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vendredi 12 novembre 2021

Malgré des progrès, les contrôles officiels du bien-être animal durant l'abattage et les opérations annexes seraient insuffisants en France

Voici le résumé d’un Rapport final d'un audit de France du 25 janvier 2021 au 5 février 2021, afin d’évaluer les contrôles du bien-être animal durant l'abattage et les opérations annexes.

Ce rapport décrit le résultat d'un audit à distance de la France réalisé du 25 janvier au 5 février 2021.

L'objectif principal de l'audit était d'évaluer l'efficacité des contrôles officiels sur les opérateurs afin de s'assurer que les animaux sont épargnés de toute douleur, détresse ou souffrance évitable pendant leur abattage et les opérations annexes.

L'audit a également évalué les mesures prises en réponse aux recommandations formulées dans le précédent rapport d'audit DG(SANTE) 2015-7427.

Le rapport conclut que les autorités françaises ont pris un large éventail de mesures pour améliorer la mise en œuvre de contrôles officiels sur le bien-être des animaux pendant l'abattage et pour traiter la plupart des recommandations du rapport d'audit précédent. Dans l'ensemble, les autorités françaises ont augmenté l'efficacité de leurs contrôles officiels visant à épargner aux animaux toute douleur évitable, détresse ou souffrances au cours de leur mise à mort et des opérations anexes.

Les contrôles officiels se sont concentrés sur les autocontrôles des opérateurs, notamment en s'assurant qu'ils élaborent et mettent en œuvre des procédures opérationnelles normalisées et sur le renforcement du rôle d'un responsable désigné du bien-être animal et ses responsabilités particulières dans les établissements.

Grâce à des mesures de formation complètes et à des documents d'orientation complets, les inspecteurs sont bien en mesure d'évaluer les structures et les processus dans les abattoirs. En particulier, la mise en œuvre des autocontrôles par les opérateurs s'est considérablement améliorée.

Dans de nombreux cas, les autorités compétentes n'assurent toujours pas une correction en temps utile des non-conformités structurelles signalées aux opérateurs économiques. C'est notamment le cas pour la période de transition, au regard de certaines exigences relatives à la structure et à l'équipement, lorsque les autorités compétentes ont initié une action corrective qu'après son expiration à la fin de 2019.

Les autorités compétentes n'ont pas encore pleinement répondu à trois recommandations formulées dans le rapport d'audit DG(SANTE) 2015-7427:

Les autorités compétentes attendent toujours la publication d'un décret qui leur permettrait de poursuivre légalement les fabricants de matériel de contention et d'étourdissement qui refusent de rendre les instructions accessibles au public.

Les autorités n'ont pas encore finalisé l'instruction technique sur la façon d'utiliser les données collectées des
taux de mortalité quotidiens des poulets de chair dans les
élevages, ce qui les empêche d'avoir des évaluations des taux de mortalité constants et élevés du bien-être animal dans les exploitations d'origine.

Les animaux gravement blessés sont encore systématiquement transportés vers les abattoirs.

Certains domaines doivent encore être mieux traités par les contrôles officiels et les mesures administratives dans le suivi des non-conformités identifiées dans les activités des opérateurs.

Le rapport formule deux recommandations aux autorités compétentes visant à améliorer leur
les contrôles.

1. S’assurer que les autorités compétentes appliquent des mesures d'exécution, en particulier pour les non-conformités persistantes dans les abattoirs, qui soient efficaces, dissuasives et proportionnées.

2. S’assurer que les abattoirs qui sont entrés en activité avant le 1er janvier 2013 se conforment aux exigences pertinentes (construction, aménagement, équipement) de l'annexe II du Règlement (CE) n°1099/2009.
Aux lecteurs du blog
Grâce à la revue PROCESS Alimentaire, vous n'avez plus accès aux 10 052 articles initialement publiés par mes soins de 2009 à 2017 sur le lien suivanthttp://amgar.blog.processalimentaire.com/. Triste histoire de sous ...

lundi 24 mai 2021

Dynamique de la transmission des Escherichia coli producteurs de shigatoxines chez des bovins néo-zélandais, de l'élevage à l'abattage

«Dynamique de la transmission des Escherichia coli producteurs de shigatoxines chez des bovins néo-zélandais de l'élevage à l'abattage», source AEM. L'article est disponible en intégralité.

Résumé

Les bovins sont des porteurs asymptomatiques de souches de Escherichia coli producteurs de shigatoxines (STEC) qui peuvent causer des maladies graves ou la mort chez l'homme. En Nouvelle-Zélande, le contact avec des excréments de bovins et la vie à proximité des populations de bovins sont des facteurs de risque connus d'infection humaine à STEC. La contamination de la viande fraîche par des souches STEC entraîne également un risque de rejet des envois par les pays importateurs.

Nous avons utilisé une combinaison de PCR/spectrométrie de masse de type MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight) et du séquençage du génome entier (WGS) pour évaluer la présence et la transmission de STEC dans des élevages et dans les usines de trainsformation afin de mieux comprendre la voies potentielles d'exposition humaine et ainsi réduire les risques.

Des prélèvement animaux et environnementaux (n = 2 580) ont été collectés dans six élevages et trois usines de transformation de la viande en Nouvelle-Zélande au cours de plusieurs séances de prélèvements au printemps 2015 et 2016. L'analyse PCR/MALDI-TOF a révélé que 6,2% étaient positifs pour le «Top 7» des STEC (O103, O111, O121, O145, O157, O26 et O45). Les 7 top souches de STEC ont été identifiées dans toutes les sources de prélèvements (n = 17) testées. Une augmentation marquée de la prévalence des 7 top STEC a été observée entre les peaux de veaux à la ferme (prévalence de 6,3%) et les peaux de veaux dans les usines de transformation (prévalence de 25,1%). Le séquençage du génome entier a été effectué sur les 7 top isolats bactériens de STEC (n = 40). L'analyse de STEC O26 (n = 25 isolats) a révélé une diversité génétique relativement faible dans les fermes individuelles, compatible avec la présence d'une souche résidente disséminée dans l'environnement de la ferme. Les efforts de santé publique devraient se concentrer sur la minimisation du contact humain avec les matières fécales dans les fermes et pendant la manipulation, le transport et l'abattage des veaux. Les usines de transformation de la viande devraient se concentrer sur la réduction de la contamination croisée entre les peaux de veaux d'une cohorte pendant le transport, la stabulation et l'abattage.

Importance

Les bovins sont des porteurs asymptomatiques de souches de E. coli producteurs de shigatoxines (STEC), qui peuvent causer des maladies graves ou la mort chez les humains. Le contact avec les excréments de bovins et la vie à proximité des bovins sont des facteurs de risque connus d'infection humaine à STEC. Cette étude a évalué le portage de STEC chez les jeunes veaux et l'environnement de la ferme avec une évaluation approfondie de six fermes et trois usines de transformation de la viande sur 2 ans. Une méthode avancée de détection moléculaire et un séquençage du génome entier ont été utilisés pour fournir une évaluation détaillée de la transmission des STEC à l'intérieur et entre les fermes. L'étude a révélé une contamination généralisée par les STEC dans l'environnement de la ferme, mais aucune preuve de propagation récente entre les fermes. La contamination des peaux de jeunes veaux laitiers a augmenté après le transport et la détention dans les usines de transformation de la viande. L'élimination des STEC dans les environnements agricoles peut être très difficile compte tenu des multiples voies de transmission; les interventions doivent viser à réduire la contamination fécale des peaux de veaux pendant le transport, la stabulation et la transformation.

Conclusion

Notre étude a démontré que les facteurs clés de la colonisation des très jeunes veaux sont une combinaison de facteurs mère-veau, veau-veau et environnement-veau. Plusieurs voies liées à la mère, y compris la colonisation des vaches et la contamination du colostrum et des filtres à lait, indiquent fortement que les vaches font partie du cycle de transmission. La contamination des peaux de veaux, tout en indiquant l’excrétion des 7 top STEC dans l’enclos, peut également servir de voie de transmission, en raison du comportement de reniflement des veaux avec d’autres veaux. Nos analyses génomiques soutiennent la conclusion que les vaches, les veaux, l'environnement et les sources d'alimentation et d'eau sont contaminés ou colonisés par les mêmes souches des 7 top STEC, indiquant que plusieurs voies de transmission sont en action.

Le transport et la stabulation ont conduit à des augmentations significatives de la prévalence et de la diversité génomique des 7 top STEC sur les peaux de veaux à l'usine, ce qui indique une importante contamination croisée des peaux. La contamination visuellement détectable des peaux, ainsi que la contamination des peaux de veaux dans les fermes, ont augmenté le niveau de contamination des carcasses immédiatement après le retrait des peaux. L'augmentation du nombre d'exploitations visitées par le camion de transport était également associée à une augmentation du niveau de contamination des carcasses. Cela suggère que la contamination des peaux de veaux ou la colonisation des veaux par les STEC d'une ferme peut entraîner des niveaux importants de contamination croisée des peaux de veaux et la contamination des carcasses de veaux provenant d'autres fermes.

En raison du grand nombre de voies de transmission potentielles identifiées dans cette étude, la prévention de l'exposition des très jeunes veaux aux STEC dans les fermes laitières sera probablement très difficile à réaliser dans la pratique. Même dans les 3 premiers jours de leur vie, les veaux avaient déjà une contamination de la peau des 7 top STEC, et l'un était déjà colonisé par une souche des 7 top STEC.

Une contamination réduite des peaux de veaux peut entraîner une diminution de la transmission des STEC dans les exploitations agricoles, ainsi qu'une diminution des chances de contamination initiale des carcasses pendant l'abattage et l'habillage. La diminution de la persistance des STEC dans l'environnement de l'enclos à veaux, ainsi que sur les camions de transport et dans les stabulations, peut encore diminuer le niveau de contamination. Des désinfectants et une désinfection locale pourraient être appliqués, mais il y aurait probablement des limitations pratiques importantes pour inciter les agriculteurs à participer. Cependant, plusieurs possibilités d'interventions chimiques existent pendant le transport et la stabulation, à savoir le chargement dans un camion de transport, le déchargement d'un camion de transport et pendant la stabulation.

Bien que l'application de mesures de contrôle spécifiques pour minimiser le niveau de contamination des peaux et des carcasses fraîches soit un élément important de la gestion des risques, une formation à l'hygiène de la viande et la mise en œuvre de pratiques d'hygiène de base sont toujours nécessaires. En 2016, la Meat Industry Association de Nouvelle-Zélande a travaillé avec le ministère des Industries primaires pour lancer neuf initiatives visant à réduire le degré de contamination des carcasses de veau par les 7 top STEC, y compris des ateliers destinés aux opérateurs supérieurs, aux superviseurs, au personnel technique et au personnel technique. personnel de vérification sur place. La poursuite des efforts d'éducation dans les usines de transformation de la viande en Nouvelle-Zélande est susceptible de réduire davantage la contamination des carcasses.

Ces résultats indiquent que les 7 top souches de STEC sont susceptibles d'être maintenues dans une certaine mesure dans l'environnement de la ferme tout au long de l'année, et il existe un certain nombre de facteurs de risque susceptibles d'augmenter le niveau de colonisation des jeunes veaux dans les fermes laitières, comme ainsi que cacher la contamination et la contamination croisée de la carcasse dans l'abattoir. Bien que cette recherche suggère que les possibilités de réduire la transmission à la ferme en contrôlant les voies de transmission individuelles sont limitées, il est clair que les conditions de transport, de stabulation, d'abattage et d'habillage ont un effet profond sur le niveau de contamination croisée de la carcasse avec les 7 top souches de STEC, ce qui a un impact sur le potentiel de transmission d'origine alimentaire.

dimanche 22 novembre 2020

Il était une fois l'Anses, le ministre de l'agriculture, le Covid-19 et les visons en France

L'Anses informe le 19 novembre 2020, « Covid-19 : pas de rôle épidémiologique des animaux sauvages et domestiques dans le maintien et la propagation du virus en France ».
Suite à l’acquisition et à l’analyse de nouvelles données scientifiques, l’Anses a actualisé son expertise publiée en avril 2020 sur la transmission potentielle de la maladie Covid-19 par l’intermédiaire des animaux domestiques. L’Agence confirme qu’à ce jour les animaux domestiques et les animaux sauvages ne jouent aucun rôle épidémiologique dans le maintien et la propagation du SARS-CoV-2 en France, où la diffusion du virus est aujourd’hui le résultat d'une transmission interhumaine par voie respiratoire. Certaines situations particulières, comme une forte concentration d’animaux réceptifs au SARS-CoV-2, appellent toutefois à la vigilance pour ne pas constituer, à l’avenir, un réservoir animal favorable à la propagation du virus.
Dans le paragraphe, « Les animaux domestiques et sauvages ne jouent pas à ce jour de rôle actif dans l’épidémie Covid-19 », on peut lire,
A ce jour et à la lumière des éléments scientifiques actuellement disponibles, l’Agence confirme que les animaux domestiques et sauvages ne jouent pas un rôle épidémiologique dans le maintien et la propagation du SARS-CoV-2. A ce stade, cette diffusion est le résultat d'une transmission interhumaine par voie respiratoire.
Toutefois, la réceptivité de certaines espèces animales au SARS-CoV-2 étant désormais établie, le risque de constitution d’un réservoir animal existe. À cet égard, l’Anses recommande d’être particulièrement vigilant vis-à-vis de situations impliquant des contacts entre l’Homme et les espèces réceptives (chats, visons…), dans des conditions de densité importante d’animaux, et de promiscuité animal-Homme particulièrement en milieu clos ou confiné.
Un communiqué de plusieurs ministères du 22 novembre 2020 rapporte la
Surveillance du SARS-COV-2 dans les élevages de visons : un élevage contaminé.
Des analyses sont réalisées depuis mi-novembre dans le cadre d’un programme scientifique conduit par l’ANSES pour définir le statut sanitaire des 4 élevages de visons français vis-à-vis du virus SARS-COV-2.
A ce stade, ces analyses ont permis de révéler que le virus circulait dans un élevage d’Eure-et-Loir. Dès qu’ils ont eu connaissance de ces résultats, les Ministres concernés ont immédiatement ordonné l’abattage de la totalité des 1000 animaux encore présents sur l’exploitation et l’élimination des produits issus de ces animaux, afin de protéger la santé publique contre la Covid-19. Un autre élevage est indemne. Des analyses sont encore en cours dans les deux derniers élevages et les résultats sont attendus dans le courant de la semaine. Si des résultats s’avéraient positifs dans l’un de ces deux élevages, les mêmes mesures d’abattage que dans le premier élevage concerné seraient appliquées.
Les résultats des analyses réalisées sur les éleveurs des 4 élevages se sont tous révélés négatifs. Une surveillance renforcée a été mise en place pour 4 personnes en lien avec l’élevage contaminé et de nouvelles analyses sont en cours.
L’analyse de séquençage du virus sera connue d’ici la fin de la semaine et doit permettre d’exclure toute contamination par le variant SARS-COV-2
La surveillance et les mesures de biosécurité renforcées sont maintenues dans les trois autres élevages.
Les ministres rappellent l'importance des gestes barrières pour lutter contre la propagation de la Covid-19 : il s’agit de protéger les visons d’une éventuelle contamination à partir du personnel des élevages, mais aussi, par précaution, d’éviter les contacts entre des animaux qui seraient infectés et le personnel des élevages.
D'une part, l'Anses nous dit « Les animaux domestiques et sauvages ne jouent pas à ce jour de rôle actif dans l’épidémie Covid-19 ». Attention à la crédibilité scientifique !

D'un autre côté, on nous dit, 
« Le virus circulait dans un élevage d’Eure-et-Loir. (…) Les Ministres concernés ont immédiatement ordonné l’abattage de la totalité des 1000 animaux encore présents sur l’exploitation et l’élimination des produits issus de ces animaux, afin de protéger la santé publique contre la Covid-19. »
« Les résultats des analyses réalisées sur les éleveurs des 4 élevages se sont tous révélés négatifs. »
Je peux comprendre la protection de la santé publique contre la Covid-19, mais aucune personne n'a été malade ... c'est encore le principe de précaution qui a tué ces visons ...

Au Danemark, selon Courrier International
Le gouvernement social-démocrate avait ordonné, le 4 novembre, que 17 millions de visons soient abattus pour parer à une mutation du Covid-19. L’ordre était illégal et scientifiquement douteux. Mogens Jensen (ministre de l'agriculture -aa) s’excuse et annonce quitter son poste ce mercredi.
Côté scientifique, un chercheur ayant travaillé sur les nombreuses variations du coronavirus chez le vison a expliqué dans le New Scientist qu’il était «complètement idiot» de croire que le futur vaccin serait inefficace contre des nouvelles versions du coronavirus dues à une mutation.