L'anthranilate agit comme un signal pour moduler la formation de biofilm, la virulence et la tolérance aux antibiotiques de Pseudomonas aeruginosa et des bactéries environnantes

«L'anthranilate agit comme un signal pour moduler la formation de biofilm, la virulence et la tolérance aux antibiotiques de Pseudomonas aeruginosa et des bactéries environnantes», source Microbiology Spectrum.

Résumé

L'anthranilate est une molécule diffusible produite par Pseudomonas aeruginosa et s'accumule à mesure que P. aeruginosa se développe. L'anthranilate est un intermédiaire important pour la synthèse du tryptophane et du signal de de Pseudomonas quinolone (PQS pour Pseudomonas quinolone signal), ainsi que métabolisé par le complexe anthranilate dioxygénase (produits d'opéron antABC). Ici, nous démontrons que l'anthranilate est un facteur clé qui module les phénotypes liés à la pathogénicité de P. aeruginosa et d'autres bactéries environnantes dans l'environnement, telles que la formation de biofilm, la tolérance aux antibiotiques et la virulence. Nous avons constaté que les niveaux d'anthranilate dans les cultures de P. aeruginosa augmentaient rapidement pendant la phase stationnaire, puis diminuaient à nouveau, formant un pic d'anthranilate. La formation de biofilm, la sensibilité aux antibiotiques et la virulence de P. aeruginosa ont été considérablement modifiées avant et après ce pic d'anthranilate. De plus, ces phénotypes ont tous été modifiés par la mutation de antABC et l'ajout exogène d'anthranilate. L'anthranilate a également augmenté la sensibilité aux antibiotiques d'autres espèces de bactéries, telles que Escherichia coli, Salmonella enterica, Bacillus subtilis et Staphylococcus aureus. Avant le pic d'anthranilate, le faible niveau d'anthranilate intracellulaire était maintenu par dégradation de la fonction antABC, dans laquelle l'induction de antABC était également limitée dans une faible mesure. La dégradation prématurée de l'anthranilate, en raison de ses niveaux élevés, et de l'expression de antABC au début de la phase de croissance, semble être toxique pour les cellules. À partir de ces résultats, nous proposons qu'en générant un pic d'anthranilate comme signal, P. aeruginosa peut induire une sorte de changement physiologique dans les cellules environnantes.

Importance

Pseudomonas aeruginosa est un pathogène notoire avec une résistance élevée aux antibiotiques, une forte virulence et la capacité de provoquer une infection chronique en liason avec un biofilm. Nous avons constaté que ces caractéristiques changent profondément avant et après le moment où l'anthranilate est produit sous forme de «pic d'anthranilate». Ce pic agit comme un signal qui induit des changements physiologiques dans les cellules environnantes, diminuant leur tolérance aux antibiotiques et la formation de biofilm. Cette étude est importante car elle fournit un nouvel aperçu de la façon dont les substances de signalisation microbiennes peuvent induire des changements dans les phénotypes liés à la pathogénicité des cellules dans l'environnement. De plus, cette étude montre que l'anthranilate peut être utilisé comme adjuvant aux antibiotiques.

Aux lecteurs du blog

Comme le montre cette notice de la BNF, le blog Albert Amgar a été indexé sur le site de la revue PROCESS Alimentaire. 10 052 articles initialement publiés par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue sont aujourd’hui inacessibles. Disons le franchement, la revue ne veut pas payer 500 euros pour remettre le site à flots, alors qu’elle a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles.

A propos de la tolérance de Listeria monocytognes aux désinfectants

Voici le détail d'un travail scientifique qui va être réalisé au sein du Center for Produce Safety de l'Université de Géorgie par Xiangyu Deng sur Possibility, duration, and molecular predictors of sanitizer tolerance in Listeria monocytogenes.

Résumé

En raison de préoccupations concernant la tolérance bactérienne aux désinfectants, la FDA et le FSIS recommandent la rotation des désinfectants dans les installations de transformation des aliments prêts à consommer afin de mieux maîtriser les pathogènes d'origine alimentaire, en particulier Listeria monocytogenes (Lm).

Ces recommandations sont non contraignantes, si Lm développe une tolérance aux désinfectants courants peu concluante et débattue. Même si Lm développe une tolérance par exposition sublétale à des désinfectants, il faut tenir compte de la durée et de la force de la tolérance pour déterminer si la rotation des désinfectants est nécessaire et à quelle fréquence elle doit être appliquée.

Le manque de consensus et de données quantitatives sur la possibilité et la durée de la tolérance aux désinfectants crée des confusions et des dilemmes, en particulier lorsque la rotation des désinfectants présente des défis considérables en matière de formation, de conformité et de contrôle des coûts pour l'industrie.

Cette proposition décrit des études pour aider à régler le débat et combler les lacunes de connaissances critiques concernant la tolérance de Lm au chlore et aux composés à base d'ammonium quaternaire.

Nous mesurerons les niveaux de désinfectant résiduel dans les installations de transformation des aliments. Nous effectuerons des analyses de laboratoire pour étudier le développement et la persistance de la tolérance. Nous explorerons la prédiction de la tolérance assistée par l'apprentissage automatique et identifierons les signaux évolutifs (ou leur absence) de développement de la tolérance à partir de données de séquençage du génome entier.

Nos résultats fourniront à l'industrie et aux services réglementaires des preuves scientifiques pour étayer, mieux mettre en œuvre ou à juste titre les programmes de rotation des désinfectants.

Résumé technique

Il n'y a toujours pas de consensus scientifique sur la question de savoir si Listeria monocytogenes (Lm) développe une tolérance aux désinfectants.

Nous émettons l'hypothèse que le développement de deux types de tolérance au désinfectant peut se produire chez Lm.

Premièrement, une adaptation à court terme à des niveaux sublétaux de désinfectants induit une tolérance acquise, qui est transitoire et non héréditaire.

Deuxièmement, la sélection à long terme par des désinfectants entraîne une tolérance intrinsèque, qui est établie dans les populations de Lm par des changements évolutifs du génome de Lm.

Pour aider à régler le débat, nous testerons notre hypothèse en distinguant et en étudiant les deux types de tolérance de Lm en utilisant comme désinfectants, le chlore et un composé à base d'ammonium quaternaire.

Dans cette étude, nous étudierons les niveaux de désinfectant résiduels dans une usine de transformation de légumes feuilles vertes et de tomates afin d'évaluer si les niveaux optimaux de désinfectant dérivés du laboratoire pour le développement de la tolérance sont pertinents pour les transformateurs.

Nous évaluerons la possibilité d'une tolérance acquise en mesurant la différence des concentrations minimales d'inhibitrices (CMI) avant et après adaptation au désinfectant.

Nous étudierons comment les différents niveaux de désinfectant et le temps d'exposition affectent le développement de la tolérance acquise, y compris la durée de la tolérance après exposition aux désinfectants.

Nous explorerons les mécanismes derrière le développement de la tolérance acquise au désinfectant en caractérisant les changements temporels du transcriptome de Lm pendant toute la durée de la tolérance.

Nous évaluerons la tolérance intrinsèque dans une collection de 200 à 300 souches de Lm stratégiquement sélectionnées en utilisant des tests de cinétique de croissance à haut débit.

Nous rechercherons des preuves évolutives suggérant le développement d'une tolérance intrinsèque dans l'histoire récente en analysant les données de séquençage du génome entier (WGS) de ces souches.

Nous construirons une classification par apprentissage automatique pour prédire les niveaux de tolérance et identifier les prédicteurs de tolérance clés issus du WGS.

Cette recherche fournira de précieuses informations préalables pour déterminer si la rotation des désinfectants est nécessaire pour prévenir le développement d'une tolérance de Lm aux désinfectants. Les données scientifiques du projet aideront également à optimiser les pratiques de désinfection afin de réduire le développement de la tolérance et de déterminer la fréquence de rotation des désinfectants, si une rotation est nécessaire.

L’affiche de Xiangyu Deng, «Possibility, duration, and molecular predictors of sanitizer tolerance in Listeria monocytogenes» peut être vue ici.

Une vidéo sur YouTube est aussi proposée ici.

A propos de souches mutantes de Escherichia coli et de Staphylococcus aureus obtenues par sélection en laboratoire pour survivre sur des surfaces solides en cuivre

Le blog avait proposé entre autres articles en 2013, Inactivation de norovirus sur des surfaces sèches en alliage de cuivre et Le cuivre est-il le super matériau antimicrobien pour les surfaces de contact dans les hôpitaux ? puis en 2016, Le cuivre en tant que matériau  antibactérien dans différentes installations et enfin en 2019, Des lits en cuivre à l’hôpital tuent des bactéries et sauvent des vies.

Mais voici ce qu'on peut lire, selon les éditeurs de la revue Applied and Environmental Microbioloy, « Des souches mutantes qui survivent sur des surfaces en cuivre ».

Les microbes sont rapidement tués sur les surfaces en cuivre par contact. À l'aide d'une évolution artificielle en laboratoire, Bleichert et ses collègues ont isolé des mutants de Escherichia coli et de Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline (SARM) qui ont survécu à la destruction par contact sur des surfaces de cuivre. Les mutants partageaient des caractéristiques avec des membres de sous-populations bactériennes entrant dans l'état de persistance précoce, mais leur phénotype stable n'était pas limité à une petite sous-population.

En conséquence, des procédures opérationnelles standardisées avec des mesures d'hygiène strictes sont extrêmement importantes pour prévenir l'émergence de souches bactériennes persistantes et tolérantes à la surface du cuivre si des surfaces solides en cuivre doivent être utilisées pour limiter la propagation de bactéries pathogènes.

L'article paru dans Applied and Environmental Microbiology, a pour titre, Souches mutantes de Escherichia coli et de Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline obtenues par sélection en laboratoire pour survivre sur des surfaces solides en cuivre.

Résumé

L'évolution artificielle en laboratoire a été utilisée pour produire des souches mutantes de Escherichia coli et de Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) capables de survivre sur des surfaces antimicrobiennes en cuivre. Ces mutants étaient 12 et 60 fois moins sensibles au processus de destruction par contact lié au cuivre que leurs souches parentales respectives. Les niveaux de croissance du mutant et de son parent dans un milieu de croissance complexe étaient similaires. La tolérance aux ions cuivre des mutants est restée inchangée. Le phénotype mutant est resté stable sur environ 250 générations dans des conditions non stressantes. Les mutants et leurs souches parentales respectives ont accumulé du cuivre libéré des surfaces métalliques à des degrés similaires. Néanmoins, seules les souches parentales ont succombé au stress du cuivre lorsqu'elles ont été mises en cause sur des surfaces en cuivre, subissant une destruction complète de la structure cellulaire.

Le séquençage du génome entier et l'analyse du transcriptome global ont été utilisés pour déchiffrer les altérations génétiques des souches mutantes; cependant, ces résultats n'ont pas expliqué les phénotypes de tolérance au cuivre au niveau systémique.

Au lieu de cela, les mutants partageaient des caractéristiques avec celles des sous-populations bactériennes stressées entrant dans l'état de persistance précoce ou «superficiel». Contrairement à l'état de persistance canonique, cependant, la capacité à survivre sur des surfaces en cuivre a été adoptée par la majorité de la population de souches mutantes. Cela a indiqué que l'application de surfaces solides en cuivre dans les hôpitaux et ailleurs doit être accompagnée de schémas de nettoyage stricts pour maintenir les surfaces en cuivre actives et prévenir l'évolution de souches mutantes tolérantes.

Importance

Les microbes sont rapidement détruits sur des surfaces solides en cuivre par contact. Les surfaces en cuivre ont donc un rôle important à jouer dans la prévention de la propagation des infections nosocomiales. Les bactéries s'adaptent à des environnements naturels et cliniques difficiles grâce à des processus évolutifs, par exemple par l'acquisition de mutations spontanées bénéfiques. Nous souhaitons aborder la question de savoir si des mutants peuvent être sélectionnés qui ont évolué pour survivre à la destruction par contact sur des surfaces solides en cuivre.

Nous avons isolé ces mutants de Escherichia coli et de Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline (SARM) par évolution artificielle en laboratoire. La capacité de survivre sur des surfaces solides en cuivre était un phénotype stable de la population mutante et non limitée à une petite sous-population. En conséquence, des procédures opérationnelles standardisées assorties de mesures d'hygiène strictes sont extrêmement importantes pour prévenir l'émergence et la propagation de souches bactériennes de type persistantes et tolérantes à la surface en cuivre, si les surfaces en cuivre doivent être utilisées de manière durable pour limiter la propagation de bactéries pathogènes, par exemple pour freiner les infections nosocomiales.

Mise à jour du 14 janvier 2021. On lira le communiqué de Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Evolution in a test tube: these bacteria survive on deadly copper surfaces.

Quand des probiotiques permettent à des allergiques au lait de vache de devenir tolérant

Et si des probiotiques permettaient à des allergiques au lait de vache de devenir tolérant …

« Trois souches probiotiques candidates ont un impact sur le microbiote intestinal et induisent une anergie chez les souris allergiques au lait de vache », source Applied and Environmental Microbiology. Article en accès libre.

Résumé

L’allergie au lait de vache est un problème de santé publique mondial, d’autant plus qu’il n’existe pas de traitement efficace, mis à part l’évitement du lait et des produits laitiers.

Le but de cette étude était d'évaluer le rôle bénéfique de trois souches probiotiques préalablement sélectionnées pour leurs propriétés prophylactiques dans un modèle murin d'allergie à la β-lactoglobuline. L'administration de Lactobacillus rhamnosus LA305, L. salivarius LA307 ou Bifidobacterium longum subsp. Infantis LA308 pendant 3 semaines post-sensibilisation et provocation a modifié la composition du microbiote intestinal, avec une augmentation du groupe Prevotella NK3B31 et une diminution de Marvinbryantia, appartenant à la famille des Lachnospiraceae. Bien qu'aucun impact sur les marqueurs de sensibilisation n'ait été détecté, des modifications de l'expression des gènes iléaux foxp3, tgfβ et il10, ainsi que des altérations métabolomiques plasmatiques de la voie du tryptophane, ont été observées.

De plus, des études ex vivo ont montré que toutes les souches probiotiques induisaient des diminutions significatives de la production de cytokines par les splénocytes stimulés par la β-lactoglobuline.

Pris ensemble, ces résultats suggèrent que les trois souches probiotiques testées conduisent à des altérations des réponses immunitaires, c'est-à-dire à l'induction d'une anergie tolérogène et à des réponses anti-inflammatoires. Cette anergie pourrait être liée à des modifications du microbiote cæcal bien qu'aucun impact sur les concentrations fécales d'acides gras à chaîne courte n'ait été détecté. L'anergie pourrait également être liée à un impact direct des souches probiotiques sur les cellules dendritiques, car l'expression des molécules costimulatrices était diminuée après la co-incubation de ces souches avec des cellules dendritiques dérivées de la moelle osseuse.

Pour conclure, les trois souches probiotiques candidates ont induit un microbiote intestinal spécifique à la souche et des changements métaboliques, ce qui pourrait potentiellement être bénéfique pour la santé générale, ainsi que l'anergie, ce qui pourrait contribuer à l'acquisition de la tolérance orale.

Importance
Nous avons montré précédemment que trois souches probiotiques, à savoir Lactobacillus rhamnosus LA305, L. salivarius LA307 et Bifidobacterium longum subsp. Infantis LA308, a exercé différents effets préventifs dans un modèle murin d’allergie au lait de vache.

Dans cette étude, nous avons évalué leurs avantages potentiels dans un modèle murin curatif d'allergie au lait de vache. Lorsqu'elle est administrée pendant 3 semaines après le processus de sensibilisation et une première réaction allergique, aucune des souches n'a modifié les niveaux de sensibilisation et les marqueurs allergiques.

Cependant, les trois souches affectent les communautés de bactéries intestinales et modifient les réponses immunitaires et inflammatoires, conduisant à un profil tolérogène.

Fait intéressant, les trois souches ont exercé un effet direct sur les cellules dendritiques, qui sont connues pour jouer un rôle majeur dans la sensibilisation alimentaire grâce à leurs propriétés potentiellement tolérogènes et leurs réponses anergiques.

Prises ensemble, ces données indiquent un rôle potentiellement bénéfique des souches probiotiques testées dans ce modèle d’allergie au lait de vache en ce qui concerne l’acquisition de la tolérance.

Les auteurs notent,

En conclusion, l'administration orale des trois souches probiotiques candidates à des souris allergiques induites à la β-lactoglobuline a conduit à des modifications microbiennes et métaboliques potentiellement bénéfiques pour la santé générale, ainsi qu'à l'anergie, qui pourraient jouer un rôle dans l'acquisition de la tolérance orale. L'immunothérapie est recommandée chez les enfants souffrant d'allergies persistantes au lait de vache de plus de 4 à 5 ans, mais elle a été associée à des risques importants. Par conséquent, ces souches probiotiques pourraient être utiles comme adjuvants dans les processus de désensibilisation, comme indiqué pour une souche de L. rhamnosus associée à une immunothérapie orale de l'allergie aux arachides. Des études cliniques devraient être réalisées pour confirmer ces résultats expérimentaux et pour déterminer laquelle est la plus efficace des trois souches probiotiques testées.

Cliquez sur l'image pour l'agrandir 

COVID-19 : Des nouvelles du vaccin expérimental de Moderna

« NIH: le vaccin expérimental contre le COVID-19 est généralement bien toléré et a provoqué une activité d'anticorps neutralisants », source Outbreak News Today.

Un vaccin expérimental, ARNm-1273, conçu pour protéger contre le SRAS-CoV-2, le virus qui cause la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), a été généralement bien toléré et a rapidement neutraliser l'activité des anticorps chez des adultes en bonne santé, selon des résultats provisoires publiés en ligne dans le New England Journal of Medicine. L'essai de phase 1 en cours est soutenu par le National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), composante des National Institutes of Health. Le vaccin expérimental est développé conjointement par des chercheurs du NIAID et de Moderna Inc. basée à Cambridge, Massachusetts. Fabriqué par Moderna, l'ARNm-1273 est conçu pour induire des anticorps neutralisants dirigés contre une partie de la protéine «spike» du coronavirus, que le virus utilise pour se lier aux cellules humaines et y pénétrer.

L'essai a été mené par Lisa A. Jackson du Kaiser Permanente Washington Health Research Institute à Seattle, où le premier participant a reçu le vaccin candidat le 16 mars. Ce rapport intérimaire détaille les premiers résultats des 45 premiers participants âgés de 18 ans à 55 ans inscrits dans les sites d'étude à Seattle et à l'Université Emory à Atlanta. Trois groupes de 15 participants ont reçu deux injections intramusculaires, à 28 jours d'intervalle, de 25, 100 ou 250 microgrammes du vaccin expérimental. Tous les participants ont reçu une injection; 42 ont reçu les deux injections programmées.

En avril, l'essai a été élargi pour inscrire des adultes de plus de 55 ans ; il compte désormais 120 participants. Cependant, les résultats récemment publiés ne couvrent que le groupe d'âge des 18 à 55 ans.

Concernant la sécurité sanitaire, aucun événement indésirable grave n'a été rapporté. Plus de la moitié des participants ont signalé de la fatigue, des maux de tête, des frissons, des myalgies ou des douleurs au site d'injection. Les événements indésirables systémiques étaient plus fréquents après la deuxième vaccination et chez ceux qui avaient reçu la dose de vaccin la plus élevée. Les données sur les effets secondaires et les réponses immunitaires à diverses doses de vaccin ont informé des doses utilisées ou prévues pour une utilisation dans les essais cliniques de phase 2 et 3 du vaccin expérimental.

L'analyse intermédiaire comprend des résultats des essais mesurant les niveaux d'activité neutralisante induite par le vaccin jusqu'au J43 après la deuxième injection. Deux doses de vaccin ont provoqué des niveaux élevés d'activité d'anticorps neutralisants qui étaient supérieurs aux valeurs moyennes observées dans les sérums de convalescence obtenus auprès de personnes atteintes d'une maladie à COVID-19 confirmée.

Un essai clinique de phase 2 sur l'ARNm-1273, parrainé par Moderna, a commencé à être enrôlé fin mai. Des plans sont en cours pour lancer un essai d'efficacité de phase 3 en juillet 2020.

De l'évolution de Listeria monocytogenes dans une usine de transformation des aliments

Cet article publié, en intégralité et gratuitement, dans la revue Applied and Environmental Microbiology a pour titre, « L'évolution de Listeria monocytogenes dans une usine de transformation des aliments implique des substitutions limitées d'un seul nucléotide mais une diversification considérable par le gain et la perte de prophages* ».

Résumé

Le séquençage du génome entier (WGS pour Whole-genome sequencing) devient la méthode standard pour le sous-typage de Listeria monocytogenes. L'interprétation des données WGS pour les isolats provenant des aliments et des environnements associés est cependant difficile en raison d'un manque de données détaillées sur l'évolution de Listeria dans les installations de transformation.

Ici, nous avons utilisé les données WGS précédemment collectées pour 40 isolats de L. monocytogenes obtenus dans une usine de transformation de saumon fumé à froid entre 1998 et 2015 pour démontrer l'évolution moléculaire de L. monocytogenes dans cette installation, combinée à une évaluation phénotypique d'isolats sélectionnés.

Les isolats représentaient trois clusters (1, 2 et 3) ; les isolats du groupe 3 (n = 32) ont été obtenus sur 18 ans. Le taux de mutation moyen pour le groupe 3 a été estimé à 1,15 × 10⁻⁷ changements par nucléotide par an (∼0,35 changements par génome par an) ; on estime que les ancêtres communs les plus récents des sous-groupes 3a et 3b se sont produits vers 1958 et 1974, respectivement, à l'âge de l'établissement, ce qui suggère une persistance sur le long terme dans cet établissement.

Une grande diversité de prophages a été observée dans les sous-clusters 3a et 3b, qui ont un profil de prophage partagé et six profils de prophage uniques pour chaque sous-cluster (avec 16 profils de prophage retrouvés parmi les 40 isolats). L'opéron de tolérance aux ammonium quaternaires bcrABC a été retrouvé dans tous les isolats des clusters 2 et 3, tandis que le gène de tolérance au désinfectant, le transposon qacH (tolérance aux ammonium quaternaires) a été retrouvé dans un isolat du cluster 1; la présence de ces gènes était corrélée à la capacité de survivre à des concentrations accrues de désinfectants.

Les isolats sélectionnés ont montré une variation significative dans la capacité de se fixer aux surfaces, les isolats persistants se fixant mieux que les isolats transitoires à 21°C.

Importance

Les connaissances sur l'évolution génétique de L. monocytogenes dans les installations de transformation alimentaire sur plusieurs années font généralement défaut.

Ces informations sont essentielles pour interpréter les résultats du WGS impliquant des aliments ou des isolats associés aux aliments.

Cette étude suggère que L. monocytogenes qui persiste dans les installations de transformation peut évoluer avec un faible taux de mutation d’un seul nucléotidique principalement dû à une sélection négative (c'est-à-dire purificatrice) mais avec une diversification rapide des prophages.

Par conséquent, l'isolement de L. monocytogenes avec peu de différences de polymorphisme d’un seul nucléotidique dans différents endroits (par exemple, les ateliers fournisseurs et les ateliers récepteurs) est possible, soulignant l'importance des métadonnées épidémiologiques et détaillées des isolats pour interpréter les données WGS dans l'enquête de traçabilité.

Notre étude montre également comment les analyses des données WGS avancées peuvent être utilisées pour soutenir les efforts d'analyse des causes profondes et peuvent, par exemple, localiser le moment où un événement de persistance a commencé (qui pourrait alors potentiellement être lié aux changements d'installations, à l'introduction de nouveaux équipements, etc. ).

Dans la conclusion, les auteurs notent,

Dans cette étude, nous avons montré que dans les conditions environnementales retrouvées dans une installation de fumage de poissons, L. monocytogenes évolue plus lentement que ce qui avait été estimé précédemment sur la base d'isolats humains et animaux.

De plus, nous avons également montré que la diversification du prophage est répandue et se produit beaucoup plus rapidement que la diversification d’un seul nucléotidique.

Par conséquent, l'isolement des souches de L. monocytogenes avec peu de différences du polymorphisme d’un seul nucléotidique à différents endroits (par exemple, les ateliers fournisseurs et les ateliers récepteurs) est possible, soulignant l'importance des métadonnées épidémiologiques et isolées détaillées pour interpréter les données du WGS dans les enquêtes de traçabilité. Par exemple, alors que l'isolement d'isolats presque identiques à partir d'équipements en contact avec les aliments immédiatement après désinfection serait un signe de persistance, l'isolement répété dans une zone de matières premières à fort trafic pendant la production pourrait également être dû à la réintroduction. Ce défi est soutenu par le fait que nous avons identifié un isolat étroitement lié au sous-cluster 3b, qui persistait dans l'établissement X évalué ici, dans un autre établissement voisin, semblable aux résultats d'une étude précédente qui a également identifié des isolats de L. monocytogenes étroitement apparentés (< 4 différences du polymorphisme d’un seul nucléotidique) dans des établissements de distribution dans deux États différents aux États-Unis. Bien que nous croyions que cette étude fournisse des résultats clés qui peuvent aider les services réglementaires et l'industrie alimentaire à mieux interpréter les données du WGS de L. monocytogenes provenant d’aliments et des isolats associés aux aliments, de futures études similaires dans des installations avec différentes conditions environnementales seront nécessaires pour fournir une plus large contexte et des résultats plus généralisables. Surtout, nos données suggèrent également que les estimations des ancêtres communs les plus récents pourraient être en mesure d'aider à identifier des événements spécifiques (par exemple, des expansions) qui pourraient avoir été associés à l'introduction de L. monocytogenes persistants ; cette approche peut être utile pour les efforts d'analyse des causes profondes.

*Un prophage est un génome de bactériophage inséré et intégré dans le chromosome d'ADN bactérien circulaire ou existe sous forme de plasmide extrachromosomique.

Listeria monocytogenes, à propos de la tolérance aux désinfectants et la résistance croisée avec des antibiotiques

Voici le résumé d’une étude, « Des isolats de Listeria monocytogenes tolérants aux biocides provenant d'usines allemandes de production alimentaire ne présentent pas de résistance croisée avec des antibiotiques cliniquement pertinents ».

L’étude est parue dans Applied and Environmental Microbiology, une revue de l’American Society for Microbiology.

Résumé

La contamination des aliments au cours de la transformation est reconnue comme l'une des principales voies de transmission de Listeria monocytogenes. Pour prévenir la contamination microbienne, les biocides sont largement utilisés comme désinfectants dans les usines de transformation alimentaires.

Cependant, il y a des inquiétude à propos du développement d’une résistance antimicrobienne chez les agents pathogènes d'origine alimentaire en raison de l'utilisation répandue de biocides.

Dans notre étude, 93 isolats de L. monocytogenes provenant d’installations allemandes de production alimentaire ont été (i) analysés avec des essais de sensibilité aux biocides et de résistance aux antibiotiques en utilisant des essais de microdilution sur bouillon, (ii) analysés pour des liens entre la sensibilité réduite aux biocides et la résistance aux antibiotiques, et (iii) caractérisés par séquençage du génome complet, y compris la détection de gènes codant pour la tolérance aux biocides, la résistance aux antibiotiques et d'autres facteurs de virulence.

Quinze isolats de L. monocytogenes étaient tolérants au chlorure de benzalkonium (BAC) et des gènes conférant la tolérance au BAC ont été retrouvés dans 13 d’entre eux.

La résistance aux antibiotiques n’a pas été associée à la tolérance aux biocides. Les isolats tolérants au BAC ont été attribués à 6 complexes clonaux par MLST, et la plupart d'entre eux hébergeaient des pseudogènes d'internine A avec des codons d'arrêt ou des délétions prématures (n = 9).

Notre étude a démontré une grande diversité génétique parmi les isolats étudiés, y compris des génotypes fréquemment impliqués dans des infections humaines. Bien que les études d’adaptation in vitro aux biocides aient suscité des inquiétudes quant à l’augmentation de la résistance croisée aux antibiotiques, nos résultats ne fournissent aucune preuve de ce phénomène dans les isolats de terrain.

Importance

Les agents pathogènes d'origine alimentaire tels que L. monocytogenes peuvent persister dans les environnements de production alimentaire pendant une longue période, provoquant ainsi des épidémies régulières. Par conséquent, les agents pathogènes bactériens peuvent survivre aux procédures de nettoyage et de désinfection. En conséquence, ils peuvent être exposés de manière répétée à des concentrations sublétales de désinfectants, ce qui pourrait entraîner une adaptation bactérienne à ces biocides. De plus, on sait que la résistance aux antibiotiques et la résistance croisée évoluent sous la pression de sélection des biocides in vitro. Par conséquent, la tolérance aux antimicrobiens semble jouer un rôle crucial dans la résilience et la persistance des agents pathogènes d'origine alimentaire dans la chaîne alimentaire et pourrait réduire les options thérapeutiques des maladies infectieuses.