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jeudi 17 novembre 2022

35 000 décès annuels dus à la résistance aux antimicrobiens dans l'UEet dans l'Espace Economique Européen, selon l'ECDC

«35 000 décès annuels dus à la résistance aux antimicrobiens dans l'UE/EEE», source ECDC.

Plus de 35 000 personnes meurent chaque année d'infections résistantes aux antimicrobiens dans l'UE/EEE, selon les estimations présentées dans un nouveau rapport publié le 17 novembre 2022. Le nombre estimé de décès dans le rapport examine les années 2016-2020 et montre une augmentation par rapport aux estimations précédentes. L'impact sur la santé de la résistance aux antimicrobiens (RAM) est comparable à celui de la grippe, de la tuberculose et du VIH/SIDA combinés.

Dans l'ensemble, les dernières données montrent des tendances à la hausse significative du nombre d'infections et de décès attribuables pour presque toutes les combinaisons de résistance bactérie-antibiotique, en particulier dans les établissements de santé. En 2021, le nombre de cas signalés d'espèces de Acinetobacter résistants à différents groupes d'antimicrobiens a plus que doublé (+121%) par rapport à la moyenne de 2018-2019. Un autre exemple est le pourcentage de cas de Klebsiella pneumoniae résistants aux carbapénèmes - un antibiotique souvent utilisé en dernier recours - dont on a enregistré une augmentation de 31% en 2020 et une nouvelle augmentation de 20% en 2021. Ce sont des pathogènes difficiles à contrôler. éradiquer une fois établi dans les établissements de santé. De plus, le nombre de cas signalés de Candida auris a presque doublé entre 2020 et 2021 et était considérablement plus élevé que les années précédentes.

Une diminution de 23% de la consommation totale d'antimicrobiens chez l'homme, dans les secteurs des soins primaires et hospitaliers combinés, a été observée dans l'UE/EEE au cours de la période 2012-2021. Bien qu'il s'agisse d'un exploit, la proportion d'antibiotiques à «large spectre» utilisés, en particulier dans les hôpitaux, a augmenté. Entre 2012 et 2021 dans les hôpitaux, la consommation d'antibiotiques «à large spectre» a augmenté de 15%, la consommation de carbapénèmes de 34% et la proportion d'antibiotiques «de réserve», c'est-à-dire d'antibiotiques qu'il convient de réserver au traitement des polychimiothérapies confirmées ou suspectées. infections résistantes - ont plus que doublé au cours de la même période.

Les pourcentages de RAM signalés variaient considérablement d'un pays à l'autre pour plusieurs combinaisons d'espèces bactériennes et de groupes d'antimicrobiens. En général, les pourcentages de RAM les plus faibles ont été signalés par les pays du nord de l'Europe et les plus élevés par les pays du sud et de l'est de l'Europe.

Dernières données
- Assessing the health burden of infections with antibiotic-resistant bacteria in the EU/EEA, 2016-2020 (Évaluation de la charge sanitaire des infections à bactéries résistantes aux antibiotiques dans l'UE/EEE, 2016-2020). Surveillance, 17 novembre 2022.
- Surveillance of antimicrobial resistance in Europe, 2021 data (Surveillance de la résistance aux antimicrobiens en Europe, données 2021). Rapport, 17 novembre 2022
- Antimicrobial consumption in the EU/EEA (ESAC-Net) - Annual Epidemiological Report for 2021 (Consommation d'antimicrobiens dans l'UE/EEE (ESAC-Net) - Rapport épidémiologique annuel pour 2021). Rapport Surveillance, 17 novembre 2022.
- Antimicrobial resistance in the EU/EEA (EARS-Net) - Annual epidemiological report for 2021 (Résistance aux antimicrobiens dans l'UE/EEE (EARS-Net) - Rapport épidémiologique annuel pour 2021). Rapport Surveillance, 17 novembre 2022.
- Antimicrobial consumption dashboard (ESAC-Net) (Tableau de bord de la consommation d'antimicrobiens ou ESAC-Net)
- Data from the ECDC Surveillance Atlas - Antimicrobial resistance (Données de l'Atlas de surveillance de l'ECDC - Résistance aux antimicrobiens)

NB : L'image provient de ce site.

jeudi 3 novembre 2022

Reprise de la consommation d'antibiotiques en France en 2021

«La France encore trop consommatrice d’antibiotiques», selon Santé publique France du 3 novembre 2022.

Santé publique France publie les données de consommation d’antibiotiques pour l’année 2021. Environ 700 prescriptions d’antibiotiques pour 1 000 habitants ont été réalisées au cours de l’année (hors hospitalisation).

Ce rapport montre l’importance de l’utilisation prudente et à bon escient des antibiotiques et souligne le risque de développement de bactéries résistantes aux antibiotiques, appelé antibiorésistance, accéléré par l’utilisation des antibiotiques. A quelques jours de la Semaine mondiale pour un bon usage des antibiotiques qui se déroulera du 18 au 24 novembre, Santé publique France, le ministère de la Santé et de la Prévention et l’Assurance Maladie ont lancé une campagne de prévention «Les antibiotiques : bien se soigner, c'est d'abord bien les utiliser» dans l’objectif de sensibiliser à leur utilisation à bon escient et de participer à la réduction de leur consommation en population générale.

Un presque retour à la normale
Malgré une baisse continue depuis 10 ans de la consommation d’antibiotiques en ville, la France reste le 4ème pays européen le plus consommateur derrière la Grèce, la Roumanie et la Bulgarie

Après une baisse accélérée des prescriptions d’antibiotiques en 2020, concomitante aux mesures de gestion de l’épidémie de COVID-19 (confinements, adoption de gestes barrière, baisse des consultations médicales), l’année 2021 s’est accompagnée d’une reprise des infections hivernales courantes, des consultations médicales et des prescriptions d’antibiotiques, particulièrement au dernier trimestre.

En 2021 :
- Environ 80% des prescriptions d’antibiotiques s’est faite en soins de ville, comme habituellement, avec un pic en fin d’année dû aux retours des infections hivernales.
- L’évolution la plus importante des prescriptions d’antibiotiques est observée chez les enfants âgés de 0 à 4 ans : elles ont augmenté pour revenir quasiment au même niveau qu’en 2019, avant la pandémie de COVID-19.
- En Ehpad et chez les personnes âgées de 80 ans et plus en ville, la baisse s’est poursuivie en 2021.

En 2019
- En santé humaine, 93 % des antibiotiques sont dispensés en médecine de ville et 7% en établissements de santé ; parmi ceux dispensés en ville, 15% relèvent d’une prescription hospitalière.
- La consommation d’antibiotiques amorce une lente diminution en établissement de santé (-9,6% depuis 2015 exprimée en DDJ ou doses définies journalières). Elle baisse de 18% de 2009 à 2019 en secteur de ville lorsqu’elle est exprimée en nombre de prescriptions.

En 2020
- Forte diminution de la consommation d’antibiotiques dans le secteur de ville. Cette baisse est, dans une large mesure, imputable à la pandémie de COVID‑19.
- Les circonstances exceptionnelles de l’année 2020 ont entraîné une diminution de la consommation plus importante que toutes les baisses cumulées des dix dernières années.
- Exprimée en nombre de DDJ pour 1 000 habitants et par jour, la consommation s’est établie à 18,1DDJ/pour 1 000 habitants et par jour en 2020, soit une baisse de 17% par rapport aux résultats attendus.
- Exprimée en nombre de prescriptions pour 1 000 habitants et par jour, la consommation s’est fixée en 2020 à 1,82 prescription pour 1 000 habitants et par jour, soit une baisse de 18% par rapport aux résultats attendus.

Commentaire
Je m'étonne que l'on s'étonne de cette augmentation..

samedi 15 octobre 2022

Une étude détaille comment la résistance aux antimicrobiens frappe l'Europe

«Une étude détaille comment la résistance aux antimicrobiens frappe l'Europe», source article de Chris Dal dans CIDRAP News.

Une nouvelle analyse du la charge de la résistance aux antimicrobiens (RAM) en Europe estime que les bactéries résistantes aux médicaments étaient liées à plus d'un demi-million de décès dans la région en 2019.

L'étude, publiée dans The Lancet Public Health, a révélé que, dans les 53 pays de la région européenne de l'Organisation mondiale de la santé (OMS), 541 000 décès étaient associés à la RAM d’origine bactérienne et 133 000 décès étaient directement attribuables aux pathogènes résistants aux antibiotiques. Les taux de mortalité les plus élevés à la fois attribuables et associés à la RAM se trouvaient en Europe de l'Est, suivie de l'Europe centrale.

La grande majorité des décès dus à la RAM ont été causés par sept pathogènes bactériens, Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) et Escherichia coli résistant à l'aminopénicilline étant les principaux coupables.

Les auteurs de l'étude disent que l'analyse fournit l'évaluation la plus détaillée et la plus complète à ce jour de la charge de la RAM en Europe.

«Les niveaux élevés de résistance de plusieurs pathogènes bactériens importants et de combinaisons pathogène-antibiotique, ainsi que les taux de mortalité élevés associés à ces pathogènes, montrent que la résistance aux antimicrobiens est une menace sérieuse pour la santé publique dans la région européenne de l'OMS», ont-ils écrit.

Décès attribuables et associés
L'étude, menée par une équipe internationale de scientifiques et dirigée par des chercheurs de l'Institute for Health Metrics and Evaluation de l'Université de Washington, a utilisé des données provenant de diverses sources pour estimer, grâce à la modélisation statistique, les décès et les années de vie ajustées sur l'incapacité (DALYs) attribuables et associés à 23 pathogènes bactériens et 88 médicaments utilisés contre les pathogènes dans la Région européenne de l'OMS en 2019.

Dans l'ensemble, 471 millions de dossiers individuels ou d'isolats bactériens ont été obtenus auprès de sources telles que le Réseau européen de surveillance de la résistance aux antimicrobiens, le Réseau de surveillance de l'Asie centrale et de l'Europe de la résistance aux antimicrobiens et le Système mondial de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (GLASS pour Global Antimicrobial Resistance Surveillance System) de l'OMS.

La méthodologie de l'étude était similaire à l'approche utilisée dans le rapport de la recherche mondiale sur la résistance aux antimicrobiens (GRAM pour Global Research on Antimicrobial Resistance) publié plus tôt cette année, qui estimait que 1,27 million de décès dans le monde étaient directement attribuables à la RAM en 2019 (sur 4,95 millions qui étaient associés à pathogènes résistants aux antibiotiques). Les auteurs disent que cette étude étend ces résultats tout en fournissant des estimations plus granulaires et spécifiques à chaque pays en Europe.

Comme dans le rapport GRAM, les chercheurs ont calculé la charge de la RAM (décès et DALYs) en utilisant une approche basée sur deux scénarios contrefactuels. Pour estimer les décès directement attribuables aux bactéries résistantes, ils ont envisagé un scénario dans lequel ces infections étaient remplacées par des infections sensibles aux antibiotiques. Pour estimer les décès associés, ils ont considéré un scénario dans lequel les infections résistantes étaient remplacées par une absence d'infection.

Sur les 133 000 décès attribuables estimés (intervalle d'incertitude à 95% [II], 90 100 à 188 000) et 541 000 décès associés (II à 95%, 370 000 à 763 000), la plus grande charge mortelle due à la RAM provenait des infections du sang, avec 47 200 décès attribuables et 195 000 décès associés liés à toute combinaison antibiotique-pathogène résistant. Les autres principales causes de décès dues à toute combinaison antibiotique-pathogène résistant étaient les infections intra-abdominales (31 200 décès attribuables et 127 000 décès associés) et les infections respiratoires (28 500 décès attribuables et 120 000 décès associés).

Sept principaux pathogènes bactériens étaient responsables de 112 784 décès attribuables et de 457 591 décès associés : E. coli, S aureus, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecium, Streptococcus pneumoniae et Acinetobacter baumannii.

Le SARM était la principale combinaison antibiotique-pathogène pour les décès attribuables à la RAM dans 27 pays (51% de la région), tandis que E. coli résistant à l'aminopénicilline était la principale combinaison antibiotique-pathogène pour les décès associés dans 47 pays (89% de la région) . Une distribution similaire a été observée avec les DALYs pour les combinaisons pathogène-antibiotique.

Les taux de mortalité estimés pour 100 000 habitants observés en Europe de l'Est (19,9/100 000 attribuables et 74,0/100 000 associés) et en Europe centrale (16,6/100 000 attribuables et 68,0/100 000 associés) étaient considérablement plus élevés qu'en Europe de l'Ouest (11,7/100 000 attribuables et associés) et 52,5/100 000 associés). Compte tenu des taux de mortalité normalisés selon l'âge pour 100 000 habitants, les pays les plus touchés par la RAM étaient concentrés en Asie centrale (qui est considérée par l'OMS comme faisant partie de la Région européenne).

L'analyse a également révélé que les pays de la région dotés de plans d'action nationaux sur la résistance aux antimicrobiens élaborés, approuvés, financés et mis en œuvre se situaient dans le 50e centile le plus bas des taux de mortalité normalisés selon l'âge, tant pour les décès attribuables que pour les décès associés. Les pays ayant des scores d'indice sociodémographique (SDI) inférieurs - une mesure du développement global - avaient une charge de mortalité liée à la RAM plus élevée.

De plus, une corrélation positive entre le taux brut de mortalité liés à la RAM et l'utilisation d'antimicrobiens ont été observés, la relation la plus forte étant observée en Europe occidentale et centrale.

Nécessité de stratégies de réduction de la résistance aux antimicrobiens
Par rapport aux estimations du rapport GRAM, la région européenne de l'OMS, qui représente environ 12% de la population mondiale, représente 10,5% des 1,27 million de décès estimés dans le monde attribuables à la RAM, et 10,9% des 4,95 millions estimés associés des décès.

Dans un commentaire d'accompagnement, des experts en maladies infectieuses des Hôpitaux universitaires et de la Faculté de médecine de Genève disent que les résultats illustrent l'impact négatif substantiel sur la santé des infections liées à la RAM dans toute l'Europe. Ils ajoutent que les futures stratégies de réduction de la résistance aux antimicrobiens dans la région nécessiteront de développer et de maintenir des réseaux de surveillance de la résistance aux antimicrobiens de haute qualité pour faire progresser les connaissances sur la véritable charge de la résistance aux antimicrobiens, en finançant la recherche pour évaluer la charge de combinaisons spécifiques d'agents résistants et de développer des interventions spécifiques aux pathogènes, et la quantification de l'impact économique et des coûts indirects attribuables à la RAM.

«Tous ces éléments peuvent combler les lacunes dans les connaissances et ouvrir la voie à une stratégie de sortie de cette pandémie silencieuse», ont écrit Nasreen Hassoun-Kheir et Stephan Harbarth.

Ils disent également que les résultats devraient encourager les cliniciens et les décideurs politiques de toute l'Europe à approuver et à mettre en œuvre des plans de contrôle de la résistance aux antimicrobiens spécifiques à chaque pays, en mettant parallèlement l'accent sur la mise en œuvre des meilleurs programmes de contrôle des infections et de gestion des antibiotiques dans les établissements de santé.

vendredi 14 octobre 2022

États-Unis : Les chaînes de magasins alimentaires pourraient faire plus pour prévenir la surutilisation d'antibiotiques dans la viande, selon un rapport

«Les chaînes de magasins alimentaires pourraient faire plus pour prévenir la surutilisation d'antibiotiques dans la viande, selon un rapport», source article de Chris Dall dans CIDRAP News.

Un nouveau rapport sur les plus grandes chaînes de magasins du pays montre que la plupart obtiennent une note d'échec sur leurs politiques visant à éliminer l'utilisation systématique d'antibiotiques dans la viande et la volaille de marque qu'elles vendent.

Le rapport Superbugs in Stock, produit par une coalition de groupes de santé publique, de bien-être animal et de sécurité des aliments, révèle que, sur les 12 principales chaînes de magasins du pays, 8 ont reçu une note «F» pour leurs politiques en matière d'antibiotiques et leurs pratiques d'approvisionnement en viande. et produits avicoles vendus sous leurs propres marques. La note la plus élevée attribuée était un «C».

Les rapports précédents de la coalition Antibiotics Off The Menu se sont concentrés sur les chaînes américaines de restaurants et leurs politiques et pratiques concernant l'utilisation d'antibiotiques dans la viande bovine qu'elles servent, dans le but d'encourager l'industrie et les consommateurs à exercer davantage de pression sur les fournisseurs de viande pour qu'ils réduisent les antibiotiques. surexploitation chez les bovins de boucherie. La pression des consommateurs a été un facteur important pour inciter l'industrie avicole à réduire considérablement l'utilisation d'antibiotiques.

Les auteurs disent que les magasins où sont achetés environ 50% des produits carnés vendus aux États-Unis, sont un autre lieu où la pression peut être exercée.

«Les magasins sont le principal moyen par lequel les gens achètent de la viande… et ils sont l'un des principaux moyens par lesquels les consommateurs obtiennent des informations sur la viande qu'ils achètent», rapporte le contributeur Matt Wellington de l’US PIRG (Public Interest Research Group) Education Fund à CIDRAP News. «Ils peuvent avoir un impact réel s'ils interviennent et s'engagent à s'approvisionner en viande élevée sans surutiliser d'antibiotiques.»

Environ les deux tiers des antibiotiques médicalement importants - ces antibiotiques qui sont également utilisés en médecine humaine - vendus aux États-Unis sont utilisés dans le secteur de l'élevage. Mais ils sont souvent utilisés pour plus que le simple traitement des animaux malades. Alors que les producteurs de viande américains ne sont pas autorisés à utiliser des antibiotiques médicalement importants pour favoriser la croissance des animaux, ils sont autorisés à les utiliser pour la prévention des maladies, une pratique qui, selon les critiques, contribue au développement et à la propagation de bactéries résistantes aux antibiotiques et couvre des pratiques qui augmentent le risque de maladie pour les animaux.

Absence de politiques, de rapports, de vérification
Le rapport analyse les politiques et pratiques d'utilisation d'antibiotiques des chaînes de magasins et les note sur les mesures prises pour réduire la surutilisation d'antibiotiques dans leurs produits de viande à marque distributeur, là où les auteurs disent que les chaînes ont le plus de surveillance et d'influence. Selon le rapport, les produits de viande à marque distributeur représentaient 25% du total des produits de viande dans les rayons de la distribution alimentaire en 2021.

Les notes étaient basées sur les critères suivants :
- Si les chaînes disposaient d'une démarche significative et accessible au public interdisant l'utilisation d'antibiotiques médicalement importants pour la promotion de la croissance ou la prévention des maladies dans la viande vendue sous leurs marques distributeur
- La force du langage dans la démarche de l’entreprise.
- Si la démarche s'appliquait à tous les principaux groupes de viande (bœuf, dinde, poulet, porc)
- Si la démarche est liée à un délai et à des engagements plus larges en matière de bien-être animal.

Les entreprises ont également été notées sur leurs réponses à une enquête qui posait des questions supplémentaires sur la démarche d'utilisation des antibiotiques.

L'auteure principale Annette Manusevich de World Animal Protection a dit que, pour obtenir un «A», les chaînes de magasin devraient avoir une politique de bien-être animal qui exige que tous les fournisseurs de viande et de volaille à marque distributeur aient une démarche claire pour éliminer les antibiotiques médicalement importants pour la prévention des maladies, une démarche qui interdit le confinement étroit des animaux et les procédures douloureuses, l'obligation pour les fournisseurs de viande de suivre et de signaler l'utilisation d'antibiotiques et la vérification par une tierce partie indépendante.

«Nous recherchions plus de transparence, plus d'audits et des démarches plus claires qui mettent vraiment l'accent sur l'élimination des antibiotiques médicalement et médicalement importants à des fins de prévention des maladies», a-t-elle dit.

Peu de chaînes de magasins répondaient à ces critères. Sur les 12, Target a reçu la note la plus élevée, obtenant un «C» avec une démarche d'utilisation d'antibiotiques limitée dans le temps qui s'applique à chaque espèce de produits d'origine animale vendus sous leur marque distributeur et est liée à des préoccupations plus larges en matière de bien-être animal. Ahold Delhaize, la société mère de Stop and Shop, Food Lion et d'autres chaînes d'épicerie, a reçu un «C-» pour une démarche qui s'applique à toutes les espèces animales.

Mais Target n'a fourni aucune information sur la proportion de viande qu'elle vend par le biais de sa marque distributeur qui respecte ses engagements en matière d'utilisation d'antibiotiques, tandis que la démarche d'Ahold Delhaize ne prévoyait aucun délai pour la mise en œuvre de la démarche dans sa chaîne d'approvisionnement en viande et volaille. Et aucune chaîne n'a pris de mesures pour vérifier si ses fournisseurs de viande se conforment à leurs démarches.

Parmi les autres chaînes examinées, Costco et Meijer ont reçu un «D» et huit, dont Kroger, Aldi, Walmart et Trader Joe's, ont reçu un «F». Le rapport a révélé que ces entreprises, dont certaines figurent parmi les cinq premières du pays en termes de chiffre d'affaires annuel - n'avait pas de démarche accessible au public sur l'utilisation d'antibiotiques dans les produits de viande.

«Nous pensons que les magasins alimentaires ont un rôle vital à jouer dans la construction d'un système alimentaire plus humain et durable qui protège également notre santé, nos ressources et nos animaux», a dit Manusevich. «Leur évaluation a montré qu'il y a beaucoup d'améliorations qui peuvent être faites dans ce secteur en ce qui concerne les démarches sur les antibiotiques.

Donner un coup de pouce aux chaînes de magasins alimentaires
Le rapport fait valoir que des démarches claires et une vérification par des tierce partie des chaînes de magasins sur l'utilisation d'antibiotiques dans leur approvisionnement en viande sont importantes, car si certains produits de viande vendus dans les magasins portent des étiquettes telles que «Élevé sans antibiotiques» ou «Jamais d'antibiotiques», et les consommateurs paient généralement plus pour ces produits, ces étiquettes n'ont pas de mécanisme d'obligation. En fait, une étude récente a révélé que, dans 42% des parcs d'alimentation de bovins certifiés élevés sans antibiotiques (Raised Without Antibiotics-certified) dans un seul abattoir de bovins, au moins un animal a été testé positif pour la présence d’antibiotiques.

«Les produits que les magasins stockent, les informations fournies dans les magasins et même le placement des produits dictent souvent les décisions d'achat du consommateur», indique le rapport. «Il est de leur responsabilité de fournir aux consommateurs des options alimentaires sûres, et les produits de viande et de volaille qui contribuent à l'augmentation et à la propagation des infections résistantes aux antibiotiques ne sont pas alignés sur cette obligation.»

À l'avenir, le rapport appelle les chaînes de magasins à prendre des engagements fermes et limités dans le temps pour éliminer progressivement l'utilisation systématique d'antibiotiques pour la prévention des maladies dans toutes les chaînes d'approvisionnement en viande, à travailler en étroite collaboration avec les producteurs de viande, à améliorer la collecte de données sur la façon dont les fournisseurs de viande utilisent les antibiotiques et à les partager. données avec le public. Ils exhortent également les consommateurs à encourager les chaînes de magasins à ne vendre que de la viande élevée sans utilisation systématique d'antibiotiques.

Wellington dit que l'objectif est d’«initier» les chaînes de magasins dans la compréhension de l'importance de la résistance aux antibiotiques, qui, selon des estimations de recherches récentes, était directement liée à près de 1,3 million de décès en 2019 et s'aggrave.

«Nous parlons de préserver les fondements de la médecine moderne, et ils ont un rôle à jouer pour y parvenir», a-t-il dit.

mercredi 12 octobre 2022

Un nouvel antibiotique provient d'une bactérie pathogène de la pommes de terre

«Un nouvel antibiotique provient d'une bactérie pathogène des pommes de terre», source ASM News.

Faits saillants
- La plupart des composés antibiotiques proviennent des microbes du sol.
- Des chercheurs ont découvert la solanimycine, un nouvel antibiotique antifongique.
- La solanimycine est produite par une série de bactéries phytopathogènes.
- La solanimycine et les composés apparentés peuvent aider à traiter les champignons pathogènes humains et végétaux.
- Les bactéries associées aux plantes sont une source potentielle d'antibiotiques qui pourraient être utilisés en clinique et en agronomie.

La menace croissante de la résistance aux antimicrobiens a conduit des chercheurs à rechercher partout de nouveaux composés. Cette semaine dans mBio, une équipe multinationale de chercheurs en Europe rapporte la découverte d'un nouvel antibiotique antifongique nommé solanimycine. Le composé, initialement isolé à partir d'une bactérie pathogène qui infecte les pommes de terre, semble être produit par un large éventail de bactéries phytopathogènes apparentées.

La solanimycine agit contre un large éventail de champignons connus pour infecter et faire des ravages sur les cultures agricoles, selon les chercheurs. Dans des études en laboratoire, le composé a également agi contre Candida albicans, un champignon qui se produit naturellement dans le corps mais qui peut provoquer des infections dangereuses. Les résultats suggèrent que la solanimycine et les composés apparentés pourraient être utiles à la fois en milieu agricole et clinique.

Les microbes du sol, en particulier du phylum Actinobacteria, produisent la plupart des antibiotiques thérapeutiques utilisés aujourd'hui. La nouvelle découverte suggère que les micro-organismes des plantes méritent d'être examinés de plus près, d'autant plus que les cultures développent une résistance aux traitements existants, déclare la microbiologiste Rita Monson de l'Université de Cambridge. Elle a codirigé l'étude avec le microbiologiste moléculaire Miguel Matilla de l'Estación Experimental del Zaidín du Conseil espagnol de la recherche de Grenade.

«Nous devons examiner de manière plus approfondie un plus grand nombre de populations microbiennes à notre disposition», a dit Monson.

La bactérie pathogène de la pomme de terre Dickeya solani, productrice de solanimycine, a été identifiée pour la première fois il y a plus de 15 ans. Des chercheurs du laboratoire du microbiologiste moléculaire de George Salmond de l'Université de Cambridge, ont commencé à étudier son potentiel antibiotique il y a environ une décennie.

«Ces souches ont émergé rapidement, et maintenant elles sont largement distribuées», a dit Matilla.

La solanimycine n'est pas le premier antibiotique découvert à partir du microbe. Dans des travaux antérieurs, des chercheurs ont découvert que D. solani produit un antibiotique appelé oocydine A, qui est très actif contre plusieurs agents pathogènes fongiques des plantes.

Ces découvertes précédentes, ainsi que l'analyse du génome de la bactérie, ont laissé entendre qu'elle pourrait synthétiser des antibiotiques supplémentaires, a dit Matilla, également avec un potentiel antifongique. Cet indice a porté ses fruits : Matilla, Monson, Salmond et leurs collègues ont découvert que lorsqu'ils réduisaient au silence les gènes responsables de la production d'oocydine A, la bactérie continuait à montrer une activité antifongique.

Cette observation a conduit à l'identification de la solanimycine et à l'identification des clusters de gènes responsables des protéines qui composent le composé.

Les chercheurs ont découvert que la bactérie utilise le composé avec parcimonie, le produisant en réponse à la densité cellulaire. Un environnement à pH acide - comme celui présent dans une pomme de terre - active également le cluster de gènes de la solanimycine. Monson a dit que cela ressemblait presque à un mécanisme de protection intelligent.

«C'est un antifongique qui, selon nous, fonctionnera en tuant les concurrents fongiques, et les bactéries en profitent tellement», a dit Monson. «Mais vous ne mettez en route que si vous êtes dans une pomme de terre.»

Monson a dit que les chercheurs ont commencé à collaborer avec des chimistes pour en savoir plus sur la structure moléculaire de la solanimycine et mieux comprendre son fonctionnement. Ensuite, Monson et Matilla ont dit qu'ils espéraient voir des tests continus du composé dans des modèles végétaux et animaux.

«Nos prochaines étapes sont axées sur l'utilisation de cet antibiotique antifongique pour la protection des plantes», a dit Matilla. L'équipe de recherche considère cette découverte comme un signe encourageant que les pathogènes des plantes - comme D. solani - pourraient être amenés à fabriquer des composés pouvant être utilisés contre les maladies des plantes et des humains.

«Nous devons nous ouvrir à l'exploration de tout ce qui existe pour trouver de nouveaux antibiotiques», a dit Matilla.

mardi 11 octobre 2022

De nombreux médecins généralistes français se sentent obligés de prescrire des antibiotiques. One Health ?

«Des enquêtes téléphoniques indiquent que de nombreux médecins généralistes français se sentent obligés de prescrire des antibiotiques», source CIDRAP News.

Des enquêtes téléphoniques auprès du grand public et des médecins généralistes (MGs) ont révélé que, malgré une baisse globale de l'utilisation des antibiotiques en France au cours de la dernière décennie, plus d'un tiers des cliniciens signalent une pression pour prescrire des antibiotiques, ont rapporté des chercheurs la semaine dernière dans Antimicrobial Resistance & Infection Control«Perceptions et attitudes face à la résistance aux antibiotiques dans le grand public et les médecins généralistes en France».

Pour aider à éclairer les futures campagnes nationales de sensibilisation sur la résistance aux antimicrobiens, des chercheurs de Santé publique France ont mené deux enquêtes téléphoniques en 2019 et 2020. La première a exploré la consommation d'antibiotiques et les connaissances et croyances sur la résistance aux antibiotiques auprès d'un échantillon représentatif du grand public âgé de 15 ans et plus. La seconde a exploré l'évolution des pratiques de prescription et des attitudes envers les demandes d'antibiotiques des patients parmi un échantillon représentatif de 388 médecins généralistes.

Dans l'enquête grand public, 27% des personnes interrogées ont déclaré avoir reçu des antibiotiques au cours des 12 derniers mois et 54% des personnes ayant un enfant de 6 ans et moins ont déclaré que leur enfant avait reçu un antibiotique au cours de la même période.

Dans l'enquête chez des médecins généralistes, 65% déclarent avoir réduit leur prescription d'antibiotiques au cours des 5 dernières années, et 64% déclarent ne pas prescrire automatiquement d'antibiotiques mais conseillent aux patients de les contacter dans les 2 ou 3 jours si les symptômes persistent. Parmi les médecins généralistes, 33% ont déclaré avoir souvent des patients qui insistent pour avoir des antibiotiques, et que les patients âgés présentant des comorbidités étaient parmi les plus exigeants. Seuls 3% du grand public déclarent faire pression sur leur médecin généraliste pour qu'il prescrive un antibiotique.

La grande majorité des répondants à l'enquête grand public ont exprimé leur confiance dans leur médecin généraliste, qu'il leur ait prescrit des antibiotiques (89%) ou non (91%). Seulement la moitié des personnes interrogées ont déclaré savoir que les antibiotiques n'agissent que sur les bactéries, et 38% ont déclaré comprendre exactement ce qu'est la résistance aux antibiotiques.

Une étude de 2020 de Santé publique France a révélé que, de 2009 à 2019, le nombre de prescriptions d'antibiotiques a diminué de 18% dans toutes les tranches d'âge, à l'exception des personnes âgées.

Les auteurs disent qu'une prochaine campagne de sensibilisation du public tiendra compte des résultats de l'enquête.

Dans la conclusion, les auteurs notent,
Bien que l'utilisation des antibiotiques diminue en France, la pression des patients sur les médecins généralistes pour qu'ils prescrivent des antibiotiques est très élevée. La population française n'a encore qu'une connaissance partielle de la résistance aux antibiotiques et doit être mieux informée, notamment les personnes âgées. Les médecins généralistes sont des ambassadeurs clés dans la réduction de l'utilisation des antibiotiques. Une nouvelle campagne d'information publique tiendra compte des résultats de notre enquête en 2022-2023. Elle sera précédée d'un accompagnement et d'une information des professionnels de santé.

samedi 8 octobre 2022

Résistance de E. coli provenant de denrées alimentaires d’origine animale destinés à l'alimentation en Europe

«Une étude révèle une gamme de résistance chez E. coli provenant de denrées alimentaires d’origine animale destinés à l'alimentation en Europe», source CIDRAP News.

Une analyse de Escherichia coli provenant d'animaux producteurs de denrées alimentaires en Europe a révélé que la sensibilité aux antibiotiques variait considérablement selon les antibiotiques, les espèces animales et les pays, avec quelques signes de déclin ces dernières années, a rapporté une équipe de chercheurs européens dans Journal of Antimicrobial Chemotherapy, European-wide antimicrobial resistance monitoring in commensal Escherichia coli isolated from healthy food animals between 2004 and 2018.

Pour décrire la sensibilité de E. coli provenant de denrées alimentaires d’origine animale à des antibiotiques médicalement importants, des chercheurs ont réalisé au hasard des prélèvements du contenu intestinal de bovins, de porcs et de poulets de chair sains à l'abattoir dans cinq ou six pays de l'Union européenne sur quatre périodes (2004-2006, 2008-2009, 2013-2014 et 2017-2018). 2013-2014 et 2017-2018). Ils ont effectué des tests de sensibilité pour 11 antibiotiques jugés médicalement importants par l'OMS et ont recherché la présence des gènes de résistance à la colistine MCR-1 à MCR-10.

Au total, 10 613 souches de E coli ont été récupérées. En règle générale, l'occurrence de la résistance était plus faible parmi les isolats de E coli provenant de bovins que parmi ceux provenant de porcs et de poulets de chair. Chez les poulets de chair, les pourcentages de résistance étaient les plus faibles en 2017-2018. La résistance au méropénem et à la tigécycline était absente et la résistance à l'azithromycine était de 0,2% à 2,0%. De plus, une faible résistance aux céphalosporines de troisième génération (1,1% à 7,4%) a été détectée chez les poulets de chair. La résistance à la colistine variait de 0,1% à 4,8%.

Les E coli des poulets de chair a montré une résistance élevée à la ciprofloxacine (7,3% à 23,3%), alors que pour les bovins et les porcs, elle était de 0,2% à 2,5%. Une résistance faible et/ou modérée au chloramphénicol (9,3% à 21,3%) et à la gentamicine (0,9% à 7,0%) a été observée chez les porcs et les poulets de chair. La résistance la plus élevée a été notée pour l'ampicilline (32,7% à 65,3%), la tétracycline (41,3% à 67,5%), le triméthoprime (32,0% à 35,7%) et l’association triméthoprime et sulfaméthoxazole (27,5% à 49,7%) chez les porcs et les poulets de chair, avec des différences selon les pays.

Les valeurs globales regroupées pour la multirésistance aux antibiotiques (MDR pour multidrug-resistance) étaient de 3,5% chez les bovins, 23,7% chez les porcs et 25,9% chez les poulets de chair. Une diminution significative de la MDR au fil du temps a également été observée pour les poulets de chair et une tendance à la baisse chez les porcs, alors qu'aucune tendance constante n'a été observée chez les bovins.

Les chercheurs disent que la baisse de la résistance chez les poulets de chair dans plusieurs pays, en particulier pour les antibiotiques les plus couramment utilisés en médecine vétérinaire, est probablement influencée par la baisse de l'utilisation globale d'antibiotiques vétérinaires depuis 2011.

jeudi 28 juillet 2022

Des bactériophages produits dans un système acellulaire aident à combattre les bactéries résistantes aux antibiotiques

Résumé graphique (Image : Neurobiological Engineering)

«Production acellulaire de bactériophages. Des virus aident à combattre les bactéries résistantes aux antibiotiques», source Technical University of Munich (TUM).

De plus en plus de bactéries deviennent résistantes aux antibiotiques. Les bactériophages sont une alternative dans la lutte contre les bactéries : ces virus attaquent les bactéries très particulières de manière très spécifique. Aujourd'hui, une équipe de recherche munichoise a mis au point une nouvelle façon de produire des bactériophages de manière efficace et sans risque.

L'Organisation mondiale de la santé (OMS) considère les germes multirésistants comme l'une des plus grandes menaces pour la santé. Dans la seule Union européenne, 33 000 personnes décèdent chaque année des suites d'infections bactériennes qui ne peuvent être traitées avec des antibiotiques. Des traitements alternatifs ou des médicaments sont donc nécessaires de toute urgence.

Les bactériophages, ennemis naturels des bactéries, sont une solution prometteuse. Il existe des millions de types différents de ces virus sur terre, chacun étant spécialisé dans certaines bactéries. Dans la nature, les virus utilisent les bactéries pour se reproduire ; ils insèrent leur ADN dans les bactéries, où les virus se multiplient rapidement. En fin de compte, ils tuent la cellule et infectent de nouvelles cellules. Les bactériophages fonctionnent comme un antibiotique spécifique en attaquant et en détruisant un type particulier de bactérie.

Des virus pour la santé
«Les bactériophages offrent un énorme potentiel pour la thérapie hautement efficace et personnalisée des maladies infectieuses bactériennes», observe Gil Westmeyer, professeur de génie neurobiologique à l'Université technique de Munich (TUM) et directeur de l'Institut de biomédecine synthétique à Helmholtz Munich. «Cependant, dans le passé, il n'était pas possible de produire des bactériophages de manière ciblée, reproductible, sûre et efficace - bien que ce soient exactement les critères décisifs pour la production réussie de produits pharmaceutiques.»

Aujourd'hui, l'équipe de recherche a mis au point une nouvelle méthode de production contrôlée pour créer des bactériophages à usage thérapeutique. La base de cette technologie a été établie par un groupe d'étudiants de la TUM et de l'Université Ludwig Maximilian de Munich (LMU), qui a remporté un prix lors du concours 2018 de l’International Genetically Engineered Machine (iGEM). Ce groupe a ensuite donné naissance à la spin-off Invitris, qui développe actuellement une plate-forme technologique pour les médicaments à base de phages

La pierre angulaire de la nouvelle technologie, qui est déjà dans le processus de demande de brevet et est désormais utilisée dans de nouvelles recherches au TUM, est une solution nutritive spéciale dans laquelle les bactériophages se forment et se reproduisent. La solution nutritive est constituée d'un extrait de E. coli et ne contient pas de cellules viables ; il s'agit d'une différence fondamentale par rapport aux méthodes de production de bactériophages précédentes, qui utilisaient traditionnellement des cultures cellulaires avec des souches de bactéries potentiellement infectieuses.

Dans les laboratoires du TUM, l'équipe de Munich a maintenant pu démontrer la production ciblée de bactériophages dans la solution nutritive acellulaire : le seul composant nécessaire est le génome, l'ADN simple, des virus souhaités. Le génome contient tout le schéma directeur de la formation des bactériophages. Lorsque l'ADN est injecté dans la solution nutritive contenant les composants moléculaires et les enzymes de la bactérie E. coli, les protéines s'assemblent selon le schéma directeur : des milliers de copies identiques sont générées en quelques secondes seulement. «Cette méthode de production est non seulement rapide et efficace, mais elle est également très propre - le processus élimine la contamination par des toxines bactériennes ou d'autres bactériophages, qui sont des complications possibles dans les cultures cellulaires», explique Westmeyer.

Antibiotiques personnalisés
Mais la nouvelle solution nutritive acellulaire est-elle réellement adaptée à la production de bactériophages qui pourraient être utilisés dans des thérapies individuelles ? Les chercheurs ont mis l'idée à l'épreuve avec l'hôpital de la Bundeswehr de Berlin : à l'aide d'un échantillon bactérien d'un patient souffrant d'une infection cutanée résistante aux antibiotiques, l'équipe de Munich a recherché un nouveau bactériophage prometteur et isolé son ADN. Le phage a ensuite été produit dans la solution nutritive acellulaire et finalement utilisé pour combattre avec succès les bactéries multirésistantes.

Une archive génétique pour les urgences
«Nos études prouvent la faisabilité d'une méthode sans cellule pour produire des bactériophages efficaces pour la médecine personnalisée qui peuvent également être utilisés pour traiter les infections à germes multirésistants», déclare Westmeyer. Il ajoute qu'à l'avenir, la méthodologie pourrait idéalement être utilisée avec une archive génétique qui stockerait l'ADN des bactériophages concernés. Chaque fois que nécessaire, cette archive pourrait être utilisée pour produire rapidement des bactériophages complets dans la solution nutritive, tester leur efficacité, puis appliquer les phages dans les combinaisons appropriées, dit Westmeyer, ajoutant que bien que ce travail soit encore au stade de la recherche fondamentale, la méthode a néanmoins un potentiel pour des essais cliniques.

Références
Quirin Emslander, Kilian Vogele, Peter Braun, Jana Stender, Christian Willy, Markus Joppich, Jens A. Hammerl, Miriam Abele, Chen Meng, Andreas Pichlmair, Christina Ludwig, Joachim J. Bugert, Friedrich C. Simmel, Gil G. Westmeyer. Cell-free production of personalized therapeutic phages targeting multidrug-resistant bacteria, Cell Chemical Biology (2022), DOI: 10.1016/j.chembiol.2022.06.003.

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lundi 25 juillet 2022

Des membres d'une coalition disent que McDonald's ‘revient’ sur son engagement en matière d'antibiotiques

«Des groupes disent que McDonald's ‘revient’ sur son engagement en matière d'antibiotiques», source CIDRAP News . Les membres de cette coalition sont : US PIRG, NRDC, FACT, Consumer Reports, the Antibiotic Resistance Action Center.

Une coalition de groupes d'intérêt public, de protection des animaux et environnementaux aux Etats-Unis critique McDonald's pour avoir renoncé à son engagement de réduire l'utilisation d'antibiotiques médicalement importants dans sa chaîne d'approvisionnement en viande bovine.

Dans une déclaration publiée le 21 juillet, la coalition Antibiotics Off the Menu a noté que la politique antibiotique mise à jour de l'entreprise pour le bœuf et le bœuf laitier s'éloigne de la fixation d'objectifs concrets pour la réduction des antibiotiques médicalement importants par les fournisseurs de 10 pays (Australie, Nouvelle-Zélande, France, Allemagne, Irlande, Pologne, Royaume-Uni, Canada, États-Unis et Brésil) qui fournissent la majeure partie de sa viande bovine. En décembre 2018, McDonald's s'est engagé à établir des objectifs de réduction des antibiotiques pour les fournisseurs de bœuf de ces pays d'ici la fin de 2020, un engagement qu'il n'a pas encore tenu.

La société déclare désormais qu'après avoir mené des tests pilotes dans ces pays, elle collaborera avec des leaders de l'industrie, des universitaires, des fournisseurs et des experts pour établir des objectifs adaptés au marché pour une utilisation responsable d'antibiotiques médicalement importants.

«McDonald's a fait preuve de leadership en 2018 en s'engageant à réduire les antibiotiques dans son énorme chaîne d'approvisionnement en viande bovine» a déclaré le groupe. «De manière décevante, il est clair que l'entreprise revient sur son engagement. En passant d'objectifs de ‘réduction de l'utilisation’ à des objectifs d'’utilisation responsable’, McDonald's a cessé de diriger et a commencé à suivre, car sa dernière approche laisse amplement de place aux pratiques commerciales habituelles de continuer.»

McDonald's affirme que son objectif est d'affiner la sélection et l'administration des antibiotiques, de réduire l'utilisation d'antibiotiques non thérapeutiques et, lorsque cela est possible, de remplacer les antibiotiques par «des solutions à long terme pour prévenir de manière proactive les maladies et protéger la santé et le bien-être des animaux».

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jeudi 21 juillet 2022

Nourrir les chiens avec de la viande crue est associée à une présence accrue de bactéries résistantes aux antibiotiques

«Nourrir les chiens avec de la viande crue est associée à une présence accrue de bactéries résistantes aux antibiotiques», source Université de Bristol.

De nouvelles études ont révélé une association entre l'alimentation en viande crue des chiens de compagnie et la présence de bactéries résistantes aux antibiotiques d'importance critique.

Deux études menées par une équipe de l'Université de Bristol ont révélé que les chiens nourris avec de la viande crue étaient plus susceptibles d'excréter des bactéries Escherichia coli (E. coli) résistantes aux antibiotiques dans leurs selles. Des recherches antérieures ont montré qu'il existe un potentiel de partage de bactéries entre les chiens et leurs propriétaires humains par le biais d'interactions quotidiennes, ce qui a conduit les chercheurs à suggérer que l'aliment cru n'est pas le choix alimentaire le plus sûr et que, s'il est choisi, les propriétaires devraient prendre des précautions supplémentaires. lors de la manipulation de viande crue et faites particulièrement attention lors du nettoyage de leur chien.

L'étude publiée dans le Journal of Antimicrobial Chemotherapy a enquêté sur des chiens adultes et a trouvé des liens entre les chiens mangeant de la viande crue et excrétant des E. coli résistants. L’étude soutient une étude récente de l'équipe, publiée dans la revue One Health, qui a examiné des chiots de 16 semaines. Les deux études, qui ont utilisé des données provenant de différents chiens, démontrent que les chiens peuvent excréter des bactéries résistantes, quel que soit leur âge ou la durée de leur alimentation avec de la viande crue.

L'environnement dans lequel vit un chien a également joué un rôle dans le potentiel d'excrétion de bactéries résistantes. L'alimentation crue était un facteur de risque important pour les chiens vivant à la campagne, tandis que chez les chiens vivant en ville, les facteurs de risque étaient beaucoup plus compliqués, reflétant probablement la variété des modes de vie et des expositions chez les chiens de ville.

Les deux études ont recruté un total de 823 chiens et leurs propriétaires (223 chiots pour la première étude et 600 chiens adultes dans la seconde étude). Les propriétaires ont rempli des questionnaires sur leurs chiens, leur régime alimentaire et leur environnement, et ont fourni des échantillons de matières fécales de leurs chiens.

Les échantillons ont ensuite été analysés pour détecter la présence de E. coli résistants aux antibiotiques et des analyses des facteurs de risque ont été menées pour explorer les associations entre les facteurs liés au mode de vie, les environnements signalés dans l'enquête auprès des propriétaires et la détection de E. coli résistants.

Matthew Avison, professeur de bactériologie moléculaire à la School of Cellular and Molecular Medicine, qui a dirigé les aspects microbiologiques de ces études, a déclaré : «Les bactéries résistantes aux antibiotiques sont partout, mais certains antibiotiques sont considérés comme extrêmement importants pour une utilisation chez l'homme. Nous avons montré que les chiens nourris avec de la viande crue sont plus susceptibles d'être porteurs de bactéries résistantes à ces médicaments importants, ce qui ne signifie pas que l'animal ou son propriétaire tombera malade.»

«E. coli est une bactérie répandue qui se trouve dans les intestins de tous les humains et animaux, mais c'est une cause fréquente de nombreuses maladies, y compris l'infection des voies urinaires, et peut provoquer des maladies graves, y compris la septicémie, si elle se propage à d'autres parties du corps.»

«Nous devons faire tout ce que nous pouvons pour réduire la circulation de E. coli et d'autres bactéries d'importance critique résistantes aux antibiotiques. Nos études s'ajoutent aux preuves de plus en plus nombreuses que le fait de ne pas donner de viande crue aux chiens peut contribuer à cet objectif.»

«Nous savons que les humains et les animaux partagent des bactéries les uns avec les autres, donc ce que nous trouvons dans votre animal de compagnie peut également être en vous. Les propriétaires d'animaux doivent être encouragés à pratiquer une bonne hygiène et ne pas donner d'aliments crus à votre chien peut en faire partie», a ajouté Kristen Reyher, professeur d'épidémiologie vétérinaire et de santé des populations à la Bristol Veterinary School et co-auteur des deux articles. «Nous pouvons tous faire notre part pour réduire la résistance aux antibiotiques et ses terribles effets sur la santé humaine et animale.»

NB : Merci à Joe Whitworth de m’voir signalé l’information.

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