Un nouvel anticorps thérapeutique neutralisant la shigatoxine 2a avec une faible immunogénicité et une efficacité élevée

Les traitements des infections à Escherichia coli producteurs de shigatoxines sont limités car les antibiotiques peuvent induire une surexpression de la shigatoxine (Stx). Dans une étude parue dans Antimicrobial Agents and Chemotherapy, des chercheurs décrivent un nouvel anticorps neutralisant Stx2a avec une faible immunogénicité et une efficacité élevée.

Treatments for Shiga toxin-producing Escherichia coli infections are limited since antibiotics can induce overexpression of Shiga toxin (Stx). In #AACJournal, researchers describe a novel Stx2a neutralizing antibody with low immunogenicity & high efficacy. https://t.co/LrBTysmTOD pic.twitter.com/GcbJgOX1FF

— ASM (@ASMicrobiology) December 21, 2023

SARS-CoV-2 : L’infection induit des anticorps capables de tuer les cellules infectées quelle que soit la sévérité de la maladie

 «SARS-CoV-2 : L’infection induit des anticorps capables de tuer les cellules infectées quelle que soit la sévérité de la maladie», source Institut Pasteur.

En s’appuyant sur des études épidémiologiques de terrain et sur la cohorte hospitalière FrenchCOVID coordonnée par l’Inserm, des équipes de l’Institut Pasteur, du CNRS et du Vaccine Research Institute (VRI, Inserm/université Paris Est Créteil) ont étudié les anticorps induits chez des individus infectés par le SARS-CoV-2 de manière asymptomatique ou symptomatique. Les chercheurs et chercheuses ont montré que l’infection induit des anticorps polyfonctionnels, c’est à dire possédant une activité neutralisante mais aussi capables d’activer d’autres mécanismes de défense tels que les cellules tueuses NK (Natural Killer) ou les molécules du complément. Les niveaux d’anticorps sont légèrement plus faibles chez les personnes asymptomatiques en comparaison à celles symptomatiques, mais des anticorps polyfonctionnels sont retrouvés chez tous les individus. Ces résultats montrent que l’infection induit des anticorps capables de tuer les cellules infectées quelle que soit la sévérité de la maladie. L’étude fait l’objet d’une publication dans la revue Cell Reports Medicine, le 21 avril 2021.

Près de la moitié des personnes infectées par le SARS-CoV-2 ne développe pas de symptôme. Cependant, la réponse immunitaire induite par les formes asymptomatiques de la Covid-19 est encore mal caractérisée. L’étendue des fonctions antivirales des anticorps anti-SARS-CoV-2 est également mal comprise. En effet, les anticorps sont capables de neutraliser le virus, mais aussi d’activer des fonctions dites « non neutralisantes ». Parmi elles, la cytotoxicité dépendante des anticorps (antibody-dependent cellular cytotoxicity ; ADCC) et l’activation du complément sont des constituants majeurs de la réponse immunitaire et de l’efficacité de certains vaccins. L’ADCC est un phénomène en deux étapes, durant lequel les cellules infectées sont d’abord reconnues par les anticorps, puis détruites par les cellules NK. Le complément est un ensemble de protéines plasmatiques qui permet également l’élimination des cellules ciblées par les anticorps. La capacité des anticorps à activer ces fonctions non neutralisantes est encore très peu décrite dans le contexte de l’infection par le SARS-CoV-2.

Dans un premier temps, les équipes de l’Institut Pasteur, du CNRS et du VRI (Inserm/université Paris Est Créteil) ont mis au point de nouveaux tests permettant de mesurer les différentes fonctions des anticorps. Elles ont développé des tests pour étudier la mort cellulaire induite par les cellules NK ou par le complément en présence d’anticorps. En étudiant les cultures en temps réel grâce à la vidéo-microscopie, les chercheurs et chercheuses ont montré que les cellules NK, en présence des anticorps, peuvent tuer les cellules infectées, démontrant une nouvelle activité antivirale des anticorps.

Les scientifiques ont ensuite étudié des sérums de patients atteints de formes symptomatiques ou asymptomatiques de la Covid-19. En plus de leurs nouveaux tests, ils ont analysé les anticorps avec différentes méthodes préalablement développées à l’Institut Pasteur, telles que le test S-Flow pour rechercher la présence d’anticorps dirigés contre la Spike du SARS-CoV-2 et le test S-Fuse qui mesure la capacité de neutralisation de ces anticorps.

«Cette étude a permis de montrer que les individus infectés par le SARS-CoV-2 possèdent des anticorps capables d’attaquer le virus de différentes manières, en l’empêchant d’entrer dans les cellules (neutralisation) ou en tuant les cellules infectées grâce à l’activation des cellules NK (via la fonction ADCC). On parle donc d’anticorps polyfonctionnels», explique Timothée Bruel, co-auteur principal de l’étude et chercheur au sein de l’unité Virus et immunité à l’Institut Pasteur et au VRI. En comparant différents groupes de patients, les scientifiques ont ensuite montré que les personnes asymptomatiques possèdent également des anticorps polyfonctionnels et que leur réponse est légèrement plus faible que celle des patients atteints de formes modérées de la Covid-19.

«Cette étude révèle de nouveaux modes d’action des anticorps et suggère que la protection induite par une infection asymptomatique est très proche de celle observée après une infection symptomatique», conclut Olivier Schwartz, co-auteur principal de l’étude et responsable de l’unité Virus et immunité à l’Institut Pasteur et au VRI (Inserm/université Paris Est Créteil).

Des études montrent une réponse immunitaire sur le long terme contre le COVID-19

« Des études montrent une réponse immunitaire sur le long terme contre le COVID-19 », source article de Stacy Kuebelbeck Paulsen paru le 26 octobre 2020 dans CIDRAP News.

La durabilité de la réponse immunitaire au SARS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, est essentielle pour comprendre les épidémies communautaires et les données des tests sérologiques, et pour prédire la longévité de la protection vaccinale. Deux nouvelles études démontrent comment la gravité de la maladie est prédictive de la production d'anticorps à plus long terme et détaillent comment l'immunité diminue avec le temps, mais peut exister jusqu'à 7 mois.

Maladie grave et réponse immunitaire plus durable

Une étude britannique dans Nature Microbiology a examiné 65 personnes atteintes d'une infection confirmée par le SARS-CoV-2 par PCR et 31 personnels de santé (PS) séropositifs.

Les auteurs de l'étude ont échantillonné des patients - avec des symptômes allant d'asymptomatiques à critiques - pour les réponses anticorps dans le sérum collectées jusqu'à 94 jours après l'apparition des symptômes à l'aide d'un dosage immunoenzymatique.

Plus de 95% des patients ont présenté une séroconversion - la présence d'anticorps détectables contre le SARS-CoV-2 - et des anticorps neutralisants dans les échantillons 8 jours après l'apparition des symptômes, mais l'ampleur de la réponse des anticorps neutralisants semble dépendre de la gravité de la maladie, avec un pic d'anticorps plus faible niveaux chez les individus présentant une maladie plus bénigne.

Les chercheurs ont découvert que la réponse anticorps contre le SARS-CoV-2 est typique d'autres infections virales aiguës, avec un pic initial de réponse anticorps suivi d'une baisse des niveaux. Les anticorps, immunoglobulines (Ig) A et IgM, ont approché les niveaux de base chez certains patients 60 jours après le début des symptômes, les IgG restant élevées chez la plupart des patients jusqu'à 94 jours après le début.

Chez certains individus avec de faibles niveaux initiaux d'anticorps neutralisants du pic (dose infectieuse moyenne [DI50], 100 à 300), les anticorps étaient indétectables après 50 jours, tandis que certains patients avec des niveaux initiaux élevés (DI50, 1000 à 3500) ont maintenu des anticorps neutralisants pendant plus plus de 60 jours après les premiers symptômes.

«Chez certains individus, l'infection par le SARS-CoV-2 ne génère qu'une réponse d'anticorps neutralisants transitoire qui diminue rapidement», suggèrent les auteurs. En revanche, les taux d'anticorps chez les patients présentant des taux initiaux élevés (DI50 > 4000) ont diminué mais sont restés dans la fourchette de 1000 à 3500 jusqu'à la fin de la période d'étude.

Anticorps jusqu'à 7 mois après l'infection

Des résultats similaires ont émergé d'une étude portugaise publiée la semaine dernière dans le European Journal of Immunology qui a examiné les niveaux d'anticorps chez plus de 500 patients hospitalisés, personnels de santé et volontaires qui s'étaient rétablis du COVID-19. Les chercheurs ont découvert que 90% des individus positifs au SARS-CoV-2 avaient des anticorps détectables de 40 jours à 7 mois après l'infection, avec des taux plus élevés chez les patients atteints d'une maladie plus grave.

L'étude a également identifié une augmentation rapide des niveaux d'anticorps dans les trois premières semaines après l'apparition des symptômes. Bien que les taux d'anticorps IgA et IgM aient diminué avec le temps, les chercheurs ont trouvé une activité de neutralisation du virus et des anticorps IgG détectables pendant au moins 6 mois après l'infection par le SARS-CoV-2.

Les hommes avaient des niveaux d'anticorps plus élevés dans la phase aiguë, mais des niveaux équilibrés entre les sexes dans les mois suivant l'infection. Aucune différence significative entre les groupes d'âge n'a été identifiée pour la production d'anticorps.

«Bien que nous ayons observé une réduction des taux d'anticorps au fil du temps, les résultats de nos tests de neutralisation ont montré une activité de neutralisation robuste jusqu'à sept mois après l'infection chez une grande proportion de sujets préalablement testés positifs au virus» a expliqué l'auteur principal Marc Veldhoen, dans un communiqué de presse de l'institut de médecine moléculaire, Lisbonne.

La plupart des personnes infectées par le SARS-CoV-2 auront une immunité protectrice contre les virus en circulation pendant plusieurs mois après l'infection initiale, concluent les auteurs.

Les niveaux d'anticorps COVID-19 varient considérablement chez des patients rétablis

« Les niveaux d'anticorps COVID-19 varient considérablement chez des patients rétablis », source article de Mary Van Beusekom paru le 19 août 2020 dans CIDRAP News.

Une étude publiée dans JAMA Internal Medicine de 175 patients qui se sont rétablis d'un COVID-19 léger révèle une large variation des niveaux d'anticorps contre le nouveau coronavirus, allant de niveaux très élevés chez 2 patients à des niveaux indétectables chez 10, mais aucune différence significative dans durée de la maladie.

Des chercheurs de l'Université Fudan de Shanghai, Chine, ont mesuré les niveaux d'anticorps chez des patients COVID-19 libérés du centre de santé publique de Shanghai après avoir été hospitalisés du 24 janvier au 26 février.

Sur les 175 patients, 165 (94%) avaient des niveaux significativement plus élevés d'anticorps COVID-19 que 13 témoins non infectés dans la phase de convalescence de l'infection. Les niveaux d'anticorps étaient moyens-faibles chez 29 patients (17%), moyens-élevés chez 69 patients (39%) et élevés chez 25 patients (14%).

Âge, sexe, réponse inflammatoire

Les chercheurs ont détecté des anticorps neutralisants chez les patients 4 à 6 jours après l'apparition des symptômes, et les taux ont culminé 4 à 11 jours plus tard. Les niveaux d'anticorps étaient significativement plus élevés chez les 56 sujets plus âgés (60 à 85 ans) et 63 sujets d'âge moyen (40 à 59 ans) que chez 56 patients plus jeunes (15 à 39 ans). Les 10 patients avec des anticorps indétectables étaient plus jeunes (âge médian, 34 ans), et 8 d'entre eux étaient des femmes.

À la sortie de l'hôpital, des taux d'anticorps significativement plus élevés ont été retrouvés chez 82 hommes (47%) que chez 93 femmes (53%).

Parmi les 117 patients avec des données de suivi à 2 semaines, le niveau médian d'anticorps était nettement inférieur au niveau médian à la sortie de l'hôpital, et les 56 hommes (48%) avaient encore des niveaux d'anticorps significativement élevés par rapport aux 61 femmes (52% ). Les niveaux d'anticorps chez les patients avec des niveaux d'anticorps indétectables à la sortie de l'hôpital sont restés indétectables au suivi.

À l'admission à l'hôpital, les taux d'anticorps étaient corrélés avec ceux de la protéine C-réactive (indiquant une réponse inflammatoire) mais pas avec le nombre de lymphocytes (indiquant une réponse immunitaire à l'infection). De faibles niveaux de lymphocytes et des niveaux élevés de protéine C-réactive ont été associés à de mauvais résultats pour le COVID-19.

Par rapport aux sujets plus jeunes, les patients plus âgés et d'âge moyen avaient un nombre de lymphocytes significativement plus bas et des taux de protéine C-réactive plus élevés à l'hospitalisation, indiquant une réponse immunitaire plus faible et une réponse inflammatoire plus forte au coronavirus.

Rôle du plasma de convalescents

Bien que les anticorps neutralisants soient considérés comme importants pour la guérison des maladies infectieuses et la protection contre une infection future, on ne sait pas s'ils confèrent une immunité contre une future infection au COVID-19 et combien de temps cette immunité pourrait durer.

L'utilisation de plasma de convalescents, ou le transfert de plasma sanguin de patients atteints de coronavirus rétablis à des patients non infectés pour conférer une immunité, repose sur l'hypothèse que les anticorps COVID-19 peuvent fournir une protection contre l'infection, mais sa durabilité est inconnue.

Les auteurs ont dit que la variabilité des niveaux d'anticorps neutralisants chez les patients atteints de COVID-19 rétablis met en évidence la nécessité d'évaluer et d'ajuster les niveaux d'anticorps dans le plasma de convalescents avant l'administration, si cela s'avère efficace.

Ils ont également souligné que leur découverte selon laquelle les patients plus âgés COVID-19 ont tendance à avoir des niveaux d'anticorps plus élevés, mais des résultats pires les amène à remettre en question l'hypothèse selon laquelle les anticorps protègent contre une future infection à coronavirus. « Les implications cliniques potentielles de ces découvertes pour le développement de vaccins et la protection future contre l'infection sont inconnues », ont-ils écrit.

Dans une note de l’éditeur du même journal, Mitchell Katz de NYC Health + Hospitals, a noté que les patients plus âgés, les hommes et ceux qui ont des réponses inflammatoires plus fortes, qui ont généralement eu de mauvais résultats pour le COVID-19, avaient des niveaux d'anticorps plus élevés que les autres sujets de l'étude, « suggérant que les titres plus élevés d'anticorps ne conduisent pas nécessairement à un taux de récupération plus élevé. »

Katz a appelé à des recherches pour savoir si certains groupes de personnes ont besoin de niveaux d'anticorps plus élevés pour se rétablir et si des niveaux plus élevés d'anticorps se traduisent par une meilleure protection contre le virus en termes de vaccin.

« Dans cette étude, 10 des 175 patients avaient des niveaux d'anticorps indétectables malgré une infection documentée », a-t-il écrit. « Ces patients sont-ils sensibles à une infection future, ou ont-ils une protection basée sur leur infection, sensibilisant les lymphocytes T cytotoxiques ou killer ou les lymphocytes B à mémoires? Les réponses à ces questions pointues peuvent conduire à une meilleure protection face à cet adversaire encore largement méconnu. »

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous

COVID-19 : Des nouvelles du vaccin expérimental de Moderna

« NIH: le vaccin expérimental contre le COVID-19 est généralement bien toléré et a provoqué une activité d'anticorps neutralisants », source Outbreak News Today.

Un vaccin expérimental, ARNm-1273, conçu pour protéger contre le SRAS-CoV-2, le virus qui cause la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), a été généralement bien toléré et a rapidement neutraliser l'activité des anticorps chez des adultes en bonne santé, selon des résultats provisoires publiés en ligne dans le New England Journal of Medicine. L'essai de phase 1 en cours est soutenu par le National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), composante des National Institutes of Health. Le vaccin expérimental est développé conjointement par des chercheurs du NIAID et de Moderna Inc. basée à Cambridge, Massachusetts. Fabriqué par Moderna, l'ARNm-1273 est conçu pour induire des anticorps neutralisants dirigés contre une partie de la protéine «spike» du coronavirus, que le virus utilise pour se lier aux cellules humaines et y pénétrer.

L'essai a été mené par Lisa A. Jackson du Kaiser Permanente Washington Health Research Institute à Seattle, où le premier participant a reçu le vaccin candidat le 16 mars. Ce rapport intérimaire détaille les premiers résultats des 45 premiers participants âgés de 18 ans à 55 ans inscrits dans les sites d'étude à Seattle et à l'Université Emory à Atlanta. Trois groupes de 15 participants ont reçu deux injections intramusculaires, à 28 jours d'intervalle, de 25, 100 ou 250 microgrammes du vaccin expérimental. Tous les participants ont reçu une injection; 42 ont reçu les deux injections programmées.

En avril, l'essai a été élargi pour inscrire des adultes de plus de 55 ans ; il compte désormais 120 participants. Cependant, les résultats récemment publiés ne couvrent que le groupe d'âge des 18 à 55 ans.

Concernant la sécurité sanitaire, aucun événement indésirable grave n'a été rapporté. Plus de la moitié des participants ont signalé de la fatigue, des maux de tête, des frissons, des myalgies ou des douleurs au site d'injection. Les événements indésirables systémiques étaient plus fréquents après la deuxième vaccination et chez ceux qui avaient reçu la dose de vaccin la plus élevée. Les données sur les effets secondaires et les réponses immunitaires à diverses doses de vaccin ont informé des doses utilisées ou prévues pour une utilisation dans les essais cliniques de phase 2 et 3 du vaccin expérimental.

L'analyse intermédiaire comprend des résultats des essais mesurant les niveaux d'activité neutralisante induite par le vaccin jusqu'au J43 après la deuxième injection. Deux doses de vaccin ont provoqué des niveaux élevés d'activité d'anticorps neutralisants qui étaient supérieurs aux valeurs moyennes observées dans les sérums de convalescence obtenus auprès de personnes atteintes d'une maladie à COVID-19 confirmée.

Un essai clinique de phase 2 sur l'ARNm-1273, parrainé par Moderna, a commencé à être enrôlé fin mai. Des plans sont en cours pour lancer un essai d'efficacité de phase 3 en juillet 2020.

COVID-19: des anticorps de lamas comme voie potentielle pour un traitement contre le coronavirus

« Des anticorps de lama comme voie potentielle pour un traitement contre le coronavirus », source UT News du 29 avril 2020.

Le lama Winter, VIB de l’Université de Gand.
Photo crédit: Tim Coppens

La recherche d'un traitement efficace pour COVID-19 a conduit une équipe de chercheurs à trouver un allié improbable pour leur travail: un lama nommé Winter. Il s’agit d’une femelle de quatre ans qui vit en Belgique. L'équipe de l'Université du Texas à Austin, du National Institutes of Health et de l'Université de Gand en Belgique, a présenté une étude le 5 mai dans la revue Cell., dont ses conclusions ouvre une voie potentielle pour un traitement contre le coronavirus impliquant des lamas. Le document est actuellement disponible en ligne en tant que «pré-épreuve», ce qui signifie qu'il est révisé par des pairs, mais il est en cours de formatage final.

Les chercheurs ont lié deux copies d'un type spécial d'anticorps produit par les lamas pour créer un nouvel anticorps qui se lie étroitement à une protéine clé du coronavirus qui cause le COVID-19. Cette protéine, appelée spike protein ou protéine de pointe, permet au virus de pénétrer dans les cellules hôtes. Les premiers essais indiquent que l'anticorps bloque le virus qui présentent cette protéine de pointe afin d'infecter les cellules en culture.

« Il s'agit de l'un des premiers anticorps connus pour neutraliser le SRAS-CoV-2 », a déclaré Jason McLellan, professeur à l'UT Austin et coauteur principal, faisant référence au virus qui cause le COVID-19.

L'équipe se prépare désormais à mener des études précliniques sur des animaux tels que des hamsters ou des primates non humains, dans l'espoir de procéder à de nouveaux essais sur l'homme. L'objectif est de développer un traitement qui aiderait les personnes peu de temps après l'infection par le virus.

« Les vaccins doivent être administrés un mois ou deux avant l'infection pour assurer la protection », a déclaré McLellan. « Avec les thérapies par anticorps, vous donnez directement à quelqu'un les anticorps protecteurs et donc, immédiatement après le traitement, ils doivent être protégés. Les anticorps pourraient également être utilisés pour traiter quelqu'un qui est déjà malade afin d'atténuer la gravité de la maladie. »

Cela serait particulièrement utile pour les groupes vulnérables tels que les personnes âgées, qui réagissent modestement aux vaccins, ce qui signifie que leur protection peut être incomplète. Les personnels de santé et d’autres personnes à risque d'exposition au virus peuvent également bénéficier d'une protection immédiate.

Lorsque le système immunitaire des lamas détecte des envahisseurs étrangers tels que des bactéries et des virus, ces animaux (et d'autres camélidés tels que les alpagas) produisent deux types d'anticorps: l'un qui est similaire aux anticorps humains et l'autre qui ne représente qu'environ un quart de la taille. Ces plus petits, appelés anticorps à domaine unique ou nanocorps, peuvent être nébulisés et utilisés dans un inhalateur.

« Cela les rend potentiellement très intéressants en tant que médicament pour un agent pathogène respiratoire, car vous l'apportez directement sur le site de l'infection », a déclaré Daniel Wrapp, étudiant diplômé du laboratoire de McLellan et co-premier auteur de l'article.

Winter, un lama, a 4 ans et vit toujours dans une ferme dans la campagne belge avec environ 130 autres lamas et alpagas. Son rôle dans l'expérience s'est produit en 2016 alors qu'elle avait environ 9 mois et les chercheurs étudiaient deux coronavirus antérieurs: SARS-CoV-1 et MERS-CoV.

Dans un processus similaire à celui des humains recevant des injections pour l’immuniser contre un virus, on lui a injecté des protéines de pointe stabilisées provenant de ces virus au cours d'environ six semaines.

Ensuite, les chercheurs ont prélevé un échantillon de sang et des anticorps isolés qui se sont liés à chaque version de la protéine de pointe. L'un d'eux a montré une réelle promesse pour arrêter un virus qui présente des protéines de pointe provenant du SRAS-CoV-1 provenant de cellules infectieuses en culture.

« C'était excitant pour moi parce que je travaillais là-dessus depuis des années », a déclaré Wrapp. « Mais il n'y avait pas alors un grand besoin d'un traitement contre les coronavirus. Ce n'était que de la recherche fondamentale. Maintenant, cela peut aussi avoir des implications translationnelles. »

L'équipe a conçu le nouvel anticorps qui semble prometteur pour traiter l'actuel SARS-CoV-2 en reliant deux copies de l'anticorps de lama qui a fonctionné contre le virus antérieur du SRAS. Ils ont démontré que le nouvel anticorps neutralise le virus présentant des protéines de pointe du SRAS-CoV-2 dans les cultures cellulaires.

Les scientifiques ont pu achever cette recherche et la publier dans une revue de premier plan en quelques semaines grâce aux années de travail qu'ils avaient déjà effectuées sur les coronavirus apparentés.

McLellan a également dirigé l'équipe qui a d'abord cartographié la protéine de pointe du SRAS-CoV-2, une étape critique vers un vaccin. (Wrapp a également co-écrit l’article avec d'autres auteurs dans Cell, dont Nianshuang Wang de l’Université Texas Austin, et Kizzmekia S. Corbett et Barney Graham du Centre de recherche sur les vaccins de l'Institut national des allergies et des maladies infectieuses.) Outre Wrapp, l'autre co-premier auteur de l'article est Dorien De Vlieger, chercheur en postdoc au Vlaams Institute for Biotechnology (VIB) de l'Université de Gand, et les autres auteurs principaux en plus de McLellan sont Bert Schepens et Xavier Saelens, tous deux du VIB.

Ce travail a été soutenu par le National Institute of Allergy and Infectious Diseases (États-Unis), VIB, The Research Foundation-Flanders (Belgique), Flanders Innovation and Entrepreneurship (Belgique) et le ministère fédéral de l'Éducation et de la Recherche (Allemagne).

Les premiers anticorps que l'équipe a identifiés dans les premiers tests SARS-CoV-1 et MERS-CoV comprenaient un anticorps appelé VHH-72, qui se liait étroitement à la protéine de pointe du SARS-CoV-1. Ce faisant, il a empêché un virus pseudotypé, un virus qui ne peut pas rendre les gens malades et a été génétiquement modifié pour afficher des copies de la protéine de pointe du SRAS-CoV-1 à sa surface, des cellules infectées.

Lorsque le SRAS-CoV-2 est apparu et a déclenché la pandémie de COVID-19, l'équipe s'est demandée si l'anticorps qu'ils avaient découvert pour le SRAS-CoV-1 serait également efficace contre son cousin viral. Ils ont découvert qu'il se liait également à la protéine de pointe du SRAS-CoV-2, bien que faiblement. L'ingénierie qu'ils ont faite pour le rendre plus efficace impliquait de lier deux copies de VHH-72, dont ils ont ensuite montré qu'elles neutralisaient un virus pseudotypé portant des protéines de pointe provenant du SARS-CoV-2. Il s'agit du premier anticorps connu qui neutralise à la fois le SARS-CoV-1 et le SARS-CoV-2.

Il y a quatre ans, De Vlieger développait des antiviraux contre la grippe A lorsque Bert Schepens et Xavier Saelens lui ont demandé si elle serait intéressée à aider à isoler les anticorps contre les coronavirus des lamas.

« Je pensais que ce serait un petit projet parallèle », a-t-elle déclaré. « Désormais, l'impact scientifique de ce projet est devenu plus important que je ne pouvais l'imaginer. C'est incroyable de voir à quel point les virus peuvent être imprévisibles. »

L’article finalisé sera disponible le 5 mai, ici.

Les entreprises alimentaires américaines deviennent des points chauds pour le COVID-19

« Les entreprises alimentaires américaines deviennent des points chauds pour le COVID-19 », source article de Stephanie Soucheray paru le 27 avril dans CIDRAP | News.

Au cours du week-end, plusieurs usines de transformation de viande et de fromages à travers le pays ont fermé leurs portes à la suite d'infections au COVID-19 parmi les employés, ce qui a incité le responsable de Tyson Foods à déclarer que la chaîne d'approvisionnement alimentaire aux États-Unis était en train de se briser.

John Tyson, président du conseil d'administration de Tyson Foods, a publié hier une publicité pleine page dans plusieurs journaux, expliquant que les fermetures d'usines de transformation entraînent un énorme gaspillage alimentaire et une pénurie potentielle de produits carnés à travers le pays.

« Des millions d'animaux, poulets, porcs et bovins, seront abattus en raison de la fermeture de nos installations de transformation », a écrit Tyson. « La chaîne d'approvisionnement alimentaire se casse. » « Un dilemme entre nourrir le pays et conserver nos employés en bonne santé. » Voir le texte en fin d'article.

La semaine dernière, Tyson a fermé une usine de transformation de porcs à Waterloo, dans l'Iowa, l'une des plus grandes du pays, après que 180 employés aient été testés positifs pour le COVID-19. À la fin de la semaine dernière, la société a annoncé qu'elle allait tester les 2 800 employés de l'usine pour le nouveau virus.

Début avril, Tyson a également fermé une usine à Columbus Junction, Iowa, pendant 2 semaines après que des centaines d'employés ont été infectés, dont deux sont décédés. L'Iowa a vu une augmentation des cas de COVID-19 au cours de la semaine dernière et a enregistré 349 nouveaux cas le 27 avril 2020, selon le Des Moines Register. L'État compte un total de 5 868 cas de COVID-19 et 127 décès.

Selon Associated Press, environ 25% des usines de conditionnement de viande du pays ont été fermées au cours des deux dernières semaines.

Dans l'Illinois, Smithfield a fermé deux usines après avoir refusé de se conformer aux ordonnances sanitaires locales. Selon WBEZ Chicago, Smithfield a dû fermer des usines à Cudahy, Wisconsin, Martin City, Missouri et Sioux Falls, Dakota du Sud, après que des employés ont été testés positifs pour le virus.

Une usine appartenant à JBS à Green Bay, Wisconsin, est maintenant le site de la plus grande épidémie liée de cet Etat, rapporte la Green Bay Press Gazette. JBS Packerland, une usine de viande bovine, est le site de 189 cas de COVID-19, et le comté de Brown, où se trouve l'usine, avait 776 cas le 26 avril après-midi.

Le 26 avril 2020, à Fort Morgan, dans le Colorado, Leprino Foods a fermé une usine de transformation de fromages après qu'un nombre élevé d'employés se soient révélés positifs pour le virus. Une usine de viande bovine de JBS à Greely, au Colorado, a été fermée pendant 9 jours plus tôt ce mois-ci, après que des centaines de travailleurs ontt également contracté le virus.

Nouvelles lignes directrices pour les usines de viande

Le 26 avril 2020, les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) ont publié de nouvelles lignes directrices de sécurité sanitaire pour les employés et les employeurs des usines de transformation de la viande et de volaille.

Dans le cadre de l'infrastructure critique du pays, les employés des usines peuvent être autorisés à continuer de travailler après une exposition potentielle au COVID-19, tant qu'ils sont asymptomatiques et que des précautions supplémentaires sont mises en œuvre pour les protéger, a indiqué le CDC.

Le CDC a déclaré que les employés travaillent souvent près les uns des autres sur les lignes de transformation, se tiennent ensemble pendant de longues périodes de 10 à 12 heures et ont un contact élevé dans en ville en dehors du travail. Le CDC recommande aux usines d'examiner la distance physique dans l'espace de travail, d'installer des barrières en plexiglas lorsque cela est possible et d'augmenter les systèmes de ventilation.

Le CDC recommande également aux employés de porter des rmasques en tissu.

De nouveaux États arrêtent le confinement alors que les États-Unis approchent du million de cas

Le gouverneur du Texas, Greg Abbott, a annoncé le 27 avril 2020 que l'ordre de séjour à domicile de l'État expirera le 30 avril, et les entreprises ouvriront par étapes à partir de vendredi, tandis que le président Donald Trump, lors d'un appel téléphonique avec les gouverneurs, a suggéré que certains États devraient rouvrir les écoles avant la fin. de l'année universitaire, selon le New York Times.

Au Texas, les magasins de vente au détail, les restaurants, les cinémas et les centres commerciaux seront autorisés à rouvrir avec restrictions vendredi, avec une occupation ne dépassant pas 25%. Le 27 avril 2020, certaines entreprises du Colorado, du Minnesota et du Mississippi ont ouvert.

Le 26 avril 2020, le gouverneur Andrew Cuomo de New York a déclaré que certaines entreprises en dehors de la région de New York pourraient ouvrir dès le 15 mai, mais a averti que la distanciation sociale sera toujours la règle dans les semaines à venir.

Le 26 avril 2020, New York a enregistré 367 décès dus à COVID-19, la première fois en avril le nombre de décès quotidiens a été inférieur à 400. Au total, New York compte 291 996 cas COVID-19, dont 17 303 décès.

Selon le tracker COVID-19 d'USA Today, les États-Unis approchent du million de cas de COVID-19, avec 983 848 cas contaminés, dont 55 735 décès.

La FDA traite le sujet des tests d'anticorps défectueux

Enfin, le 27 avril 2020, la Food and Drug Administration (FDA) va traiter des retombées des tests d'anticorps défectueux, après que 120 fabricants et laboratoires ont introduit des tests sur le marché américain sans examen par l’agence, selon Politico.

Les tests d'anticorps ont été salués comme la clé de la réouverture des Etats, et nécessaires pour un virus qui présente une transmission asymptomatique. Mais des résutats de faux positifs et négatifs répandus à New York et en Californie, deux États qui ont commencé à utiliser des tests de recherche d’anticorps plus largement, ont conduit à critiquer la FDA pour ne pas avoir supervisé les tests de plus près.

La FDA a déclaré qu'elle était sur le point de finaliser un plan qui obligerait les fabricants de nouveaux tests d'anticorps à demander des autorisations d'utilisation d'urgence.

Voici le tweet annonçant la pleine page de pub de Tyson Foods mentionnée ci-dessus:

“The food supply chain is breaking,” Tyson Foods warns in a full page ad in NYT today pic.twitter.com/5cyusH6L9V

— Ana Swanson (@AnaSwanson) April 26, 2020

Les tests d'anticorps peuvent contenir des indices sur l'exposition au COVID-19. Quid de l'immunité. C'est compliqué

« Les tests d'anticorps peuvent contenir des indices sur l'exposition au COVID-19. Quid de l'immunité, cela semble compliqué », source article de Chris Dall du 15 avril 2020 paru dans CIDRAP News.

Alors que le pays (Etats-Unis) cherche des moyens d'émerger des ordonnances de confinement chez soi instituées à travers le pays, il y a de plus en plus d'espoir que notre sang puisse contenir des indices sur la façon dont nous allons de l'avant.

À la fin de la semaine dernière, le National Institutes of Health (NIH) a annoncé qu'il avait commencé à recruter des volontaires pour une étude visant à déterminer combien d'Américains sans diagnostic confirmé de COVID-19 ont été exposés au virus SARS-CoV-2, en se basant sur la présence d'anticorps dans leur sang.

Cette « enquête sérologique » analysera les échantillons de sang de plus de 10 000 volontaires pour la présence de deux anticorps, l'immunoglobuline M (IgM) et l'immunoglobuline G (IgG), que le corps produit en réponse à un virus. Les chercheurs peuvent également effectuer des analyses supplémentaires sur le sang de certains volontaires pour déterminer le type de réponse immunitaire générée.

L'objectif principal de l'étude est de fournir aux chercheurs une meilleure idée de la mesure à laquelle le nouveau coronavirus s'est propagé à travers le pays. Alors que près de 600 000 personnes aux États-Unis ont été testées positives pour le COVID-19, ce chiffre est basé uniquement sur les résultats des tests moléculaires qui recherchent l'ARN viral, qui ont été principalement effectués chez des personnes malades ou ayant connu une exposition à personnes infectées.

Les tests d'anticorps, bien qu'ils ne soient pas utiles à des fins de diagnostic en raison du temps nécessaire pour produire une réponse en anticorps, pourraient indiquer ceux qui ont eu la maladie à un moment donné mais n'ont jamais reçu de confirmation officielle de l'infection, et ceux qui ont eu une même des infections asymptomatiques (sans symptômes).

« C'est essentiellement une façon de dire qui a été infecté à tout moment par le passé », explique Gregory Storch, spécialiste des maladies infectieuses à la Washington University School of Medicine de St. Louis.

Les scientifiques espèrent également que la preuve d'une réponse immunitaire au coronavirus pourrait aider à déterminer qui peut retourner au travail en toute sécurité alors que le virus demeure une menace.

« Les tests sérologiques nous permettront de déterminer quel pourcentage de la population a été exposé au virus », explique Joanne Bartkus, directrice de la division Laboratoire de santé publique du département de la santé du Minnesota (MDH). « Si nous comprenons ou constatons qu'un certain niveau d'anticorps confère une immunité à une infection ultérieure, eh bien, cela peut être utilisé pour déterminer peut-être qui peut retourner au travail ou qui est moins susceptible de transmettre le virus. »

Mais Storch, Bartkus et d'autres experts affirment qu'il reste un certain nombre d'inconnues à résoudre.

La question de l'immunité

Les inconnues commencent par de combien est une réponse immunitaire au SRAS-CoV-2 - le virus qui cause COVID-19. Les premières études suggèrent que la production d'IgM et d'IgG chez les patients atteints de COVID-19 se produit généralement entre 7 et 11 jours après l'exposition, les anticorps IgM apparaissant en premier, suivis des anticorps IgG.

La présence de ces anticorps, qui répondent à des antigènes spécifiques à la surface du virus SARS-CoV-2, indique qu'une personne a été exposée et que son système immunitaire a réagi. Mais cela signifie-t-il nécessairement qu'une personne est immunisée contre la réinfection?

« Souvent, mais pas toujours, la présence d'anticorps correspond à l'immunité à cet agent, et si cela s'avère être le cas pour COVID-19, ce serait extrêmement important », explique Storch.

L'espoir que l'exposition au SRAS-CoV-2 confère un certain type d'immunité est basé sur les résultats d'une étude avant impression en Chine, dans laquelle des singes rhésus qui avaient été infectés et se sont rétablis ont été de nouveau infectés par le virus. Les résultats, qui n'ont montré aucune récurrence de COVID-19 chez les singes ayant subi un nouveau challenge, suggéraient un certain niveau d'immunité protectrice après l'infection.

« C'est une découverte très encourageante, mais nous ne savons pas encore si cela est encore vrai chez l'homme, et nous ne savons certainement pas combien de temps dure la durée de l'immunité », dit Storch.

La réalisation de tests d'anticorps pourrait aider à répondre à cette question, explique Bill Hanage, professeur d'épidémiologie au T.H. Chan School of Public Health de Harvard. « Nous ne savons pas quels titres exacts d'anticorps assureront l'immunité, mais c'est la façon de commencer à l'étudier », dit-il.

S'il existe un certain niveau d'immunité protectrice pour les personnes qui ont eu le COVID-19, les tests sérologiques pourraient également être un moyen de prédire à quoi ressembleront les prochains mois à travers le pays, alors que les États tentent de comprendre comment, ou une exigence de confinemant peu être assouplie, davantage de personnes peuvent retourner au travail et les enfants peuvent retourner à l'école.

« Les tests sérologiques… nous donneront une idée de qui reste dans notre communauté qui risque de développer une infection », a déclaré Angela Caliendo, professeure de médecine à l'Université Brown, lors d'une récente conférence de presse pour l'Infectious Diseases Society of Amérique. « Savoir combien de personnes dans une communauté donnée sont encore sensibles au virus sera très important pour nous de décider quoi faire l'hiver prochain, et comment gérer les deux tests et si nous devons limiter à nouveau les interactions sociales des gens de manière préventive. »

« Ensemble avec des méthodes de distanciation physique plus douces et plus sensibles (y compris peut-être des masques) et de bons tests et un suivi des contacts des infections actives, nous pourrions espérer reprendre l'activité de manière plus ‘normale’ dans les mois à venir si une fraction substantielle de la population fait preuve d'immunité », dit Hanage par un e-mail, bien qu'elle ajoute qu'elle pense qu'il est peu probable qu'une fraction substantielle fasse preuve d'immunité.

Besoin de tests étendus

Certains pays, comme l'Allemagne et le Royaume-Uni, ont même lancé l'idée de « passeports d'immunité » qui pourraient être délivrés aux personnes sur la base des résultats des tests d'anticorps. Bien que cela puisse sembler de la science-fiction, Storch dit que nous entrons dans un nouveau monde.

« Vous pourriez imaginer que cela s’applique essentiellement à tous ceux qui pourraient avoir besoin d’être sur le marché du travail, ou qui pourraient avoir besoin d’aller à l’école, et les personnes qui sont positives pourraient vaquer à leurs occupations et effectuer des travaux critiques impliquant une exposition, et elles ne courraient aucun risque ou un risque très réduit par rapport aux personnes négatives », dit-il. « Et puis les personnes négatives pourraient être retenues et protégées le cas échéant. »

Mais déterminer combien d'Américains ont été exposés au coronavirus et pourraient avoir un certain niveau d'immunité nécessitera des tests sérologiques généralisés à travers le pays, et c'est un problème. Comme pour de nombreux tests du COVID-19, il existe un écart entre les projections du nombre de personnes pouvant être testées et le nombre de tests en cours.

À l'heure actuelle, les tests d'anticorps en sont à leurs débuts. Alors que le NIH commence à inscrire des participants à son étude, plusieurs États et villes commencent tout juste à déployer leurs propres tests d'anticorps. Parmi eux se trouve le Minnesota, où l'Université du Minnesota et la Mayo Clinic ont développé des tests d'anticorps qui sont initialement réservés aux professionnels de santé de première ligne. Les responsables de l'État espèrent pouvoir disposer à terme d'un test de dépistage des anticorps dans tout l'État.

Storch dit que l'un des avantages du test d'anticorps, qui peut être effectué sur une simple piqûre de sang et peut donner des résultats rapidement, est qu'il se prête à une extension. « Chaque hôpital dispose d'instruments qui effectuent des tests sérologiques pour divers virus », dit-il. « Les tests peuvent être automatisés et peuvent être exécutés sur des volumes d'échantillons élevés, il sera donc certainement possible de tester un grand nombre de prélèvements. »

Pour que les tests d'anticorps au COVID-19 soient utiles pour aider à élaborer une stratégie pandémique à l'avenir, ils devront cependant être capables de distinguer une réponse anticorps spécifique au nouveau coronavirus, et ne captant pas les réponses d’autres coronavirus humains qui causent des infections. Ils devront également être suffisamment sensibles pour déterminer qui a eu une réponse immunitaire légère à l'infection, et suffisamment spécifiques pour exclure ceux qui n'ont pas été exposés.

« Cela pourrait nous en dire beaucoup sur le véritable spectre de la maladie en termes de gravité », explique Hanage. « Les premiers travaux suggèrent que certaines personnes séropositives ne savaient pas qu'elles avaient été infectées. »

La précision du test n'est pas claire

Mais pour le moment, la véritable précision des tests sérologiques pour le SRAS-CoV-2 est une autre inconnue. Jusqu'à présent, la Food and Drug Administration (FDA) a accordé une autorisation d'utilisation d'urgence (EUA) pour un seul test anticorps - le test rapide qSARS-CoV-2 IgG/IgM de Cellex. L'EUA permet à une entreprise de commercialiser des produits diagnostiques et thérapeutiques non approuvés lors d'une urgence déclarée. Selon Cellex, le test était sensible à 93,8% lors de tests sur 128 prélèvements de patients chinois COVID-19 confirmés par PCR et spécifiques à 96,4%.

Ces chiffres d'apparence impressionnante, mais laissent encore la possibilité à un nombre important de personnes de subir des tests faussement positifs et des faux négatifs. Par exemple, si 5% de la population américaine avait effectivement le virus, un test avec une sensibilité de 95% et une spécificité de 95% effectué sur un million de personnes détecterait correctement 47 500 cas, ainsi que 2 500 faux négatifs (ceux qui ont été infectés mais qui ont été ratés).

Mais cela produirait également 47 500 faux positifs. Cela signifie que si vous deveniez positif, il n'y aurait que 50% de chances que vous ayez réellement le virus et que vous jouissiez d'une certaine immunité.

« Imaginez-vous aller voir un professionnel de la santé et lui dire ‘nous allons vous tester pour les anticorps en ce moment, et si vous êtes positif, vous avez 1 chance sur 2 que ce n'est pas réel’ », explique Michael Osterholm, directeur du Center for Infectious Disease Research and Policy (éditeur de CIDRAP News). « Allez-vous réellement utiliser ce test de manière significative? »

Selon une autre voie établie par la FDA pour accélérer la disponibilité des tests de diagnostic en réponse à la pandémie, connue sous le nom de « Policy D », les tests sérologiques pour le SRAS-CoV-2 peuvent être commercialisés et vendus aux laboratoires cliniques et aux hôpitaux tant que les fabricants ont généré un certain niveau de données de validation, même si la FDA n'a pas examiné ces données.

Bartkus du MDH dit qu'il y a actuellement plus de 70 fournisseurs qui ont notifié à la FDA leur intention de commercialiser des tests d'anticorps avec une combinaison de réponse IgM, IgG et d'immunoglobuline A (IgA). Et on sait peu de choses sur ces tests.

« Ce que nous allons devoir faire, c'est de déterminer quels tests sérologiques seront utiles et lesquels ne le seront pas, et nous ne savons pas à ce stade quels laboratoires cliniques vont adopter ces tests », a-t-elle déclaré. dit. « C'est en fait assez déroutant, car il y en a tellement et ils n'ont fait l'objet d'aucun examen par la FDA. »

Bartkus dit que ce n'est que l'un des problèmes que les responsables de la santé publique tentent de comprendre à la volée lorsqu'ils réagissent à la pandémie.

« Nous construisons l'avion pendant que nous le pilotons », dit-elle.

J'ai ajouté à cet article de CIDRAP News, un complément sur le 'passeport d'immunité',

Selon cet article, COVID-19: Le 'passeport d'immunité' pourrait être une bonne idée,

L'Allemagne envisage également un tel système, selon The Guardian. Des chercheurs allemands préparent une étude de masse qui vise à découvrir l'étendue de la pandémie en testant initialement 100 000 volontaires pour les anticorps anti-coronavirus. Le test serait étendu à un échantillon croissant de la population au fil du temps.

Un système de passeport d'immunité pourrait être ajouté à la campagne de tests. « Ceux qui sont immunisés pourraient se voir délivrer une sorte de carte de vaccination qui leur permettrait, par exemple, d'être exemptés des restrictions sur leur activité », a déclaré à The Guardian Gerard Krause, responsable de l'épidémiologie au Helmholtz Center for Infection Research.