Etats-Unis : Souche persistante de Salmonella Infantis (REPJFX01) liée à du poulet

«Souche persistante de Salmonella Infantis (REPJFX01) liée à du poulet», source communication du CDC du 21juillet 2023.

REPJFX01 est une souche persistante et multirésistante de la bactérie Salmonella Infantis qui a provoqué des cas de maladie et des épidémies aux États-Unis et dans le monde.

La maladie causée par cette souche a été signalée pour la première fois à PulseNet en 2012. Au 31 décembre 2022, les informations de 2 900 patients infectés par REPJFX01 ont été signalées à PulseNet. L'âge médian des patients était de 54 ans (intervalle interquartile, 27-70 ans) et 62% étaient des femmes. La source de l'isolat était les selles dans 65% des cas et l'urine dans 27% des cas. Les maladies causées par cette souche surviennent toute l'année, mais sont plus fréquentes en juillet et en août. Dans le passé, REPJFX01 s'est propagé aux personnes par le biais de poulets contaminés aux États-Unis et par des expositions lors de voyages internationaux.

Parmi un sous-ensemble de 251 patients ayant des dossiers dans le Foodborne Disease Active Surveillance Network (FoodNet) entre 2018 et 2020, 10% des patients ont voyagé à l'étranger dans les 7 jours précédant le début de leur maladie ; la plupart se sont rendus en République Dominicaine (45%), au Pérou (25%) ou en Équateur (10%). Parmi le même sous-ensemble de patients, 29% ont été hospitalisés, 7% ont été admis en unité de soins intensifs et moins de 1% sont décédés. Parmi les 85 patients qui ont reçu des antibiotiques recommandés comme traitement de première ligne ou alternatif pour la salmonellose, 78% avaient un isolat résistant à cet antibiotique.

Cette souche de Salmonella Infantis est génétiquement relativement diversifiée. Les bactéries de la souche ont des différences de 82 allèles de l’une par rapport l’autre par cgMLST**. Ceci est plus diversifié sur le plan génétique que les épidémies d'origine alimentaire dans plusieurs États typiques, dans lesquelles les bactéries se situent généralement à moins de 10 d'allèles différents les uns des autres.

Points rapides

Bactéries	Salmonella enterica
Sérotype	Infantis
Profil de résistance aux antimicrobiens	Multirésistant aux antibiotiques (voir détails ci-dessous)
Souche persistante	REPJFX01
Première détection	Juin 2012
Nombre de cas signalés dans PulseNet	2900
Investigations d’épidémies	7
Origine identifiées des épidémies	- Produits de poulet cru (confirmé) : 1 épidémie - Poulet séparé mécaniquement (suspecté) : 1 épidémie

*Selon la Société Française de Microbiologie, le cgMLST est une première approche standardisée qui permet de se repérer dans la classification des souches d’une espèce, et apporte le plus souvent une discrimination suffisante pour exclure des relations clonales.

**Des sources confirmées ont été impliquées par des données épidémiologiques
ainsi que des données de traçabilité ou de laboratoire. Sources suspectées n'ont été mis en cause que par des données épidémiologiques. Plus d’information ici.

La suite est à découvrir dans le document du CDC.

Complément

On lira l’article de Bill Marler dans le Marler Blog, «Sérieusement, pourquoi diable l'USDA et le CDC ne protègent-ils pas le public de Salmonella Infantis dans le poulet ?»