Efficacité de 23 désinfectants couramment utilisés contre des isolats de Candida auris

«Des désinfectants sporicides plus efficaces contre Candida auris», source article de Chris Dall paru le 2 août 2023 dans CIDRAP News.

Selon une étude publiée dans Infection Control & Hospital Epidemiology, des essais effectués par une équipe de chercheurs du Louis Stokes Cleveland VA Medical Center indiquent que les désinfectants sporicides sont plus efficaces contre le pathogène fongique multirésistant Candida auris que les désinfectants à base d'ammonium quaternaire.

Pour l'étude, les chercheurs ont testé 23 désinfectants utilisés pour nettoyer et désinfecter les surfaces dans 57 établissements de santé dans 30 États des États-Unis. Les produits comprenaient des désinfectants à base de chlore et d'acide peracétique, qui sont sporicides, et des désinfectants à base d'ammonium quaternaire et de peroxyde d'hydrogène, qui ne le sont pas.

Pour tester leur efficacité contre C. auris, les chercheurs ont utilisé une charge de souillure en trois parties contenant des isolats de quatre clades phylogénétiques de C. auris, y compris la souche AR-0385 du clade 4 résistante aux médicaments, et une souche de Candida albicans, puis ils ont cultivé les surfaces souillées après traitement.

Les désinfectants ont été classés comme efficaces si une réduction supérieure à 5 log₁₀ de C. auris était obtenue.

Dans l'ensemble, cinq désinfectants à base de chlore et un désinfectant à base d'acide peracétique ont systématiquement réduit toutes les souches de C. auris et de C. albicans de 5 log₁₀ ou plus, tout comme trois nettoyants à base de peroxyde d'hydrogène. Mais les désinfectants à base d'ammonium quaternaire étaient largement inefficaces. Un seul produit a réduit les souches de C. auris de plus de 5 log₁₀, mais il n'a pas été efficace contre la souche AR-0385 résistante aux médicaments.

Les pratiques actuelles peuvent ne pas suffire

Les auteurs de l'étude disent que si des études dans le monde réel sont nécessaires, les résultats sont importants car les désinfectants à base d'ammonium quaternaire sont largement utilisés dans les établissements de santé américains, qui ont connu une augmentation spectaculaire de la colonisation et de l'infection par C. auris ces dernières années.

«Le fait que de nombreux patients atteints de C. auris soient colonisés et détectés uniquement par dépistage augmente la probabilité que des cas non reconnus puissent entrer dans des établissements où les pratiques de nettoyage et de désinfection peuvent ne pas être suffisantes pour limiter la propagation», ont-ils écrit.

Des chercheurs découvrent Candida auris résistant aux antibiotiques et souvent mortels dans les oreilles de chiens

«Des chercheurs découvrent des champignons résistants aux antibiotiques et souvent mortels vivant dans les oreilles de chiens », source Université McMaster.

Des scientifiques de l'Université McMaster et de l'Université de Delhi en Inde ont découvert et isolé la première culture vivante de l'agent pathogène résistant aux antibiotiques, Candida auris, d'un animal, en particulier des conduits auditifs de chiens errants.

La découverte suggère que les animaux de compagnie pourraient agir comme des réservoirs de superbactéries, transmettant potentiellement des infections aux humains.

Signalée pour la première fois au Japon en 2009, C. auris est un type de levure qui s'est depuis répandu dans le monde entier.

Le champignon émergent peut provoquer des infections persistantes et graves et des épidémies généralisées dans les hôpitaux. Les médicaments antifongiques ne fonctionnent souvent pas contre ce pathogène et plus d'un patient sur trois souffrant d'infections invasives graves mourra, selon certaines estimations.

L'Organisation mondiale de la santé l'a déclaré l'un des quatre agents pathogènes fongiques «prioritaires critiques» au monde.

Dans une étude publiée en ligne dans Journal of Fungi, des chercheurs ont analysé des prélèvements de peau et d'oreille de 87 chiens dans un refuge de Delhi. Les écouvillons ont été analysés pour les cultures de bactéries et de champignons à l'aide de protocoles de diagnostic de routine pour les infections de la peau et des oreilles.

Parmi ceux-ci, 52 étaient des animaux errants déjà sous soins intensifs pour des lésions graves dues à des maladies cutanées chroniques. Les 35 chiens restants étaient des animaux domestiques traités pour des infections gastro-intestinales et urinaires mineures. Leurs conditions n'étaient pas liées à l'agent pathogène à l'étude.

Les chercheurs ont trouvé des preuves de C. auris dans les conduits auditifs de quatre des animaux atteints d'infections cutanées chroniques.

«Les chiens sont des animaux de compagnie communs. Même si C. auris n'a été retrouvé que chez les chiens errants dans cette étude, il existe de nombreux chiens errants dans de nombreuses régions du monde», explique Jianping Xu, auteur principal de l'article et professeur au département de biologie de McMaster.

«Ces chiens pourraient servir de véhicules de transmission pour que C. auris atteigne d'autres animaux et les humains.»

Bien que les champignons soient des agents pathogènes importants pour les animaux, aucune culture vivante de C. auris n'avait été isolée auparavant.

Une analyse ADN a mis en évidence des similitudes génomiques entre certaines des souches trouvées chez les chiens et celles retrouvées chez l'homme, fournissant une preuve supplémentaire que la propagation de l'infection à d'autres animaux et à l'homme est un risque.

«Nous devons être vigilants dans la surveillance des chiens, des autres animaux de compagnie domestiques et des animaux sauvages dans les régions où C. auris est endémique», a dit Xu, qui est également chercheur à la Global Nexus School for Pandemic Prevention & Response de McMaster.

Bien que C. auris se propage facilement d'homme à homme, la voie de transmission entre animaux ou d'animaux à humains est beaucoup moins claire et une enquête plus approfondie est nécessaire.»

Lorsque les humains sont infectés par C. auris, les objets inanimés dans l'environnement sont facilement contaminés par l'excrétion de pélicules cutanées.

Parce que la levure a été trouvée dans le conduit auditif des chiens, par rapport à la peau exposée, l'excrétion dans l'environnement immédiat a été réduite, contenant la propagation de l'infection.

C. auris a également été découvert à la surface de pommes entreposées, dans des marais côtiers, dans des environnements à salinité extrêmement élevée et, récemment, dans des eaux usées, ce qui suggère qu'il peut survivre dans des conditions difficiles.

Les pommes et d'autres fruits peuvent héberger des levures pathogènes résistantes aux antibiotiques sur leurs surfaces

«Les pommes et d'autres fruits peuvent héberger des levures pathogènes résistantes aux antibiotiques sur leurs surfaces», source ASM News.

Lorsqu'ils sont préparés pour le transport, les pommes et autres fruits sont souvent traités avec un fongicide pour éviter l’altérioration et prolonger la durée de conservation. La pratique préserve la fraîcheur, mais c'est peut-être une arme à double tranchant: cela peut aider à sélectionner et à favoriser la transmission de levures pathogènes multirésistantes.

Une étude publiée cette semaine dans mBio, une revue en accès libre de l'American Society for Microbiology, offre de nouvelles preuves de cette idée.

«Des études antérieures ont examiné l'effet des fongicides sur le pathogène humain Aspergillus fumigatus», a dit la mycologue Anuradha Chowdhary de l'Université de Delhi, mais de nouveaux travaux se concentrent sur des souches résistantes aux antibiotiques de Candida auris, une levure pathogène qui se propage rapidement dans les hôpitaux. et a été isolé de la nature. «Les fongicides utilisés en agriculture peuvent sélectionner par inadvertance des champignons résistants aux antibiotiques», a dit Chowdhary.

Elle et ses collaborateurs ont passé au crible les surfaces de 84 fruits, représentant 9 types de fruits d'arbres différents, à la recherche de C. auris pathogènes et d'autres levures. Les fruits ont été récoltés en 2020 et 2021 dans des régions du nord de l'Inde et comprenaient 62 pommes, 20 cueillies dans des vergers et 42 achetées sur un marché de Delhi. Chaque espèce de fruit hébergeait au moins 1 type de levure.

Les scientifiques se sont concentrés sur les pommes. Ils ont trouvé des souches résistantes aux antibiotiques de C. auris sur un total de 8 pommes (13%) et ont utilisé le séquençage du génome entier pour identifier 16 colonies distinctes. Les pommes comprenaient 5 variétés ‘Red Delicious’ et 3 variétés ‘Royal Gala’. Ces 8 pommes avaient toutes été entreposées avant l'achat et aucune des pommes fraîchement cueillies n'hébergeait C. auris>«Le groupe a trouvé d'autres souches de Candida sur les pommes conditionnées», a dit le microbiologiste Jianping Xu de l'Université McMaster à Hamilton, Ontario. Xu a codirigé l'étude avec Chowdhary.

C. auris est résistant à de nombreux antibiotiques. Il a été identifié pour la première fois en 2009 au Japon, et depuis lors, il a émergé ou s'est propagé à tous les continents habités. Les chercheurs ont étudié l'origine et la propagation du pathogène. «Nous ne comprenons toujours pas vraiment les forces qui conduisent à l'émergence simultanée de plusieurs groupes génétiques distincts de C. auris», a dit Xu. Une étude menée par Chowdhary et Xu publiée l'année dernière dans mBio a été la première à isoler C. auris d'un environnement naturel, les marais et les plages de sable d'un écosystème côtier naturel des îles Andaman, Inde.

Les nouvelles découvertes suggèrent que les pommes pourraient être une force sélective du pathogène et l'aider à se propager. Bien que l'étude se soit concentrée sur des fruits récoltés dans le nord de l'Inde, Xu a souligné que la propagation de C. auris n'est pas un phénomène spécifique à l'Inde. C'est une menace mondiale: en 2019, le Centers for Disease Control and Prevention ont identifié C. auris comme l'un des 5 pathogènes qui constituent une menace urgente pour la santé publique dans le monde. Pour comprendre comment répondre à la menace du pathogène pour l'homme, les chercheurs doivent savoir comment il se déplace à travers d'autres systèmes naturels.

«Lorsque nous examinons les pathogènes humains, nous avons tendance à regarder ce qui nous est immédiat», a dit Xu. «Mais nous devons voir cela plus largement. Tout est connecté à tout le système. Les fruits ne sont qu'un exemple.»

Les champignons sont une partie importante de l'environnement, et Chowdhary a dit que la nouvelle étude montre comment l'environnement, les animaux et les humains sont tous connectés, le principe central du concept de One Health (Une seule santé) «Le concept One Health justifie des efforts continus et notre attention pour prévenir la transmission des infections», a-t-elle dit.

Aux lecteurs du blog

Je suis en conflit depuis plusieurs années avec la revue PROCESS Alimentaire pour une triste question d’argent qui permettrait de récupérer et de diffuser correctement les 10 052 articles initialement publiés gracieusement par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue, alors qu’elle a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles. Le départ du blog de la revue a été strictement motivé par un manque de réactivité dans la maintenance du blog, la visibilité de celui-ci devenant quasi nulle. J’accuse la direction de la revue de fuir ses responsabilités et le but de ce message est de leur dire toute ma colère. Elle ne veut pas céder, moi non plus, et je lui offre ainsi une publicité gratuite.

L'augmentation des infections à Candida auris pourrait être imputée au réchauffement climatique

« L'augmentation de Candida auris pourrait être imputée au réchauffement climatique », source ASM News.

Selon une nouvelle étude publiée dans mBio, une revue en accès libre de l'American Society for Microbiology, le réchauffement de la planète pourrait avoir joué un rôle déterminant dans l'émergence de Candida auris.

C. auris, qui est souvent multirésistant aux antibiotiques, constitue une menace sérieuse pour la santé publique, et est peut être le premier exemple d'une nouvelle maladie fongique résultant du changement climatique.

« L’argument que nous avançons sur la base de la comparaison avec d’autres champignons proches est que, lorsque le climat s’est réchauffé, certains de ces micro-organismes, dont Candida auris, se sont adaptés à des températures plus élevées et ont percé les températures protectrices de l’homme. », a déclaré Arturo Casadevall, titulaire de la chaire de microbiologie moléculaire et immunologie à l'École de santé publique Bloomberg de Johns Hopkins, Baltimore, Maryland. « Le réchauffement climatique pourrait entraîner de nouvelles maladies fongiques dont nous n’avons même pas connaissance à ce jour. »

C. auris est apparu indépendamment sur trois continents simultanément, chaque clade étant génétiquement distinct. « Ce qui est inhabituel chez Candida auris, c'est qu'il est apparu sur trois continents différents en même temps, et que les isolats provenant d'Inde, d'Afrique du Sud et d'Amérique du Sud ne sont pas liés. Quelque chose s'est passé pour permettre à ce micro- organisme de bouillonner et de provoquer des maladies. Nous avons commencé à envisager la possibilité d'un changement climatique », a dit le Dr Casadevall.

« Si les infections fongiques sont rares chez l'homme, c'est que dans la plupart des champignons dans l'environnement ne peuvent pas proliférer aux températures, ni dans notre corps. »

La résistance des mammifères aux maladies fongiques invasives résulte de la combinaison de températures de base élevées qui créent une zone de restriction thermique et des mécanismes de défense avancés de l'hôte sous forme d'immunité innée et adaptative.

Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont comparé la susceptibilité thermique de C. auris à certains de ses proches parents phylogénétiques.

Les chercheurs ont découvert que C. auris est capable de croître à des températures plus élevées que la plupart des espèces étroitement apparentées, et que la plupart des espèces apparentées ne toléraient pas les températures chez les mammifères. Selon les chercheurs, l’adaptation à des températures plus élevées est l’une des causes de l’émergence de C. auris.

« Ce que suggère cette étude est le début de l’adaptation des champignons aux températures plus élevées, et nous aurons de plus en plus de problèmes au cours du siècle », a dit le Dr Casadevall.

« Le réchauffement climatique conduira à la sélection de lignées de champignons qui sont plus tolérantes thermiquement, de sorte qu'elles puissent franchir la zone de restriction thermique des mammifères. »

Le Dr. Casadevall a dit que si de meilleurs systèmes de surveillance avaient été mis en place, la présence de C. auris aurait déjà été détectée.

« Nous devons investir dans une meilleure surveillance des maladies fongiques. Nous sommes assez doués pour surveiller la grippe et les maladies qui causent la diarrhée ou qui sont contagieuses, mais les maladies fongiques ne le sont généralement pas et personne ne s'est vraiment soucié de les documenter », a dit le Dr Casadevall.

« Si plus de champignons devaient traverser cette zone de restriction thermique, vous ne le sauriez vraiment pas avant que quelqu'un ne commence à le rapporter dans la littérature. »