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mercredi 3 mars 2021

Pour la santé du microbiote intestinal, faut-il préférer des glycanes des végétaux ou des bifidobactéries ? Science versus marketing ?

Voici une mini revue, parue Applied and Environmental Microbiology, une revue d el'Américan Society for Microbiology, qui estime que pour moduler le microbiote intestinal des humains, il faut opter pour une intervention diététique avec des glycanes végétaux.

Le côlon humain contient une communauté d'espèces microbiennes, principalement des bactéries, souvent appelées microbiote intestinal. La communauté est considérée comme essentielle au bien-être humain en conférant une capacité supplémentaire de récupération d'énergie, une exclusion de niche des pathogènes et des activités de signalisation moléculaire qui sont intégrées dans les processus physiologiques humains.

Les polysaccharides végétaux (glycanes, fibres alimentaires) sont une source importante de carbone et d'énergie qui soutient le maintien et le fonctionnement du microbiote intestinal.

Par conséquent, la quantité et la qualité quotidiennes des glycanes végétaux consommés par l'hôte humain ont le potentiel d'influencer la santé. Les membres du microbiote intestinal diffèrent par leur capacité à utiliser différents types de glycanes végétaux.

Les interventions diététiques avec des glycanes spécifiques pourraient moduler le microbiote, neutralisant les perturbations écologiques qui perturbent les relations complexes entre le microbiote et l'hôte (dysbiose).

Cette revue examine les perspectives et les options de recherche pour la modulation du microbiote intestinal par la formulation de régimes alimentaires qui, lorsqu'ils sont consommés de façon habituelle, corrigeraient la dysbiose en créant divers consortiums qui stimulent la résilience fonctionnelle.

Les «prébiotiques» traditionnels favorisent les bifidobactéries et les lactobacilles, alors que des mélanges alimentaires de glycanes végétaux dont la complexité chimique est variée favoriseraient des microbiotes à haute diversité.

Il est conclu que la recherche devrait viser à améliorer la connaissance des consortiums bactériens qui, grâce à une alimentation partagée, dégradent et fermentent les glycanes végétaux. La composition des consortiums peut varier d'une personne à l'autre, mais les résultats fonctionnels seront cohérents dans un contexte donné en raison de la redondance métabolique entre les bactéries. Ainsi, l'individualité des microbiotes intestinaux pourrait être englobée, la résilience fonctionnelle encouragée et la correction de la dysbiose obtenue.

vendredi 10 avril 2020

Des scientifiques révèlent le camouflage du coronavirus qui facilitera la recherche d’un vaccin


« Des scientifiques révèlent le camouflage du coronavirus qui facilitera la recherche d’un vaccin », communiqué de l'Université de Southampton du 8 avril 2020.

Des recherches menées par l'Université de Southampton ont révélé les caractéristiques fondamentales du coronavirus SARS-CoV-2 qui cause le COVID19. Les chercheurs ont produit le premier modèle d'une pique du virus qui montre comment il se déguise pour pénétrer dans les cellules humaines sans être détecté, et les protéines virales qui sont la cible des anticorps et la recherche d’un vaccin. Les résultats de cette étude pourraient fournir des informations cruciales pour aider les scientifiques qui recherchent actuellement un vaccin.

Le virus du SRAS-CoV-2 a un grand nombre de piques dépassant de sa surface qu'il utilise pour se fixer aux cellules du corps humain et y pénétrer. Ces piques sont enrobées de sucres, appelés glycanes, qui masquent leurs protéines virales et les aident à échapper au système immunitaire du corps humain.

L'équipe de recherche, dirigée par le professeur Max Crispin, a étudié la structure des glycanes recouvrant la surface d'un mimétique d'une pique virale à l'aide d'équipements précédemment achetés grâce à une subvention de la Fondation Bill et Melinda Gates via la Collaboration for AIDS Vaccine Discovery.

Ils ont ensuite pu cartographier la structure des glycanes qui fournit des informations importantes sur l'accessibilité de la surface des protéines virales aux anticorps, c'est une étape importante dans la conception d’un vaccin.

« En s’enduisant de sucre, les virus sont comme un loup dans des habits de moutons », a expliqué le professeur Crispin. « Mais l'une des principales conclusions de notre étude est que, malgré le nombre de sucres, ce coronavirus n'est pas aussi bien protégé que certains autres virus. »

« Les virus comme le VIH, qui s’accroche à un hôte, doivent constamment échapper au système immunitaire et ils ont une couche très dense de glycanes comme bouclier pour le système immunitaire; mais dans le cas du coronavirus, le blindage inférieur par les sucres qui y sont attachés peut refléter qu'il s'agit d'un virus ‘hit and run’ (théorie selon laquelle le virus disparaît dans une phase tardive -aa), se déplaçant d'une personne à une autre. »

« Cependant, la faible densité de glycanes signifie qu'il y a moins d'obstacles pour le système immunitaire pour neutraliser le virus avec des anticorps. C'est donc un message très encourageant pour le développement d’un vaccin. »

À Southampton, l'équipe du professeur Crispin comprend des doctorants Yasunori Watanabe et Joel Allen, et ils ont travaillé en étroite collaboration avec l'équipe de Jason McLellan de l'Université du Texas qui a été la première à déterminer la structure du SRAS-CoV-2. Ils ont publié leurs résultats avant l'examen par des pairs sur le serveur de préimpression BioRxiv.

L'équipe du professeur Crispin a une très forte histoire dans l'analyse des caractéristiques des virus et ils ont fait des découvertes clés déterminant les caractéristiques de la pique plié nativement du VIH.

Ils travaillent maintenant avec des partenaires qui ont développé des vaccins candidats, dont le professeur Rogier Sanders de l'Université d'Amsterdam, et analysent maintenant la teneur en glycanes à Southampton. L'évaluation des glycanes sur les immunogènes permettra de déterminer dans quelle mesure ils imitent un pique viral plié nativement et aidera à comprendre la réponse immunitaire aux candidats vaccins.