.

La Food Safety Authority of Ireland (FSAI) a utilisé la toile de fond de la Journée mondiale de la sécurité alimentaire pour rappeler aux consommateurs de ne jamais laver un poulet cru.

La FSAI et safefood, un groupe qui promeut la sensibilisation et la connaissance de la sécurité des aliments et de la nutrition en Irlande, ont dit que le lavage du poulet cru peut propager des bactéries responsables d'intoxication alimentaire jusqu'à une longueur d'un bras au-delà de l'évier, ce qui pourrait vous rendre malade, ainsi que d'autres personnes.

• 32% des adultes cuisinent davantage à partir de zéro en raison des restrictions liées au Covid-19,
• 49% déclarent cuisiner plus qu'auparavant,
• 40% des 18-34 ans recherchent régulièrement des recettes en ligne.

Avec plus de personnes qui cuisinent maintenant à la maison que jamais auparavant, safefood rappelle aux personnes de ne jamais laver le poulet cru lors de sa préparation.

Campylobacter est une bactérie présente dans le poulet cru. C'est la cause la plus fréquente d'intoxication alimentaire bactérienne en Irlande. En 2018, il y a eu plus de 3 000 cas notifiés en République d'Irlande, soit une augmentation de plus de 8% par rapport à 2017.

La deuxième Journée mondiale de la sécurité sanitaire des aliments, le 7 juin, est dirigée par l'Organisation mondiale de la santé (OMS) et l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO).

Une étude récente a révélé que les conseils d'experts ne sont pas pleinement adoptés par le public, tandis que les recommandations des autorités sur la surveillance de la cuisson du poulet et les pratiques des consommateurs ne garantissent pas la réduction des agents pathogènes à des niveaux sûrs.

Le ministre de la santé, Simon Harris, a dit qu'il était essentiel d'avoir l'hygiène à l'esprit lors de la préparation des aliments à la maison.

«Nous sommes beaucoup plus nombreux à cuisiner à la maison et certains d'entre nous le font peut-être pour la première fois. C'est donc le bon moment pour maintenir de bons comportements en matière d'hygiène personnelle comme le lavage des mains, pour de nombreuses raisons essentielles de sécurité - et bien sûr, la sécurité des aliments est importante.»

Ray Dolan, directeur général de safefood, a dit que les personnes préparant du poulet ne devraient jamais le laver.

«Bien que vous puissiez penser que vous le nettoyez, vous propagez en fait des bactéries nocives jusqu'à 80 centimètres de votre évier. C'est une cuisson minutieuse du poulet qui détruit en toute sécurité toutes les bactéries responsables d'intoxication alimentaire qui s'y trouvent», a-t-il dit

«Lavez-vous les mains avant et après avoir manipulé du poulet cru et lavez tous les ustensiles ou surfaces de travail qui entrent en contact avec lui pour éviter la contamination croisée dans votre cuisine. Les personnes les plus à risque de tomber malades à cause d'une intoxication alimentaire sont les très jeunes, les personnes âgées, les personnes ayant un problème de santé et les femmes enceintes.»

Rôle de l'industrie

Michael Creed, ministre de l'agriculture, de l'alimentation et de la marine, a dit qu'il était important de ne pas perdre de vue le travail accompli pour maintenir le haut niveau de sécurité des aliments, de traçabilité et d'authenticité des produits irlandais.

«Compte tenu du thème de la campagne de cette année, il est juste de reconnaître en particulier le travail du Poultry Stakeholder Group, sous la présidence du professeur Patrick Wall, qui continue de développer et d'affiner une approche globale de la ferme à la fourchette en matière de sécurité sanitaire des aliments dans ce domaine. en étroite collaboration avec mon département.»

Pamela Byrne, directrice générale de la FSAI, a dit que les entreprises alimentaires doivent être en état d'alerte élevé pour arrêter la propagation des bactéries lors de la préparation du poulet.

«La maîtrise des bactéries, telles que Campylobacter, doit être géré tout au long de la chaîne alimentaire, de la ferme à l'assiette. Les traiteurs et les distributeurs qui utilisent du poulet cru dans leurs plats doivent supposer qu'il contient des bactéries dangereuses. Aucune étape du traitement du poulet ne peut garantir l'élimination des bactéries, sauf la cuisson à des températures correctes», a-t-elle dit.

«Nous rappelons aux traiteurs et aux distributeurs leur obligation légale de suivre à tout moment les meilleures pratiques d'hygiène pour éviter la contamination croisée entre la volaille crue et les aliments prêts à consommer. Conservez toujours le poulet cru correctement et, en fin de compte, la dernière ligne de défense consiste à vous assurer que le poulet soit bien cuit. »

NB : Peut-être qu'un thermomètre peut aider ...

Il était une fois des œufs durs écalés et la secrétaire d'Etats à l'environnement ...

Mais quelle mouche a donc piquée la secrétaire d'Etat à l'environnement ou comment se faire un peu de pub en ces temps difficiles ... avec ce tweet ci-dessous, 

Sinon, pour protéger un œuf, la nature a inventé un emballage ingénieux qui s’appelle la coquille !
Bravo @Leclerc_MEL pour cette fantastique innovation 👏🏽😓
Heureusement, la #LoiAntiGaspillage va permettre la suppression de ces aberrations.#WorldEnvironmentDay2020 pic.twitter.com/WZaXuGB7m5

— Brune Poirson (@brunepoirson) June 5, 2020

La Voix du Nord nous explique cette 'sortie' de la secrétaire d'Etat,

Alors que sa loi contre le gaspillage et pour une économie circulaire a été promulguée le 11 février dernier, Brune Poirson a épinglé ce 5 juin un magasin Leclerc de Concarneau, dans le Finistère, pour un emballage en plastique d’œufs durs proposés à la vente. « Il y a deux éléments que l’on voit dans cette photo, explique-t-on au cabinet de Brune Poirson auprès du Figaro. D’abord le socle noir très certainement en polystyrène expansé comme les boîtes de kebab, et qui sera interdit dès le 1er janvier 2021. Ensuite le film étirable, qui est techniquement recyclable, mais pas forcément partout dans les faits puisque la filière de recyclage n’est pas encore déployée sur tout le territoire. »

Vous voyez comme c'est clair … et un petit tour aux rayons viande et volaille d'un supermarché lui aurait montré que les barquettes en polystyrène expansé et film étirable sont légions … mais à quoi bon ...

«La loi anti-gaspillage permettra à l’État de mettre en place des systèmes de bonus-malus en fonction de critères environnementaux des différents matériaux utilisés dans les emballages. Cela pourra faire varier les coûts de production de plus ou moins 20%», poursuit-on dans l’entourage de la secrétaire d’État.

Le bonus-malus de la loi anti-gaspillage même quand il n'y a pas de filière de recyclage ?

Le 10 mars dernier, rappelle Le Figaro, Brune Poirson avait également épinglé le géant français de l’agroalimentaire Fleury Michon, toujours sur Twitter, pour l’une de ses salades proposée dans une boîte en plastique non recyclable.

Dans la soirée, Michel-Edouard Leclerc a réagi. Il a évoqué «une bourde» dans ce magasin breton.

Ce qui est curieux dans cette affaire est que rien de ce qui a été entrepris par E.Leclerc n'est interdit !

Selon ce guide la DGCCRF sur les Spécifications techniques applicables aux œufs et aux ovoproduits, à propos des œufs durs écalés, il est rapporté,

Les œufs subissent une cuisson, un refroidissement puis un écalage avant d’être conditionnés. Les œufs durs sont prêts à l’emploi. Lorsqu’ils sont présentés dans un liquide de couverture, un égouttage et un rinçage peuvent s’avérer nécessaires pour éliminer le goût légèrement acide

Parmi les principaux produits existant sur le marché, il existe des œufs sous atmosphère modifiée … d'où la nécessité d'une barquette et d'un film plastique ...

Moralité, il faut se méfier d'une secrétaire d'Etat à l'environnement qui ne sait pas quoi faire de son temps pour exister ...

Mise à jour du 16 juin 2020. On lira sur le blog de seppi, Les « étranges » méthodes de Mme Brune Poirson : M. Michel-Édouard Leclerc répond poliment mais fermement...