Syndrome hémolytique et urémique pédiatrique en France : L'incidence en 2019 est la plus élevée observée depuis le début de la surveillance

Santé publique de France publie le 3 décembre 2020 les données 2019 de la surveillance du syndrome hémolytique et urémique pédiatrique.

Le dispositif de surveillance du syndrome hémolytique et urémique pédiatrique permet de suivre l’évolution de cette maladie grave, mais peu fréquente en France (100 à 160 cas signalés/an).

En fait, comme nous allons le voir, il n'y a pas eu entre 100 à 160 cas signalés/an, mais 168 cas en 2019, c'est-à-dire le nombre le plus élevé depuis que la surveillance existe ...

Incidence annuelle du SHU pour 100 000 personnes-années chez les enfants de moins de 15 ans (flèches : épidémies survenues). France, 1996-2019. 

Incidence élevée de syndrome hémolytique et urémique pédiatrique en 2019

En 2019, 168 cas de syndrome hémolytique et urémique pédiatrique ont été notifiés à Santé publique France. L’incidence annuelle du SHU pédiatrique était de 1,46 cas/10⁵personnes-années (PA) chez les enfants de moins de 15 ans, incidence la plus élevée observée depuis le début de la surveillance. L’incidence est maximale chez les enfants de moins de 3 ans, et diminue avec l’âge. Cette incidence en 2019 est la plus élevée observée depuis le début de la surveillance (5,78 cas/10⁵personnes-années ).

A noter, que le sérogroupe le plus fréquemment observé en 2019 était O26 (49 % des 127 cas de SHU avec la présence de gènes stx confimée) comme en 2018, suivi par le sérogroupe O80 (17 % des cas). Le sérogroupe O157 représente seulement 8 % des cas en 2019. 

Epidémie liée à la consommation de fromages au lait cru : des messages de prévention à renforcer

L’incidence annuelle élevée en 2019 s’explique en partie par la survenue d’une épidémie d’infections à E. coli producteur de Shiga-toxines (STEC) O26 survenue au printemps en lien avec la consommation de fromages au lait cru. Cette épidémie a fait l’objet de mesures de gestion (retrait-rappel des fromages). Elle souligne, avec les cas groupés investigués en 2018 liés à la consommation de reblochon au lait cru, le risque associé au lait cru et aux fromages au lait cru et le besoin de privilégier des messages de prévention auprès des populations sensibles dont les jeunes enfants. 

Pour la grande majorité, aucune source commune de contamination n’a été identifiée. Une investigation a permis d’identifier comme source de contamination commune la consommation de fromages Saint Félicien et Saint Marcellin au lait cru, conduisant à des mesures de contrôle.

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Comme il est rapporté dans la conclusion de l'article, « La sensibilisation du public et des professionnels de santé sur ce sujet doit être améliorée afin de prévenir la survenue de nouvelles épidémies. »

Mais pourquoi seulement le lait cru et les fromages au lait cru et ne pas y associer la cuisson à cœur des steaks hachés pour les enfants, les femmes enceintes, les personnes immunodéprimées et les personnes âgées.  

On lira pour s'en convaincre Comment éviter les toxi-infections alimentaires en confinement, selon l'Anses.

Le ministère de l'agriculture a diffusé le 9 juillet 2020 une recommandation à propos de la Consommation de fromages à base de lait cru : rappel des précautions à prendre.

Listeria ou listériose ?

On dit que l'histoire ne se répète pas et pourtant, souvent des amalgames ont parfois la vie dure !

Il s'agit de la relation entre la présence de Listeria dans un produit alimentaire et la listériose, une infection à Listeria ...

Voici ce qu'on peut lire sur le site Internet de l'UFC Que Choisir ce qui suit à propos d'un rappel d'un fromage, il y a quelques jours,

En espérant que ce fromage rappelé n'entraîne pas d'infection à Listeria ou listériose, pour l'instant, il est seulement rappelé en raison d'une contamination par Listeria ...n'allons pas trop vite en besogne ... et ne confondons pas la nature du problème et sa conséquence ...

Dans un article du 7 août 2009, « Listeria ou listériose ? », je rapportais les faits suivants : 

Listeria ou listériose ? Telle est la question ? De temps à autre, quelques informations diffusées ça et là ne sont pas comme l’on dit vérifiées.

Ainsi, en mars 1999, un communiqué signé par trois ministères avait pour titre sur une page Internet, « Communiqué : camemberts Lepetit : nouveau cas de listériose ». 

Qu’un fromage puisse éventuellement contenir des Listeria est du domaine du possible, l’histoire a par ailleurs montrait dans ce cas précis qu’il n’y en avait pas, les autorités belges utilisaient une méthode de détection qui ne marchait pas sur les fromages au lait cru et qui pouvait donner lieu à des faux positifs, mais de là à entraîner ‘par avance’ une listériose, la maladie infectieuse, il y a une étape d’incubation qui est vite franchie. Les amalgames ont parfois la vie dure !

France : Autopsie d'un rappel de bûche de fromage de chèvre des Pays-Bas

La Commission européenne vous vante tellement la coopération entre les Etats membres de l'UE en matière de sécurité des aliments qu'on finirait par la croire. Personnellement, cela fait bien longtemps que j'y crois pas, mais en voici un nouvel exemple avec le réseau RASFF de l'UE, sensé être, hum, rapide …

Tout commence le 20 octobre 2020 avec une notification au RASFF le 22 octobre 2020 par la Pologne à propos d'une suspicion de contamination par Listeria monocytogenes dans des fromages de chèvre des Pays-Bas.

Le produit a été distribué dans 18 pays : Autriche, Belgique, Bulgarie, République tchèque, Danemark, Estonie, Finlande, France, Allemagne, Grèce, Irlande, Italie, Pologne, Slovaquie, Espagne, Suède, Royaume-Uni, dont les Pays-Bas.

Les Pays-Bas ont publié un avis de rappel par NWVA le 28 octobre 2020 y compris pour pour des fromages de chèvre bio non encore rappelés le 22 octobre 2020 ...

Ce qui est intéressant c'est le contenu de l'avis de rappel,

Aucune contamination n'a été démontrée sur les produits finis. Une source potentielle de contamination n'a été identifiée que lors des tests dans l'environnement du site de production. Bettinehoeve a décidé de rappeler tous les produits de fromage de chèvre affiné (à croûte de moisissures blanches) par mesure de précaution auprès des distributeurs, détaillants et partenaires de la restauration.

La France a demandé des informations le 2 novembre 2020, soit 13 jours après la notification initiale, d'où le rappel le 3 novembre par Auchan via le fabricant Bettinehoeve (Pay-Bas) qui a décidé de rappeler, «toutes les tranches de bûche de chèvre affinés frais emballées auprès des distributeurs». Il y est question de « traces de Listeria monocytogenes ».

Le texte du communiqué indique,

Bien qu'il n'y ait aucune indication de contamination au niveau des produits fabriqués localement, une source potentielle de contamination a été identifiée au cours des tests, des mesures correctives et préventives ont été prises pour garantir la sécurité alimentaire des produits. Bettinehoeve prend ce cas très sérieux et la sécurité des consommateurs est primordiale.

Le Royaume-Uni, qui semble-t-il n'a pas vue cette notification initiale au RASFF de l'UE, a publié une nouvelle notification le 30 octobre 2020 et rappelle le produit en question le même jour via une publication de la Food Standards Agency.

En Allemagne, il y a eu trois rappels, le 29 octobre (deux rappels, 1 et 2) et le troisième rappel a eu lieu le 3 novembre 2020 pour le chèbre bio.

Notons enfin qu'il y a eu une troisième notification au RASFF de l'UE le 30 octobre 2020 par l'Allemagne à propos d'une suspicion de contamination par Listeria monocytogenes dans des fromages de chèvre bio des Pays-Bas.

L'Irlande a rappelé des fromages des Pays-Bas en raison d'une possible présence de Listeria monocytogenes ; la Suède le 30 octobre 2020.

A suivre ...

Ces odeurs géniales de fromages permettent aux microbes de 'se parler' et de se nourrir

« Ces odeurs géniales de fromages permettent aux microbes de 'se parler' et de se nourrir », source communiqué de Tufts university et EurekAlert!

Les chercheurs découvrent que les bactéries qui affinent le fromage réagissent aux gaz volatils produits par les moisissures du fromage.

Des chercheurs de l'Université Tufts ont découvert que ces odeurs distinctement géniales du fromage sont un moyen pour les moisissures de communiquer avec les bactéries, et ce qu'ils disent a beaucoup à voir avec la délicieuse variété de saveurs que le fromage a à offrir.

L'équipe de recherche a découvert que les bactéries communes essentielles à l'affinage du fromage peuvent détecter et réagir aux composés produits par les moisissures dans la croûte et libérés dans l'air, améliorant ainsi la croissance de certaines espèces de bactéries par rapport à d'autres.

La composition des bactéries, des levures et des moisissures qui composent le microbiome du fromage est essentielle à la saveur et à la qualité du fromage, alors déterminer comment cela peut être contrôlé ou modifié ajoute de la science à l'art de la fabrication du fromage.

La découverte, publiée dans Environmental Microbiology, fournit également un modèle pour la compréhension et la modification d'autres microbiomes économiquement et cliniquement importants, comme dans le sol ou le tractus gastro-intestinal.

« Les humains apprécient les divers arômes des fromages depuis des centaines d'années, mais l'impact de ces arômes sur la biologie du microbiome du fromage n'a pas été étudié », a déclaré Benjamin Wolfe, professeur de biologie à l'École des arts et des sciences de l'Université Tufts et correspondant auteur de l'étude. « Nos dernières découvertes montrent que les microbes du fromage peuvent utiliser ces arômes pour changer radicalement leur biologie, et l'importance de ces découvertes s'étend au-delà de la fabrication du fromage à d'autres domaines également. »

De nombreux microbes produisent des composés chimiques aéroportés appelés composés organiques volatils (COV), lorsqu'ils interagissent avec leur environnement.

Un COV microbien largement reconnu est la géosmine, qui est émise par les microbes du sol et peut souvent être sentie après une forte pluie dans les forêts. Au fur et à mesure que les bactéries et les moisissures se développent sur les fromages affinés, ils sécrètent des enzymes qui décomposent les acides aminés pour produire des acides, des alcools, des aldéhydes, des amines et divers composés soufrés, tandis que d'autres enzymes décomposent les acides gras pour produire des esters, des méthylcétones et des alcools secondaires. Tous ces produits biologiques contribuent à la saveur et à l'arôme du fromage et ils sont la raison pour laquelle le camembert, le bleu et le limbourg ont des odeurs caractéristiques.

Les chercheurs de Tufts ont découvert que les COVs ne contribuent pas seulement à l'expérience sensorielle du fromage, mais fournissent également un moyen pour les moisissures de communiquer avec les bactéries du microbiome du fromage et de les «nourrir».

En associant 16 bactéries de fromage communes différentes à 5 moisissures communs de la croûte de fromage, les chercheurs ont découvert que les moisissures provoquaient des réponses chez les bactéries allant d'une forte stimulation à une forte inhibition.

Une espèce de bactérie, Vibrio casei, a répondu en se développant rapidement en présence de COVs émis par les cinq moisissures. D'autres bactéries, telles que Psychrobacter, ne se sont développées qu'en réponse à l'une des moisissures (Galactomyces), et deux bactéries communes du fromage ont diminué de manière significative en nombre lorsqu'elles sont exposées aux COVs produits par les Galactomyces.

Les chercheurs ont découvert que les COVs modifiaient l'expression de nombreux gènes dans les bactéries, y compris des gènes qui affectent la façon dont ils métabolisent les nutriments. Un mécanisme métabolique qui a été amélioré, appelé le shunt glyoxylaique, permet aux bactéries d'utiliser des composés plus simples comme «aliment» lorsque des sources plus complexes telles que le glucose ne sont pas disponibles. En effet, ils ont permis aux bactéries de mieux «manger» certains des COVs et de les utiliser comme sources d'énergie et de croissance.

« Les bactéries sont capables de manger ce que nous percevons comme des odeurs », a déclaré Casey Cosetta, post-doct au département de biologie de l'Université Tufts et premier auteur de l'étude. « C'est important parce que le fromage lui-même fournit peu de sucres facilement métabolisés tels que le glucose. Avec les COVs, les moisissures fournissent vraiment une aide utile aux bactéries pour les aider à prospérer. »

Cette recherche a des implications directes pour les producteurs de fromage du monde entier. Lorsque vous entrez dans une cave à fromages, de nombreux COVs sont libérés dans l'air à mesure que les fromages vieillissent. Ces COVs peuvent avoir un impact sur le développement des fromages voisins en favorisant ou en inhibant la croissance de microbes spécifiques, ou en modifiant la façon dont les bactéries produisent d'autres produits biologiques qui ajoutent à la saveur. Une meilleure compréhension de ce processus pourrait permettre aux producteurs de fromage de manipuler l'environnement des COVs pour améliorer la qualité et la variété des saveurs.

Les implications de la recherche peuvent même s'étendre beaucoup plus loin.

« Maintenant que nous savons que les produits chimiques en suspension dans l'air peuvent contrôler la composition des microbiomes, nous pouvons commencer à réfléchir à la manière de contrôler la composition d'autres microbiomes, par exemple dans l'agriculture pour améliorer la qualité des sols et la production végétale et en médecine pour aider à gérer les maladies affectées par les centaines d'espèces de bactéries dans le corps », a déclaré Wolfe.

Un fromager suisse sous enquête après 34 cas de listériose dont 10 décès

« Un fromager suisse sous enquête après 10 décès à la listeria », selon Le Figaro avec l’AFP.

La justice suisse enquête sur un fromager dont les produits infestés de listeria auraient tué dix personnes depuis 2018 et rendu 24 autres malades (soit un total de 34 cas -aa), ont indiqué les autorités jeudi.

Cette enquête fait suite à une plainte pénale déposée en juillet par le chimiste intercantonal à l'encontre de ce fromager installé dans le canton de Schwyz, dans le centre de la Suisse, et qui est désormais fermée. Selon la plainte, «dix des 34 personnes tombées malades sont décédées», a indiqué à l'AFP la procureure de la région de Innerschwyz, Franziska Steiner. Suite à la plainte, «une procédure pénale en rapport avec l'infestation de listeria dans les produits» de la fromagerie a été ouverte, a-t-elle ajouté. 

Le parquet régional, en collaboration avec la police cantonale de Schwyz, enquête désormais pour savoir si le fromager est «responsable» des décès et «s'il a enfreint la loi sur les denrées alimentaires», a-t-elle détaillé, en soulignant que la présomption d'innocence s'applique. Entre les mois de mars et de mai, quatre patients du Centre hospitalier du Valais romand, à Sion, avaient été infectés après avoir consommé un fromage schwyzois, avaient révélé des journaux suisses début mai. L'un des patients, souffrant d'une forme grave de cancer, est décédé, selon l'agence de presse suisse ATS. 

Selon cette même source, le fromage incriminé est du brie. Début mai, la fromagerie avait informé ses clients après avoir découvert de la listeria dans ses produits. La fromagerie avait aussi alerté l'Office fédéral de la sécurité alimentaire et des affaires vétérinaires, qui avait lancé une mise en garde auprès des consommateurs.

Selon Food Safety News,

Plus de 25 articles vendus dans toute la Suisse ont été rappelés et la distribution comprenait également la Belgique et l'Allemagne.

Au cours du même mois, des responsables de l'Office fédéral de la sécurité alimentaire et des affaires vétérinaires (OSAV) ont déclaré à Food Safety News qu'au moins 11 personnes avaient été infectées par Listeria avec deux décès et qu'une analyse était en attente pour 10 autres infections pour voir si elles appartenaient aux cas groupés de l’éclosion.

Sur les 11 cas confirmés, cinq étaient des hommes et six étaient des femmes âgées de 66 à 86 ans. Les cas d’infection se sont produits dans sept cantons ou régions du pays. Le fromage était fabriqué à partir de lait pasteurisé.

Le Centre Hospitalier du Valais Romand avait précédemment indiqué que de fin mars à début mai, quatre patients avaient reçu un diagnostic de listériose invasive. Les patients infectés ont consommé du fromage pendant l'hospitalisation mais la marque n'était pas claire. Trois personnes se sont rétablies mais une personne souffrant de problèmes de santé sous-jacents est décédée.

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous

Influence du microbiote du lait sur la survie de Listeria monocytogenes pendant l'affinage du fromage

« Influence du microbiote du lait sur la survie de Listeria monocytogenes pendant l'affinage du fromage », source article en accès libre d’une équipe sud-coréenne paru dans la revue Food Science & Nutrition.

Résumé

Cette étude visait à comparer la survie des trois souches de Listeria monocytogenes dans du fromage au lait cru et du fromage au lait pasteurisé et à suggérer l'effet du microbiote du lait sur la survie. Le nombre de cellules de L. monocytogenes diminuait dans tous les fromages à mesure que le temps d'affinage augmentait, et le taux de survie était différent pour les souches de L. monocytogenes. De plus, L. monocytogenes a survécu plus longtemps dans du fromage au lait cru que dans du fromage au lait pasteurisé.

La différence de survie bactérienne dans chaque fromage était indépendante de l’a_w ou des populations de Lactobacillus spp. dans les fromages; il n'y avait aucune différence entre l’a_w ou les populations de Lactobacillus spp.  dans tous les fromages. La richesse du microbiote dans le lait cru était un peu plus élevée que dans le lait pasteurisé et cinq phylums (Chloroflexi, Cyanobacteria, Deinococcus-Thermus, Lentisphaerae et Verrucomicrobia) n'étaient présents que dans le lait cru.

De plus, les bactéries productrices d'acide organique étaient plus présentes dans le lait pasteurisé que dans le lait cru; ainsi, la croissance de L. monocytogenes était plus lente dans le lait pasteurisé. En conclusion, les différences dans la communauté microbienne du lait peuvent affecter la croissance de L. monocytogenes. Faire du fromage avec du lait cru présente un risque d'infection à L. monocytogenes; ainsi, des efforts pour prévenir la croissance de L. monocytogenes tels que l'utilisation d'additifs alimentaires appropriés sont nécessaires.

En conclusion, il a été observé une variation de la survie de L. monocytogenes selon les souches. De plus, L. monocytogenes peut survivre plus longtemps dans le fromage au lait cru que dans le fromage au lait pasteurisé pendant l'affinage du fromage, et nous pensons que la survie de L. monocytogenes est influencée par les différences de composition du microbiote (c.-à-d., Les bactéries productrices d'acide organique) entre les bactéries lait du cru et du lait pasteurisé. Selon les résultats de cette étude, fabriquer du fromage avec du lait cru ne peut garantir la sécurité sanitaire contre la listériose. Par conséquent, lors de la fabrication de fromage avec du lait cru, divers efforts seront nécessaires, tels que l'ajout d'additifs alimentaires appropriés (par exemple, l'acide lactique) qui peuvent maîtriser L. monocytogenes afin d’inhiber la croissance de L. monocytogenes et prévenir davantage l'infection à L. monocytogenes.

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous !

France: Consommation des aliments crus par les populations fragiles, il n'y a pas que le lait cru et les fromages au lait cru !

Le ministère de l’agriculture communique le 9 juillet 2020 sur la « Consommation de fromages à base de lait cru : rappel des précautions à prendre ». 

Les autorités sanitaires recommandent aux populations fragiles de ne pas consommer de lait cru ni de fromages au lait cru. Ces préconisations concernent :

• les jeunes enfants, et particulièrement ceux de moins de 5 ans ;
• les femmes enceintes ;
• les personnes immunodéprimées, c'est-à-dire les personnes déjà malades, très fatiguées voire hospitalisées.
• Les enfants de moins de cinq ans ne doivent pas consommer de fromage au lait cru, ni de lait cru. Au-delà, le risque existe toujours mais il est décroissant, les enfants sont quand même mieux protégés au-delà de cinq ans.

Cela semble motivé par un nombre important d’alertes, selon cet article du blog, 

La Mission des urgences sanitaires a recensé, en 2018, toutes origines d'alertes confondues (autocontrôles, plans de surveillance et plans de contrôle …) :
- 61 alertes portant sur des fromages au lait cru mis sur le marché, contaminés par L. monocytogenes,
- 16 alertes portant sur des fromages au lait cru mis sur le marché, contaminés par Salmonella et,
- 37 alertes portant sur des fromages au lait cru mis sur le marché, contaminés par STEC.

Par ailleurs, Santé publique de France avait indiqué dans la « Surveillance du syndrome hémolytique et urémique post-diarrhéique chez l’enfant de moins de 15 ans en France en 2018 »,

Les données de surveillance en 2018 montrent une forte incidence de SHU pédiatrique en France (1,33 cas/10⁵ PA) avec une prédominance du sérogroupe O26. (…)

Ces épisodes soulignent le risque associé au lait cru et aux fromages au lait cru. Il est nécessaire de privilégier des messages de prévention, en particulier auprès des populations les plus sensibles dont les jeunes enfants. Il est nécessaire de privilégier des messages de prévention, en particulier auprès des populations les plus sensibles dont les jeunes enfants.

Il est effectivement bon donc de rappeler les précautions à prendre, mais alors pourquoi le ministère de l’agriculture ne communique-t-il pas sur les précautions à prendre pour les populations fragiles à propos de la cuisson du steak haché, sans oublier aussi les poissons crus …

Pour mémoire, selon l’Anses,

.. un mode de cuisson des steaks hachés plus adapté aux jeunes enfants permettrait une réduction significative du risque (cuisson à cœur à une température de 70°C).

Voici ci-contre un pictogramme de l'Anses qui résume bien la situation dans son infographie, 10 recommandations pour éviter les intoxications alimentaires,

La fin du communiqué du ministère perd en crédibilité car il devient un mélange des genres avec un bandeau : « Le fromage au lait cru reste une filière de qualité qui valorise les territoires ».

Encéphalite à tiques : première description d'un foyer de contamination d'origine alimentaire en France

L'Anses nous a informé le 18 mai 2020 de CiTIQUE : la nouvelle version de l’application est désormais disponible.

Pour améliorer la prévention des risques liés aux piqûres de tiques, l’INRAE et ses partenaires ont créé en 2017 l’application participative « Signalement Tique » dans le cadre du projet CiTIQUE auquel l’Anses participe. A partir d’aujourd’hui, une nouvelle version, plus pratique pour les utilisateurs et plus utile pour les chercheurs, est accessible à tous.

L’application gratuite « Signalement Tique » a vocation à améliorer la connaissance des tiques et des maladies associées. Impliquant citoyens et chercheurs, cette application permet de collecter des données sur la répartition géographique, le contexte des piqûres de tiques (date, zone du corps piquée, nombre de tiques implantées, type d’environnement, motif de la présence sur le lieu de piqûre, photo de la piqûre et/ou de la tique…) et les agents pathogènes qu’elles transportent.

Depuis 2007, plus de 23 500 piqûres ont déjà été recensées à l’échelle française et plus de 20 000 tiques ont été déposées dans la première et unique tiquothèque participative française. Grâce à ces données, les chercheurs savent désormais que :

• les périodes les plus à risques sont le printemps et l’automne,
• 15 % des tiques analysées sont porteuses de la bactérie à l’origine de la maladie de Lyme,
• 1/3 des piqûres signalées ont lieu dans des jardins privés ou des parcs publics.

Mais c'est d'une autre information que j'aimerais partager avec vous, grâce à une internaute vétérinaire, il s'agit d'un article paru dans La Dépêche Vétérinaire le 4 juin 2020 par la Pr Jeanne Brugère-Picoux, « Encéphalite à tiques : première description d'un foyer de contamination d'origine alimentaire en France ».

Des fromages au lait cru de chèvre seraient à l'origine d'un foyer de cas d'encéphalite à tiques chez des habitants dans l'Ain, selon l'Agence régionale de santé Auvergne-Rhône-Alpes et la préfecture du département. C'est la première fois qu'un foyer d'encéphalite à tiques d'origine alimentaire est décrit en France. La transmission de cette maladie par des produits laitiers non pasteurisés semble augmenter ces dernières années en Europe.

L'annonce, le 28 mai, d'un foyer de cas d'encéphalite à tiques (EAT) confirmé (10 cas dont un décès qui ne semble pas être directement lié à cette virose) ou probable chez 26 habitants dans l'Ain, par l'Agence régionale de santé Auvergne-Rhône-Alpes et la préfecture de l'Ain, a surtout surpris par le caractère exceptionnel de l'origine de l'infection : des fromages au lait cru de chèvre d'une exploitation agricole du bassin d'Oyonnax (ces produits auraient été consommés par au moins 50% des personnes malades).

En effet, l'EAT est l'une des zoonoses virales les plus importantes transmises par la morsure d'une tique infectée. Elle est due à un flavivirus (Tick Borne Encephalitis virus ou TBEV).

Il existe trois sous-types principaux de TBEV (européen, sibérien et extrême-oriental), le sous-type européen étant transmis principalement par la tique Ixodes ricinus (Ixodes persulcatus transmettant les autres sous-types).

La transmission alimentaire par la consommation d'un lait ou d'un produit laitier non pasteurisé provenant d'un ruminant infecté, considérée comme rare, n'avait jamais été décrite en France jusqu'à cette suspicion récente.

Exceptionnellement, une contamination au laboratoire par piqûre ou par aérosols est également possible. 

Selon l'ARS Auvergne Rhône Alpes,

Trente-deux cas de méningite lymphocytaire, encéphalites et syndromes infectieux, ont été recensés depuis le 14 avril 2020 dans une zone limitée de l'Ain chez des personnes habitant sur le bassin de la commune d’Oyonnax, dans un rayon de 30 km environ. Le pic épidémique des cas est survenu dans la semaine du 20 au 26 avril 2020. Parmi ces 32 cas, le diagnostic d'infection par le virus TBE (Tick-Borne Encephalitis) a été confirmé par le Centre National de référence des Arbovirus le 27 mai 2020 pour 14 cas. Ce virus est l’agent responsable de l’encéphalite à tiques. Les 18 autres cas sont en cours d’investigation et des tests biologiques sont réalisés pour confirmer ou infirmer le diagnostic d’encéphalite à tiques.

L’âge médian des cas est de 48 ans et 17 (53%) sont des femmes. Vingt-huit cas ont été hospitalisés ou ont consulté aux urgences, dont 2 ont été admis en unités de soins intensifs. Un cas possible présentant des comorbidités est décédé. Parmi les cas investigués, les signes les plus fréquemment rapportés sont : fièvre (78%), céphalées (52%), myalgies (35%), vertiges (30%), asthénie (21%), diarrhées (13%), vomissements (13%), troubles de la vigilance (9%) et tremblements (9%).

Trente et un des 32 cas (97%) rapportent avoir consommé du fromage ou de la faisselle de chèvre à base de lait cru en provenance du même producteur de fromages situé dans la zone de résidence des cas. La cause alimentaire de ces infections a été confirmée le 2 juin 2020 par le Centre National de référence des Arbovirus. En effet, la présence de génome du virus TBE a été identifiée dans un fromage de chèvre du producteur concerné. Un retrait-rappel des produits laitiers de ce producteur a été effectué avant même la connaissance de ce résultat. Des investigations vétérinaires sont en cours. Cet épisode de cas groupés d’encéphalite à tiques est le premier identifié en France lié à la consommation alimentaire. En revanche, la documentation de cas d’encéphalites à tiques n’est pas nouvelle en Auvergne Rhône-Alpes. Quelques rares cas sont décrits chaque année dans la région d’Annecy depuis 2003 et plus récemment dans le massif du Livradois-Forez avec la détection de 3 cas en Loire et Haute-Loire durant les étés 2017 et 2018.

L'encéphalite à tiques en augmentation constante en Europe

De 1990 à 1994, on a pu observer une augmentation des cas d'EAT dans les pays de l'espace économique européen, peut-être du fait d'une surveillance accrue, puis, de 1995 à 2009, une certaine stabilité, avec 2 000 à 4 000 cas déclarés par an.

En 2012, la maladie accompagnée de troubles nerveux est devenue à déclaration obligatoire dans l'Union européenne.

Une enquête concernant l'EAT a été réalisée sur la période de 2012 à 2016 en Europe : 23 pays de l'Union européenne ont déclaré 12 500 cas d'EAT (l'Irlande et l'Espagne ne déclarant aucun cas), dont 93% ont été confirmés (11 623) et 7% considérés comme probables (783).

Les Pays-Bas ont déclaré des cas à partir de 2016. Deux pays (République tchèque et Lituanie) ont représenté 38,6% de tous les cas signalés, malgré un effectif ne représentant que 2,7% de la population sous surveillance.

Le taux annuel de notification a fluctué entre 0,41 cas pour 100 000 habitants en 2015 et 0,65 en 2013, sans modification significative. La Lituanie, la Lettonie et l'Estonie avaient les taux de notification les plus élevés avec respectivement 15,6, 9,5 et 8,7 cas pour 100 000 habitants.

Au niveau infranational, six régions avaient des taux de notification annuels moyens supérieurs à 15 cas pour 100 000 habitants, dont cinq dans les pays baltes.

Augmentation des cas en France en 2016

Plusieurs pays avaient signalé l'augmentation des cas d'EAT sur leur territoire, notamment la Suisse qui, de 100 cas annuels déclarés ces 5 dernières années, a notifié 251 cas à la fin du mois d'octobre 20196.

En France, depuis 1968 avec la description du premier cas humain, on a surtout observé une dizaine de cas par an en région alsacienne puis, à partir de 2003, un ou deux cas en Haute-Savoie et, en 2006, un premier cas dans le Sud-Ouest (soit 1 cas pour 100 000 habitants).

Une augmentation marquée des cas d'EAT en France a été observée en 2016 : 54 cas dont 46 avec des troubles nerveux (9 malades ont gardé des séquelles pendant les 15 jours à 8 mois suivants) et une enquête sérologique montrant 5,89% de séropositifs sur 1 643 échantillons sanguins.

La région alsacienne est ainsi passée de 0,5 cas à 1,33 cas pour 100 000 habitants.

Selon l'évaluation de l'ECDC sur l'encéphalite à tiques (EAT),

L'EAT est présent dans de grandes régions d'Europe avec des taux de notification les plus élevés dans les pays d'Europe du Nord, centrale et orientale. L'EAT suit une tendance saisonnière, la plupart des cas étant généralement signalés entre juin et septembre. Le vecteur Ixodes ricinus est largement distribué en France et est présent dans la région Auvergne-Rhône-Alpes. Bien que la transmission d'origine alimentaire soit rare, elle peut survenir par la consommation de lait non pasteurisé et de produits laitiers provenant d'animaux infectés. Des investigations complémentaires sont nécessaires pour définir l'étendue de la circulation du virus dans la région.

Les personnes qui vivent ou voyagent dans des régions où l'encéphalite à tiques est endémique doivent être conscientes du risque d'exposition aux tiques, se protéger contre les piqûres de tiques et envisager la vaccination avant l'exposition, qui offre la protection la plus efficace.

La vaccination est recommandée pour les personnes qui vivent dans des zones à risque TBE ou qui visitent fréquemment les forêts et les prairies. Il a conseillé d'éviter la consommation de lait et de produits laitiers non pasteurisés dans les zones à risque à EAT.

NB : L'article s'est largement inspiré de celui de la Pr Jeanne Brugère-Picoux et je conseille vivement la lecture intégrale de l'article qui est en accès libre.

Sur le sujet on lira de l'Anses, Tiques et maladie de Lyme. Mieux connaître et combattre les agents pathogènes transmis par les tiques.

Mise à jour du 2 juillet 2020. On lira le volet encéphalite à tique dans le Bulletin de l'IHU de Marseille du 30 juin 2020, où il est rapporté,

En pratique : L’encéphalite est endémique, de mai à octobre, dans les zones rurales de plusieurs pays d’Europe Centrale et du Nord. L’encéphalite à tiques est rare en France, une vingtaine de cas sont diagnostiqués chaque année essentiellement en Alsace et en Haute Savoie. La transmission du virus se fait par piqure de tique infestée.de façon exceptionnelle une contamination peut se faire par consommation de lait cru de chèvre ou de brebis. Cette transmission n’avait jamais été décrite en France.

Il existe deux vaccins : Ticovac  et Encepur.

Le fromage de brebis des Pyrénées, victime indirecte du coronavirus

« Le fromage de brebis des Pyrénées, victime indirecte du coronavirus », source agri-mutuel avec l’AFP du 23 mai 2020.

Conséquence inattendue de la crise sanitaire du coronavirus: la qualité de l'herbe sur les sommets des Pyrénées est compromise et avec elle la qualité et la quantité des célèbres fromages de brebis produits durant l'estive.

Avec l’approche de l’été, la transhumance des troupeaux de brebis doit commencer ces prochains jours dans le Béarn, mais les bergers redoutent une saison «très compliquée» après les restrictions du printemps. Le confinement les a contraints, comme tout le monde, à rester chez eux. Pas question, donc, de partir en montagne pour entretenir les cabanes qui les accueillent pendant l’estive.

Ce sont les 13 gendarmes du peloton de haute montagne, basé à Oloron-Sainte-Marie, qui s’en sont chargés. « On a proposé notre aide au début du confinement à l’Institut patrimonial du Haut Béarn qui nous a donné une liste d’une cinquantaines de cabanes à aller inspecter », explique le chef Renaud Saison. Il peut y avoir eu des coulées d’avalanches dans l’hiver ou bien des tuiles manquantes ou cassées sur les toits, détaille le gendarme.

Mais les bergers sont avant tout préoccupés par la qualité de l’herbe, compromise en montagne par l’interdiction de tout écobuage durant le confinement, selon l’association des éleveurs transhumants des vallées béarnaises.

Le 20 mars, la préfecture des Pyrénées-Atlantiques décidait de suspendre la pratique « jusqu’à la fin du confinement », afin que « les services départementaux d’incendie et de secours ainsi que la gendarmerie se concentrent exclusivement à la protection de la population ».

L’écobuage, cette pratique ancestrale qui consiste à mettre le feu à des parcelles délimitées afin d’en brûler la végétation dite «sèche», permet le fleurissement d’une herbe tendre et feuillue, idéale pour le pâturage.

fromages d'estive

Jeanine Loustau, bergère installée à Arette et Ledeuix, qui monte en estive à Accous, en vallée d’Aspe, «ne comprend pas du tout» la décision de la préfecture et estime au contraire que le confinement aurait été « un moment idéal, puisque la montagne était vide de tout marcheur pendant deux mois ! » Sans écobuage, « l’herbe de l’an passé fait un tapis au sol et la végétation qui parvient à percer la couche, c’est du ligneux, des tiges qui se sont renforcées qui n’ont pas la même valeur fourragère ou laitière que l’herbe tendre », précise Julien Lassalle, président de l’association des éleveurs transhumants.

« On se sent oubliés » 

Ce «tapis», en cas d’humidité, dégage même une odeur repoussante pour les brebis, qui renoncent à pâturer. Habituellement pratiqué entre mars et avril, l’écobuage n’est désormais plus d’actualité. « Entre temps, le gros bétail c’est-à-dire les vaches et les chevaux ont été montés, donc la cohabitation avec des écobuages est impossible », explique Julien Lassalle. D’autant que depuis 2012, la pratique est interdite entre avril et octobre « afin de contrôler des écobuages non réglementés qui pourraient partir en feu », souligne la préfecture.

Les 380 bêtes de Jeanine Loustau monteront donc à Accous dès le début du mois de juin, mais l’éleveuse ne se fait pas d’illusion : « Il n’y aura pas d’herbe, donc pas de lait et pas de fromage. On a parlé de l’agriculture pendant deux mois, pour qu’on nourrisse les gens, mais à côté de ça on se sent oubliés », souffle l’éleveuse.

Elle dit avoir «sérieusement envisagé» de renoncer à l’estive, sans s’y résoudre. « Les brebis en ont besoin et l’exploitation aussi parce qu’on ne peut pas faire les foins si les bêtes sont là. C’est indispensable sur des petites surfaces comme les nôtres ». Pour elle, le fromage d’estive, produit savoureux qui fait souvent la notoriété d’une ferme, représente 30% de sa production annuelle.

La crise sanitaire a également rendu impossible un aspect important de la transhumance: la fête qui l’accompagne. Là aussi, les rassemblements aux départs des transhumances ont été interdits. « C’est un moment important pour nous parce qu’il y a beaucoup de participation et ça nous permet de créer du lien avec les gens du pays, les touristes, les consommateurs. Ce sont des moments privilégiés où on se fait du bien », regrette Julien Lassalle.

Confirmation avec cet article, « Les estives 2020 impactées par le COVID19 », source Petite république.com.

Avec les nouvelles conditions sanitaires imposées face au coronavirus le cadre de l’organisation des estives 2020 est modifié. La montée aux estives va démarrer le lundi de Pentecôte. Les troupeaux partiront accompagnés de leurs éleveurs selon un planning sur une semaine mis en place par la municipalité. Cette année pas de réunions d’éleveurs, Yves le berger ne fera pas le tour des bergeries pour effectuer le marquage et la vaccination. Le marquage se fera sur le lieu de l’estive. Il n’y aura pas de regroupement avant le départ à Aspet avec le traditionnel casse-croûte offert par la mairie. La vision de l’osmose dans le lien ancestral entre les bêtes et les hommes gravissant les pentes de Cagire demeure pour cette année un souvenir.

Les contraintes sanitaires impactent également la venue de stagiaires comme les autres années. L’employé communal seul se rendra sur les lieux pour aider les bergers. Les éleveurs pourront visiter leurs troupeaux le dimanche selon un protocole précis, répartis en petits groupes. Ils devront apporter leur propre matériel pour l’entretien du bétail.

Toutes ces contraintes n’ont pas impacté le nombre d’éleveurs pratiquant l’estive et le nombre des brebis reste aussi équivalent.

NB : Dans les Pyrénées, on parle d’estive et non d’alpage.

Cas de listériose en Suisse liés à la consommation de fromages

Je vous avais déjà entretenu de trois rappels distincts de fromages liés à la présence de Listeria monocytogenes en Suisse ici. Cela concernait des rappels ayant eu lieu les 5, 7 et 8 mai 2020.

« Des responsables signalent davantage de patients dans une épidémie à Listeria liés à des fromages », source article de Joe Whitworth paru le 14 mai 2020 dans Food Safety News et complété par mes soins -aa.

Au moins 11 personnes en Suisse ont été infectées par Listeria et deux sont décédées après avoir consommé du fromage contaminé.

Des responsables de l'Office fédéral de la sécurité alimentaire et des affaires vétérinaires (OVAV) ont déclaré à Food Safety News que l'analyse est en attente pour 10 autres cas d’infection pour voir si elles appartiennent au même cluster épidémique. Au total, 28 cas de listériose ont été signalés dans le pays depuis le début de cette année.

Sur les 11 cas d'infection confirmés, cinq sont des hommes et six sont des femmes âgés de 66 à 86 ans. Les cas d’infection se sont produits dans sept cantons ou régions du pays.

Le premier patient lié au cluster épidémique a présenté des symptômes fin janvier. Dans le dernier cas d’infection apparenté signalé à ce jour, les symptômes ont commencé mi-avril.

Fermeture de l'entreprise

Käserei Vogel AG, basée à Steinerberg, a retrouvé Listeria dans du fromage à pâte mi-dure et son site de production au début du mois. L'entreprise a émis un rappel, a informé les autorités et a informé ses acheteurs de retirer les produits des rayons.

Jacques Gygax, directeur de Fromarte, l'Association des spécialistes suisses du fromage, a déclaré au journal 20 Minuten que le fromager avait prévu de prendre sa retraite mais qu'il a maintenant décidé de fermer plus tôt l'entreprise. Le site Internet de la société est hors ligne avec un message disant qu'il n’est plus accessible.

Le fromage était fabriqué à partir de lait pasteurisé. Il peut être identifié comme des produits avec un ovale comprenant CH 5707. Il provient de Käserei Vogel.

Plus de 25 produits vendus dans toute la Suisse ont été rappelés par la société. La distribution comprenait également la Belgique et l'Allemagne.

En effet, une notification d’alerte au au RASFF de l’UE du 8 mai 2020 (référence 2020.1951), soit trois jours après le communiqué de rappel par l’OSAV, il y en aurait à dire sur le réseau d’alerte rapide …, rapporte la présence de Listeria monocytogenes (sérotype 4b, ST6) dans des fromages semi-dur de Suisse. La notification d’alerte indique que le produit est originaire de Suisse mais qu’il n’est pas distribué en Suisse mais seulement en Allemagne et Belgique.

A noter, autre curiosité de cette alerte au RASFF, que la catégorie de danger mentionnée est ‘autres contaminants microbiens’ et non pas ‘pathogènes’, de plus en plus étonnant …

Le Centre Hospitalier du Valais Romand (CHVR) communique cette information en insistant fortement sur le conditionnel. Ce que l’on sait, c’est que quatre patients ont été frappés par une «infection invasive à listéria» durant la période s’étalant du 30 mars au 2 mai. Selon, l’Hôpital, ces malades «auraient pu contracter cette bactérie par la consommation de ces fromages durant leur séjour», puisqu’ils ont consommé du fromage.

Un des patients contaminés est décédé. Il était traité pour une grave maladie oncologique. L’infection a provoqué une aggravation de sa situation, qui s’est révélée mortelle.