Abondance des gènes de résistance aux antibiotiques liée à l'eau potable et à l'assainissement, selon une étude

Selon le ministère de l’écologie, «L’assainissement a pour fonction de collecter les eaux usées, puis de les débarrasser des pollutions dont elles sont chargées avant de rejeter l’eau ainsi traitée dans le milieu naturel. Le traitement des eaux usées produit des boues qui sont ensuite valorisées ou éliminées.»

«Abondance des gènes de résistance aux antibiotiques liée à l'eau potable et à l'assainissement», source article de Chris Dall paru le 3 juillet 2023 dans CIDRAP News.

Une  analyse des métagénomes fécaux et des données d'enquêtes auprès des ménages suggère que l'accès à l'eau potable et à l'assainissement pourrait être une stratégie pour freiner la résistance aux antimicrobiens (RAM) dans les pays à revenu faible et intermédiaire (PRFI), a rapporté une équipe internationale de chercheurs à la fin de la semaine dernière dans The Lancet Microbe.

À l'aide de 1 589 métagénomes fécaux humains accessibles au public de 26 pays, une équipe dirigée par des chercheurs de l'Université de Californie à Berkeley a identifié des gènes de résistance aux antibiotiques (ARGs) et calculé leur abondance relative par région. Ils ont ensuite analysé les données des enquêtes démographiques et sanitaires - qui comprennent des questions sur l'accès à l'eau, à l'assainissement et à l'hygiène (WASH pour water, sanitation and hygiene) - à partir d'ensembles de données géospatialement étiquetés et représentatifs au niveau national pour déterminer les associations entre l'abondance d'ARGs et l'accès à un WASH amélioré.

L'abondance moyenne des ARG était la plus élevée en Afrique par rapport à l'Europe ( P = 0,014), l'Amérique du Nord ( P = 0,0032) et le Pacifique occidental ( P = 0,011), et la deuxième plus élevée en Asie du Sud-Est par rapport à l'Europe ( P = 0,047) et Amérique du Nord ( P = 0,014). Les tendances d'abondance variaient selon la classe de médicaments, l'abondance du gène de la bêta-lactamase étant la plus élevée en Afrique et en Asie du Sud-Est et la résistance aux tétracyclines omniprésente dans toutes les régions.

Le passage de 0% à 100% d'accès à un WASH amélioré a été associé à une réduction estimée de 0,22 (intervalle de confiance [IC] à 95%, -0,39 à -0,05) de l'abondance d'AGR. L'ampleur de l'association était plus élevée pour l'accès à l'assainissement amélioré seul (-0,13 ; IC à 95%, -0,31 à -0,05) par rapport à l'accès à l'eau potable amélioré seul (-0,08 ; IC à 95%, -0,28 à 0,11), et dans les zones urbaines. (-0,32 ; IC à 95%, -0,63 à 0,00) par rapport aux zones rurales (-0,16 ; IC à 95%, -0,38 à 0,07).

Les auteurs de l'étude notent que bien que les résultats soient limités par la nature observationnelle et écologique de l'étude, et que des recherches supplémentaires soient nécessaires pour déterminer s'il existe une relation causale entre l'amélioration de WASH et le fardeau de la RAM, les résultats suggèrent néanmoins que les efforts pour améliorer l'accès à WASH devrait faire partie des plans d'action nationaux sur la résistance aux antimicrobiens.

«Nous avons constaté que la réduction la plus significative statistiquement des ARG était associée à l'accès à des améliorations combinées de l'eau et de l'assainissement, ce qui suggère qu'un accès complet à WASH pourrait être plus efficace que des interventions uniques», ont-ils écrit.