Les décès causés par des infections bactériennes représentaient
plus d’un décès sur huit en 2019 est lié à des infections
bactériennes, la deuxième cause de décès dans le monde, cinq
agents pathogènes représentant plus de la moitié de ces décès, a
rapporté hier une équipe internationale de chercheurs dans The
Lancet.
Les résultats de l'étude,
«Global mortality associated with 33 bacterial pathogens in 2019: a
systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2019»,
qui est la première à fournir une estimation mondiale des décès
associés aux pathogènes bactériens courants, indiquent que les
infections bactériennes étaient la deuxième cause de décès en
2019 derrière les cardiopathies ischémiques et affectaient tous les
groupes d'âge. Les 7,7 millions de décès estimés associés à 33
agents pathogènes bactériens représentaient 13,6% de tous les
décès dans le monde en 2019.
Plus de 75% de ces décès ont été causés par trois syndromes de
maladies infectieuses, et l'impact a été le plus important dans les
pays à revenu faible et intermédiaire (PRFI). Le taux de mortalité
le plus élevé associé aux infections bactériennes était en
Afrique subsaharienne.
Les auteurs de l'étude affirment que les résultats soulignent la
menace posée par les pathogènes bactériens pour les jeunes et les
moins jeunes, que ces agents pathogènes soient résistants ou
sensibles aux antibiotiques.
«Il est de la plus haute importance de mettre ces résultats sur le
radar des initiatives de santé mondiale afin qu'une plongée plus
profonde dans ces pathogènes mortels puisse être menée et que des
investissements appropriés soient faits pour réduire le nombre de
décès et d'infections», a déclaré Christopher Murray, co-auteur
de l’étude et directeur de l'Institute for Health Metrics and
Evaluation (IHME) de la faculté de médecine de l'Université de
Washington, dans un communiqué
de presse. A noter qu’il existe une version française de ce
communiqué ici.
«Abandon profond» des infections bactériennes
Pour estimer la mortalité mondiale associée aux infections
bactériennes, les chercheurs ont utilisé des méthodes de
modélisation et les données de deux études précédentes : l'étude
de 2019 du Global Burden of Disease (GBD) ou charge mondiale des
maladies) et le rapport
Global Research on Antimicrobial Resistance (GRAM) ou recherche
mondiale sur la résistance antimicrobienne.
En analysant 343 millions de dossiers individuels de patients (y
compris les dossiers des causes de décès et des hôpitaux) et des
isolats d'agents pathogènes, ils ont estimé le nombre total de
décès dans lesquels l'infection a joué un rôle, la fraction des
décès attribuables à un syndrome infectieux donné et la fraction
des décès par syndrome infectieux attribuables à un agent
pathogène donné.
Les auteurs notent que s'il existe des estimations de décès liés à
des agents pathogènes bactériens spécifiques et à des infections
bactériennes invasives, elles ont jusqu'à présent été limitées
à certains groupes d'âge ou à des pays à revenu élevé.
«Bien que de telles estimations offrent des informations
importantes, aucune estimation complète n'existe couvrant tous les
lieux pour un large éventail de bactéries dans les principaux
syndromes infectieux», ont-ils écrit. «Pour cette raison, ces
agents pathogènes et les syndromes infectieux pertinents ont été
profondément négligés dans les campagnes mondiales de
sensibilisation visant à maximiser les interventions vitales.»
Cinq bactéries représentent 55% des 7,7 millions de décès
Dans l'ensemble, les chercheurs ont estimé à 13,7 millions le
nombre de décès liés aux infections en 2019, dont 7,7 millions
associés aux 33 agents pathogènes bactériens et aux 11 syndromes
infectieux étudiés. Ces décès représentaient 13,6 % de tous les
décès dans le monde et 56,2 % de tous les décès liés à la
septicémie en 2019. Le taux de mortalité tous âges confondus était
de 99,6 décès pour 100 000 habitants.
Parmi les agents pathogènes étudiés, cinq - Staphylococcus
aureus, Escherichia coli, Streptococcus pneumoniae, Klebsiella
pneumoniae et Pseudomonas aeruginosa - représentaient
54,9% des 7,7 millions de décès, S. aureus
étant associé à plus de 1,1 million de décès.
Les pathogènes associés aux taux de mortalité les plus élevés
variaient en fonction de l’âge. Avec 940 000 décès, S. aureus
était associé au plus grand nombre de décès chez les adultes de
plus de 15 ans. Les décès les plus nombreux parmi les enfants de 5
à 14 ans étaient associés à Salmonella enterica sérovar
Typhi, avec 49 000 décès. Chez les enfants plus âgés que les
nouveau-nés mais de moins de 5 ans, S. pneumoniae était le
pathogène le plus mortel, représentant 225 000 décès. Le
pathogène associé à la plupart des décès néonatals était K.
pneumoniae, responsable de 124 000 décès.
«Une réalité qui donne à réfléchir est qu'une lourde charge
d'infections traitables s'est produit dans les très jeunes groupes
d'âge», ont écrit les auteurs.
Les syndromes infectieux responsables de plus de 6 millions des 7,7
millions de décès liés aux infections étaient les infections des
voies respiratoires inférieures, les infections du sang et les
infections péritonéales et intra-abdominales. Les décès causés
par ces infections variaient selon les régions. L'étude note que
ces estimations placeraient ces infections devant le VIH, le cancer
et l'automutilation en tant que principales causes de décès dans le
monde en 2019.
Les chercheurs ont également découvert que les 33 agents pathogènes
avaient le plus grand impact sur les PRFI, en particulier ceux
d'Afrique subsaharienne, qui avaient un taux standardisé selon l'âge
de 230 décès pour 100 000 habitants. En comparaison, les pays à
revenu élevé avaient le taux standardisé selon l'âge le plus bas
associé aux agents pathogènes étudiés, à 52,2 décès pour 100
000.
Cette constatation est similaire à ce
qui a été observé dans le rapport GRAM, qui a estimé que
l'Afrique subsaharienne avait le taux de mortalité le plus élevé
associé aux agents pathogènes résistants aux antibiotiques. Mais
les auteurs notent que ces résultats indiquent que, pour les PRFI,
la résistance aux médicaments n'est qu'un des nombreux facteurs qui
rendent les infections bactériennes plus mortelles.
«Des antimicrobiens efficaces existent pour les 33 bactéries
étudiées, mais une grande partie de la charge
disproportionnellement élevé dans les PRFI pourrait être
attribuable à un accès insuffisant à des antimicrobiens efficaces,
à des systèmes de santé faibles et à des programmes de prévention
insuffisants», ont écrit les auteurs.
L'impact des différents agents pathogènes variait également selon
la région. Par exemple, S. aureus représentait 23% des
décès causés par des infections du sang dans les pays à revenu
élevé, contre seulement 5% des décès dus à des infections du
sang en Afrique subsaharienne, où K. pneumoniae était la
principale cause de décès causés par des infections du sang.
Plus de fonds nécessaires pour la recherche
Les auteurs affirment que si les résultats sont limités par un
manque de données, notamment dans les PRITI où la charge des
infections bactériennes est le plus élevé, ils soulignent la
nécessité de systèmes de santé plus solides, de meilleurs
diagnostics, de stratégies de contrôle des infections appropriées
et d'un accès à des soins efficaces. antibiotiques dans ces pays.
En outre, ils affirment qu'un meilleur accès à l'eau potable et aux
installations sanitaires, une utilisation accrue des vaccins
existants (comme le vaccin contre S. pneumoniae) et le
développement de nouveaux vaccins contre les agents pathogènes
bactériens seront essentiels.
«Jusqu’à présent, nous ne disposions d’aucune estimation
nationale pour certaines parties du monde où les habitants sont les
plus affectés par les infections bactériennes», indiquait Authia
Gray, co-auteur de l’étude et boursière post-licence à l’IHME
à la faculté de médecine de l’University of Washington. «Ces
nouvelles données pourraient nous aider à remédier à la charge
disproportionnellement élevée des infections bactériennes dans les
pays à revenus faible et moyens et pourraient, à terme, permettre
de sauver des vies et d’épargner aux gens des années de vie
perdues en raison de maladies.»
En fin de compte, les chercheurs espèrent que leurs estimations
conduiront à une meilleure appréciation de la charge des infections
bactériennes, ainsi qu'à des efforts de prévention ciblés et à
davantage d'investissements dans la santé publique. Ils citent une
étude de 2020 sur le financement mondial des chercheurs en maladies
infectieuses qui a révélé que, de 2000 à 2017, la recherche sur
Staphylococcus spp. et E coli ont reçu
respectivement 1,4 milliard de dollars et 800 millions de dollars de
financement. En comparaison, la recherche sur le VIH a reçu 42
milliards de dollars au cours de la même période.
«Les investissements dans la recherche sur le VIH sont certainement
justifiés et, bien que les infections bactériennes puissent être
traitées avec différentes stratégies qui se chevauchent, cette
disparité de financement pourrait avoir été due, en partie, au
manque de données sur la charge mondiale de ces agents pathogènes
bactériens», ont-ils écrit.
NB : Dans le
supplément
2 de l’article du Lancet, vous pourrez avoir le nombre
de décès et le taux de mortalité pour 100 000 par agent pathogène
et par pays en 2019, dont la France. La photo est du NSAID.
