Selon une étude, une nouvelle approche pourrait améliorer les décisions de gestion des risques concernant E. coli producteurs de shigatoxines (STEC).
La classification et la gestion des risques liés aux STEC isolés des aliments ont été entravées par des lacunes dans les connaissances sur la façon dont différents types peuvent provoquer des maladies graves.
En 2019, une réunion conjointe d'experts FAO/OMS sur l'évaluation des risques microbiologiques (JEMRA) a proposé que le potentiel pathogène d'une souche de STEC soit classé en fonction des gènes de virulence. Le JEMRA a présenté un classement des souches avec divers gènes de virulence en cinq niveaux en fonction de leur potentiel à provoquer des diarrhées, des diarrhées sanglantes et le syndrome hémolytique et urémique (SHU).
En 2020, l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) a dit que le sérogroupe des STEC ne pouvait pas être utilisé comme prédicteur des résultats cliniques. L'EFSA a également conclu que tous les types de STEC peuvent être associés à une maladie grave, mais les souches contenant le gène produisant le sous-type de toxine stx2a ont montré les taux les plus élevés de SHU, d'hospitalisation et de diarrhée sanglante, et la présence du gène eae n'est pas essentielle mais était un facteur aggravant.
Des souches de STEC isolées d’aliments ou de cas de SHU, caractérisées en termes de gènes stx et eae présents, et pour lesquelles des données cliniques ont été rapportées dans l'ensemble de données de l'EFSA ont été utilisées pour illustrer l'approche.
Les chercheurs ont évalué cette méthode en rangeant et en classant les souches alimentaires de STEC recueillies lors d'enquêtes et lors d'une épidémie en Suède.
Du point de vue de la gestion des risques, fixer la limite entre un résultat satisfaisant ou non d'un échantillon alimentaire est un compromis entre l'impact potentiel sur la santé et le coût de déclarer le résultat insatisfaisant, selon l'étude.
Une analyse coûts-bénéfices a été effectuée en utilisant la proportion d'échantillons d'aliments classés comme satisfaisants ou non en fonction du coût en termes de proportion d'aliments rejetés et du bénéfice en termes de proportion de souches causant des maladies graves qui sont capturées.
Une limite de 500 mDALY 10-3 DALY), ciblant les génotypes stx2a+eae+autres gènes stx, conduirait à ce que 14% ou moins des échantillons d'aliments soient considérés comme insatisfaisants et qu'environ 85% des souches de STEC ayant causé le SHU en Suède soient capturées.
Les approches existantes ne classent pas sans équivoque les différents génotypes de STEC en fonction de leur probabilité de provoquer une maladie grave. La nouvelle approche aborde cette limitation, améliore la transparence des décisions de gestion des risques et est basée sur les risques en termes de probabilité et de conséquences suite à une infection (maladie grave). Elle n'est pas fondée sur le risque en termes de risque associé à la présence d'un génotype de STEC dans l'aliment, car cela impliquerait des évaluations des risques spécifiques au génotype tenant compte de l'exposition, ce qui impliquerait plus de travail et des données qui ne sont pas toujours disponibles.
Selon la Saudi Food and Drug Authority, en 2017, au moins 562, 280 et 50 échantillons de viande de bœuf, de poulet et de mouton ont été testés pour E. coli O157:H7, selon l'étude publiée dans la revue Scientific Reports.
E. coli O157 a été détecté dans 29 des 428 échantillons de bœuf importés d'Inde, deux des 91 du Brésil et un des 15 des Émirats arabes unis. Il a été retrouvé dans 16 des 230 échantillons de poulet du Brésil et un sur 28 d'Ukraine. L'agent pathogène a également été détecté dans l'un des 47 échantillons de viande de mouton provenant d'Inde. Les produits positifs provenaient de plusieurs entreprises différentes.
En Arabie saoudite, aucune éclosion à E. coli O157:H7 n'a été signalée à ce jour et la prévalence est inconnue. Cependant, il a été isolé de plusieurs élevages locaux de bovins.
«La présence de E. coli O157:H7 dans des échantillons de viande crue importée souligne la nécessité d'une surveillance plus régulière aux frontières de l'Arabie saoudite avant que les produits ne soient mis à disposition sur le marché pour être consommés par le public. Nos résultats soulignent la nécessité de protocoles de contrôle plus stricts pour l'approbation des produits alimentaires importés, en particulier de l'Inde et du Brésil, qui sont les principaux fournisseurs de viande de l'Arabie saoudite», ont dit des chercheurs.
NB : La photo est issue du CDC.
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