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mercredi 7 décembre 2022

L'IA écoute les bruits des toilettes pour deviner si les personnes ont la diarrhée

Voilà une invention qui doit valoir son pesant de nouveauté, jugez plutôt !

«Des toilettes équipées d'un microphone afin de détecter des maladies gastro-intestinales et qui en plus et vous donneront des conseils», source Intersting Engineering.

Le capteur du microphone peut classer les maladies intestinales à l'aide d'un apprentissage automatique. Le capteur non invasif peut détecter une maladie dans l’intestin.

Maia Gatlin, ingénieure de recherche au Georgia Institute of Technology, a créé un moyen d'utiliser l'intelligence artificielle pour détecter la diarrhée. Elle a appelé sa présentation The Feces Thesis: Using Machine Learning to Detect Diarrhoea.

Gatlin a présenté le capteur le 5 décembre, lors de la réunion annuelle de l'Acoustical Society of America, expliquant ses découvertes sur la façon dont l'apprentissage automatique peut être utilisé pour détecter les maladies de l'intestin. Elle utilise un capteur doté d’un microphone non invasif pour identifier les maladies intestinales, sans nécessairement collecter d'informations identifiables, ce qui signifie que l'Intelligence Artificielle (IA) peut déterminer l'infection sans avoir à être examinée dans un établissement médical pour collecter des données supplémentaires.

La méthode consiste à utiliser le microphone et l'apprentissage automatique pour détecter la diarrhée. Gatlin et son équipe de recherche ont testé la technique du capteur sur des fichiers audio provenant de ressources en ligne. Chaque échantillon audio unique d'une excrétion, ou selle, a été converti en un spectrogramme, qui capture le son dans une image.

Un spectrogramme est une manière visuelle de représenter le son d'un signal dans le temps, représentant un visuel du son.

Les différents types d'excrétion créent des caractéristiques différentes dans l'audio et le spectrogramme. Le ton diarrhéique a produit plus d'un son aléatoire pour les chercheurs. Les images du spectrogramme ont ensuite été utilisées comme entrée et ont été placées dans un algorithme d'apprentissage automatique. Les performances de l'algorithme ont ensuite été testées par rapport à des données avec et sans bruit de fond pour s'assurer qu'il obtenait les informations nécessaires pour interpréter les sons à l'aide du capteur, quel que soit l'environnement.

NB : La photo représente le capteur situé au-dessus des toilettes. ©Maia Gatlin/l'Acoustical Society of America.

dimanche 18 juillet 2021

Les épidémies à norovirus en augmentation en Angleterre. Vers un retour une situation avant la pandémie et surtout au lavage des mains avec de l'eau et du savon

«Les épidémies à norovirus en augmentation en Angleterre», source Public Health England du 16 juillet 2021.

Public Health England (PHE) rappelle au public les mesures simples qu'il peut prendre pour réduire la propagation de norovirus.

L'avis intervient après que la surveillance de routine montre que le nombre d'épidémies causées par le virus du vomissement a augmenté au cours des dernières semaines (période de 5 semaines de fin mai à juillet), en particulier dans les milieux éducatifs de la petite enfance, et que les cas reviennent aux niveaux de la période pré-pandémique dans tous les groupes d'âge et dans tous les milieux en Angleterre.

Norovirus est hautement infectieux et provoque des vomissements et de la diarrhée, mais disparaît généralement en quelques jours. Il se transmet facilement par contact avec des personnes infectées ou des surfaces contaminées. L'augmentation des épidémies s'est produite principalement dans les établissements d'enseignement, en particulier dans les crèches et les garderies, avec beaucoup plus d'incidents signalés à PHE que prévu au cours des mois d'été. Au cours des 5 dernières semaines, 154 foyers de cas ont été signalés, contre une moyenne de 53 foyers de cas signalés au cours de la même période au cours des 5 années précédentes.

Le nombre total de rapports liés à la présence de norovirus confirmée en laboratoire dans tous les groupes d'âge a également récemment augmenté pour atteindre les niveaux observés les années" style="color: black;"> précédentes avant la pandémie de coronavirus (COVID-19).

Le professeur Saheer Gharbia, directeur adjoint du service national des infections à la PHE, a dit :

Norovirus, communément appelé virus des vomissements hivernaux, a été à des niveaux inférieurs à la normale tout au long de la pandémie avec moins de possibilités de se propager entre les personnes de la communauté, mais à mesure que les restrictions se sont assouplies, nous avons constaté une augmentation des cas dans tous les groupes d'âge.

Les symptômes comprennent l'apparition soudaine de nausées, de vomissements en jet et de diarrhée, mais peuvent également inclure une température élevée, des douleurs abdominales et des membres endoloris. Restez à la maison si vous présentez des symptômes de norovirus et ne retournez pas au travail ou n'envoyez pas les enfants à l'école ou à la crèche avant 48 heures après la disparition des symptômes. Comme avec COVID-19, le lavage des mains est vraiment important pour aider à arrêter la propagation de ce virus, mais rappelez-vous, contrairement à COVID-19, les gels d'alcool ne tuent pas le norovirus, donc le savon et l'eau sont les meilleurs.

Commentaire. Il n'y a peut-être pas de relachement des gestes barrières mais comme les solutions hydro-alcooliques ne sont pas acitves contre norovirus, la réponse à la réapparition de norovirus est sans doute dans une utilisation unique de ces produits. Il nous faut revenir au classique lavage des mains avec de l'eau et savon.

jeudi 29 avril 2021

Combattre Shigella en bloquant sa toxine

«De nouvelles molécules abordables pour lutter contre les maladies diarrhéiques chez les jeunes enfants», source Univesrité d'Utrecht.

Des scientifiques d'Utrecht et une branche mondiale de la société pharmaceutique GSK, spécialisée dans la santé, ont découvert de nouvelles molécules abordables dans la lutte contre les maladies diarrhéiques chez les jeunes enfants.

La bactérie Shigella cause 165 millions de cas de maladies diarrhéiques, dont de nombreux décès, dont 70% chez des enfants de moins de 5 ans. Plus de 95% de ces décès surviennent dans les pays en développement. L'issue de la maladie est plus grave si elle produit une shigatoxine, qui peut provoquer une maladie rénale mortelle. Dans un article publié Journal of Medicinal Chemistry (l'article est disponible en intégralité) des chercheurs présentent une nouvelle molécule capable de bloquer cette toxine, dont la prévalence augmente parmi les quatre espèces de bactéries Shigella.

Des tentatives antérieures par d'autres ont produit des molécules puissantes capturant la toxine, mais ces molécules étaient trop complexes pour un développement et une application ultérieure dans les pays à faible revenu. De plus, la toxine est une cible difficile, car elle passe du tractus intestinal à la circulation après quelques jours. Alors que la présente étude se concentrait sur une forte capture en circulation, des chercheurs d'Utrecht ont également découvert un polysaccharide et un additif alimentaire facilement disponibles qui peuvent capturer la toxine dans l'intestin. Une telle approche à deux volets peut être nécessaire pour lutter contre ce pathogène difficile.

Pays en voie de développement

«Nous sommes très heureux d'avoir trouvé une molécule non seulement efficace, mais aussi relativement facile et peu coûteuse à fabriquer», a dit Roland Pieters, auteur correspondant de la publication. «Cela signifie qu'il convient parfaitement à une utilisation dans les pays en voie de développement.»

Afin de capturer la toxine, les chercheurs ont exploré les glycodendrimères: des molécules arborescentes avec des feuilles de glucides appropriées. De plus, ils ont étudié un type de glycopolymère qui s'assemble en une sphère semblable à des particules d'une taille similaire à celle de la toxine. Ces dernières particules se sont révélées les plus efficaces et des études ont indiqué qu'elles n'étaient pas toxiques.

Rayon d'espoir

Lluís Ballell, responsable de l'incubateur GSK Global Health, a dit: «Les effets d'une diarrhée sévère sont dramatiques, en particulier chez les enfants des pays en voie de développement. Cette innovation offre une lueur d'espoir vers une solution simple et abordable qui s'attaque aux effets les plus pernicieux de la sécrétion de toxines dans les maladies diarrhéiques. Nous sommes très heureux que GSK et la Fondation Tres Cantos Open Lab aient pu jouer un rôle déterminant dans ce projet.

Ce travail est d'autant plus pertinent qu'une souche de souche de E. coli (STEC) produit des toxines similaires pour lesquelles aucun traitement ou vaccin adéquat n'est actuellement disponible.

mardi 23 février 2021

Des chatons pourraient détenir la clé de la compréhension de maladies diarrhéiques mortelles chez les enfants

«Des chatons pourraient détenir la clé de la compréhension des maladies diarrhéiques mortelles chez les enfants», source North Carolina State University.

Les chatons pourraient être le modèle pour comprendre les maladies diarrhéiques infectieuses, parfois mortelles, chez les animaux et les enfants, selon une étude de la North Carolina State University parue dans Infection and Immunity, une revue de l'ASM. L'article est disponible en intégralité.

Les bactéries diarrhéiques Escherichia coli (DEC) provoquent des maladies diarrhéiques mortelles chez les enfants du monde entier, tuant jusqu'à 120 000 enfants de moins de cinq ans par an. Les Escherichia coli atypiques (ATEC pour atypical Escherichia coli) sont une forme de DEC de plus en plus associée aux maladies diarrhéiques chez les humains et les chatons.

«Nous recherchions les causes de la diarrhée infectieuse chez les chatons, qui a un taux de mortalité élevé, et sommes tombés sur ce pathogène», explique Jody Gookin, professeur éméritee en formation de chercheurs vétérinaires à la NC State et auteur correspondant de l'étude.

«Ce qui est intéressant à propos des ATEC c'est que vous pouvez le trouver chez les personnes en bonne santé et malades. L’avoir dans votre tractus intestinal ne signifie pas que vous êtes malade, mais ceux qui sont malades ont un fardeau plus élevé, ou une plus grande quantité de bactéries, dans leur corps.»

Gookin et Victoria Watson, une ancienne Ph.D. Étudiante à NC State et principal auteur de l'étude, a effectué une analyse génomique des isolats ATEC provenant à la fois de chatons en bonne santé qui ont été colonisés par la bactérie et de chatons atteints d'infections mortelles pour essayer de déterminer pourquoi les ATEC provoque la maladie chez certains chatons mais reste dormant chez d'autres.

Avec des collaborateurs de l'Université du Maryland, Gookin et Watson ont ensuite comparé les données génomiques des deux groupes de chatons aux isolats humains ATEC. Cependant, aucun marqueur génétique spécifique n'a permis aux chercheurs de distinguer les groupes d'isolats.

«ATEC isolé des humains est le même que celui retrouvé chez les chatons sains et malades», dit Gookin. «Il n’existait pas de marqueurs génétiques uniques qui pourraient expliquer pourquoi un groupe de bactéries provoque des maladies alors que l’autre ne le fait pas. La seule chose que nous avons trouvée était des différences de comportement entre les groupes d'isolats.»

«Les isolats pathogènes causant la maladie avaient plus de motilité, ils étaient de meilleurs nageurs. Les bactéries ATEC provoquent des maladies en se fixant aux cellules épithéliales tapissant l'intestin. Ces cellules sécrètent alors des fluides, provoquant la diarrhée. Ainsi, plus les bactéries ATEC pourraient nager, plus il serait facile de trouver des cellules et de s'y attacher.»

Les résultats indiquent que les chatons sont un modèle potentiellement inestimable pour une exploration plus approfondie des ATEC au niveau moléculaire afin d'informer les approches de traitement pour les humains et les félins.

«C'est le premier article sur la génétique qui est la même dans des groupes d'isolats ATEC des humains et des chatons, à la fois en bonne santé et malades», dit Gookin. «C'est également une preuve supplémentaire que nos animaux de compagnie peuvent nous donner des informations importantes sur les maladies qui nous affectent tous les deux.»

jeudi 10 décembre 2020

Une toxine fournit des indices sur les effets à long terme de la diarrhée causée par E. coli

Les bactéries E. coli producteurs de toxines (en verte) se fixent aux cellules intestinales humaines exprimant la protéine CEACAM6 (en rouge).

«Une toxine fournit des indices sur les effets à long terme de la diarrhée causée par E. coli», source Washington University School of Medicine.

Les bactéries changent la surface de l'intestin humain pour en bénéficier.

Pour les habitants des pays riches, la diarrhée n'est généralement rien de plus qu'un inconvénient inconfortable pendant quelques jours. Mais pour un enfant pauvre d'un pays en voie de développement, des épisodes répétés de diarrhée peuvent entraîner de graves conséquences sur la santé telles que la malnutrition, un retard de croissance et des déficits cognitifs.

Des chercheurs de la faculté de médecine de l'Université de Washington à Saint-Louis ont découvert qu'une toxine produite par la bactérie Escherichia coli (E. coli), connue depuis longtemps pour causer la diarrhée, a également d'autres effets sur le tube digestif humain. La toxine, ont-ils découvert, modifie l'expression des gènes dans les cellules qui tapissent l'intérieur de l'intestin, les incitant à fabriquer une protéine que la bactérie utilise ensuite pour se fixer à la paroi intestinale.

Les résultats, publiés dans les Proceedings of the National Academy of Sciences, offrent un indice sur les raisons pour lesquelles des épisodes de diarrhée récurrents mais de courte durée pourraient entraîner des problèmes nutritionnels à long terme.

«Il y a plus que ce que l'on voit avec cette toxine», a déclaré l'auteur principal, James M. Fleckenstein, professeur de médecine et de microbiologie moléculaire. «Il s'agit essentiellement de modifier la surface de l'intestin pour en tirer profit, probablement finalement au détriment de l'hôte. Il y a des décennies, des personnes ont découvert comment la toxine provoque la diarrhée, mais jusqu'à récemment, personne n'avait vraiment les outils pour explorer ce que cette toxine pouvait faire d'autre. Nous essayons de rassembler les pièces du puzzle pour découvrir comment E. coli producteurs de toxines pourrait entraîner la malnutrition et d'autres effets d'entraînement de la diarrhée.»

Fleckenstein et le premier auteur Alaullah Sheikh, chercheur en postdoc, étudient E. coli entérotoxigènes (ETEC), une souche de E. coli productrice de toxines qui est une cause fréquente de diarrhée aqueuse sévère. La soi-disant toxine thermolabile de la bactérie provoque l’ouverture des canaux ioniques sur les cellules intestinales, déclenchant un déversement d’eau et d’électrolytes dans le tube digestif - en d’autres termes, la diarrhée.

Depuis que la thérapie de réhydratation orale a été inventée dans les années 1970, les décès dus à la diarrhée ont chuté de plus de 80% dans le monde. Bien qu'inestimable pour aider les gens à survivre à une crise de diarrhée, la thérapie ne fait rien pour réduire le nombre de cas. Dans le monde entier, les jeunes enfants développent encore la diarrhée en moyenne trois fois par an, les enfants les plus jeunes et les plus pauvres étant les plus touchés par le nombre de cas - et les conséquences à long terme sur la santé.

Fleckenstein et Sheikh ont émis l'hypothèse que la toxine thermolabile des ETEC pourrait faire plus que simplement provoquer une diarrhée aiguë et une déshydratation. Si tel est le cas, cela pourrait expliquer le lien entre les ETEC et la malnutrition, le retard de croissance et d'autres problèmes.

Pour trouver d'autres façons dont la toxine affecte l'intestin, les chercheurs ont cultivé des cellules intestinales humaines et ont traité les cellules avec la toxine. Ils ont découvert que la toxine active un ensemble de gènes appelés CEACAM. Un en particulier - CEACAM6 - code pour une protéine qui se trouve normalement dans les cellules de l'intestin grêle à de faibles niveaux. D'autres expériences ont révélé que la toxine amène les cellules à produire plus de protéine CEACAM6, que la bactérie utilise ensuite pour se fixer aux cellules intestinales et délivrer encore plus de toxine. De plus, en utilisant des spécimens de biopsie intestinale provenant de personnes au Bangladesh infectées par des ETEC, les chercheurs ont montré que l'expression de CEACAM6 augmente dans l'intestin grêle lors d'une infection naturelle.

«La CEACAM6 est exprimée dans ce qu'on appelle la bordure en brosse de l'intestin grêle, où toutes vos vitamines et nutriments sont absorbés», a déclaré Sheikh. «C'est l'une des premières preuves que les ETEC peuvent modifier la surface intestinale. Nous ne savons pas encore combien de temps cela dure et ce que cela signifie pour les personnes infectées, mais il va de soi que des dommages à cette partie du corps pourraient affecter la capacité à absorber les nutriments

Fleckenstein, Sheikh et ses collègues continuent d'étudier le lien entre les ETEC et la malnutrition, le retard de croissance et d'autres conséquences sur la santé.

«Nous essayons en laboratoire de comprendre le rôle des ETEC et de ses toxines en ce qui concerne les effets non diarrhéiques de l'infection à ETEC, en particulier chez les jeunes enfants dans les pays en développement», a déclaré Fleckenstein. «Il y a beaucoup de travail à faire pour explorer comment les toxines pourraient être liées aux conséquences à long terme de la diarrhée.»

jeudi 9 janvier 2020

La gastro est bien là !


Ce site présente la diarrhée aiguë avec ce titre énigmatique, « Si vous avez la gastro, la diarrhée est votre meilleure arme ».

Décidément la presse ne sait pas quoi inventer pour parler de la gastro ou de la diarrhée aiguë ...

Les gastro-entérites aiguës (GEA) hivernales sont souvent virales. Une recrudescence est observée chaque année, en France, comme en Europe, générant une augmentation des consultations médicales pour GEA. 

Cela étant, selon le « réseau Sentinelles, INSERM/Sorbonne Université » :
En France métropolitaine, la semaine dernière (2020 semaine 01), le taux d’incidence des cas de diarrhée aiguë vus en consultation de médecine générale a été estimé à 326 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [304 ; 348]), soit 214 749 [200 309 ; 229 189] habitants ...
Au niveau régional, les taux d’incidence les plus élevés ont été observés en : Nouvelle-Aquitaine (462 [371 ; 553]), Grand Est (426 [345 ; 507]) et Pays de la Loire (415 [298 ; 532]).

IC est l’intervalle de confiance, qui a 95 % de chances de contenir la vraie valeur.

On pourra voir la carte de ka France métropolitaine de la semaine 01 de 2010 en fin d'article.

On reliera ces données à l'article de Santé publique de France du 3 janvier 2020,
Toxi-infectionsalimentaires collectives suspectées d’être liées à laconsommation de coquillages crus, bilan épidémiologique au 2janvier 2020.

Définition des cas de diarhée aiguë : :Au moins 3 selles liquides ou molles par jour datant de moins de 14 jours motivant la consultation.

La gastro-entérite aiguë est une infection gastro-intestinale, due à divers virus, bactéries ou parasites. Elle se manifeste par une diarrhée aiguë d'apparition soudaine.
Et n'oubliez pas de vous laver les mains avec de l'eau et savon !

Complément du 15 janvier 2020. Selon le Réseau Sentinelles, « Diarrhée aiguë, Activite forte en augmentation en medecine générale »  pour la semine 02 de 2020.
En France métropolitaine, la semaine dernière (2020 semaine 02), le taux d’incidence des cas de diarrhée aiguë vus en consultation de médecine générale a été estimé à 398 cas pour 100 000 habitants (IC 95% [375 ; 421]), soit un total de l’incidence de 262 013 cas [246 891 ; 277 135].
Au niveau régional, les taux d’incidence les plus élevés ont été observés en : Pays de la Loire (677 [493 ; 861]), Hauts-de-France (568 [462 ; 674]) et Nouvelle-Aquitaine (489 [385 ; 593]).